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当前共找到 39812 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2026-05-28 |
Engrailed transcription factors direct excitatory cerebellar neuron diversity and survival
2023-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569445
PMID:38077070
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间表达分析，揭示了EN1/2转录因子在兴奋性小脑神经元多样性和存活中的保守作用 | 首次定义胚胎期小脑核内侧兴奋性神经元的分子亚域，并揭示EN1/2在三种小脑兴奋性神经元类型中调控TBR2表达、神经元分化和存活的保守功能 | NA | 阐明EN1/2转录因子在小脑兴奋性神经元多样性和存活中的功能机制 | 小鼠胚胎期小脑核兴奋性神经元 | 分子神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间表达分析 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 422 | 2026-05-28 |
The origin and structural evolution of de novo genes in Drosophila
2023-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.03.13.532420
PMID:37425675
|
研究论文 | 结合全基因组比对、生物信息学和计算结构建模，系统性研究了果蝇属新基因的起源、演化及蛋白质结构特征 | 首次系统揭示果蝇谱系特异性新基因的蛋白质结构起源与演化规律，发现大多数潜在折叠良好的蛋白质在诞生时即已折叠，并观察到少数无序蛋白在短时间内转变为有序结构 | 基于计算预测的蛋白质结构缺乏实验验证，且研究局限于果蝇属，结论的普适性有待验证 | 解析新基因在果蝇属中的起源机制、演化过程及蛋白质结构变化规律 | 果蝇属（Drosophila）中555个谱系特异性新基因候选者 | 机器学习和生物信息学交叉 | NA | 全基因组比对、生物信息学分析、Alphafold2、ESMFold、分子动力学模拟、祖先序列重构、单细胞RNA-seq | Alphafold2, ESMFold | 基因组序列、蛋白质结构预测数据、单细胞转录组数据 | 果蝇属555个新基因候选者，以及睾丸单细胞RNA-seq数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 用于果蝇睾丸组织的单细胞RNA-seq分析 |
| 423 | 2026-05-28 |
RNA polymerase II pausing is essential during spermatogenesis for appropriate gene expression and completion of meiosis
2023-May-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.05.08.539879
PMID:37215034
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研究论文 | 本研究利用稳态、新生和单细胞RNA测序策略全面分析雄性生殖细胞群体的基因表达，揭示RNA聚合酶II暂停在精子发生过程中对基因表达调控和减数分裂完成的关键作用 | 首次发现RNA聚合酶II暂停在精子分化的早期阶段对建立基因活性图谱至关重要，并揭示了Pol II暂停在减数分裂过程中对SPO11介导的双链断裂形成的新调控作用 | 未在摘要中明确说明研究局限性 | 阐明RNA聚合酶II暂停在雄性生殖细胞分化和减数分裂中的调控机制 | 雄性生殖细胞（包括未成熟和成熟精子细胞） | 机器学习 | 不育症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 新生RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 424 | 2026-05-28 |
Astroglial toxicity promotes synaptic degeneration in the thalamocortical circuit in frontotemporal dementia with GRN mutations
2023-03-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI164919
PMID:36602862
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研究论文 | 通过比较单细胞转录组学揭示星形胶质细胞毒性在GRN突变导致的额颞叶痴呆丘脑皮质回路突触变性中的关键作用 | 首次发现并验证GRN突变引起的星形胶质细胞病理特征（GJA1、AQP4、APOE上调及SLC1A2下调）是跨物种突触变性的保守机制 | 未明确星形胶质细胞毒性与TDP-43蛋白病之间的上下游因果关系 | 阐明GRN突变导致额颞叶痴呆的丘脑皮质回路神经退行性机制 | Grn-/-小鼠及FTLD-GRN患者的丘脑和额叶皮层 | 数字病理学 | 额颞叶痴呆 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | Grn-/-小鼠及FTLD-GRN患者样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 425 | 2026-05-28 |
Mechanical tension mobilizes Lgr6+ epidermal stem cells to drive skin growth
2022-04-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abl8698
PMID:35476447
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研究论文 | 使用受控组织扩张系统结合机器学习辅助三维重建和单细胞RNA测序，揭示机械张力通过Hippo通路激活Lgr6+表皮干细胞驱动小鼠皮肤生长的细胞与分子机制 | 首次在哺乳动物中系统揭示机械张力通过优先激活Lgr6+表皮干细胞驱动皮肤生长的机制，并利用机器学习三维重建和单细胞RNA测序技术构建器官大小动态变化的平台 | 主要基于小鼠模型，在人体中的适用性需要进一步验证；部分机制如Hippo通路的具体作用细节尚待阐明 | 阐明成年哺乳动物皮肤显著尺寸变化的细胞与分子基础 | 小鼠皮肤组织及Lgr6+表皮干细胞 | 机器学习， 数字病理学 | NA | RNA-seq | CNN | 图像， 文本 | 小鼠皮肤样本，具体数量未在摘要中提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 426 | 2026-05-28 |
The landscape of human tissue and cell type specific expression and co-regulation of senescence genes
2022-01-09, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-021-00507-7
PMID:35000600
|
研究论文 | 对人类组织及细胞类型中衰老基因的表达与共调控网络进行了系统分析 | 首次通过整合网络分析揭示健康人类组织中衰老基因的共表达模块和细胞类型特异性 | 主要依赖公开数据库，未进行实验验证；对衰老细胞在组织中的实际分布缺乏直接证据 | 阐明人类组织中衰老基因的共表达模式及其细胞类型特异性 | 健康人类组织中的衰老基因及其在不同细胞类型中的表达特征 | 机器学习和生物信息学 | 衰老相关疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 基因共表达网络分析 | 转录组数据 | 50个人体组织的GTEx队列数据 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 427 | 2026-05-28 |
Caspases and therapeutic potential of caspase inhibitors in moderate-severe SARS-CoV-2 infection and long COVID
2022-01, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.14907
PMID:33993490
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研究论文 | 研究半胱天冬酶在中度至重症SARS-CoV-2感染及长新冠中的表达及其抑制剂的治疗潜力 | 首次在单细胞水平揭示COVID-19患者免疫细胞中半胱天冬酶的独特表达模式，并发现泛半胱天冬酶抑制剂可减轻长新冠患者CD4+ T细胞中caspase-1活性 | 初步结果需进一步临床相关性验证，样本量有限可能影响结论普适性 | 探索半胱天冬酶在COVID-19疾病谱中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | COVID-19急性期和恢复期患者血液细胞，以及伴有合并症的非COVID-19对照组 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | COVID-19患者及非COVID-19对照者血液样本（具体数量未提及） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台用于免疫细胞转录组分析 |
| 428 | 2026-05-28 |
Categorization of lung mesenchymal cells in development and fibrosis
2021-Jun-25, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.102551
PMID:34151224
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，对小鼠和人类肺发育及纤维化过程中的间充质细胞进行分类 | 首次系统鉴定并描绘了胚胎、出生后、成年及老化纤维化肺中间充质细胞的转录组特征，发现了一种表达特定基因的新细胞亚群，并描述了亚型选择性转录因子及发育过程中的分化路径 | 未明确说明局限性 | 阐明肺间充质细胞在发育和纤维化过程中的异质性 | 小鼠和人类肺间充质细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种发育阶段（胚胎、出生后、成年、老化）及纤维化状态的小鼠和人类肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2026-05-28 |
Obtaining purified human intestinal epithelia for single-cell analysis and organoid culture
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100597
PMID:34169291
|
研究论文 | 描述从人类胎儿和儿童肠道组织制备高活性上皮单细胞悬液并用于单细胞RNA测序和类器官培养的协议 | 提供了从人类胎儿和儿童肠道组织中高效分离纯化上皮细胞以进行单细胞分析和类器官培养的详细方案 | 未明确说明 | 开发从人类肠道组织获得纯化上皮单细胞用于单细胞分析和类器官培养的标准化协议 | 人类胎儿和儿童肠道组织及由该组织产生的肠道类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 人类胎儿和儿童肠道组织样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 430 | 2026-05-28 |
Collection and preprocessing of fine needle aspirate patient samples for single cell profiling and data analysis
2021-06-18, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100581
PMID:34151301
|
研究论文 | 本文描述了对皮肤细针穿刺样本进行采集、预处理以用于单细胞RNA测序和数据分析的协议 | 提出了一种从细针穿刺样本中获取高质量单细胞测序数据的系统方法，包括活细胞生物库建立和预处理流程 | 未提及具体的局限性 | 建立细针穿刺样本的单细胞分析方法，实现临床样本中细胞异质性的高通量检测 | 皮肤细针穿刺样本中的单细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2026-05-28 |
Charting human development using a multi-endodermal organ atlas and organoid models
2021-06-10, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2021.04.028
PMID:34019796
|
研究论文 | 通过构建多内胚层器官图谱和类器官模型，描绘人类发育过程中的细胞动态和分子机制 | 首次整合多器官单细胞转录组图谱与类器官模型，系统揭示呼吸和胃肠道内胚层器官发育的细胞状态、转录因子及间质-上皮互作，并利用图谱作为高维搜索空间评估类器官培养条件 | 未提及具体限制，可能包括样本数量有限、类器官模型无法完全模拟体内复杂环境等 | 利用单细胞图谱和类器官技术解析人类内胚层器官发育的细胞多样性和分子调控 | 内胚层器官的细胞状态、转录因子及器官特异性上皮干细胞和间充质相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个发育中的人体呼吸和胃肠道内胚层器官样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 432 | 2026-05-28 |
Naive stem cell blastocyst model captures human embryo lineage segregation
2021-06-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.04.031
PMID:33957081
|
研究论文 | 通过自我组织生成人类胚胎模型（囊胚样结构），模拟自然囊胚的谱系分离 | 首次通过短暂诱导滋养外胚层在3天内形成具有三种组织层的囊胚样结构，且单细胞转录组分析证实其高保真度模拟人类胚胎 | 未在摘要中提及模型在长期发育或植入后阶段的适用性及潜在局限性 | 建立可扩展的体外人类胚胎模型以研究早期谱系分离 | 人类原始多能细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未在摘要中明确样本数量，但涉及多批次囊胚样结构 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 433 | 2026-05-28 |
Dissecting the microenvironment around biosynthetic scaffolds in murine skin wound healing
2021-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abf0787
PMID:34039601
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析生物合成支架周围微环境在小鼠皮肤伤口愈合中的作用 | 首次利用单细胞RNA测序全面解析不同表面形貌的静电纺丝支架周围的免疫细胞异质性，并发现定向支架促进适应性免疫主导阶段、揭示T细胞调节毛囊再生的新机制 | 仅在小鼠和大鼠模型中验证，缺乏临床人体数据验证 | 研究生物材料表面形貌对伤口愈合和免疫调节特性的影响 | 小鼠和大鼠的背部皮肤全层伤口 | 数字病理学 | 皮肤创伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠和大鼠模型样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞测序系统 |
| 434 | 2026-05-28 |
In vitro characterization of the human segmentation clock
2020-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-019-1885-9
PMID:31915384
|
研究论文 | 在体外表征人类分节时钟，发现人类前体节中胚层细胞再现分节时钟的振荡，且其周期是小鼠的两倍 | 首次在人类体外模型中鉴定出分节时钟的存在，并揭示其振荡周期比小鼠长两倍，同时发现FGF信号调控振荡的相位和周期，扩展了经典'时钟与波前'模型 | 研究主要基于体外细胞模型，可能无法完全反映体内复杂环境；振荡机制的具体分子细节尚需进一步探索 | 验证人类是否存在与模式生物类似的分节时钟，并比较其与小鼠的差异 | 人类和小鼠的前体节中胚层体外分化细胞 | 数字病理学 | 脊椎分节缺陷所致疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类和小鼠体外前体节中胚层细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 435 | 2026-05-27 |
Glia Are Bussin': How Single-Cell and Spatial Transcriptomics Enlighten the Role of Neuroglia in Spinal Cord Injury and Regeneration
2026-06, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.70139
PMID:41934089
|
综述 | 总结单细胞和空间转录组技术如何揭示神经胶质细胞在脊髓损伤与再生中的作用，并通过荟萃分析提供方法学见解 | 首次对五个脊髓损伤单细胞时间序列图谱进行荟萃分析，揭示损伤模型、时间进程、样本制备、细胞分类和分析方法对研究解读的影响 | NA | 综述单细胞和空间基因组技术对神经胶质细胞在脊髓损伤中作用的最新发现，并通过荟萃分析提供方法学警示 | 神经胶质细胞在脊髓损伤后的表型与分子信号互动 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 五个脊髓损伤单细胞时间序列图谱 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 436 | 2026-05-27 |
Granulocyte heterogeneity in immune-mediated and inflammatory diseases: Insights from single-cell transcriptomic analyses
2026-May-26, International immunology
IF:4.8Q2
DOI:10.1093/intimm/dxag026
PMID:42186818
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综述 | 通过单细胞转录组分析揭示免疫介导和炎症性疾病中粒细胞异质性的最新进展与当前局限 | 利用单细胞RNA测序技术突破传统分类，定义基于转录组的粒细胞亚群，揭示多种疾病中粒细胞的异质性，并探讨临床相关生物标志物和靶向治疗策略的开发 | 疾病相关粒细胞群体在疾病病理生理学中的因果作用尚不明确，缺乏实验验证功能和临床适用的替代标志物 | 总结免疫介导和炎症性疾病中粒细胞异质性的研究进展与局限，讨论整合性单细胞方法如何支持临床生物标志物和靶向治疗策略的开发 | 粒细胞（中性粒细胞和嗜酸性粒细胞）及其在各种疾病中的异质性 | 单细胞转录组学 | 免疫介导和炎症性疾病（如微观多血管炎、COVID-19、败血症、心血管疾病、过敏性疾病） | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 437 | 2026-05-27 |
Toward simultaneous pseudo-space reconstruction and cell-type deconvolution of single-cell spatial transcriptome using SpaDicer
2026-May-25, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101465
PMID:42184831
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科研论文 | 介绍SpaDicer，一个统一伪空间重建和细胞类型反卷积的单细胞空间转录组端到端深度学习框架 | 通过跨域特征解耦提取细胞身份和空间定位的域不变特征，并采用自适应损失加权策略协调多个目标任务 | 未明确提及局限性 | 桥接单细胞RNA测序和空间转录组之间的差距，同时实现单细胞伪空间重建和空间点位细胞类型反卷积 | 模拟数据集和五个真实人类组织样本 | 机器学习 | 不适用 | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据，空间转录组数据 | 两个模拟数据集和五个真实人类组织样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 438 | 2026-05-27 |
Explainable machine learning-guided integrated multiomics analysis reveals macrophage-driven immune suppression in breast cancer
2026-May-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73617-9
PMID:42185288
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研究论文 | 本研究利用可解释机器学习管道整合多组学数据分析，揭示了巨噬细胞在乳腺癌中驱动的免疫抑制机制 | 创新性地结合可解释机器学习与多组学分析（包括成像质谱流式技术和单细胞RNA测序），发现了巨噬细胞浸润与乳腺癌复发风险及化疗反应的矛盾关联，并揭示了HLA-ABC+巨噬细胞通过特定配体-受体相互作用介导免疫抑制的新机制 | 研究主要基于回顾性数据分析，巨噬细胞驱动免疫抑制的因果关系需进一步实验验证 | 解析乳腺肿瘤微环境中细胞组成与疾病进展及预后的关联，为改善治疗结局提供潜在靶点 | 乳腺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞、调节性T细胞和耗竭性T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌 | 可解释机器学习、成像质谱流式技术（IMC）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、细胞间通讯分析 | 可解释机器学习模型 | 基因表达数据、细胞分数数据、成像质谱流式数据、单细胞转录组数据 | 约5000份患者样本（来自METABRIC和TCGA数据集） | NA | 成像质谱流式技术、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 439 | 2026-05-27 |
CNet-Cox for interpretable network biomarker discovery and survival risk scoring in precise breast cancer prognosis
2026-May-25, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-026-02756-6
PMID:42185445
|
研究论文 | 提出CNet-Cox框架，一种结合先验网络连接性的正则化Cox比例风险模型，用于在乳腺癌预后中识别具有生物学可解释性的网络生物标志物并进行生存风险评分 | 将基因共定位关系整合到稀疏特征选择中，发现连接性预后模块，提高了生物标志物的可解释性和临床转化潜力 | 仅在乳腺癌数据集上验证，虽声称可扩展至其他疾病，但缺乏多疾病泛化性评估 | 开发一种疾病无关的网络感知生存模型，用于系统性发现连接生物标志物并实现可解释的风险预测 | 乳腺癌患者的基因表达数据，包括发现数据集（TCGA，n=1080）、内部测试数据集、7个独立批量转录组数据集（GEO，n=1602）和空间转录组数据集（Visium，4992个点） | 机器学习和数字病理学 | 乳腺癌 | 批量RNA-seq、空间转录组学 | Cox比例风险模型 | 基因表达数据 | 发现数据集1080个样本，内部测试数据集若干（未具体说明），7个独立数据集共1602个样本，空间转录组数据集4992个点 | Illumina | 批量RNA-seq、空间转录组学 | Illumina NovaSeq、10x Visium | TCGA样本的批量RNA-seq（平台未具体说明）、空间转录组学使用10x Visium平台 |
| 440 | 2026-05-27 |
Integrating single-cell and bulk transcriptomic analyses to explore key lactylation-related genes in benign prostatic hyperplasia
2026-May-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-54516-x
PMID:42185567
|
研究论文 | 整合单细胞和批量转录组分析，探究良性前列腺增生中关键乳酸化相关基因 | 首次在单细胞分辨率下描绘良性前列腺增生中乳酸化相关基因的活性图谱，并识别出ANXA2和IFI27作为关键候选基因，揭示了ANXA2与代谢和炎症之间的潜在联系 | 基于公开数据集和体外细胞实验，缺乏体内验证和更大样本量的确认 | 探究蛋白质乳酸化在良性前列腺增生发病机制中的作用及相关分子特征 | 良性前列腺增生组织与正常前列腺组织的单细胞和批量转录组数据，以及BPH-1细胞系 | 生物信息学 | 良性前列腺增生 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 公开数据集，具体样本数未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |