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当前共找到 40345 篇文献,本页显示第 421 - 440 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
421 2026-06-09
Workshop Introduction: Advances of AI Methods in Single Cell Spatial Omics
2026, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
会议简介 介绍在单细胞空间组学中应用人工智能和机器学习的最新进展,涵盖空间转录组学、蛋白质组学和代谢组学 聚焦AI方法在单细胞空间组学中的前沿应用,包括数据整合、细胞间相互作用建模及转化医学应用 NA 展示AI和机器学习在单细胞空间组学领域的最新方法进展 单细胞空间组学数据,包括转录组、蛋白质组和代谢组 机器学习 NA 空间转录组学、蛋白质组学、代谢组学 NA 空间组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
422 2026-06-09
Anti-PD-1 blockade reverses low-intensity electric stimulation-driven pancreatic cancer progression
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 探索低强度电刺激联合抗PD-1阻断对胰腺癌免疫微环境的影响及协同抗肿瘤效应 首次使用原位胰腺导管腺癌模型系统评估低强度电刺激的免疫调节和巨噬细胞极化作用,并发现抗PD-1阻断可逆转低强度电刺激驱动的肿瘤进展 未提及研究局限性 探究低强度电刺激后的肿瘤免疫微环境重塑并评估其与抗PD-1阻断联合的抗肿瘤效果 胰腺导管腺癌小鼠原位模型及肿瘤细胞 数字病理学 胰腺癌 单细胞RNA测序、批量RNA测序、流式细胞术、多色免疫荧光 NA 单细胞转录组数据、批量转录组数据、图像数据 小鼠原位胰腺癌模型 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
423 2026-06-09
A tryptophan metabolism-related gene signature predicts prognosis and immune features in cutaneous melanoma
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 构建色氨酸代谢相关基因风险模型预测皮肤黑色素瘤预后和免疫特征 首次基于色氨酸代谢相关基因构建五基因风险模型,结合bulk和单细胞RNA测序数据全面分析免疫微环境差异,并通过体外实验验证IDO1对黑色素瘤细胞功能的影响 未明确说明局限性 探索色氨酸代谢相关基因在皮肤黑色素瘤预后和免疫状态中的预测价值 皮肤黑色素瘤患者样本及黑色素瘤细胞系 机器学习 黑色素瘤 RNA-seq, 单细胞RNA-seq Cox回归风险模型 转录组数据, 临床数据 457例皮肤黑色素瘤患者 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
424 2026-06-09
Molecular heterogeneity of HPV-associated cancers and strategies to overcome treatment resistance
2026, Cancer heterogeneity and plasticity
综述 本文总结了HPV相关癌症的分子异质性及其导致的治疗耐药机制,并探讨了克服这些挑战的新型联合治疗策略 整合单细胞转录组学与HPV整合图谱,揭示病毒和宿主异质性如何共同塑造免疫逃逸和治疗响应,为个性化联合疗法提供框架 未详细讨论具体临床试验数据或定量分析不同联合策略的疗效差异 阐述HPV相关癌症的分子异质性及其对治疗耐药的影响,提出应对策略以改善患者预后 HPV相关癌症(包括宫颈癌、口咽癌、肛门癌及其他肛门生殖器癌)及其肿瘤微环境 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA测序 NA 文本 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
425 2026-06-09
Piezo1-Fstl1 Axis in Fracture Healing: Modulation of the Chondrocyte Inflammation-ROS-Mitochondrial Damage Cascade and Application of Smart Delivery System
2026, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了智能递药系统通过Piezo1-Fstl1信号轴促进骨折愈合的调控机制,并验证了其对软骨细胞炎症反应、线粒体氧化应激和成骨细胞分化的调节作用 首次揭示了Piezo1-Fstl1轴在骨折愈合中调控软骨细胞炎症-活性氧-线粒体损伤级联反应的作用,并开发了含软骨细胞靶向脂质纳米颗粒的HA-PBA/TA自愈合水凝胶作为智能递药系统 研究主要基于小鼠模型,在人体内的验证尚未进行;智能递药系统的长期安全性和有效性需要进一步评估 探究Piezo1-Fstl1信号轴在骨折愈合中的作用机制并开发智能递药系统促进骨折修复 小鼠股骨骨折模型中的软骨细胞和骨折愈合过程 机器学习和数字病理学 骨折 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠股骨骨折部位组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
426 2026-06-09
Integration of single-cell and bulk RNA sequencing reveals divergent T-cell immune circuits and a shared osteo-immune pathway in spinal tuberculosis and brucellar spondylitis
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology IF:4.6Q1
研究论文 整合单细胞和批量RNA测序揭示脊柱结核和布鲁氏菌性脊柱炎中不同的T细胞免疫回路和共享的骨免疫通路 首次通过整合单细胞和批量RNA测序比较脊柱结核和布鲁氏菌性脊柱炎的免疫病理机制,发现病原体特异的T细胞回路和共享的骨免疫通路 样本量较小,需要更大规模研究验证结果 阐明脊柱结核和布鲁氏菌性脊柱炎的免疫病理机制差异和共性 脊柱结核和布鲁氏菌性脊柱炎患者的感染椎间盘组织 单细胞转录组学 脊柱结核,布鲁氏菌性脊柱炎 单细胞RNA测序,批量RNA测序,AUCell,伪时间轨迹分析,调控网络推断,细胞间通讯分析 NA 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 单细胞RNA测序:脊柱结核n=3,布鲁氏菌性脊柱炎n=3;批量RNA测序:脊柱结核n=7,布鲁氏菌性脊柱炎n=5;共67,274个高质量细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序,批量RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
427 2026-06-09
Integrative Multiomics Analysis Identifies a Novel Gene Signature That Predicts Chemotherapy Resistance and Poor Survival in Osteosarcoma
2026, Human mutation IF:3.3Q2
research paper 通过整合多组学分析,鉴定出一个预测骨肉瘤化疗耐药和不良预后的新型基因特征 首次结合加权基因共表达网络分析及多队列验证,构建包含13个基因的风险模型,并整合单细胞和空间转录组学揭示化疗耐药与肿瘤增殖激活、基因组不稳定性及免疫冷表型的潜在机制 摘要未明确提及局限性 基于转录组特征预测骨肉瘤化疗耐药并探索相关生物学机制 骨肉瘤患者的肿瘤样本及相关转录组数据 机器学习的生物信息学应用 骨肉瘤 NGS、WGCNA、单细胞转录组、空间转录组 WGCNA 转录组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 四个独立队列(TARGET-OS, GSE21257, GSE16091, GSE39055) 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium
428 2026-06-09
Identification of a lactylation-related gene signature in microsatellite stable gastric cancer based on bulk and single-cell RNA-seq
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 基于批量与单细胞RNA-seq数据,识别微卫星稳定型胃癌中乳酰化相关基因特征并评估其预后和治疗预测价值 首次在微卫星稳定型胃癌中构建乳酰化相关基因特征,并通过单细胞分析揭示关键基因在癌症相关成纤维细胞亚型中的功能角色 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏多中心独立验证队列;功能验证仅通过计算机模拟敲除进行,缺乏体外或体内实验证实 探索乳酰化相关基因特征在微卫星稳定型胃癌中的预后和治疗预测潜力 微卫星稳定型胃癌患者及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞亚型 机器学习 胃癌 RNA-seq,单细胞RNA-seq NA 基因表达数据,单细胞转录组数据 微卫星稳定型胃癌患者数据来自TCGA和GEO数据库 NA 批量RNA-seq,单细胞RNA-seq NA NA
429 2026-06-09
GPX7 marks fibroblast-associated stromal-innate immune crosstalk in ulcerative colitis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合孟德尔随机化、跨队列转录组学和单细胞RNA测序,揭示GPX7作为溃疡性结肠炎中成纤维细胞相关基质-先天免疫交互作用的标记物 首次通过多组学整合方法鉴定GPX7在成纤维细胞-巨噬细胞交互中的关键角色,并结合药物对接和分子动力学探索潜在调控因子QL-X-138 基于公共数据库和临床样本的观察性研究,QL-X-138的调控效应需进一步实验验证;结构分析仅为假设生成阶段 探究丝氨酸-甘氨酸-一碳代谢在溃疡性结肠炎成纤维细胞-巨噬细胞交互中的作用 溃疡性结肠炎患者的结肠黏膜样本、成纤维细胞-巨噬细胞共培养体系 数字病理学 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、qPCR、药物对接、分子动力学模拟 NA 转录组数据、单细胞测序数据、共培养体系实验数据 多个公共队列和独立临床队列,具体数量文中未明确提及 NA 单细胞RNA测序 NA NA
430 2026-06-09
Integrative multi-omics analysis identifies SNRPE as a key driver gene in uterine corpus endometrial carcinoma: promoting tumor progression, and mediating immune evasion
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过整合多组学分析发现SNRPE是子宫内膜癌的关键驱动基因,促进肿瘤进展并介导免疫逃逸 首次识别SNRPE作为子宫内膜癌的驱动癌基因,揭示其通过重塑全局剪接网络同时维持内在恶性进展和外在免疫抑制的双重机制 具体局限性未在摘要中提及,但可能包括样本量有限、缺乏更广泛的临床验证等 研究剪接失调在子宫内膜癌肿瘤进展和免疫逃逸中的生物学机制 子宫内膜癌(UCEC)中SNRPE基因的功能角色 机器学习 子宫内膜癌 RNA-seq, scRNA-seq, GWAS, sQTL, eQTL NA 序列数据 包括TCGA-UCEC队列和一个独立的临床UCEC患者标本队列 Illumina 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq NA
431 2026-06-09
Single-cell extracellular vesicle-program scoring maps immunometabolic rewiring and immune crosstalk of mesenchymal stromal cells in intervertebral disc degeneration, prioritizing AP2S1 and CSTB
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析,揭示间充质干细胞胞外囊泡相关程序在椎间盘退变中的免疫代谢重塑和免疫串扰作用,并优先筛选出AP2S1和CSTB作为关键调控因子 首次在单细胞分辨率下构建了MSC胞外囊泡相关程序评分,并将其置于IDD的免疫通信和免疫代谢框架中,同时通过机器学习方法优先识别出AP2S1和CSTB作为连接EV程序状态与免疫信号和代谢应激的关键节点 分析基于公共数据集,缺乏独立验证队列;分子对接结果仅为预测性,需进一步实验验证CSTB与ripasudil的相互作用 研究椎间盘退变中MSC胞外囊泡相关转录程序及其在免疫网络中的角色 8例IDD和3例对照髓核样本中的间充质干细胞 生物信息学 椎间盘退变 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 机器学习(LASSO, SVM-RFE), CellChat网络分析, GSVA/GSEA 单细胞转录组数据 11例髓核样本(8例IDD,3例对照) NA 单细胞RNA测序 NA 公共数据集GSE230809
432 2026-06-09
Research progress of CMTM4 in the tumor immune microenvironment and immunotherapy
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 总结CMTM4在肿瘤免疫微环境和免疫治疗中的作用机制 系统阐述了CMTM4在PD-L1稳定性调控、TME相关膜蛋白互作以及免疫检查点抑制剂耐药调节中的多重角色 当前研究模型的局限性、临床转化挑战以及未解决的机制问题 探讨CMTM4作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力及其在免疫治疗中的应用前景 CMTM4蛋白及其在肿瘤免疫微环境中的功能 NA 肿瘤 NA NA NA NA NA 单细胞多组学, 空间转录组学 NA 未来研究建议整合单细胞多组学、空间转录组学、蛋白质组学和类器官模型
433 2026-06-09
Integrative multi-omics analysis reveals inflammation-related molecular networks in acute mountain sickness
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 整合多组学分析揭示急性高山病中炎症相关分子网络 首次通过整合多组学数据(bulk RNA-seq、非编码RNA-seq和单细胞RNA-seq)系统揭示急性高山病中炎症相关分子调控网络,并发现HBEGF作为潜在治疗靶点 研究主要基于公开数据集和动物模型验证,缺乏人体临床样本的直接验证 探索急性高山病中炎症相关分子调控网络及潜在治疗靶点 急性高山病患者血液样本和低压低氧诱导的高原脑水肿小鼠模型 生物信息学 急性高山病 RNA-seq, 非编码RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 公开数据集包括GSE75665(bulk RNA-seq)、GSE90500(非编码RNA-seq)和单细胞RNA-seq数据集;动物模型使用HACE小鼠 Illumina bulk RNA-seq, 非编码RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina测序平台 数据来源于GEO数据库中的公开数据集,具体平台配置未详细说明
434 2026-06-09
Single-cell landscape of immune remodeling in alopecia areata suggests MIF + fibroblasts and their potential ligand-receptor crosstalk with dendritic cells
2026, Frontiers in medicine IF:3.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序分析揭示斑秃中免疫重塑的特征,特别是MIF+成纤维细胞与树突状细胞之间的配体-受体相互作用 首次发现并鉴定斑秃病变中新型促炎成纤维细胞亚群FB3,该亚群通过高表达MIF参与免疫炎症调控,并提出MIF-(CD74+CXCR4/CD44)信号轴是连接FB3与树突状细胞的核心机制 研究基于公开数据集,样本量有限(15份头皮样本),功能验证和体内实验缺失,亚群特异性标记物尚未完全验证 探究斑秃微环境中基质和上皮细胞在炎症维持中的作用及其与免疫细胞的相互作用 斑秃患者的头皮组织样本(正常皮肤、非病变区和病变区) 单细胞转录组学 斑秃 单细胞RNA测序 NA 单细胞基因表达数据 15份头皮样本(包括正常皮肤、非病变区和斑秃病变区) Illumina 单细胞RNA测序 Illumina NovaSeq 10x Genomics平台生成的scRNA-seq数据,来源于GEO数据库GSE212450和GSE233906数据集
435 2026-06-09
Trainable clustering framework for spatial transcriptomics
2026, Bioinformatics advances IF:2.4Q2
研究论文 介绍了一种用于空间转录组学的可训练聚类框架,结合自编码器与聚类层实现空间域识别 提出了一种统一四种互补策略(ACT、FACT、Scatter和Ensemble)的可训练聚类框架,通过自编码器驱动特征学习与Mclust辅助聚类层的联合优化实现端到端训练 未明确讨论模型在大规模数据集上的计算效率或对高度噪声数据的鲁棒性 开发一种用于空间转录组空间域识别的可训练聚类框架 人类DLPFC、小鼠前脑、人类乳腺癌样本 空间转录组学 乳腺癌 空间转录组学 自编码器、Mclust 空间转录组数据 人类DLPFC、小鼠前脑和人类乳腺癌数据集,以及Stereo-seq和Slide-seq数据集 NA 空间转录组学 Stereo-seq, Slide-seq NA
436 2026-06-09
Integrated transcriptomic identification and validation reveal key autophagy-associated biomarkers in sleep deprivation
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 通过整合转录组数据分析和实验验证,识别睡眠剥夺相关的关键自噬生物标志物 首次综合运用机器学习和单细胞RNA测序技术,发现CDKN1A、HSPA5和NR4A1作为睡眠剥夺相关自噬关键基因,并探讨其在免疫微环境和不同细胞亚群中的作用 本研究主要基于小鼠模型和公共数据集,人类样本仅为外周血,缺乏直接的人类脑组织验证;样本量有限,功能性验证尚不充分 识别与睡眠剥夺相关的自噬基因,为阐明睡眠剥夺发病机制和治疗靶点提供依据 小鼠脑组织、大鼠脑组织(前额叶皮层和海马)、人外周血样本 机器学习 睡眠剥夺相关疾病 转录组测序、RT-qPCR、单细胞RNA测序 机器学习模型 基因表达数据 多个转录组数据集(GSE33302、GSE9442、GSE9441、GSE3767、GSE37665),包括小鼠脑组织、大鼠脑组织和人外周血样本;大鼠模型(雄性Sprague-Dawley大鼠,连续7天睡眠剥夺) NA 单细胞RNA测序 NA NA
437 2026-06-09
Myeloid HDAC7 drives liver inflammation and systemic glucose dysregulation during diet-induced obesity
2026, Clinical & translational immunology IF:4.6Q2
研究论文 该研究探讨了髓系HDAC7在饮食诱导的肥胖过程中驱动肝脏炎症和全身性葡萄糖失调的作用 首次通过遗传功能获得和缺失实验在小鼠中明确证实髓系HDAC7在肥胖驱动的代谢疾病中促进肝脏炎症和全身性葡萄糖失调,并与人类晚期慢性肝病特征相关 主要基于小鼠模型,尚未完全阐明HDAC7在人类代谢疾病中的具体机制和临床转化价值 研究髓系HDAC7在肥胖驱动的代谢疾病中的功能,特别是在肝脏炎症和葡萄糖代谢中的作用 小鼠模型及人类晚期慢性肝病患者肝脏样本 机器学习 代谢性疾病、慢性肝病 空间转录组学、基因敲除和过表达技术 NA 基因表达数据、空间转录组学数据 小鼠模型(包括转基因和敲除小鼠)及人类晚期慢性肝病患者肝脏样本 NA 空间转录组学 NA NA
438 2026-06-09
Single-cell and repertoire profiling reveals immune remodelling in paediatric upper airway: insights from adenoid hypertrophy
2026, Clinical & translational immunology IF:4.6Q2
研究论文 利用单细胞RNA测序和配对B/T细胞受体分析揭示了儿童腺样体肥大中的免疫重塑特征 首次在单细胞分辨率下联合分析腺样体肥大中B细胞和T细胞受体库,发现免疫细胞组成和功能改变 样本量较小(每组4例),且未进行功能性验证实验 解析儿童腺样体肥大中的免疫细胞景观和配对B/T细胞受体谱系变化 儿童腺样体组织(肥大组和对照组各4例) 数字病理学 儿科疾病 10x Genomics 5'单细胞RNA测序,配对VDJ分析 NA 单细胞转录组和免疫受体库数据 8例腺样体组织(4例肥大,4例对照),共72,076个高质量细胞 10x Genomics 单细胞RNA测序,单细胞VDJ分析 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 5'试剂盒,含配对V(D)J分析
439 2026-06-09
Pathogenic Implications of the THY1/NF-κB Feedback Relationship in Osteoarthritis and Its Potential as a Therapeutic Target
2026, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过整合差异表达分析、WGCNA和PPI网络分析等方法,鉴定出THY1作为骨关节炎的诊断标志物,并探讨其与NF-κB信号通路的反馈关系及作为治疗靶点的潜力 首次通过多种机器学习算法整合单细胞测序和分子动力学模拟,揭示THY1在骨关节炎软骨细胞发育中的动态表达,并预测小檗碱与THY1的结合作用 研究主要基于计算模拟和初步实验验证,THY1/NF-κB反馈关系的临床意义和分子机制仍需进一步验证;小檗碱与THY1的相互作用仅提供结构预测,缺乏体内药理学证据 鉴定骨关节炎的潜在治疗靶点并探索相关分子机制 骨关节炎患者和动物模型的软骨细胞及组织样本 机器学习 骨关节炎 单细胞测序、分子动力学模拟、WGCNA、PPI网络分析 RF, LASSO, SVM-RFE 基因表达数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
440 2026-06-09
Immune-excluded and immune-suppressive tumor microenvironments: mechanisms, spatial biomarkers, and therapeutic rewiring
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
综述 综述了免疫排斥和免疫抑制肿瘤微环境的机制、空间生物标志物及治疗重塑策略 整合空间转录组学、多重成像、空间蛋白质组学等新兴技术,系统阐述耐药性TME的空间组织特征和动态演化机制,提出空间生物标志物可优化患者分层和治疗决策 前瞻性临床验证仍有限,空间生物标志物系统的临床应用尚未成熟 阐明免疫排斥和免疫抑制肿瘤微环境的生物学机制、空间标志物的潜在价值及治疗重塑方向 肿瘤微环境中的基质重塑、癌相关成纤维细胞、髓系细胞主导、细胞因子和趋化因子网络、血管功能障碍、代谢应激及器官特异性微环境效应 数字病理学 恶性肿瘤(多种实体瘤) 空间转录组学、多重成像、空间蛋白质组学 NA 空间转录组数据、多重成像数据、空间蛋白质组数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
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