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当前共找到 37441 篇文献，本页显示第 4421 - 4440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 4421 | 2026-01-07 |
GCHFR-gut microbiota axis in gout: an integrative multi-omics and Mendelian randomization study with clinical and molecular validation
2026-Feb-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.116064
PMID:41422660
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研究论文 | 本研究通过整合多组学孟德尔随机化、临床验证、肠道菌群分析和计算机药物评估，探索了痛风相关的候选基因，并验证了GCHFR作为潜在治疗靶点 | 首次整合多组学孟德尔随机化、肠道菌群分析和分子对接模拟，系统性地识别并验证了痛风相关的候选基因及其与肠道菌群的关联 | 样本量相对较小（51名痛风患者和50名健康对照），且部分预测的药物相互作用尚未进行体内实验验证 | 识别痛风相关的候选基因，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 痛风患者和健康对照者的外周血样本、公共单细胞RNA测序数据集、肠道菌群数据库 | 生物信息学 | 痛风 | 多组学孟德尔随机化（pQTL/eQTL/mQTL）、单细胞RNA测序、qRT-PCR、分子对接、分子动力学模拟 | 孟德尔随机化模型、分子对接模型 | 基因组数据、转录组数据、甲基化数据、肠道菌群数据、临床样本数据 | 51名痛风患者和50名健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4422 | 2026-01-07 |
SPP1 secreted by nucleus pulposus cells mediates inflammatory infiltration and contributes to intervertebral disc degeneration
2026-Feb-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.116099
PMID:41443102
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研究论文 | 本研究揭示了SPP1在髓核细胞炎症反应和细胞外基质失衡中的关键作用，并探索了其作为椎间盘退变早期诊断和治疗靶点的潜力 | 首次在单细胞水平上鉴定出高表达SPP1的髓核细胞亚型，并阐明SPP1通过PI3K/AKT/NF-κB信号通路介导炎症反应，同时发现SPP1能增强巨噬细胞炎症因子分泌 | 研究主要基于体外实验和测序数据，缺乏在体动物模型验证SPP1靶向治疗的实际效果 | 探究SPP1在椎间盘退变过程中的作用机制，寻找潜在的治疗靶点 | 退变髓核组织、髓核细胞、巨噬细胞 | 数字病理学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4423 | 2026-01-07 |
Recovering gene regulatory networks in single-cell multi-omics data with PRISM-GRN
2026-Jan-05, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.280757.125
PMID:41067887
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研究论文 | 提出了一种名为PRISM-GRN的贝叶斯模型，用于从单细胞多组学数据中重建细胞类型特异性的基因调控网络 | 首次将已知的基因调控网络、scRNA-seq和scATAC-seq数据整合到一个概率框架中，采用基于生物学可解释机制的架构，能够处理非配对组学数据和有限的先验网络信息 | 未明确说明模型对计算资源的需求或可扩展性限制 | 从单细胞多组学数据中精确、稳健地重建基因调控网络 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 贝叶斯模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | 四个基准数据集（包含配对scRNA-seq和scATAC-seq数据） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 4424 | 2026-01-07 |
scHyperLink: Revealing Cell-Type-Specific Gene Regulation with Hypergraph Neural Networks
2026-Jan-05, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3650661
PMID:41489955
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研究论文 | 本文提出了一种基于超图神经网络的单细胞基因调控网络重建框架scHyperLink | 首次将超图神经网络应用于单细胞基因调控网络重建，能够捕捉基因间的高阶依赖关系，克服传统图神经网络仅能建模成对节点交互的局限 | 未明确说明模型在超大规模数据集上的计算效率，也未讨论对特定细胞类型或组织类型的泛化能力 | 提高单细胞分辨率下基因调控网络重建的准确性，特别是捕捉多转录因子协同调控的高阶依赖关系 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 超图神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4425 | 2026-01-07 |
PPIA regulates fatty acid and glutamine metabolism in lung adenocarcinoma based on multiomics prognostic model and experiment validation
2026-Jan-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-34313-8
PMID:41491011
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研究论文 | 本研究通过多组学分析构建了一个基于脂肪酸代谢相关基因的肺腺癌预后风险模型，并通过实验验证了PPIA通过c-Myc介导的脂肪酸-谷氨酰胺代谢轴驱动肺腺癌进展的机制 | 首次整合多组学数据、单细胞RNA测序和实验验证，揭示了PPIA通过调控c-Myc介导的脂肪酸-谷氨酰胺代谢网络重塑来促进肺腺癌恶性进展和影响免疫微环境的新机制，并构建了一个具有强预测能力的四基因预后风险模型 | 部分数据集的临床信息不完整，无法进行全面的亚组分析 | 阐明PPIA在肺腺癌代谢重编程和肿瘤进展中的具体作用机制，并构建有效的预后评估工具 | 肺腺癌细胞系（A549和H1975细胞）以及来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者多组学数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，WGCNA，qRT-PCR，Western blotting，CCK-8，集落形成，伤口愈合，Transwell实验，代谢谱分析 | Cox回归风险模型，WGCNA | 多组学数据，单细胞RNA测序数据，基因表达数据，临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肺腺癌患者队列数据，以及A549和H1975细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4426 | 2026-01-07 |
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophages-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2026-Jan-02, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00235.2025
PMID:41481288
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠肺泡巨噬细胞在臭氧暴露后的转录组变化和功能调控 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了臭氧浓度依赖性的肺泡巨噬细胞转录组景观和功能状态异质性 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠，未考虑性别差异；暴露时间固定为3小时，未评估长期效应 | 探究肺泡巨噬细胞对臭氧暴露的响应机制及其浓度依赖性变化 | 成年雄性C57BL/6J小鼠的肺泡巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三组小鼠（过滤空气、1 ppm臭氧、1.5 ppm臭氧暴露组），具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4427 | 2026-01-07 |
BCMA/CD19 CAR T cell therapy for refractory myasthenia gravis: Proteomic signatures and single-cell transcriptomics of disease flares
2026-Jan-02, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aeb6424
PMID:41481736
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研究论文 | 本研究探讨了BCMA/CD19 CAR T细胞疗法在治疗难治性重症肌无力中的安全性和有效性，并通过蛋白质组学和单细胞转录组学分析了疾病复发的分子特征 | 首次将BCMA/CD19 CAR T细胞疗法应用于难治性重症肌无力患者，并识别出FCRL5作为复发的新潜在靶点 | 样本量较小（仅6名患者），且为单中心研究，需要更大规模试验验证 | 评估BCMA/CD19 CAR T细胞疗法对难治性重症肌无力的治疗效果并探索复发机制 | 6名难治性重症肌无力患者 | 单细胞转录组学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序, Olink蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据 | 6名患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4428 | 2026-01-07 |
A single-cell multiomics roadmap of zebrafish spermatogenesis reveals regulatory principles of male germline formation
2026-Jan, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00157-7
PMID:41087739
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术绘制了斑马鱼精子发生的路线图，揭示了雄性生殖细胞形成的调控原理 | 首次在斑马鱼中结合单细胞RNA测序、单细胞染色质可及性分析和全基因组甲基化测序，全面解析精子发生过程，并识别出逃避全局染色质压缩的位点，为跨代遗传调控状态提供了潜在机制 | 研究主要聚焦于斑马鱼，对非羊膜动物精子发生的理解仍有限，且未涉及其他脊椎动物的比较验证 | 研究脊椎动物生殖细胞发育和表观遗传继承，特别是斑马鱼精子发生的调控机制 | 斑马鱼（Danio rerio）睾丸中的生殖细胞群体 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞染色质可及性分析（scATAC-seq），全基因组甲基化测序（WGBS） | NA | 单细胞转录组数据，单细胞染色质可及性数据，DNA甲基化数据 | 斑马鱼睾丸中分选的生殖细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq，bulk DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 4429 | 2026-01-07 |
CellPredX, a computational framework for cross-data type, cross-sample, and cross-protocol cell type annotation through domain adaptation and deep metric learning
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013824
PMID:41481570
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研究论文 | 本文提出了一种名为CellPredX的计算框架，用于通过域适应和深度度量学习实现跨数据类型、跨样本和跨协议的单细胞类型注释 | CellPredX是一个结构统一但参数自适应的半监督跨模态框架，集成了域适应和深度度量学习，并引入了带有注意力机制的稀疏中心损失以增强判别性表示，同时通过基于梯度归因的解释器模块提供生物可解释性 | NA | 解决单细胞分析中跨异构数据集和模态的细胞类型注释挑战，特别是在scRNA-seq和scATAC-seq数据之间的标签转移 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq）数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | 深度度量学习，域适应 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 4430 | 2026-01-07 |
TDP2 drives immune evasion and metastatic progression in prostate cancer
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0339607
PMID:41481587
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和通路富集分析，揭示了TDP2在前列腺癌中通过调控肿瘤微环境促进免疫逃逸和转移进展的关键作用 | 首次在单细胞水平上系统阐明了TDP2通过抑制M1巨噬细胞极化和树突状细胞成熟、富集EMT相关通路来驱动免疫逃逸和转移的机制 | 研究主要基于单细胞测序和通路分析，缺乏体内外功能实验的直接验证，且临床样本量未明确说明 | 探究TDP2在前列腺癌肿瘤微环境调控和疾病进展中的作用机制 | 前列腺癌患者样本中的上皮细胞、髓系细胞、巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4431 | 2026-01-07 |
A non-invasive urinary diagnostic signature for diabetic kidney disease revealed by machine learning and single-cell analysis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0340096
PMID:41481634
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研究论文 | 本研究通过整合尿液和肾脏单细胞测序数据与机器学习，开发了一种用于糖尿病肾病（DKD）的非侵入性诊断生物标志物面板 | 首次利用尿液来源细胞的单细胞分析结合机器学习，识别出与肾小管损伤相关的三基因生物标志物面板（PDK4、RHCG、FBP1），用于DKD的非侵入性诊断 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，需要进一步在独立临床队列中进行前瞻性验证以确认其诊断效能 | 开发糖尿病肾病的非侵入性诊断生物标志物 | 糖尿病肾病患者的尿液来源细胞和肾脏组织 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序，机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 2089个尿液来源细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4432 | 2026-01-07 |
Roll with the punches: Fibroblast growth factor 10 alleviates pyroptosis of alveolar epithelial cells in different immune niches
2026-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70569
PMID:41482636
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研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞生长因子10（FGF10）通过抑制AMPK-RIPK1/caspase-8/caspase-3/GSDME介导的细胞焦亡，减轻急性肺损伤的机制 | 首次阐明FGF10通过调节ATP水平和AMPK活性，抑制不同免疫细胞引发的肺泡上皮细胞焦亡，为ARDS提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养系统，临床样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究FGF10在急性呼吸窘迫综合征（ARDS）中的临床意义及其减轻肺泡上皮细胞焦亡的分子机制 | ARDS患者血清样本、LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型、肺泡上皮细胞、巨噬细胞、中性粒细胞 | 单细胞组学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | ARDS患者血清样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4433 | 2026-01-07 |
Integrated Network Pharmacology, Single-Cell Transcriptomics Unveil the Mechanistic Role of Morusin in Aortic Dissection
2026-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70971
PMID:41482800
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、单细胞转录组学和实验验证，揭示了桑根酮在主动脉夹层中的多靶点、多通路作用机制 | 首次结合网络药理学、单细胞转录组学及体内外实验，系统阐明桑根酮通过靶向IL-17、HIF-1和MAPK等信号通路，在细胞类型特异性水平上缓解主动脉夹层进展 | 研究主要基于动物模型和体外细胞实验，尚未进行临床验证；单细胞转录组分析可能受样本量和技术限制 | 阐明桑根酮缓解主动脉夹层进展的多靶点、多通路药理机制 | 桑根酮的药理靶点、主动脉夹层相关基因、血管平滑肌细胞、BAPN诱导的主动脉夹层小鼠模型 | 计算生物学 | 心血管疾病 | 网络药理学、单细胞转录组学、分子对接、体外细胞实验、体内动物模型 | NA | 转录组数据、蛋白质相互作用数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4434 | 2026-01-07 |
Pan-cancer analysis of RNA expression signatures associated with cancer tissue architecture
2026-Jan, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03233-9
PMID:41107552
|
研究论文 | 本研究通过非负矩阵分解方法分析了28种癌症类型的RNA表达数据，识别出七个与癌症组织结构相关的特征，揭示了其与癌症病理特征的关联 | 首次在泛癌水平上系统分析癌症组织结构相关的RNA表达特征，并识别出七个不同的CTA特征，包括普遍存在的纤维胶原相关特征和具有组织特异性的细胞间粘附特征 | 研究主要基于TCGA数据集，虽然使用了多种验证方法，但仍需更多独立队列和实验验证来确认发现的普适性 | 探究癌症组织结构在泛癌水平上的RNA表达特征及其与癌症病理特征的关系 | 28种癌症类型的肿瘤组织样本 | 生物信息学 | 泛癌分析 | 非负矩阵分解，空间转录组学，体内外模型实验 | 非负矩阵分解 | RNA表达数据 | 来自28种癌症类型的多个样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4435 | 2026-01-07 |
SGMS2+ macrophages enhance NR4A3hi NK cell infiltration to improve prognosis and PD-1 treatment efficacy in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07040-x
PMID:41316300
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研究论文 | 本研究揭示了SGMS2在肝细胞癌中通过极化巨噬细胞为M1表型并分泌CXCL2招募NR4A3hi NK细胞，从而改善预后和增强PD-1治疗效果的机制 | 首次阐明了SGMS2在巨噬细胞中的特异性作用，及其通过CXCL2介导的NK细胞招募机制改善肝细胞癌免疫微环境和PD-1治疗反应 | 研究主要基于回顾性临床数据和体外实验，缺乏体内动物模型验证；样本量相对有限（临床队列188例） | 探究SGMS2在肝细胞癌免疫微环境中的作用及其对患者预后和PD-1治疗疗效的影响 | 肝细胞癌患者组织样本、TCGA数据库、THP-1单核细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多重免疫荧光、流式细胞术、慢病毒转染 | NA | RNA-seq数据、单细胞数据、空间转录组数据、免疫荧光图像 | TCGA-LIHC数据集371例，独立临床队列188例（2017-2022） | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4436 | 2025-11-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNC-positive cancer-associated fibroblasts that mediate immunosuppression and promote tumor progression in basal cell carcinoma
2025-Nov-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07491-2
PMID:41310748
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4437 | 2026-01-07 |
Single-cell and bulk transcriptome analyses revealed the role of macrophage cholesterol metabolism in atherosclerosis
2025-Nov-26, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-025-02773-6
PMID:41299485
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组分析，揭示了巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的关键作用，并识别了FABP4、RNASET2和FILIP1L作为潜在诊断标志物和治疗靶点 | 结合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据，应用机器学习算法识别与巨噬细胞胆固醇代谢相关的关键基因，并构建风险评分模型进行外部验证，同时通过体外实验验证基因功能 | 研究主要依赖于公共数据库数据，可能受样本来源和批次效应影响；体外实验验证范围有限，需进一步体内研究确认基因功能 | 探究巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的调控机制，并识别相关诊断和治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者组织样本中的巨噬细胞及相关基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 逻辑回归, 机器学习算法 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的一个单细胞RNA测序数据集和多个批量mRNA转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4438 | 2026-01-07 |
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01379-z
PMID:41291434
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，识别骨关节炎相关基因并预测潜在药物 | 结合hdWGCNA、随机森林和PPI网络分析识别关键基因，并利用孟德尔随机化和斑马鱼实验验证药物效果 | 研究主要依赖公共数据集和预测算法，实验验证仅在斑马鱼模型中进行，未涉及人类临床试验 | 寻找骨关节炎的预防和治疗药物 | 骨关节炎相关基因和候选药物 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，RT-qPCR | 随机森林，hdWGCNA，PPI网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 4439 | 2026-01-07 |
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04117-1
PMID:41276825
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综述 | 本文综述了结直肠癌共识分子亚型分类的研究进展及其在预后预测和个性化治疗中的应用 | 系统总结了CMS分类的预后价值、预测作用、鉴定方法（包括基于深度学习的图像分类器）、与免疫治疗等靶向治疗的关联，并探讨了肿瘤内异质性带来的挑战及单细胞测序等新兴解决方案 | 肿瘤内异质性和技术壁垒阻碍了临床广泛应用 | 回顾CMS分类在结直肠癌中的研究进展，旨在推动亚型驱动的治疗策略 | 结直肠癌及其共识分子亚型 | 自然语言处理 | 结直肠癌 | 基因表达谱分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 深度学习 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4440 | 2026-01-07 |
Multienzymatic nanocatalysts attenuate acute pancreatitis via dual modulation of pyroptotic pathways and autodigestion blockade
2025-Nov-23, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03783-3
PMID:41276804
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研究论文 | 本研究设计了一种多酶纳米催化剂，通过双重调节细胞焦亡通路和阻断胰腺自消化来治疗急性胰腺炎 | 开发了表面修饰有胰蛋白酶抑制剂Rhamnetin的单原子钴基纳米酶（Rh@SAE），首次将催化疗法应用于急性胰腺炎治疗，并同时靶向细胞焦亡和胰腺酶过度激活两个关键病理过程 | 研究主要基于动物模型，尚未进行临床试验；纳米材料的长期生物安全性需要进一步评估 | 开发新型纳米药物治疗急性胰腺炎，改善临床预后 | 急性胰腺炎（AP）和重症急性胰腺炎（SAP）的病理过程 | 纳米医学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |