单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
421	2025-05-16	Combined analysis of single-cell and bulk transcriptome sequencing data identifies critical glycolysis genes in idiopathic pulmonary arterial hypertension 2025-Mar-26, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06373-x PMID:40140873	研究论文	本研究通过结合单细胞和批量转录组测序数据，识别了特发性肺动脉高压（IPAH）中关键的糖酵解基因	首次通过整合单细胞和批量转录组数据分析，识别了IPAH中与糖酵解相关的关键调控基因IGF1、KARS、CASP3和CDKN2A	研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分仅使用了MCT诱导的大鼠PH模型	探究IPAH中糖酵解的关键调控机制	特发性肺动脉高压（IPAH）患者组织样本和大鼠PH模型	生物信息学	肺动脉高压	单细胞测序、批量转录组测序、scMetabolism分析、AUCcell分析、ssGSEA方法、WGCNA、PPI网络分析	MCT诱导的大鼠PH模型	转录组数据	来自GEO数据库的IPAH患者组织样本数据和大鼠PH模型
422	2025-05-16	Spatiotemporal profiling of adhesion G protein-coupled receptors in developing mouse and human pancreas reveals a role for GPR56 in islet development 2025-Mar-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-025-05659-z PMID:40137991	研究论文	本研究通过时空分析揭示了粘附G蛋白偶联受体（aGPCRs）在小鼠和人类胰腺发育中的表达模式，并探讨了GPR56在胰岛发育中的作用	首次系统性地描述了aGPCRs在胰腺发育中的动态表达模式，并确定了GPR56在β细胞增殖和胰岛发育中的关键作用	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限	探究aGPCRs在胰腺内分泌谱系决定中的作用	发育中的小鼠和人类胰腺	发育生物学	糖尿病	单细胞RNA测序、空间转录组学、qPCR分析	Gpr56基因敲除小鼠模型	RNA测序数据、基因表达数据	小鼠模型和不同妊娠阶段的人类胰腺样本
423	2025-05-16	Identification and characterization of human retinal stem cells capable of retinal regeneration 2025-Mar-26, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adp6864 PMID:40138453	研究论文	本文通过单细胞多组学和空间转录组学技术，鉴定并表征了人视网膜中具有再生潜力的干细胞亚群——人神经视网膜干细胞样细胞（hNRSCs）	首次在人类胎儿视网膜中发现并表征了hNRSCs，证明其具有自我更新和分化潜能，并验证了其在视网膜退行性疾病模型中的治疗潜力	研究主要基于胎儿视网膜和视网膜类器官，在成人视网膜中的存在和功能需要进一步验证	鉴定和表征人类视网膜干细胞，探索其在视网膜再生医学中的应用潜力	人类胎儿视网膜、视网膜类器官（hROs）和rd10视网膜色素变性小鼠模型	再生医学	视网膜色素变性	单细胞多组学、空间转录组学	NA	单细胞转录组数据、空间转录组数据	人类胎儿视网膜样本和视网膜类器官
424	2025-05-16	Single-cell RNA sequencing reveals an IL1R2+Treg subset driving immunosuppressive microenvironment in HNSCC 2025-Mar-25, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-025-04015-1 PMID:40131478	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究发现了一种IL1R2+Treg亚群在头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中促进肿瘤进展，并验证了其临床诊断价值及潜在的治疗策略	首次鉴定出IL1R2+Treg亚群在HNSCC中的免疫抑制作用，并探索了联合靶向IL1R2和CTLA4的抗肿瘤效果	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化效果尚需进一步验证	探究不同Treg亚群对HNSCC肿瘤微环境的影响及潜在治疗策略	头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）中的调节性T细胞（Tregs）	肿瘤免疫学	头颈部鳞状细胞癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、组织微阵列（TMA）、酶联免疫吸附试验（ELISA）	NA	单细胞RNA测序数据、组织样本数据、血清样本数据	NA
425	2025-05-16	DNA methylation-regulated HLA-C expression modulates immune responses and metabolic alterations to influence prognosis in mesothelioma 2025-Mar-25, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-025-04012-4 PMID:40131544	research paper	该研究探讨了DNA甲基化调控的HLA-C表达如何通过影响免疫反应和代谢变化来调节间皮瘤的预后	首次全面研究了HLA-C在间皮瘤中的具体作用，并揭示了DNA甲基化如何调控HLA-C表达进而影响疾病预后	研究主要基于TCGA数据库的间皮瘤队列，可能需要更多独立队列验证	阐明HLA-C在间皮瘤进展中的作用及其调控机制	间皮瘤肿瘤微环境中的免疫细胞和代谢过程	肿瘤免疫学	间皮瘤	单细胞RNA测序、表达数量性状位点(eQTL)分析、孟德尔随机化(MR)分析	NA	基因组数据、转录组数据、表观遗传数据	TCGA间皮瘤队列数据，涉及91种炎症细胞因子、731个免疫细胞群体、91种血细胞类型和1400种代谢物
426	2025-05-16	Single-cell sequencing combined with urinary multi-omics analysis reveals that the non-invasive biomarker PRDX5 regulates bladder cancer progression through ferroptosis signaling 2025-Mar-24, BMC cancer IF:3.4Q2 DOI:10.1186/s12885-025-13881-y PMID:40122834	研究论文	本研究通过单细胞测序和尿液多组学分析揭示了非侵入性生物标志物PRDX5通过铁死亡信号调控膀胱癌进展的机制	首次结合单细胞RNA测序和尿液多组学数据，揭示了PRDX5通过调节ROS水平和铁死亡通路促进膀胱癌进展的新机制	研究主要基于体外和动物实验，临床样本验证有限	阐明PRDX5在膀胱癌中的表达特征及其通过铁死亡信号通路调控肿瘤进展的生物学意义	膀胱癌组织和细胞	数字病理学	膀胱癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、尿液蛋白质组学、转录组分析	NA	蛋白质组数据、转录组数据、单细胞测序数据	TCGA数据库膀胱癌组织样本及实验细胞系
427	2025-05-16	Intranasal prime-boost RNA vaccination elicits potent T cell response for lung cancer therapy 2025-Mar-24, Signal transduction and targeted therapy IF:40.8Q1 DOI:10.1038/s41392-025-02191-1 PMID:40122855	研究论文	研究开发了一种利用环状RNA封装在脂质纳米颗粒中的非侵入性鼻内癌症疫苗，以诱导局部黏膜免疫反应	提出了一种新型鼻内RNA疫苗策略，通过黏膜途径诱导强效T细胞反应，同时减轻静脉RNA疫苗接种常见的全身不良反应	研究仅在临床前肺癌模型中进行，尚未进行人体试验	开发针对黏膜恶性肿瘤的RNA疫苗新方法	肺癌模型	癌症免疫治疗	肺癌	RNA疫苗技术、单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	临床前肺癌模型（具体数量未提及）
428	2025-05-16	Unveiling the role of PPIF and macrophage subtypes in LSCC progression via single-cell and exosome RNA sequencing 2025-Mar-24, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-93584-3 PMID:40128571	研究论文	通过单细胞和外来体RNA测序揭示PPIF和巨噬细胞亚型在LSCC进展中的作用	首次揭示了PPIF在Macrophage-C1-C1QC细胞中的上调与其抗炎表型增强及F11R-F11R信号传导促进的关系，为LSCC的治疗提供了新的潜在靶点	研究未涉及PPIF在LSCC中的具体作用机制，需要进一步的实验验证	研究LSCC肿瘤微环境中的细胞异质性及其在LSCC进展中的作用	喉鳞状细胞癌(LSCC)组织和肿瘤微环境中的细胞	数字病理学	喉癌	单细胞RNA测序, 外来体RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量
429	2025-05-16	Prognostic and immunological implications of protein kinases in gastric cancer: a focus on hub gene ABL2 and its impact on the polarization of M2 macrophages 2025-Mar-24, Biology direct IF:5.7Q1 DOI:10.1186/s13062-025-00636-9 PMID:40128818	research paper	该研究通过分析胃癌患者的蛋白激酶转录谱，发现了一种新的分子亚型，并构建了一个基于差异表达激酶基因的预后模型，探讨了ABL2基因在M2巨噬细胞极化中的作用	首次基于差异表达激酶基因构建了胃癌预后模型，并发现ABL2基因在调控M2巨噬细胞极化中的关键作用	研究主要基于生物信息学分析，实验验证部分相对有限	探索蛋白激酶在胃癌中的预后价值和免疫调节机制	胃癌患者和胃癌细胞系	肿瘤免疫学	胃癌	转录组测序、scRNA-seq分析、TIMER算法、体外实验	机器学习算法组合构建的DE-KGsM模型	转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床数据	来自GEO和TCGA数据库的胃癌患者样本
430	2025-05-16	Dietary emulsifier carboxymethylcellulose-induced gut dysbiosis and SCFA reduction aggravate acute pancreatitis through classical monocyte activation 2025-Mar-24, Microbiome IF:13.8Q1 DOI:10.1186/s40168-025-02074-1 PMID:40128912	研究论文	该研究探讨了食品乳化剂羧甲基纤维素（CMC）通过肠道菌群失调和短链脂肪酸减少加剧急性胰腺炎（AP）的机制，并提出了可能的缓解策略	首次揭示了CMC通过肠道菌群失调和单核细胞活化加剧AP的机制，并提出Akkermansia muciniphila或丁酸盐补充作为潜在治疗途径	研究主要在动物模型中进行，人类数据仅涉及相关性分析	探究CMC对急性胰腺炎的影响及其机制	C57BL/6小鼠和AP患者	消化系统疾病研究	急性胰腺炎	16S rRNA基因扩增子测序、单细胞RNA测序、粪便微生物移植（FMT）	动物模型（小鼠）	分子免疫参数、微生物组数据、单细胞测序数据	未明确说明小鼠数量，包含AP患者样本
431	2025-05-16	Enhancing TREM2 expression activates microglia and modestly mitigates tau pathology and neurodegeneration 2025-Mar-23, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1 DOI:10.1186/s12974-025-03420-8 PMID:40122810	research paper	该研究探讨了TREM2在tau病理和神经退行性变中的作用，并评估了增强TREM2表达对微胶质细胞激活的影响	研究发现增强TREM2-WT表达可适度降低可溶性磷酸化tau蛋白水平并轻微保护神经元完整性，而TREM2-R47H过表达则表现出功能丧失表型	研究仅使用了PS19 tauopathy小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探究TREM2在tau病理和神经退行性变中的作用及其作为治疗靶点的潜力	PS19 tauopathy小鼠模型	神经科学	阿尔茨海默病	单细胞RNA测序	PS19 tauopathy小鼠模型	RNA测序数据	NA
432	2025-05-16	NCKAP1 Inhibits the Progression of Renal Carcinoma via Modulating Immune Responses and the PI3K/AKT/mTOR Signaling Pathway 2025-Mar-20, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26062813 PMID:40141455	研究论文	本研究探讨了NCKAP1在肾癌中的免疫调节和肿瘤进展中的具体作用	首次揭示了NCKAP1通过调节免疫反应和PI3K/AKT/mTOR信号通路抑制肾癌进展的机制	研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证	探索NCKAP1在肾癌中的功能及其作为预测标志物和治疗靶点的潜力	肾癌患者样本和769P肾癌细胞系	癌症研究	肾癌	RNA测序、ssGSEA、单细胞RNA测序、CIBERSORT分析	NA	基因表达数据、单细胞数据	多种癌症类型的患者样本和769P细胞系
433	2025-05-16	Pulmonary Myeloid Cells in Mild Cases of COVID-19 Upregulate the Intracellular Fc Receptor TRIM21 and Transcribe Proteasome-Associated Molecules 2025-Mar-19, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26062769 PMID:40141410	research paper	该研究通过单细胞RNA测序技术分析了轻度和重度COVID-19患者支气管肺泡灌洗液中的细胞群体，重点研究了TRIM21及其下游信号分子的转录情况	揭示了TRIM21在轻度COVID-19患者髓系细胞中的上调表达及其通过蛋白酶体途径减少病毒载量的潜在保护机制	研究仅基于转录组数据，缺乏蛋白质水平和功能验证	探究COVID-19患者肺部免疫细胞中Fc受体TRIM21的表达模式及其在病毒感染中的作用	健康人群和COVID-19患者（轻度和重度）的支气管肺泡灌洗液样本	免疫学	COVID-19	scRNA-seq	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量，包含健康人群、轻度COVID-19患者和重度COVID-19患者三类
434	2025-05-16	Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data Reveal a Novel Prognostic Signature of Combining Cuproptosis- and Ferroptosis-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma 2025-Mar-19, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26062779 PMID:40141422	研究论文	通过整合分析批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，研究铜死亡和铁死亡相关基因在肝细胞癌中的预后特征	首次构建了基于铜死亡和铁死亡相关基因的评分模型，并揭示了其与免疫特征、药物敏感性和单细胞特征的关联	研究依赖于公共数据集，未进行实验验证	探索铜死亡和铁死亡相关基因在肝细胞癌预后和治疗中的作用	肝细胞癌患者	生物信息学	肝细胞癌	RNA测序（批量RNA测序和单细胞RNA测序）	CFRG评分模型、PCA、WGCNA	基因表达数据	未明确说明样本数量
435	2025-05-16	Diverse Subsets of γδT Cells and Their Specific Functions Across Liver Diseases 2025-Mar-19, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26062778 PMID:40141420	research paper	该文章探讨了γδT细胞在多种肝脏疾病中的功能多样性和调控机制	利用高通量单细胞测序和空间转录组学揭示了γδT细胞亚群（特别是Vδ1和Vδ2）的显著异质性及其在肝脏疾病中的不同免疫作用	γδT细胞的功能多样性和调控机制尚未完全理解	研究γδT细胞在肝脏疾病中的功能多样性和调控机制，探索其治疗潜力	γδT细胞及其亚群（Vδ1、Vδ2、γδT17等）	免疫学	肝脏疾病（病毒性肝炎、非酒精性脂肪肝病、酒精性肝病、肝纤维化、自身免疫性肝病和肝细胞癌）	高通量单细胞测序、空间转录组学	NA	单细胞测序数据、转录组数据	NA
436	2025-05-16	Inflammatory Transformation of Skin Basal Cells as a Key Driver of Cutaneous Aging 2025-Mar-14, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26062617 PMID:40141258	研究论文	本研究通过单细胞测序、转录组学和面部衰老相关的全基因组关联研究（GWAS）数据，全面调查了皮肤衰老过程中角质形成细胞亚群的异质性和发育轨迹	识别了基底细胞分化的两条不同路径，并揭示了衰老过程中IFI27细胞比例的增加及其炎症和免疫调节信号的活跃性	NA	揭示皮肤衰老的复杂细胞和分子机制，为新的诊断方法和治疗干预提供潜在靶点	角质形成细胞亚群（基底细胞、棘细胞和IFI27角质形成细胞）	生物医学研究	皮肤衰老	单细胞测序、转录组学、GWAS	NA	基因组数据、转录组数据	NA
437	2025-05-16	Single-Cell Analysis of Molecular Mechanisms in Rapid Antler Osteogenesis During Growth and Ossification Stages 2025-Mar-14, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26062642 PMID:40141284	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，全面分析了梅花鹿鹿角在生长和骨化阶段的快速成骨分子调控机制	首次在单细胞水平上揭示了鹿角生长和骨化阶段的基因表达模式及细胞间动态相互作用	研究仅针对梅花鹿鹿角，结果可能不适用于其他哺乳动物的骨再生过程	探究哺乳动物中唯一可完全再生骨组织（鹿角）的快速成骨分子机制	梅花鹿鹿角在生长和骨化阶段的细胞类型及其分子特征	单细胞组学	骨质疏松症	单细胞RNA测序（scRNA-seq），bulk RNA测序	NA	基因表达数据	梅花鹿鹿角在生长和骨化阶段的多种细胞类型（8种主要细胞类型及其亚群）
438	2025-05-16	Novel cell-to-cell communications between macrophages and fibroblasts regulate obesity-induced adipose tissue fibrosis 2025-03-10, Diabetes IF:6.2Q1 DOI:10.2337/db24-0762 PMID:40063503	研究论文	本研究探讨了巨噬细胞与成纤维细胞之间的细胞间通讯如何调节肥胖诱导的脂肪组织纤维化	发现了表达Mincle的巨噬细胞亚群，并揭示了其通过分泌Osm调节脂肪组织纤维化的新机制	研究主要基于小鼠模型，人类数据相关性仍需进一步验证	阐明肥胖条件下脂肪组织纤维化的细胞间通讯机制	饮食诱导肥胖小鼠的脂肪组织	细胞生物学	肥胖	单细胞转录组分析、空间转录组学	NA	转录组数据	饮食诱导肥胖小鼠模型及人类肥胖脂肪组织样本
439	2025-05-16	Impact of Peripheral Inflammation on Blood-Brain Barrier Dysfunction and Its Role in Neurodegenerative Diseases 2025-Mar-09, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26062440 PMID:40141084	综述	探讨外周炎症对血脑屏障功能障碍的影响及其在神经退行性疾病中的作用	强调了肠-脑轴在血脑屏障完整性中的关键作用，以及肠道菌群失调和慢性炎症通过免疫和代谢途径对屏障破坏的贡献	关于血脑屏障功能障碍的精确机制仍存在关键知识空白	研究外周炎症、肠道菌群和血脑屏障功能障碍之间的分子机制，及其在神经退行性疾病中的作用	血脑屏障、外周炎症、肠道菌群、神经退行性疾病	神经科学	阿尔茨海默病、帕金森病	单细胞转录组学、器官芯片模型	NA	文献数据	涵盖2015年至2025年的出版物
440	2025-05-16	Role of Galactosylceramide Metabolism in Satellite Glial Cell Dysfunction and Neuron-Glia Interactions in Painful Diabetic Peripheral Neuropathy 2025-Mar-07, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14060393 PMID:40136642	研究论文	本研究探讨了半乳糖神经酰胺（GalCer）在糖尿病周围神经病变（DPN）进展过程中卫星胶质细胞（SGCs）功能障碍和神经元-胶质细胞相互作用中的作用	首次揭示了GalCer代谢在SGC功能障碍和神经元-胶质细胞相互作用中的核心作用，并提出了GalCer代谢作为潜在治疗靶点	研究基于大鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探究GalCer在糖尿病周围神经病变（DPN）进展中的作用机制	卫星胶质细胞（SGCs）和神经元-胶质细胞相互作用	神经科学	糖尿病周围神经病变	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、靶向质谱分析、免疫荧光分析	NA	基因表达数据、质谱数据、图像数据	使用PDPN大鼠模型