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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-05 |
Human memory CD4+ T-cells recognize Mycobacterium tuberculosis-infected macrophages amid broader pathogen-specific responses
2025-Feb-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.23.639515
PMID:40060660
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研究论文 | 本研究揭示了人类记忆CD4+T细胞识别结核分枝杆菌感染巨噬细胞的机制及其在结核病免疫中的作用 | 首次在潜伏性结核感染者中量化T细胞对感染巨噬细胞的识别，并通过TCR测序和单细胞转录组学揭示了特异性T细胞克隆的特征 | 研究仅针对潜伏性结核感染者，未涉及活动性结核病患者；使用单核细胞来源的巨噬细胞模型可能不完全反映体内情况 | 探究记忆CD4+T细胞识别结核分枝杆菌感染巨噬细胞的机制及其在结核病免疫保护中的作用 | 潜伏性结核感染者的单核细胞来源巨噬细胞和自体记忆CD4+T细胞 | 免疫学 | 结核病 | T细胞受体测序，单细胞转录组学 | NA | 基因组测序数据，转录组数据 | 潜伏性结核感染者的免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 422 | 2025-10-05 |
Comparison of imaging-based single-cell resolution spatial transcriptomics profiling platforms using formalin-fixed, paraffin-embedded tumor samples
2025-Jan-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5656204/v1
PMID:39877088
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研究论文 | 使用福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样本比较三种成像型单细胞分辨率空间转录组学平台的性能 | 首次系统比较CosMx、MERFISH和Xenium平台在FFPE样本中的表现，并进行像素级手动评估 | 仅使用肺腺癌和胸膜间皮瘤两种肿瘤类型，样本类型有限 | 评估商业空间转录组平台在肿瘤空间生物学研究中的性能差异 | 福尔马林固定石蜡包埋的肺腺癌和胸膜间皮瘤手术切除样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学，RNA测序，多重免疫荧光，HE染色 | NA | 空间转录组数据，图像数据，测序数据 | 肺腺癌和胸膜间皮瘤组织芯片样本 | 10x Genomics, Vizgen, NanoString | 单细胞空间转录组学，空间多组学 | Xenium, MERFISH, CosMx, GeoMx Digital Spatial Profiler | 单细胞分辨率空间转录组平台，包括单模态和多模态版本 |
| 423 | 2025-10-06 |
Identification of prognostic biomarkers for hepatocellular carcinoma based on the m6A RNA modification
2025 Jan-Dec, International journal of immunopathology and pharmacology
IF:3.0Q2
DOI:10.1177/03946320251370847
PMID:41013996
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研究论文 | 本研究通过分析m6A RNA修饰识别肝细胞癌的预后生物标志物 | 基于m6A调节因子的转录谱识别了四种肝细胞癌分子亚型，并建立了稳健的风险预测模型 | NA | 识别肝细胞癌的预后生物标志物 | 肝细胞癌患者数据和肝癌细胞系（Huh7、Hep 3B、Hep G2）及正常肝细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、qRT-PCR | 风险模型 | RNA测序数据、临床数据、单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA-LIHC和ICGC-LIRI-JP数据库的样本及三种肝癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 424 | 2025-10-05 |
Comparison of imaging-based single-cell resolution spatial transcriptomics profiling platforms using formalin-fixed, paraffin-embedded tumor samples
2024-Dec-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.13.628390
PMID:39763763
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研究论文 | 使用福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样本系统比较三种成像型单细胞空间转录组学平台的性能 | 首次使用严格对照实验系统评估商业空间转录组平台在单细胞分辨率下的表现差异 | 研究仅针对特定肿瘤类型（肺腺癌和胸膜间皮瘤），样本量有限 | 比较不同空间转录组学平台在肿瘤研究中的性能差异 | 福尔马林固定石蜡包埋的肺腺癌和胸膜间皮瘤手术切除样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 免疫荧光, RNA测序 | NA | 图像, 转录组数据 | 组织微阵列中的连续5微米切片样本 | CosMx, MERFISH, Xenium | 单细胞空间转录组学, 多重免疫荧光, 数字空间分析 | CosMx, MERFISH, Xenium, GeoMx Digital Spatial Profiler | 单细胞分辨率空间转录组学平台（包括单模态和多模态） |
| 425 | 2025-10-05 |
A specific gene expression program underlies antigen archiving by lymphatic endothelial cells in mammalian lymph nodes
2024-Dec-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5493746/v1
PMID:39711554
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研究论文 | 本研究揭示了淋巴结中淋巴内皮细胞通过特定基因表达程序实现抗原归档的机制 | 首次定义了淋巴内皮细胞抗原归档的独特转录程序，并证明该程序能预测不同疾病状态和物种中的抗原归档能力 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限 | 探究淋巴内皮细胞如何实现持久抗原归档及其独特转录特征 | 淋巴结淋巴内皮细胞和树突状细胞 | 空间转录组学 | 病毒感染（基孔肯雅病毒） | 单细胞测序, 空间转录组学, 机器学习 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 多个时间点的免疫后淋巴结组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 426 | 2025-10-05 |
SPACE: Spatially variable gene clustering adjusting for cell type effect for improved spatial domain detection
2024-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.23.609477
PMID:39229093
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研究论文 | 提出SPACE框架，通过调整细胞类型混杂效应改进空间可变基因聚类，以提升空间域检测精度 | 无需基因簇数量、空间模式或细胞类型信息的先验知识，通过调整细胞类型混杂效应实现空间可变基因的准确聚类 | 未明确说明方法在特定组织类型或数据质量下的性能限制 | 改进空间转录组学中空间可变基因的聚类方法以提升空间域检测准确性 | 空间可变基因(SVGs) | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学分析 | SPACE框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 427 | 2025-10-05 |
FUSION: A web-based application for in-depth exploration of multi-omics data with brightfield histology
2024-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.09.602778
PMID:39026885
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研究论文 | 开发了一个基于网络的工具FUSION，用于深度探索多组学数据与明场组织学的关联分析 | 将分子数据与组织病理学特征整合到单一工作空间，提供端到端的功能性组织单元分析 | NA | 开发一个能够连接分子特征与组织病理学特征的分析平台 | 健康与疾病组织样本的空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习算法 | 全切片图像, 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 福尔马林固定石蜡包埋和冷冻制备的数据集 |
| 428 | 2025-10-05 |
Endothelial POFUT1 controls injury-induced liver fibrosis by repressing fibrinogen synthesis
2024-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.032
PMID:38460791
|
研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞POFUT1通过抑制纤维蛋白原合成控制损伤诱导的肝纤维化的机制 | 首次发现POFUT1通过NOTCH/HES1/STAT3信号通路抑制纤维蛋白原表达，并鉴定纤维蛋白原作为新的促纤维化旁分泌信号激活肝星状细胞 | 研究主要基于小鼠模型，临床相关性仍需进一步验证 | 探究肝窦内皮细胞表达的POFUT1在肝纤维化中的作用机制 | 内皮特异性Pofut1敲除小鼠、肝窦内皮细胞、肝星状细胞、肝硬化患者样本 | 分子生物学 | 肝纤维化/肝硬化 | RNA测序、qPCR、蛋白质印迹、ELISA、组织学分析、电子显微镜、免疫染色、RNA原位杂交 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、组织学图像 | 内皮特异性Pofut1敲除小鼠模型、肝硬化患者和健康个体的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2025-10-05 |
Van Gogh-like 2 is essential for the architectural patterning of the mammalian biliary tree
2024-07, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2024.02.030
PMID:38460794
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研究论文 | 本研究揭示了平面细胞极性蛋白VANGL2在哺乳动物胆管系统结构模式形成中的关键作用 | 首次发现VANGL2通过调控细胞间接触形成和肌动蛋白细胞骨架极化来协调胆管模式形成 | 研究主要基于小鼠胚胎肝脏模型，在人类系统中的直接适用性需要进一步验证 | 阐明胆管板从简单上皮细胞片转变为复杂连接胆管系统的机制 | 小鼠胚胎肝脏胆管上皮细胞 | 发育生物学 | 肝胆疾病 | 单细胞RNA测序,遗传学工具,类器官模型 | NA | 基因表达数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 430 | 2025-10-05 |
Mechanosensitive genomic enhancers potentiate the cellular response to matrix stiffness
2024-Jan-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.10.574997
PMID:38260455
|
研究论文 | 本研究通过表观基因组分析鉴定了一类响应机械微环境的基因组增强子——机械增强子 | 首次发现并定义了一种新型基因组增强子，能够响应细胞外基质硬度的机械信号调控转录 | 机械增强子调控转录的具体分子机制尚未完全阐明 | 探索机械微环境如何通过表观遗传调控影响细胞转录和表型 | 细胞机械微环境与表观遗传调控的相互作用 | 表观遗传学 | NA | 全基因组表观基因组分析, 表观基因组编辑, 单细胞RNA-seq CRISPR筛选 | NA | 表观基因组数据, 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 431 | 2025-10-05 |
Leveraging single-cell transcriptomic data to uncover immune suppressive cancer cell subsets in triple-negative canine breast cancers
2024, Frontiers in veterinary science
IF:2.6Q1
DOI:10.3389/fvets.2024.1434617
PMID:39376916
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研究论文 | 利用单细胞转录组数据识别三阴性犬乳腺癌中的免疫抑制癌细胞亚群 | 首次通过整合分析已发表单细胞测序数据揭示犬三阴性乳腺癌的免疫抑制亚群及其作用机制 | 基于已发表数据集进行二次分析，缺乏原始实验验证 | 鉴定和表征犬三阴性乳腺癌中的免疫抑制癌细胞亚群 | 犬三阴性乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 30只狗分为6组 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2025-10-05 |
Rapid and signal crowdedness-robust in situ sequencing through hybrid block coding
2023-11-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2309227120
PMID:37963245
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研究论文 | 介绍一种名为SPRINTseq的新型原位测序方法，通过混合块编码和分子稀释策略实现快速、高分辨率的空间转录组分析 | 结合混合块编码和分子稀释策略，解决了现有方法在分辨率、灵敏度或速度方面的限制 | NA | 开发改进的空间转录组技术以探索复杂生物过程和疾病机制 | 小鼠大脑冠状切片中的453,843个细胞 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 原位测序 | NA | 空间转录组数据 | 4个小鼠大脑冠状切片中的453,843个细胞，恢复超过1.42亿个转录本 | NA | 空间转录组学,原位测序 | SPRINTseq | 使用108个基因panel的混合块编码和分子稀释策略 |
| 433 | 2025-10-05 |
NMDAR antagonists suppress tumor progression by regulating tumor-associated macrophages
2023-11-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2302126120
PMID:37967215
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研究论文 | 本研究揭示了NMDAR在肿瘤相关巨噬细胞中的免疫抑制作用及其拮抗剂的抗肿瘤潜力 | 首次发现NMDAR激活通过钙内流和活性氧生成驱动肿瘤相关巨噬细胞的免疫抑制功能，并证明NMDAR拮抗剂可逆转此过程 | 研究主要聚焦于肝细胞肉瘤和纤维肉瘤模型，尚未验证其他肿瘤类型 | 探究NMDAR在肿瘤微环境中对巨噬细胞的调控机制及治疗潜力 | 肿瘤相关巨噬细胞、T细胞、NK细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞肉瘤、纤维肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 434 | 2025-10-05 |
Controlling donor and newborn neuron migration and maturation in the eye through microenvironment engineering
2023-11-14, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2302089120
PMID:37931105
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研究论文 | 通过微环境工程控制供体和新生神经元在眼中的迁移与成熟 | 建立了'计算模拟-体外实验-体内验证'框架，首次利用单细胞转录组数据筛选出SDF1作为引导分子，在视网膜中构建人工梯度显著促进神经元迁移 | 研究仅聚焦于视网膜神经节细胞，未验证该方法在其他神经元类型或脑区的普适性 | 开发控制移植后供体细胞行为的精准方法，促进神经元整合 | 视网膜神经节细胞（RGCs） | 神经科学 | 青光眼 | 单细胞转录组测序，计算机模拟分析，体外功能实验 | NA | 基因表达数据，细胞迁移数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 435 | 2025-10-05 |
A cellular and molecular spatial atlas of dystrophic muscle
2023-07-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2221249120
PMID:37410813
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研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞RNA测序数据，构建了营养不良肌肉的高分辨率细胞和分子空间图谱 | 首次将空间转录组学与单细胞RNA测序相结合，揭示了DMD肌肉中细胞群体的非均匀分布和异步再生特征 | 研究基于D2-mdx小鼠模型，结果向人类DMD的转化需要进一步验证 | 研究杜氏肌营养不良症中异步肌肉再生对疾病进展的生物学机制 | 严重营养不良的D2-mdx小鼠模型的肌肉组织 | 空间生物学 | 杜氏肌营养不良症 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据, 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 436 | 2025-10-05 |
Integrative in situ mapping of single-cell transcriptional states and tissue histopathology in a mouse model of Alzheimer's disease
2023-03, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01251-x
PMID:36732642
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研究论文 | 开发STARmap PLUS方法，结合空间转录组学和蛋白质检测，绘制阿尔茨海默病小鼠模型的单细胞转录状态与组织病理学图谱 | 首次实现高分辨率空间转录组学与蛋白质检测在同一组织切片中的整合，揭示淀粉样斑块周围的核心-壳结构细胞分布 | 仅在阿尔茨海默病小鼠模型中验证，样本量有限 | 研究阿尔茨海默病发病机制中的时空细胞和分子变化 | 阿尔茨海默病小鼠模型的脑组织 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，蛋白质检测 | NA | 空间转录组数据，蛋白质表达数据，组织图像 | 8月龄和13月龄阿尔茨海默病小鼠脑组织 | NA | 空间转录组学 | STARmap PLUS | 高分辨率空间转录组学与蛋白质检测整合方法 |
| 437 | 2025-10-05 |
Decoding molecular and cellular heterogeneity of mouse nucleus accumbens
2021-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00938-x
PMID:34663959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重错误鲁棒荧光原位杂交技术，构建了小鼠伏隔核的细胞图谱，揭示了其细胞异质性 | 首次结合单细胞转录组和空间信息构建小鼠伏隔核的细胞分类系统，揭示了神经元亚型的转录和空间多样性 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他物种中验证 | 解析小鼠伏隔核的分子、细胞和解剖异质性 | 小鼠伏隔核脑区 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 多重错误鲁棒荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 438 | 2025-09-30 |
Single-cell transcriptomics unveils iron dysregulation in macrophages: Implicated genes in periodontitis pathogenesis identified via Mendelian randomization
2026-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101544
PMID:41019505
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 439 | 2025-09-30 |
Uncovering stromal cell fate genes and a novel risk stratification in UCEC by integrating single-cell RNA sequencing and multi-omics analysis
2026-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101743
PMID:41019513
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 440 | 2025-10-05 |
Activated MAFB in ovarian cancer promotes cytoskeletal remodeling and immune microenvironment suppression by interfering with m6A modifications through WTAP competition
2025-Oct, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03522-w
PMID:40796955
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研究论文 | 本研究揭示了MAFB通过竞争性结合WTAP干扰m6A修饰，促进卵巢癌细胞骨架重塑和免疫微环境抑制的新机制 | 首次发现MAFB通过竞争性结合m6A甲基转移酶复合物核心组分WTAP，建立MAFB-WTAP-CD55调控轴，连接转录调控与表观转录组修饰 | NA | 探索卵巢癌免疫逃逸的分子机制 | 卵巢癌 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个临床队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |