单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 4401 - 4420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4401 | 2025-02-14 |
RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics in Traumatic Spinal Cord Injury (Review)
2023, Sovremennye tekhnologii v meditsine
DOI:10.17691/stm2023.15.6.08
PMID:39944372
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综述 | 本文综述了单细胞和单核RNA测序技术以及空间转录组学在创伤性脊髓损伤中的应用，探讨了这些技术在揭示细胞类型、定位损伤区域和解析病理机制方面的潜力 | 结合单细胞/单核RNA测序与空间转录组学技术，提供了更精确的细胞定位和病理分析，为神经连接重组和感觉运动功能恢复机制的研究开辟了新视角 | 需要更多关于人类细胞群体特异性的全面信息，以确定脊髓损伤中细胞选择性易感性的原因 | 探讨单细胞和单核RNA测序技术以及空间转录组学在创伤性脊髓损伤中的应用，以揭示细胞类型、定位损伤区域和解析病理机制 | 创伤性脊髓损伤中的细胞类型及其在正常和病理反应中的作用 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA |
| 4402 | 2025-02-14 |
[Research advances on the role and mechanism of epidermal stem cells in skin wound repair]
2022-Sep-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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综述 | 本文综述了表皮干细胞在皮肤自我更新和伤口修复中的作用及其机制 | 结合单细胞测序和基因敲除等新技术和新概念，揭示了表皮干细胞在表皮自我更新和伤口修复中的新机制 | NA | 探讨表皮干细胞在皮肤伤口修复中的作用和机制 | 表皮干细胞 | NA | NA | 单细胞测序, 基因敲除 | NA | NA | NA |
| 4403 | 2025-02-14 |
[Investigation on the growth factor regulatory network of dermal fibroblasts in mouse full-thickness skin defect wounds based on single-cell RNA sequencing]
2022-Jul-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序技术，探索了小鼠全层皮肤缺损伤口中真皮成纤维细胞的异质性及其生长因子调控网络 | 首次利用单细胞RNA测序技术详细描绘了小鼠全层皮肤缺损伤口中真皮成纤维细胞的异质性及其在生长因子信号通路中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他动物模型，且样本量较小 | 探索小鼠全层皮肤缺损伤口中真皮成纤维细胞的异质性及其生长因子调控网络 | 小鼠全层皮肤缺损伤口中的真皮成纤维细胞 | 数字病理 | 皮肤损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 10只8周龄雄性C57BL/6小鼠（5只正常皮肤组织，5只伤口组织） |
| 4404 | 2025-02-14 |
[Re-understanding the physiological and pathophysiological roles of neutrophils]
2022-Feb-20, Zhonghua shao shang yu chuang mian xiu fu za zhi
|
综述 | 本文综述了近年来关于中性粒细胞的生物学行为及其在各种疾病中的作用的研究进展 | 重新审视了中性粒细胞的生理和病理生理作用，特别是其异质性及与其他免疫细胞相互作用的机制 | NA | 重新理解中性粒细胞在生理和病理生理中的作用 | 中性粒细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞测序技术、空间转录组测序技术、多组学联合测序技术 | NA | NA | NA |
| 4405 | 2025-02-13 |
Single-cell sequencing of peripheral blood mononuclear cells reveals immune landscape of monkeypox patients with HIV
2025-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2025.2459136
PMID:39868995
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了猴痘病毒（MPXV）感染患者的外周血单核细胞，揭示了HIV感染者与非感染者的免疫景观差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细描绘了HIV感染与非感染猴痘患者的免疫细胞表型和基因表达差异，揭示了HIV感染者病情严重的潜在机制 | 样本量较小，仅包括6名患者，可能影响结果的普遍性 | 研究猴痘病毒在HIV感染与非感染患者中的免疫病理学机制 | 猴痘病毒感染患者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 猴痘 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 6名患者（3名HIV+，3名HIV-） |
| 4406 | 2025-02-13 |
A single-cell transcriptome analysis reveals astrocyte heterogeneity and identifies CHI3L1 as a diagnostic biomarker in Parkinson's disease
2025-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42051
PMID:39931480
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了帕金森病中星形胶质细胞的异质性，并发现CHI3L1可能作为帕金森病的诊断生物标志物 | 首次在单细胞水平上揭示了帕金森病中星形胶质细胞的异质性，并识别出CHI3L1作为潜在的诊断标志物 | 研究主要基于公开的GEO数据库数据，缺乏独立验证队列 | 识别帕金森病中星形胶质细胞的异质性并研究与其分化轨迹相关的基因 | 帕金森病患者和正常样本中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞转录组分析, qRT-PCR, Western Blot | Monocle2, AUCell | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但包括帕金森病患者和正常样本 |
| 4407 | 2025-02-13 |
A multi-omic single-cell landscape of the aging mouse ovary
2025-Feb-11, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01556-2
PMID:39934558
|
研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq）技术，描绘了小鼠年轻和年老卵巢的多组学单细胞图谱，揭示了卵巢衰老过程中的细胞类型特异性转录变化及其调控元件 | 首次结合scRNA-seq和scATAC-seq技术，全面描绘了小鼠卵巢衰老的多组学单细胞图谱，并揭示了TGF-beta信号通路和ER应激在衰老过程中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类卵巢衰老的直接证据 | 探究卵巢衰老的分子机制，以理解女性年龄相关的生育功能障碍 | 小鼠年轻和年老卵巢 | 生物信息学 | 生殖系统疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞多组学数据 | 小鼠年轻和年老卵巢样本 |
| 4408 | 2025-02-13 |
Integrative Multi-omics Analysis and Mendelian Randomization Reveal Potential Therapeutic Targets and their Stratification in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Feb-06, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和孟德尔随机化方法，识别了肺鳞状细胞癌（LUSC）的潜在治疗靶点，并对其进行了分层 | 结合了bulk RNA测序、WGCNA、生存分析、孟德尔随机化、LASSO回归、PPI网络分析、免疫浸润评估、单细胞RNA测序和伪时间分析等多种技术手段，全面探索了LUSC的治疗靶点 | 未提及具体样本量，可能影响结果的普适性 | 识别肺鳞状细胞癌（LUSC）的新型治疗靶点，以改善其治疗策略 | 肺鳞状细胞癌（LUSC） | 数字病理 | 肺癌 | bulk RNA测序、WGCNA、孟德尔随机化、LASSO回归、PPI网络分析、单细胞RNA测序、伪时间分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4409 | 2025-02-13 |
Integrative mapping of human CD8+ T cells in inflammation and cancer
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02530-0
PMID:39614111
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scAtlasVAE的深度学习模型，用于整合大规模单细胞RNA测序数据并进行跨图谱比较，构建了一个广泛的人类CD8 T细胞图谱 | 开发了scAtlasVAE模型，能够整合大规模单细胞RNA测序数据，构建了包含1,151,678个细胞的人类CD8 T细胞图谱，揭示了不同细胞亚型之间的联系及其表型和功能转变 | NA | 研究人类CD8 T细胞在炎症和癌症中的克隆景观和动态变化 | 人类CD8 T细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | VAE（变分自编码器） | 单细胞RNA测序数据 | 1,151,678个细胞，来自961个样本，涵盖68项研究和42种疾病条件 |
| 4410 | 2024-12-01 |
Human CD8+ T cell map with single-cell transcriptome and TCR information
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02529-7
PMID:39614112
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4411 | 2024-12-01 |
Publisher Correction: Massively parallel single-cell sequencing of diverse microbial populations
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02570-6
PMID:39614113
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4412 | 2025-02-13 |
Capture of Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells in the Absence of Pdzk1
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408852
PMID:39630006
|
研究论文 | 本研究通过删除单个基因Pdzk1，在胚胎干细胞（ESCs）中建立了全能性 | 首次通过删除Pdzk1基因在胚胎干细胞中实现全能性，突破了胚胎和胚胎外组织之间的屏障 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞，尚未在人类细胞中验证 | 探索胚胎干细胞的全能性扩展及其分化潜能 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析，bulk RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 4413 | 2025-02-13 |
SYISL Knockout Promotes Embryonic Muscle Development of Offspring by Modulating Maternal Gut Microbiota and Fetal Myogenic Cell Dynamics
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410953
PMID:39680624
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研究论文 | 本研究探讨了SYISL基因敲除如何通过调节母体肠道微生物群和胎儿肌源性细胞动态来促进胚胎肌肉发育 | 揭示了SYISL基因敲除通过改变母体肠道微生物群组成和提高胚胎血清中的丁酸水平，进而通过丁酸-HDAC-H3K9ac/H3K27ac途径调节肌肉生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类或其他动物模型中进行验证 | 探讨SYISL基因敲除对胚胎肌肉发育的影响及其机制 | 小鼠胚胎 | 生物医学 | 肌肉疾病 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq | 小鼠模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 4414 | 2025-02-13 |
Mesenchymal Stem Cells Prevent SLC39A14-Dependent Hepatocyte Ferroptosis through Exosomal miR-16-5p in Liver Graft
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411380
PMID:39680749
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研究论文 | 本文研究了间充质干细胞通过外泌体miR-16-5p预防肝移植中SLC39A14依赖的肝细胞铁死亡 | 首次发现SLC39A14在肝移植中的促铁死亡作用，并揭示了hBMSCs通过外泌体miR-16-5p下调SLC39A14表达的治疗机制 | 未提及具体样本量及实验设计的局限性 | 探究肝移植中肝细胞损伤的机制及间充质干细胞的治疗作用 | 肝移植中的肝细胞及人骨髓来源的间充质干细胞 | 生物医学 | 肝移植相关疾病 | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4415 | 2025-02-13 |
Aberrant Chitinase 3-Like 1 Expression in Basal Cells Contributes to Systemic Sclerosis Fibrosis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202310169
PMID:39686726
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了系统性硬化症（SSc）中基底细胞异常表达的几丁质酶3样1（Chi3L1）在纤维化过程中的作用，并探讨了其作为潜在生物标志物和治疗靶点的可能性 | 首次在SSc患者中识别出高表达Chi3L1的基底细胞亚群，并揭示了Chi3L1通过IL-17RA介导的纤维化机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人体临床试验中验证Chi3L1和IL-17RA作为治疗靶点的有效性和安全性 | 探讨系统性硬化症纤维化的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 系统性硬化症患者的皮肤细胞和小鼠模型 | 生物医学研究 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA测序数据 | SSc患者和健康对照的皮肤细胞样本 |
| 4416 | 2025-02-13 |
A Bi-Specific T Cell-Engaging Antibody Shows Potent Activity, Specificity, and Tumor Microenvironment Remodeling in Experimental Syngeneic and Genetically Engineered Models of GBM
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.18.628714
PMID:39763755
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研究论文 | 本文研究了一种双特异性T细胞接合抗体（BTE）在实验性同源和基因工程胶质母细胞瘤（GBM）模型中的活性、特异性及肿瘤微环境重塑效果 | 在具有完整免疫系统的原位和基因工程小鼠模型中评估BTE的功能，填补了以往研究主要在免疫缺陷动物模型中进行的空白 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探讨BTE在胶质母细胞瘤中的治疗机制和效果 | 胶质母细胞瘤（GBM） | 生物医学 | 胶质母细胞瘤 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、多重免疫荧光、多参数磁共振成像（MRI） | NA | 实验数据 | 多个GBM临床前模型中的小鼠 |
| 4417 | 2025-01-23 |
Finding and Profiling Renal Cells with Spatial Transcriptomics
2025-Jan-22, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000632
PMID:39836482
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4418 | 2025-02-13 |
TGFBR2 High mesenchymal glioma stem cells phenocopy regulatory T cells to suppress CD4+ and CD8+ T cell function
2025-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.07.631757
PMID:39829747
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研究论文 | 本研究通过多方面的分析方法，揭示了TGFBR2高表达的间充质胶质瘤干细胞（GSCs）通过模仿调节性T细胞（Tregs）来抑制CD4+和CD8+ T细胞功能的机制 | 首次发现并描述了TGFBR2驱动的免疫抑制性GSC状态，并确定了其与TGF-β II型受体的特异性关联 | 研究主要基于体外实验和患者来源的细胞，尚未在体内模型中验证这些发现 | 探索胶质母细胞瘤（GBM）中肿瘤微环境的免疫抑制机制，特别是GSCs在其中的作用 | 胶质母细胞瘤中的间充质胶质瘤干细胞（GSCs） | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序，生物信息学分析，分子和药理学操作 | NA | 临床和实验数据集，单细胞测序数据 | 患者来源的GBM神经球和临床GBM标本 |
| 4419 | 2025-02-13 |
Differentiation signals induce APOBEC3A expression via GRHL3 in squamous epithelia and squamous cell carcinoma
2025-Jan, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-024-00298-9
PMID:39548236
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了APOBEC3A和APOBEC3B在健康和恶性黏膜上皮中的表达，并通过免疫组织化学、空间转录组学和功能实验验证了关键观察结果 | 研究发现APOBEC3A的表达主要局限于终末分化细胞，并需要grainyhead-like转录因子3（GRHL3），而在鳞状细胞癌中，GRHL3的表达和活性扩展到一部分进行DNA复制的细胞，同时APOBEC3A的表达也扩展到增殖细胞 | 研究未涉及APOBEC3A和APOBEC3B在其他类型癌症中的表达和作用 | 研究APOBEC3A和APOBEC3B在健康和恶性黏膜上皮中的表达及其在肿瘤发展中的作用 | 健康和恶性黏膜上皮细胞 | 分子生物学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、空间转录组学 | NA | RNA测序数据、免疫组织化学数据、空间转录组数据 | NA |
| 4420 | 2025-02-13 |
Multi-omics analysis reveals distinct gene regulatory mechanisms between primary and organoid-derived human hepatocytes
2025-Jan-01, Disease models & mechanisms
IF:4.0Q1
DOI:10.1242/dmm.050883
PMID:39878507
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组和染色质可及性分析，揭示了原代人肝细胞和肝类器官来源的肝细胞之间基因调控机制的差异 | 首次揭示了AP-1因子与肝细胞特异性转录因子（如HNF4A）在调控区域共定位的潜在合作机制，并发现ELF3在肝类器官来源的肝细胞中独特表达且与肝标志基因表达负相关 | 研究主要基于体外模型，可能无法完全反映体内肝细胞的复杂调控网络 | 研究肝细胞发育和疾病的基因调控机制 | 原代人肝细胞和肝类器官来源的肝细胞 | 基因组学 | 肝病 | 单细胞转录组分析，染色质可及性分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据，染色质可及性数据 | NA |