单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
421	2025-07-19	Dual-specificity phosphatases 13 and 27 as key switches in muscle stem cell transition from proliferation to differentiation 2024-09-10, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxae045 PMID:38975693	研究论文	该研究揭示了双特异性磷酸酶DUSP13和DUSP27在肌肉干细胞从增殖向分化转变过程中的关键作用	首次发现MyoD直接靶向DUSP13和DUSP27，并阐明其在肌肉干细胞命运转变中的调控机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类细胞中验证	探究肌肉干细胞从增殖向分化转变的分子机制	肌肉干细胞（MuSCs）	分子生物学	肌肉疾病	单细胞RNA测序、基因敲除	MyoD敲入小鼠模型	基因表达数据	MyoD敲入小鼠的肌肉干细胞
422	2025-07-19	Integrative analysis of long isoform sequencing and functional data identifies distinct cortical layer neuronal subtypes derived from human iPSCs 2024-09-01, Journal of neurophysiology IF:2.1Q3 DOI:10.1152/jn.00045.2024 PMID:38988287	研究论文	通过整合长读长测序和功能数据，鉴定了源自人类iPSCs的不同皮质层神经元亚型	比较了两种培养基（StemFlex Medium和Essential 8 Medium）在iPSCs向神经元分化中的效率，发现E8M培养基能在更短时间内高效生成功能性神经元	研究仅比较了两种培养基，可能未涵盖所有潜在的高效分化条件	提高iPSCs向神经元分化的效率，以促进再生医学和药物发现	人类诱导多能干细胞（iPSCs）及其分化的神经元	再生医学	NA	长读长单细胞RNA测序、免疫细胞化学、全细胞膜片钳记录	NA	RNA测序数据、功能数据	未明确提及具体样本数量，但涉及iPSCs在两种培养基中的分化比较
423	2025-07-19	Re-analysis of single-cell RNA-seq data reveals the origin and roles of cycling myeloid cells 2024-07-08, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxae030 PMID:38655770	研究论文	本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，揭示了循环髓系细胞的起源、分化及其在生理过程中的作用	首次初步揭示了循环髓系细胞（CMCs）的起源、分化及其在生理过程中的作用，特别是确认了循环髓系细胞亚群a（aCMCs）属于特定细胞类型	NA	理解循环髓系细胞（CMCs）的起源、分化及其在各种生理和病理过程中的作用	循环髓系细胞（CMCs）及其亚群a（aCMCs）	单细胞RNA测序	创伤性损伤、癌症、病原体感染	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	NA
424	2025-07-19	Candida albicans-myeloid cells-T lymphocytes axis in the tumor microenvironment of oral tumor-bearing mice 2024-04-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216814 PMID:38499264	研究论文	该研究探讨了白色念珠菌感染对口腔肿瘤微环境中髓系细胞和T淋巴细胞轴的影响	揭示了白色念珠菌感染通过改变肿瘤微环境中的免疫细胞组成促进口腔肿瘤发展的机制	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体中验证	探索白色念珠菌感染如何通过免疫微环境促进口腔肿瘤发展	口腔肿瘤小鼠模型	肿瘤免疫学	口腔癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
425	2025-07-19	An effective two-stage NMBzA-induced rat esophageal tumor model revealing that the FAT-Hippo-YAP1 axis drives the progression of ESCC 2024-04-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2024.216813 PMID:38499266	研究论文	本研究建立了一种高效的两阶段NMBzA诱导的大鼠食管鳞状细胞癌(ESCC)模型，并发现FAT-Hippo-YAP1轴驱动ESCC的进展	使用多激酶抑制剂索拉非尼作为肿瘤促进剂，显著提高了肿瘤发生率和缩短了肿瘤形成时间，并通过多组学分析揭示了FAT-Hippo-YAP1轴的激活在ESCC进展中的关键作用	研究仅基于大鼠模型，结果在人类ESCC中的直接应用需要进一步验证	研究ESCC的发病机制和新的治疗策略	NMBzA诱导的大鼠ESCC模型及衍生的肿瘤细胞系	癌症研究	食管鳞状细胞癌	全基因组测序、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、三维器官培养	NA	基因组数据、转录组数据	NA
426	2025-07-19	Therapeutic application of human type 2 innate lymphoid cells via induction of granzyme B-mediated tumor cell death 2024-02-01, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2023.12.015 PMID:38211590	研究论文	本文探讨了人类2型先天淋巴样细胞(ILC2s)通过诱导颗粒酶B介导的肿瘤细胞死亡的潜在治疗应用	首次发现人类ILC2s分泌颗粒酶B(GZMB)并通过诱导焦亡和/或凋亡直接溶解肿瘤细胞，揭示了DNAM-1-CD112/CD155相互作用调控FOXO1的机制	未提及具体临床转化面临的挑战或体内应用的潜在副作用	探索人类ILC2s在肿瘤治疗中的潜在应用价值	人类2型先天淋巴样细胞(ILC2s)和肿瘤细胞	免疫治疗	白血病和实体瘤	单细胞RNA测序	NA	分子和细胞数据	未明确提及具体样本数量，但建立了可扩展2000倍的人类ILC2s培养平台
427	2025-07-19	Single-Cell RNA Sequencing Technology Landscape in 2023 2024-01-13, Stem cells (Dayton, Ohio) DOI:10.1093/stmcls/sxad077 PMID:37934608	review	本文综述了2023年单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术的现状及其在细胞异质性和基因表达动态研究中的重要性	总结了scRNA-seq和snRNA-seq的优缺点，并概述了当前多种scRNA-seq技术（如基于液滴、平板、水凝胶和空间转录组学）的发展	未具体讨论每种技术的详细性能比较或实际应用案例	探讨单细胞RNA测序技术的现状及其在细胞生物学和疾病机制研究中的应用	单细胞RNA测序技术及其在干细胞研究中的应用	生物信息学	NA	scRNA-seq, snRNA-seq, 空间转录组学	NA	RNA测序数据	NA
428	2025-07-19	Involvement of S100A6/S100A11 in T-Cell Immune Regulatory in HCC Revealed by Single Cell RNA-seq 2024 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment IF:2.7Q3 DOI:10.1177/15330338241252610 PMID:38766816	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探索了S100A6/S100A11在肝细胞癌（HCC）T细胞免疫调节中的作用	首次揭示了S100A6/S100A11通过NF-κB通路调控HCC中T细胞亚群的分化和细胞活性，并发现其低表达与良好预后相关	研究机制尚未完全阐明，需要进一步实验验证	探索S100蛋白家族成员在HCC免疫细胞中的功能机制	肝细胞癌（HCC）和乙型肝炎病毒相关HCC的肿瘤微环境	肿瘤免疫学	肝细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	TCGA数据集和研究者收集的HCC样本（具体数量未说明）
429	2025-07-18	Targeting KIT With Antibody-Drug Conjugates in Chromophobe Renal Cell Carcinoma 2025-Aug, Clinical genitourinary cancer IF:2.3Q2 DOI:10.1016/j.clgc.2025.102359 PMID:40408838	研究论文	该研究探讨了在嗜铬肾细胞癌（ChRCC）中靶向KIT的抗体-药物偶联物（ADC）的治疗潜力	首次在ChRCC中测试了靶向KIT的ADC，并证实其有效性	研究仅基于细胞系和有限的患者样本，未进行大规模临床试验	探索KIT作为ChRCC治疗靶点的可行性	嗜铬肾细胞癌（ChRCC）细胞系和患者样本	肿瘤学	肾细胞癌	单细胞RNA测序、Western blot分析	NA	RNA表达数据、蛋白质表达数据	15例转移性ChRCC样本和5个ChRCC细胞系
430	2025-07-18	SOX11 and GLIS2: Novel Biomarkers for Understanding the Progression of Oral Leukoplakia 2025-Aug, International dental journal IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.identj.2025.100872 PMID:40543136	研究论文	本研究通过整合单细胞RNA测序和大块RNA测序数据，探讨了口腔白斑病（LP）进展中的转录调控机制，并鉴定了SOX11和GLIS2作为潜在的生物标志物	首次将单细胞RNA测序技术应用于LP研究，发现SOX11和GLIS2作为LP特异性分子标志物，并揭示其通过调控EMT和血管生成影响疾病进展	研究样本量有限，且主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平的功能验证	探索口腔白斑病进展的分子机制并寻找潜在生物标志物	口腔白斑病（LP）组织样本和口腔鳞状细胞癌（OSCC）样本	数字病理学	口腔癌	单细胞RNA测序，大块RNA测序，免疫组化染色	NA	RNA测序数据，临床生存数据	LP组织样本和TCGA数据库中的OSCC样本
431	2025-07-18	Decoding Cellular Landscapes: Unravelling Periodontitis and Periapical Periodontitis at the Single-Cell Frontier 2025-Aug, International dental journal IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.identj.2025.100851 PMID:40554261	研究论文	通过分析单细胞RNA测序数据，揭示了牙周炎和根尖周炎在牙槽骨中关键基因表达和细胞异质性的差异	首次在单细胞水平上比较了牙周炎和根尖周炎的关键基因表达和细胞异质性，并识别了疾病特异性的关键基因和细胞类型	研究仅基于公开可用的单细胞RNA测序数据集，未进行独立实验验证	阐明牙周炎和根尖周炎在牙槽骨中的分子和细胞差异	牙周炎和根尖周炎患者的牙槽骨组织	单细胞组学	牙周炎和根尖周炎	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 定量实时聚合酶链反应(qRT-PCR)	NA	单细胞RNA测序数据	两个公开数据集(GSE171213和GSE181688)
432	2025-07-18	Integrated Analyses to Identify the Roles of GPX1 in Frailty and Hypertension 2025-Aug, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979) DOI:10.1161/HYPERTENSIONAHA.125.24664 PMID:40575858	研究论文	通过整合分析确定GPX1在衰弱和高血压中的作用	首次通过两样本孟德尔随机化分析评估2532个可药物化基因对衰弱和高血压的因果效应，并利用RNA表达谱和单细胞RNA测序进行验证	研究主要基于遗传学和分子水平分析，缺乏临床干预实验验证	确定衰弱和高血压的有效药物靶点	老年人群中的衰弱和高血压患者	生物医学研究	老年疾病	两样本孟德尔随机化分析, RNA表达谱, 单细胞RNA测序, 分子对接	NA	遗传数据, RNA测序数据	2532个可药物化基因的分析
433	2025-07-18	Interleukin (IL)-34 promotes the inflammatory role of IL-1β-producing myeloid cells in pemphigus lesions 2025-Jul-17, The British journal of dermatology DOI:10.1093/bjd/ljaf130 PMID:40203120	研究论文	研究探讨了髓系细胞在天疱疮病变中形成异位淋巴样结构（ELS）的作用，并揭示了IL-34/CSF-1R通路作为潜在治疗靶点	首次发现IL-1β产生的髓系细胞（IL1B_Macro）是天疱疮病变中的主要髓系亚群，并揭示IL-34和TNF-α协同促进其分化	研究主要基于体外实验和单细胞测序数据，尚未进行体内功能验证	探究髓系细胞在天疱疮病变中形成ELS的机制并寻找潜在治疗靶点	天疱疮患者的皮肤病变组织	免疫病理学	天疱疮	scRNA-seq, IHC, 免疫荧光, 流式细胞术, bulk RNA-seq, Transwell趋化实验	NA	单细胞转录组数据, 免疫组织化学数据, 流式细胞数据	天疱疮患者的皮肤病变组织样本（未明确数量）
434	2025-07-18	An unbiased genomewide screen uncovers 7 genes that drive hematopoietic stem cell fate from mouse embryonic stem cells 2025-Jul-17, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024027742 PMID:40209065	研究论文	通过全基因组CRISPR激活筛选，发现了7个基因在小鼠胚胎干细胞向造血干细胞分化过程中的关键作用	采用了一种新颖且无偏的全基因组CRISPR激活筛选方法，首次鉴定了7个在造血干细胞命运决定中起关键作用的基因	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类细胞中验证	探索体外生成造血干细胞的关键调控因素	小鼠胚胎干细胞和造血干细胞	再生医学	血液系统疾病	全基因组CRISPR激活筛选、单细胞RNA测序	小鼠模型	基因组数据、转录组数据	未明确说明具体样本数量，使用了小鼠胚胎干细胞和免疫缺陷NSG小鼠
435	2025-07-18	PLAUR+ Neutrophils Drive Anti-PD-1 Therapy Resistance in Patients with Hepatocellular Carcinoma by Shaping an Immunosuppressive Microenvironment 2025-Jul-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202507167 PMID:40673864	研究论文	该研究揭示了PLAUR+中性粒细胞在肝细胞癌患者中通过塑造免疫抑制微环境驱动抗PD-1治疗耐药的作用	首次发现PLAUR+中性粒细胞在免疫治疗无应答者中富集，并通过多组学分析揭示其在塑造免疫抑制微环境中的关键作用，同时发现一种新型PLAUR抑制剂可逆转中性粒细胞的免疫抑制表型	研究主要基于临床队列和临床前模型，需要进一步在更大规模的临床试验中验证PLAUR抑制剂的疗效	探索肝细胞癌中免疫治疗耐药的机制并寻找潜在的治疗策略	肝细胞癌患者和临床前模型中的PLAUR+中性粒细胞	肿瘤免疫学	肝细胞癌	多组学分析、空间转录组学、单细胞RNA测序、基于结构的虚拟筛选	NA	临床数据、测序数据	未明确提及具体样本数量，涉及临床队列和多种体内肿瘤模型
436	2025-07-18	ER-phagy Activation by AMFR Attenuates Cardiac Fibrosis Post-Myocardial Infarction via mTORC1 Pathway 2025-Jul-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202504552 PMID:40673870	研究论文	本研究探讨了自分泌运动因子受体(AMFR)通过激活ER-phagy减轻心肌梗死后心脏纤维化的机制	首次揭示了AMFR通过调节FAM134B介导的ER-phagy活性抑制心脏纤维化的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证	探究ER-phagy在心肌梗死后心脏纤维化中的作用机制	心肌梗死后的小鼠心脏组织和心脏成纤维细胞	心血管疾病	心血管疾病	scRNA-seq分析	基因敲除小鼠模型	基因表达数据	小鼠心脏组织和体外培养的心脏成纤维细胞
437	2025-07-18	The Evolutionary Trajectory and Prognostic Value of GITR+ Tregs Reprogramed by Tumor-Intrinsic PD-1/c-MET Signaling in Pancreatic Cancer 2025-Jul-17, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202500806 PMID:40673866	研究论文	本研究探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)中肿瘤固有PD-1/c-MET信号通路对GITR+ Tregs的进化轨迹和预后价值的影响	首次揭示了MET-IL-23-STAT4轴在PDAC中介导GITR+ Tregs免疫逃逸的机制，并证明MET抑制与GITR激动剂联合治疗可增强抗肿瘤免疫	研究主要基于临床前模型，需要进一步临床试验验证	探究PDAC中肿瘤固有PD-1/c-MET信号通路的免疫调节作用及其治疗潜力	胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和原位PDAC模型	肿瘤免疫学	胰腺癌	单细胞RNA测序	原位PDAC模型	基因表达数据	未明确说明患者样本数量，使用原位PDAC模型
438	2025-07-18	Antibiotic treatment limits survival of peripheral and bone marrow B cell populations 2025-Jul-16, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024013694 PMID:40668665	研究论文	该研究探讨了长期或广谱抗生素治疗对小鼠骨髓和外周B细胞群体的影响	首次发现抗生素治疗会导致骨髓B细胞在所有发育阶段的显著耗竭，并揭示了MYC信号通路在维持B细胞祖细胞存活中的关键作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究抗生素治疗对造血系统特别是B细胞群体的影响机制	小鼠骨髓和外周B细胞群体	免疫学	NA	单细胞RNA测序、流式细胞术	小鼠模型	基因表达数据、细胞计数数据	NA
439	2025-07-18	Systemic administration of an RNA binding and cell-penetrating antibody targets therapeutic RNA to multiple mouse models of cancer 2025-Jul-16, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adk1868 PMID:40668891	研究论文	本研究开发了一种名为TMAB3的抗体，能够与RNA形成稳定的复合物，实现RNA在肿瘤细胞中的特异性递送，并在多种癌症小鼠模型中展现出抗肿瘤效果	利用具有肿瘤靶向、细胞穿透和RNA结合能力的单克隆抗体TMAB3，形成稳定的抗体/RNA复合物，实现RNA在肿瘤细胞中的高效特异性递送	研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	开发一种能够特异性递送治疗性RNA至肿瘤细胞的抗体平台，用于癌症治疗	胰腺癌、髓母细胞瘤和黑色素瘤的小鼠模型	肿瘤治疗	胰腺癌、髓母细胞瘤、黑色素瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术	小鼠模型	RNA测序数据、流式细胞数据	多种癌症小鼠模型（具体数量未明确说明）
440	2025-07-18	Excitatory synaptic transmission is differentially modulated by opioid receptors along the claustro-cingulate pathway 2025-Jul-16, eNeuro IF:2.7Q3 DOI:10.1523/ENEURO.0219-25.2025 PMID:40670155	research paper	研究阿片受体如何调节claustro-cingulate通路中的兴奋性突触传递	揭示了KOR、MOR和DOR阿片受体在CLA-ACC通路中对突触传递的不同调节作用，特别是KOR的独特作用	研究仅在小鼠中进行，尚未在人类中验证	探究阿片受体对claustro-cingulate环路中谷氨酸能信号传递的调节作用	小鼠的claustrum（CLA）和前扣带回皮层（ACC）	神经科学	疼痛和情绪障碍	空间转录组学、脑片电生理学、光遗传学和药理学方法	NA	电生理数据	小鼠（性别未具体说明数量）