单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4361	2025-02-03	Pulmonary Aerosol Delivery of Let-7b microRNA Confers a Striking Inhibitory Effect on Lung Carcinogenesis through Targeting the Tumor Immune Microenvironment 2021-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202100629 PMID:34236760	研究论文	本研究探讨了通过气溶胶递送let-7b microRNA在肺癌预防中的效果，发现其能显著抑制肺癌发生，并通过调节肿瘤免疫微环境促进抗肿瘤免疫	首次展示了气溶胶递送let-7b microRNA在肺癌预防中的应用，并揭示了其通过下调PD-L1和PD-1表达来增强抗肿瘤免疫的机制	研究中未提及长期使用气溶胶递送let-7b microRNA的安全性和潜在副作用	探索let-7b microRNA通过气溶胶递送在肺癌预防中的效果及其作用机制	肺癌模型中的肿瘤微环境及肿瘤浸润T细胞	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
4362	2025-02-03	Inhibition of lung tumorigenesis by a small molecule CA170 targeting the immune checkpoint protein VISTA 2021-07-23, Communications biology IF:5.2Q1 DOI:10.1038/s42003-021-02381-x PMID:34302042	研究论文	本文研究了小分子CA170通过靶向免疫检查点蛋白VISTA抑制肺癌发生的作用	首次展示了CA170作为VISTA拮抗剂在抑制肺癌发生中的强效抗癌作用，并揭示了其与KRAS疫苗联合使用的协同效应	研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证	探索VISTA拮抗剂CA170在肺癌免疫治疗中的潜力	小鼠肺癌模型	癌症免疫治疗	肺癌	流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据、流式细胞数据	小鼠肺癌模型
4363	2025-01-31	Epidermal stem cell derived exosomes-induced dedifferentiation of myofibroblasts inhibits scarring via the miR-203a-3p/PIK3CA axis 2025-Jan-29, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1 DOI:10.1186/s12951-025-03157-9 PMID:39881312	研究论文	本研究通过比较转录组学和单细胞测序技术，探讨了表皮干细胞来源的外泌体（EpiSC-EVs）通过miR-203a-3p/PIK3CA轴抑制肌成纤维细胞去分化，从而减少瘢痕形成的机制	首次揭示了EpiSC-EVs通过miR-203a-3p抑制PIK3CA表达和PI3K/AKT/mTOR通路过度激活，从而促进肌成纤维细胞去分化的分子机制	研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验验证其安全性和有效性	探索抑制瘢痕形成的分子机制和潜在治疗方法	肌成纤维细胞和瘢痕组织	细胞生物学	瘢痕	比较转录组学、单细胞测序、miRNA测序、超速离心、过滤、Western blotting、免疫荧光	NA	转录组数据、单细胞数据、miRNA数据	NA
4364	2025-01-07	Single-Cell RNA Sequencing Reveals Age-Related Changes in Epidermal Cell Populations and Interactions 2025-Jan-03, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1 DOI:10.1016/j.jid.2024.12.013 PMID:39756533	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
4365	2025-02-02	Cholesterol restriction primes antiviral innate immunity via SREBP1-driven noncanonical type I IFNs 2025-Jan, EMBO reports IF:6.5Q1 DOI:10.1038/s44319-024-00346-9 PMID:39668245	研究论文	本文探讨了胆固醇代谢与先天免疫反应之间的关系，特别是通过SREBP1驱动的非经典I型干扰素（IFN）表达来增强RIG-I依赖的抗病毒反应	揭示了胆固醇合成限制通过SREBP1转录因子依赖的方式诱导非经典I型IFN（如IFN-ω）的表达，从而增强RIG-I介导的信号传导	研究主要集中于特定细胞类型和小鼠模型，尚未在更广泛的生物体或临床环境中验证	研究胆固醇代谢如何影响先天免疫反应，特别是RIG-I依赖的抗病毒反应	特定细胞类型和小鼠模型	免疫学	病毒感染	化学筛选、单细胞转录组分析	NA	基因表达数据	小鼠模型和特定细胞类型
4366	2025-02-02	Reduced TRIM expression correlates with anomalous CD4 T cell activation in systemic lupus Erythematosus and its clinical diagnostic potential 2024-12, Immunology letters IF:3.3Q3 DOI:10.1016/j.imlet.2024.106913 PMID:39233252	研究论文	本研究探讨了系统性红斑狼疮（SLE）患者循环CD4+T细胞亚群中T细胞受体相互作用分子（TRIM）的表达、功能及其临床相关性	首次在SLE患者中系统性地研究了TRIM在CD4+T细胞亚群中的表达及其与疾病活动的相关性，并探讨了其在临床诊断中的潜在应用	研究主要基于单细胞RNA测序数据和流式细胞术分析，未涉及TRIM在SLE中的具体分子机制	阐明TRIM在SLE患者CD4+T细胞亚群中的表达、功能及其临床意义	系统性红斑狼疮（SLE）患者、健康对照者（HCs）和类风湿性关节炎（RA）患者的外周血单核细胞（PBMCs）及小鼠的CD4+T细胞亚群	免疫学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序、流式细胞术	NA	RNA测序数据、流式细胞术数据	SLE患者、健康对照者（HCs）和类风湿性关节炎（RA）患者的外周血单核细胞（PBMCs）及小鼠的CD4+T细胞亚群
4367	2025-02-02	Beyond the Heartbeat: Single-Cell Omics Redefining Cardiovascular Research 2024-Nov, Current cardiology reports IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s11886-024-02117-3 PMID:39158785	综述	本文探讨了单细胞组学技术在人类心脏不同区域的应用，揭示了细胞多样性、调控网络和疾病机制	强调了单细胞组学技术在心脏研究中的革命性应用，特别是在心脏再生、疾病建模和精准医学方面的潜力	NA	探索单细胞组学技术在心血管研究中的应用，以揭示心脏的细胞组成和分子动态	人类心脏的不同区域	生物信息学	心血管疾病	单细胞转录组学、基因组学、蛋白质组学、表观基因组学、空间转录组学	NA	单细胞组学数据	NA
4368	2025-02-02	Single-cell sequencing has revealed a more complex array of thymic epithelial cells 2024-10, Immunology letters IF:3.3Q3 DOI:10.1016/j.imlet.2024.106904 PMID:39117004	综述	本文综述了单细胞测序在揭示胸腺上皮细胞分类中的最新见解，包括正常和肿瘤胸腺中的细胞类型	利用单细胞测序技术揭示了胸腺上皮细胞的更复杂分类，特别是在正常和肿瘤胸腺中的细胞类型	NA	探讨单细胞测序在胸腺上皮细胞分类中的应用	胸腺上皮细胞	单细胞测序	NA	单细胞测序	NA	单细胞数据	NA
4369	2025-02-02	Molecular Organization of Autonomic, Respiratory, and Spinally-Projecting Neurons in the Mouse Ventrolateral Medulla 2024-Jul-31, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience DOI:10.1523/JNEUROSCI.2211-23.2024 PMID:38918066	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，创建了小鼠腹外侧延髓（VLM）细胞的全面数据集，揭示了VLM中神经元和星形胶质细胞的分子和细胞组织	首次通过单细胞RNA测序技术，系统地识别了VLM中23种神经元亚型和5种星形胶质细胞亚型，并验证了脊髓投射神经元的丰富性	研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他动物模型	揭示腹外侧延髓（VLM）中神经元和星形胶质细胞的分子和细胞组织，以更好地理解VLM在重要功能和运动控制中的作用	小鼠腹外侧延髓（VLM）中的神经元和星形胶质细胞	神经科学	NA	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	114,805个VLM细胞
4370	2025-02-02	A high-throughput single-cell RNA expression profiling method identifies human pericyte markers 2023-Dec, Neuropathology and applied neurobiology IF:4.0Q1 DOI:10.1111/nan.12942 PMID:37812061	研究论文	本文介绍了一种高通量单细胞RNA表达谱分析方法，用于识别人类周细胞标记物	使用了一种名为EasySci的高通量、低成本单细胞转录组测序方法，识别了人类周细胞的特异性基因标记物，并验证了这些标记物在人类脑组织中的表达	在其他人类器官（如肾脏、肺、肝脏、肌肉）中，免疫组织化学未显示出相同的周细胞样染色模式	识别和优化一种普遍可用的组织学标记物，用于人类脑中的周细胞	人类和小鼠脑组织中的周细胞	单细胞转录组学	NA	单细胞RNA测序（EasySci）、免疫印迹、免疫组织化学	NA	RNA表达谱、免疫组织化学图像	人类和小鼠脑组织样本，以及其他人类器官（肾脏、肺、肝脏、肌肉）的探索性样本
4371	2025-02-02	Genetic control of the dynamic transcriptional response to immune stimuli and glucocorticoids at single-cell resolution 2023-06, Genome research IF:6.2Q1 DOI:10.1101/gr.276765.122 PMID:37442575	研究论文	本文使用单细胞RNA测序技术研究了96名非裔美国儿童外周血单核细胞对糖皮质激素的转录反应动态	提出了新的统计方法来计算基因表达变异性的均值独立度量，并基于对角线性判别分析开发了基因表达反应动态的新度量	研究样本仅限于非裔美国儿童，可能限制了结果的普适性	研究糖皮质激素对免疫刺激的转录反应的动态调控机制	96名非裔美国儿童的外周血单核细胞	基因组学	免疫相关疾病	单细胞RNA测序	对角线性判别分析	单细胞RNA测序数据	96名非裔美国儿童的外周血单核细胞
4372	2025-02-02	Systematic Comparison of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Models Identifies a Conserved Highly Plastic Basal Cell State 2022-Oct-04, Cancer research IF:12.5Q1 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-22-1742 PMID:35952360	研究论文	本文通过单细胞基因组学方法，研究了胰腺导管腺癌（PDAC）在不同生长条件下的细胞异质性，发现了一种高度可塑性的基底细胞状态	揭示了PDAC中基底细胞状态的高度可塑性及其在促进肿瘤内异质性中的作用	研究主要依赖于体外和体内模型，可能无法完全反映人类PDAC的复杂性	理解PDAC中细胞多样性的机制	胰腺导管腺癌（PDAC）细胞	癌症研究	胰腺癌	单细胞基因组学	NA	单细胞转录组数据	多种体外和体内模型
4373	2025-02-01	Glucocorticoid receptor suppresses GATA6-mediated RNA polymerase II pause release to modulate classical subtype identity in pancreatic cancer 2025-Jan-30, Gut IF:23.0Q1 DOI:10.1136/gutjnl-2024-334374 PMID:39884837	研究论文	本研究揭示了胰腺导管腺癌（PDAC）分子亚型身份的转录调控机制，特别是糖皮质激素受体（GR）激动剂通过GATA6抑制经典转录程序的作用	发现了GR激动剂通过与GATA6相互作用抑制经典转录程序的新机制，并利用多种高通量测序技术揭示了GATA6在调控经典特异性转录中的作用	研究主要依赖于体外实验和单细胞测序数据，尚未在临床环境中验证GR激动剂的治疗效果	揭示PDAC分子亚型身份的转录调控机制	胰腺导管腺癌（PDAC）的经典和基底分子亚型	癌症生物学	胰腺癌	单细胞RNA测序、ATAC-seq、ChIP-seq、HiChIP、PRO-seq、dCas9	NA	RNA-seq、ATAC-seq、ChIP-seq、HiChIP、PRO-seq	NA
4374	2025-02-01	Roles of central nervous system resident and recruited macrophages in the brain barrier system 2025-Jan-29, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-00986 PMID:39885670	综述	本文综述了大脑屏障系统中巨噬细胞的起源、发育、重要分子和功能，特别是小胶质细胞和边界相关巨噬细胞	强调了单细胞测序技术和重要细胞标志物的进展，展望了未来研究大脑屏障系统中驻留和招募巨噬细胞的先进方法	未提及具体实验数据或样本量，主要基于现有文献进行综述	探讨大脑屏障系统中巨噬细胞的作用及其在神经免疫学中的重要性	大脑屏障系统中的巨噬细胞，包括小胶质细胞和边界相关巨噬细胞	神经免疫学	NA	单细胞测序	NA	NA	NA
4375	2025-02-01	Single-cell transcriptomics of bronchoalveolar lavage during PRRSV infection with different virulence 2025-Jan-28, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-54676-2 PMID:39875369	研究论文	本研究通过单细胞转录组学技术，评估了不同毒力PRRSV感染期间支气管肺泡灌洗液中免疫细胞组成的变化及其临床结果	揭示了高毒力和中等毒力PRRSV感染在肺损伤时间点、免疫细胞组成变化及机制上的差异，特别是发现了抗炎M2样巨噬细胞在肺恢复中的作用	研究主要关注PRRSV感染，结果可能不直接适用于其他呼吸道病毒感染	理解PRRSV不同毒力水平对免疫细胞组成和临床结果的影响，以促进疾病管理和疫苗开发	支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞	生物信息学	猪繁殖与呼吸综合征	单细胞转录组学	NA	单细胞RNA测序数据	未明确提及具体样本数量
4376	2025-02-01	RASGRF2 as a potential pathogenic gene mediating the progression of alcoholic hepatitis to alcohol-related cirrhosis and hepatocellular carcinoma 2025-Jan-28, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-01853-4 PMID:39875737	研究论文	本研究通过多转录组数据库分析，确定了酒精性肝炎（AH）和肝细胞癌（HCC）之间的潜在共享基因，并验证了RASGRF2作为核心共享基因的作用	首次通过多转录组数据库和机器学习算法筛选出AH和HCC之间的共享基因，并验证了RASGRF2在AH向酒精性肝硬化（AC）和HCC进展中的致病作用	研究主要依赖于转录组数据和体外实验，缺乏体内实验验证	确定AH和HCC之间的共享基因，并验证其在疾病进展中的作用	酒精性肝炎（AH）、酒精性肝硬化（AC）和肝细胞癌（HCC）	生物信息学	肝细胞癌	转录组分析、免疫浸润分析、单细胞转录组分析、空间转录组分析	机器学习算法	转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据	多个转录组数据库和独立验证队列的数据
4377	2025-02-01	Prognostic models of immune-related cell death and stress unveil mechanisms driving macrophage phenotypic evolution in colorectal cancer 2025-Jan-28, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06143-9 PMID:39875913	研究论文	本文构建了一个与免疫相关的细胞死亡和应激（ICDS）预后模型，揭示了肿瘤细胞通过铜死亡下调GAL3ST4表达以抑制M2样巨噬细胞极化的机制	首次构建了ICDS预后模型，并揭示了肿瘤细胞通过铜死亡调控巨噬细胞极化的新机制	研究主要基于转录组数据，缺乏更多实验验证	揭示结直肠癌中免疫细胞浸润、程序性细胞死亡和应激之间的复杂相互作用，以指导治疗策略和改善患者预后	结直肠癌患者的转录组数据	数字病理学	结直肠癌	单细胞测序、生化实验	机器学习模型	转录组数据	来自TCGA和GEO数据库的大量结直肠癌样本
4378	2025-02-01	UBE2J1 is identified as a novel plasma cell-related gene involved in the prognosis of high-grade serous ovarian cancer 2025-Jan-28, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06135-9 PMID:39876019	研究论文	本研究通过单细胞测序数据识别了高浆液性卵巢癌（HGSOC）中的关键免疫细胞类型，并揭示了UBE2J1作为HGSOC的新型预后标志物和致癌基因	首次将UBE2J1识别为HGSOC的新型预后标志物和致癌基因，揭示了其在细胞增殖、侵袭、迁移和肿瘤生长中的关键作用	研究主要依赖于公共数据库的数据，缺乏独立验证队列	识别HGSOC中的关键免疫细胞标志物并探索其在肿瘤进展和治疗反应中的作用	高浆液性卵巢癌（HGSOC）患者和细胞系	数字病理学	卵巢癌	单细胞测序、CCK-8、Transwell、克隆形成、伤口愈合、免疫荧光和体内肿瘤生长实验	NA	单细胞测序数据、批量测序数据	来自GEO和TCGA数据库的HGSOC样本
4379	2025-02-01	Retinal Phenotypes and Single-cell Sequencing Analysis of Ush2a Knockout Mice 2025-Jan-28, Experimental eye research IF:3.0Q1 DOI:10.1016/j.exer.2025.110247 PMID:39884543	研究论文	本研究通过CRISPR/Cas9技术构建了Ush2a基因敲除小鼠模型，并进行了听觉脑干反应测试、视网膜电图、HE染色和视网膜单细胞RNA测序，以探索Usher综合征中视网膜退化的机制	成功构建了Ush2a基因敲除小鼠模型，并首次通过单细胞RNA测序构建了视网膜细胞的初步调控图谱	在20个月大的Ush2a基因敲除小鼠中未发现明显的视网膜形态和电生理表型	探索Usher综合征中视网膜退化的分子机制	Ush2a基因敲除小鼠和野生型小鼠	遗传学	Usher综合征	CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序	Ush2a基因敲除小鼠模型	RNA测序数据	Ush2a基因敲除小鼠和野生型小鼠
4380	2025-02-01	Integrating representation learning, permutation, and optimization to detect lineage-related gene expression patterns 2025-Jan-27, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-56388-7 PMID:39870610	研究论文	本文开发了一种名为PORCELAN的方法，用于识别与细胞谱系紧密相关的基因或子树，并应用于小鼠肺癌模型和胚胎发育的单细胞RNA测序数据	PORCELAN方法结合了表示学习、排列和优化技术，能够识别与细胞谱系紧密相关的基因或子树，为研究细胞状态记忆提供了新工具	方法主要应用于小鼠模型和C. elegans的胚胎发育数据，尚未在更广泛的生物系统中验证	研究细胞谱系相关的基因表达模式，特别是在肺癌进展和胚胎发育中的细胞状态记忆	小鼠肺癌模型、小鼠和C. elegans的胚胎发育	生物信息学	肺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	表示学习、排列和优化	单细胞RNA测序数据	小鼠肺癌模型、小鼠和C. elegans的胚胎发育数据