单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27667 篇文献，本页显示第 4401 - 4420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4401 | 2025-02-08 |
TRPV4-Expressing Tissue-Resident Macrophages Regulate the Function of Collecting Lymphatic Vessels via Thromboxane A2 Receptors in Lymphatic Muscle Cells
2024-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.21.595189
PMID:38826322
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研究论文 | 本文研究了TRPV4通道在收集淋巴管中的表达及其对淋巴管收缩功能的调节作用 | 揭示了TRPV4通道在淋巴系统中的新作用，特别是其在组织驻留巨噬细胞中的表达及其通过血栓素A2受体调节淋巴管收缩功能的机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人体中进行验证 | 表征TRPV4通道在收集淋巴管中的表达并确定其对淋巴管收缩功能的调节程度 | 收集淋巴管及其周围的细胞 | 生物医学 | 淋巴水肿 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 基因表达数据 | 来自小鼠、大鼠和非人灵长类动物的淋巴管样本 |
| 4402 | 2025-02-08 |
Accelerating Single-Cell Sequencing Data Analysis with SciDAP: A User-Friendly Approach
2024-May-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.28.582604
PMID:38464095
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研究论文 | 本文介绍了SciDAP平台，一个用户友好的单细胞测序数据分析工具，旨在简化scRNA-Seq、scATAC-Seq和scMultiome数据的分析过程 | SciDAP平台通过使用Common Workflow Language (CWL)编写的可移植和可重复的管道，为非计算专业的生物学家提供了无需编码的单细胞测序数据分析方法 | 本文未明确提及SciDAP平台在处理特定类型数据或大规模数据集时的性能限制 | 开发一个用户友好的平台，以简化单细胞测序数据的分析过程，提高分析结果的可重复性 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、单细胞ATAC测序（scATAC-Seq）和单细胞多组学测序（scMultiome）数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-Seq, scATAC-Seq, scMultiome | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 4403 | 2025-02-08 |
Leveraging single-cell transcriptomic data to uncover immune suppressive cancer cell subsets in triple-negative canine breast cancers
2024, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2024.1434617
PMID:39376916
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，识别并表征了三阴性犬乳腺癌中的免疫抑制亚群 | 首次在三阴性犬乳腺癌中识别出免疫抑制亚群，并揭示了其通过抗炎和M2样巨噬细胞等机制促进免疫逃逸的潜在途径 | 研究依赖于已发布的单细胞RNA测序数据集，样本量较小（30只犬），可能限制了结果的普适性 | 识别和表征三阴性犬乳腺癌中的免疫抑制亚群，以揭示其免疫逃逸机制 | 三阴性犬乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 30只犬的样本 |
| 4404 | 2025-02-08 |
Idiopathic subglottic stenosis arises at the epithelial interface of host and pathogen
2023-May-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2945067/v1
PMID:37292825
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了特发性声门下狭窄（iSGS）的发病机制，揭示了上皮细胞变化与微生物群位移、免疫激活和局部纤维化之间的关系 | 首次利用单细胞RNA测序技术对iSGS患者的近端气道瘢痕进行无偏倚的细胞亚群表征，并详细描述了其分子表型，揭示了上皮细胞变化与微生物群位移、免疫激活和局部纤维化之间的关系 | 疾病罕见性和患者地理分布广泛限制了iSGS发病机制的实质性机制研究 | 研究特发性声门下狭窄（iSGS）的发病机制 | 特发性声门下狭窄（iSGS）患者的近端气道瘢痕组织 | 生物医学 | 特发性声门下狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 国际iSGS患者队列的致病性黏膜样本 |
| 4405 | 2025-02-08 |
Epitenon-derived cells comprise a distinct progenitor population that contributes to both tendon fibrosis and regeneration following acute injury
2023-Feb-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.30.526242
PMID:36778469
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研究论文 | 本文通过遗传谱系追踪和单细胞RNA测序技术，识别了一种源自腱外膜的双向祖细胞群，该细胞群在急性肌腱损伤后既参与腱周纤维化，也参与肌腱的再生愈合 | 首次识别出一种源自腱外膜的双向祖细胞群，并揭示了其在肌腱损伤愈合过程中的双重作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证仍需进一步扩展 | 探索肌腱损伤愈合过程中细胞群的作用，以改善肌腱愈合的治疗方法 | 小鼠和人类的腱外膜细胞及腱周纤维化组织 | 生物医学 | 肌腱损伤 | 遗传谱系追踪、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型及人类腱周纤维化组织样本 |
| 4406 | 2025-02-07 |
Emerging technologies of single-cell multi-omics
2025-Feb-06, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2022.282557
PMID:39911109
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综述 | 本文综述了单细胞多组学技术的最新进展，包括其原理、历史发展以及不断扩展的多组学工具 | 单细胞多组学技术能够直接测量每个细胞的个体信号，显著增强了揭示细胞异质性的能力 | NA | 为研究者选择最适合其研究需求的单细胞多组学平台提供指导 | 正常和恶性造血系统中的遗传克隆性和转录异质性 | 分子生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 4407 | 2025-02-07 |
The use of deidentified organ donor testes for research
2025-Feb-06, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70008
PMID:39912553
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综述 | 本文讨论了使用去识别化的人类睾丸捐赠组织进行基础科学研究的情况 | 强调了使用去识别化的人类睾丸捐赠组织进行研究的价值，特别是在人类睾丸发育和功能研究中的独特优势 | 使用去识别化的人类睾丸捐赠组织可能面临伦理和获取难度的问题 | 探讨人类睾丸发育和功能，以改进不育症的治疗和诊断 | 去识别化的人类睾丸捐赠组织 | 生殖医学 | 不育症 | 单细胞转录组和表观基因组分析 | NA | 组织样本 | NA |
| 4408 | 2025-02-07 |
An inducible mouse model of OI type V reveals aberrant osteogenesis caused by Ifitm5 c.-14C > T mutation
2025-Feb-05, Journal of bone and mineral research : the official journal of the American Society for Bone and Mineral Research
IF:5.1Q1
DOI:10.1093/jbmr/zjaf022
PMID:39908237
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研究论文 | 本文开发了一种可诱导的小鼠模型，用于研究由Ifitm5 c.-14C>T突变引起的V型成骨不全症的病理机制 | 开发了一种新的可诱导小鼠模型，能够在不同发育阶段通过Cre表达来探索MALEP-IFITM5蛋白的致病效应 | 尽管模型解决了胚胎致死性问题，但仍需进一步研究以全面理解MALEP-IFITM5的分子机制 | 探索V型成骨不全症的病理机制，特别是由Ifitm5 c.-14C>T突变引起的异常成骨 | 可诱导的Ifitm5flox c.-14C>T小鼠模型 | 分子生物学 | 成骨不全症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 多种Cre表达的小鼠模型 |
| 4409 | 2025-02-07 |
Loss of 18q Alters TGFβ Signalling Affecting Anteroposterior Neuroectodermal Fate in Human Embryonic Stem Cells
2025-Feb-05, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13813
PMID:39908990
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研究论文 | 本文研究了染色体18q缺失如何影响人类胚胎干细胞（hESCs）向视网膜祖细胞分化的能力，并探讨了TGFβ信号通路在此过程中的作用 | 首次揭示了18q缺失通过影响TGFβ信号通路，导致hESCs在前后神经外胚层命运决定中的异常 | 研究仅限于实验室条件下的hESCs，未涉及体内环境或临床样本 | 探究染色体异常对hESCs分化能力的影响，特别是18q缺失对神经外胚层命运决定的作用 | 人类胚胎干细胞（hESCs） | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具有复杂核型的hESCs细胞系 |
| 4410 | 2025-02-07 |
SCovid v2.0: a comprehensive resource to decipher the molecular characteristics across tissues in COVID-19 and other human coronaviruses
2025-Feb-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01933-24
PMID:39714149
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研究论文 | SCovid v2.0是一个更新的数据库，旨在通过转录组测序帮助研究人员揭示2019冠状病毒病（COVID-19）在不同组织中的分子特征 | SCovid v2.0相较于其前身，增加了全面的数据、实用的功能，并重建了分析流程，包括更多的单细胞RNA测序数据和批量RNA测序数据，以及与其他人类冠状病毒的比较分析 | NA | 揭示COVID-19在不同组织中的分子特征，并进行与其他人类冠状病毒的比较分析 | COVID-19及其他人类冠状病毒的分子特征 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 3,544,360个细胞来自45个单细胞RNA测序数据集，涵盖15个组织的789个样本；1,688个样本来自12个组织的62个COVID-19批量RNA测序数据；7个与其他人类冠状病毒相关的批量RNA测序数据集 |
| 4411 | 2025-02-07 |
Development of a prognostic model based on four genes related to exhausted CD8+ T cell in triple-negative breast cancer patients: a comprehensive analysis integrating scRNA-seq and bulk RNA-seq
2025-Feb-03, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01812-z
PMID:39899181
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研究论文 | 本研究旨在开发基于与耗竭CD8+ T细胞相关的四个基因的三阴性乳腺癌（TNBC）预后模型，并探讨其临床和免疫相关性 | 通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序（bulk RNA-seq）数据，筛选出与TNBC患者生存显著相关的四个基因，构建了一个新的预后模型 | 研究主要依赖于公开数据集，缺乏独立的外部验证队列 | 开发一个基于耗竭CD8+ T细胞相关基因的TNBC预后模型，并评估其临床和免疫相关性 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | 预后模型 | RNA测序数据 | TCGA队列和外部队列的TNBC患者数据 |
| 4412 | 2025-02-07 |
EMT-driven plasticity prospectively increases cell-cell variability to promote therapeutic adaptation in breast cancer
2025-Feb-03, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03637-w
PMID:39901189
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研究论文 | 本文研究了上皮-间质转化（EMT）驱动的细胞可塑性在三阴性乳腺癌（TNBC）治疗适应中的作用 | 首次揭示了EMT驱动的可塑性如何增加细胞间表型多样性，并在化疗前产生罕见的预适应状态 | 研究仅基于体外模型，未涉及体内环境 | 探讨EMT驱动的可塑性在TNBC治疗适应中的作用 | 三阴性乳腺癌（TNBC）细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 两个TNBC体外模型 |
| 4413 | 2025-02-07 |
Oxygen-dependent alternative mRNA splicing and a cone-specific motor protein revealed by single-cell RNA sequencing in hypoxic retinas
2025-Feb, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2024.110190
PMID:39638278
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了缺氧条件下小鼠视网膜中特定细胞类型的反应，揭示了氧依赖的mRNA选择性剪接和锥体特异性运动蛋白Kif4的表达 | 首次在缺氧视网膜中发现了锥体特异性运动蛋白Kif4的强烈诱导表达，并揭示了RNA结合蛋白Rbm3和Cirbp在缺氧条件下的异构体转换 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类视网膜的缺氧反应 | 理解特定视网膜细胞类型在缺氧条件下的反应机制 | 小鼠视网膜细胞 | 单细胞RNA测序 | 视网膜退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠视网膜细胞 |
| 4414 | 2025-02-07 |
CRISPR-Cas9 screening identifies the role of FER as a tumor suppressor
2025-Feb, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6374
PMID:39648412
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研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9筛选技术鉴定了FER作为肿瘤抑制基因的作用，并揭示了其在肿瘤发生和进展中的关键角色 | 首次通过体内全基因组CRISPR-Cas9筛选技术鉴定FER为肿瘤抑制基因，并揭示了其在肿瘤发生和进展中的具体机制 | 研究主要基于实验模型，尚未在临床样本中广泛验证 | 系统识别肿瘤抑制基因以增进对肿瘤发生的理解，并开发早期诊断和疾病进展缓解策略 | FER基因及其在肿瘤发生和进展中的作用 | 肿瘤生物学 | 肿瘤 | CRISPR-Cas9筛选, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4415 | 2025-02-07 |
Heterogeneity of tertiary lymphoid structures predicts the response to neoadjuvant therapy and immune microenvironment characteristics in triple-negative breast cancer
2025-Feb, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02917-y
PMID:39658606
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研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）中三级淋巴结构（TLSs）对新辅助治疗（NAT）反应和免疫微环境特征的预测作用 | 首次结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫荧光染色（mIF）和放射组学技术，评估TNBC患者NAT前后的TLSs和肿瘤微环境（TME）变化，并开发了预测TLS状态和NAT疗效的影像生物标志物评分系统 | CD8+T细胞水平未能有效预测NAT反应，研究样本量未明确说明 | 探讨TLSs在TNBC中对NAT反应和免疫微环境特征的预测作用 | 三阴性乳腺癌（TNBC）患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重免疫荧光染色（mIF）、放射组学 | NA | RNA测序数据、影像数据 | NA |
| 4416 | 2025-02-07 |
TEAD1-Mediated Trans-Differentiation of Vascular Smooth Muscle Cells into Fibroblast-Like Cells Contributes to the Stabilization and Repair of Disrupted Atherosclerotic Plaques
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407408
PMID:39665254
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研究论文 | 本研究揭示了TEAD1在促进血管平滑肌细胞（VSMCs）向成纤维样细胞转分化中的关键作用，以及这一过程在动脉粥样硬化斑块稳定性和破裂后修复中的重要性 | 首次通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和VSMC谱系追踪研究，揭示了TEAD1在VSMCs向成纤维样细胞转分化中的关键作用，并阐明了其通过Wnt4/β-Catenin通路促进斑块稳定性和修复的机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探讨TEAD1在动脉粥样硬化斑块稳定性和破裂后修复中的作用 | 血管平滑肌细胞（VSMCs） | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 4417 | 2025-02-07 |
Single-Nucleus and Spatial Transcriptome Profiling Delineates the Multicellular Ecosystem in Hepatocellular Carcinoma After Hepatic Arterial Infusion Chemotherapy
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405749
PMID:39686623
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研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学技术，描绘了肝动脉灌注化疗（HAIC）后肝细胞癌（HCC）的多细胞生态系统 | 首次整合单核RNA测序和空间转录组学技术，详细描述了HAIC治疗后HCC的多细胞生态系统，并揭示了CD4 T、CD20 B和树突状细胞亚型的增加及其在细胞通讯中的作用 | 研究样本量有限，且未涉及长期随访数据 | 研究HAIC治疗后HCC的多细胞生态系统 | 肝细胞癌（HCC）患者 | 数字病理学 | 肝癌 | 单核RNA测序，空间转录组学 | NA | RNA测序数据，空间转录组数据 | 治疗前和治疗后的HCC肿瘤样本 |
| 4418 | 2025-02-06 |
Single-cell transcriptomics and metabolomic analysis reveal adenosine-derived metabolites over-representation in pseudohypoxic neuroendocrine tumours
2025-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70159
PMID:39902723
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4419 | 2025-02-07 |
Differentiation of lung tissue-resident c-Kit+ cells into microvascular endothelial cells alleviates pulmonary vascular remodeling
2025-Jan-29, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.01.010
PMID:39909047
|
研究论文 | 本文探讨了肺组织驻留的c-Kit+细胞分化为微血管内皮细胞对缓解肺血管重塑的作用 | 揭示了肺组织驻留的c-Kit+细胞通过分化为成熟内皮细胞在肺血管重塑中的保护作用，并提出了通过靶向NR2F2表达来逆转肺血管重塑的新策略 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨肺组织驻留的c-Kit+细胞在肺血管重塑中的作用及其潜在治疗策略 | 肺组织驻留的c-Kit+细胞及其分化为内皮细胞的潜力 | 生物医学 | 肺血管疾病 | 遗传谱系追踪、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | SU5416/缺氧（SuHx）诱导的肺血管重塑小鼠模型 | 基因表达数据 | 肺血管重塑小鼠模型及肺高压患者样本 |
| 4420 | 2025-02-07 |
Molecular and cellular morphology of placenta unveils new mechanisms of reproductive immunology
2025-Jan-20, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.01.025
PMID:39842636
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研究论文 | 本文通过空间转录组学、多重免疫组化和双重标记技术，研究了早期和晚期胎盘的分子和细胞特征，揭示了人类生殖过程中免疫调节的新机制 | 发现了胚胎滋养层在植入前早期表达免疫检查点蛋白，揭示了胎儿和母体免疫系统之间的免疫反应机制，并提出了胎儿驱动的免疫平衡机制 | 研究主要基于正常和异位妊娠以及动物模型，可能无法完全代表所有人类妊娠情况 | 研究胎盘在早期和晚期的分子和细胞特征，以更好地理解人类生殖过程中的免疫调节 | 早期和晚期胎盘、正常和异位妊娠、动物模型 | 生殖免疫学 | NA | 空间转录组学(ST)、多重免疫组化、双重标记（免疫组化和荧光原位杂交(FISH)） | NA | 组织、细胞、蛋白质和分子水平的数据 | 正常和异位妊娠样本及动物模型 |