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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-06-08 |
Regulatory T cells in vitiligo: a review of functional disequilibrium between peripheral blood and lesional tissue
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1844106
PMID:42233009
|
综述 | 综述白癜风中调节性T细胞在外周血和病变组织之间的功能失衡 | 从系统到局部的解剖学层级角度综合分析了Treg功能失调,并提出了Treg-黑素细胞相互作用网络及新兴生物标志物 | 未详细提及综述方法的具体搜索策略或偏倚评估,实际证据来源尚缺乏系统量化分析 | 综合白癜风中Treg生物学和免疫调节功能的现有证据,重点关注外周血与病变皮肤的对比分析 | 白癜风患者的外周血和病变皮肤中的调节性T细胞 | 自然语言处理 | 白癜风 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 422 | 2026-06-08 |
Single-cell transcriptomics reveals keratinocyte dynamic processes associated with S100a4 expression in psoriasiform dermatitis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1744860
PMID:41660613
|
研究论文 | 利用单细胞转录组学揭示S100a4在银屑病样皮炎中调控角质形成细胞动态过程的机制 | 首次通过S100a4基因敲除小鼠模型结合单细胞RNA测序,揭示了S100a4在银屑病发病中的具体细胞特异性转录调控机制,并发现Klf9介导的Krt15转录失调是角化过度的关键驱动因素 | 未明确提及实验样本量及人类样本验证,机制研究仅在动物模型中进行 | 探究S100a4在银屑病发病中的具体功能及分子机制 | S100a4基因敲除小鼠的银屑病模型角质形成细胞 | 数字病理学 | 银屑病 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明小鼠样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 423 | 2026-06-07 |
Neoplastic CD3⁺ B cells remodel the DLBCL tumor microenvironment via single-cell and spatial transcriptomics
2026-Dec-31, Cancer biology & therapy
IF:4.4Q2
DOI:10.1080/15384047.2026.2684140
PMID:42247321
|
research paper | 通过整合单细胞、单核和空间转录组学数据,构建弥漫性大B细胞淋巴瘤的高分辨率多组学图谱,发现了一群表达CD3的恶性B细胞亚群 | 首次识别出弥漫性大B细胞淋巴瘤中表达CD3的恶性B细胞亚群,并揭示其由BCLAF1、CHURC1、FLI1、NFATC2和ELF2等关键调控基因驱动的遗传回路,以及其在肿瘤微环境重塑和临床预后中的重要作用 | 未明确提及研究局限性 | 构建弥漫性大B细胞淋巴瘤的高分辨率多组学图谱,并探索肿瘤微环境中的细胞异质性和分子机制 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的肿瘤样本 | machine learning | diffuse large B-cell lymphoma | single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | gene expression data | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3' 和 10x Visium 空间转录组学平台 |
| 424 | 2026-06-07 |
Ubiquitination-anchored signature defines neuroendocrine prostate cancer: hub genes and single-cell ecosystem insights from integrated bioinformatics analysis of public transcriptomic datasets
2026-Dec-31, The aging male : the official journal of the International Society for the Study of the Aging Male
DOI:10.1080/13685538.2026.2680719
PMID:42249833
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研究论文 | 通过整合公共转录组数据集,结合生信分析定义泛素化标记基因特征,并揭示其在神经内分泌前列腺癌中的核心基因及单细胞生态系统 | 首次将泛素化失调与神经内分泌前列腺癌谱系可塑性关联,通过整合 bulk 和单细胞转录组数据定义以泛素化为中心的诊断和治疗相关特征及肿瘤微环境回路 | 结果依赖于公共数据集,需在前瞻性收集的临床队列中进行外部验证,缺乏蛋白水平评估 | 定义神经内分泌前列腺癌中的泛素化相关基因特征,并探索其在诊断和治疗中的潜在价值 | 神经内分泌前列腺癌与前列腺腺癌的转录组数据 | 生物信息学 | 神经内分泌前列腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | 共表达网络、蛋白互作网络 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | GEO发现队列49个组织样本;单细胞数据集25,325个细胞 | NA | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2026-06-07 |
Zinc-based metal orchestrates early osteoimmune microenvironment to promote angiogenesis via macrophage-derived extracellular vesicles
2026-Nov, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 探究锌基金属通过巨噬细胞来源的细胞外囊泡调控早期骨免疫微环境以促进血管生成的机制 | 首次揭示锌基金属通过巨噬细胞来源的细胞外囊泡介导的免疫调控促进血管生成的新机制,并利用单细胞RNA测序鉴定关键细胞亚群 | 未提及具体局限性,但可能包括机制验证的体内模型限制或临床转化挑战 | 阐明锌基金属在骨再生过程中如何通过免疫调节影响血管生成 | 巨噬细胞来源的细胞外囊泡及其与内皮细胞的相互作用 | 机器学习 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 426 | 2026-06-07 |
Targeting dysregulated glycolysis in type 2 diabetic osteoporosis: Identification of a diagnostic gene signature and therapeutic validation of calcifediol
2026-Sep-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2026.124473
PMID:42184924
|
研究论文 | 本文结合生物信息学和实验验证,识别了2型糖尿病性骨质疏松症中与糖酵解相关的八个关键诊断基因,并验证了骨化二醇(calcifediol)的治疗潜力 | 通过整合多种转录组数据、机器学习和单细胞RNA测序分析,首次鉴定出ATN1等八个糖酵解相关基因作为T2DOP的诊断生物标志物,并发现骨化二醇可能同时改善糖尿病高血糖和骨质疏松 | 骨化二醇的临床价值需在后续研究中进一步验证 | 探究2型糖尿病性骨质疏松症中糖酵解相关基因的作用,并鉴定诊断标志物和潜在治疗药物 | 2型糖尿病性骨质疏松症患者及小鼠模型的组织样本和数据 | 机器学习 | 2型糖尿病性骨质疏松症 | RNA-seq、单细胞RNA测序 | WGCNA、机器学习(113种算法) | 转录组数据、单细胞转录组数据 | 合并的骨质疏松症和2型糖尿病数据集,以及T2D小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 427 | 2026-06-07 |
Integrative multi-omics and experimental validation reveal UBE2C as a central hub gene and prognostic biomarker in hepatocellular carcinoma
2026-Aug-15, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116866
PMID:42155390
|
研究论文 | 通过整合多组学数据和实验验证,揭示UBE2C在肝细胞癌中作为关键枢纽基因和预后生物标志物的作用 | 首次结合空间转录组学、单细胞转录组学和免疫微环境分析,全面阐明UBE2C在肝细胞癌免疫景观中的作用及其与免疫治疗反应的相关性 | 未提及具体局限性 | 探索UBE2C在肝细胞癌中的表达模式、功能作用及作为预后生物标志物的潜力 | 肝细胞癌肿瘤组织、细胞系及皮下肿瘤模型 | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 定量逆转录PCR, 免疫印迹 | Cox回归模型 | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | TCGA, GEO, CPTAC数据库中的肝细胞癌样本(未具体说明数量) | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 428 | 2026-06-07 |
Immune dysregulation and cellular dysfunction mediate di-n-pentyl phthalate-induced hepatotoxicity: Insights from single-cell RNA sequencing
2026-Aug, Food and chemical toxicology : an international journal published for the British Industrial Biological Research Association
IF:3.9Q1
DOI:10.1016/j.fct.2026.116114
PMID:42061636
|
research paper | 采用单细胞RNA测序技术研究邻苯二甲酸二正戊酯(DNPP)诱导小鼠肝毒性的机制 | 首次利用单细胞RNA测序揭示DNPP通过破坏免疫稳态和损伤细胞功能导致肝毒性的分子机制 | NA | 探究DNPP诱导肝毒性的潜在机制 | 小鼠肝脏组织 | NA | 肝毒性 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、定量实时PCR | NA | RNA表达数据 | DNPP暴露小鼠模型 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 429 | 2026-06-07 |
Loss of foxp3a drives sex-specific immune-metabolic remodeling across the gut-liver-gonad axis in zebrafish
2026-Aug, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2026.111461
PMID:42214511
|
研究论文 | 利用foxp3a缺陷斑马鱼模型,研究foxp3a缺失如何沿肠-肝-性腺轴驱动性别特异性免疫-代谢重塑 | 首次揭示foxp3a在斑马鱼中作为哺乳动物FOXP3的功能同源物,并系统阐明其沿肠-肝-性腺轴的性别二态性免疫-代谢协调机制 | 未明确说明 | 探讨foxp3a在性别特异性黏膜免疫调节中的作用及其对多器官免疫-代谢过程的协调机制 | foxp3a缺陷斑马鱼模型及其肠道、肝脏、性腺和肠道微生物组 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 多组学整合分析 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 微生物组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 430 | 2026-06-07 |
Single-Cell RNA-Sequencing of Soybean Reveals Transcriptional Changes and Antiviral Functions of GmGSTU23 and GmGSTU24 in Response to Soybean Mosaic Virus
2026-Jul, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15164
PMID:39301882
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序构建大豆响应大豆花叶病毒感染的转录图谱,并发现GmGSTU23和GmGSTU24的抗病毒功能 | 首次在单细胞分辨率下解析大豆对SMV感染的转录网络变化,并鉴定出两个具有抗病毒功能的GSTU基因 | 未明确说明 | 揭示大豆在SMV感染下转录网络的变化机制,并鉴定参与抗病毒反应的GSTU基因 | 大豆(Glycine max)叶片原生质体及本氏烟瞬时表达系统 | 机器学习 | 植物病毒病(大豆花叶病毒) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 50,294个原生质体(来自SMV感染和模拟接种的大豆新叶) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 431 | 2026-06-07 |
STCF: Multi-View Clustering for Spatial Transcriptomics Based on Cross-View Fusion
2026-Jul, IEEE transactions on pattern analysis and machine intelligence
IF:20.8Q1
DOI:10.1109/TPAMI.2026.3665779
PMID:41701605
|
研究论文 | 提出了一种基于交叉视图融合的空间转录组学多视图聚类框架STCF,通过融合高变基因和低变基因表达视图提升空间域识别精度 | 首次将高变基因和低变基因作为两个独立的表达视图,通过反向缩放余弦误差损失实现对齐与分离的平衡,采用即插即用的交叉视图融合策略增强鲁棒表示学习 | 未明确指出方法在非灵长类组织或大样本数据的泛化能力,可能依赖预设基因子集的划分方式 | 开发一种能够有效融合不同全局变异水平基因信息以提升空间域识别精度的聚类方法 | 空间转录组数据中的组织空间域(包括DLPFC、HBC、MBA三个基准数据集) | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 交叉视图融合网络(含反向缩放余弦误差损失) | 空间转录组基因表达数据 | 三个基准数据集(DLPFC、HBC、MBA),具体样本量未说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 432 | 2026-06-07 |
Targeting BATF: A new strategy for cancer immunotherapy
2026-Jul, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189579
PMID:41866089
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综述 | 本文综述了BATF转录因子在抗肿瘤免疫治疗中作为新靶点的研究进展,重点介绍了BATF在CD8 T细胞发育和耗竭中的作用及其潜在应用 | 首次系统阐述了BATF在T细胞耗竭过程中的关键作用及其与PD-1的正反馈机制,提出靶向BATF可能成为增强T细胞抗肿瘤能力的新策略 | BATF作为治疗靶点研究中仍存在一些未解决的矛盾和挑战,其具体作用机制和临床应用还需进一步探索 | 总结BATF作为新靶点在抗肿瘤免疫治疗中的研究进展,为改善免疫治疗效果提供新思路 | BATF转录因子、CD8 T细胞 | machine learning | 癌症 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2026-06-07 |
Mapping the immune landscape of PCa: From tumor microenvironment to therapeutics
2026-Jul, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189586
PMID:41956336
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综述文章 | 整合单细胞与空间转录组学数据,解码前列腺癌肿瘤微环境的免疫图谱,并提出免疫治疗新策略 | 首次提出并强调‘神经-免疫-微生物组’三角调控网络在前列腺癌免疫抑制中的作用,并系统解析TREM2+巨噬细胞介导的代谢共生驱动疾病进展的机制 | 现有数据主要基于公开数据集,缺乏前瞻性临床验证;神经-免疫-微生物组轴的具体分子机制仍需进一步实验证实 | 系统描绘前列腺癌肿瘤微环境的免疫景观,为精准肿瘤学中‘生态编辑’策略提供理论基础 | 前列腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞、神经细胞、微生物及代谢物 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE |
| 434 | 2026-06-07 |
Analysis of B cell dynamic changes and pivotal drivers based on single-cell transcriptome of peripheral blood in sepsis
2026-Jul, Blood cells, molecules & diseases
DOI:10.1016/j.bcmd.2026.103009
PMID:42184475
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研究论文 | 基于外周血单细胞转录组分析脓毒症中B细胞的动态变化及关键驱动因子 | 首次整合多个GEO数据集进行单细胞B细胞轨迹分析,识别出六种具有强诊断潜力的枢纽基因(DDX17、SLC2A3、RPS4X、PCBP2、S100A9、PFDN5),并揭示脓毒症中B细胞组成及分化路径的显著变化 | NA | 探讨脓毒症中B细胞的动态分化机制及关键调控因子,并筛选用于诊断和靶向治疗的潜在生物标志物 | 脓毒症患者的外周血B细胞 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | XGBoost, LASSO | 单细胞转录组数据 | 四个GEO数据集,包含健康对照和脓毒症患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 435 | 2026-06-07 |
Tumor immune microenvironment in cervical cancer: Histological subtype-specific immune landscapes and therapeutic implications
2026-Jul, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2026.189581
PMID:41932455
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综述 | 综述了宫颈癌不同组织学亚型的肿瘤免疫微环境特征,包括免疫细胞组成、基质结构和代谢影响,并探讨了亚型特异性治疗策略 | 首次系统总结宫颈癌不同组织学亚型(如鳞状细胞癌、腺癌等)的免疫微环境异质性,揭示其免疫细胞组成、基质结构和代谢影响的差异,为亚型特异性免疫治疗提供依据 | 未提供实验数据验证,主要基于现有研究的综述性总结,缺乏对免疫微环境动态变化的深入分析 | 整合宫颈癌主要组织学亚型的免疫特征,支持更精细和亚型特异性的治疗策略 | 宫颈癌的肿瘤免疫微环境,包括免疫细胞、基质结构和代谢因素 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、蛋白质组学 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium FFPE空间转录组学 |
| 436 | 2026-06-07 |
Recent advances in multimodal approaches for investigating placental development and related diseases
2026-Jun-12, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.05.004
PMID:40374418
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综述 | 综述了结合先进影像学、单细胞与空间组学及人工智能的多模态方法在胎盘发育及相关疾病研究中的最新进展 | 系统总结了多模态方法在胎盘研究中的应用,特别是中国研究团队开发的新平台、图谱和临床工具,并强调了人工智能与可穿戴技术在未来精准产科中的潜力 | 当前挑战包括数据标准化、人工智能模型的可解释性及伦理问题 | 评述多模态方法在胎盘发育和疾病研究中的最新进展,并展望未来发展方向 | 胎盘发育和相关疾病(如先兆子痫、胎儿生长受限、胎盘植入谱系障碍) | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | NA | NA | 影像数据、单细胞数据、空间组学数据 | NA | NA | 单细胞转录组学、空间组学 | NA | NA |
| 437 | 2026-06-07 |
Single cell and spatial atlas of macrophage and astrocyte interactions in glioblastoma
2026-Jun-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05289-2
PMID:42249233
|
研究论文 | 通过单细胞和空间分析技术揭示胶质母细胞瘤中巨噬细胞与星形胶质细胞样细胞的相互作用图谱 | 首次结合单细胞RNA测序和空间重建技术,系统解析胶质母细胞瘤中巨噬细胞与星形胶质细胞样细胞亚群间的特异性信号网络(如APP-CD74通路),并鉴定与不良预后相关的关键亚群 | 样本量较小(仅10例患者),且未进行功能验证实验来确认信号通路的因果关系 | 阐明胶质母细胞瘤中巨噬细胞与星形胶质细胞样细胞间的细胞互作机制及临床意义 | 10例胶质母细胞瘤患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例胶质母细胞瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 438 | 2026-06-07 |
Single-cell immunoprofiling reveals a dysfunctional-like immune microenvironment and malignant phenotype in aging penile squamous cell carcinoma
2026-Jun-06, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10212-0
PMID:42249992
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研究论文 | 通过单细胞免疫分析揭示衰老阴茎鳞状细胞癌中功能失调的免疫微环境和恶性表型 | 首次系统揭示衰老对阴茎鳞状细胞癌(PSCC)的影响,鉴定出衰老相关肿瘤细胞亚群及其恶性特征,并发现IL1B可作为PSCC的潜在预后标志物 | 样本量较小(仅2例非老年和3例老年PSCC样本) | 探索衰老对阴茎鳞状细胞癌免疫微环境和肿瘤表型的影响 | 非老年(2例)和老年(3例)阴茎鳞状细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 单细胞组学 | 阴茎鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单细胞TCR测序(scTCR-seq)、免疫组化、免疫荧光、Masson染色、β-半乳糖苷酶染色、流式细胞术 | NA | 单细胞基因表达数据、TCR序列数据、组织图像 | 5份阴茎鳞状细胞癌样本(2例非老年,3例老年) | NA | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 439 | 2026-06-07 |
Machine learning methods identified cellular senescence-related hub molecules in sepsis-induced acute respiratory distress syndrome (ARDS) and their upstream regulatory network
2026-Jun-06, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-026-12109-x
PMID:42250009
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研究论文 | 运用机器学习方法识别脓毒症诱发的急性呼吸窘迫综合征中细胞衰老相关的核心分子及其上游调控网络 | 首次通过多种机器学习方法系统鉴定脓毒症相关ARDS中细胞衰老相关的核心分子,并验证其在上游调控网络中的角色 | 部分hub分子在qRT-PCR中未验证出显著差异表达 | 探索细胞衰老相关基因在脓毒症诱发的ARDS中的作用,并鉴定核心分子及上游调控网络 | 脓毒症诱发的急性呼吸窘迫综合征(ARDS)患者及小鼠模型 | 机器学习 | 脓毒症诱发的急性呼吸窘迫综合征 | RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR | 机器学习(共识聚类、多种算法) | 基因表达数据 | 在线数据库数据及小鼠模型样本 | NA | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 440 | 2026-06-07 |
Omics-driven strategies for identifying biomarkers in Alzheimer's disease
2026-Jun-06, Metabolic brain disease
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11011-026-01873-1
PMID:42250049
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综述 | 本文综述了组学技术在阿尔茨海默病生物标志物发现中的应用,特别是代谢组学与多组学整合方法如何提高诊断特异性和精准医学潜力 | 提出了以代谢紊乱为中心的AD生物标志物发现范式,强调脑葡萄糖低代谢、胰岛素抵抗等代谢功能障碍在发病机制中的核心地位,而非次要因素,并展示了多组学整合如何增强生物标志物特异性和预测能力 | 数据整合、可重复性和临床转化方面仍然存在重要挑战 | 探索组学驱动策略在阿尔茨海默病生物标志物发现中的应用,特别是整合多组学方法在精准医学中的价值 | 阿尔茨海默病患者的基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组和代谢组学数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、单细胞RNA测序、空间转录组学、质谱分析 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |