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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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4381 | 2025-02-11 |
Key Considerations on CITE-Seq for Single-Cell Multiomics
2025-Feb-09, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202400011
PMID:39924789
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综述 | 本文综述了CITE-Seq技术,一种同时分析单个细胞中基因表达和蛋白质丰度的先进单细胞测序方法 | 本文详细介绍了CITE-Seq的工作流程,并提供了使用抗体衍生标签(ADTs)染色细胞的关键考虑因素 | 本文主要基于微孔单细胞分析系统,可能不涵盖所有CITE-Seq应用场景 | 探讨CITE-Seq技术在单细胞多组学分析中的应用 | 单个细胞中的基因表达和蛋白质丰度 | 单细胞测序 | NA | CITE-Seq, 单细胞mRNA测序, 抗体衍生标签(ADTs) | NA | 基因表达数据, 蛋白质丰度数据 | NA |
4382 | 2025-02-11 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing data to construct and validate a signature based on NK cell marker genes to predict immunotherapy response and prognosis in colorectal cancer
2025-Feb-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01842-7
PMID:39920524
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研究论文 | 本研究旨在构建基于NK细胞标记基因的签名,以预测结直肠癌患者的免疫治疗反应和预后 | 通过整合单细胞RNA测序数据和TCGA结直肠癌样本的WGCNA分析,识别出NK细胞相关的核心基因和特征基因,并构建了一个新的预后签名 | 研究依赖于公开数据集,可能受到数据质量和样本选择的限制 | 预测结直肠癌患者的免疫治疗反应和预后 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),加权基因共表达网络分析(WGCNA) | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 587个TCGA结直肠癌样本,124和201个GEO验证样本 |
4383 | 2025-02-11 |
TAp63γ is the primary isoform of TP63 for tumor suppression but not development
2025-Feb-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02326-x
PMID:39915463
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研究论文 | 本文探讨了TP63基因的不同亚型在肿瘤抑制和发育中的作用,特别是TAp63γ的功能 | 首次通过CRISPR-cas9技术生成p63γ缺陷小鼠模型,揭示了TAp63γ在肿瘤抑制中的主要作用,而非发育 | 研究主要基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探索TP63基因不同亚型在肿瘤抑制和发育中的具体功能 | TP63基因的不同亚型,特别是TAp63γ | 分子生物学 | 肿瘤 | CRISPR-cas9, 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | p63γ缺陷小鼠 |
4384 | 2025-02-11 |
MiR-18a-LncRNA NONRATG-022419 pairs targeted PRG-1 regulates diabetic induced cognitive impairment by regulating NGF\BDNF-Trkb signaling pathway
2025-Feb-06, Proteome science
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12953-025-00239-2
PMID:39915794
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病诱导的认知功能障碍(DCD)中PRG-1的分子机制和细胞异质性,以及其在突触可塑性调节中的作用 | 揭示了PRG-1通过NGF/BDNF-Trkb信号通路在DCD中的突触可塑性调节作用,并发现了miR-18a-LncRNA NONRATG-022419对PRG-1的靶向调控 | 研究主要基于体外高糖诱导的HT22细胞损伤模型,尚未在体内模型中验证 | 探讨糖尿病诱导的认知功能障碍(DCD)的分子机制和细胞异质性,以及PRG-1在该过程中的功能作用 | 海马细胞、HT22细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RNA转录组分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
4385 | 2025-02-11 |
Retinoic acid antagonizes estrogen signaling to maintain adult uterine cell fate
2025-Feb-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416089122
PMID:39874292
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研究论文 | 本研究通过遗传学证据揭示了视黄酸(RA)和雌激素信号在维持成年小鼠子宫上皮细胞命运中的拮抗作用 | 首次提供了RA和雌激素信号在维持成年子宫上皮细胞命运中拮抗作用的遗传学证据,并揭示了RA信号缺失导致的细胞命运转变和免疫细胞浸润 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探讨RA和雌激素信号在维持成年子宫上皮细胞命运中的作用 | 小鼠子宫上皮细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种相关小鼠遗传模型 |
4386 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human blood eosinophils reveals plasticity and absence of canonical cell subsets
2025-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16213
PMID:38934897
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
4387 | 2025-02-11 |
Changes in border-associated macrophages after stroke: single-cell sequencing analysis
2025-Jan-29, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01092
PMID:39927762
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研究论文 | 本文通过单细胞测序分析研究了中风后边界相关巨噬细胞的变化 | 首次全面分析了中风后边界相关巨噬细胞的转录变化及其在炎症相关通路中的调控作用 | 许多细节和潜在机制仍不清楚 | 研究中风后边界相关巨噬细胞的变化及其在神经炎症中的作用 | 小鼠边界相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 中风 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的GSE174574和GSE225948数据集 |
4388 | 2025-02-10 |
Single-cell Sequencing Traces Mitochondrial Transfers
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae092
PMID:39724171
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
4389 | 2025-02-11 |
Whole-exome sequencing association study reveals genetic effects on tumor microenvironment components in nasopharyngeal carcinoma
2025-Jan-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI182768
PMID:39744943
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研究论文 | 本文通过全外显子测序关联研究揭示了鼻咽癌肿瘤微环境成分的遗传影响 | 揭示了与鼻咽癌易感性相关的3种遗传变异,并引入了一种改进的复合多基因风险评分(rcPRS),在预测鼻咽癌风险方面优于现有模型 | NA | 研究鼻咽癌的遗传基础及其与肿瘤微环境成分的相互作用 | 鼻咽癌患者和对照组 | 基因组学 | 鼻咽癌 | 全外显子测序、批量转录组测序、单细胞RNA测序 | 复合多基因风险评分(rcPRS) | 基因组数据、转录组数据 | 6,969例鼻咽癌患者和7,100例对照 |
4390 | 2025-02-11 |
Single-cell transcriptomes of dissecting the intra-tumoral heterogeneity of breast cancer microenvironment
2024-Dec-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06015-7
PMID:39724260
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析,探讨了乳腺癌微环境中的肿瘤内异质性机制 | 识别了恶性上皮细胞的六种常见表达程序和六种亚型特异性表达程序,揭示了乳腺癌中髓系细胞谱系的深刻细胞异质性 | 样本量较小,仅包括4名恶性和4名非恶性患者的样本 | 研究乳腺癌异质性发展的机制及其在单细胞转录组中的作用 | 乳腺癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞转录组数据 | 54,055个高质量细胞,来自4名恶性和4名非恶性患者的临床样本 |
4391 | 2025-02-11 |
Integrated analysis reveals prognostic correlation and immune characteristics of a tumor-associated macrophage-based risk signature in triple-negative breast cancer
2024-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1037
PMID:39525038
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据识别了三阴性乳腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞簇,构建了与预后相关的风险特征,并验证了其与免疫特征的关系 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别了三阴性乳腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞簇,并构建了一个8基因风险特征,验证了其作为独立预后因素的价值 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据,样本量和数据来源可能限制了结果的普适性 | 探索三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的特性,构建与预后相关的风险特征,并验证其与免疫特征的关系 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),逆转录聚合酶链反应(RT-PCR),蛋白质印迹(Western blot),免疫组织化学 | LASSO回归 | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
4392 | 2025-02-11 |
Cystic fibrosis-related diabetes is associated with reduced islet protein expression of GLP-1 receptor and perturbation of cell-specific transcriptional programs
2024-10-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-76722-1
PMID:39463434
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研究论文 | 本文研究了囊性纤维化相关糖尿病(CFRD)中胰岛GLP-1受体蛋白表达的减少及其对胰岛素分泌的影响 | 通过空间转录组学技术揭示了CFRD患者胰岛中α和β细胞基因的差异表达,并发现GLP-1受体蛋白水平的降低可能是胰岛素分泌受损的原因 | 研究样本量未明确说明,且仅针对CFRD患者,未涉及其他类型的糖尿病 | 探讨CFRD中胰岛GLP-1及其信号成分的表达变化,以改善CFRD的治疗方法 | CFRD患者的胰腺组织 | 生物医学 | 囊性纤维化相关糖尿病 | 免疫组织化学、空间转录组学 | NA | 组织样本、基因表达数据 | 未明确说明 |
4393 | 2025-02-11 |
Sympathetic neuropeptide Y protects from obesity by sustaining thermogenic fat
2024-Oct, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-07863-6
PMID:39198648
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研究论文 | 本文揭示了交感神经元中的神经肽Y(NPY)如何通过维持产热脂肪来防止肥胖的机制 | 发现了NPY在交感神经元中通过维持血管周围细胞来保护肥胖的新机制,并揭示了NPY在能量消耗中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 研究NPY在交感神经元中防止肥胖的机制 | 小鼠的棕色脂肪组织(BAT)和白色脂肪组织(WAT) | 生物医学 | 肥胖 | 单细胞RNA测序、成像技术 | 小鼠模型 | 基因表达数据、成像数据 | 小鼠脂肪组织样本 |
4394 | 2025-02-11 |
The CD8+ T cell tolerance checkpoint triggers a distinct differentiation state defined by protein translation defects
2024-06-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.026
PMID:38776918
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研究论文 | 本文研究了外周CD8+ T细胞耐受性检查点,揭示了其与自身免疫疾病和抗癌免疫的关系 | 通过流式细胞术、单细胞RNA测序和染色质可及性分析,发现耐受性触发了一种与耗竭、记忆和功能性效应细胞不同的分化状态 | 研究主要关注于小鼠模型,可能需要在人类样本中进一步验证 | 探讨外周CD8+ T细胞耐受性检查点的分子机制及其在自身免疫疾病和抗癌免疫中的作用 | 外周CD8+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病, 癌症 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 染色质可及性分析 | NA | RNA测序数据, 染色质可及性数据 | NA |
4395 | 2025-02-11 |
β-cell Jagged1 is sufficient but not necessary for islet Notch activity and insulin secretory defects in obese mice
2024-Mar, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2024.101894
PMID:38311286
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研究论文 | 本文研究了肥胖小鼠和2型糖尿病患者胰岛中Jagged1的表达及其对Notch信号通路和胰岛素分泌缺陷的影响 | 研究发现Jagged1是肥胖小鼠和2型糖尿病患者胰岛中Notch活性增加的唯一配体,并通过中和抗体实验证明抑制Jagged1-Notch信号可能具有治疗益处 | 遗传功能丧失实验表明β细胞可能不是Jagged1信号的来源,这限制了Jagged1作为治疗靶点的潜力 | 研究Jagged1在肥胖小鼠和2型糖尿病患者胰岛中的表达及其对Notch信号通路和胰岛素分泌缺陷的影响 | 肥胖小鼠和2型糖尿病患者的胰岛 | 生物医学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),葡萄糖耐量测试,单克隆中和抗体 | NA | 基因表达数据,生理数据 | 高脂饮食喂养的小鼠和瘦素受体缺陷小鼠,以及有和无2型糖尿病患者的胰岛 |
4396 | 2025-02-11 |
Single-cell RNA-seq and single-cell bisulfite-sequencing reveal insights into yak preimplantation embryogenesis
2024-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105562
PMID:38097189
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和单细胞亚硫酸盐测序揭示了牦牛胚胎植入前发育过程中的基因表达和DNA甲基化变化 | 结合单细胞DNA甲基化和转录组分析,鉴定了43个可能与胚胎发育相关的候选甲基化驱动基因,并确定了与组蛋白去乙酰化酶HDAC1/2相关的表观遗传修饰对胚胎发育的重要性 | 研究主要聚焦于牦牛胚胎,可能限制了其在其他物种中的普适性 | 研究牦牛胚胎植入前发育过程中的表观遗传重编程及其对转录调控网络的影响 | 牦牛的卵母细胞和不同发育阶段的胚胎 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞亚硫酸盐测序 | NA | 单细胞基因表达数据, 单细胞DNA甲基化数据 | 牦牛的卵母细胞和一系列不同发育阶段的胚胎 |
4397 | 2025-02-11 |
Human placental cells are resistant to SARS-CoV-2 infection and replication
2024, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.20514.2
PMID:39640372
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术,探讨了人类胎盘细胞对SARS-CoV-2感染的易感性及其支持病毒释放的能力 | 首次量化了胎盘细胞对SARS-CoV-2感染的易感性,并确定了其支持病毒释放的能力 | 研究主要依赖于体外实验,可能无法完全反映体内情况 | 探讨SARS-CoV-2在胎盘细胞中的感染和复制能力 | 人类胎盘细胞 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序(scRNAseq),共聚焦显微镜 | NA | RNA测序数据,显微镜图像 | 包括早期妊娠和足月胎盘细胞,以及JEG-3、JAR和HUVEC细胞系 |
4398 | 2025-02-11 |
Here and there a trophoblast, a transcriptional evaluation of trophoblast cell models
2022-Nov-08, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04589-4
PMID:36346530
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综述 | 本文综述了人类滋养层细胞和干细胞(hTSCs)模型的转录组数据,评估了这些模型的实用性和适用性 | 整合了单细胞RNA测序数据集,以识别这些模型如何重现早期滋养层发育 | NA | 评估人类滋养层细胞和干细胞模型的转录组数据,以确定其在实际应用中的价值 | 人类滋养层细胞和干细胞模型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
4399 | 2025-02-11 |
CD34+ cell atlas of main organs implicates its impact on fibrosis
2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04606-6
PMID:36315271
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析和遗传谱系追踪小鼠模型,研究了CD34+细胞在生理和病理条件下的异质性及其在血管生成和器官纤维化中的作用 | 揭示了CD34+细胞在血管生成和器官纤维化中的双重作用,特别是表达Pi16的CD34+细胞可能转化为肌成纤维细胞并参与器官纤维化 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探讨CD34+细胞在生理和病理条件下的身份和作用,特别是其在血管生成和器官纤维化中的角色 | CD34+细胞 | 单细胞RNA测序 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,遗传谱系追踪 | 遗传谱系追踪小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
4400 | 2025-02-11 |
Integrative insights and clinical applications of single-cell sequencing in cancer immunotherapy
2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04608-4
PMID:36316529
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综述 | 本文综述了单细胞测序在癌症免疫治疗中的进展和应用 | 单细胞测序提供了单细胞水平的多维度细胞特征,揭示了肿瘤微环境的复杂性、肿瘤异质性的普遍性、细胞组成和细胞间相互作用、细胞谱系追踪以及肿瘤耐药机制 | 单细胞技术的临床转化尚未深入,特别是在免疫治疗中的应用 | 提高免疫治疗疗效,推动精准医学发展 | 癌症患者 | 数字病理 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组和多组学数据 | NA |