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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-05-08 |
Prognostic Role of Uric Acid-Related Gene Signatures in Glioblastoma Multiforme: Insights from Bulk RNA and Single-Cell RNA Sequencing
2026-Apr-20, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18081297
PMID:42073621
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研究论文 | 基于尿酸相关基因在多形性胶质母细胞瘤中构建预后风险模型,并利用批量RNA和单细胞RNA测序揭示其免疫微环境特征 | 首次从尿酸相关基因角度构建GBM预后模型,结合批量RNA和单细胞RNA测序揭示树突状细胞、巨噬细胞和T细胞等关键细胞亚群与尿酸基因表达的关联 | 未提及外部验证队列或实验验证,依赖公开数据库且样本量有限 | 阐明尿酸驱动机制在GBM风险分层和治疗脆弱性中的作用 | TCGA和GEO数据库中的多形性胶质母细胞瘤转录组数据及单细胞数据集GSE162631 | 机器学习 | 多形性胶质母细胞瘤 | RNA-seq | LASSO回归 | 基因表达数据 | TCGA和GEO数据库中的GBM样本(具体数量未提及)以及GSE162631单细胞数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 422 | 2026-05-08 |
Multimodal Single-Cell Transcriptomic and Chromatin Accessibility Profiling Reveals Monocyte-Derived Macrophage Dynamics Following Ischemic Stroke
2026-Apr-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083657
PMID:42074294
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研究论文 | 通过单细胞转录组和染色质可及性分析揭示缺血性卒中后单核细胞来源巨噬细胞的动态变化 | 鉴定出应激反应性单核细胞来源巨噬细胞(MDM)亚群,并揭示其向溶酶体富集MDM功能状态的转变轨迹 | 研究局限于小鼠模型和卒中后48小时时间点,人类卒中后期MDM动态变化尚未探索 | 解析缺血性卒中后单核细胞来源巨噬细胞(MDM)的异质性和表型转变 | 小鼠大脑中的巨噬细胞谱系细胞 | 神经科学、单细胞组学 | 缺血性卒中 | scRNA-seq、scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据、单细胞染色质可及性数据 | 小鼠脑组织样本:卒中模型组和假手术对照组 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 用于scRNA-seq,10x Chromium Single Cell ATAC用于scATAC-seq |
| 423 | 2026-05-08 |
An Integrative Network Analysis Framework for Identifying Altered Glycosylation Pathways Associated with Autism Spectrum Disorder
2026-Apr-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040486
PMID:42074604
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研究论文 | 开发整合转录组和网络分析框架研究自闭症谱系障碍中糖基化通路改变及其功能关联 | 首次系统性地利用转录组和网络分析框架,结合公开数据集的批量及单细胞RNA测序数据,研究自闭症中糖基化相关基因的表达变化及其与免疫和神经发育通路的互作 | 依赖公开数据集的可用性和质量,可能限制发现的特异性和可重复性 | 探究糖基化通路在自闭症谱系障碍病理生理学中的作用 | 自闭症谱系障碍患者脑和血液组织中的糖基化相关基因表达变化 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍 | RNA-seq | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 424 | 2026-05-08 |
Spatial Dynamics Links PD-L1 and Tumor-Associated Macrophage-Enriched Niches to Immune and Mesenchymal States in Microsatellite-Stable Colorectal Cancer
2026-Apr-18, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18081288
PMID:42073611
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研究论文 | 探索微卫星稳定结直肠癌中PD-L1表达与肿瘤相关巨噬细胞富集微环境对免疫和间充质状态的影响 | 首次在微卫星稳定结直肠癌中通过空间转录组学揭示PD-L1表达与免疫激活状态及间充质主导状态之间的关联,并指出PD-L1阴性肿瘤中上皮-间充质转化相关程序在巨噬细胞富集的基质微环境中占主导地位 | 样本仅为254例局部错配修复能力完好的结直肠癌病例,属于探索性分析,且未涉及功能性验证实验 | 识别微卫星稳定结直肠癌中与预后相关的免疫细胞成分,并探究其与RNA表达谱及高分辨率空间转录组特征的差异 | 254例局部错配修复能力完好的结直肠癌病例的肿瘤组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学, 批量RNA表达分析 | NA | 空间转录组数据, 批量RNA表达数据 | 254例局部错配修复能力完好的结直肠癌病例 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台用于高分辨率空间基因表达分析 |
| 425 | 2026-05-08 |
Single-Cell Transcriptomic Profiling of Ectopic ACTH-Secreting Pheochromocytoma Reveals the Chromaffin Cell Origin of Ectopic Hormone Production
2026-Apr-18, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083625
PMID:42074262
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示异位ACTH分泌性嗜铬细胞瘤中ACTH产生的嗜铬细胞起源 | 首次通过单细胞RNA测序揭示异位ACTH分泌性嗜铬细胞瘤中POMC阳性嗜铬细胞是ACTH的细胞来源,并发现代谢重编程和免疫调节机制 | 样本量较小(仅3例患者),缺乏功能验证实验,未探讨POMC表达调控机制 | 阐明异位ACTH分泌性嗜铬细胞瘤的细胞起源和分子特征 | 异位ACTH分泌性嗜铬细胞瘤患者的肿瘤组织和邻近肾上腺组织 | 数字病理学 | 内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例患者的肿瘤标本和邻近肾上腺组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 426 | 2026-05-08 |
Single-cell landscape of goose thymus uncovers developmental and regulatory dynamics of T cell differentiation
2026-Apr-17, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.106951
PMID:42061246
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研究论文 | 通过单细胞转录组图谱揭示了浙东白鹅胸腺中T细胞分化的发育和调控动态 | 首次构建了鸟类胸腺发育的单细胞转录组图谱,发现γδ T细胞在禽类中异常丰富,并揭示了T细胞分化中DN细胞从预承诺状态到承诺状态的转变过程及胸腺上皮细胞作为信号中枢的调控作用 | 未提及具体局限性 | 研究禽类胸腺T细胞发育的细胞和分子机制 | 浙东白鹅胸腺细胞 | 数字化病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 涵盖胚胎、幼鹅、幼年和成年四个发育阶段 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 427 | 2026-05-08 |
SEC-seq reveals translation-focused metabolic strategies for high IgG productivity in clonal CHO cells
2026-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.14.718270
PMID:42039631
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研究论文 | 应用SEC-seq技术同时测量单细胞转录组和分泌的IgG,揭示CHO细胞高产IgG的翻译聚焦型代谢策略 | 首次利用分泌编码单细胞测序(SEC-seq)同时分析单细胞中的转录组和分泌蛋白,克服了传统转录组分析无法完全解释分泌异质性的局限,并发现了与IgG产量耦合的代谢和分泌回路特征 | NA | 解析CHO细胞中IgG产量相关的代谢和分泌异质性,为工程化改造或选育高产细胞系提供框架 | 中国仓鼠卵巢(CHO)细胞,包括一个亲本生产细胞系和五个克隆 | machine learning | NA | SEC-seq(分泌编码单细胞测序) | NA | 单细胞转录组和分泌蛋白数据 | 一个亲本细胞系和五个CHO克隆 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | SEC-seq(分泌编码单细胞测序) |
| 428 | 2026-05-08 |
CCL5 Orchestrates Paradoxical Immune Landscapes in NSCLC: Simultaneous Recruitment of Effector and Suppressor Cells Shapes Immunotherapy Resistance
2026-Apr-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18081271
PMID:42073595
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research paper | 研究发现CCL5在NSCLC中同时招募效应细胞和抑制性细胞,导致免疫治疗耐药 | 揭示CCL5在非小细胞肺癌中同时促进免疫效应细胞和免疫抑制细胞招募的双重免疫调节功能,并提出其作为免疫治疗生物标志物的可能性 | 样本量较小(外周血队列33例),缺乏独立前瞻性队列验证,属于假设生成性研究 | 探索CCL5在非小细胞肺癌免疫治疗中的双重免疫调节作用及其对预后的影响 | 非小细胞肺癌患者(外周血队列33例)及公共单细胞RNA测序数据集 | machine learning | lung cancer | single-cell RNA-seq, CellChat, SCENIC | NA | scRNA-seq数据 | 外周血队列33例,单细胞RNA测序数据8例和234例 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 429 | 2026-05-08 |
Research on Bamboo Shoot Bud Development: A Leap from Tissue Heterogeneity to Single-Cell Spatial Atlas
2026-Apr-16, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15081233
PMID:42075434
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综述 | 本文综述了毛竹笋芽发育的研究进展,提出从组织异质性到单细胞空间图谱的转变策略以突破现有瓶颈 | 首次系统提出构建单细胞分辨率、空间解析、多组学整合和功能验证框架的核心策略,以解决组织均质化掩盖细胞异质性、空间位置信息丢失、单细胞技术应用困难和染色质可及性与转录调控耦合未解析等关键瓶颈 | 未涉及具体实验验证,仅提供理论框架和策略,缺乏对现有技术局限性的定量评估 | 阐明毛竹笋芽发育的分子基础,为笋品质和竹材机械性能的遗传改良提供关键靶标 | 毛竹笋芽发育过程 | 机器学习 | NA | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | 图像、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 430 | 2026-05-08 |
Microbial Monotherapy With Leuconostoc sp LB-P8 Improves Inflammation and Fibrosis in Mouse Primary Sclerosing Cholangitis by Inhibiting Transforming Growth Factor β1/SMAD Signaling
2026-Apr-15, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101789
PMID:41997362
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研究论文 | 本研究鉴定了一种新的明串珠菌菌株LB-P8,并证明其通过抑制TGF-β1/SMAD信号通路改善小鼠原发性硬化性胆管炎的炎症和纤维化 | 首次发现明串珠菌菌株LB-P8具有抗纤维化特性,并通过抑制TGF-β/SMAD信号通路发挥作用,为原发性硬化性胆管炎提供了新型微生物治疗策略 | NA | 研究微生物如何影响原发性硬化性胆管炎进展,并评估新型明串珠菌菌株LB-P8的治疗效果和机制 | 原发性硬化性胆管炎小鼠模型和人类肠道细胞 | 机器学习 | 原发性硬化性胆管炎 | 超高效液相色谱-串联质谱、逆转录定量聚合酶链反应、空间转录组学分析 | NA | 文本, 图像 | 三种小鼠模型(胆管结扎、DDC喂养、Mdr2-/-小鼠)和人类肠道细胞 | Nanostring | 空间转录组学 | GeoMX | Nanostring GeoMX空间转录组分析 |
| 431 | 2026-05-08 |
In Silico Perturbation Identifies Transcription Factors as Protective Targets in HSPCs After Irradiation
2026-Apr-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083522
PMID:42074165
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和计算机扰动分析,识别具有保护作用的转录因子,以加速辐照后造血干细胞和祖细胞的造血重建 | 首次将计算机模拟转录因子扰动分析与单细胞RNA测序相结合,系统地预测辐照后HSPCs谱系偏向中的转录因子作用,并验证了具有药理激活潜力的新调控因子 | 主要依赖计算机模拟预测,体内外验证仅针对个别转录因子,可能未涵盖所有关键调控因子 | 识别能加速辐照后造血重建的转录因子调控因子 | 辐照后小鼠骨髓中的造血干细胞和祖细胞 | 机器学习 | 辐射诱导的造血损伤 | 单细胞RNA测序、计算机模拟转录因子扰动分析 | 基因调控网络模型 | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明样本量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2026-05-08 |
Single-Cell Analysis Highlights Pivotal Role of Eosinophil-Basophil Mast Cell Progenitor-Related Mechanism in Primary Immune Thrombocytopenia
2026-Apr-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083535
PMID:42074179
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示嗜酸性-嗜碱性肥大细胞祖细胞相关机制在原发性免疫性血小板减少症中的关键作用 | 首次利用单细胞测序分析揭示ITP患者骨髓中CD34+造血干祖细胞的异质性,特别是发现嗜酸性-嗜碱性肥大细胞祖细胞比例显著升高,并鉴定出LGALS9-CD44轴在EBMP与MkP1细胞间的受损交互,为ITP治疗提供了新靶点 | 样本量可能有限,且机制验证主要基于体外实验和细胞间通讯分析,需进一步体内实验验证 | 探索原发性免疫性血小板减少症中巨核细胞功能障碍的潜在机制 | ITP患者与健康对照组的骨髓CD34+造血干祖细胞 | 单细胞组学 | 免疫性血小板减少症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | ITP患者与健康对照组骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 433 | 2026-05-08 |
Multi-Omics Analyses Identify ANLN as a Prognostic Biomarker for Recurrence and Metastasis in Non-Small Cell Lung Cancer
2026-Apr-15, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040461
PMID:42074579
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研究论文 | 通过多组学分析鉴定ANLN为非小细胞肺癌复发和转移的预后生物标志物 | 整合bulk和单细胞转录组数据,首次系统性鉴定ANLN是肺癌复发和转移的核心驱动基因,并验证其在上皮细胞和增殖性肿瘤细胞中高表达与侵袭表型相关 | 功能验证仅限于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;药物预测未进行体内药效学验证 | 识别调控肺癌复发和转移的关键分子标志物 | 非小细胞肺癌患者的肿瘤组织及单细胞RNA测序数据 | 机器学习和生物信息学 | 非小细胞肺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 多个队列的bulk转录组和单细胞RNA测序数据集,具体样本数未提及 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 434 | 2026-05-08 |
Lineage-specific CK2α deletion reshapes the transcriptome of hematopoietic stem cells toward an immune-primed state
2026-Apr-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.10.717787
PMID:42039464
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究CK2α缺失对造血干细胞转录组的影响,发现其向免疫启动状态重塑 | 首次揭示CK2α在稳态造血中调控造血干细胞免疫转录程序,发现组织环境可调节CK2α缺失的转录后果 | NA | 明确CK2α如何塑造造血细胞,特别是其在稳态造血中的功能 | 小鼠骨髓和脾脏组织样本中的造血干细胞 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 野生型对照和条件性敲除CK2α的转基因小鼠骨髓和脾脏样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 435 | 2026-05-08 |
Integrative Analysis and Experimental Validation Identify Potential m6A-Related Biomarkers for Osteoporosis
2026-Apr-14, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17040458
PMID:42074576
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研究论文 | 本研究通过整合分析和实验验证,鉴定了骨质疏松症中潜在的m6A相关生物标志物 | 首次将m6A调控因子与免疫微环境联系起来,并通过多级实验验证(单细胞测序、转录组测序、蛋白印迹)确认HIRA为持续下调的生物标志物 | 未提及样本量和实验验证的具体局限性,可能需要更多人群验证 | 鉴定骨质疏松症中m6A相关生物标志物,用于风险评估和治疗 | 骨质疏松症患者的外周血单核细胞和骨组织 | 机器学学习 | 骨质疏松症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质印迹 | 共识聚类, 机器学习算法(未明确具体模型), 列线图 | 转录组数据 | 来自GEO数据集的外部数据集,以及实验验证中的PBMCs和骨组织样本(具体数量未明确) | NA | NA | NA | NA |
| 436 | 2026-05-08 |
Heterogeneous, population-level drug-tolerant persisters exhibit ion-channel remodeling and ferroptosis susceptibility
2026-Apr-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.02.03.479045
PMID:42039444
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研究论文 | 该研究揭示药物耐受持久细胞(DTPs)并非单一细胞状态,而是由多个具有不同分裂和死亡速率的亚状态组成的异质性群体,并发现离子通道重塑和铁死亡易感性 | 提出DTPs是异质性种群而非单一细胞状态的新观点,通过单细胞转录组学和谱系条形码技术识别多个表型状态,并发现离子通道活性改变和铁死亡易感性 | 未提及具体局限性 | 研究药物耐受持久细胞的异质性及其对靶向癌症治疗的潜在影响 | 药物耐受持久细胞及其亚状态的异质性 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞转录组学、谱系条形码 | NA | 单细胞转录组数据、谱系条形码数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 437 | 2026-05-08 |
Single-Cell Immune Atlases to Map Small Extracellular Vesicle Cargo in Tuberculosis-Diabetes Comorbidity: A Narrative Review and Conceptual Roadmap
2026-Apr-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27083437
PMID:42074081
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综述 | 本文提出利用单细胞免疫图谱解析结核病-糖尿病共病中小细胞外囊泡货物,并构建概念性路线图 | 首次提出将单细胞多模态免疫参考图谱(scRNA-seq/CITE-seq)作为支架,将小细胞外囊泡货物模式与特定免疫细胞状态、通路和解剖区室联系起来,用于结核病-糖尿病共病研究 | 大部分小细胞外囊泡研究仍为整体水平且未考虑细胞来源,解释受限于囊泡异质性、选择性货物包装及共分离的非囊泡污染物,尤其缺乏严格对照的核酸分析 | 为结核病-糖尿病共病中宿主导向干预提供具有细胞来源解析的生物标志物和机制靶点 | 结核病-糖尿病共病患者血浆和支气管肺泡灌洗液中的小细胞外囊泡及其RNA和蛋白质货物 | 生物信息学 | 结核病,糖尿病 | 单细胞RNA测序,CITE-seq,小细胞外囊泡分离与分析 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | NA |
| 438 | 2026-05-08 |
Histo-Molecular Intratumoral Heterogeneity in Meningiomas: A Narrative Review
2026-Apr-10, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18081206
PMID:42073533
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综述 | 本文对脑膜瘤组织分子瘤内异质性进行了叙述性综述,总结了其临床意义和潜在机制 | 系统整合了组织学、细胞遗传学、单细胞RNA测序和空间转录组学等多层次数据,揭示了脑膜瘤中复杂的组织分子异质性,首次强调了SULT1E1亚克隆和COL6A3介导的巨噬细胞-肿瘤相互作用在恶性进展和复发中的关键作用 | 仅纳入已发表文献,可能存在出版偏倚;综述为叙述性,缺乏定量荟萃分析;部分研究的样本量较小可能影响结论的普适性 | 阐明脑膜瘤组织分子瘤内异质性的特征及其临床意义 | 脑膜瘤患者 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | FISH、核型分析、单细胞RNA测序、拷贝数变异分析、空间转录组学 | NA | 图像, 文本, 基因表达数据 | 2952例脑膜瘤患者,平均年龄59.4±14.8岁,范围16-85岁 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 439 | 2026-05-08 |
spRefine denoises and imputes spatial transcriptomic data with a reference-free framework powered by genomic language model
2026-04-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281001.125
PMID:41633767
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研究论文 | spRefine是一种无参考框架,利用基因组语言模型对空间转录组数据进行降噪和填补 | 首次将基因组语言模型应用于空间转录组数据的联合降噪和填补,无需参考数据,能提升细胞和点级表示的鲁棒性、数据整合效果,并发现新的生物学信号 | 未明确提及 | 开发一种深度学习方法,以降低空间转录组数据的噪声和缺失基因测量,提高数据质量,并用于下游分析 | 空间转录组数据中的细胞和点级表示 | 机器学习 | 老年病(利用空间转录组分析衰老效应) | 空间转录组学 | 基因组语言模型(深度学习框架) | 空间转录组数据 | 多种规模的公开数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 440 | 2026-05-08 |
Single-nucleus multiomic profiling of the aging mouse substantia nigra reveals conserved gene alterations linked to Parkinson's disease
2026-04-07, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.281113.125
PMID:41781332
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研究论文 | 利用单细胞多组学技术绘制小鼠黑质衰老图谱,揭示与帕金森病相关的保守基因变化 | 首次利用单核多组学测序技术同时获取小鼠黑质全生命周期的转录组和表观遗传组图谱,并整合公共帕金森病单细胞RNA-seq数据集,系统性鉴定与衰老和帕金森病相关的保守基因变化 | 研究基于小鼠模型,其与人类帕金森病的直接相关性需进一步验证;未对功能验证实验进行描述 | 阐明衰老与帕金森病病理之间的分子机制 | 小鼠黑质细胞(包括少突胶质细胞、小胶质细胞、谷氨酸能神经元等) | 机器学习 | 帕金森病 | 单核多组学测序(snRNA-seq + scATAC-seq) | NA | 转录组和表观基因组数据 | 40,125个小鼠黑质单细胞核(覆盖全生命周期) | 10x Genomics | 单细胞多组学测序(单核转录组+染色质可及性) | 10x Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression | 10x Chromium单细胞核多组学测序(同时捕获转录组和染色质可及性) |