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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4421 | 2025-10-06 |
Integrative multiomics elucidate crotonylation-associated GCDH in Parkinson's disease pathogenesis via metabolome remodeling
2025-Jul-10, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10151-x
PMID:40640550
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研究论文 | 通过整合多组学方法阐明巴豆酰化相关基因GCDH通过代谢组重塑在帕金森病发病机制中的作用 | 首次将孟德尔随机化与中介分析相结合,系统揭示GCDH通过代谢物介导的巴豆酰化调控网络在帕金森病中的因果机制 | 研究主要基于公共数据库和已有数据集,缺乏实验验证 | 阐明巴豆酰化及其代谢组调控网络在帕金森病发病机制中的作用 | 巴豆酰化相关基因、代谢物和帕金森病患者脑组织 | 生物信息学 | 帕金森病 | 孟德尔随机化分析、中介分析、单细胞转录组分析 | 两样本MR分析、两步MR分析 | 基因表达数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 | eQTLGen数据集、GEO单细胞转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4422 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Hair Cell-Specific Molecular Responses to Polystyrene Nanoplastics in a Zebrafish Embryo Model
2025-Jul-10, Biotechnology and applied biochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/bab.70028
PMID:40641182
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了斑马鱼胚胎中毛细胞对聚苯乙烯纳米塑料的特异性分子响应 | 首次在单细胞水平揭示纳米塑料对斑马鱼毛细胞的特异性分子影响,发现细胞类型比例变化和特定基因上调 | 仅使用环境相关浓度,未观察到大体表型变化,对长期生态影响评估有限 | 探究聚苯乙烯纳米塑料对斑马鱼胚胎的生理和分子影响 | 斑马鱼胚胎 | 单细胞组学 | 环境毒理学 | 单细胞RNA测序,表型分析 | NA | 单细胞转录组数据,表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4423 | 2025-10-06 |
Sjögren's syndrome is associated with a reduction in the surface area of the right caudal anterior cingulate gyrus
2025-Jul-09, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-025-04205-9
PMID:40629343
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析和脑部MRI验证,发现干燥综合征与右侧尾侧前扣带皮层表面积减少存在遗传因果关系 | 首次使用孟德尔随机化方法证明干燥综合征对大脑皮层结构的因果影响,并识别出相关的基因和细胞类型 | 样本量有限,仅针对初治患者进行研究,需要更大规模的研究验证 | 探究干燥综合征对大脑皮层结构的影响及其机制 | 干燥综合征患者的大脑皮层结构 | 神经科学 | 干燥综合征 | 孟德尔随机化分析, GWAS, TWAS, scRNA-seq, 脑部MRI | 逆方差加权, MR-Egger, 加权中位数, 线性模型 | 基因组数据, 转录组数据, 脑部影像数据 | 初治干燥综合征患者群体 | NA | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因型-组织表达数据库v8版 |
4424 | 2025-10-06 |
Distinct roles of HMOX1 on tumor epithelium and macrophage for regulation of immune microenvironment in ovarian cancer
2025-Jul-09, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002829
PMID:40638251
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研究论文 | 本研究揭示了铁死亡相关基因HMOX1在卵巢癌免疫微环境调控中的双重作用机制 | 首次发现HMOX1在卵巢癌细胞和巨噬细胞中具有相反表达模式,并通过不同信号通路共同促进免疫抑制微环境形成 | 研究主要基于卵巢癌模型,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 阐明铁死亡相关因子在调节免疫微环境中的双重作用机制 | 卵巢癌肿瘤微环境中的上皮细胞和巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 蛋白质印迹, 多重免疫组织化学, 小鼠模型 | Cox回归, Kaplan-Meier | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 来自多个数据库的卵巢癌样本(TCGA、GTEx、GEO等) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4425 | 2025-10-06 |
Chronic cerebral hypoperfusion induces venous dysfunction via EPAS1 regulation in mice
2025-Jul-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61614-3
PMID:40628749
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研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了慢性脑灌注不足通过EPAS1调控导致静脉功能异常的机制 | 首次发现EPAS1在静脉细胞中的特异性信号传导及其在脑血管功能障碍中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类验证数据有限 | 探究慢性脑灌注不足导致血管性痴呆的分子机制 | 小鼠模型和人类细胞模型 | 神经科学 | 血管性痴呆 | 单细胞转录组测序, 成像技术 | NA | 基因表达数据, 影像数据 | 小鼠模型和人类细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4426 | 2025-10-06 |
Identifying propionate metabolism-related genes as biomarkers of sepsis development and therapeutic targets
2025-Jul-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06463-2
PMID:40628770
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析脓毒症患者外周血单核细胞中丙酸代谢差异,并构建诊断模型 | 首次在单细胞水平揭示脓毒症中丙酸代谢的异质性,发现浆细胞可分为高/低丙酸代谢亚群,并鉴定出13个关键诊断基因 | 机制研究仍需进一步实验验证,样本量相对有限 | 探索丙酸代谢在脓毒症发病机制中的作用,寻找诊断生物标志物和治疗靶点 | 脓毒症患者和健康对照的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | LASSO, XGBoost, CatBoost, NGBoost | 基因表达数据 | 脓毒症患者和健康对照的外周血单核细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4427 | 2025-10-06 |
Thioredoxin regulates T cell proliferation and aggravates the severity of influenza a virus infection
2025-Jul-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10676-w
PMID:40629048
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研究论文 | 本研究通过多组学方法发现硫氧还蛋白(TXN)是甲型流感病毒(IAV)感染中T细胞增殖的关键靶基因 | 首次结合转录组和单细胞转录组分析鉴定TXN在增殖性T细胞中的特异性高表达及其与IAV感染的关联 | 未明确解释IAV感染后T细胞发育是否受到负向调控 | 探索IAV感染过程中T细胞的免疫变化及相关靶基因 | T淋巴细胞 | 免疫学 | 流感病毒感染 | 多组学方法,转录组分析,单细胞转录组分析,差异分析,WGCNA,Friends分析 | NA | 转录组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4428 | 2025-10-06 |
CAF-derived GLUT1 and its role in modulating ovarian cancer progression: a multi-dimensional analysis of the tumor microenvironment
2025-Jul-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08380-6
PMID:40629043
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研究论文 | 本研究通过多维度分析揭示了卵巢癌微环境中癌症相关成纤维细胞高表达GLUT1并通过代谢重编程促进肿瘤进展的机制 | 首次发现GLUT1在CAFs中的关键代谢调控作用,并通过单细胞测序和3D生物打印模型验证其在肿瘤微环境重塑中的功能 | 未明确GLUT1在CAFs中高表达的具体上游调控机制 | 解析卵巢癌微环境中癌症相关成纤维细胞的葡萄糖代谢重编程及其在肿瘤进展中的作用 | 卵巢癌微环境中的癌症相关成纤维细胞和卵巢癌细胞 | 肿瘤代谢 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 3D生物打印 | 3D生物打印模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4429 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis links DCUN1D5 to immune remodeling and cisplatin resistance in recurrent osteosarcoma
2025-Jul-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08409-w
PMID:40629059
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示DCUN1D5在复发性骨肉瘤免疫重塑和顺铂耐药中的作用机制 | 首次通过整合多个单细胞RNA测序数据集,发现DCUN1D5基因通过促进破骨前体细胞成熟驱动骨肉瘤复发和顺铂耐药 | NA | 探究骨肉瘤复发和顺铂耐药的分子机制,特别关注肿瘤微环境的作用 | 骨肉瘤患者样本和细胞系 | 单细胞分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4430 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics reveals the cellular heterogeneity of vestibular schwannoma
2025-Jul-08, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01028-y
PMID:40629113
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研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术揭示了前庭神经鞘瘤的细胞异质性 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,识别出VEGFA富集的雪旺细胞亚型并验证其空间定位 | 样本量较小(3例单细胞测序样本和2例空间转录组样本),研究结果需要更大样本验证 | 探索前庭神经鞘瘤的发育机制和空间异质性 | 前庭神经鞘瘤组织样本 | 数字病理学 | 前庭神经鞘瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 5例前庭神经鞘瘤样本(3例用于scRNA-seq,2例用于空间转录组学) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4431 | 2025-10-06 |
Mechanistic study of CTHRC1 in promoting Wilms' tumor progression by regulating M2-type tumor-associated macrophages polarization
2025-Jul-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06752-4
PMID:40629408
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研究论文 | 本研究揭示CTHRC1通过TNFSF9-TNFRSF9轴调控M2型肿瘤相关巨噬细胞极化促进肾母细胞瘤进展的分子机制 | 首次发现CTHRC1通过TNFSF9-TNFRSF9轴调控M2-TAMs极化,并阐明M2-TAMs通过PI3K/Akt通路促进肾母细胞瘤恶性进展的双向作用机制 | NA | 探究CTHRC1在肾母细胞瘤进展中的作用及其通过调控M2-TAMs极化的分子机制 | 肾母细胞瘤组织、肿瘤细胞、M2型肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肾母细胞瘤 | 生物信息学分析、单细胞测序、RT-qPCR、Western blot、免疫组化、免疫荧光、转录组测序、中和抗体拯救实验、共定位分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质表达数据、免疫细胞浸润数据 | NA | NA | 单细胞测序,转录组测序 | NA | NA |
4432 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers and exploration of mechanisms for atopic dermatitis based on transcriptome and scRNA-seq data analysis
2025-Jul-04, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042291
PMID:40629565
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研究论文 | 通过转录组和单细胞RNA测序数据分析鉴定特应性皮炎的生物标志物并探索其致病机制 | 结合转录组和单细胞RNA测序数据,首次系统鉴定特应性皮炎的关键基因并确定角质形成细胞为关键细胞类型 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 鉴定特应性皮炎的生物标志物并探索其致病机制 | 特应性皮炎患者样本 | 生物信息学 | 特应性皮炎 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | PPI网络分析, MCC算法, 度算法, ROC分析 | 基因表达数据 | 数据集GSE16161和GSE32924(转录组), GSE180885(单细胞RNA测序) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
4433 | 2025-10-06 |
Large-Scale Production of Expandable Hepatoblast Organoids and Polarised Hepatocyte Organoids From hESCs Under 3D Static and Dynamic Suspension Conditions
2025-Jul, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70001
PMID:39921573
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研究论文 | 开发了一种在3D悬浮条件下从人胚胎干细胞大规模生产可扩展肝祖细胞类器官和极化肝细胞类器官的新方法 | 利用低浓度基质胶支持的3D悬浮培养系统,首次实现了人胚胎干细胞来源的可扩展肝祖细胞类器官和成熟极化肝细胞类器官的大规模生产 | NA | 建立大规模生产功能性肝细胞的技术平台 | 人胚胎干细胞(hESCs)、肝祖细胞类器官(HB-orgs)、极化肝细胞类器官(P-hep-orgs) | 干细胞生物学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 功能分析 | NA | 基因表达数据, 功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4434 | 2025-10-06 |
Klotho Regulates Club Cell Senescence and Differentiation in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jul, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70000
PMID:39930762
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研究论文 | 本研究探讨Klotho蛋白在慢性阻塞性肺疾病中调控Clara细胞衰老和分化的机制 | 首次揭示Klotho通过hnRNPA2/B1调控Clara细胞衰老,并发现neddylation是导致hnRNPA2/B1下调的关键因素 | 研究主要基于动物模型和体外实验,在人体中的直接验证尚不充分 | 阐明Klotho蛋白在COPD发病机制中对Clara细胞衰老和分化的调控作用 | COPD患者肺组织、香烟烟雾诱导的COPD小鼠模型、Clara细胞 | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, SA-β-gal染色, 基因敲除, 基因过表达 | NA | 单细胞转录组数据, 组织学图像 | COPD患者肺组织和香烟烟雾诱导的COPD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4435 | 2025-10-06 |
IGF2BP2 binding to CPSF6 facilitates m6A-mediated alternative polyadenylation of PUM2 and promotes malignant progression in ovarian cancer
2025-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70388
PMID:40629911
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研究论文 | 本研究揭示了m6A通过IGF2BP2与CPSF6相互作用调控PUM2基因选择性多聚腺苷化的新机制,促进卵巢癌恶性进展 | 首次发现m6A通过IGF2BP2与CPSF6的相互作用调控选择性多聚腺苷化,介导PUM2基因3'UTR缩短并促进卵巢癌进展 | 研究主要聚焦于卵巢癌,机制在其他癌症中的普适性需要进一步验证 | 探索m6A与选择性多聚腺苷化在卵巢癌中的调控机制及其在肿瘤恶性进展中的作用 | 卵巢癌细胞系和临床样本 | 分子生物学 | 卵巢癌 | RNA甲基化测序,单细胞测序,RNA pull-down,免疫沉淀,质谱分析,Western blot,蛋白纯化,GST pull-down,PAS-seq,eCLIP-seq,RIP-seq,meRIP-seq,RT-qPCR,3'RACE,RNA稳定性检测,双荧光素酶报告基因检测 | NA | RNA测序数据,蛋白质相互作用数据,基因表达数据 | 卵巢癌细胞系和公共数据库中的临床样本 | NA | 单细胞测序,RNA测序,CLIP-seq,RIP-seq,meRIP-seq | NA | NA |
4436 | 2025-10-06 |
Underlining the Molecular Mechanism of Nonalcoholic Fatty Liver Disease and Coronary Artery Disease in Lipid Metabolism by Combining Multiple Sets of Data Sets
2025-Jul, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70040
PMID:40631874
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研究论文 | 通过整合多组数据集揭示非酒精性脂肪肝病与冠状动脉疾病在脂质代谢中的共同分子机制 | 首次通过整合多组数据集识别出GPD1、MVK和PIK3R2三个关键基因在NAFLD和CAD脂质代谢中的共同作用 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 阐明非酒精性脂肪肝病与冠状动脉疾病在脂质代谢中的共享遗传特征和分子机制 | 非酒精性脂肪肝病和冠状动脉疾病患者相关基因数据 | 生物信息学 | 非酒精性脂肪肝病,冠状动脉疾病 | 单细胞测序,生物信息学分析 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4437 | 2025-10-06 |
Investigating the dynamic signaling pathways involved in the specialization and differentiation of epiblast cells in early human embryos
2025-Jun-26, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.05.014
PMID:40581241
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研究论文 | 通过分析人类胚胎单细胞RNA测序数据,研究胚外组织信号对上皮细胞发育的调控机制 | 首次系统揭示BMP、WNT、FGF等多条信号通路在人类胚胎上皮细胞特化和分化过程中的动态调控网络 | 研究结果基于RNA表达模式推断,需要蛋白质水平和功能实验进一步验证 | 探究人类胚胎早期发育过程中胚外组织与上皮细胞间的信号通讯机制 | 人类早期胚胎(植入前、植入后、原肠胚形成前和早期原肠胚形成阶段) | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涵盖人类胚胎多个发育阶段的单细胞数据 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
4438 | 2025-10-06 |
Single-cell RNAseq of Angiotensin II-induced abdominal aortic tissue identifies aneurysm-associated cell clusters in C57BL/6J mice
2025-05-28, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20241235
PMID:40440080
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析血管紧张素II诱导的小鼠腹主动脉瘤组织,识别与动脉瘤相关的关键细胞群 | 首次在腹主动脉瘤中发现由内皮细胞转化的特殊细胞群(恶性ECs),并揭示Cxcl12-Cxcr4/Ackr3炎症轴在动脉瘤形成中的作用 | 研究仅使用C57BL/6J小鼠模型,样本量有限(不同年龄组样本数为21和7) | 探究腹主动脉瘤形成过程中起关键作用的特定细胞群 | C57BL/6J小鼠的腹主动脉组织 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 28只C57BL/6J小鼠(14周龄21只,32周龄7只) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4439 | 2025-10-06 |
Study on the mechanism of action of the active ingredient of Calculus Bovis in the treatment of sepsis by integrating single-cell sequencing and machine learning
2025-Apr-18, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042184
PMID:40258762
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研究论文 | 本研究整合单细胞测序和机器学习方法探究牛黄活性成分治疗脓毒症的作用机制 | 首次结合网络药理学、RNA测序、单细胞测序和多种机器学习模型系统研究牛黄治疗脓毒症的分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证 | 探究牛黄活性成分治疗脓毒症的分子作用机制 | 脓毒症相关基因和牛黄活性成分靶点 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 | XGBoost,SVM,Decision Tree,KNN | 基因表达数据 | 来自中国国家基因库数据库和GSE65682数据库的样本 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
4440 | 2025-10-06 |
FLASH radiation reprograms lipid metabolism and macrophage immunity and sensitizes medulloblastoma to CAR-T cell therapy
2025-Mar, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00905-6
PMID:39910249
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研究论文 | 本研究揭示FLASH放疗通过重编程巨噬细胞脂质代谢逆转肿瘤免疫抑制,并增强CAR-T细胞疗法对髓母细胞瘤的疗效 | 首次发现FLASH放疗通过调节脂质代谢影响巨噬细胞免疫表型,并证明其与CAR-T细胞疗法的协同作用 | 研究基于基因工程小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索FLASH放疗对肿瘤免疫的影响及其与CAR-T细胞疗法的联合治疗效果 | 髓母细胞瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组分析 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |