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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4441 | 2025-10-06 | Disruption of cell-intrinsic PCSK9 enhances the antitumor efficacy of CD8+ T cells 
          2025-Jul-15, Journal for immunotherapy of cancer
          
          IF:10.3Q1
          
         
          DOI:10.1136/jitc-2025-011657
          PMID:40664445
         | 研究论文 | 本研究揭示了免疫细胞内在PCSK9对CD8+ T细胞抗肿瘤功能的抑制作用及其作为癌症免疫治疗新靶点的潜力 | 首次发现CD8+ T细胞自身表达的PCSK9会抑制其抗肿瘤功能,敲除PCSK9可增强CD8+ T细胞和CAR-T细胞的肿瘤杀伤能力 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用的转化效果需要进一步验证 | 探究免疫细胞内在PCSK9在肿瘤控制中的作用机制 | 胰腺癌和黑色素瘤小鼠模型、CD8+ T细胞、CAR-T细胞 | 免疫肿瘤学 | 胰腺癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | Pcsk9缺陷小鼠肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 4442 | 2025-10-06 | High-resolution mapping of single cells in spatial context 
          2025-Jul-15, Nature communications
          
          IF:14.7Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41467-025-61667-4
          PMID:40664667
         | 研究论文 | 开发了一种名为CMAP的方法,通过整合单细胞和空间数据实现大规模单个细胞到精确空间位置的映射 | 采用分治策略整合单细胞和空间数据,有效处理两种数据间的不一致性,实现完整单细胞分辨率 | NA | 解决空间转录组技术中基因恢复不足和难以实现完整单细胞分辨率的问题 | 组织微环境中的细胞 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学,单细胞测序 | 分治策略 | 单细胞数据,空间数据 | 模拟和真实数据集 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA | 
| 4443 | 2025-10-06 | Exploring the mechanism of metabolic cell death-related genes AKR1C2 and MAP1LC3A as biomarkers in Parkinson's disease 
          2025-Jul-15, Scientific reports
          
          IF:3.8Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41598-025-11481-1
          PMID:40664780
         | 研究论文 | 本研究通过整合帕金森病相关差异表达基因和代谢性细胞死亡相关基因,鉴定AKR1C2和MAP1LC3A作为帕金森病的潜在生物标志物 | 首次系统分析代谢性细胞死亡相关基因在帕金森病中的作用,并鉴定出AKR1C2和MAP1LC3A作为新型生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探索代谢性细胞死亡相关基因在帕金森病发病机制中的作用 | 帕金森病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 蛋白质相互作用网络分析 | 机器学习 | 基因表达数据 | GSE7621数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 4444 | 2025-10-06 | A novel cancer-associated membrane signature predicts prognosis and therapeutic response for lung adenocarcinoma 
          2025-Jul-15, Scientific reports
          
          IF:3.8Q1
          
         
          DOI:10.1038/s41598-025-11105-8
          PMID:40664871
         | 研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组数据开发了基于膜蛋白的肺腺癌预后预测模型LCaMPS | 首次在单细胞和空间分辨率水平系统识别肺腺癌特异性膜蛋白并构建预后模型 | 需要进一步的前瞻性临床验证 | 开发肺腺癌预后预测和治疗指导的生物标志物 | 肺腺癌患者队列 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | 预后预测模型 | RNA测序数据,蛋白质表达数据 | 多个肺腺癌队列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA | 
| 4445 | 2025-10-06 | Deciphering cancer therapy resistance via patient-level single-cell transcriptomics with CellResDB 
          2025-Jul-15, Communications biology
          
          IF:5.2Q1
          
         
          DOI:10.1038/s42003-025-08457-2
          PMID:40664938
         | 研究论文 | 介绍了一个用于研究癌症治疗耐药性的患者水平单细胞转录组数据库CellResDB | 开发了首个整合患者水平单细胞转录组数据和临床注释的癌症治疗耐药性数据库,并包含智能机器人辅助数据检索 | NA | 系统研究癌症治疗耐药性的潜在机制 | 肿瘤微环境中的细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型 | 单细胞转录组数据 | 1391个患者样本,约470万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 4446 | 2025-10-06 | Unraveling the role of gut microbiota on the formation of nephrolithiasis: insights from integrated analysis of GWAS, single-cell transcriptomics, bulk RNA sequencing and network Pharmacology 
          2025-Jul-15, Urolithiasis
          
          IF:2.0Q2
          
         
          DOI:10.1007/s00240-025-01809-x
          PMID:40664942
         | 研究论文 | 通过整合GWAS、单细胞转录组学、bulk RNA测序和网络药理学分析,探索肠道微生物群在肾结石形成中的分子机制 | 首次通过多组学整合分析鉴定出与肾结石相关的关键基因PALLD和R3HDM1,并发现成纤维细胞和血管平滑肌细胞/周细胞是关键的细胞类型 | 研究数据来源于公共数据库,缺乏实验验证 | 探索肠道微生物群在肾结石形成中的分子机制 | 肾结石患者和肠道微生物群 | 生物信息学 | 肾结石 | GWAS, 单细胞转录组测序, bulk RNA测序, 网络药理学, 分子对接 | 孟德尔随机化, 差异表达分析, 富集分析 | 基因组数据, 转录组数据 | 多个公共数据集(ukb-b-18372, GSE73680, GSE117518, GSE231569) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, GWAS | NA | NA | 
| 4447 | 2025-10-06 | In silico analysis of the oncogenic role of myoferlin (MYOF) and suggestion of folate as a potential therapeutic for brain cancer in the Caucasian population 
          2025-Jul-15, Discover oncology
          
          IF:2.8Q2
          
         
          DOI:10.1007/s12672-025-03091-0
          PMID:40665025
         | 研究论文 | 通过生物信息学分析探讨肌铁蛋白(MYOF)在脑癌中的致癌作用并提出叶酸作为潜在治疗方法 | 首次通过计算药物发现和空间转录组学结合生成式人工智能实验,研究叶酸在MYOF敲低中的治疗潜力 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索MYOF在脑癌发生发展中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 肌铁蛋白(MYOF)基因及其在脑癌中的作用机制 | 生物信息学 | 脑癌 | 生物信息学分析, 计算药物发现, 空间转录组学, 生成式人工智能 | 生成式人工智能 | 基因表达数据, 突变数据, 通路数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 4448 | 2025-10-06 | Role of PRC2 in the stochastic expression of Aire target genes and development of mimetic cells in the thymus 
          2025-Jul-07, The Journal of experimental medicine
          
          IF:12.6Q1
          
         
          DOI:10.1084/jem.20240817
          PMID:40244172
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞多组学方法揭示了PRC2在Aire靶基因随机表达和胸腺模拟细胞发育中的关键作用 | 首次发现PRC2通过染色质抑制为Aire实现随机基因表达提供先决条件,并独立于Aire调控模拟细胞的发育 | 研究聚焦于胸腺上皮细胞,未涉及其他免疫细胞类型 | 阐明Aire靶基因的表达调控机制及其在胸腺中枢耐受中的作用 | 髓质胸腺上皮细胞(mTECs) | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞多组学分析,深度单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA | 
| 4449 | 2025-10-06 | Myeloma cell-intrinsic ANXA1 elevation and T cell dysfunction contribute to BCMA-negative relapse after CAR-T therapy 
          2025-Jul-02, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
          
          IF:12.1Q1
          
         
          DOI:10.1016/j.ymthe.2025.03.001
          PMID:40057828
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了骨髓瘤细胞内在ANXA1升高和T细胞功能障碍导致BCMA阴性复发的新机制 | 首次在单细胞水平发现BCMA阴性骨髓瘤细胞高表达ANXA1,并证实ANXA1通过激活AMPKα信号通路促进肿瘤生长和削弱CAR-T细胞功能 | 研究样本量有限,主要基于单个病例的深入分析,需要更大规模研究验证 | 探究多发性骨髓瘤在接受BCMA CAR-T细胞治疗后出现BCMA阴性复发的分子机制 | 多发性骨髓瘤患者、骨髓瘤细胞系、CAR-T细胞 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1例CAR-T治疗后复发患者及未接受CAR-T治疗的MM患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 4450 | 2025-10-06 | Targeting IGF1-Induced Cellular Senescence to Rejuvenate Hair Follicle Aging 
          2025-Jul, Aging cell
          
          IF:8.0Q1
          
         
          DOI:10.1111/acel.70053
          PMID:40159808
         | 研究论文 | 本研究揭示了IGF-1信号通路通过诱导毛囊干细胞衰老调控毛发老化的机制,并提出了针对性的干预策略 | 首次发现皮肤中IGF-1水平随年龄显著增加,并通过转基因模型证实过量IGF-1会触发毛囊干细胞衰老,同时验证了多种干预策略的有效性 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需要进一步验证;干预策略的长期效果和安全性需进一步评估 | 探究IGF-1信号通路在毛囊老化过程中的作用机制及潜在治疗策略 | 小鼠模型(包括转基因小鼠)和人类皮肤样本 | 细胞生物学 | 毛发老化 | 单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 4451 | 2025-10-06 | Pyrroloquinoline Quinone Reprograms the Single-Cell Landscape of Immune Aging in Hematopoietic Immune System 
          2025-Jul, Aging cell
          
          IF:8.0Q1
          
         
          DOI:10.1111/acel.70050
          PMID:40192736
         | 研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了吡咯喹啉醌在重编程造血免疫系统衰老单细胞景观中的作用 | 首次在单细胞水平系统阐明PQQ通过调控ASPP1、Yy1和CD62L等关键分子靶点逆转免疫衰老的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床应用效果仍需进一步验证 | 探究PQQ对造血免疫系统衰老的调控作用及分子机制 | 小鼠脾脏和骨髓免疫细胞 | 单细胞生物学 | 免疫衰老 | 单细胞RNA测序 | 机器学习程序 | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 4452 | 2025-10-06 | Deciphering Immunosenescence From Child to Frailty: Transcriptional Changes, Inflammation Dynamics, and Adaptive Immune Alterations 
          2025-Jul, Aging cell
          
          IF:8.0Q1
          
         
          DOI:10.1111/acel.70082
          PMID:40285422
         | 研究论文 | 通过整合分析儿童至衰弱老年人的PBMC转录组数据,揭示免疫衰老的复杂动态变化 | 首次结合bulk-cell和单细胞RNA-seq数据,系统描绘从儿童到衰弱老年人全年龄段的免疫衰老轨迹 | 样本年龄跨度大但具体样本数量未明确说明,缺乏功能验证实验 | 研究年龄相关的免疫系统变化,特别是免疫衰老过程 | 外周血单个核细胞(PBMCs),涵盖从儿童到衰弱老年人的不同年龄段人群 | 生物信息学 | 老年疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 从儿童到衰弱老年人的PBMC样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 4453 | 2025-10-06 | C-COUNT: a convolutional neural network-based tool for automated scoring of erythroid colonies 
          2025-Jul, Experimental hematology
          
          IF:2.5Q3
          
         
          DOI:10.1016/j.exphem.2025.104786
          PMID:40287006
         | 研究论文 | 开发基于卷积神经网络的自动化红细胞集落计数工具C-COUNT | 首次将卷积神经网络应用于红细胞集落形成单位(CFU-e)检测的自动化评分 | 未明确说明模型在更广泛实验条件下的泛化能力 | 解决红细胞集落形成检测中人工计数耗时且易出错的问题 | 红细胞集落形成单位(CFU-e)集落 | 计算机视觉 | 血液疾病 | 自动显微镜成像 | CNN | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 4454 | 2025-10-06 | Spatial Analysis Identifies CD147 as a Novel Marker of High-Grade Childhood Posterior Fossa Ependymoma 
          2025-Jul, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
          
         
          DOI:10.1016/j.labinv.2025.104175
          PMID:40250710
         | 研究论文 | 通过空间表型分析发现CD147是儿童后颅窝高级别室管膜瘤的新型标志物 | 首次在儿童PFA-EPN中通过空间表型分析鉴定CD147作为高级别肿瘤的新型标志物,并揭示CD147+小胶质细胞在肿瘤进展中的关键作用 | 样本量较小(G2 n=5,G3 n=7),仅针对后颅窝A型室管膜瘤 | 研究儿童后颅窝室管膜瘤肿瘤微环境的空间异质性及其与肿瘤分级的关系 | 儿童后颅窝A型室管膜瘤(WHO 2级和3级)肿瘤样本 | 数字病理学 | 室管膜瘤 | 多重免疫荧光,单细胞RNA测序 | 空间表型分析 | 图像,基因表达数据 | 12例肿瘤样本(5例G2,7例G3) | NA | 空间表型分析,单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 4455 | 2025-10-06 | Asperosaponin VI Promotes Osteoporotic Fracture Healing by Targeting Piezo1 to Enhance the Coupling of LEPR+ BMSCs and PODXL+ ECs 
          2025-Jul, Phytotherapy research : PTR
          
          IF:6.1Q1
          
         
          DOI:10.1002/ptr.8523
          PMID:40393465
         | 研究论文 | 本研究揭示了Asperosaponin VI通过靶向Piezo1增强LEPR+ BMSCs与PODXL+ ECs的偶联,促进骨质疏松性骨折愈合 | 首次发现Asperosaponin VI可靶向Piezo1激活Piezo1/ERK1/2/YAP/VEGF信号通路,促进骨形成和血管生成的偶联 | 研究主要基于动物模型,临床转化效果需进一步验证 | 阐明骨质疏松性骨折的分子发病机制并开发新的治疗方案 | LEPR+骨髓间充质干细胞和PODXL+内皮细胞 | 分子生物学 | 骨质疏松性骨折 | 单细胞RNA测序,分子对接,CETSA,DARTS,三维培养,免疫荧光,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据 | 卵巢切除结合股骨骨折小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 4456 | 2025-10-06 | Role of Defense/Immunity Proteins in Non-Obstructive Azoospermia: Insights from Gene Expression and Single-Cell RNA Sequencing Analyses 
          2025-Jul, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
          
         
          DOI:10.1007/s43032-025-01916-5
          PMID:40537735
         | 研究论文 | 通过基因表达和单细胞RNA测序分析探讨防御/免疫蛋白在非梗阻性无精子症中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序确认免疫相关基因在睾丸不同细胞群体中的差异表达 | 研究基于现有数据集分析,需要进一步实验验证 | 探讨免疫失调在非梗阻性无精子症发病机制中的作用 | 非梗阻性无精子症患者睾丸组织和细胞 | 生物信息学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | 差异表达分析 | 基因表达数据 | 多个数据集中的睾丸组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 4457 | 2025-10-06 | Single-cell mutational burden distributions in birth-death processes 
          2025-Jul, PLoS computational biology
          
          IF:3.8Q1
          
         
          DOI:10.1371/journal.pcbi.1013241
          PMID:40623094
         | 研究论文 | 本文通过引入动力学矩阵分析单细胞突变负荷分布与位点频率谱、细胞分裂分布之间的关系 | 开发了新的数学框架——动力学矩阵,首次统一分析三种突变统计分布并推导了死亡情况下的近似表达式 | NA | 研究肿瘤细胞群体中突变积累的统计分布规律 | 肿瘤细胞群体的突变分布 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞测序 | 动力学矩阵 | 突变数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA | 
| 4458 | 2025-10-06 | Age-dependent accumulation of mitochondrial tRNA mutations in mouse kidneys linked to mitochondrial kidney diseases 
          2025-Jul, Nature aging
          
          IF:17.0Q1
          
         
          DOI:10.1038/s43587-025-00909-y
          PMID:40579478
         | 研究论文 | 本研究通过基因编辑技术创建携带线粒体tRNA突变的小鼠模型,揭示了这些突变在肾脏中的年龄依赖性积累规律及其与线粒体肾病的关系 | 首次利用DddA衍生的胞嘧啶碱基编辑器技术构建多种致病性线粒体tRNA突变小鼠模型,并结合多组学技术揭示肾脏不同细胞类型的异质性突变动态 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究线粒体DNA突变在衰老过程中的组织特异性积累模式及其与线粒体肾病的机制联系 | 携带三种不同致病性线粒体tRNA突变的基因编辑小鼠模型 | 生物医学 | 线粒体肾病 | DddA-derived cytosine base editor, mtscATAC-seq, 单细胞RNA测序, 空间增强分辨率组学测序 | 基因编辑小鼠模型 | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | 三种不同突变类型的小鼠模型 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 线粒体单细胞转座酶可及染色质测序(mtscATAC-seq) | 
| 4459 | 2025-10-06 | Identification of Prognostic Biomarkers in Gene Expression Profile of Neuroblastoma Via Machine Learning 
          2025-Jun, Pediatric discovery
          
         
          DOI:10.1002/pdi3.70009
          PMID:40666234
         | 研究论文 | 通过机器学习方法识别神经母细胞瘤基因表达谱中的预后生物标志物 | 提出了一种基于网络的整合机器学习方法,结合bulk和单细胞RNA测序数据发现神经母细胞瘤预后相关生物标志物 | NA | 识别神经母细胞瘤的预后生物标志物和治疗靶点 | 神经母细胞瘤基因表达数据 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 支持向量机 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 4460 | 2025-10-06 | Cross-expression meta-analysis of 695 brain samples reveals coordinated gene expression across spatially adjacent cells 
          2025-May-18, bioRxiv : the preprint server for biology
          
         
          DOI:10.1101/2024.09.17.613579
          PMID:39345494
         | 研究论文 | 通过695个脑样本的交叉表达元分析,揭示了空间相邻细胞间基因表达的协调机制 | 提出交叉表达概念,避免基因列表筛选或细胞类型注释,直接从空间相邻细胞中发现协调表达的基因对 | NA | 研究空间相邻细胞间基因表达的协调机制 | 成年小鼠脑组织样本 | 空间转录组学 | 帕金森病 | 空间转录组学 | 元分析网络 | 空间转录组数据 | 约2500万个细胞,695个样本 | NA | 空间转录组学 | NA | 8种不同技术平台 |