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当前共找到 37421 篇文献，本页显示第 4401 - 4420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4401 | 2025-11-29 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal TNC-positive cancer-associated fibroblasts that mediate immunosuppression and promote tumor progression in basal cell carcinoma
2025-Nov-27, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07491-2
PMID:41310748
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4402 | 2026-01-07 |
Single-cell and bulk transcriptome analyses revealed the role of macrophage cholesterol metabolism in atherosclerosis
2025-Nov-26, Lipids in health and disease
IF:3.9Q2
DOI:10.1186/s12944-025-02773-6
PMID:41299485
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组分析，揭示了巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的关键作用，并识别了FABP4、RNASET2和FILIP1L作为潜在诊断标志物和治疗靶点 | 结合单细胞RNA测序与批量RNA测序数据，应用机器学习算法识别与巨噬细胞胆固醇代谢相关的关键基因，并构建风险评分模型进行外部验证，同时通过体外实验验证基因功能 | 研究主要依赖于公共数据库数据，可能受样本来源和批次效应影响；体外实验验证范围有限，需进一步体内研究确认基因功能 | 探究巨噬细胞胆固醇代谢在动脉粥样硬化中的调控机制，并识别相关诊断和治疗靶点 | 动脉粥样硬化患者组织样本中的巨噬细胞及相关基因 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 逻辑回归, 机器学习算法 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的一个单细胞RNA测序数据集和多个批量mRNA转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4403 | 2026-01-07 |
Identification of osteoarthritis-related genes and potential drugs based on single cell RNA-seq data
2025-Nov-25, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01379-z
PMID:41291434
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研究论文 | 本研究基于单细胞RNA测序数据，识别骨关节炎相关基因并预测潜在药物 | 结合hdWGCNA、随机森林和PPI网络分析识别关键基因，并利用孟德尔随机化和斑马鱼实验验证药物效果 | 研究主要依赖公共数据集和预测算法，实验验证仅在斑马鱼模型中进行，未涉及人类临床试验 | 寻找骨关节炎的预防和治疗药物 | 骨关节炎相关基因和候选药物 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，RT-qPCR | 随机森林，hdWGCNA，PPI网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | NA | NA |
| 4404 | 2026-01-07 |
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04117-1
PMID:41276825
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综述 | 本文综述了结直肠癌共识分子亚型分类的研究进展及其在预后预测和个性化治疗中的应用 | 系统总结了CMS分类的预后价值、预测作用、鉴定方法（包括基于深度学习的图像分类器）、与免疫治疗等靶向治疗的关联，并探讨了肿瘤内异质性带来的挑战及单细胞测序等新兴解决方案 | 肿瘤内异质性和技术壁垒阻碍了临床广泛应用 | 回顾CMS分类在结直肠癌中的研究进展，旨在推动亚型驱动的治疗策略 | 结直肠癌及其共识分子亚型 | 自然语言处理 | 结直肠癌 | 基因表达谱分析、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | 深度学习 | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4405 | 2026-01-07 |
Multienzymatic nanocatalysts attenuate acute pancreatitis via dual modulation of pyroptotic pathways and autodigestion blockade
2025-Nov-23, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03783-3
PMID:41276804
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研究论文 | 本研究设计了一种多酶纳米催化剂，通过双重调节细胞焦亡通路和阻断胰腺自消化来治疗急性胰腺炎 | 开发了表面修饰有胰蛋白酶抑制剂Rhamnetin的单原子钴基纳米酶（Rh@SAE），首次将催化疗法应用于急性胰腺炎治疗，并同时靶向细胞焦亡和胰腺酶过度激活两个关键病理过程 | 研究主要基于动物模型，尚未进行临床试验；纳米材料的长期生物安全性需要进一步评估 | 开发新型纳米药物治疗急性胰腺炎，改善临床预后 | 急性胰腺炎（AP）和重症急性胰腺炎（SAP）的病理过程 | 纳米医学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4406 | 2026-01-07 |
SpaMWGDA: Identifying spatial domains of spatial transcriptomes using multi-view weighted fusion graph convolutional network and data augmentation
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013667
PMID:41223185
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研究论文 | 本文提出了一种基于多视图加权融合图卷积网络和数据增强的新型深度学习模型SpaMWGDA，用于空间转录组数据的空间域识别 | 通过多视图加权融合图卷积网络和数据增强，成功捕获了spot特征的全面邻域信息，并自适应地学习空间信息与基因特征之间的依赖关系 | 未在摘要中明确提及 | 提高空间转录组数据中空间域识别的准确性和效率 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 多视图加权融合图卷积网络（GCN） | 基因表达和空间信息数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4407 | 2026-01-07 |
An integrative analysis of transcriptome, methylome and single-cell RNA sequencing data identifies UBE2H as a marker of oxaliplatin resistance in colorectal cancer
2025-Oct-31, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03996-4
PMID:41174727
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组、甲基化组和单细胞RNA测序数据，识别出UBE2H作为结直肠癌对奥沙利铂耐药的潜在标志物 | 首次将多组学数据（转录组、甲基化组、单细胞RNA测序）整合分析，系统揭示了UBE2H在奥沙利铂耐药中的作用及其与免疫微环境、细胞分化和增殖状态的关联 | 研究主要基于细胞系和公共数据集，缺乏前瞻性临床队列验证；耐药机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 识别结直肠癌对奥沙利铂耐药的生物标志物并探索其生物学机制 | 结直肠癌细胞系、TCGA和GEO数据库中的结直肠癌样本、正常结肠组织单细胞数据 | 生物信息学 | 结直肠癌 | RNA-seq, DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序 | Cox比例风险模型, 差异表达分析 | 转录组数据, 甲基化数据, 单细胞基因表达数据 | 多个公共数据集（TCGA及5个GEO数据集）及细胞系数据，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 4408 | 2026-01-07 |
[Progress of scRNA-seq technology in nasopharyngeal carcinoma research]
2025-Sep, Lin chuang er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Journal of clinical otorhinolaryngology head and neck surgery
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在鼻咽癌研究中的应用进展 | 总结了scRNA-seq技术在揭示鼻咽癌肿瘤细胞亚群、进化轨迹及肿瘤微环境细胞功能与相互作用方面的新思路 | NA | 探讨scRNA-seq技术在鼻咽癌发病机制、肿瘤异质性、肿瘤微环境、耐药性及治疗反应研究中的应用 | 鼻咽癌 | 数字病理学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4409 | 2026-01-07 |
Multi-region spatial transcriptomics reveals region specific differences in response to amyloid beta (Aβ) plaque induced changes in Alzheimer's Disease (AD)
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.31.667719
PMID:40766691
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研究论文 | 本研究利用多区域空间转录组学结合Aβ免疫荧光染色，揭示了阿尔茨海默病中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异 | 首次在多个脑区同时进行空间转录组学与Aβ斑块分析，识别了抑制性神经元和细胞通讯网络的区域特异性变化 | 样本量较小（仅两名患者），且局限于Braak III和Thal 4阶段的AD病例，可能无法代表疾病全谱 | 探究阿尔茨海默病中脑区特异性对Aβ斑块诱导变化的脆弱性和恢复力的细胞与分子机制 | 两名Braak III和Thal 4阶段阿尔茨海默病患者的多个脑区组织，包括内嗅、枕颞、背外侧前额和纹状皮质 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据，免疫荧光图像 | 两名患者，覆盖四个脑区 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4410 | 2026-01-07 |
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophages-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.11.664370
PMID:40791434
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠在单次臭氧暴露模型中肺泡巨噬细胞的特异性转录组响应及其功能调控 | 首次在单细胞分辨率下系统分析了不同浓度臭氧暴露对肺泡巨噬细胞转录组的影响，并识别出浓度依赖性的通路富集和亚群特异性变化 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠，未考虑性别或品系差异；暴露时间固定为3小时，未探索不同时间点的动态变化 | 探究肺泡巨噬细胞对臭氧暴露的响应机制，特别是不同浓度下的转录组变化和功能调控 | C57BL/6J雄性成年小鼠的肺泡巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | C57BL/6J雄性成年小鼠，分为过滤空气暴露组、1 ppm臭氧暴露组和1.5 ppm臭氧暴露组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4411 | 2026-01-07 |
Intrinsic OASL expression licenses interferon induction during influenza A virus infection
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643375
PMID:40166309
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研究论文 | 本文通过分析流感A病毒感染细胞的单细胞RNA测序数据，揭示了宿主因子OASL的内在表达对IFNL诱导的关键作用 | 开发了一种分析时间序列单细胞RNA测序数据的方法，以识别调控细胞间干扰素诱导异质性的宿主因子，并首次发现干扰素刺激基因OASL的内在表达是流感A病毒感染中IFNL稳健诱导所必需的 | 未明确说明样本量或实验设计的详细限制，可能局限于流感A病毒感染的特定模型 | 识别在病毒感染中调控细胞间干扰素诱导异质性的宿主因子 | 流感A病毒感染的细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4412 | 2026-01-07 |
Spatially distinct cellular and molecular landscapes define prognosis in triple negative breast cancer
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637503
PMID:39990419
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，深入分析了三阴性乳腺癌中不同预后患者的细胞和分子异质性 | 首次利用空间转录组学技术，系统揭示了三阴性乳腺癌不同预后背后的空间和分子异质性，并识别出能高精度分类预后的上皮基因特征 | 研究样本量相对较小（32例），且为回顾性设计，可能限制结果的普遍性 | 探究三阴性乳腺癌不同预后的细胞和分子基础，以推动精准诊断和治疗策略 | 三阴性乳腺癌患者的FFPE组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 卷积神经网络（CNN） | 空间转录组数据 | 32例女性患者（17例良好预后，15例不良预后） | NA | 空间转录组学 | GeoMX® Digital Spatial Profiler | GeoMx人类全转录组图谱（WTA）面板 |
| 4413 | 2026-01-07 |
The Single-Cell Landscape of Peripheral and Tumor-infiltrating Immune Cells in HPV- HNSCC
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.632928
PMID:39868329
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据，揭示了HPV阴性头颈鳞状细胞癌中免疫细胞的动态变化及其与疾病进展的关系 | 首次整合两个单细胞RNA测序数据集，全面分析HPV阴性HNSCC中免疫细胞的分子特征和细胞间通讯模式，并发现细胞毒性免疫细胞作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 样本量相对较小（29个样本），且仅针对HPV阴性HNSCC，可能无法推广到其他亚型 | 探索HPV阴性头颈鳞状细胞癌的复杂免疫景观，以识别潜在的治疗靶点 | HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的外周血单个核细胞和肿瘤浸润免疫细胞 | 单细胞组学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，高度多重免疫荧光检测 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫荧光图像 | 29个样本，近300,000个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4414 | 2026-01-07 |
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.08.631962
PMID:39829764
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和空间转录组学数据，构建了甲状腺癌进展的图谱，识别了与疾病进展相关的成纤维细胞亚群 | 结合单细胞测序、空间转录组学和批量RNA测序，首次在甲状腺癌中定义了炎症性和肌成纤维性癌症相关成纤维细胞亚群及其空间分布 | NA | 研究甲状腺癌进展过程中的基质细胞亚群和肿瘤-基质相互作用 | 甲状腺癌样本，包括分化良好和未分化的类型 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞测序，空间转录组学，批量RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组数据，批量RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学，批量RNA-seq | NA | NA |
| 4415 | 2026-01-07 |
Construction and validation of an anoikis-related prognostic model for lung adenocarcinoma based on bulk and single-cell transcriptomic data
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0335788
PMID:41187171
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研究论文 | 本研究基于批量转录组和单细胞转录组数据，构建并验证了一个与失巢凋亡相关的肺腺癌预后模型 | 首次结合批量转录组和单细胞RNA测序数据，利用机器学习方法开发了一个包含7个基因的失巢凋亡相关预后模型，并深入探讨了TIMP1在肿瘤微环境中的作用 | 模型仅在GEO数据库的两个队列中进行了验证，需要更多独立队列和前瞻性研究来确认其临床适用性 | 开发并验证一个用于肺腺癌预后预测的失巢凋亡相关基因模型 | 肺腺癌患者及其转录组数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 多重免疫荧光 | Cox回归, LASSO回归, 随机森林 | 转录组数据 | 来自GEO数据库的两个肺腺癌队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4416 | 2026-01-07 |
Altered AP-1, RUNX and EGR chromatin dynamics drive fibrotic lung disease
2024-Oct-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619858
PMID:39554071
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研究论文 | 本研究通过多组学单核ATAC/RNA测序分析，揭示了AP-1、RUNX和EGR转录因子在纤维化肺病中的染色质动态变化及其对促纤维化基因程序的调控机制 | 首次使用神经网络工具ChromBPNet在单碱基对分辨率下推断转录因子结合，并开发新算法HALO确认AP-1、RUNX和EGR的活性，构建了TF-调控元件-基因网络 | 研究基于移植肺样本，可能无法完全反映疾病早期或动态变化，且样本量有限 | 探究纤维化肺病中成纤维细胞和巨噬细胞的转录调控机制 | 系统性硬化相关间质性肺病（SSc-ILD）患者和供体对照的肺组织 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单核ATAC-seq, 单核RNA-seq, 多组学分析 | 神经网络（ChromBPNet） | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4417 | 2026-01-07 |
ENPP1 is an innate immune checkpoint of the anticancer cGAMP-STING pathway in breast cancer
2023-12-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2313693120
PMID:38117852
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研究论文 | 本文揭示了ENPP1作为先天免疫检查点，通过抑制细胞外cGAMP-STING通路促进乳腺癌生长和转移的机制 | 首次在单细胞水平证明ENPP1通过水解细胞外cGAMP抑制STING通路，是乳腺癌免疫逃逸的关键因子 | 研究主要基于乳腺癌模型，其他癌症类型中的机制尚未完全阐明 | 探究ENPP1在乳腺癌进展中的分子机制及其作为治疗靶点的潜力 | 乳腺癌细胞、正常组织及患者样本 | 癌症免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确样本数量，但包括乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4418 | 2026-01-07 |
A distinct human cell type expressing MHCII and RORγt with dual characteristics of dendritic cells and type 3 innate lymphoid cells
2023-12-26, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2318710120
PMID:38109523
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序技术，识别并表征了人类中一种罕见的具有树突状细胞特征的RORγt细胞亚群，称为RORγt DC样细胞 | 首次在人类中识别出一种独特的RORγt DC样细胞亚群，该细胞兼具树突状细胞和3型先天淋巴样细胞的特征，并展示了其增殖潜力和向CD1c DC2样细胞分化的可塑性 | 研究主要基于体外实验，其在体内免疫稳态、炎症和自身免疫中的具体功能和影响仍需进一步探究 | 探究人类中表达RORγt的抗原呈递细胞亚群的特性、功能及其在免疫调节中的作用 | 人类RORγt DC样细胞 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 4419 | 2026-01-07 |
Genetic and immune determinants of E. coli liver abscess formation
2023-12-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2310053120
PMID:38096412
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了小鼠肝脏脓肿形成的遗传和免疫决定因素，特别是TLR4介导的早期炎症反应在脓肿易感性中的作用 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序技术，系统性地表征了E. coli肝脏脓肿的免疫细胞组成和遗传基础，并发现TLR4介导的先天免疫反应过度激活是脓肿易感性的关键驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证；脓肿形成的具体分子机制和遗传位点仍需进一步探索 | 探究E. coli感染后肝脏脓肿形成的宿主遗传和免疫决定因素 | 小鼠（特别是C57BL品系）的肝脏组织及E. coli细菌 | 空间转录组学 | 肝脏感染 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个小鼠品系（包括C57BL/6N雌性等） | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4420 | 2026-01-07 |
Interleukin-17-mediated protective cytokine signaling against degeneration of the retinal pigment epithelium
2023-12-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2311647120
PMID:38085785
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脉络膜γδ T细胞通过IL-17信号通路调控视网膜下小胶质细胞代谢重编程，从而保护视网膜色素上皮免受损伤的机制 | 首次在单细胞水平上鉴定脉络膜γδ T细胞为IL-17的主要生产者，并阐明IL-17通过受体介导的级联反应调控小胶质细胞脂质代谢的新保护机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类视网膜疾病中验证；单细胞测序数据可能受样本量和技术限制 | 探究视网膜色素上皮损伤后免疫细胞相互作用的分子机制 | 小鼠脉络膜免疫细胞和视网膜色素上皮细胞 | 单细胞组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量的小鼠脉络膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |