单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28196 篇文献，本页显示第 4441 - 4460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4441 | 2025-03-12 |
VCAM-1 mediates proximal tubule-immune cell cross talk in failed tubule recovery during AKI-to-CKD transition
2024-Oct-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00076.2024
PMID:39116349
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研究论文 | 本研究探讨了在急性肾损伤（AKI）向慢性肾病（CKD）转变过程中，血管细胞粘附蛋白-1（VCAM-1）在近端肾小管细胞中的表达及其在修复失败状态中的作用 | 首次揭示了VCAM-1在AKI向CKD转变过程中通过NF-κB信号通路介导近端肾小管与免疫细胞间的相互作用，促进修复失败状态 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，尚未在人体中进行验证 | 探讨VCAM-1在AKI向CKD转变过程中的作用机制 | 近端肾小管细胞和免疫细胞 | 肾脏病学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组分析、RNA测序、蛋白质分析 | NA | RNA测序数据、蛋白质数据 | AKI和CKD患者的单细胞转录组数据、小鼠模型的肾脏RNA和蛋白质数据 |
| 4442 | 2025-03-12 |
Age-related epithelial defects limit thymic function and regeneration
2024-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01915-9
PMID:39112630
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研究论文 | 本文通过单细胞和空间转录组学、谱系追踪和先进成像技术，定义了非造血基质细胞中与年龄相关的变化，并发现了两类非典型胸腺上皮细胞（aaTECs）状态的出现 | 发现了与年龄相关的胸腺上皮细胞（aaTECs）状态，这些细胞在胸腺髓质周围形成高密度的上皮簇，缺乏胸腺细胞，并表现出上皮-间质转化特征 | 未明确aaTECs在胸腺再生中的具体分子机制 | 研究胸腺随年龄增长的功能衰退和再生能力下降的原因 | 非造血基质细胞，特别是胸腺上皮细胞（TECs） | 免疫学 | 老年疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、谱系追踪、先进成像 | NA | 转录组数据、成像数据 | 未明确具体样本数量，但涉及年龄相关的胸腺组织 |
| 4443 | 2025-03-12 |
CD4+ T cells exhibit distinct transcriptional phenotypes in the lymph nodes and blood following mRNA vaccination in humans
2024-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-024-01888-9
PMID:39164479
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学评估了BNT162b2 mRNA疫苗接种后3个月和6个月时，血液和引流淋巴结中针对SARS-CoV-2刺突蛋白的CD4 T细胞反应 | 使用深度学习反向表位映射方法Trex预测抗原特异性，揭示了人类引流淋巴结中刺突特异性CD4滤泡辅助T细胞的异质性表型 | 研究样本量相对较小，仅分析了1,277个刺突特异性CD4 T细胞 | 研究SARS-CoV-2 mRNA疫苗接种后CD4 T细胞的转录表型变化 | 接种BNT162b2 mRNA疫苗的个体以及SARS-CoV-2感染后的个体 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学，深度学习反向表位映射方法Trex | 深度学习 | 单细胞转录组数据 | 1,277个刺突特异性CD4 T细胞 |
| 4444 | 2025-03-12 |
Comprehensive profiling of migratory primordial germ cells reveals niche-specific differences in non-canonical Wnt and Nodal-Lefty signaling in anterior vs posterior migrants
2024-Aug-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610420
PMID:39257761
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，全面分析了小鼠原始生殖细胞（PGCs）在迁移过程中的转录异质性及其与周围体细胞微环境的相互作用 | 揭示了前后迁移PGCs在非经典Wnt和Nodal-Lefty信号通路中的差异，并首次通过实验验证了前迁移PGCs中LEFTY1/2蛋白的特异性上调 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅通过重新分析已发表数据集进行推测，缺乏直接实验验证 | 研究原始生殖细胞在迁移过程中的转录异质性及其与体细胞微环境的相互作用 | 小鼠原始生殖细胞（PGCs）及其周围体细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 13,262个小鼠PGCs和7,868个周围体细胞 |
| 4445 | 2025-03-12 |
Scupa: Single-cell unified polarization assessment of immune cells using the single-cell foundation model
2024-Aug-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.15.608093
PMID:39229048
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Scupa的计算方法，用于全面分析免疫细胞的极化状态 | Scupa是首个用于系统性研究细胞因子效应和免疫细胞极化的计算方法，利用Universal Cell Embeddings模型的细胞嵌入，有效识别不同物种和实验条件下新数据集中的极化细胞 | NA | 开发一种计算方法以系统性研究细胞因子效应和免疫细胞极化 | 免疫细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Universal Cell Embeddings模型 | 单细胞RNA测序数据 | 66种细胞因子驱动的极化状态，涉及14种免疫细胞类型 |
| 4446 | 2025-03-12 |
Enhanced Complement Expression in the Tumor Microenvironment Following Neoadjuvant Therapy: Implications for Immunomodulation and Survival in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2024-May-13, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4104258/v1
PMID:38798691
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研究论文 | 本研究探讨了新辅助治疗（NAT）对胰腺导管腺癌（PDAC）癌细胞和肿瘤微环境（TME）的差异影响，特别是补体基因表达的变化及其与患者生存率的关系 | 首次揭示了NAT在PDAC中通过上调TME中的补体基因表达，改善免疫抑制状态，并与患者生存率提高相关 | 样本量相对较小（23例NAT治疗患者和13例未治疗患者），且需要进一步验证补体基因表达作为预后标志物的临床实用性 | 研究NAT对PDAC癌细胞和TME的差异影响，特别是补体基因表达的变化及其与患者生存率的关系 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者 | 肿瘤学 | 胰腺癌 | 空间转录组学、单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 23例NAT治疗患者和13例未治疗患者 |
| 4447 | 2025-03-12 |
Molecular differences between neonatal and adult stria vascularis from organotypic explants and transcriptomics
2024-Apr-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.24.590986
PMID:38712156
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研究论文 | 本研究通过开发新生和成年小鼠的完整组织外植模型，结合单细胞RNA测序技术，揭示了耳蜗血管纹（SV）在新生和成年阶段的分子差异，为SV相关听力损失的研究提供了新的视角 | 开发了新生和成年小鼠的完整组织外植模型，并结合单细胞RNA测序技术揭示了SV在新生和成年阶段的分子差异，为SV研究提供了新的平台和方法 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类SV的生物学特性 | 研究耳蜗血管纹（SV）在新生和成年阶段的分子差异，以探索SV相关听力损失的生物学解决方案 | 新生和成年小鼠的耳蜗血管纹（SV） | 生物医学研究 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | 小鼠组织外植模型 | RNA测序数据 | 新生和成年小鼠的耳蜗血管纹（SV）组织 |
| 4448 | 2025-03-12 |
Seq-Scope Protocol: Repurposing Illumina Sequencing Flow Cells for High-Resolution Spatial Transcriptomics
2024-Apr-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.29.587285
PMID:38617262
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Seq-Scope的新技术，该技术重新利用Illumina测序平台进行高分辨率、高内容的空间转录组分析 | Seq-Scope技术通过重新利用Illumina测序平台，克服了传统空间转录组技术在分辨率、基因范围、可扩展性、成本及设备复杂性方面的限制 | 尽管Seq-Scope技术具有显著优势，但其应用仍受限于需要复杂的实验步骤和计算分析流程 | 开发并优化一种高分辨率、高内容的空间转录组分析技术，以克服现有技术的限制 | 多种生物组织的冷冻切片 | 分子生物学与组织学 | NA | Illumina NovaSeq 6000测序平台 | NA | 转录组数据与组织学图像 | 7 mm × 7 mm或更大的多个组织切片 |
| 4449 | 2025-03-12 |
Multi-omics analyses reveal bacteria and catalase associated with keloid disease
2024-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104904
PMID:38061241
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了细菌和过氧化氢酶（CAT）与瘢痕疙瘩病的关联 | 首次结合微生物组、代谢组、单细胞转录组和细胞来源异种移植（CDX）小鼠模型，全面探讨了细菌在瘢痕疙瘩病中的作用 | 研究主要基于实验室模型和小鼠实验，尚未在人体中进行大规模验证 | 探讨细菌和过氧化氢酶在瘢痕疙瘩病中的角色 | 瘢痕疙瘩和健康皮肤 | 生物医学 | 瘢痕疙瘩病 | 多组学分析（微生物组、代谢组、单细胞转录组）、16S rRNA测序、蛋白质质谱、细胞来源异种移植（CDX）模型 | CDX小鼠模型 | 微生物组数据、蛋白质质谱数据、单细胞RNA测序数据 | 瘢痕疙瘩和健康皮肤样本，BALB/c雌性裸鼠 |
| 4450 | 2025-03-12 |
A longitudinal molecular and cellular lung atlas of lethal SARS-CoV-2 infection in K18-hACE2 transgenic mice
2024-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2023.104932
PMID:38118400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，详细分析了K18-hACE2转基因小鼠在SARS-CoV-2感染期间的肺组织分子和细胞反应 | 首次在K18-hACE2转基因小鼠模型中，利用单细胞RNA测序技术全面解析了SARS-CoV-2感染引起的肺组织病理变化和细胞动态反应 | 研究仅限于K18-hACE2转基因小鼠模型，可能无法完全模拟人类SARS-CoV-2感染的复杂性 | 探究SARS-CoV-2感染在肺组织中的分子和细胞机制，以期为COVID-19的诊断和治疗提供新思路 | K18-hACE2转基因小鼠的肺组织 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | K18-hACE2转基因小鼠模型 | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量，但使用了K18-hACE2转基因小鼠的肺组织 |
| 4451 | 2025-03-12 |
CD8+ lymphocytes are critical for early control of tuberculosis in macaques
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230707
PMID:37843832
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研究论文 | 本文研究了CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的功能作用，通过去除猕猴中的先天和/或适应性CD8+淋巴细胞，展示了CD8α+细胞的缺失如何显著影响结核分枝杆菌感染的早期控制 | 首次在猕猴模型中系统地展示了CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的关键作用，并揭示了CD8+淋巴细胞的多功能细胞毒性反应作为疫苗靶点的潜力 | 研究仅限于猕猴模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的功能作用 | 猕猴 | 免疫学 | 结核病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 生物样本数据 | 猕猴样本 |
| 4452 | 2025-03-12 |
Severe COVID-19 is associated with fungal colonization of the nasopharynx and potent induction of IL-17 responses in the nasal epithelium
2022-Oct-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.10.25.22281528
PMID:36324802
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研究论文 | 本文探讨了严重COVID-19患者中真菌定植与鼻咽部IL-17反应增强的关联 | 通过单细胞RNA测序技术，揭示了严重COVID-19患者中真菌定植与IL-17刺激的免疫特征之间的关系 | 研究样本量有限，且未涵盖所有COVID-19严重程度的患者 | 研究严重COVID-19患者中真菌定植的频率及其与特定免疫反应的关联 | 严重COVID-19患者 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 一组严重COVID-19患者 |
| 4453 | 2025-03-12 |
CD4+ T-Cell Dysfunction in Severe COVID-19 Disease Is Tumor Necrosis Factor-α/Tumor Necrosis Factor Receptor 1-Dependent
2022-06-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202111-2493OC
PMID:35348444
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研究论文 | 本文研究了严重COVID-19患者中CD4+ T细胞功能障碍与肿瘤坏死因子-α（TNF-α）/肿瘤坏死因子受体1（TNF receptor 1）依赖性的关系 | 研究发现严重COVID-19患者中CD4+ T细胞功能障碍与TNF-α/TNF receptor 1依赖性相关，并证明TNF-α阻断剂可以挽救S1特异性CD4 T细胞增殖并减少细胞死亡 | 研究样本量有限，且未涉及其他潜在免疫机制的影响 | 探讨严重COVID-19患者中T细胞功能障碍的免疫机制 | 严重COVID-19患者和轻度COVID-19患者的T细胞反应 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据、RNA测序数据 | 148名严重COVID-19患者 |
| 4454 | 2025-03-12 |
Multimodal profiling of lung granulomas in macaques reveals cellular correlates of tuberculosis control
2022-05-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.04.004
PMID:35483355
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研究论文 | 本文通过多模态分析揭示了猕猴肺肉芽肿中结核病控制的细胞相关性 | 通过结合纵向PET-CT成像、单细胞RNA测序和细菌清除测量，首次定义了结核病肉芽肿中细菌控制的复杂多细胞生态系统 | 研究仅限于猕猴模型，可能不完全适用于人类结核病 | 揭示结核病肉芽肿中细菌控制的细胞相关性，为开发新的疫苗和治疗策略提供依据 | 猕猴肺肉芽肿 | 数字病理 | 结核病 | 纵向PET-CT成像、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA测序数据 | 猕猴肺肉芽肿样本 |
| 4455 | 2025-03-12 |
SARS-CoV-2 Receptor ACE2 Is an Interferon-Stimulated Gene in Human Airway Epithelial Cells and Is Detected in Specific Cell Subsets across Tissues
2020-05-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.04.035
PMID:32413319
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研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2的受体ACE2在人类气道上皮细胞中的表达及其在不同组织细胞亚群中的分布 | 发现ACE2是人类干扰素刺激基因（ISG），并揭示了其在肺、回肠和鼻黏膜特定细胞亚群中的共表达 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏直接的实验验证 | 理解SARS-CoV-2的致病机制及其受体ACE2的表达调控 | 人类、非人类灵长类动物和小鼠的气道上皮细胞及组织细胞亚群 | 分子生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 人类、非人类灵长类动物和小鼠的组织样本 |
| 4456 | 2025-03-11 |
TREM2 as a Therapeutic Target in Atherosclerosis
2025-Apr, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12279
PMID:39891588
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review | 本文回顾了TREM2从基础研究到作为动脉粥样硬化治疗靶点的历程，并探讨了其临床应用的可能性 | 揭示了TREM2在泡沫巨噬细胞存活和动脉粥样硬化进展中的重要性，并提出了TREM2作为治疗靶点的潜力 | NA | 探讨TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的可行性和临床应用前景 | 动脉粥样硬化中的泡沫巨噬细胞和TREM2表达 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4457 | 2025-03-11 |
Spatial-Temporal Diversity of Extrachromosomal DNA Shapes Urothelial Carcinoma Evolution and Tumor-Immune Microenvironment
2025-Mar-11, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1532
PMID:40062518
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研究论文 | 本文通过计算分析方法研究了595例尿路上皮癌（UC）患者全基因组测序数据中的染色体外DNA（ecDNA），揭示了ecDNA在肿瘤进化和免疫微环境中的作用 | 首次系统性地分析了ecDNA在尿路上皮癌中的时空多样性及其对肿瘤进化和免疫微环境的影响，揭示了ecDNA通过结构重排驱动克隆进化的机制 | 研究主要基于尿路上皮癌患者的数据，可能不适用于其他类型的癌症 | 研究ecDNA在尿路上皮癌中的时空多样性及其对肿瘤进化和免疫微环境的影响 | 595例尿路上皮癌患者的全基因组测序数据 | 基因组学 | 尿路上皮癌 | 全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、RNA数据 | 595例尿路上皮癌患者 |
| 4458 | 2025-03-11 |
Characterizing the Cellular Constituents of Proximal Airway Disease in Granulomatosis With Polyangiitis
2025-Mar-10, Otolaryngology--head and neck surgery : official journal of American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery
DOI:10.1002/ohn.1197
PMID:40062629
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了肉芽肿性多血管炎（GPA）患者近端气道黏膜的细胞组成，揭示了GPA风险基因在免疫细胞中的表达定位 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细描述了GPA患者近端气道黏膜的细胞组成，并发现了一种仅存在于GPA中的CD4-/CD8-炎症性T细胞亚群 | 研究样本量较小（GPA n=9，iSGS n=7，PIPS n=5，对照 n=10），且仅在单一三级医疗中心进行，可能限制结果的普遍性 | 旨在揭示GPA患者近端气道疾病的细胞组成及其病理机制 | GPA患者、特发性声门下狭窄（iSGS）患者、插管后近端狭窄（PIPS）患者及对照组的近端气道样本 | 数字病理学 | 肉芽肿性多血管炎 | 单细胞RNA测序 | Monocle 3 | RNA测序数据 | GPA n=9，iSGS n=7，PIPS n=5，对照 n=10 |
| 4459 | 2025-03-11 |
Spatially separated epithelium-associated and lamina propria neutrophils present distinct functional identities in the inflamed colon mucosa
2025-Mar-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.02.008
PMID:40057307
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研究论文 | 本文研究了炎症性肠病（IBD）中结肠黏膜内不同空间位置的中性粒细胞（PMNs）的功能差异 | 首次揭示了结肠黏膜中不同空间位置的中性粒细胞（LPNs和EANs）具有不同的功能特性，并发现EANs可能作为疾病驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的单细胞RNA测序，可能无法完全反映人类IBD的复杂性 | 探讨炎症性肠病（IBD）中结肠黏膜内不同空间位置的中性粒细胞的功能差异及其临床意义 | 结肠黏膜中的中性粒细胞（PMNs），特别是位于固有层黏膜（LPNs）和隐窝上皮（EANs）的中性粒细胞 | 生物医学研究 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间RNA转录组学，实时活体成像 | NA | RNA测序数据，活体成像数据 | 小鼠模型和人类IBD患者样本 |
| 4460 | 2025-03-11 |
Neoplastic immune mimicry potentiates breast tumor progression
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633673
PMID:39896558
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研究论文 | 本文探讨了乳腺癌进展中肿瘤细胞通过去分化程序增强适应性，并发现部分去分化的肿瘤细胞表达白细胞表面受体蛋白，称为“免疫拟态” | 首次提出并验证了乳腺癌细胞通过表达白细胞表面受体蛋白进行免疫拟态的现象，并发现这种拟态与肿瘤的侵袭性和治疗抵抗性相关 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和细胞系模型，尚未在更大规模的临床样本中进行验证 | 研究乳腺癌进展中肿瘤细胞的去分化及其对肿瘤侵袭性和治疗抵抗性的影响 | 乳腺癌细胞、人类乳腺癌单细胞RNA测序数据集、乳腺癌细胞系、小鼠转基因和细胞系来源的乳腺肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、组织病理学样本 | 公共人类乳腺癌单细胞RNA测序数据集、乳腺癌细胞系、小鼠模型 |