单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4301 - 4320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4301 | 2025-10-06 |
Splicing regulatory dynamics for precision analysis and treatment of heterogeneous leukemias
2025-May-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr1471
PMID:40333990
|
研究论文 | 开发OncoSplice计算方法分析白血病剪接调控动态并发现新的治疗靶点 | 开发无监督计算方法OncoSplice，在无剪接因子突变情况下发现新的白血病分子亚型，并验证PRMT5抑制剂对白血病剪接异常的治疗效果 | 未明确说明样本量的具体数字和研究队列的详细特征 | 研究剪接调控在白血病中的作用机制并探索治疗策略 | 成人和儿童急性髓系白血病(AML) | 生物信息学 | 白血病 | 长读长单细胞RNA测序 | 无监督计算方法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4302 | 2025-10-06 |
Epitenon-derived cells comprise a distinct progenitor population that contributes to both fibrosis and regeneration following acute flexor tendon injury in a spatially-dependent manner
2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.30.526242
PMID:36778469
|
研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了腱外膜来源细胞在肌腱损伤后同时参与纤维化和再生过程的空间依赖性作用 | 首次明确鉴定腱外膜作为重要的祖细胞群来源，这些细胞在肌腱损伤后同时参与纤维化和再生过程，具有空间依赖性特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探索肌腱损伤后参与纤维化和再生过程的细胞群体及其作用机制 | 小鼠肌腱损伤模型和人类腱周瘢痕组织 | 单细胞生物学 | 肌腱损伤 | 遗传谱系追踪, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 小鼠肌腱损伤模型和人类瘢痕组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4303 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial analyses reveal the effect of VSIG4+S100A10+TAMs on the immunosuppression of glioblastoma and anti-PD-1 immunotherapy
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142415
PMID:40127797
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了VSIG4+S100A10+TAMs在胶质母细胞瘤免疫抑制和抗PD-1免疫治疗中的作用 | 首次发现VSIG4+S100A10+TAM是GBM不良预后的独立预后指标，并在抗PD-1免疫治疗无应答患者中显著积累 | 样本量相对有限（16例患者样本），需要更大规模研究验证 | 探索胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞异质性及其对免疫治疗疗效的影响 | 胶质母细胞瘤患者样本和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 多重免疫荧光, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 细胞表型数据 | 16例胶质母细胞瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4304 | 2025-10-06 |
SCassist: An AI Based Workflow Assistant for Single-Cell Analysis
2025-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.650107
PMID:40492199
|
研究论文 | 开发了一个基于大型语言模型的单细胞RNA测序数据分析辅助工具SCassist | 首次将大型语言模型集成到单细胞RNA测序数据分析工作流中，提供参数推荐和结果解释 | NA | 简化单细胞RNA测序数据分析流程，降低使用门槛 | 单细胞RNA测序数据分析工作流 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | LLM（大型语言模型） | 单细胞RNA测序数据 | NA | Google, OpenAI, Meta | 单细胞RNA-seq | Gemini, GPT, Llama3 | 基于大型语言模型的单细胞数据分析辅助工具 |
| 4305 | 2025-10-06 |
Histopathologic Evaluation and Single-Cell Spatial Transcriptomics of the Colon Reveal Cellular and Molecular Abnormalities Linked to J-Pouch Failure in Patients with Inflammatory Bowel Disease
2025-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.27.635092
PMID:39974918
|
研究论文 | 本研究通过组织病理学评估和单细胞空间转录组学分析结肠组织，揭示与炎症性肠病患者J型储袋失败相关的细胞和分子异常 | 首次结合组织病理学特征和单细胞空间转录组学技术系统分析J型储袋失败的预测因素和分子机制 | 回顾性研究设计，单细胞空间转录组学仅分析了部分患者亚群 | 探究与炎症性肠病患者J型储袋失败相关的组织病理学特征和分子机制 | 接受回肠储袋肛管吻合术(IPAA)的炎症性肠病患者 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞空间转录组学，组织病理学评估 | NA | 空间转录组数据，组织病理图像 | 417名患者队列，部分患者进行单细胞空间转录组分析 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 4306 | 2025-10-06 |
Single Cell Spatial Transcriptomics Reveals Immunotherapy-Driven Bone Marrow Niche Remodeling in AML
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.24.634753
PMID:39975227
|
研究论文 | 本研究利用单细胞空间转录组学技术揭示免疫疗法对急性髓系白血病患者骨髓微环境的重塑作用 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组数据，通过深度学习细胞分割模型实现精确的转录本定位和细胞间距离分析 | 测序读长限制可能影响数据完整性，样本量相对有限 | 研究免疫检查点抑制剂联合低甲基化药物治疗对急性髓系白血病骨髓微环境中细胞间相互作用的影响 | 难治性或复发性急性髓系白血病患者的骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 深度学习图像分析 | 细胞分割模型 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 难治性或复发性急性髓系白血病患者骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4307 | 2025-10-06 |
The chromatin remodeler ADNP regulates neurodevelopmental disorder risk genes and neocortical neurogenesis
2025-Jan-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405981122
PMID:39808658
|
研究论文 | 本研究揭示了染色质重塑复合物ChAHP通过调控神经发育障碍风险基因和神经发生过程在脑发育中的关键作用 | 首次发现Adnp通过两步过程调控大脑皮层上层神经元生成：维持祖细胞增殖和调控神经元基因表达程序 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的直接相关性需要进一步验证 | 探究染色质重塑复合物ChAHP在神经发育和神经发育障碍中的作用机制 | 小鼠新皮层发育过程中的神经祖细胞和分化神经元 | 神经发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学, cut&run-seq, 组织学方法 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 染色质结合数据, 组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4308 | 2025-10-06 |
Airway epithelial cell response to RSV is mostly impaired in goblet and multiciliated cells in asthma
2024-08-19, Thorax
IF:9.0Q1
DOI:10.1136/thorax-2023-220230
PMID:38373824
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了哮喘患者和健康捐赠者支气管上皮细胞对呼吸道合胞病毒(RSV)感染的转录反应 | 首次在单细胞分辨率下揭示了哮喘患者杯状细胞和多纤毛细胞对RSV感染的应答受损 | 样本量较小(哮喘患者n=8，健康捐赠者n=8)，需要更大规模研究验证 | 探究哮喘患者支气管上皮细胞对RSV感染的分子应答机制 | 原代支气管上皮细胞(pBECs) | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 16例(8例哮喘患者，8例健康捐赠者) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4309 | 2025-10-06 |
scGPT: toward building a foundation model for single-cell multi-omics using generative AI
2024-Aug, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02201-0
PMID:38409223
|
研究论文 | 开发基于生成式预训练变换器的单细胞多组学基础模型scGPT | 首次将生成式预训练模型应用于单细胞生物学领域，构建了包含3300多万个细胞的跨组学基础模型 | NA | 探索基础模型在细胞生物学和遗传研究中的适用性 | 单细胞测序数据中的基因和细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 生成式预训练变换器 | 单细胞多组学数据 | 超过3300万个细胞 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4310 | 2025-10-06 |
Genomic and single-cell characterization of patient-derived tumor organoid models of head and neck squamous cell carcinoma
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.28.601068
PMID:39005427
|
研究论文 | 本研究通过建立头颈部鳞状细胞癌患者来源肿瘤类器官模型，揭示了肿瘤异质性特征及其与顺铂治疗反应的关系 | 首次在头颈部鳞癌类器官模型中系统表征基因组特征和单细胞异质性，发现混合上皮-间质转化状态与顺铂耐药的相关性 | 样本量相对有限（31例患者），需要更大规模验证研究结果 | 建立头颈部鳞癌患者来源肿瘤类器官模型，研究肿瘤异质性与治疗反应机制 | 头颈部鳞状细胞癌患者来源肿瘤类器官 | 数字病理 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 患者来源肿瘤类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 31例头颈部鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4311 | 2025-10-06 |
Early Developmental Origins of Cortical Disorders Modeled in Human Neural Stem Cells
2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.14.598925
PMID:38915580
|
研究论文 | 通过人类神经干细胞研究早期端脑发育阶段与皮质障碍病因的关联 | 首次在人类神经干细胞中模拟皮质障碍的早期发育起源，揭示了疾病特异性关键阶段和跨疾病的汇聚信号通路 | 研究主要基于体外模型，需要进一步验证在完整生物系统中的适用性 | 探索人类端脑早期发育阶段在皮质障碍病因中的作用机制 | 人类神经干细胞、自闭症患者来源的神经干细胞 | 发育神经生物学 | 皮质障碍、自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4312 | 2025-10-06 |
Prognostic gene landscapes and therapeutic insights in sepsis-induced coagulopathy
2024-05, Thrombosis research
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.thromres.2024.03.011
PMID:38513536
|
研究论文 | 本研究通过分析脓毒症患者的转录组数据，识别了与凝血相关的关键基因，并开发了预后模型和列线图来预测患者生存 | 首次通过单细胞测序揭示脓毒症中血小板与免疫细胞间的通讯改变，并发现FYN基因在凝血功能障碍中的核心作用 | 研究样本量有限，机制研究主要在动物模型中进行，需要进一步临床验证 | 探索脓毒症诱导凝血病(SIC)的预后基因标志物和治疗靶点 | 脓毒症患者和脓毒症大鼠模型 | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞测序, 实时定量PCR | 预后模型, 列线图, 共识聚类 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 脓毒症患者全血转录组数据，脓毒症大鼠模型 | NA | 单细胞测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 4313 | 2025-10-06 |
PIP4K2C inhibition reverses autophagic flux impairment induced by SARS-CoV-2
2024-Apr-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.15.589676
PMID:38659941
|
研究论文 | 研究发现小分子抑制剂RMC-113通过双重抑制PIP4K2C和PIKfyve脂质激酶，逆转SARS-CoV-2诱导的自噬流损伤，发挥广谱抗病毒作用 | 首次揭示PIP4K2C在SARS-CoV-2进入、RNA复制和组装/释放过程中的作用，并发现其与病毒非结构蛋白6结合调控自噬流 | NA | 开发广谱抗病毒药物并阐明其作用机制 | 人类肺类器官和多种RNA病毒包括SARS-CoV-2 | 病毒学 | COVID-19 | 脂质组学、蛋白质组学、单细胞转录组学、功能测定 | NA | 分子数据、转录组数据、功能测定数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 4314 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing highlights epithelial and microenvironmental heterogeneity in malignant progression of pancreatic ductal adenocarcinoma
2024-03-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216607
PMID:38246225
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析胰腺导管腺癌恶性进展过程中的上皮细胞和微环境异质性 | 首次在单细胞水平揭示IPMN向PDAC进展过程中上皮细胞和肿瘤微环境的异质性变化，发现SPP1-CD44通路在PDAC中显著增强 | 样本量相对有限（仅5个手术切除样本），需要更大队列验证发现 | 解析胰腺导管腺癌恶性进展的细胞分子机制 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤（IPMN）和胰腺导管腺癌（PDAC）患者手术样本 | 单细胞转录组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 35,693个细胞，来自3个高级别IPMN和2个IPMN来源的PDAC | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞测序技术 |
| 4315 | 2025-10-06 |
Advanced insights on tumor-associated macrophages revealed by single-cell RNA sequencing: The intratumor heterogeneity, functional phenotypes, and cellular interactions
2024-03-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216610
PMID:38244910
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在揭示肿瘤相关巨噬细胞异质性、功能表型和细胞相互作用方面的最新研究进展 | 从发育角度系统总结TAM表型和功能变化，深入理解TAM在肿瘤微环境中的意义 | NA | 探讨单细胞RNA测序在肿瘤相关巨噬细胞研究中的应用和意义 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs) | 单细胞组学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4316 | 2025-10-06 |
PGF2α signaling drives fibrotic remodeling and fibroblast population dynamics in mice
2023-12-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.172977
PMID:37934604
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示PGF2α信号通路在特发性肺纤维化中的作用机制 | 首次发现PGF2α/FPr信号轴是TGF-β1非依赖性的IPF信号枢纽，并识别出易感的成纤维细胞亚群 | 研究基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究PGF2α信号在肺纤维化重塑和成纤维细胞群体动态中的作用 | 表达Sftpc基因突变的小鼠模型和Ptgfr基因敲除小鼠 | 病理生物学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序，伪时序分析，体外实验 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据，组织病理数据 | 多组基因型小鼠队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4317 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics of human T cells reveals tissue and activation signatures in health and disease
2019-10-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-12464-3
PMID:31624246
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示人类T细胞在健康和疾病状态下的组织特异性特征和活化特征 | 首次建立人类T细胞在多个组织部位的高维参考图谱，揭示组织特异性T细胞特征和谱系特异性活化状态 | 样本来源仅限于肺部、淋巴结、骨髓和血液组织，未涵盖所有人体组织 | 研究组织部位对人类T细胞持久性和功能的影响 | 人类T细胞 | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 超过50,000个静息和活化T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4318 | 2025-10-06 |
SOD2 expression in patients with triple-negative breast cancer is associated with tumor-infiltrating lymphocytes and prognosis
2025-Aug, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-025-07775-7
PMID:40634732
|
研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌中SOD2表达与肿瘤浸润淋巴细胞及预后的关系 | 首次系统揭示SOD2表达与三阴性乳腺癌免疫微环境特征和临床预后的关联 | 样本来源多样且部分为回顾性分析，需进一步功能验证实验 | 探究SOD2在三阴性乳腺癌中的表达特征及其临床意义 | 三阴性乳腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫组织化学,蛋白质组学,RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 组织切片图像,蛋白质表达数据,基因表达数据 | 组织芯片229例手术样本和144例新辅助化疗前活检样本，TCGA数据库91例，公共数据库534例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4319 | 2025-10-06 |
C3a-C3aR1-mediated interactions between fibroblast-like synoviocytes and macrophages promote the progression of rheumatoid arthritis
2025-Jul-14, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43319
PMID:40654154
|
研究论文 | 本研究通过成像质谱流式细胞术和单细胞RNA测序揭示了类风湿关节炎滑膜中成纤维样滑膜细胞与巨噬细胞通过C3a-C3aR1信号通路促进疾病进展的新机制 | 首次发现成纤维样滑膜细胞与巨噬细胞通过C3a-C3aR1信号通路形成正反馈调节环路促进类风湿关节炎滑膜炎症 | 研究主要基于胶原诱导关节炎小鼠模型，人类样本验证仍需进一步开展 | 探究类风湿关节炎滑膜微环境中细胞间相互作用机制及其在疾病进展中的作用 | 类风湿关节炎患者滑膜组织、胶原诱导关节炎小鼠模型 | 单细胞分析 | 类风湿关节炎 | 成像质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 图像,单细胞转录组数据 | 类风湿关节炎与骨关节炎滑膜组织比较研究 | NA | 成像质谱流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4320 | 2025-10-06 |
SLC3A2 as a key anoikis-related gene for prognosis and tumor microenvironment remodeling in melanoma
2025-Jul-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03125-7
PMID:40643718
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞分析，鉴定SLC3A2作为黑色素瘤预后和肿瘤微环境重塑的关键失巢凋亡相关基因 | 首次系统评估101种机器学习算法组合构建黑色素瘤预后模型，并通过单细胞分析揭示失巢凋亡在肿瘤微环境重塑中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 识别黑色素瘤中失巢凋亡相关的预后标志物并探索其与肿瘤微环境的关系 | 黑色素瘤患者和细胞系 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 机器学习, shRNA敲低, 集落形成实验, Transwell迁移实验 | 随机生存森林, 梯度提升机, Cox回归 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床数据 | 多个黑色素瘤队列（TCGA, GSE19234, GSE22153, GSE65904）和单细胞数据集GSE215120 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |