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当前共找到 41240 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-07-01 |
SMURF: soft-segmentation for single-cell reconstruction and topological analysis of spatial transcriptomic data
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.28.656357
PMID:40502153
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研究论文 | SMURF是一种用于空间转录组数据单细胞重建和拓扑分析的软分割算法 | 提出了一种跨平台的软分割算法SMURF，不仅能准确将mRNA分配到单个细胞，还能将复杂组织结构投影到笛卡尔坐标上，揭示细胞类型组织和基因表达梯度 | NA | 开发一种新的计算方法，用于高分辨率空间转录组数据中准确将转录本分配到单个细胞，并分析复杂组织结构 | 空间转录组数据中的单个细胞和组织架构 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 软分割算法 | 图像与空间转录组数据 | 跨多个组织和平台的多重样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 422 | 2026-07-01 |
Durable B-Cell Impairment While Sparing IgA B Cells After Ocrelizumab Therapy in Multiple Sclerosis
2025-11, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70135
PMID:40781066
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研究论文 | 评估奥克雷珠单抗治疗复发缓解型多发性硬化症期间B细胞亚群的早期变化，特别是对IgA B细胞的保留作用 | 首次通过光谱流式细胞术和单细胞RNA测序揭示奥克雷珠单抗治疗在保留IgA B细胞的同时导致B细胞功能持久损伤，并发现治疗后B细胞恢复呈现炎症和迁移表型 | 样本量较小（18名患者和10名健康志愿者），停药后B细胞重建分析仅3例患者 | 探究奥克雷珠单抗在多发性硬化症中的作用机制及疾病病理生理学 | 复发缓解型多发性硬化症患者和健康志愿者 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 光谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据，基因表达数据 | 18名患者（治疗前后及停药后），10名健康志愿者，3名停药患者（单细胞RNA测序） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 423 | 2026-07-01 |
Early developmental neuronal activity inhibits oligodendrocyte differentiation through AMPA receptor activation
2025-Oct-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.17.683139
PMID:41279286
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研究论文 | 早期神经元活动通过AMPA受体激活抑制少突胶质细胞分化 | 首次揭示在早期脑发育过程中，感觉诱发和化学遗传改变的神经元活动会抑制少突胶质细胞分化，而减少神经元活动则缓解这种抑制并促进分化 | 未提及具体局限 | 研究早期脑发育中神经元活动对少突胶质细胞成熟的影响 | 小鼠的嗅觉系统、体感皮层和胼胝体中的少突胶质细胞前体细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA |
| 424 | 2026-07-01 |
Persistent interferon signaling and clonal expansion mark early events in DNA methylation damage-induced liver cancer
2025-Oct-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.01.679856
PMID:41256671
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研究论文 | 通过纵向分析揭示NDMA诱导的DNA甲基化损伤导致肝癌的早期分子事件，包括持续的干扰素信号和克隆扩增 | 首次通过纵向多组学分析（表型组、转录组、磷酸化蛋白质组）描绘NDMA暴露后从早期DNA损伤响应到数月后肝癌发生的完整分子级联事件，并发现持续的干扰素信号作为主导激活通路与克隆扩增相关 | 未明确提及局限性，但可能包括小鼠模型与人类的差异、单一致癌物暴露场景的局限性 | 阐明NDMA诱导肝癌进展的分子机制，识别早期生物标志物和疾病缓解策略 | 野生型和MGMT缺陷小鼠的肝脏组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 磷酸化蛋白质组学, 转录组学, 空间转录组学 | NA | 文本, 图像 | 未明确样本数量，涉及野生型和MGMT缺陷小鼠的纵向分析 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 425 | 2026-07-01 |
spammR: an R package designed for analysis and integration of spatial multi-omic measurements
2025-Aug-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672472
PMID:40909542
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研究论文 | 提出了一个用于分析和整合空间多组学测量的R包spammR，特别针对质谱衍生数据 | spammR专注解决质谱空间组学数据的小样本量、空间稀疏性和高缺失率问题，采用完全数据驱动方法，无需先验知识 | 目前主要针对质谱衍生空间组学数据，在其他平台适用性有待验证 | 开发一个通用的空间多组学分析工具，填补质谱空间组学数据分析工具的空白 | 空间多组学测量数据，包括转录本、蛋白质、代谢物和翻译后修饰的空间分布 | 机器学习 | NA | 质谱成像 | NA | 空间组学数据（质谱成像数据） | NA | NA | 空间组学 | NA | NA |
| 426 | 2026-07-01 |
An emergent disease-associated motor neuron state precedes cell death in a mouse model of ALS
2025-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.21.671404
PMID:40909710
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研究论文 | 通过对SOD1-G93A ALS小鼠模型的脊髓运动神经元进行纵向单核转录组和染色质可及性分析，揭示了运动神经元退化和选择性易感性的分子决定因素，发现了一种新的疾病相关运动神经元状态（DAMNs） | 首次识别出ALS中易感运动神经元的一种新型细胞状态“疾病相关运动神经元”（DAMNs），并揭示了驱动健康细胞向该状态转变的转录因子调控网络，同时利用空间转录组学发现疾病早期反应性胶质细胞与运动神经元的空间邻近性 | 基于小鼠模型，人类对应基因组区域与ALS遗传风险变异的相关性仍需进一步验证 | 理解ALS中运动神经元退化和选择性易感性的分子机制 | SOD1-G93A ALS小鼠模型的脊髓运动神经元（特别是易感的α运动神经元和抵抗性亚型） | 机器学习, 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症（ALS） | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | 转录因子调控网络模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 空间转录组数据 | SOD1-G93A ALS小鼠模型在多个时间点的脊髓组织样本（具体数量未明确） | 10x Genomics | 单核RNA-seq, 单核ATAC-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单核RNA测序和ATAC测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 427 | 2026-07-01 |
A single-cell transcriptomic atlas of the pigtail macaque placenta in late gestation
2025-Aug-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.15.669966
PMID:40894803
|
研究论文 | 构建了妊娠晚期猪尾猕猴胎盘的单细胞转录组图谱 | 首次构建了猪尾猕猴胎盘三个组织（绒毛膜绒毛、羊膜绒毛膜和母体蜕膜）的单细胞RNA-Seq图谱，并揭示了与人类胎盘高度相似的细胞组成 | 未明确说明局限性 | 比较非人灵长类与人类胎盘在单细胞水平上的细胞类型和功能相似性 | 妊娠晚期猪尾猕猴母胎界面的三个组织：绒毛膜绒毛、羊膜绒毛膜和母体蜕膜 | 单细胞转录组学 | 妊娠相关疾病 | scRNA-Seq | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA-Seq文库构建及Seurat数据分析流程 |
| 428 | 2026-07-01 |
Molecular Subtypes and Risk Prediction Model Based on Malignant Cell Differentiation Trajectories in Breast Cancer
2025-08, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70680
PMID:40778650
|
研究论文 | 基于乳腺癌恶性细胞分化轨迹构建分子亚型及风险预测模型 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组和大量RNA测序数据，首次基于恶性细胞分化轨迹构建乳腺癌分子分型系统（四种亚型）并建立预后模型，同时识别骨转移相关调控网络和潜在药物 | 预后模型的准确性中等（AUC=0.708），可能需要更多独立验证 | 揭示乳腺癌恶性细胞分化轨迹与分子异质性，构建新的分子分型系统和预后预测模型 | 乳腺癌（BRCA）患者的肿瘤组织样本，包括TCGA-BRCA队列的1097个大量RNA测序样本、单细胞RNA测序和空间转录组数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、大量RNA测序、UMAP分析、Monocle 2伪时间分析、LASSO回归 | Cox比例风险模型、LASSO回归模型 | 基因表达数据、空间转录组数据 | 1097个TCGA-BRCA大量RNA测序样本，2493个恶性斑点（空间转录组），单细胞RNA测序样本数量未明确 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序和10x Visium空间转录组学 |
| 429 | 2026-07-01 |
The Key Role of COA6 in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: Metabolic Reprogramming and Regulation of the Immune Microenvironment
2025-07, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70685
PMID:40596639
|
研究论文 | 研究了COA6在胰腺导管腺癌中的代谢重编程及免疫微环境调节作用 | 首次通过SMR/HEIDI分析结合多数据库识别COA6为PDAC关键基因，并利用单细胞RNA测序和空间转录组学构建细胞相互作用网络 | 需要进一步研究开发靶向COA6的疗法 | 探索COA6在胰腺导管腺癌代谢重编程和免疫微环境调节中的作用及治疗潜力 | 胰腺导管腺癌细胞系SW1990和PANC-1 | 机器学习和数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | SMR/HEIDI分析、单细胞RNA测序、空间转录组学、药物预测与分子对接 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、空间转录组数据 | SW1990和PANC-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 430 | 2026-07-01 |
Global Thyroid Cancer Patterns and Predictive Analytics: Integrating Machine Learning for Advanced Diagnostic Modelling
2025-07, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70676
PMID:40596746
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习方法，分析甲状腺癌的分子特征并验证诊断标志物，以促进早期检测和靶向治疗开发 | 结合单细胞转录组学和计算诊断算法（如Ridge、Lasso惩罚回归模型），揭示以骨髓细胞为中心的通讯网络在甲状腺癌发展中的关键作用 | 需要在前瞻性、多样化的患者群体中进行验证以确认临床实用性并优化实施策略 | 探究甲状腺癌的分子发病机制并验证诊断标志物 | 甲状腺癌标本及其非恶性相邻组织 | 机器学习 | 甲状腺癌 | 单细胞转录组学、定量PCR、ELISA | Ridge回归、Lasso回归 | 基因表达数据、转录组数据、细胞因子浓度数据 | GSE27155外部验证数据集及其他甲状腺癌标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 高分辨率单细胞转录组学 |
| 431 | 2026-07-01 |
Mendelian randomization combined with single-cell sequencing data analysis of chemokines and chemokine receptors and key genes and molecular mechanisms associated with epilepsy
2025-06-04, Neuroreport
IF:1.6Q4
DOI:10.1097/WNR.0000000000002168
PMID:40298633
|
研究论文 | 结合孟德尔随机化与单细胞测序数据，分析趋化因子及其受体相关基因在癫痫中的作用和潜在调控机制 | 首次将孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序数据结合，系统评估趋化因子受体相关基因与癫痫的因果关系，并鉴定关键基因及潜在治疗药物 | 样本量可能有限，且研究基于公开数据集，需进一步验证关键基因和免疫细胞在癫痫中的功能 | 探索趋化因子和趋化因子受体相关基因在癫痫中的功能和潜在调控机制 | 趋化因子受体相关基因及癫痫患者单细胞数据中的细胞类型 | 机器学习 | 癫痫 | RNA-seq | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确提及样本数量，但涉及六种细胞簇的数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2026-07-01 |
Machine Learning-Assisted Analysis of the Oral Cancer Immune Microenvironment: From Single-Cell Level to Prognostic Model Construction
2025-06, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70637
PMID:40457149
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研究论文 | 利用机器学习方法结合单细胞测序数据分析口腔癌免疫微环境，构建免疫浸润预测模型以指导个性化治疗和预后评估 | 将单细胞测序与多种机器学习算法（Lasso回归、随机森林、梯度提升机）联合应用，深入解析口腔癌免疫微环境异质性并构建可靠的预后模型 | 未明确说明外部验证集的规模及模型在真实临床场景中的应用验证，且C-index仅提供于补充材料中，正文缺乏具体数值 | 构建基于免疫浸润的口腔癌预后预测模型，为个性化治疗和预后评估提供理论依据 | 口腔癌患者的临床基因组数据和单细胞测序数据 | 机器学习 | 口腔癌 | 单细胞测序 | Lasso回归、随机森林、梯度提升机 | 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NA | NA | NA | NA |
| 433 | 2026-07-01 |
Longitudinal single cell RNA-sequencing reveals evolution of micro- and macro-states in chronic myeloid leukemia
2025-May-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.14.653262
PMID:40661452
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序揭示慢性髓系白血病微观与宏观状态的演变 | 建立理论框架解释离散疾病表型在单细胞尺度隐藏但在宏观水平清晰显现的机制，利用状态转移理论揭示细胞类型特异性贡献 | 未明确提及 | 阐明单细胞数据中离散疾病定义状态的形成机制 | 慢性髓系白血病（CML）进展模型 | 自然语言处理 | 白血病 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 434 | 2026-07-01 |
Biological sex affects gene expression and functional variation across the human genome
2025-Apr-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.09.03.24313025
PMID:39281750
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研究论文 | 利用480个淋巴母细胞系单细胞RNA-seq数据，鉴定人类基因组中性别偏倚表达基因及其功能变异 | 首次系统揭示性别对基因表达影响的广泛性，发现1200个性别偏倚基因，并建立核心基因集（21个基因）在多种组织和数据集中一致表达；通过机器学习识别关键转录因子（FOSL1、ZNF730等），发现X染色体数目调控这些因子 | 独立数据集的验证证据较弱，且性别偏倚eQTL复制率有限 | 探究生物性别如何影响人类基因组中的基因表达和功能变异 | 人类淋巴母细胞系及GTEx多组织样本 | 基因组学 | 自身免疫性疾病（如多发性硬化） | 单细胞RNA-seq | 机器学习、线性建模 | 单细胞转录组数据 | 480个淋巴母细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 435 | 2026-07-01 |
Unleashing the Power of Multiomics: Unraveling the Molecular Landscape of Peripheral Neuropathy
2025-04, Annals of clinical and translational neurology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/acn3.70019
PMID:40126913
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综述 | 追踪基因组技术在外周神经病变研究中的演变，强调多组学整合在揭示分子景观中的作用 | 全面分析新兴多组学技术（如RNA测序和蛋白质组学）与传统基因组方法的整合，推动对外周神经病变病理生理学的整体理解 | 多组学技术临床标准化面临挑战，需要稳健指南以最大化临床效用 | 综述基因组技术在外周神经病变中的应用，探索多组学整合对诊断和治疗的意义 | 外周神经病变的分子机制和遗传变异 | 自然语言处理 | 外周神经病变 | NGS, ONT, 单细胞测序, RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 436 | 2026-07-01 |
Spatial Transcriptomics Identifies Immune-Stromal Niches Associated with Cancer in Adult Dermatomyositis
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.19.644147
PMID:40166232
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研究论文 | 通过空间和单细胞转录组学分析，揭示了成人皮肌炎中与癌症相关的免疫-基质微环境 | 首次对成人皮肌炎进行了全面的空间和单细胞转录组学分析，揭示了与癌症相关的免疫和基质细胞微环境，并发现了与癌症相关的DM皮肤病变中的分散免疫浸润特征 | NA | 研究成人皮肌炎中与癌症相关的免疫和基质微环境 | 成人皮肌炎患者皮肤病变组织 | 数字病理学 | 成人皮肌炎 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics, 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 空间转录组学, 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 437 | 2026-07-01 |
A high-resolution view of the immune and stromal cell response to Haemophilus ducreyi infection in human volunteers
2025-03-12, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03885-24
PMID:39882906
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学，高分辨率解析人类志愿者感染杜克雷嗜血杆菌后的免疫与基质细胞反应 | 首次在单细胞水平上定义人类皮肤对细胞外细菌病原体感染的免疫浸润特征，揭示了脓疱形成过程中的细胞类型和空间定位 | NA | 表征人类皮肤感染杜克雷嗜血杆菌后的细胞免疫反应，确定差异表达转录本的细胞来源 | 五名人类志愿者的皮肤活检样本（脓疱和模拟感染伤口） | 数字病理学 | 软下疳（生殖器溃疡疾病） | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | RNA序列数据、空间转录组数据 | 5名志愿者（scRNA-seq），其中4名同时用于空间转录组分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学 |
| 438 | 2026-07-01 |
Single-Cell RNA Sequencing to Guide Autologous Preterm Cord Mesenchymal Stromal Cell Therapy
2025-03, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202403-0569OC
PMID:39586004
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析早产脐带间充质干细胞转录组，指导自体细胞治疗支气管肺发育不良 | 首次利用单细胞RNA测序比较足月与早产脐带间充质干细胞的转录组差异，并关联妊娠并发症对治疗潜力的影响，发现NEGR和NRNX信号通路在治疗性干细胞中的独特作用 | 未明确提及样本量较小对结果普适性的限制，以及体内实验仅使用大鼠模型可能无法完全模拟人类BPD病理 | 探究妊娠相关并发症（先兆子痫和绒毛膜羊膜炎）是否改变脐带间充质干细胞的治疗潜力 | 足月与早产脐带间充质干细胞，以及人新生儿真皮成纤维细胞 | 单细胞转录组学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 5名足月供体、16名早产供体的脐带间充质干细胞，以及人新生儿真皮成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序 | NA | 使用公开新生儿肺单核RNA测序数据 |
| 439 | 2026-07-01 |
Cluster replicability in single-cell and single-nucleus atlases of the mouse brain
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639959
PMID:40060489
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研究论文 | 评估小鼠大脑单细胞和单核图谱中细胞簇的可重复性 | 利用转录组范围邻居投票方法，在两个大型小鼠大脑图谱中识别出2009个相互匹配的细胞簇对，并验证其空间定位和协调基因表达的一致性 | 下丘脑异质性限制了细胞簇的一致性，区分相近细胞簇仍具挑战性 | 确定单细胞RNA测序研究中细胞簇的生物学稳健性与跨研究可重复性 | 两个大型小鼠大脑图谱（单细胞RNA测序和单核RNA测序图谱），涵盖超过400万个细胞和5000多个簇 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过400万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 440 | 2026-07-01 |
SRSF1 Is Crucial for Maintaining Satellite Cell Homeostasis During Skeletal Muscle Growth and Regeneration
2024-12, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13607
PMID:39381961
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研究论文 | 本文揭示了剪接因子SRSF1在骨骼肌生长与再生过程中维持卫星细胞稳态的关键作用 | 首次阐明SRSF1通过调控Fgfr1op2剪接维持有丝分裂纺锤体组织，缺失导致卫星细胞有丝分裂异常、细胞周期阻滞及过早衰老 | 未明确说明研究局限性 | 探究SRSF1缺失影响卫星细胞功能的具体机制及其在肌肉再生中的角色 | 小鼠卫星细胞、C2C12成肌细胞、原代成肌细胞 | 分子生物学 | 肌肉萎缩与肌肉再生障碍 | 单细胞RNA测序、RNA测序、免疫染色、EdU掺入实验 | NA | 基因表达数据、测序数据 | 新生小鼠膈肌单核细胞悬液；每组至少4-10只小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |