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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4421 | 2026-04-03 |
A Role for Protease Activated Receptor Type 3 (PAR3) in Nociception Demonstrated Through Development of a Novel Peptide Agonist
2021-06, The journal of pain
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jpain.2020.12.006
PMID:33429107
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研究论文 | 本研究通过开发一种新型肽激动剂C660,探讨了蛋白酶激活受体3(PAR3)在痛觉感知中的作用 | 开发了选择性激活PAR3的脂质锚定激动剂C660,并首次在体内证明了PAR3对机械超敏和痛觉可塑性的贡献 | 研究主要基于小鼠模型,PAR3在人类痛觉中的具体作用仍需进一步验证 | 探究PAR3在外周感觉神经系统中的功能及其在痛觉调节中的作用 | 小鼠背根神经节神经元和三叉神经神经元 | 神经科学 | 疼痛相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠背根神经节神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4422 | 2026-04-03 |
Circulating testican-2 is a podocyte-derived marker of kidney health
2020-10-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2009606117
PMID:32958645
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研究论文 | 本文通过蛋白质组学分析发现循环中的testican-2是一种足细胞来源的肾脏健康生物标志物 | 首次发现testican-2在肾脏健康中的关键作用,证明其可作为肾脏功能和预后的新型生物标志物 | 研究样本量相对有限,且主要基于观察性研究,需要进一步验证其因果关系 | 探索肾脏释放到循环中的分子是否能够反映肾脏健康状况 | 人类肾脏组织、循环蛋白质、足细胞 | 生物医学研究 | 肾脏疾病 | 适体蛋白质组学、单细胞RNA测序、免疫组化、免疫荧光、电子显微镜 | NA | 蛋白质组数据、基因表达数据、影像数据 | 22名接受侵入性采样的个体,Jackson心脏研究(1,928名非裔美国人),Framingham心脏研究(1,621名白人) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4423 | 2026-04-03 |
Prospective isolation of chondroprogenitors from human iPSCs based on cell surface markers identified using a CRISPR-Cas9-generated reporter
2020-02-18, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-020-01597-8
PMID:32070421
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9生成的报告基因系统,识别并分离了人诱导多能干细胞中表达特定表面标志物的软骨祖细胞亚群 | 首次利用CRISPR-Cas9编辑的COL2A1-GFP报告基因hiPSC系结合表面标志物筛选,鉴定出CD146+/CD166+/PDGFRβ+/CD45-的独特软骨祖细胞亚群 | 研究仅基于体外实验,未验证体内修复效果;样本量未明确说明 | 提高hiPSC软骨分化的同质性和效率,为软骨组织工程和疾病建模提供纯化细胞源 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs)及其衍生的软骨祖细胞 | 干细胞与再生医学 | 骨关节炎 | CRISPR-Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4424 | 2026-04-03 |
DSAVE: Detection of misclassified cells in single-cell RNA-Seq data
2020, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0243360
PMID:33270740
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DSAVE的新方法,用于评估单细胞转录组簇的纯度并识别错误分类的细胞 | 开发了基于下采样的变异估计方法,通过消除采样噪声差异并使用基于对数似然的度量来识别错误分类的细胞,这是现有类似工具无法检测的 | 未在摘要中明确说明 | 评估单细胞RNA测序数据中细胞亚群的纯度并检测错误分类的细胞 | 单细胞RNA测序数据中的细胞簇和细胞亚群 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4425 | 2026-04-02 |
Single-cell transcriptome deciphers key targets of thrombopoietin receptor agonists and immune microenvironment characteristics of immune thrombocytopenia
2026-Dec, Platelets
IF:2.5Q2
DOI:10.1080/09537104.2026.2651849
PMID:41918402
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研究论文 | 本研究结合网络药理学与单细胞转录组学,系统解析了四种血小板生成素受体激动剂在免疫性血小板减少症中的关键靶点及免疫微环境特征 | 首次整合网络药理学与单细胞高维加权基因共表达网络分析,系统鉴定出TPO-RAs在ITP中的五个关键靶点基因,并揭示了骨髓微环境中异常的细胞间通讯和巨核细胞成熟动力学紊乱 | 研究主要基于计算生物学和体外数据验证,缺乏体内实验的直接功能验证;样本量可能有限,且ITP患者的异质性可能影响结果的普适性 | 阐明血小板生成素受体激动剂在免疫性血小板减少症中的作用分子机制,并探索其治疗靶点 | 免疫性血小板减少症患者的骨髓单细胞转录组数据、四种TPO-RAs药物(罗米司亭、艾曲泊帕、阿伐曲泊帕、海曲泊帕)的靶点 | 生物信息学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序、网络药理学、高维加权基因共表达网络分析、分子对接、伪时间轨迹分析、计算机基因敲低 | hdWGCNA、分子对接模型、伪时间分析模型 | 单细胞转录组数据 | ITP患者和健康对照的骨髓单细胞RNA测序数据(具体样本数未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4426 | 2026-04-02 |
Construction of a Prognostic and Diagnostic Gene Signature Based on the Characteristics of Cancer Stem-Like Cells for the Treatment Guidance of Hepatocellular Carcinoma
2026-May, Annals of human genetics
IF:1.0Q4
DOI:10.1111/ahg.70032
PMID:41536251
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研究论文 | 本研究通过分析肝癌患者样本的单细胞转录组数据,构建了一个基于癌症干细胞样细胞特征的12基因签名,用于预测患者生存和治疗反应 | 首次在患者样本中识别出具有癌症干细胞样特征的罕见细胞群,并基于此构建了CARS评分系统,揭示了其与索拉非尼耐药性和免疫检查点抑制剂敏感性的关联 | 研究基于单细胞转录组数据,样本量有限,需要更大规模的临床验证来确认CARS的预测价值 | 开发一个基于癌症干细胞样细胞特征的预后和诊断基因签名,以指导肝细胞癌的治疗 | 肝细胞癌患者样本中的癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组测序 | 基因签名评分模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4427 | 2026-04-02 |
Identification of potential biomarkers and therapeutic targets for cerebral venous thrombosis
2026-Apr, Neurological research
IF:1.7Q4
DOI:10.1080/01616412.2025.2532039
PMID:40684330
|
研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化方法,整合大规模表达数量性状位点数据和脑静脉血栓形成全基因组关联研究,系统识别并验证了与脑静脉血栓形成易感性相关的可药物化基因 | 首次通过整合外周血和脑组织表达数量性状位点数据,结合孟德尔随机化框架,识别出IL18、BMPR2和COMT等基因作为脑静脉血栓形成的新型潜在生物标志物和治疗靶点 | 研究结果基于遗传推断,需要进一步的机制和临床验证 | 系统识别和验证与脑静脉血栓形成易感性相关的可药物化基因 | 脑静脉血栓形成患者 | 生物信息学 | 脑静脉血栓形成 | 孟德尔随机化、表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序、分子对接 | 两样本孟德尔随机化框架 | 遗传数据、表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4428 | 2026-04-02 |
Spatial transcriptomics reveals TGF-β-driven endothelial-mesenchymal transition in vascular remodeling of moyamoya disease
2026-Apr, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X251388370
PMID:41305891
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学揭示了TGF-β信号通路驱动的内皮-间质转化在烟雾病血管重塑中的关键作用 | 首次在烟雾病中应用空间转录组学技术,识别了具有内皮和间质双重表型的细胞簇,并明确了TGF-β/Snail通路在驱动内皮-间质转化中的核心作用 | 需要在临床前模型中进行进一步验证 | 阐明TGF-β信号通路在烟雾病血管重塑中的作用机制 | 烟雾病患者血管标本 | 数字病理学 | 烟雾病 | 空间转录组学,免疫组织化学,免疫荧光,苏木精-伊红染色 | 伪时间轨迹分析,细胞-细胞通讯模型 | 空间转录组数据,图像数据 | 11例烟雾病标本用于空间转录组学,总计51例烟雾病和11例对照血管标本用于组织学分析 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 4429 | 2026-04-02 |
Sex-Based Differences in Cell Types and Gene Expression within the Anterior Cruciate Ligament
2026-Apr-01, The Journal of bone and joint surgery. American volume
DOI:10.2106/JBJS.25.00860
PMID:41587266
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前交叉韧带中基于性别的细胞类型和基因表达差异,特别是女性患者的TPPP3+祖细胞样细胞在胶原失调和降解相关基因上表达更高 | 首次在单细胞水平上系统比较了前交叉韧带中男性和女性患者的细胞类型和基因表达差异,并识别出与性别相关的祖细胞群体 | 样本量较小(4名男性和5名女性患者),且仅关注了前交叉韧带,未考虑其他因素如年龄、活动水平等 | 探究前交叉韧带损伤率性别差异的细胞和分子基础 | 人类前交叉韧带样本中的活细胞 | 单细胞组学 | 肌肉骨骼损伤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,免疫荧光 | NA | 单细胞RNA测序数据,组织切片图像 | 9名患者(4名男性,5名女性)的前交叉韧带样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4430 | 2026-04-02 |
KGLAR: Deconvoluting Spatial Transcriptomics Data with Single-cell Transcriptomes through Knowledge-guided NMF and Least Angle Regression
2026-Apr-01, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-026-00815-w
PMID:41920506
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4431 | 2026-04-02 |
Complementary multi-omics profiling of chronic thromboembolic pulmonary hypertension reveals immune cell alterations, epigenetic changes, and genetically supported candidate genes
2026-Mar-31, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70166
PMID:41915478
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、DNA甲基化和孟德尔随机化分析,揭示了慢性血栓栓塞性肺动脉高压的免疫细胞改变、表观遗传变化和遗传支持的关键候选基因 | 首次在CTEPH中整合多组学数据(单细胞转录组、DNA甲基化、孟德尔随机化)进行互补分析,并识别出具有遗传支持的新型候选基因(如ETS1和FGR)及其诊断潜力 | 样本量相对有限,且为观察性研究,需进一步功能验证和更大队列验证 | 早期识别慢性血栓栓塞性肺动脉高压的分子标志物以支持更准确的诊断和个体化治疗 | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压患者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, DNA甲基化测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 遗传数据 | 未明确具体样本数,涉及CTEPH患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 表观遗传分析 | NA | NA |
| 4432 | 2026-04-02 |
Sparser2Sparse: Single-shot Sparser-to-Sparse Learning for Spatial Transcriptomics Imputation with Natural Image Co-learning
2026-Mar-31, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2026.3679252
PMID:41915529
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研究论文 | 提出了一种名为S2S-ST的新型单次稀疏到稀疏学习框架,用于空间转录组学数据插补,并利用自然图像进行协同训练 | 1) 提出稀疏到稀疏的自监督学习策略,利用ST数据内在空间模式从更稀疏子集预测部分观测稀疏区域;2) 引入与自然图像的跨域协同学习以增强特征表示;3) 设计级联数据一致性插补网络(CDCIN),在迭代优化预测的同时保持采样基因数据的保真度 | NA | 解决高分辨率空间转录组学数据成本高、稀缺性的挑战,实现从稀疏输入进行准确数据插补 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 级联数据一致性插补网络(CDCIN) | 空间转录组学数据,自然图像 | 多种组织类型(包括乳腺癌、肝脏和淋巴组织) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4433 | 2026-04-02 |
Tobacco exposure and peripheral artery disease: A multi-omics investigation integrating epidemiology, genetics, toxicology, and single-cell transcriptomics
2026-Mar-30, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120083
PMID:41916120
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研究论文 | 本研究通过整合流行病学、遗传学、毒理学和单细胞转录组学方法,探讨烟草暴露与血清可替宁水平对周围动脉疾病的影响及其炎症通路机制 | 首次将流行病学分析、网络毒理学、孟德尔随机化、分子对接动力学和单细胞转录组学整合,系统揭示可替宁通过IL6/STAT3信号通路介导烟草暴露与周围动脉疾病关联的新机制 | 分子对接和动力学分析仅提示可替宁与IL6/STAT3可能存在瞬时相互作用,需进一步实验验证;单细胞数据未明确说明样本来源和数量 | 阐明烟草暴露通过血清可替宁介导的炎症通路导致周围动脉疾病的分子机制 | 烟草暴露人群、周围动脉疾病患者、血管相关免疫细胞和基质细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、分子对接与动力学、网络毒理学 | NA | 流行病学数据、遗传数据、分子模拟数据、单细胞转录组数据 | 基于NHANES数据库的流行病学队列(具体样本数未说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4434 | 2026-04-02 |
Pre-existing cell states predict resistance to multiple treatments
2026-Mar-30, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2026.101191
PMID:41916275
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研究论文 | 本研究通过多治疗、高通量克隆追踪和单细胞RNA测序技术,揭示了癌症细胞在治疗前的预存状态如何预测其对多种治疗产生耐药性 | 首次在平行多治疗条件下追踪稀有克隆的耐药性发展过程,并识别出与多治疗耐药相关的细胞状态,特别是发现治疗前CD44高表达可作为多治疗耐药的预测指标 | 研究主要基于体外实验模型,尚未在临床样本中得到充分验证 | 探究癌症细胞预存状态对多种治疗耐药性的预测机制 | 癌症细胞克隆 | 单细胞组学 | 癌症 | DNA条形码技术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4435 | 2026-04-02 |
Perturb-seq uncovers pathological obstacles to direct cardiac reprogramming in vivo
2026-Mar-30, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.03.006
PMID:41916284
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研究论文 | 本研究利用Perturb-seq平台系统识别了体内心脏重编程的障碍,发现calreticulin (Calr)是主要抑制剂,其敲除可显著提高诱导心肌细胞效率并改善心肌梗死后的心脏功能 | 开发了适用于复杂病理环境的Perturb-seq平台,首次系统比较并排名了140个潜在体内心脏重编程障碍,揭示了Calr作为关键抑制剂的新机制 | 研究主要基于shRNA筛选和单细胞RNA-seq数据,体内实验验证可能受模型特异性限制,未全面探讨其他潜在障碍的长期影响 | 识别并克服体内直接心脏重编程的病理障碍,以提高心肌细胞诱导效率,促进心脏再生 | 成纤维细胞向心肌细胞的直接转分化过程,特别是在心肌梗死后的病理微环境中 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | Perturb-seq, 单细胞RNA-seq, shRNA筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涉及140个潜在障碍的筛选 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 定制化Perturb-seq平台,适用于复杂病理环境 |
| 4436 | 2026-04-02 |
Spatiotemporal multiomics reveal a default CD4 fate and a stem-like CD8 T cell subset in the thymus
2026-Mar-25, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.03.053
PMID:41895464
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、蛋白质分析、染色质可及性和空间转录组学技术,构建了小鼠胸腺T细胞发育的多模态图谱,揭示了αβ和γδ谱系的早期分叉、CD4谱系的默认程序以及一个干细胞样CD8 T细胞亚群 | 首次结合单细胞多组学和空间转录组学技术,高分辨率地解析了胸腺T细胞发育的时空动态,明确了αβ和γδ谱系在DN1阶段的早期分叉,并发现CD4谱系是转录默认程序,而CD8谱系需要Runx3激活和I类MHC信号 | 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类;空间转录组学分辨率有限,可能无法完全捕捉细胞间相互作用的细节 | 构建胸腺T细胞发育的全面多模态图谱,以阐明早期谱系决定、中间状态和空间检查点的分子机制 | 小鼠胸腺中的胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学、CITE-seq、scATAC-seq、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 4437 | 2026-04-02 |
Exploring the developmental mechanisms of tea plant trichomes using genomics and single-cell transcriptome sequencing
2026-Mar, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf352
PMID:41918624
|
研究论文 | 本研究通过基因组测序和单细胞转录组测序,探索了茶树毛状体的发育机制 | 首次提供了三倍体茶树品种的高质量染色体级别基因组组装,并构建了木本植物的单细胞图谱,鉴定了毛状体特异性标记基因和发育轨迹 | NA | 探索茶树毛状体的发育机制,为茶树育种提供遗传资源 | 福鼎大白茶(三倍体白茶品种)及其叶片组织 | 基因组学 | NA | PacBio长读长测序、Hi-C支架、单核RNA测序 | NA | 基因组序列、单细胞转录组数据 | 叶片组织混合样本 | PacBio | 长读长测序、Hi-C、单核RNA-seq | NA | NA |
| 4438 | 2026-04-02 |
Oncolytic Zika virus therapy leverages CCR2+ monocytes to boost anti-glioblastoma T cell responses
2026-Feb-23, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag037
PMID:41729934
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研究论文 | 本研究探讨了溶瘤寨卡病毒(ZIKV)通过激活CCR2+单核细胞来增强抗胶质母细胞瘤CD8+ T细胞反应的机制 | 揭示了ZIKV通过CCR2+单核细胞介导的T细胞反应增强机制,为克服胶质母细胞瘤免疫抑制提供了新策略 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 探究ZIKV治疗胶质母细胞瘤的免疫机制,特别是单核细胞在其中的作用 | 胶质母细胞瘤小鼠模型中的CCR2+单核细胞和CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4439 | 2026-04-02 |
Gut Microbiome, Immune Cells, and Heart Failure: A Multi-Omics Mendelian Randomization Study
2026-Jan-23, Cardiology
IF:1.9Q3
DOI:10.1159/000550655
PMID:41915616
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研究论文 | 本研究通过多组学孟德尔随机化分析,探讨了肠道微生物组通过免疫细胞对心力衰竭的因果影响 | 首次结合肠道微生物组、免疫细胞和心力衰竭的GWAS数据,利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术,通过eQTL孟德尔随机化分析揭示微生物与免疫互作在心力衰竭中的因果机制 | 研究依赖于公开的GWAS摘要数据,可能受限于样本异质性和潜在混杂因素,且因果推断基于遗传工具变量,需实验验证 | 探究肠道微生物组通过免疫调节对心力衰竭发病的因果关系 | 肠道微生物分类群、免疫细胞(如CD4+T细胞、NK/T细胞)和心力衰竭患者及健康对照 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq)、表达数量性状位点(eQTL)分析 | 孟德尔随机化(MR)模型 | 遗传摘要数据、单细胞转录组数据 | 基于公开GWAS和单细胞测序数据,具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 4440 | 2026-04-02 |
Loss of HOXA10 activates NLRP3 for epithelial plasticity and pyroptosis in endometrium during embryo implantation
2026-01-15, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1093/reprod/xaaf007
PMID:41575153
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子HOXA10通过抑制NLRP3来维持子宫内膜上皮细胞特性,其下调会激活NLRP3介导的炎症小体形成和细胞焦亡,从而为胚胎植入创造条件的分子机制 | 首次发现HOXA10通过直接调控NLRP3表达来控制胚胎植入过程中的上皮重塑,并阐明了NLRP3在诱导上皮可塑性(pEMT)和细胞焦亡中的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,在人类子宫内膜中的验证尚需进一步研究;NLRP3抑制剂MCC950的具体作用机制和长期影响有待深入探索 | 探究胚胎植入过程中子宫内膜上皮细胞重塑的分子调控机制 | 小鼠子宫内膜(特别是腔上皮细胞) | 生殖生物学/发育生物学 | 生殖系统疾病(胚胎植入相关) | CUT&RUN测序,单细胞RNA-seq,免疫染色 | NA | 基因组学数据,转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |