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当前共找到 41493 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-07-10 |
Defining the host dependencies and the transcriptional landscape of RSV infection
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01010-25
PMID:40815167
|
研究论文 | 该论文结合全基因组CRISPR敲除筛选和单细胞RNA测序，解析呼吸道合胞病毒（RSV）感染中宿主依赖性因素及转录组景观 | 首次联合CRISPR筛选和单细胞测序，揭示RSV感染细胞与旁观者细胞的差异转录模式，并系统比较29个已发表筛选结果 | 未提供具体局限性说明 | 阐明RSV感染的宿主决定因素及宿主应答的细胞类型特异性转录特征 | RSV感染的宿主细胞及未感染旁观者细胞 | 机器学习 | 呼吸道合胞病毒感染 | CRISPR敲除筛选, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 29个已发表筛选研究（覆盖17种病毒的交叉分析） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'测序平台 |
| 422 | 2026-07-10 |
AP2X-1 is a negative regulator of Toxoplasma gondii sexual commitment
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00052-25
PMID:40823841
|
研究论文 | 本研究揭示了AP2X-1是弓形虫有性发育的关键负调控因子，通过调节HDAC3/MORC复合体功能抑制缓殖子分化和有性转化 | 首次发现AP2X-1作为负调控因子控制弓形虫有性发育，阐明其通过影响染色质可及性和HDAC3/MORC复合体功能的新机制 | 未明确AP2X-1与HDAC3/MORC复合体相互作用的分子细节，且体内实验仅局限于小鼠模型 | 探究弓形虫生命周期转换的调控机制，特别是有性发育的负调控因子 | 弓形虫AP2X-1基因及其在速殖子、缓殖子、裂殖子阶段的表达和功能 | 分子生物学 | 弓形虫病 | 单细胞测序, CUT&Tag, ATAC-seq, 基因敲除 | NA | 测序数据, 基因表达数据 | 弓形虫野生型及AP2X-1敲除株, 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 423 | 2026-07-10 |
Defining the host dependencies and the transcriptional landscape of RSV infection and bystander activation
2025-Aug-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.26.645108
PMID:40196489
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研究论文 | 结合CRISPR筛选和单细胞RNA测序，揭示RSV感染和旁观者激活的宿主依赖性和转录景观 | 首次将全基因组CRISPR敲除筛选与单细胞RNA测序结合，系统解析RSV感染细胞与未感染旁观者细胞中不同的宿主反应和转录模式 | 未明确提及，但可能限于体外实验模型，需要进一步验证 | 理解RSV感染的宿主决定因素及感染细胞和未感染旁观者细胞的宿主反应 | RSV感染的细胞和未感染的旁观者细胞 | 机器学习和基因组学 | 呼吸道合胞病毒感染 | CRISPR敲除筛选，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 全基因组CRISPR筛选和单细胞RNA测序数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 424 | 2026-07-10 |
Rethinking eco-evo studies of gene expression for non-model organisms in the genomic era
2025-08, Molecular ecology
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/mec.17378
PMID:38721834
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评论 | 本文回顾了长读长测序和单细胞RNA测序等新兴基因组技术在对非模式生物进行生态基因组学研究中的潜力与影响 | 强调将长读长测序与单细胞RNA测序结合用于非模式生物，以解决传统批量RNA-seq无法捕捉稀有细胞类型表达和细胞组成变化的问题 | 未提及具体实验验证或量化技术限制，可能依赖未来技术成熟度 | 探讨基因组技术如何推动非模式生物基因表达的生态与进化研究 | 非模式生物（生态基因组学研究中的物种） | 机器学习 | NA | 长读长测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 短读长RNA测序 | NA | NA |
| 425 | 2026-07-10 |
Integrated ultrasensitive metabolomics and single-cell transcriptomics identify crucial regulators of sheep oocyte maturation and early embryo development in vitro
2025-07, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.08.040
PMID:39233000
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研究论文 | 利用超灵敏代谢组学和单细胞转录组学整合分析，识别绵羊卵母细胞体外成熟和早期胚胎发育的关键调节因子 | 首次通过超灵敏代谢组学和单细胞RNA-seq整合分析，在微量样本中鉴定出体外培养系统中缺失的关键代谢物（甜菜碱、肉碱和肌酸），并验证其补充能显著提高囊胚形成率 | 未明确说明具体局限性，但研究仅针对绵羊，可能需验证其他物种；机制探索基于组学分析，需进一步功能验证 | 提高绵羊卵母细胞体外发育能力，识别并补充培养系统中缺失的关键代谢物 | 绵羊卵母细胞和早期胚胎 | 数字病理学 | NA | 超灵敏代谢组学、单细胞RNA-seq | NA | 代谢组学数据、转录组学数据 | 微量样本（卵母细胞、胚胎、卵泡液、输卵管液、体外培养系统） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 超灵敏代谢组学分析（基于微量样本） |
| 426 | 2026-07-10 |
Interrogating mediators of single-cell transcriptional changes in the acute damaged cerebral cortex: Insights into endothelial-astrocyte interactions
2025-06, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2025.104003
PMID:40090391
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究急性损伤大脑皮层中内皮细胞EphA4敲除对星形胶质细胞转录组变化的影响，揭示了内皮-星形胶质细胞相互作用的介导机制 | 首次通过内皮细胞特异性EphA4敲除模型结合单细胞RNA测序，系统解析了创伤性脑损伤后内皮细胞与星形胶质细胞之间的细胞特异性互作机制，并验证了一个新的Sox9+/Mertk+星形胶质细胞簇在凋亡细胞清除和抗炎反应中的介导作用 | 未提及具体局限性，但可能包括实验模型（小鼠）与人类的差异、单细胞测序覆盖深度有限、仅关注急性期变化等 | 探究内皮细胞EphA4受体在调节受损大脑皮层中细胞特异性转录组变化中的作用，特别关注内皮-星形胶质细胞互作 | 实验性创伤性脑损伤小鼠模型中的内皮细胞和星形胶质细胞 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤（神经系统疾病） | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA（未明确样本数量，但涉及小鼠内皮细胞特异性EphA4敲除组与对照组） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 427 | 2026-07-10 |
Systematic evaluation of single-cell RNA-seq analyses performance based on long-read sequencing platforms
2025-05, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.05.020
PMID:38782298
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研究论文 | 系统评估基于长读长测序平台的单细胞RNA测序分析性能 | 首次系统比较Oxford Nanopore Technologies (ONT)和Pacific Biosciences (PacBio)两种第三代测序技术在单细胞RNA测序分析中的性能，并使用NGS作对照评估其在细胞类型鉴定、新异构体识别和等位基因特异性表达方面的表现 | 未明确提及限制 | 系统性评估ONT和PacBio平台在单细胞RNA-seq分析中的性能，为单细胞转录组研究设计测序策略提供指导 | 来自相同单细胞cDNA文库的不同数量细胞 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 长读长测序 | 不适用 | 基因表达数据 | 不同数量细胞的单细胞cDNA文库 | Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences | 单细胞RNA测序 | ONT, PacBio | ONT长读长测序平台, PacBio长读长测序平台 |
| 428 | 2026-07-10 |
Life-long microbiome rejuvenation improves intestinal barrier function and inflammaging in mice
2025-04-02, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02089-8
PMID:40176137
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研究论文 | 通过长期肠道微生物组年轻化干预，评估其对小鼠肠道屏障功能和炎症老化的改善作用 | 首次在非反刍哺乳动物中证明终生反复粪菌移植（FMT）可延缓衰老相关过程，并利用单细胞RNA测序揭示肠道细胞表型变化机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，结果向人类转化的可行性尚未验证；未对特定细菌菌株或代谢产物进行因果验证 | 探索终生肠道微生物组年轻化策略是否能够延缓或预防哺乳动物的衰老进程 | 小鼠（年轻供体与同龄受体） | 机器学习, 数字病理学 | 老年疾病 | 粪菌移植（FMT）, 16S rRNA基因测序, 宏基因组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 微生物组数据 | 小鼠，具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA基因测序, 宏基因组学 | NA | NA |
| 429 | 2026-07-10 |
Faecalibacterium prausnitzii-derived outer membrane vesicles reprogram gut microbiota metabolism to alleviate Porcine Epidemic Diarrhea Virus infection
2025-04-02, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02078-x
PMID:40176190
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研究论文 | 探讨粪杆菌外膜泡通过重编程肠道菌群代谢减轻猪流行性腹泻病毒感染的作用机制 | 首次发现粪杆菌外膜泡是缓解PEDV感染的主要功能成分，并揭示其通过增加磷脂酰胆碱水平、改变肠道细胞组成及抑制坏死性凋亡信号通路的新机制 | 研究仅基于猪仔模型，且未在人体中验证该益生菌及外膜泡的潜在应用 | 探究粪杆菌在减轻猪流行性腹泻病毒感染中的作用及其机制 | 粪杆菌及其外膜泡在PEDV感染猪仔模型中的作用 | 微生物组学 | 猪流行性腹泻 | 蛋白质组学、非靶向代谢组学、小RNA测序、宏基因组学、单细胞测序 | NA | 蛋白质、代谢物、RNA、DNA序列、单细胞数据 | 猪仔模型，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞测序用于分析肠道细胞相对丰度 |
| 430 | 2026-07-10 |
CellBouncer, A Unified Toolkit for Single-Cell Demultiplexing and Ambient RNA Analysis, Reveals Hominid Mitochondrial Incompatibilities
2025-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.23.644821
PMID:40166335
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研究论文 | 提出CellBouncer工具包用于单细胞测序中的多路分解和背景RNA分析，并揭示人科线粒体不相容性 | 首次统一处理单细胞测序数据中的多路分解与背景RNA分析，并发现跨物种线粒体不相容性 | 可能受限于特定实验设计和细胞融合模型，通用性需进一步验证 | 开发并验证用于合并实验单细胞测序数据的计算工具 | 细胞混合物（多物种、多个体）、线粒体单倍型、脂质偶联条形码、CRISPR sgRNA和四倍体复合细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞测序 | NA | 图像 | 10个细胞融合系的细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 431 | 2026-07-10 |
Immune mechanisms in multiple sclerosis: CD3 levels on CD28+ CD4+ T cells link antibody responses to human herpesvirus 6
2025-03, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2025.156866
PMID:39884183
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研究论文 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞测序，研究抗体介导的免疫反应与多发性硬化症之间的关系，揭示CD3水平在CD28+ CD4+ T细胞上通过改变人疱疹病毒6型抗体比例影响MS进展 | 首次通过孟德尔随机化结合单细胞测序，发现CD3在特定T细胞上的水平通过调节HHV-6抗体反应影响MS进展的因果关系 | 未明确提及研究局限性，可能包括样本量有限或因果推断的假设限制 | 探究抗体介导的免疫反应与多发性硬化症之间的因果关系，并识别潜在的感染病原体 | MS患者与对照组的免疫细胞浸润及抗体反应关联 | 机器学习 | 多发性硬化症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2026-07-10 |
Highly multiplexed spatial transcriptomics in bacteria
2025-01-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adr0932
PMID:39847624
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研究论文 | 结合1000倍体积膨胀和多重误差鲁棒荧光原位杂交技术，创建细菌MERFISH方法，实现单个细菌内数千个操纵子的高通量空间分辨分析 | 首次将MERFISH技术应用于细菌空间转录组学，通过1000倍体积膨胀克服细菌mRNA高密度难题 | 未明确提及局限性 | 开发细菌高多重空间转录组学方法并研究细菌在复杂环境中的单细胞行为 | 细菌（包括炭疽杆菌和肠道共生菌） | 数字病理学 | NA | MERFISH, 膨胀显微术 | NA | 图像 | 单个细菌水平 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | 细菌MERFISH（结合1000倍体积膨胀和多重误差鲁棒荧光原位杂交） |
| 433 | 2026-07-10 |
Distinct myeloid-derived suppressor cell populations in human glioblastoma
2025-01-17, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abm5214
PMID:39818911
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析33例胶质瘤，在IDH野生型胶质母细胞瘤中鉴定出两种不同的髓源性抑制细胞亚群，并揭示其与肿瘤干细胞的相互作用 | 首次在人类胶质母细胞瘤中鉴定出早期祖细胞型MDSC和单核细胞型MDSC两种亚群，并发现它们与代谢性干细胞样肿瘤细胞在假栅栏区的空间共定位和配体-受体相互作用的分子机制 | 未提及具体局限性 | 阐明胶质瘤相关髓系细胞在肿瘤生长和免疫逃逸中的作用 | 33例胶质瘤的免疫细胞和肿瘤细胞 | 计算生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 33例胶质瘤样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台，10x Visium空间转录组学平台 |
| 434 | 2026-07-10 |
Single-cell RNA sequencing: an emerging tool revealing dysregulated innate and adaptive immune response at single cell level in Kawasaki disease
2025-01, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2401105
PMID:39230194
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综述 | 本文强调了单细胞RNA测序技术在川崎病中揭示先天性和适应性免疫反应失调的关键作用 | 首次系统综述scRNA-seq在川崎病免疫细胞转录组谱和信号通路表征中的高分辨率应用潜力 | 依赖现有文献数据，缺乏原始实验验证；scRNA-seq技术本身存在成本高、数据分析复杂等局限性 | 探讨scRNA-seq在川崎病诊断、预后和个性化治疗中的诊断和治疗潜力 | 川崎病患者的免疫细胞转录组和信号/反应通路 | 机器学习 | 川崎病 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 435 | 2026-07-10 |
Understanding developing kidneys and Wilms tumors one cell at a time
2025, Current topics in developmental biology
DOI:10.1016/bs.ctdb.2024.11.005
PMID:40254343
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综述 | 综述了单细胞测序技术在正常肾脏发育和肾母细胞瘤研究中的应用，讨论了不同技术的优劣及其组合策略 | 系统总结了单细胞测序技术在肾脏发育和肾母细胞瘤领域的应用，并分析了不同技术组合如何最大化生物学理解 | 未提供实验数据验证，仅基于现有文献综述技术现状 | 探讨单细胞测序技术在肾脏发育和肾母细胞瘤研究中的应用及技术选择策略 | 发育中的肾脏和肾母细胞瘤 | 数字病理学 | 肾母细胞瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2026-07-10 |
Genomic Exploration of Nonalcoholic Fatty Liver Disease: Insights From Gene Expression and Variation in Morbidly Obese Individuals
2025, Journal of obesity
IF:3.8Q2
DOI:10.1155/jobe/9245699
PMID:40365443
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研究论文 | 利用整合生物信息学分析，包括bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq，探索非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的差异表达基因及其遗传变异，重点关注肥胖患者中NAFLD的发病机制 | 鉴定了与代谢、免疫和脂质功能相关的新基因（如和），并在肥胖患者肝细胞中过表达，同时发现这些基因的新型致病性变异可能与NAFLD相关 | 研究可能受限于样本代表性、验证范围或致病性变异的直接功能验证不足 | 通过基因表达和遗传变异分析，阐明NAFLD的疾病机制并识别潜在治疗靶点和生物标志物 | 肥胖患者的肝组织及相关基因（如和） | 数字病理学 | 非酒精性脂肪性肝病 | RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据，遗传变异数据 | NA | NA | bulk RNA-seq，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 437 | 2026-07-10 |
Endoplasmic Reticulum Stress Induces ROS Production and Activates NLRP3 Inflammasome Via the PERK-CHOP Signaling Pathway in Dry Eye Disease
2024-12-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.65.14.34
PMID:39699913
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研究论文 | 本研究探讨内质网应激通过PERK-CHOP信号通路诱导ROS产生并激活NLRP3炎症小体在干眼症中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据结合体内外模型，揭示PERK-CHOP-TXNIP轴在干眼症中连接内质网应激与氧化应激及炎症的关键机制 | 未提及具体限制，如样本量较小或模型与人体差异等 | 研究内质网应激在干眼症发展中的潜在作用及其分子机制 | 干眼症小鼠模型、原代人角膜上皮细胞和永生化人角膜上皮细胞 | 数字病理学 | 干眼症 | 单细胞RNA测序、siRNA转染、免疫荧光、Western blotting、实时PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库获取干眼小鼠角膜组织scRNA-seq数据，以及东莨菪碱诱导的干眼小鼠模型和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 使用Seurat R程序分析从GEO数据库获取的scRNA-seq数据 |
| 438 | 2026-07-11 |
The mRNA expression profile of glycine receptor subunits alpha 1, alpha 2, alpha 4 and beta in female and male mice
2024-12, Molecular and cellular neurosciences
DOI:10.1016/j.mcn.2024.103976
PMID:39580061
|
研究论文 | 本研究调查了甘氨酸受体亚基α1、α2、α4和β在成年雌性和雄性小鼠中的mRNA表达谱 | 首次系统分析了甘氨酸受体四个亚基在不同性别小鼠中枢神经系统中的单细胞和整体表达模式 | RNAscope检测到Glra4的表达，但qRT-PCR未能检测到，表明低丰度转录本的检测方法存在局限性 | 明确甘氨酸受体亚基在成年小鼠中枢神经系统中的分布和性别差异 | 成年雌性和雄性小鼠的中枢神经系统组织及部分内脏器官 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, RNAscope | NA | 转录组表达数据 | 成年雌性和雄性小鼠多个脑区及脊髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 439 | 2026-07-10 |
Whole brain alignment of spatial transcriptomics between humans and mice with BrainAlign
2024-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50608-2
PMID:39080277
|
研究论文 | 开发了一种名为BrainAlign的自监督学习方法，用于人类和小鼠全脑空间转录组学比对 | 提出了一种自监督学习方法，通过异构图形神经网络同时编码空间转录组学中的点和基因，实现跨物种全脑比对，并揭示了保守脑区和同源基因表达模式 | NA | 推动人类和啮齿动物全脑空间转录组学研究方法的跨物种比对 | 人类和小鼠的全脑空间转录组学数据 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学 | 异构图形神经网络 | 图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 440 | 2026-07-10 |
CRISPR-CasRx-mediated disruption of Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2 genes reduces intraocular pressure and retinal ganglion cell damage in mice
2024-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50050-4
PMID:39080269
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研究论文 | 利用CRISPR-CasRx技术靶向Aqp1/Adrb2/Rock1/Rock2基因，降低小鼠眼内压并保护视网膜神经节细胞 | 首次利用CasRx RNA干扰工具结合shH10腺相关病毒，靶向调控房水循环相关基因，实现眼内压降低和视网膜神经节细胞保护，并通过单细胞测序阐明作用机制 | 研究仅限于雌性小鼠，未涉及其他性别或人类模型，且基因敲降效果的长期安全性未评估 | 探索基因治疗降低眼内压和延缓青光眼进展的新方法 | 雌性小鼠 | 基因治疗 | 青光眼 | CRISPR-CasRx, 腺相关病毒载体, 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 雌性小鼠，具体数量未指定 | 未指定 | 单细胞测序 | 未指定 | 未指定 |