单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-05 |
Extracellular Vesicle-Packaged circTAX1BP1 from Cancer-Associated Fibroblasts Regulates RNA m6A Modification through Lactylation of VIRMA in Colorectal Cancer Cells
2025-Sep-29, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514008
PMID:41017455
|
研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过细胞外囊泡递送circTAX1BP1调控结直肠癌肝转移的新机制 | 首次发现CAF来源的EV-packaged circTAX1BP1通过VIRMA乳酰化调控RNA m6A修饰，并鉴定出ITGA11 myCAFs亚群在正反馈环路中的关键作用 | 机制研究主要基于体外实验，临床转化价值需进一步验证 | 阐明结直肠癌肝转移的分子机制并探索治疗靶点 | 结直肠癌细胞、癌症相关成纤维细胞、细胞外囊泡 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, PDX模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 422 | 2025-10-05 |
Redox Regulation of Microvascular Physiology and Pathophysiology: Insights into Therapeutic Strategies and Limitations
2025-Sep-29, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251372607
PMID:41020442
|
综述 | 本文探讨氧化还原机制在微血管生理和病理生理中的作用及其治疗策略 | 强调微血管与大血管对ROS/RNS反应差异，指出单细胞RNA测序揭示不同血管床内皮细胞具有独特基因特征 | 技术挑战限制了可靠关联ROS/RNS水平与微血管结果的能力，缺乏针对微血管氧化还原信号的特效治疗方法 | 阐明氧化还原介导的微血管功能障碍在疾病发病机制中的具体作用 | 微血管内皮细胞及其对活性氧/活性氮物种(ROS/RNS)的响应 | 病理生理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 423 | 2025-10-05 |
Multi-omics genetic study revealing ferroptosis regulator CTSB driving prostate cancer progression by modulating the immune microenvironment
2025-Sep-29, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04593-y
PMID:41020944
|
研究论文 | 本研究通过多组学孟德尔随机化方法揭示了铁死亡调控因子CTSB通过调节免疫微环境驱动前列腺癌进展的因果机制 | 首次提供了铁死亡-免疫相互作用在前列腺癌中因果作用的证据，识别了CTSB作为关键风险因子 | 研究主要基于遗传学证据，需要进一步实验验证机制细节 | 探究铁死亡基因/蛋白表达与前列腺癌的遗传因果关系及免疫介导机制 | 前列腺癌患者样本和免疫细胞类型 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 多组学孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 免疫浸润分析 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白组数据 | 涉及731种免疫细胞类型的多组学数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 424 | 2025-10-05 |
Simultaneous Measurement of RNA Synthesis and Degradation Rates in Single Cells Unveils the Regulatory Mechanisms of Temporal RNA Dynamics
2025-Sep-28, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202510939
PMID:41017207
|
研究论文 | 开发了一种名为scDUAL-seq的新方法，能够在单细胞水平同时测量RNA合成和降解速率 | 整合了双核苷类似物脉冲标记、化学核苷转化和单细胞RNA测序技术，首次实现单细胞水平转录组范围内RNA合成和降解速率的同步测量 | NA | 解析动态过程中RNA调控机制 | 异质性细胞群体中的RNA转录和降解过程 | 单细胞组学 | NA | 双核苷类似物脉冲标记,化学核苷转化,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 425 | 2025-10-05 |
Immune cell dynamics and their role in cardiac injury: Mechanisms and therapeutic implications
2025-Sep-27, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118608
PMID:41016152
|
综述 | 本文综述了心脏损伤中免疫细胞动态变化及其作用机制与治疗前景 | 整合单细胞转录组学、空间组学、免疫代谢和神经内分泌-免疫相互作用等多维度数据，提出精准免疫治疗框架 | NA | 阐明心脏疾病中免疫细胞动态变化机制及其治疗意义 | 中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞、T细胞等免疫细胞及其与心肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞的相互作用 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学, 空间组学, 免疫代谢分析 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 426 | 2025-10-05 |
Intervention of Rutin and Ochnaflavone in the Attenuation of Neuroinflammation and Neuronal Apoptosis in Spinal Cord Injury
2025-Sep-26, Global spine journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1177/21925682251383489
PMID:41001708
|
研究论文 | 本研究探讨芦丁和奥那黄酮通过调节PI3K/AKT和NF-κB信号通路减轻脊髓损伤后神经炎症和神经元凋亡的机制 | 首次揭示芦丁和奥那黄酮协同作用通过调控小胶质细胞活化和PI3K/AKT/NF-κB信号通路发挥神经保护作用的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；机制研究尚未完全阐明所有下游效应分子 | 阐明芦丁和奥那黄酮在脊髓损伤中的神经保护机制 | 脊髓损伤小鼠模型、BV2小胶质细胞系、小胶质细胞-神经元共培养系统 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 网络药理学, 蛋白质印迹, 免疫荧光, ELISA | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞培养数据 | 小鼠脊髓损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 427 | 2025-10-05 |
Integrated multi-omics analysis reveals PTM networks as key regulators of colorectal cancer progression and immune evasion
2025-Sep-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03445-8
PMID:41003898
|
研究论文 | 通过整合多组学分析揭示翻译后修饰网络作为结直肠癌进展和免疫逃逸的关键调控因子 | 首次全面揭示PTM网络在结直肠癌中的调控作用，发现GALNT6介导的糖基化通过稳定PD-L1和排除CD8+T细胞驱动免疫逃逸 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探索翻译后修饰在结直肠癌进展和免疫逃逸中的综合作用 | 结直肠癌患者样本和细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学整合分析，孟德尔随机化，空间转录组学 | LASSO，SVM，随机森林 | 转录组数据，单细胞数据 | 1,783例批量RNA-seq样本，41,143个单细胞 | NA | 单细胞转录组学，空间转录组学，批量RNA-seq | NA | NA |
| 428 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis reveals the prognostic value and immunomodulatory role of CTSW in breast cancer
2025-Sep-26, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03550-8
PMID:41003895
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示CTSW在乳腺癌中的预后价值和免疫调节作用 | 首次采用多组学框架系统研究CTSW在乳腺癌中的预后意义和免疫调节功能，并通过单细胞RNA测序发现CTSW在活化CD8+T细胞中的表达与预后相关 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索乳腺癌中新的生物标志物和治疗靶点 | 乳腺癌患者和肿瘤免疫微环境 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 转录组学、甲基化组学、数量性状位点分析、全基因组关联研究、单细胞RNA测序 | Cox回归、Kaplan-Meier生存分析、孟德尔随机化 | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2025-10-05 |
Data-driven inference of Boolean networks from transcriptomes to predict cellular differentiation and reprogramming
2025-Sep-26, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00569-z
PMID:41006334
|
研究论文 | 提出一种从转录组数据自动推断布尔网络的方法，用于预测细胞分化和重编程 | 开发了整合转录组数据和先验知识自动生成布尔网络集合的通用方法，能够处理模型不确定性并预测稳健的重编程靶点 | 方法依赖于转录组数据的质量和对基础基因调控网络的先验知识 | 构建能够再现细胞定性行为的布尔网络模型，用于预测细胞分化和重编程 | 造血系统细胞分化和骨髓基质细胞向脂肪细胞/成骨细胞分化 | 计算生物学 | NA | RNA-seq | 布尔网络 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 430 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of molecular mechanisms in prostate cancer via single-cell RNA sequencing and weighted gene co-expression network analysis
2025-Sep-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-15682-6
PMID:41006377
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析研究前列腺癌的分子机制 | 首次整合scRNA-seq和bulk RNA-seq与hdWGCNA方法，在更高分辨率下分析前列腺癌肿瘤微环境，识别出6个关键基因 | 需要进一步的临床验证 | 探索前列腺癌进展的分子机制，发现潜在治疗靶点 | 前列腺癌组织样本 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 加权基因共表达网络分析 | Cox回归, LASSO回归, 预后预测模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 9,809个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 431 | 2025-10-05 |
Hypersonic levitation and spinning: paving the way for enhanced single-cell analysis via contactless tissue dissociation
2025-Sep-26, Communications engineering
DOI:10.1038/s44172-025-00497-0
PMID:41006575
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型非接触式组织解离技术——高超声悬浮旋转技术，用于改进单细胞分析 | 开发了基于三声谐振器探针的高超声悬浮旋转技术，实现非接触式组织解离，通过微尺度'液体射流'施加精确流体动力 | NA | 开发高效、温和的组织解离方法以改进单细胞分析 | 人类肾癌组织 | 单细胞分析 | 肾癌 | 高超声悬浮旋转技术 | NA | 流式细胞术、原代细胞培养、免疫荧光、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2025-10-05 |
Comprehensive characterization of lysosome-dependent cell death reveals prognostic significance and immune landscape in colon adenocarcinoma
2025-Sep-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-18267-5
PMID:41006689
|
研究论文 | 本研究全面表征了溶酶体依赖性细胞死亡在结肠腺癌中的预后意义和免疫景观 | 首次系统分析LDCD相关基因在结肠腺癌中的表达特征，建立五基因预后标志物，并揭示其与肿瘤免疫微环境的关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，需要更多前瞻性研究验证 | 探索溶酶体依赖性细胞死亡相关基因在结肠腺癌中的预后价值和免疫学意义 | 结肠腺癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 结肠癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，LASSO回归，Cox回归分析 | 预后预测模型 | 基因表达数据，临床数据 | TCGA和GEO数据库中的结肠腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序，转录组测序 | NA | NA |
| 433 | 2025-10-05 |
Single-cell mapping of TMZ-resistant glioma reveals CXCL2/3-CXCR2-associated neutrophil communication
2025-Sep-25, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152706
PMID:41016335
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示TMZ耐药胶质瘤中CXCL2/3-CXCR2信号轴介导的肿瘤-中性粒细胞通讯机制 | 首次发现耐药胶质瘤干细胞通过CXCL2/3-CXCR2化学趋化轴与中性粒细胞建立特异性通讯回路 | 基于已发表数据的二次分析，需进一步实验验证具体分子机制 | 探究胶质母细胞瘤中TMZ耐药性与肿瘤微环境的关联机制 | 胶质瘤细胞、免疫细胞（小胶质细胞/巨噬细胞、中性粒细胞） | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | CellChat细胞通讯分析 | 转录组数据 | 基于大型单细胞RNA-seq数据集的二次分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 434 | 2025-10-05 |
Integrated Multiomics Analysis Identifies CDO1 as a Novel Therapeutic Target for Osteoarthritis
2025-Sep-25, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets
|
研究论文 | 通过整合多组学分析识别CDO1作为骨关节炎的新型治疗靶点 | 首次通过整合单细胞RNA测序、批量RNA测序和WGCNA分析识别CDO1作为骨关节炎的因果风险基因，并通过体内实验验证其治疗潜力 | 研究仅在大鼠模型中进行功能验证，尚未在人类临床试验中得到证实 | 识别骨关节炎进展中的关键基因和潜在治疗靶点 | 骨关节炎患者样本和大鼠模型 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,WGCNA,孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据 | 7个公共OA数据集和大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-05 |
Expression patterns of desmosome family members during tooth development and the role of Desmocollin-3 in cytodifferentiation of stratum intermedium
2025-Sep-24, Archives of oral biology
IF:2.2Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析牙齿发育过程中桥粒蛋白家族成员表达模式，并探讨Desmocollin-3在中间层细胞分化中的功能作用 | 首次发现桥粒蛋白家族基因在牙齿中间层细胞簇中高表达，并证实Dsc3对维持中间层细胞完整性和成釉细胞谱系定向的关键作用 | 研究主要使用SF2牙上皮细胞系，缺乏体内实验验证；样本局限于出生后第12天的磨牙 | 鉴定牙齿中间层特异性标志物并研究Dsc3在维持中间层细胞完整性和分化中的功能 | 小鼠磨牙牙齿发育过程中的中间层细胞和SF2牙上皮细胞系 | 发育生物学 | 牙齿发育异常 | 单细胞RNA测序，基因敲低，细胞培养 | NA | 单细胞转录组数据，细胞形态数据 | 出生后第12天小鼠磨牙，SF2牙上皮细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2025-10-05 |
Spatiotemporal profiling reveals the impact of caloric restriction in the aging mammalian brain
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116165
PMID:40833855
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和空间转录组学技术，揭示了热量限制对衰老小鼠大脑的细胞和分子影响 | 首次结合单细胞转录组和空间转录组技术，在时空维度上系统解析热量限制对哺乳动物大脑衰老的影响机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究热量限制延缓大脑衰老的细胞种群和分子通路机制 | 小鼠大脑细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单核转录组测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据 | 36只小鼠大脑的超过50万个细胞，12个大脑切片 | EasySci, IRISeq | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | EasySci单核转录组, IRISeq空间转录组 | 无成像IRISeq空间转录组技术 |
| 437 | 2025-10-05 |
gwSPADE: gene frequency-weighted reference-free deconvolution in spatial transcriptomics
2025-Sep-23, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf966
PMID:41002029
|
研究论文 | 提出一种名为gwSPADE的基因频率加权无参考空间转录组解卷积方法 | 开发了无需外部单细胞参考数据的空间转录组解卷积方法，采用基因频率加权方案和主题模型 | NA | 解决空间转录组数据中细胞类型组成的准确解卷积问题 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 主题模型 | 基因计数矩阵 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 438 | 2025-10-05 |
Dihydroartemisinin inhibits histone lactylation through YAP1 to act as a 'hot' switch for 'cold' tumor in hepatocellular carcinoma
2025-Sep-23, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157307
PMID:41016295
|
研究论文 | 本研究揭示了双氢青蒿素通过抑制YAP1降低组蛋白乳酸化，将肝细胞癌的肿瘤微环境从免疫抑制状态转变为免疫激活状态 | 首次发现双氢青蒿素通过YAP1抑制组蛋白乳酸化的新机制，并证明其能重塑肝癌免疫微环境 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探索双氢青蒿素改变肝细胞癌肿瘤微环境免疫状态的具体机制 | 肝细胞癌小鼠模型和细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化,Western blot,免疫荧光,代谢流分析,共免疫沉淀,细胞因子芯片,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,免疫细胞表型数据 | 多种免疫缺陷小鼠模型（NCG小鼠、BALB/c裸鼠、CD8+ T细胞清除小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 439 | 2025-10-05 |
Single-cell-scale spatial transcriptome of the developing and adult mouse ovary
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.16.676655
PMID:41000831
|
研究论文 | 本研究使用空间转录组技术构建了小鼠卵巢发育和成年期的单细胞尺度空间转录组图谱 | 首次在保持卵巢原生细胞结构的前提下，通过10X Genomics Visium HD空间转录组技术实现了近单细胞分辨率的空间基因表达分析 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种验证 | 探究卵巢发育过程中的空间模式调控机制 | 发育中和成年小鼠卵巢 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 8个关键胎儿期和出生后时间点的小鼠卵巢样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10X Genomics Visium HD空间转录组学平台 |
| 440 | 2025-10-05 |
Downregulation of heat shock protein 90 alpha family class A member 1 inhibits necroptosis in cardiac microvascular endothelial cells and alleviates sepsis-induced cardiomyopathy
2025-Sep-16, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2025.114757
PMID:40967330
|
研究论文 | 本研究探讨HSP90AA1下调通过抑制心脏微血管内皮细胞坏死性凋亡缓解脓毒症诱导心肌病的机制 | 首次在单细胞水平揭示HSP90aa1+毛细血管内皮细胞在脓毒症心肌病中的异质性，并阐明HSP90AA1通过NF-κB信号通路调控坏死性凋亡的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；未探讨其他潜在信号通路的参与 | 探究Hsp90AA1对小鼠心脏微血管内皮细胞功能和坏死性凋亡的影响及其在脓毒症诱导心肌病中的作用机制 | 小鼠心脏微血管内皮细胞和脓毒症诱导心肌病小鼠模型 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, Western blot, 免疫荧光, ELISA, 经胸超声心动图 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 影像数据 | 未明确样本数量的小鼠模型和细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |