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当前共找到 39915 篇文献,本页显示第 421 - 440 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
421 2026-05-29
Perspectives from machine learning and multi-omics to decoding the effects of VDAC2 malignant subsets on tumor evolution
2026-Mar-31, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 利用机器学习和多组学分析解码VDAC2恶性亚型对肿瘤演化的影响 通过整合批量RNA测序、单细胞RNA测序和空间转录组学数据,首次系统揭示了VDAC2在泛癌中的恶性功能及其通过VDAC2-BAK1-IFNγ通路促进肿瘤进展和免疫逃逸的机制 基于公开数据库的分析,缺乏大规模独立临床样本验证,且实验主要在体外细胞模型中进行 系统挖掘VDAC2在泛癌中的作用及其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 VDAC2基因在泛癌中的表达、功能及免疫调控机制 机器学习 泛癌 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学、RT-PCR、细胞共培养、CCK-8实验、Transwell侵袭实验、ELISA NA RNA测序数据、空间转录组数据 泛癌数据集,具体样本数量未明确说明 NA 批量RNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
422 2026-05-29
Taming autoimmunity: Alpha-1 antitrypsin overexpressing mesenchymal stromal cells promote regulatory T cell crosstalk to reverse diabetes
2026-Mar-31, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序等技术,研究了过表达alpha-1抗胰蛋白酶的间充质基质细胞如何调节T细胞以逆转糖尿病 首次揭示AAT-MSCs通过增强调节性T细胞与其他细胞的通讯来逆转新发糖尿病,并阐明其在CD4和CD8 T细胞上的免疫调节机制 仅在雌性非肥胖糖尿病小鼠模型中进行研究,尚未在人类临床试验中验证其效果 探索AAT-MSCs如何通过调节T细胞免疫反应来逆转1型糖尿病 过表达alpha-1抗胰蛋白酶的人和小鼠间充质基质细胞,以及CD4和CD8 T细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 基因表达数据 50%以上的雌性非肥胖糖尿病小鼠(具体数量未说明) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
423 2026-05-29
A spatiotemporal transcriptomic atlas of porcine (Sus scrofa) female early gonadal development
2026-Mar-30, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 利用高分辨率空间转录组技术解析猪雌性早期性腺发育过程中细胞类型及其空间动态 首次应用高分辨率空间转录组技术绘制猪早期性腺发育的时空图谱,阐明了支持细胞谱系中两波颗粒细胞的空间定位及其在生殖细胞发育中的调控作用,并发现BMP信号通路在原始生殖细胞向卵原细胞特化中的关键角色 空间转录组技术无法直接解析单细胞水平的基因表达,可能遗漏部分细胞类型的细微差异 揭示猪雌性早期性腺发育过程中原始生殖细胞向卵原细胞特化和进入减数分裂的时空动态机制 猪(Sus scrofa)雌性早期性腺组织中的原始生殖细胞、体细胞及各种细胞类型 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 空间转录组数据 猪早期性腺样本(具体数量未在标题和摘要中明确) NA 空间转录组学 NA 高分辨率空间转录组技术(具体平台未在摘要中说明)
424 2026-05-29
Same-Slide Spatial Multi-Omics Integration with IN-DEPTH Reveals Tumor Virus-Linked Spatial Reorganization of the Tumor Microenvironment
2026-Mar-24, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 提出IN-DEPTH工作流,实现同一玻片上的空间转录组和蛋白质组整合分析,结合SGCC框架揭示肿瘤微环境中的空间重排 开发了IN-DEPTH工作流,可在同一玻片上整合单细胞空间蛋白质组和转录组且无RNA信号丢失;提出SGCC框架用于跨模态整合,解析细胞间功能状态变化 新兴同玻片多组学方法在多重性、空间分辨率、信号保留和整合分析方面仍存在局限 实现空间多组学整合以揭示肿瘤微环境中的临床相关机制,并推动稳健的空间多模态AI模型发展 弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)组织样本 数字病理学 弥漫大B细胞淋巴瘤 空间转录组学、空间蛋白质组学、IN-DEPTH、SGCC NA 图像、空间转录组数据 EBV阳性和EBV阴性肿瘤样本 NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 NA NA
425 2026-05-29
Metabolic RNA Labeling-Enabled Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2026-03-17, Accounts of chemical research IF:16.4Q1
综述 本文综述了代谢RNA标记结合时间分辨单细胞RNA测序技术的最新进展,包括Well-TEMP-seq、scDUAL-seq、Dyna-vivo-seq等方法,并探讨了该技术在揭示细胞异质性和动态基因表达调控中的应用潜力 系统总结了基于代谢RNA标记的时间分辨单细胞RNA测序技术的创新,如双核苷酸标记的scDUAL-seq能同时监测RNA合成与降解,以及从体外细胞培养扩展到体内动物模型(Dyna-vivo-seq)的能力,并整合空间转录组学以解析时空动态 当前化学工具在单细胞RNA动态分析中存在局限性,如核苷酸标记效率、成本、体内外应用差异,以及时空整合的复杂度 探讨代谢RNA标记增强时间分辨单细胞RNA测序技术,以理解异质性和动态基因表达调控 单细胞RNA代谢标记、时间分辨测序技术及其在生物过程(如胚胎发育、疾病进展)中的应用 机器学习 NA 代谢RNA标记、单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
426 2026-05-29
FineST: contrastive learning integrates histology and spatial transcriptomics for nuclei-resolved ligand-receptor analysis
2026-Mar-16, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 FineST通过对比学习整合组织学和空间转录组学数据,实现核分辨率下的配体-受体分析 利用组织学基础模型的深度对比学习,实现核精度的RNA表达插补和细胞间通信分析,在VisiumHD和Xenium数据集上显著优于现有方法 主要聚焦于Visium平台,可能在其他平台上的泛化能力有限;数据稀疏性和分辨率限制在复杂组织中仍存在挑战 开发高分辨率空间转录组学分析方法以揭示细胞间通信模式 结直肠癌VisiumHD和乳腺癌Xenium数据集,以及多种癌症类型的肿瘤-免疫相互作用 计算机视觉, 机器学习, 数字病理学 结直肠癌, 乳腺癌, 鼻咽癌, 肝细胞癌 空间转录组学, 对比学习 对比学习模型 组织学图像, 空间转录组学数据 结直肠癌VisiumHD和乳腺癌Xenium数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, 10x VisiumHD, 10x Xenium 10x Visium平台用于空间基因表达分析,VisiumHD用于高分辨率数据,Xenium用于乳腺癌原位验证
427 2026-05-29
The single cell transcriptomic landscape of recurrent giant cell tumor of bone following neoadjuvant denosumab therapy
2026-Mar-04, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
研究论文 通过单细胞RNA测序分析新辅助地诺单抗治疗后复发骨巨细胞瘤的转录组特征 首次通过单细胞RNA测序揭示新辅助DMAb治疗后GCTB复发的潜在机制,包括肿瘤细胞转化及免疫抑制微环境形成 未提及 探索新辅助地诺单抗治疗增加骨巨细胞瘤局部复发风险的潜在机制 未经治疗的原发性GCTB、新辅助DMAb治疗的原发性GCTB以及刮除后停用DMAb的复发性GCTB 单细胞转录组学 骨巨细胞瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 33,440个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
428 2026-05-29
BET inhibition blunts antibody production and macrophage-mediated fibrosis to restore lung function in murine cGVHD
2026-03-02, Blood IF:21.0Q1
研究论文 在慢性移植物抗宿主病模型中,BET抑制通过降低抗体产生和巨噬细胞介导的纤维化来恢复肺功能 首次揭示BET蛋白在慢性移植物抗宿主病肺部纤维化中调控抗体产生和巨噬细胞极化的新机制 主要基于小鼠模型,缺乏临床样本验证 研究BET抑制对慢性移植物抗宿主病相关闭塞性细支气管炎综合征的治疗效果和机制 慢性移植物抗宿主病小鼠模型中的免疫细胞(T细胞、B细胞、巨噬细胞)和肺组织 医学研究 移植物抗宿主病,闭塞性细支气管炎综合征 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 慢性移植物抗宿主病小鼠与对照小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
429 2026-05-29
Neuro-epithelial circuits promote sensory convergence and intestinal immunity
2026-03, Nature IF:50.5Q1
研究论文 发现TRPV1疼痛感知伤害感受器与化学感应上皮簇细胞协同,驱动2型炎症和肠道免疫的神经-上皮回路 首次揭示TRPV1伤害感受器通过CGRP信号调控上皮簇细胞增殖分化,形成神经-上皮回路整合感觉输入驱动2型免疫 未明确其他感觉神经元类型在该回路中的作用,且机制验证主要在小鼠模型中完成 阐明神经、上皮和免疫细胞如何协调感知输入以启动2型炎症反应 小鼠肠道中的TRPV1伤害感受器、上皮簇细胞及CGRP神经纤维 机器学习 寄生虫感染相关2型免疫疾病 空间转录组学、单细胞RNA测序、化学遗传学沉默/激活 NA 基因表达数据 小鼠肠道组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'端测序, 10x Visium空间基因表达分析
430 2026-05-29
Single-cell profiling of HDAC inhibitor-induced EBV lytic heterogeneity defines abortive and refractory states in B lymphoblasts
2026-03, PLoS pathogens IF:5.5Q1
research paper 通过单细胞RNA测序揭示了HDAC抑制剂诱导的EBV溶解裂解异质性,定义了B淋巴母细胞中的流产和难治状态 首次在单细胞水平上解析HDAC抑制剂诱导EBV裂解反应的异质性,发现NF-κB及CD137信号轴在阻止成功裂解再激活中的作用 研究仅限于四种EBV阳性细胞系,且裂解再激活仅在少数细胞中成功,可能未全面反映体内微环境的影响 探讨HDAC抑制剂对EBV阳性恶性肿瘤的裂解再激活机制及宿主因素的作用 EBV阳性细胞系,包括P3HR1-ZHT Burkitt淋巴瘤、Jijoye Burkitt淋巴瘤、IBL-1免疫母细胞淋巴瘤和新生感染衍生的淋巴母细胞系 machine learning Burkitt淋巴瘤、Hodgkin淋巴瘤、鼻咽癌、胃癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 4种EBV阳性细胞系 NA 单细胞RNA-seq NA NA
431 2026-05-29
Integrated Single-Cell Profiling Reveals Dichotomous NK Cell Populations Associated with Immunosuppression in Solid Tumors
2026-Feb-27, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示肿瘤浸润NK细胞中与免疫抑制相关的二分型群体 首次系统描绘肿瘤中NK细胞的二分型表型和功能景观,发现由IFNG和TGFB1对立信号驱动的内在调控轴,并揭示组织驻留适应性NK细胞与免疫检查点阻断疗效的关联 未提及具体局限性 探究肿瘤浸润NK细胞的异质性及其对免疫反应和临床结局的影响 多种实体瘤中的肿瘤浸润NK细胞 单细胞组学 实体瘤(如肺癌、前列腺癌等) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 多个肿瘤类型的样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒
432 2026-05-29
BARTsc identifies key transcriptional regulators from single-cell omics data
2026-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
433 2026-05-29
A Pan-Cancer Single-Cell Atlas to Evaluate Tumor Identity, Cell Line Concordance, and Dependency Mapping
2026-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 通过单细胞RNA测序构建泛癌图谱,评估肿瘤身份、细胞系一致性和依赖性图谱 开发了一种基于马氏距离的严格整合框架,优先考虑代表性恶性转录状态,构建高质量泛癌单细胞图谱,并利用该图谱推断肿瘤-细胞系一致性和癌症特异性基因依赖性 未在摘要中提及具体限制,如可变数据质量、注释不一致等问题仍可能存在 建立可扩展的泛癌单细胞图谱,用于肿瘤身份推断、癌症细胞系基准测试和系统识别遗传脆弱性 来自499个样本的135,424个高质量恶性细胞,涵盖36种成人和儿童癌症 数字病理学 泛癌(包括成人和儿童癌症) 单细胞RNA测序 ElasticNet 单细胞转录组数据 499个样本,135,424个细胞 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 基于马氏距离的批次校正潜在空间选择
434 2026-05-29
Pixel2Gene enables histology-guided reconstruction and prediction of spatial gene expression
2026-Feb-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 Pixel2Gene是一个深度学习框架,通过整合组织学图像和空间转录组数据,实现基于组织学引导的空间基因表达重建和预测 首次利用共配准的组织学图像与空间转录组数据,通过深度学习实现高分辨率空间基因表达的重建和预测,无需直接转录组分析即可扩展至新样本 当前高分辨率空间转录组平台仍存在高成本、有限组织覆盖和技术伪影,导致数据噪声高、稀疏且不完整,可能影响分析准确性和生物学解释 开发一种成本效益高、可扩展的空间基因表达分析方法,通过常规组织学图像实现全组织尺度转录组分析 多种组织类型和疾病背景下的临床样本 计算机视觉, 机器学习 NA 空间转录组学 深度学习框架 图像, 基因表达数据 多个高分辨率空间转录组平台(Visium HD、Xenium、CosMx)上的临床样本 NA 空间转录组学 Visium HD, Xenium, CosMx NA
435 2026-05-29
Cardiac Macrophages Across Space and Time: Roles in Homeostasis, Disease, and Remodeling
2026-Feb-19, The Canadian journal of cardiology
综述 综述心脏巨噬细胞在不同空间和时间生态位中的稳态维持、疾病响应及损伤后重塑功能,重点强调其异质性和空间互作机制 首次系统整合单细胞与空间转录组学数据,提出区域特异性和环境依赖性巨噬细胞靶向治疗策略,并揭示衰老对巨噬细胞空间组织的重塑作用 未纳入巨噬细胞与其他免疫细胞类型(如中性粒细胞、T细胞)的空间互作分析,且缺乏直接验证区域特异性靶向效果的动物模型或临床数据 阐明心脏巨噬细胞在稳态、疾病和修复中的时空动态调控机制,为精准免疫治疗提供理论框架 心脏驻留巨噬细胞(胚胎来源)与骨髓招募CCR2+巨噬细胞,以及心肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞和周细胞 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium Single Cell 3' 用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析
436 2026-05-29
Cell-dependent contributions of thrombospondin-1 to the rupture of abdominal aortic aneurysm in mice
2026-02-14, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 该研究探讨了血栓反应蛋白1(TSP1)在不同细胞类型中对小鼠腹主动脉瘤破裂的差异性贡献 首次通过细胞类型特异性敲除小鼠模型揭示髓系来源TSP1在抑制动脉瘤破裂中的关键保护作用,并阐明其通过促进基质修复表型增强血管壁完整性的机制 研究仅限于小鼠模型,其结论在人类中的适用性尚需验证;未探索其他可能TSP1来源细胞(如成纤维细胞)的作用 探究不同细胞类型(巨噬细胞、内皮细胞、平滑肌细胞)中TSP1缺失对腹主动脉瘤破裂的影响 腹主动脉瘤小鼠模型(Apoe敲除、AAV-PCSK9诱导高胆固醇血症) 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,条件性基因敲除,组织学分析 细胞类型特异性条件性敲除小鼠模型 基因表达数据,组织学图像 涉及全局敲除、髓系特异性敲除、内皮特异性敲除和平滑肌细胞特异性敲除小鼠多组对比实验 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序平台
437 2026-05-29
Advances in single-cell transcriptomics: unraveling the pathogenesis of calcific aortic valve disease
2026-02-14, Cardiovascular research IF:10.2Q1
综述 综述了单细胞RNA测序在钙化性主动脉瓣疾病研究中的应用,揭示了细胞异质性、谱系分化和细胞间相互作用 全面总结了单细胞转录组学在CAVD研究中的最新进展,包括瓣膜细胞群体、疾病相关表型转变和分子通路,并探讨了单细胞技术的转化潜力 当前单细胞技术面临的技术挑战和未来发展方向 评估单细胞RNA测序在CAVD研究中的应用现状,为发现新治疗靶点提供依据 钙化性主动脉瓣疾病中的心脏瓣膜细胞 单细胞转录组学 钙化性主动脉瓣疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
438 2026-05-29
ARX mutation-associated interneuron defects provide insights into mechanisms underlying developmental epilepsies
2026-Feb-03, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究揭示ARX突变通过影响皮质中间神经元发育和迁移导致发育性癫痫的机制 首次结合单细胞RNA测序和ChIP-seq揭示ARX调控细胞周期进程、中间神经元亚型分化及迁移的分子机制,并发现LMO1通过抑制Cxcr4表达调控中间神经元迁移的新通路 主要在动物模型中验证,仅有一例患者脑组织数据;未完全阐明ARX下游所有靶基因的功能 阐明ARX突变导致皮质中间神经元功能障碍进而引发发育性癫痫的病理机制 小鼠模型和一名携带ARX致病突变并诊断为发育性癫痫脑病的患者脑组织 数字病理学 发育性癫痫、神经发育障碍 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、皮层切片培养 条件性基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、染色质结合数据、组织病理数据 小鼠模型和1例患者脑组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
439 2026-05-29
Single-cell atlas of the transcriptome and chromatin accessibility in the human retina
2026-Feb, Nature genetics IF:31.7Q1
研究论文 构建了人类视网膜的单细胞转录组和染色质可及性整合图谱 整合了来自125名捐赠者的约390万个细胞,包含已发表和未发表数据,鉴定出130多种细胞类型,并分析了跨细胞类型的转录组、染色质和基因调控网络差异 未明确提及局限性 创建全面的人类视网膜细胞图谱,促进对视网膜功能和病理的理解 人类视网膜细胞 单细胞组学 视网膜疾病 单细胞测序 NA 单细胞转录组和染色质可及性数据 约390万个细胞,来自125名捐赠者 NA 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq NA NA
440 2026-05-29
In Vivo CRISPR Interference Screen Reveals Long Noncoding RNA Portfolio Crucial for Cutaneous Squamous Cell Carcinoma Tumor Growth
2026-Jan, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 通过体内CRISPR干扰筛选,揭示了长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌肿瘤生长中的关键作用 首次利用体内CRISPR干扰筛选结合单细胞测序数据,系统鉴定出影响皮肤鳞状细胞癌生长的长链非编码RNA谱系 NA 探索长链非编码RNA在皮肤鳞状细胞癌生长中的作用 皮肤鳞状细胞癌细胞系和异种移植模型 机器学习和数字病理学 皮肤鳞状细胞癌 CRISPR干扰筛选、单细胞测序 NA 单细胞测序数据 正常和皮肤鳞状细胞癌人类皮肤组织样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
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