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当前共找到 33948 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-12-09 |
Loss of Intestinal Endosome-associated Protein Sorting Nexin 27 Disrupts Epithelial Barrier and Promotes Inflammation
2025-Nov-17, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101682
PMID:41260570
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研究论文 | 本研究探讨了SNX27蛋白在肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的未知作用 | 首次揭示了SNX27在肠道中的关键功能，包括维持上皮屏障和防止炎症，并开发了肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠模型 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据来自现有数据库，缺乏直接的人类样本验证 | 确定SNX27在调节肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的作用 | 人类炎症性肠病（IBD）患者数据和肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠 | 分子生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 422 | 2025-12-09 |
Enhancing RNA Capture Efficiency in Spatial Transcriptomics: A Review of Innovative Technologies and Strategies
2025-Nov-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262211076
PMID:41303559
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综述 | 本文系统回顾了近年来提升空间转录组学RNA捕获效率的创新技术与策略 | 通过比较分析Decoder-seq、Stereo-seq V2、MAGIC-seq和MSN-seq等前沿技术，总结了在解决RNA扩散、探针密度和组织处理等挑战方面的进展，并特别强调了针对FFPE临床样本的优化方法以及整合人工智能的计算预测方法 | NA | 为研究人员提供如何提升空间转录组捕获效率的全面理解，并推动该技术在基础研究和临床应用中的效用 | 空间转录组学技术及其RNA捕获效率提升策略 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 423 | 2025-12-09 |
Adaptive resampling for improved machine learning in imbalanced single-cell datasets
2025-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.04.686583
PMID:41279118
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研究论文 | 本文提出了一种自适应的重采样方法，用于改善不平衡单细胞数据集中的机器学习性能 | 提出了一种通用的自适应重采样方法，能够基于学习到的潜在结构在线、自适应地重采样数据，以增强单细胞表示学习 | 未明确提及具体限制，可能包括方法在特定数据集或任务中的泛化能力需要进一步验证 | 旨在提高单细胞转录组学数据中机器学习模型的表示学习和预测性能 | 单细胞转录组学数据，特别是基因表达重建、细胞类型分类和扰动响应预测任务 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 424 | 2025-12-09 |
Pan-cancer multi-omics profiling of MS4A2 unveils its functional landscape in lung adenocarcinoma
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002903
PMID:40607924
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了MS4A2在肺腺癌中的功能景观及其预后价值 | 首次在四种生存指标（OS、DSS、PFI、DFI）上系统评估MS4A2在肺腺癌中的预后分层，并发现其通过双向趋化因子调控塑造免疫抑制微环境 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证和前瞻性临床队列 | 阐明MS4A2在肺腺癌中的表达模式、预后意义及功能机制 | 肺腺癌患者及多种癌症类型的肿瘤样本 | 生物信息学 | 肺腺癌 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 甲基化分析, 药物敏感性分析 | Cox回归模型, Kaplan-Meier模型 | 基因表达数据, 生存数据, 甲基化数据, 药物反应数据 | TCGA/GTEx数据库中的33种癌症类型及NSCLC单细胞队列 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 425 | 2025-12-09 |
Multi-omic profiling reveals age-specific blood biomarkers and aging-driven B cell remodeling in osteoarthritis
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003076
PMID:40696927
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研究论文 | 本研究通过多组学分析，揭示了骨关节炎中年龄特异性的血液生物标志物以及衰老驱动的B细胞重塑 | 首次整合了四种OA受累关节组织的转录组分析，并利用机器学习识别出五个外周血生物标志物，同时通过单细胞RNA测序揭示了老年OA患者中B细胞分化轨迹和功能状态的年龄特异性改变 | 研究样本量相对有限，且主要关注膝关节OA，其他关节类型的OA可能具有不同的特征 | 开发骨关节炎的非侵入性诊断工具并阐明其与年龄相关的免疫失调机制 | 骨关节炎患者（包括年轻和老年患者）的关节组织（软骨、滑膜等）和外周血样本 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 转录组分析，单细胞RNA测序，流式细胞术 | 机器学习 | 基因表达数据，单细胞数据 | 217,983个关节细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 426 | 2025-12-09 |
Unraveling molecular characteristics and functional exploration of panoptosis for prognosis stratification in lung adenocarcinoma: a tumor marker prognostic study
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002968
PMID:40844260
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，开发了一个基于PANoptosis的预后评分模型（PAN Score），用于预测肺腺癌患者的预后和治疗反应，并探索了YWHAG基因在其中的关键作用 | 首次将PANoptosis这一新型细胞死亡模式与肺腺癌预后关联，结合10种机器学习方法构建了101种算法组合的预后模型，并发现了YWHAG-血管加压素-PANoptosis轴作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于回顾性队列数据，需要前瞻性临床验证；体外和体内实验仅验证了YWHAG基因的部分机制 | 探索PANoptosis在肺腺癌中的分子特征和预后价值，开发预后分层模型 | 肺腺癌患者活检样本（超过1500例）及其他癌症样本 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、机器学习算法 | 多种机器学习算法组合（10种方法形成101种组合） | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 超过1500例肺腺癌活检样本及其他癌症样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 427 | 2025-12-09 |
ResNet50 and Single-Cell Multi-Omics analysis identify key cellular and molecular features in pediatric acute lymphoblastic leukemia
2025-Nov, Annals of hematology
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s00277-025-06675-6
PMID:41125957
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研究论文 | 本研究通过整合基于深度学习的图像分析与单细胞转录组学和T细胞受体测序，揭示了儿童急性淋巴细胞白血病的细胞和分子特征 | 首次将ResNet50深度学习模型用于白血病单细胞图像分类，并与单细胞多组学数据整合，以阐明疾病机制并发现潜在的复发生物标志物 | 未明确说明样本的具体数量或来源，可能限制了结果的普遍适用性 | 解决儿童急性淋巴细胞白血病早期诊断、复发预测和个体化治疗的挑战 | 儿童急性淋巴细胞白血病（ALL） | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞转录组测序, T细胞受体测序 | ResNet50, Grad-CAM | 图像, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 428 | 2025-12-09 |
Rationale, design and baseline characteristics of REMODEL, a mechanism-of-action trial with semaglutide in people with type 2 diabetes and chronic kidney disease
2025-Oct-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfaf114
PMID:40608494
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研究论文 | 本文介绍了REMODEL试验的设计和基线特征，旨在通过多模态方法探究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾病中的肾脏特异性效应和作用机制 | 该试验首次结合MRI成像、肾脏活检以及单核和空间转录组学等多维技术，系统研究GLP-1受体激动剂在糖尿病肾病中的机制 | 样本量相对较小（106名参与者），且研究周期为52周，可能无法完全捕捉长期效应 | 探究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾病患者中的肾脏保护作用机制 | 患有2型糖尿病和慢性肾病的成年人 | NA | 2型糖尿病和慢性肾病 | 磁共振成像（MRI）、单核转录组学、空间转录组学、病理学和组织学评估 | NA | 影像数据、组织样本数据、临床生化数据 | 106名参与者（其中33名为肾脏活检亚组） | NA | 单核转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 429 | 2025-12-09 |
A Dynamic DNA Nano-Antioxidant Targeting Galectin-3 Attenuates Liver Fibrosis via Reducing Macrophage Oxidative Stress
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202509977
PMID:41168966
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研究论文 | 开发了一种靶向Galectin-3的动态DNA纳米抗氧化剂，通过减少巨噬细胞氧化应激来减轻肝纤维化 | 利用单细胞RNA测序识别Galectin-3与巨噬细胞氧化应激的正相关性，并设计动态DNA纳米结构实现肝巨噬细胞特异性siRNA递送 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证，且长期安全性和脱靶效应需进一步评估 | 开发靶向治疗肝纤维化的纳米递送平台，以减轻巨噬细胞介导的氧化应激 | 肝巨噬细胞和Galectin-3蛋白，在CCl4诱导的小鼠肝纤维化模型中测试 | 生物医学工程 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序，IVIS成像，转录组分析 | NA | 基因表达数据，荧光成像数据 | CCl4诱导的小鼠模型，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 430 | 2025-12-09 |
Scaling Large Language Models for Next-Generation Single-Cell Analysis
2025-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.14.648850
PMID:41279114
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研究论文 | 本文基于Cell2Sentence框架，通过训练大型语言模型（LLMs）整合单细胞RNA测序数据和文本信息，以提升单细胞分析的预测和生成能力 | 将单细胞RNA测序数据表示为文本“细胞句子”，并训练参数达270亿的大型语言模型，实现转录组和文本数据在空前规模上的统一，支持多细胞上下文信息合成的高级下游任务 | 模型在训练期间未见过的人类细胞模型中进行了实验验证，但可能存在其他未知细胞类型或条件的泛化限制 | 开发可扩展、灵活且能整合文本信息的下一代单细胞分析平台 | 单细胞RNA测序数据、生物文本和元数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大型语言模型（LLMs） | 文本 | 包含超过十亿个转录组数据、生物文本和元数据标记的语料库 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 431 | 2025-12-09 |
A Single-Cell Atlas of Transcriptional and Immunoglobulin Repertoire Evolution in Early B Cell Development
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681095
PMID:41278878
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，深入分析了早期B细胞发育过程中的转录组和免疫球蛋白库演化，揭示了重组事件后的增殖爆发和库特征变化 | 首次在单细胞水平上对早期B细胞发育进行深度转录组和免疫球蛋白库分析，发现了前B细胞阶段BCR重组后未描述的增殖爆发现象 | 研究仅基于六名健康供体，样本量相对有限，且未涵盖疾病状态或更广泛的个体差异 | 探究早期B细胞发育中转录组和免疫球蛋白库的演化规律，理解成熟免疫库多样性的形成基础 | 人类骨髓中的B细胞，包括从祖细胞到成熟B细胞的不同发育亚群 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 65,110个B细胞，来自六名健康供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 432 | 2025-12-09 |
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Oct-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7564369/v1
PMID:41282090
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VISTA的新方法，用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平 | VISTA结合了变分推断和几何深度学习，联合建模scRNA-seq和SST数据，并引入不确定性量化，以解决SST技术基因检测数量有限的问题 | NA | 旨在通过预测未观测基因的表达，增强空间转录组学数据的分析能力 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 几何深度学习 | 基因表达数据 | 四个SST数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 433 | 2025-12-09 |
Spatiotemporal dynamics of neuron differentiation and migration in the developing human spinal cord
2025-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.08.004
PMID:40825501
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和原位测序技术，揭示了人类和小鼠脊髓发育过程中神经元分化和迁移的时空动态与调控机制 | 首次在人类脊髓发育的早期阶段（Carnegie Stages 16-21）系统描绘了神经元分化和迁移的时空动态，并识别了跨物种保守的关键转录因子 | 研究主要聚焦于胚胎发育的特定阶段（CS16-21/E8.0-11.5），未涵盖更晚期的发育或成熟过程 | 探究人类脊髓发育过程中神经元亚型特化和迁移的分子机制 | 人类和小鼠胚胎脊髓组织 | 单细胞组学 | 神经系统发育 | 单细胞转录组测序, 原位测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组数据 | 人类脊髓样本（CS16-21阶段）和小鼠脊髓样本（E8.0-11.5阶段） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 434 | 2025-12-09 |
Ptbp1 is not required for retinal neurogenesis and cell fate specification
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.02.662808
PMID:40631124
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除Ptbp1基因，评估其在视网膜发育过程中的作用，发现Ptbp1对神经发生和细胞命运决定并非必需 | 使用遗传学方法直接验证Ptbp1在视网膜发育中的功能，挑战了先前基于RNA干扰研究提出的Ptbp1作为神经发生主要抑制因子的观点 | 研究仅聚焦于视网膜发育，未评估Ptbp1在其他神经系统区域的作用；scRNA-Seq显示转录变化较温和，可能未完全捕捉所有分子效应 | 评估Ptbp1在发育性神经发生中的作用，特别是其在视网膜细胞命运决定中的功能 | 小鼠视网膜祖细胞和Müller胶质细胞 | 发育生物学 | NA | 条件性基因敲除、免疫染色、bulk RNA-Seq、scRNA-Seq | NA | RNA测序数据、免疫染色图像 | 突变型动物（具体数量未明确说明） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 435 | 2025-12-09 |
Metabolic reprogramming of arachidonic acid in clear cell renal carcinoma promotes an immunosuppressive microenvironment by activating MDK signaling pathway
2025-Aug-13, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01807-8
PMID:40802073
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，探讨了透明细胞肾细胞癌中代谢重编程与免疫耗竭的关系，并揭示了花生四烯酸代谢异常通过激活MDK信号通路促进免疫抑制微环境的机制 | 首次结合单细胞和批量RNA测序技术，构建了ccRCC的代谢亚型，并发现花生四烯酸代谢异常通过MDK信号通路驱动免疫抑制，为免疫治疗提供了新的生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于测序数据和体外实验，缺乏大规模临床队列验证，且免疫治疗模型的体内效果需进一步确认 | 探究透明细胞肾细胞癌中代谢重编程与免疫耗竭的关联机制 | 透明细胞肾细胞癌患者样本及肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组化, Western blotting, ELISA, 细胞共培养 | Scissor算法, 细胞间通讯分析 | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 未明确样本数量，但涉及ccRCC患者分组及细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2025-12-09 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术解码HepaRG细胞在多种化学物质暴露下的应激状态，揭示细胞适应性应激反应和潜在死亡过渡的动态变化 | 应用TempO-LINC平台生成大规模单细胞转录组数据，结合文献来源的应激反应通路基因签名对单个细胞进行评分和聚类，系统可视化化学物质诱导的细胞亚群动态变化 | 研究仅针对HepaRG细胞系在24小时暴露下的反应，未涉及其他细胞类型或更长时间点的动态变化 | 利用单细胞转录组学解码细胞应激状态，为毒理学研究提供新的见解 | HepaRG细胞 | 单细胞转录组学 | 毒理学 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约40,000个HepaRG细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC | TempO-LINC平台用于生成单细胞转录组图谱 |
| 437 | 2025-12-09 |
Single-cell transcriptomics unravels the early immune landscape of renal allograft rejection and nominates Ccl3-Ccr5 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1663251
PMID:41200203
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了肾移植早期急性排斥反应的免疫景观，并识别出Ccl3-Ccr5轴作为治疗靶点 | 首次在单细胞分辨率下描绘了肾移植早期急性排斥反应的免疫细胞动态和细胞间通讯网络，并验证了Ccl3-Ccr5轴作为治疗靶点的潜力 | 研究基于大鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；样本时间点有限，可能未覆盖所有动态变化 | 阐明肾移植早期急性排斥反应的免疫细胞动态和局部细胞间通讯机制，并探索潜在治疗靶点 | 大鼠肾移植模型中的CD45+免疫细胞 | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重免疫荧光，治疗干预实验 | 无监督聚类，细胞轨迹推断，细胞间通讯网络分析 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 大鼠肾移植模型在移植后第0、1、3、7天采集的CD45+免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 438 | 2025-12-09 |
Identification of novel lipid metabolism-related biomarkers of aortic dissection by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1681989
PMID:41246346
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法，识别了主动脉夹层中与脂质代谢相关的新型生物标志物PLIN2和PLIN3 | 采用多模态策略结合单细胞RNA测序和机器学习，首次将PLIN2和PLIN3确定为主动脉夹层中脂质代谢的关键调节因子，并探索其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于计算分析和动物模型验证，缺乏大规模临床样本的直接验证，且分子机制需进一步实验探究 | 识别主动脉夹层中与脂质代谢失调相关的新型生物标志物，以阐明其病理机制并探索潜在治疗靶点 | 主动脉夹层患者样本和Ang II诱导的主动脉夹层小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 细胞间通讯分析, 伪时间轨迹重建, 分子对接 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 主动脉夹层和对照样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 439 | 2025-12-09 |
Correction: Single-cell transcriptomics unravels the early immune landscape of renal allograft rejection and nominates Ccl3-Ccr5 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1740964
PMID:41357176
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correction | 本文是对先前发表文章的更正，涉及肾脏移植排斥早期免疫景观的单细胞转录组学研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 440 | 2025-12-09 |
Correction: Identification of novel lipid metabolism-related biomarkers of aortic dissection by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1742065
PMID:41357238
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correction | 本文是对先前一篇关于整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法识别主动脉夹层新型脂质代谢相关生物标志物文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |