单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32278 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 421 | 2025-10-31 |
SpateCV: cross-modality alignment regularization of cell types improves spatial gene imputation for spatial transcriptomics
2025-Oct-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07245-0
PMID:41162996
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 422 | 2025-11-02 |
Single-cell spatial transcriptomics reveal intraglomerular cell activation and ligand-receptor relationships in chronic, active antibody mediated rejection
2025-Oct-29, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.042
PMID:41173191
|
研究论文 | 利用单细胞空间转录组技术揭示慢性活动性抗体介导排斥反应中肾小球内细胞激活状态和配体-受体关系 | 首次在单细胞分辨率下应用空间转录组技术解析CAMR中肾小球内细胞的空间分子相互作用 | 样本量有限，仅分析福尔马林固定石蜡包埋肾活检组织 | 阐明慢性活动性抗体介导排斥反应的分子机制 | 肾移植患者活检组织中的肾小球内皮细胞、自然杀伤细胞和巨噬细胞 | 空间转录组学 | 肾移植排斥反应 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | CAMR患者和对照组的肾活检组织 | NA | 单细胞空间转录组学 | CosMx Spatial Molecular Imager | CosMx空间分子成像仪 |
| 423 | 2025-11-02 |
Recent Advances and Applications of Single-cell Sequencing in Insects
2025-Oct-29, Current opinion in insect science
IF:5.8Q1
DOI:10.1016/j.cois.2025.101455
PMID:41173389
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在昆虫科学研究中的最新进展与应用 | 展示了单细胞多组学技术如何将昆虫科学从基础描述转向功能机制研究，并展望了高通量空间转录组学的潜力 | NA | 探讨单细胞基因组学在昆虫生物学研究中的应用与未来发展 | 昆虫生理、发育、免疫和进化过程 | 基因组学 | NA | 单细胞测序，单细胞多组学，空间转录组学 | 深度学习算法 | 基因组数据，转录组数据，表观基因组数据，蛋白质组数据，代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞多组学，空间转录组学 | NA | NA |
| 424 | 2025-11-02 |
Exhausted KLRG1hi CD8+ T and Pathogenic GZMA+ Th17 Cells Are Associated with the Mild Mycoplasma pneumoniae Pneumonia in Children
2025-Oct-29, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2025.106642
PMID:41173398
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和高维流式细胞术分析儿童轻度肺炎支原体肺炎中T细胞和B淋巴细胞的功能障碍 | 首次在MPP患儿中系统表征耗竭性KLRG1hi CD8+ T细胞和致病性GZMA+ Th17细胞的免疫特征 | 研究仅针对轻度肺炎患者且为单中心研究，样本量有限 | 探究适应性免疫在儿童轻度肺炎支原体肺炎发病机制中的作用 | 儿童轻度肺炎支原体肺炎患者的外周T淋巴细胞和B淋巴细胞 | 单细胞生物学 | 肺炎支原体肺炎 | 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 425 | 2025-11-02 |
Mitochondrial-activity-driven hematopoietic stem cell fate and lineage choice is first established in the aorta-gonad-mesonephros
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116296
PMID:40966086
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠胚胎主动脉-性腺-中肾区域中线粒体活性动态变化驱动造血干细胞和祖细胞功能异质性的机制 | 首次证明胚胎发育早期线粒体活性差异决定造血干细胞谱系选择倾向，并阐明了Wnt和PI3K信号通路在此过程中的作用机制 | 研究主要基于小鼠胚胎模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究线粒体代谢在胚胎造血干细胞发育过程中的作用机制 | 小鼠胚胎主动脉-性腺-中肾区域的造血干细胞和祖细胞 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组测序, 药理学干预, 遗传学方法, 体外功能实验, 体内功能实验 | NA | 基因表达数据, 功能实验数据 | 小鼠胚胎造血干细胞和祖细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 426 | 2025-11-02 |
Single-cell analysis uncovers preserved prostate cancer lineages and universally altered pathways in Matrigel-free patient-derived organoids
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116352
PMID:41037396
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析无基质胶的前列腺癌患者来源类器官，揭示了其细胞异质性和保留的患者特异性癌细胞谱系 | 发现无基质胶培养条件能更好地保留前列腺癌患者特异性细胞谱系，建立了前列腺类器官单细胞图谱(PPScA)，重新定义了细胞类型标志物 | 研究主要关注短期培养，对长期培养效果和临床转化价值需要进一步验证 | 改进前列腺癌患者来源类器官的培养方法并研究其细胞生物学特性 | 前列腺癌患者来源类器官 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 427 | 2025-11-02 |
scRNA-seq reveals persistent aberrant differentiation of nasal epithelium driven by TNFα and TGFβ in post-COVID syndrome
2025-Oct-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64778-0
PMID:41152229
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示TNFα和TGFβ驱动的新冠后综合征患者鼻上皮持续异常分化的分子机制 | 首次发现新冠后综合征的持续症状并非由持续病毒载量驱动，而是由免疫细胞活性和慢性细胞因子产生导致，并确定了TNFα-TGFβ轴的关键作用 | 样本量相对有限（25例患者），仅针对鼻上皮组织进行研究 | 探究新冠后综合征的分子机制和潜在治疗策略 | 25名中度或重度新冠后综合征患者的鼻活检组织 | 单细胞转录组学 | 新冠后综合征 | 单细胞RNA测序，气液界面培养 | NA | 单细胞转录组数据 | 25例新冠后综合征患者鼻活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 428 | 2025-11-02 |
Mapping NK cell diversity in response to COVID-19 and mRNA vaccination
2025-Oct-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11575-w
PMID:41152298
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了NK细胞在COVID-19重症患者和mRNA疫苗接种者中的多样性形成机制 | 发现外周NK细胞发育存在分叉路径，适应性NK细胞在COVID-19恢复期通过克隆扩增和线粒体氧化磷酸化增强形成 | 样本来源仅限于血液NK细胞，未涉及组织驻留NK细胞的研究 | 探索NK细胞功能异质性的形成机制及其在免疫应答中的作用 | COVID-19重症患者、BNT162b2疫苗接种者和健康捐赠者的血液NK细胞 | 免疫学 | COVID-19 | scRNA-seq | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | COVID-19重症患者（急性期和ICU后）、mRNA疫苗接种者、健康捐赠者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 429 | 2025-11-02 |
Deletion of cardiac fibroblast growth factor-23 beneficially impacts myocardial energy metabolism in left ventricular hypertrophy
2025-Oct-28, npj metabolic health and disease
DOI:10.1038/s44324-025-00087-w
PMID:41152461
|
研究论文 | 本研究通过特异性敲除心肌细胞中的Fgf23基因，探讨心脏FGF23在左心室肥厚中的作用及其对心肌能量代谢的影响 | 首次揭示心脏特异性FGF23缺失通过调节葡萄糖转运和脂肪酸氧化改善心肌能量代谢 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 阐明心脏FGF23在左心室肥厚发展中的具体作用机制 | 心肌细胞特异性Fgf23敲除小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 空间代谢组学, 空间转录组学, 基因敲除技术 | 小鼠疾病模型 | 分子生物学数据, 代谢组学数据, 转录组学数据 | 实验小鼠模型 | NA | 空间代谢组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 430 | 2025-11-02 |
Evidence from spatial transcriptomics for the mosaic hypothesis and pure cell types in the cortex
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116363
PMID:41045459
|
研究论文 | 通过空间转录组学数据验证大脑皮层中神经元类型的镶嵌假说和纯细胞类型 | 开发了针对空间转录组数据的统计点过程分析框架，首次在大脑皮层中系统验证了神经元空间回避现象 | 仅在大脑皮层中进行了验证，未涉及其他脑区；空间回避原则的普适性仍需进一步研究 | 验证大脑皮层神经元是否存在类似视网膜的镶嵌分布模式 | 大脑皮层兴奋性和抑制性神经元 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 统计点过程分析框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 431 | 2025-11-02 |
Emergence of endothelial subtypes and role of cell cycle control in arterial-venous specification during embryonic vascular development
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116368
PMID:41066228
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了胚胎血管发育过程中内皮细胞亚型的出现及细胞周期控制在动静脉分化中的关键作用 | 首次在胚胎发育早期阶段系统揭示了细胞周期状态与动静脉分化的直接关联，并利用Fucci胚胎模型验证了不同细胞周期阶段的内皮细胞具有特定的转录特征 | 研究主要聚焦于胚胎发育早期阶段（E8.0-E9.5），未涉及更晚期的发育过程 | 探究细胞周期控制在胚胎血管发育过程中动静脉分化中的作用机制 | 小鼠胚胎内皮细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，Fucci荧光标记技术 | NA | 基因表达数据，成像数据 | E8.0、E8.5和E9.5三个时间点的胚胎内皮细胞 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2025-11-02 |
Stomach encyclopedia: Combined single-cell and spatial transcriptomics reveal cell diversity and homeostatic regulation of human stomach
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116503
PMID:41100257
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 433 | 2025-11-02 |
Molecular and cellular characterization of planarian stem cell microenvironments
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116401
PMID:41101313
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术对涡虫干细胞微环境进行分子和细胞特征分析 | 首次发现并命名了与涡虫干细胞相关的分泌细胞'hecatonoblasts'，揭示了肠道细胞对干细胞位置和功能的远程调控作用 | 研究局限于淡水涡虫模型，机制在其他再生生物中的普适性有待验证 | 探究高再生能力生物中支持干细胞功能的调控机制 | 淡水涡虫Schmidtea mediterranea的干细胞及其微环境 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，电子显微镜 | NA | 空间基因表达数据，显微图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 434 | 2025-11-02 |
Medullary stromal cells define small intestinal lymph node identity in humans and mice
2025-Oct-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116441
PMID:41105512
|
研究论文 | 本研究揭示了小肠引流淋巴结髓质中基质细胞群在定义肠道淋巴结区域特性中的关键作用 | 发现淋巴结髓质中特定的基质细胞网络是驱动小肠淋巴结结构形成的关键因素，并鉴定维生素A是这一过程的核心驱动因子 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究肠道不同区域淋巴结免疫特性差异的形成机制 | 人类和小鼠的肠道引流淋巴结 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序，成像技术 | NA | 基因表达数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 435 | 2025-11-02 |
Osteopontin inhibitor alleviates neuroinflammation after subarachnoid hemorrhage in rats via TLR4/NF-κB pathway
2025-Oct-27, Brain research bulletin
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨骨桥蛋白抑制剂通过TLR4/NF-κB通路减轻大鼠蛛网膜下腔出血后神经炎症的作用 | 首次通过单细胞RNA测序发现SAH大鼠颞叶组织中SPP1(OPN)显著增加，并验证OPN抑制剂可通过TLR4/NF-κB通路改善认知障碍和血脑屏障通透性 | 研究仅使用大鼠模型，样本量未明确说明，缺乏临床验证 | 研究骨桥蛋白抑制剂对蛛网膜下腔出血后神经炎症的保护作用 | SD大鼠蛛网膜下腔出血模型 | 神经科学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序，脑立体定位脑室注射，免疫荧光 | 动物模型 | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 436 | 2025-11-02 |
SRSF1 is essential for pancreatic β-cell proliferation and the maintenance of glucose homeostasis in mice
2025-Oct-24, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2025.156421
PMID:41138848
|
研究论文 | 本研究揭示了SRSF1通过MYC介导的通路对胰腺β细胞增殖和葡萄糖稳态维持的关键作用 | 首次阐明SRSF1在β细胞增殖中的核心调控功能及其通过MYC表达调控的作用机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究SRSF1在胰腺β细胞增殖和葡萄糖调控中的作用机制 | 胰腺β细胞特异性SRSF1敲除小鼠模型 | 分子生物学 | 糖尿病 | RNA-seq, scRNA-seq, 免疫染色, 葡萄糖耐量测试 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织切片图像, 生理指标数据 | 不同年龄段的基因敲除和对照小鼠胰岛组织 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 437 | 2025-11-02 |
CCR2-driven monocyte recruitment is protective against radiotherapy-induced intestinal toxicity
2025-Oct-24, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.10.008
PMID:41171691
|
研究论文 | 本研究揭示了CCR2驱动的单核细胞募集通过IL-17通路减轻放疗诱导的肠道毒性的保护机制 | 首次发现CCR2介导的单核细胞募集在限制放疗肠道损伤中的关键作用，并阐明其通过调节ILC3细胞产生IL-17维持肠道屏障完整性的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究放疗诱导肠道毒性的免疫调节机制 | 小鼠肠道组织及免疫细胞 | 免疫学 | 肠道放射损伤 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 438 | 2025-11-02 |
From plasma proteomics Mendelian randomization to neuropathological validation: The potential role of CTSH-GRN-TMEM106B and TREM2-IL-34 networks of microglia in Alzheimer's disease
2025-Oct-23, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178297
PMID:41138838
|
研究论文 | 本研究通过双向孟德尔随机化框架结合神经病理学验证，揭示了外周生物标志物与阿尔茨海默病之间的因果关系及小胶质细胞相关调控网络 | 首次采用双向孟德尔随机化方法系统分析血浆、脑脊液和脑组织蛋白质与AD的因果关系，并通过单细胞转录组和神经病理学验证构建了小胶质细胞CTSH-GRN-TMEM106B和TREM2-IL-34调控网络 | 研究主要基于遗传工具变量和回顾性样本，需要进一步功能实验验证分子机制 | 阐明外周生物标志物与阿尔茨海默病中枢系统之间的因果关系和潜在机制 | 血浆蛋白(734种)、脑脊液蛋白(151种)、脑组织蛋白(1296种)及AD患者尸检脑组织 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 蛋白质相互作用分析 | 双向孟德尔随机化模型, PPI网络分析 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 免疫组织化学图像 | 734种血浆蛋白、151种脑脊液蛋白、1296种脑蛋白及AD尸检脑组织标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 前额叶皮层单细胞转录组测序 |
| 439 | 2025-11-02 |
StarCDP: Dynamic Programming Algorithms for Fast and Accurate Cell Lineage Tree Reconstruction from CRISPR-Based Lineage Tracing Data
2025-Oct-23, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666251386082
PMID:41173524
|
研究论文 | 提出Star-CDP动态规划算法，用于从CRISPR谱系追踪数据中快速准确地重建细胞谱系树 | 开发了基于动态规划的算法，能在约束搜索空间内寻找、计数、采样和构建共识树，相比现有方法具有更高可扩展性和准确性 | 研究显示标准数据处理流程可能影响迁移/再播种的相对性能评估 | 解决细胞谱系树重建中系统发育信号不一致的技术限制 | CRISPR诱导突变的细胞谱系数据 | 生物信息学 | 肺腺癌 | CRISPR谱系追踪，单细胞RNA测序 | 动态规划算法 | 基因突变数据 | 小鼠模型数据 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 440 | 2025-11-02 |
Comprehensive noise reduction in single-cell data with the RECODE platform
2025-Oct-20, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101178
PMID:40967209
|
研究论文 | 本研究升级了RECODE平台，通过新增iRECODE功能和技术扩展，为单细胞数据提供全面的噪声降低解决方案 | 开发了iRECODE功能可同时降低技术和批次噪声，并将RECODE适用范围扩展到单细胞Hi-C和空间转录组学等多种单细胞模态 | NA | 解决单细胞测序数据中的技术噪声和批次效应问题 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞Hi-C, 空间转录组学 | 基于高维统计的算法 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞Hi-C, 空间转录组学 | RECODE平台 | RECODE技术噪声降低平台，包含iRECODE批次噪声降低功能 |