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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-06-25 |
CycleVI: Isolating cell cycle variation with an interpretable deep generative model
2026-Jun-23, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag372
PMID:42334940
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研究论文 | CycleVI是一个可解释的深度生成模型,用于从单细胞RNA测序数据中分离细胞周期变异,以揭示其他生物信号 | 利用分区潜在表示和专用的圆形子空间,将细胞周期驱动的变异与其他信号分离,提供可解释的细胞周期相位推断 | 无相关信息 | 从单细胞RNA测序数据中准确推断细胞周期相位,并分离细胞周期相关的变异,以增强对增殖系统中细胞异质性的分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞周期相位推断和变异分离 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度生成模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 422 | 2026-06-25 |
A MYCN-GAL-SREBP1 Lipogenic Axis Drives Proliferation in Silent Corticotroph Adenomas
2026-Jun-23, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag141
PMID:42334961
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研究论文 | 整合批量及单细胞RNA测序数据,揭示MYCN-GAL-SREBP1脂质合成轴驱动静默性促肾上腺皮质激素腺瘤增殖的机制 | 首次发现MYCN-GAL-SREBP1脂质合成轴在静默性促肾上腺皮质激素腺瘤中的驱动作用,并证明SREBP1是潜在可药靶向的治疗弱点 | 未提及具体局限性 | 阐明静默性促肾上腺皮质激素腺瘤增殖的分子机制,特别是脂质代谢及其调控通路的作用 | 静默性促肾上腺皮质激素腺瘤、功能性促肾上腺皮质激素腺瘤和正常垂体组织 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | RNA-seq, 脂质组学, 荧光素酶报告基因实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 脂质组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 423 | 2026-06-25 |
PTPN1 synergistically promotes hepatocellular carcinoma progression by inhibiting the expression of STAT5 in CD8+ T cells and enhancing the activity of the PI3K-AKT pathway
2026-Jun-23, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.117061
PMID:42335545
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研究论文 | 该文章探究了PTPN1在肝细胞癌中通过抑制CD8+ T细胞中STAT5的表达并增强PI3K-AKT通路活性从而协同促进肿瘤进展的机制 | 首次将PTPN1作为免疫检查点研究其在肝细胞癌中对CD8+ T细胞和肿瘤细胞的双重作用机制,揭示其通过JAK2-STAT5轴抑制T细胞增殖同时激活PI3K-AKT通路促进癌细胞进展 | 该研究的局限性未在摘要中明确说明 | 阐明PTPN1对肝细胞癌患者预后、肿瘤微环境以及肝癌细胞生物学行为的影响,评估其作为免疫治疗靶点的临床潜力 | 肝细胞癌患者肿瘤组织、CD8+ T细胞、肝癌细胞系 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 424 | 2026-06-25 |
Decoding the complexity of intestinal immunity with spatial transcriptomics
2026-Jun-23, Current opinion in immunology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.coi.2026.102806
PMID:42335605
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综述 | 利用空间转录组学解码肠道免疫系统的复杂性 | 全面回顾了空间转录组学在解析肠道免疫系统空间异质性中的适用性及其关键发现 | 当前空间转录组学技术仍存在分辨率与覆盖度之间的平衡问题,且与互补技术的整合面临挑战 | 探讨空间转录组学在肠道免疫研究中的应用现状、挑战及未来方向 | 肠道免疫系统及其空间异质性 | 数字病理学 | 胃肠道疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 425 | 2026-06-25 |
Corrigendum to "Single-cell RNA sequencing reveals depot-specific characteristics of adipose progenitor cells in ducks" [Poultry Science, Volume 105/Issue 7, July 2026, 107004]
2026-Jun-23, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2026.107324
PMID:42335774
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 426 | 2026-06-25 |
An emergent disease-associated motor neuron state precedes cell death in ALS
2026-Jun-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2026.05.047
PMID:42335888
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研究论文 | 通过SOD1-G93A小鼠模型的纵向单核转录组和染色质开放性图谱,结合空间转录组学,定义了肌萎缩侧索硬化症中运动神经元退化的分子决定因素,发现了一种与疾病相关的运动神经元状态 | 首次识别出易受损的α运动神经元在ALS中转变为一独特细胞状态(疾病相关运动神经元,DMs),并通过人类运动神经元中DM相关转录因子的上调实验验证了其活性调控成分 | 未提及 | 定义肌萎缩侧索硬化症中运动神经元退化的分子决定因素 | SOD1-G93A小鼠模型的脊髓运动神经元及人类ALS脊髓组织 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单核RNA测序、单核ATAC测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、染色质开放性数据、空间转录组数据 | 小鼠模型(SOD1-G93A)和人类ALS脊髓样本 | NA | 单核RNA测序、单核ATAC测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 427 | 2026-06-25 |
Cancer Stem Cells and Immune Evasion: Mechanisms Driving Immunotherapy Resistance and Strategies for Therapeutic Intervention
2026-Jun-23, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105450
PMID:42336068
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综述 | 综述癌症干细胞(CSC)通过重塑肿瘤微环境驱动免疫治疗耐药性的机制,并探讨靶向CSC相关生态位的治疗策略 | 系统整合空间转录组学、单细胞分析和患者衍生模型的证据,将CSC介导的免疫逃逸机制与其对应的治疗状态进行映射,并讨论了新兴的CSC靶向纳米技术和工程细胞疗法 | 许多机制在患者中缺乏直接因果证据,且需要严格的生物标志物驱动试验来验证靶向CSC生态位能否持续改善抗肿瘤免疫 | 阐明癌症干细胞介导免疫逃逸的机制及其对免疫治疗耐药性的影响,并提出潜在的治疗干预策略 | 癌症干细胞、肿瘤微环境、免疫逃逸机制、免疫治疗耐药性 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学、单细胞分析、患者衍生模型、体内验证 | NA | 图像、文本 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | 10x Visium、10x Chromium | 空间转录组学(10x Visium)和单细胞RNA测序(10x Chromium)用于分析肿瘤微环境中的CSC相关特征 |
| 428 | 2026-06-25 |
Heterogeneous expression patterns of the T2D-associated kinesin-4 KIF21A in pancreatic islet endocrine cells
2026-Jun-23, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2026.102408
PMID:42336059
|
研究论文 | 本研究揭示了T2D相关驱动蛋白KIF21A在胰岛内分泌细胞中的异质性表达模式,并表明其可能通过锚定微管正端参与定向激素分泌 | 首次将KIF21A鉴定为与2型糖尿病相关的驱动蛋白,揭示其在胰岛内分泌细胞中的细胞类型特异性表达层级(δ > α > β)及细胞间异质性,并发现其富集于血管导向的分泌热点区域(玫瑰花结和层粘连蛋白丰富界面) | 未阐明KIF21A在T2D中下调的具体分子机制,且功能验证仅基于表达关联分析,缺乏直接的功能敲除或过表达实验 | 探究调控胰岛内分泌细胞定向分泌的细胞骨架机制,特别是KIF21A在构建分泌能力相关的皮质微管结构中的作用 | 人胰岛组织中的内分泌细胞(α、β、δ细胞)及T2D患者胰岛样本 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | RNA-seq, 定量蛋白质组学, 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 图像数据 | 人胰岛组织(T2D患者与非糖尿病对照) | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 定量蛋白质组学 | Illumina NovaSeq | NA |
| 429 | 2026-06-25 |
Single-cell and spatial transcriptomic colocalization analysis reveals the roles of histone deacetylation in lung adenocarcinoma progression and microenvironment
2026-Jun-23, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2026.06.013
PMID:42336135
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research paper | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和分子生物学研究了组蛋白去乙酰化相关基因在肺腺癌进展和微环境中的作用 | 首次通过单细胞和空间转录组共定位分析揭示FOXA1-HDAC2轴在肺腺癌中的调控机制,并建立了7基因预后模型 | 文献摘要未明确提及局限性 | 阐明组蛋白去乙酰化在肺腺癌异质性和恶性进展中的空间分布和调控网络 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | machine learning | lung cancer | scRNA-seq, 空间转录组学, 分子生物学 | 7-gene prognostic model | single-cell RNA-seq数据, 空间转录组数据, 基因表达数据 | 多个公开数据集(GSE131907, GSE189487, TCGA-LUAD),具体样本数量未提及 | NA | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | NA | NA |
| 430 | 2026-06-25 |
A Multicellular Coordinated Network Driving Lymphovascular Space Invasion in Endometrioid Endometrial Carcinoma
2026-Jun-23, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70246
PMID:42336618
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示子宫内膜样腺癌中淋巴血管间隙浸润的多细胞协调网络 | 首次通过单细胞测序解析LVSI阳性肿瘤的多细胞生态系统,发现WNT5A_mCAF和SPP1+MMP9+巨噬细胞协同重塑细胞外基质、促进淋巴血管生成并抑制T细胞活性 | 样本量较小(3个LVSI+、2个LVSI-及2个正常样本),需更大规模队列验证 | 阐明子宫内膜样腺癌中淋巴血管间隙浸润的多细胞分子机制 | 子宫内膜样腺癌LVSI阳性、LVSI阴性及正常子宫内膜组织样本 | 机器学习 | 子宫内膜癌 | 单细胞RNA测序、空间多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据、空间免疫荧光图像 | 7例组织样本(3例LVSI+、2例LVSI-、2例正常子宫内膜) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 431 | 2026-06-25 |
EFHD2 drives lactate-mediated DNA damage repair and immunosuppression via HMGB1 and HIF-1α to confer radioresistance in colorectal cancer
2026-Jun-23, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-09031-2
PMID:42336814
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了EFHD2在结直肠癌放射抵抗中通过HMGB1和HIF-1α介导乳酸驱动的DNA损伤修复和免疫抑制的机制 | 首次发现EFHD2的K9位点乳酸化修饰对其DNA修复功能至关重要,并揭示EFHD2通过乳酸代谢重塑肿瘤免疫微环境促进放射抵抗 | 未明确提及主要局限性,但可能包括多组学数据整合的复杂性及临床样本量有限 | 阐明EFHD2在结直肠癌放射抵抗中的作用机制,探索靶向EFHD2轴以恢复抗肿瘤免疫和改善治疗效果的潜力 | 放射抵抗结直肠癌细胞模型、免疫活性及免疫缺陷小鼠、患者源性直肠癌样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | RNA测序,蛋白质组学,乳酸化蛋白质组学,空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据,蛋白质组学数据,空间转录组学数据,单细胞RNA测序数据 | 放射抵抗结直肠癌细胞模型及小鼠模型,患者源性直肠癌样本 | 10x Genomics | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | 10x Visium,10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组学,10x Chromium用于单细胞RNA测序 |
| 432 | 2026-06-25 |
Stromal and endothelial transcriptional changes during progression from MGUS to myeloma and after treatment response
2026-Jun-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74389-y
PMID:42336819
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究从意义未明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)进展为多发性骨髓瘤(MM)及治疗后反应过程中,骨髓微环境中基质细胞和内皮细胞的转录变化 | 首次在基因工程小鼠模型中利用单细胞RNA测序解析非免疫性骨髓微环境在多发性骨髓瘤进展和药物反应中的动态转录变化,并发现干扰素驱动的程序在疾病阶段和治疗响应中的关键作用 | 未提及 | 阐明非免疫性骨髓微环境(内皮细胞和间充质干细胞)在多发性骨髓瘤进展和治疗反应中的作用 | 基因工程小鼠模型(BIcγ1和MI模型)以及患者样本中的内皮细胞和间充质干细胞 | 机器学习 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基因工程小鼠模型及患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2026-06-25 |
MYDGF promotes pathological and physiological retinal angiogenesis via the Gαi1/3-Gab1-Akt-mTOR signaling
2026-Jun-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74780-9
PMID:42336863
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研究论文 | 该研究确定了髓源性生长因子(MYDGF)作为视网膜血管动态的关键调节因子,并通过Gαi1/3-Gab1-Akt-mTOR信号轴促进病理性及生理性视网膜血管生成 | 首次发现MYDGF在视网膜血管生成中的关键作用,并阐明了其通过Gαi1/3-Gab1-Akt-mTOR信号轴的分子机制 | 主要基于小鼠模型及体外实验,尚需更多人体样本及临床验证 | 揭示视网膜血管生成的分子机制 | 视网膜内皮细胞、增殖性糖尿病视网膜病变患者样本、新生小鼠及成年雄性小鼠 | 数字病理学 | 视网膜血管病变(增殖性糖尿病视网膜病变) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类患者样本和小鼠模型(具体数量未在摘要中说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于单细胞转录组分析 |
| 434 | 2026-06-25 |
Spatial transcriptomics reveals coordinated ventricular patterning and maturation in the developing human heart
2026-Jun-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74476-0
PMID:42336864
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研究论文 | 通过空间转录组学绘制人心脏发育过程中的时空转录图谱,揭示心室模式化和协调成熟的分子机制 | 首次在8-15孕周的人心脏样本中,通过30个切片的空间转录组数据,识别出乳头肌和房室平面等特殊亚群,并发现从心内膜到心外膜的连续转录梯度 | 样本仅涵盖8-15孕周,未覆盖更早或更晚发育阶段;空间分辨率可能受限于单个点代表多细胞单元,无法解析单细胞水平异质性 | 阐明人心脏发育过程中空间组织结构的建立以及区域程序如何协调发育 | 8-15孕周的人心脏组织切片 | 空间转录组学 | 心脏发育相关疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组图像和基因表达数据 | 30个组织切片,来自8-15孕周的人心脏样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 435 | 2026-06-25 |
Clemastine alleviates cognitive dysfunction after SAH by targeting neuronal CNTN1 to regulate the ADA-adenosine pathway
2026-Jun-23, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-026-01852-3
PMID:42337055
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研究论文 | 本研究揭示了下调神经元CNTN1通过ADA-腺苷途径加剧蛛网膜下腔出血后脱髓鞘,并发现氯马斯汀可作为潜在治疗药物 | 首次发现神经元特异性CNTN1下调通过ADA-腺苷信号轴调控SAH后脱髓鞘,并验证氯马斯汀的治疗作用 | 具体分子机制和临床转化仍需进一步研究,且未明确CNTN1在脑实质其他细胞类型中的作用 | 阐明蛛网膜下腔出血后认知障碍的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 蛛网膜下腔出血患者脑脊液和小鼠模型中的神经元细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 患者脑脊液样本和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2026-06-25 |
Prdm15 Deficiency Results in Impaired Hippocampal Neurogenesis and Autism-Like Behaviors
2026-Jun-23, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-026-01770-2
PMID:42337135
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research paper | 本研究通过小鼠模型发现PRDM15基因缺失导致海马神经发生受损和自闭症样行为,揭示了PRDM15在自闭症谱系障碍发病机制中的关键作用 | 首次鉴定PRDM15为自闭症谱系障碍的新型候选风险基因,并利用单细胞RNA测序技术阐明其通过调控海马神经干细胞分化影响神经发生和行为表型的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型,人源PRDM15突变与自闭症表型的直接因果关系尚需进一步验证;条件性敲除仅部分复现表型,提示可能存在其他补偿机制 | 探究PRDM15基因缺陷对海马神经发生和行为发育的影响及其在自闭症谱系障碍发病中的作用 | Prdm15基因缺陷小鼠模型(全身性敲除和神经干/祖细胞条件性敲除小鼠) | NA | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠海马组织(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 437 | 2026-06-25 |
Mapping and engineering the human cell-cell interactome
2026-Jun-23, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03177-2
PMID:42337362
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评论 | 提出绘制和工程化人类细胞-细胞相互作用组的倡议,旨在系统理解细胞间如何协同调控组织功能 | 首次提出‘十亿细胞×细胞项目’,系统刻画不同细胞类型与条件下已定义细胞对的相互作用结果 | 未提及具体技术挑战或潜在局限性 | 构建人类细胞之间通信的功能图谱,并推动治疗学发现 | 人类主要细胞类型及其相互作用 | NA | NA | NA | NA | NA | 计划包含十亿个细胞对 | NA | 单细胞转录组学, 空间图谱技术 | NA | NA |
| 438 | 2026-06-25 |
Benchmarking DNA barcode decoding strategies under high error rates
2026-Jun-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-026-06540-x
PMID:42337406
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研究论文 | 比较了三种DNA条形码解码策略在高错误率条件下的性能表现 | 首次在高错误率光刻合成条形码场景下系统评估了Columba、QUIK和RandomBarcodes三种解码策略的性能,并提出34-36 nt条形码长度以实现超高准确率 | 未说明 | 在10-20%核苷酸错误率条件下,评估不同DNA条形码解码方法的准确性、速度和可扩展性 | 光刻合成的高密度条形码阵列数据(模拟和真实测序数据) | 机器学习 | NA | DNA条形码解码 | FM索引、GPU加速k-mer过滤、三体分选算法 | 序列数据 | 模拟数据集覆盖21,000-85,000条条形码;真实数据集来自42,000点亚阵列,条形码长度28-36 nt | NA | NA | NA | NA |
| 439 | 2026-06-25 |
Gnao1 acts as a gatekeeper to alleviate neuropathic pain by silencing pro-nociceptive signaling cascades
2026-Jun-23, The journal of headache and pain
IF:7.3Q1
DOI:10.1186/s10194-026-02436-6
PMID:42337441
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research paper | 本研究探讨了Gnao1基因编码的Gαo蛋白在神经病理性疼痛中的调控作用及其作为非阿片类镇痛靶点的潜力 | 首次揭示Gnao1通过沉默促伤害性信号级联充当神经病理性疼痛的守门人负调控因子,并提出其作为非阿片类镇痛靶点的新方向 | 未明确提及临床相关性与长期应用效果 | 阐明Gnao1在神经病理性疼痛中的作用机制及其作为治疗靶点的可能性 | 小鼠脊髓、背根神经节、BV2小胶质细胞和原代DRG神经元 | machine learning | neuropathic pain | spatial transcriptomics, bulk RNA-seq, AAV介导过表达与敲降, 行为测试, 免疫组化, 蛋白印迹 | NA | spatial transcriptomics, bulk RNA-seq, 行为学数据 | 小鼠模型(具体数量未明确) | 10x Genomics, Illumina | spatial transcriptomics, bulk RNA-seq | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium用于空间转录组学文库构建,Illumina NovaSeq用于RNA测序 |
| 440 | 2026-06-25 |
H3K18 lactylation promotes allergic airway inflammation in asthma via a CSF1/CSF1R/MAPK autocrine axis
2026-Jun-23, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-026-03781-5
PMID:42337539
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研究论文 | 本研究揭示了哮喘中糖酵解诱导的组蛋白H3K18乳酸化修饰通过CSF1/CSF1R/MAPK自分泌轴促进过敏性气道炎症的机制 | 首次发现组蛋白H3K18乳酸化修饰在哮喘气道炎症中的功能角色,并阐明其通过CSF1/CSF1R/MAPK自分泌正反馈轴驱动上皮细胞代谢重编程与炎症持续激活的分子机制 | 未明确提及研究局限性 | 探究糖酵解来源的组蛋白乳酸化修饰在哮喘气道炎症中的分子机制及潜在治疗靶点 | 哮喘患者的气道上皮细胞标本及单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 哮喘 | scRNA-seq, ChIP-seq, RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 临床标本(具体数量未报告) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |