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当前共找到 32188 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-31 |
Identification of m5C-related genes and subclusters in recurrent pregnancy loss
2025-Sep, Journal of assisted reproduction and genetics
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10815-025-03580-9
PMID:40751792
|
研究论文 | 通过生物信息学方法鉴定复发性流产中m5C相关基因及其亚群 | 首次将复发性流产患者分为两个不同亚群，并分析其免疫微环境差异 | 样本量较小（48例子宫内膜组织样本） | 阐明m5C相关基因与复发性流产发病机制的关系 | 复发性流产患者的子宫内膜组织 | 生物信息学 | 复发性流产 | 机器学习，单细胞RNA测序，基因集富集分析 | 机器学习模型，列线图 | 基因表达数据 | 48例子宫内膜组织样本（24例RPL样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 422 | 2025-10-31 |
Spatial transcriptomics: a bibliometric analysis with large language model on English literatures
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf553
PMID:41139313
|
文献计量分析 | 使用大语言模型对空间转录组学英文文献进行文献计量分析 | 首次将大语言模型应用于空间转录组学领域的文献计量分析，使研究结果更加全面和具体 | 仅基于Web of Science数据库的1197篇英文文献（2015-2024年），可能存在文献覆盖不全的局限性 | 分析空间转录组学领域的研究趋势、期刊分布和关键词演变 | 1197篇空间转录组学相关英文文献 | 自然语言处理 | 癌症 | 文献计量分析，大语言模型 | 大语言模型 | 文本 | 1197篇文献 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 423 | 2025-10-31 |
scDETECT: a novel statistical model accounting for cell type correlation in single-cell RNA-seq differential expression analysis
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf556
PMID:41139925
|
研究论文 | 开发了一种考虑细胞类型相关性的单细胞RNA-seq差异表达分析新方法 | 首次在单细胞RNA-seq差异表达分析中通过贝叶斯层次模型考虑细胞类型相关性 | NA | 提高单细胞RNA-seq差异表达分析的准确性和统计功效 | 单细胞RNA-seq数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯层次模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 424 | 2025-10-31 |
scVGAMF: a novel imputation method for scRNA-seq data by integrating linear and non-linear features
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf562
PMID:41139927
|
研究论文 | 提出一种整合线性和非线性特征的单细胞RNA测序数据插补新方法scVGAMF | 首次将非负矩阵分解与变分图自编码器结合，同时捕捉scRNA-seq数据中的线性和非线性特征 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中dropout事件导致的缺失值问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解, 变分图自编码器, 全连接神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 425 | 2025-10-31 |
ChromoPattern: characterizing chromosomal rearrangement patterns of copy number alteration in heterogeneous tumor cell populations at single-cell resolution
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf563
PMID:41148222
|
研究论文 | 开发了ChromoPattern计算框架，用于在单细胞分辨率下量化肿瘤细胞群中与复杂拷贝数变异机制相关的染色体重排模式 | 首个能够在单细胞分辨率下系统量化四种不同染色体重排模式的计算框架，揭示了振荡模式在肿瘤异质性和进化中的关键作用 | 方法验证主要基于模拟数据和有限的实际样本，需要更广泛的临床应用验证 | 研究染色体不稳定性导致的拷贝数变异模式在肿瘤异质性和进化中的作用 | 肝癌细胞系和乳腺癌患者的单细胞DNA测序数据 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 基因组测序数据, 转录组测序数据 | 肝癌细胞系和乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞DNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 426 | 2025-10-31 |
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.649977
PMID:40631230
|
研究论文 | 提出了一种基于基因组语言模型的无参考框架spRefine，用于空间转录组数据的去噪和插补 | 首次将基因组语言模型应用于空间转录组数据的联合去噪和插补，无需参考数据集 | 未明确说明 | 解决空间转录组数据的高噪声和基因测量缺失问题 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 衰老相关疾病 | 深度学习，基因组语言模型 | 深度学习框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 427 | 2025-10-31 |
NEUROD1 efficiently converts peripheral blood cells into neurons with partial reprogramming by pluripotency factors
2025-May-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2401387122
PMID:40299704
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过NEUROD1和四种山中因子将外周血细胞直接重编程为神经元的高效方法 | 首次使用外周血细胞替代成纤维细胞，通过五种关键转录因子组合在3周内实现谷氨酸能神经元直接重编程，无需iPSC中间阶段 | 未明确说明重编程效率的具体数值和神经元功能的全面验证 | 开发一种非侵入性、高效快速的神经元直接重编程方法 | 外周血细胞 | 细胞重编程 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 全基因组亚硫酸氢盐测序, Cre-LoxP谱系追踪 | NA | 基因表达数据, 甲基化数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组测序 | NA | NA |
| 428 | 2025-10-31 |
scBSP: A fast and accurate tool for identifying spatially variable features from high-resolution spatial omics data
2025-Feb-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.02.636138
PMID:39974940
|
研究论文 | 介绍了一个用于从高分辨率空间组学数据中识别空间可变特征的快速准确工具scBSP | 利用稀疏矩阵运算显著提高计算效率，能够处理数百万细胞级别的二维和三维数据，是目前处理此类数据最快的工具 | NA | 开发高效识别空间组学数据中空间可变特征的计算工具 | 空间组学数据中的空间可变基因和空间可变峰 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间组学测序 | 稀疏矩阵运算 | 空间组学数据 | 181,367个位点，19,950个基因 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Xenium空间转录组平台 |
| 429 | 2025-10-31 |
Proteome-wide and network pharmacology integration identifies sunitinib as a potential therapeutic for type 2 diabetes targets
2025, Therapeutic advances in endocrinology and metabolism
IF:3.9Q2
DOI:10.1177/20420188251376325
PMID:41146943
|
研究论文 | 通过全蛋白质组孟德尔随机化分析和网络药理学整合，识别出舒尼替尼作为2型糖尿病的潜在治疗药物 | 首次将全蛋白质组孟德尔随机化分析与网络药理学整合，系统识别2型糖尿病治疗靶点并发现舒尼替尼的潜在治疗价值 | 需要未来临床试验验证研究结果并评估舒尼替尼的实际疗效 | 识别2型糖尿病的潜在生物标志物和治疗靶点 | 人类蛋白质组与2型糖尿病关联 | 生物信息学 | 2型糖尿病 | 孟德尔随机化分析,蛋白质-蛋白质相互作用网络,通路富集分析,单细胞RNA测序 | 逆方差加权MR,贝叶斯加权MR | 蛋白质组数据,基因组数据 | deCODE Genetics: 35,559个体(4,907种蛋白质); FinnGen研究: 65,085例T2D病例,335,112例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 430 | 2025-10-31 |
scBSP: A fast and accurate tool for identifying spatially variable genes from spatial transcriptomic data
2024-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.06.592851
PMID:38765956
|
研究论文 | 开发了一个名为scBSP的快速准确工具，用于从空间转录组数据中识别空间可变基因 | 实现了稀疏矩阵运算，显著提高了计算效率和内存使用，能在10秒内处理包含19,950个基因和181,367个点的高清空间转录组数据 | NA | 开发高效识别空间可变基因的计算工具 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 稀疏矩阵运算 | 空间转录组数据 | 19,950个基因，181,367个点，可达数百万个细胞 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 431 | 2025-10-30 |
Biomimetic bone niche reconstructs proliferation-inhibited and therapy-resistant bone-metastatic prostate cancer
2026-Feb, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.09.041
PMID:41141585
|
研究论文 | 开发了一种模拟骨微环境的3D生物仿生平台，用于研究前列腺癌骨转移中的增殖抑制和耐药机制 | 首次通过整合磷酸钙支架、脱细胞基质、间充质干细胞和成骨细胞构建了能够诱导前列腺癌细胞进入增殖抑制状态的仿生骨微环境 | 模型仍需进一步验证其在更广泛临床样本中的适用性 | 研究前列腺癌骨转移中增殖抑制和耐药机制 | 前列腺癌细胞、间充质干细胞、成骨细胞 | 组织工程与癌症研究 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序、3D组织工程 | 3D生物仿生模型 | 转录组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2025-10-30 |
SIGLEC15 modulates the immunosuppressive microenvironment and suppresses malignant phenotypes in triple-negative breast cancer
2026-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101799
PMID:41158758
|
研究论文 | 本研究探讨SIGLEC15在三阴性乳腺癌中调节免疫抑制微环境及抑制恶性表型的作用机制 | 首次系统揭示SIGLEC15通过调控EMT和免疫浸润双重机制影响乳腺癌恶性表型 | 研究样本量有限，机制研究仍需进一步深入验证 | 阐明SIGLEC15在乳腺癌中的功能作用及相关分子机制 | 乳腺癌患者样本、小鼠模型和乳腺癌细胞系 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | mRNA测序、单细胞RNA测序、体内外实验验证 | 动物模型、细胞模型 | RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 基于人群的数据集和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2025-10-30 |
GPC2-CAR T cells have potent preclinical activity against orthotopic medulloblastoma xenografts
2025-Dec-18, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2025.201067
PMID:41159102
|
研究论文 | 本研究评估了GPC2-CAR T细胞在髓母细胞瘤异种移植模型中的临床前抗肿瘤活性 | 首次开发针对GPC2的CAR-T疗法，并在髓母细胞瘤模型中证明其通过静脉或脑室内给药均能显著诱导肿瘤消退 | 研究仅限于临床前动物模型，尚未在人体临床试验中验证 | 开发针对髓母细胞瘤的新型CAR-T免疫疗法 | 髓母细胞瘤细胞系D283和患者来源异种移植细胞系MAF1433 | 免疫治疗 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学染色，细胞因子检测 | CAR-T细胞疗法 | 基因表达数据，单细胞测序数据，免疫染色图像 | 两个髓母细胞瘤细胞系（D283和MAF1433）及患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 434 | 2025-10-30 |
Primed human pluripotent stem cell-derived blastocyst-like cell aggregates with partial lineage specification
2025-Dec, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2025.10.007
PMID:41142457
|
研究论文 | 本研究开发了一种从primed人多能干细胞直接生成人类囊胚样细胞聚集体的方法 | 使用热响应水凝胶直接从primed hPSCs生成囊胚样细胞聚集体，避免了传统方法对naïve hPSCs的依赖 | 相当比例的细胞仍保持未分化状态，未完全实现谱系特化 | 建立更易操作的人类早期发育研究模型 | primed人多能干细胞衍生的囊胚样细胞聚集体 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫细胞化学，体外植入实验 | NA | 图像，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-30 |
Multi-omics and experimental validation unveil BDNF as a diagnostic biomarker and therapeutic target in endoplasmic reticulum stress-driven lung adenocarcinoma: Therapeutic potential of Esketamine
2025-Dec, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2025.15336
PMID:41158314
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证发现BDNF可作为内质网应激驱动肺腺癌的诊断生物标志物和治疗靶点，并证实Esketamine的治疗潜力 | 首次将BDNF鉴定为内质网应激相关基因在肺腺癌中的关键作用因子，并验证Esketamine通过抑制BDNF表达对肺腺癌的治疗效果 | 研究主要基于体外细胞实验(A549和BEAS-2B细胞)，缺乏体内动物模型验证 | 探索BDNF在肺腺癌中的潜在功能并验证BDNF相关药物Esketamine的治疗应用潜力 | 肺腺癌(LUAD)细胞系A549和正常肺上皮细胞BEAS-2B | 生物信息学与肿瘤学研究 | 肺腺癌 | 多组学整合分析,单细胞转录组分析,批量RNA-seq,机器学习,孟德尔随机化分析,RT-qPCR,siRNA干扰,CCK-8检测,克隆形成实验,分子对接,Transwell实验,伤口愈合实验,TUNEL检测,Western blotting | 预测模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据,实验数据 | 67个内质网应激相关基因,两种细胞系(A549和BEAS-2B) | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 436 | 2025-10-30 |
Immune cell involvement in ulcer repair in radiation esophagitis and its role in the TGF-β1/p38MAPK/FN axis (Review)
2025-Dec, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2904
PMID:41158707
|
综述 | 探讨TGF-β1/p38MAPK/FN信号轴与免疫细胞在放射性食管炎溃疡修复中的作用机制 | 阐明TGF-β1/p38MAPK/FN信号轴在放射性食管炎中的双重作用及免疫细胞与信号轴的复杂互作关系 | 放射性食管炎病理过程复杂，限制了人们对信号轴如何精确调控不同修复阶段免疫细胞及其特性与互作的理解 | 探索放射性食管炎溃疡修复机制 | TGF-β1/p38MAPK/FN信号轴和免疫细胞（巨噬细胞、T细胞、树突状细胞） | 病理机制研究 | 放射性食管炎 | 多组学技术、单细胞测序技术 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 437 | 2025-10-30 |
pQTL Mendelian randomization analysis combined with single-cell sequencing to identify biomarkers and drug targets for bladder cancer
2025-Dec, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2901
PMID:41158706
|
研究论文 | 通过pQTL孟德尔随机化分析和单细胞测序技术识别膀胱癌的生物标志物和药物靶点 | 结合孟德尔随机化分析与单细胞测序技术识别膀胱癌新型生物标志物ATRAID和TRIM25 | NA | 发现膀胱癌的新型生物标志物和药物靶点 | 膀胱癌相关基因和细胞类型 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 孟德尔随机化分析,单细胞测序,qPCR | 诺莫图模型 | 基因表达数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 438 | 2025-10-30 |
Serum response factor is essential for endometrial function and prevention of inflammatory fibrosis
2025-Nov-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2510060122
PMID:41150713
|
研究论文 | 本研究揭示了血清应答因子(SRF)在子宫内膜功能和预防炎症性纤维化中的关键作用 | 首次系统阐明SRF在子宫内膜中的功能及其与子宫内膜异位症相关不孕的机制联系 | 动物模型与人类疾病存在差异，需要进一步验证临床转化价值 | 探究SRF在子宫内膜功能和生殖成功中的分子机制 | 人类子宫内膜异位症患者组织、小鼠模型、人类子宫内膜基质细胞 | 生殖医学 | 子宫内膜异位症 | 免疫组织化学、RNA干扰、条件性基因敲除、单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、组织病理学数据 | 人类子宫内膜异位症患者组织样本和体外培养细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 439 | 2025-10-30 |
The spatial and temporal activation of macrophages during fibrosis
2025-Nov, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-025-01186-x
PMID:40467841
|
综述 | 本文探讨巨噬细胞在纤维化过程中的时空激活机制及其治疗潜力 | 提出解释巨噬细胞跨时空调控组织纤维化的新模型，并整合单细胞转录组学揭示的巨噬细胞异质性新发现 | NA | 阐明巨噬细胞在纤维化过程中的时空调控机制 | 人类和小鼠组织中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 纤维化疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 440 | 2025-10-30 |
Utilizing CRISPR-Cas13d-knockdown in zebrafish to study a rare monogenic bone fragility syndrome
2025-Nov, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf153
PMID:41143154
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研究论文 | 利用CRISPR-Cas13d基因敲降技术研究斑马鱼中罕见单基因骨脆性综合征的分子机制 | 首次应用新型CRISPR-Cas13d基因敲降技术建立斑马鱼疾病模型研究CDL综合征 | 研究仅关注胚胎和早期幼体阶段，未涉及成年期表型分析 | 探究SMS2基因功能及CDL骨脆性综合征的分子机制 | 斑马鱼胚胎和幼体 | 基因功能研究 | 骨质疏松症 | CRISPR-Cas13d基因敲降，单细胞RNA测序，原位杂交 | 斑马鱼疾病模型 | 基因表达数据，表型图像 | 野生型和基因敲降斑马鱼胚胎及幼体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |