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当前共找到 38047 篇文献，本页显示第 4361 - 4380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4361 | 2026-01-28 |
TREM2 Impedes Recovery After Spinal Cord Injury by Regulating Microglial Lysosomal Membrane Permeabilization-Mediated Autophagy
2025-Oct, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70047
PMID:40320759
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研究论文 | 本研究探讨了TREM2在脊髓损伤后通过调节小胶质细胞溶酶体膜通透性介导的自噬来影响恢复的机制 | 首次揭示了TREM2通过调节小胶质细胞溶酶体膜通透性介导的自噬在脊髓损伤恢复中的具体作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化需进一步验证 | 探究TREM2在脊髓损伤中的潜在机制及其对小胶质细胞功能的影响 | 野生型和Trem2敲除小鼠的小胶质细胞，以及脊髓损伤模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序，免疫荧光，3D步态分析，运动诱发电位实验，H&E染色，Masson染色 | NA | 测序数据，图像数据，行为数据 | 野生型和Trem2敲除小鼠在脊髓损伤前后的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4362 | 2026-01-28 |
Identification of type 2 diabetes- and obesity-associated human β-cells using deep transfer learning
2025-Sep-22, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96713
PMID:40982369
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研究论文 | 本研究利用深度迁移学习工具DEGAS，通过单细胞RNA-seq数据识别与2型糖尿病和肥胖相关的人类β细胞亚群 | 应用深度迁移学习工具DEGAS将疾病关联映射到单细胞RNA-seq数据，首次识别出与2型糖尿病和肥胖相关的独特β细胞亚群，并验证了CDKN1C和DLK1基因的表达差异 | 研究仅基于现有单细胞RNA-seq数据，未来需要扩展到更多人类胰岛组学数据集以揭示复杂的多细胞相互作用 | 优先识别与疾病相关的β细胞亚群，以更好地理解2型糖尿病发病机制并确定靶向治疗的相关基因 | 人类胰腺胰岛β细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA-seq | 深度迁移学习 | 单细胞RNA-seq数据 | 来自健康和非糖尿病捐赠者的人类胰腺切片 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4363 | 2026-01-28 |
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.30.651101
PMID:40475445
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研究论文 | 本研究优化了单细胞长读长测序协议，以提升胰腺胰岛中异构体的检测能力 | 通过优化5'文库制备协议和靶向耗竭胰岛素转录本，提高了单细胞长读长测序的读长和转录本检测效率 | 单细胞长读长测序存在技术挑战，如读长不足和错误率较高 | 优化单细胞长读长测序协议，以增强胰腺胰岛中异构体的检测 | 胰腺胰岛细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞长读长RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4364 | 2026-01-28 |
Investigating Gene Expression Noise Reduction by MicroRNAs and MiRISC Reinforcement by Self-Feedback Regulation of mRNA Degradation
2025-Sep-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.11.637731
PMID:39990448
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研究论文 | 本研究通过数学建模和单细胞RNA-seq数据分析，探讨了microRNA通过负自反馈调控mRNA降解来降低基因表达噪声的机制 | 首次同时分析mRNA降解动力学和表达噪声，并证明通过mRNA降解的自反馈调控可以降低噪声 | NA | 研究microRNA介导的基因表达噪声减少机制 | microRNA诱导的沉默复合体（miRISC）及其靶向的mRNAs | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 数学建模 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4365 | 2026-01-28 |
Uncovering the Signatures of Cellular Senescence in the Human Dorsolateral Prefrontal Cortex
2025-Feb-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639091
PMID:40027780
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和单核RNA测序技术，构建了人类背外侧前额叶皮层衰老和细胞衰老的转录组图谱 | 结合Visium空间转录组学和单核RNA测序，首次在非病理人类组织中系统揭示了背外侧前额叶皮层细胞衰老的异质性和细胞类型特异性特征 | 研究基于非病理组织，可能未完全反映疾病状态下的衰老特征；细胞衰老的罕见性和异质性仍带来识别挑战 | 探索人类背外侧前额叶皮层在衰老过程中的细胞衰老特征和转录组变化 | 人类背外侧前额叶皮层的非病理组织样本 | 数字病理学 | 老年疾病 | 空间转录组学，单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据，单核RNA测序数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 10x Visium，10x Chromium | Visium空间转录组学用于空间基因表达分析，单核RNA测序用于细胞类型特异性转录组分析 |
| 4366 | 2026-01-28 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Dec, Advances in neural information processing systems
DOI:10.52202/079017-1129
PMID:41551654
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研究论文 | 本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过提供子图块图像的基因组特征，弥补了现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷 | STimage-1K4M数据集首次将空间转录组学数据与组织病理学图像结合，为子图块区域提供高维基因表达信息，实现了前所未有的数据粒度 | 数据集仅包含1,149张图像，可能无法覆盖所有病理类型或变异，且基因表达维度较高可能增加计算复杂度 | 旨在推动多模态数据分析在计算病理学等领域的先进研究 | 空间转录组学数据衍生的组织病理学图像及其对应的基因表达信息 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像、基因表达数据 | 1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4367 | 2026-01-28 |
UBR7 E3 Ligase Suppresses Interferon-β Mediated Immune Signaling by Targeting Sp110 in Hepatitis B Virus-Induced Hepatocellular Carcinoma
2024-11-08, ACS infectious diseases
IF:4.0Q1
DOI:10.1021/acsinfecdis.4c00213
PMID:38938101
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研究论文 | 本研究揭示了E3泛素连接酶UBR7通过泛素化Sp110蛋白，抑制I型干扰素信号通路，从而促进乙型肝炎病毒（HBV）持续感染和HBV诱导的肝细胞癌（HCC）发生的新机制 | 首次发现UBR7在非组蛋白（Sp110）泛素化中的新功能，并阐明其通过下调I型干扰素反应促进HBV持续感染和HCC发生的分子机制 | 研究主要基于体外细胞模型和患者样本分析，缺乏体内动物模型验证；UBR7-Sp110轴在HCC发生发展中的具体调控网络仍需进一步探索 | 探究UBR7在HBV诱导的肝细胞癌发生中的作用机制 | 乙型肝炎病毒（HBV）、肝细胞癌（HCC）细胞、HCC患者样本 | 分子生物学与肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq、转录组学分析、基因敲低 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | HCC患者样本（具体数量未明确说明） | NA | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq | NA | NA |
| 4368 | 2026-01-28 |
Meta-atlas of Juvenile and Adult Enteric Neuron scRNA-seq for Dataset Comparisons and Consensus on Transcriptomic Definitions of Enteric Neuron Subtypes
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.31.621315
PMID:39574584
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研究论文 | 本文通过整合多个小鼠肠道神经系统单细胞RNA测序数据集，构建了一个元图谱，旨在识别新的细胞类型、共享标记基因，并达成对肠道神经元亚型转录组定义的共识 | 首次系统整合多个独立的小鼠肠道神经系统scRNA-seq数据集，生成共识元图谱，以改善罕见神经元类别的分辨率，并连接转录组谱与历史分类系统 | 数据集依赖于不同的细胞分离和文库生成方法，可能导致细胞类型检测差异；未来研究需将深度转录组谱与历史分类系统更紧密连接 | 通过整合scRNA-seq数据集，达成对肠道神经元亚型转录组定义的共识，并提高罕见神经元类别的检测能力 | 小鼠肠道神经系统中的神经元 | 单细胞转录组学 | 肠道动力障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个独立数据集，涉及数百至数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4369 | 2026-01-28 |
Adding Highly Variable Genes to Spatially Variable Genes Can Improve Cell Type Clustering Performance in Spatial Transcriptomics Data
2024-Oct-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5315913/v1
PMID:39502778
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研究论文 | 本研究探讨在空间转录组学数据中，将高变异基因与空间变异基因结合是否能提升细胞类型聚类性能 | 首次系统评估高变异基因与空间变异基因联合使用对细胞类型聚类的影响，覆盖多个平台和超过50个真实数据集 | 未详细探讨基因选择方法对聚类结果的具体影响机制，可能受数据集异质性限制 | 提高空间转录组学数据中细胞类型聚类的准确性和效率 | 空间转录组学数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学技术 | NA | 转录组数据 | 超过50个真实空间转录组学数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4370 | 2026-01-28 |
STimage-1K4M: A histopathology image-gene expression dataset for spatial transcriptomics
2024-Jun-20, ArXiv
PMID:38947920
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研究论文 | 本研究介绍了STimage-1K4M数据集，该数据集通过空间转录组学数据提供子图块图像的基因组特征，以弥补现有医学图像-文本数据集中文本描述不足的缺陷 | STimage-1K4M是首个将病理图像子图块与高维基因表达数据（15,000-30,000维）配对的大规模数据集，提供了前所未有的空间分辨率，支持多模态数据分析的深入研究 | 数据集中仅包含1,149张原始图像，且基因表达数据维度较高，可能对计算资源要求较高，同时未提及数据来源的具体疾病类型或样本多样性 | 旨在通过提供细粒度的图像-基因表达配对数据，推动计算病理学和多模态算法的发展 | 空间转录组学数据中的病理图像及其对应的基因表达信息 | 计算病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 图像和基因表达数据 | 1,149张图像，分解为4,293,195个子图块-基因表达对 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4371 | 2026-01-27 |
KCMF1 regulates HRI ubiquitination to inhibit the integrated stress response in ovarian cancer
2026-Mar, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117634
PMID:41391693
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研究论文 | 本研究探讨了钾通道调节因子1（KCMF1）在卵巢癌中的生物学功能及其通过调节HRI泛素化抑制整合应激反应（ISR）的机制 | 首次揭示了KCMF1通过调控HRI泛素化抑制ISR通路促进卵巢癌进展的新机制，并鉴定出Plantainoside D作为新型KCMF1抑制剂 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，缺乏临床患者样本的深入验证 | 探究KCMF1在卵巢癌中的生物学功能及分子机制 | 卵巢癌细胞系、异种移植小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、qRT-PCR、免疫组化、Western blot、Ni-NTA pull-down | 异种移植小鼠模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、组织图像 | 未明确样本数量，使用细胞系和动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4372 | 2026-01-27 |
Dissecting Heterogeneity Reveals Functional Subpopulation of Stem Cells From Human Exfoliated Deciduous Teeth
2026-Feb, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.104014
PMID:41202532
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术鉴定了人脱落乳牙干细胞的功能亚群，并揭示了其血管生成和软骨生成能力 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定了SHEDs中的BAMBI⁺功能亚群，并证实其具有更强的增殖、软骨生成和血管生成能力 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内验证；样本来源有限，可能影响结果的普适性 | 鉴定人脱落乳牙干细胞的功能亚群表面标记，为干细胞精细化应用提供理论基础 | 人脱落乳牙干细胞（SHEDs） | 单细胞组学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qPCR、Western blot、组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4373 | 2026-01-27 |
Temporal single-cell landscape suggests infection-induced IgM plasma cells as a correlate of durable influenza immunity
2026-Feb, International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.ijid.2025.108227
PMID:41242688
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和BCR数据分析，比较了自然感染与疫苗接种后B细胞反应的差异，揭示了感染诱导的IgM⁺浆细胞群在持久免疫中的潜在作用 | 首次在单细胞水平上全面比较了流感自然感染与疫苗接种后的B细胞反应，识别出感染特有的、具有持续HLA-II表达的IgM⁺浆细胞群，并揭示了感染与疫苗接种在干扰素刺激基因表达、克隆多样性及时间动态上的关键差异 | 样本量较小（仅7名个体），且仅针对H3N2流感病毒，可能限制了结果的普遍适用性 | 比较流感自然感染与疫苗接种后B细胞反应的差异，以探索持久免疫的相关因素 | 人类B细胞 | 单细胞组学 | 流感 | 单细胞转录组测序，BCR测序 | NA | 单细胞转录组数据，BCR序列数据 | 7名个体（3名自然H3N2感染者，4名四价疫苗接种者），共150,131个B细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4374 | 2026-01-27 |
FAST: Scalable Factor Analysis for Spatial Dimension Reduction of Multi-section Spatial Transcriptomics
2026-Jan-24, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag006
PMID:41581212
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研究论文 | 本文开发了一种名为FAST的可扩展因子分析模型，用于多切片空间转录组数据的空间降维处理 | FAST模型能同时处理多切片计数数据，并利用局部空间依赖性进行可扩展计算，是唯一能在2小时内分析超过230万个空间位置数据的方法 | 论文未明确说明模型在处理极高维度或噪声数据时的具体限制 | 开发高效可扩展的空间降维方法以处理大规模多切片空间转录组数据 | 空间转录组数据，包括模拟数据集、真实数据集（小鼠胚胎Stereo-seq数据和乳腺癌Xenium数据） | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学技术 | 概率因子分析模型 | 空间转录组计数数据 | 超过230万个空间位置（来自小鼠胚胎Stereo-seq数据集） | NA | 空间转录组学 | Stereo-seq, Xenium | 小鼠胚胎Stereo-seq数据集和乳腺癌Xenium数据集 |
| 4375 | 2026-01-27 |
Endothelial stem cells of the retinal vasculature reside in the optic nerve
2026-Jan-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68201-6
PMID:41577708
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、集落形成实验和谱系追踪分析，揭示了视网膜血管内皮细胞由视神经中的干细胞/祖细胞库供应的新调控系统 | 首次发现视神经中存在视网膜血管内皮细胞的干细胞/祖细胞库，为视网膜血管供应提供了新的调控机制 | NA | 研究视网膜血管内皮细胞的维持和修复机制 | 视网膜血管内皮细胞和视神经中的干细胞/祖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 集落形成实验, 谱系追踪分析 | NA | RNA测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4376 | 2026-01-27 |
Functional characterization of angiogenesis genes in hepatocellular carcinoma via integrated bulk and single cell RNA sequencing
2026-Jan-22, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-32891-1
PMID:41577808
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研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据，系统研究了肝细胞癌中血管生成相关基因的表达变化，构建了预后预测模型，并探索了潜在的治疗靶点和药物 | 首次整合bulk和单细胞转录组数据，全面探索血管生成与整合应激反应（ISR）交叉基因的功能，并构建了可用于评估患者预后和免疫治疗反应的预测模型 | 未明确说明样本的具体数量或来源，且药物发现部分主要基于计算模拟，需要后续实验验证 | 系统研究肝细胞癌中血管生成相关基因的功能，构建预后模型并探索潜在治疗靶点 | 肝细胞癌（HCC） | 数字病理学 | 肝癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, WGCNA, 分子对接 | 预后预测模型, 药物反应模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4377 | 2026-01-27 |
Immunometabolic reprogramming and β-cell dedifferentiation: Integrated mechanisms driving type 2 diabetes progression
2026-Jan-19, Diabetes research and clinical practice
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.diabres.2026.113111
PMID:41564941
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综述 | 本文综述了2型糖尿病进展中免疫代谢重编程与β细胞去分化之间的整合机制，强调了代谢过载和慢性炎症在驱动β细胞身份丧失中的作用 | 提出了“β细胞身份时钟”概念框架，以捕捉β细胞在应激适应、功能下降和身份丧失过程中的动态和潜在可逆性转变 | 作为一篇综述文章，主要基于现有证据进行综合，未提供新的原始实验数据，且部分机制仍需进一步验证 | 阐明2型糖尿病进展中代谢和免疫通路如何汇聚于β细胞命运的关键分子调控因子，并探讨新兴治疗策略 | 胰腺β细胞及其在代谢和免疫应激下的身份转变过程 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞转录组学、代谢谱分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4378 | 2026-01-27 |
Discovery of Anoikis-correlated Biomarkers for Ovarian Cancer Through Integrated Transcriptome and Single-cell RNA Sequencing Analyses
2026-Jan-15, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序分析，发现了与卵巢癌免疫浸润和药物敏感性相关的两个失巢凋亡相关生物标志物STAT3和BCL2L1 | 整合了批量转录组学和单细胞RNA测序数据，识别出与失巢凋亡相关的生物标志物，并关联了免疫浸润和药物敏感性 | 需要通过功能和临床实验进一步验证STAT3/BCL-xL轴靶向和联合免疫治疗的策略 | 识别卵巢癌的精确可靠预后生物标志物 | 卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序 | LASSO回归，支持向量机-递归特征消除 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4379 | 2026-01-27 |
GLP-1 Targeting Agents Impair Chemoimmunotherapy Effectiveness in Triple-Negative Breast Cancer
2026-Jan-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8380296/v1
PMID:41542041
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研究论文 | 本研究评估了GLP-1R在多种人类肿瘤中的表达，并发现GLP-1靶向药物会通过作用于肿瘤细胞和免疫细胞，损害三阴性乳腺癌化疗免疫疗法的疗效 | 首次全面评估了GLP-1R在人类肿瘤中的表达和活性，并揭示了GLP-1暴露会重塑肿瘤微环境、促进恶性细胞间质转化并破坏巨噬细胞炎症，从而损害化疗免疫疗法效果 | NA | 研究GLP-1R靶向药物对三阴性乳腺癌化疗免疫疗法疗效的影响 | 多种人类肿瘤类型，重点关注三阴性乳腺癌 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、临床病理数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4380 | 2026-01-27 |
Imputation integrates single-cell and spatial gene expression data to resolve transcriptional networks in barley shoot meristem development
2026-Jan, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02176-6
PMID:41501532
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研究论文 | 本文通过整合深度单细胞RNA测序和空间基因表达数据，研究了大麦发育过程中的转录变化，从分生组织和器官创始细胞的指定到不同花器官的起始 | 采用一种整合单细胞RNA测序与空间基因表达数据的插补方法，实现了在细胞分辨率下分析超过40,000个基因的表达谱，并通过BARVISTA网络图形界面进行虚拟微解剖 | 当前技术无法完全实现基因表达谱的精确时空信息，可能影响对局部微环境的理解 | 解析大麦分生组织发育中的转录网络，以理解复杂发育过程的遗传基础 | 大麦分生组织和器官创始细胞，包括花器官的起始和发育 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 多个大麦组织中的超过40,000个基因 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |