单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 28063 篇文献，本页显示第 4281 - 4300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4281 | 2025-03-12 |
CD8+ lymphocytes are critical for early control of tuberculosis in macaques
2023-12-04, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20230707
PMID:37843832
|
研究论文 | 本文研究了CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的功能作用，通过去除猕猴中的先天和/或适应性CD8+淋巴细胞，展示了CD8α+细胞的缺失如何显著影响结核分枝杆菌感染的早期控制 | 首次在猕猴模型中系统地展示了CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的关键作用，并揭示了CD8+淋巴细胞的多功能细胞毒性反应作为疫苗靶点的潜力 | 研究仅限于猕猴模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨CD8+淋巴细胞在结核病早期控制中的功能作用 | 猕猴 | 免疫学 | 结核病 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 生物样本数据 | 猕猴样本 |
| 4282 | 2025-03-12 |
Severe COVID-19 is associated with fungal colonization of the nasopharynx and potent induction of IL-17 responses in the nasal epithelium
2022-Oct-26, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2022.10.25.22281528
PMID:36324802
|
研究论文 | 本文探讨了严重COVID-19患者中真菌定植与鼻咽部IL-17反应增强的关联 | 通过单细胞RNA测序技术，揭示了严重COVID-19患者中真菌定植与IL-17刺激的免疫特征之间的关系 | 研究样本量有限，且未涵盖所有COVID-19严重程度的患者 | 研究严重COVID-19患者中真菌定植的频率及其与特定免疫反应的关联 | 严重COVID-19患者 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 一组严重COVID-19患者 |
| 4283 | 2025-03-12 |
CD4+ T-Cell Dysfunction in Severe COVID-19 Disease Is Tumor Necrosis Factor-α/Tumor Necrosis Factor Receptor 1-Dependent
2022-06-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202111-2493OC
PMID:35348444
|
研究论文 | 本文研究了严重COVID-19患者中CD4+ T细胞功能障碍与肿瘤坏死因子-α（TNF-α）/肿瘤坏死因子受体1（TNF receptor 1）依赖性的关系 | 研究发现严重COVID-19患者中CD4+ T细胞功能障碍与TNF-α/TNF receptor 1依赖性相关，并证明TNF-α阻断剂可以挽救S1特异性CD4 T细胞增殖并减少细胞死亡 | 研究样本量有限，且未涉及其他潜在免疫机制的影响 | 探讨严重COVID-19患者中T细胞功能障碍的免疫机制 | 严重COVID-19患者和轻度COVID-19患者的T细胞反应 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据、RNA测序数据 | 148名严重COVID-19患者 |
| 4284 | 2025-03-12 |
Multimodal profiling of lung granulomas in macaques reveals cellular correlates of tuberculosis control
2022-05-10, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2022.04.004
PMID:35483355
|
研究论文 | 本文通过多模态分析揭示了猕猴肺肉芽肿中结核病控制的细胞相关性 | 通过结合纵向PET-CT成像、单细胞RNA测序和细菌清除测量，首次定义了结核病肉芽肿中细菌控制的复杂多细胞生态系统 | 研究仅限于猕猴模型，可能不完全适用于人类结核病 | 揭示结核病肉芽肿中细菌控制的细胞相关性，为开发新的疫苗和治疗策略提供依据 | 猕猴肺肉芽肿 | 数字病理 | 结核病 | 纵向PET-CT成像、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA测序数据 | 猕猴肺肉芽肿样本 |
| 4285 | 2025-03-12 |
SARS-CoV-2 Receptor ACE2 Is an Interferon-Stimulated Gene in Human Airway Epithelial Cells and Is Detected in Specific Cell Subsets across Tissues
2020-05-28, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2020.04.035
PMID:32413319
|
研究论文 | 本文研究了SARS-CoV-2的受体ACE2在人类气道上皮细胞中的表达及其在不同组织细胞亚群中的分布 | 发现ACE2是人类干扰素刺激基因（ISG），并揭示了其在肺、回肠和鼻黏膜特定细胞亚群中的共表达 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，缺乏直接的实验验证 | 理解SARS-CoV-2的致病机制及其受体ACE2的表达调控 | 人类、非人类灵长类动物和小鼠的气道上皮细胞及组织细胞亚群 | 分子生物学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 人类、非人类灵长类动物和小鼠的组织样本 |
| 4286 | 2025-03-11 |
TREM2 as a Therapeutic Target in Atherosclerosis
2025-Apr, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12279
PMID:39891588
|
review | 本文回顾了TREM2从基础研究到作为动脉粥样硬化治疗靶点的历程，并探讨了其临床应用的可能性 | 揭示了TREM2在泡沫巨噬细胞存活和动脉粥样硬化进展中的重要性，并提出了TREM2作为治疗靶点的潜力 | NA | 探讨TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的可行性和临床应用前景 | 动脉粥样硬化中的泡沫巨噬细胞和TREM2表达 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4287 | 2025-03-11 |
Spatial-Temporal Diversity of Extrachromosomal DNA Shapes Urothelial Carcinoma Evolution and Tumor-Immune Microenvironment
2025-Mar-11, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1532
PMID:40062518
|
研究论文 | 本文通过计算分析方法研究了595例尿路上皮癌（UC）患者全基因组测序数据中的染色体外DNA（ecDNA），揭示了ecDNA在肿瘤进化和免疫微环境中的作用 | 首次系统性地分析了ecDNA在尿路上皮癌中的时空多样性及其对肿瘤进化和免疫微环境的影响，揭示了ecDNA通过结构重排驱动克隆进化的机制 | 研究主要基于尿路上皮癌患者的数据，可能不适用于其他类型的癌症 | 研究ecDNA在尿路上皮癌中的时空多样性及其对肿瘤进化和免疫微环境的影响 | 595例尿路上皮癌患者的全基因组测序数据 | 基因组学 | 尿路上皮癌 | 全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、RNA数据 | 595例尿路上皮癌患者 |
| 4288 | 2025-03-11 |
Characterizing the Cellular Constituents of Proximal Airway Disease in Granulomatosis With Polyangiitis
2025-Mar-10, Otolaryngology--head and neck surgery : official journal of American Academy of Otolaryngology-Head and Neck Surgery
DOI:10.1002/ohn.1197
PMID:40062629
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了肉芽肿性多血管炎（GPA）患者近端气道黏膜的细胞组成，揭示了GPA风险基因在免疫细胞中的表达定位 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细描述了GPA患者近端气道黏膜的细胞组成，并发现了一种仅存在于GPA中的CD4-/CD8-炎症性T细胞亚群 | 研究样本量较小（GPA n=9，iSGS n=7，PIPS n=5，对照 n=10），且仅在单一三级医疗中心进行，可能限制结果的普遍性 | 旨在揭示GPA患者近端气道疾病的细胞组成及其病理机制 | GPA患者、特发性声门下狭窄（iSGS）患者、插管后近端狭窄（PIPS）患者及对照组的近端气道样本 | 数字病理学 | 肉芽肿性多血管炎 | 单细胞RNA测序 | Monocle 3 | RNA测序数据 | GPA n=9，iSGS n=7，PIPS n=5，对照 n=10 |
| 4289 | 2025-03-11 |
Robust Spatial Cell-Type Deconvolution with Qualitative Reference for Spatial Transcriptomics
2025-Mar-09, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401145
PMID:40059456
|
研究论文 | 本文提出了一种基于定性参考的空间转录组学细胞类型去卷积方法QR-SIDE，用于处理多细胞空间转录组数据 | QR-SIDE方法通过自适应调整每个标记基因的贡献，提供了个体标记基因的空间异质性详细图谱，并结合Potts模型促进空间连续性，统一了细胞类型去卷积与空间聚类 | 在缺乏可靠参考数据集或存在异质批次效应的情况下，现有方法可能引入偏差 | 开发一种新的空间转录组学细胞类型去卷积方法，以提高细胞类型去卷积的准确性和鲁棒性 | 多细胞空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Potts模型 | 空间转录组数据 | 模拟数据和三个真实空间转录组数据集（来自10x Visium和ST平台） |
| 4290 | 2025-03-11 |
Spatially separated epithelium-associated and lamina propria neutrophils present distinct functional identities in the inflamed colon mucosa
2025-Mar-06, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.02.008
PMID:40057307
|
研究论文 | 本文研究了炎症性肠病（IBD）中结肠黏膜内不同空间位置的中性粒细胞（PMNs）的功能差异 | 首次揭示了结肠黏膜中不同空间位置的中性粒细胞（LPNs和EANs）具有不同的功能特性，并发现EANs可能作为疾病驱动因素 | 研究主要基于小鼠模型和人类样本的单细胞RNA测序，可能无法完全反映人类IBD的复杂性 | 探讨炎症性肠病（IBD）中结肠黏膜内不同空间位置的中性粒细胞的功能差异及其临床意义 | 结肠黏膜中的中性粒细胞（PMNs），特别是位于固有层黏膜（LPNs）和隐窝上皮（EANs）的中性粒细胞 | 生物医学研究 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间RNA转录组学，实时活体成像 | NA | RNA测序数据，活体成像数据 | 小鼠模型和人类IBD患者样本 |
| 4291 | 2025-03-11 |
Neoplastic immune mimicry potentiates breast tumor progression
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633673
PMID:39896558
|
研究论文 | 本文探讨了乳腺癌进展中肿瘤细胞通过去分化程序增强适应性，并发现部分去分化的肿瘤细胞表达白细胞表面受体蛋白，称为“免疫拟态” | 首次提出并验证了乳腺癌细胞通过表达白细胞表面受体蛋白进行免疫拟态的现象，并发现这种拟态与肿瘤的侵袭性和治疗抵抗性相关 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和细胞系模型，尚未在更大规模的临床样本中进行验证 | 研究乳腺癌进展中肿瘤细胞的去分化及其对肿瘤侵袭性和治疗抵抗性的影响 | 乳腺癌细胞、人类乳腺癌单细胞RNA测序数据集、乳腺癌细胞系、小鼠转基因和细胞系来源的乳腺肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、组织病理学样本 | 公共人类乳腺癌单细胞RNA测序数据集、乳腺癌细胞系、小鼠模型 |
| 4292 | 2025-03-11 |
Pancreatic alpha and beta cell fate choice is directed by apical-basal polarity dynamics
2025-Mar-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.02.008
PMID:40056911
|
研究论文 | 本文探讨了细胞顶端-基底极性在胰腺内分泌祖细胞分化为α或β细胞命运中的调控作用 | 首次揭示了顶端-基底极性状态作为多能内分泌祖细胞分化为α或β细胞命运的关键调控因素 | 研究主要基于人类内分泌祖细胞，未涉及其他物种或细胞类型 | 研究细胞顶端-基底极性如何调控胰腺内分泌祖细胞的分化命运 | 人类胰腺内分泌祖细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确提及样本数量 |
| 4293 | 2025-03-11 |
ENPP1 promotes immune suppression, drug resistance, and adverse outcomes in bladder cancer: Potential for targeted therapy
2025-Mar-04, Cancer genetics
IF:1.4Q4
DOI:10.1016/j.cancergen.2025.03.001
PMID:40058167
|
研究论文 | 本研究探讨了ENPP1在膀胱癌中的表达及其对肿瘤进展、凋亡和免疫微环境的影响 | 首次系统性地研究了ENPP1在膀胱癌中的作用，揭示了其与肿瘤进展、免疫浸润和化疗耐药性的关系 | 样本量较小，仅包括36名膀胱癌患者的本地临床队列 | 研究ENPP1在膀胱癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 膀胱癌患者和膀胱癌细胞系 | 生物信息学 | 膀胱癌 | RT-qPCR, Western blotting, 免疫组化, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 36名膀胱癌患者的本地临床队列, TCGA-BLCA和GEO数据集 |
| 4294 | 2024-10-04 |
A Single-Cell RNA Sequencing Atlas of the Chronic Obstructive Pulmonary Disease Distal Lung to Predict Cell-Cell Communication
2025-Mar, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0232LE
PMID:39356793
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4295 | 2025-03-11 |
Unique Cell Type-Specific Signaling Patterns Define Cholesteatoma
2025-Feb-24, Otology & neurotology : official publication of the American Otological Society, American Neurotology Society [and] European Academy of Otology and Neurotology
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/MAO.0000000000004455
PMID:40062383
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术识别了胆脂瘤中的细胞类型和信号通路，并与正常鼓膜进行比较 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了胆脂瘤中独特的细胞类型特异性信号模式，为药物治疗提供了潜在靶点 | 研究主要基于计算机模拟的细胞研究，缺乏临床试验验证 | 识别驱动胆脂瘤的细胞类型和信号通路，以改善该疾病的治疗策略 | 人类胆脂瘤标本和正常鼓膜 | 数字病理 | 胆脂瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CellChat算法 | RNA测序数据 | 人类胆脂瘤标本和已发表的正常鼓膜单细胞RNA测序数据 |
| 4296 | 2025-03-11 |
STEAM: Spatial Transcriptomics Evaluation Algorithm and Metric for clustering performance
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.636505
PMID:40027655
|
研究论文 | 本文提出了一种名为STEAM的空间转录组学评估算法和指标，用于评估聚类性能的一致性和可靠性 | STEAM通过机器学习分类和预测方法，结合空间邻近性和基因表达模式，提供了一个用户友好的计算框架，用于评估聚类结果的稳健性和可重复性 | 由于缺乏真实标签，验证聚类一致性和可重复性仍然具有挑战性 | 开发一个计算评估框架，以严格且无偏见地评估空间转录组学数据的聚类性能 | 空间转录组学数据 | 空间生物学 | NA | 机器学习分类和预测方法 | NA | 空间转录组学和蛋白质组学数据 | 多个公共数据集，涵盖多细胞到单细胞分辨率 |
| 4297 | 2025-03-11 |
Joint imputation and deconvolution of gene expression across spatial transcriptomics platforms
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638195
PMID:40027720
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SIID的算法，用于从不同空间转录组学技术的数据中重建潜在的基因表达矩阵 | SIID算法通过空间对齐和联合非负因子分解模型，能够准确估算缺失的基因表达并从混合的空间转录组数据中推断细胞类型的基因表达特征 | NA | 整合不同空间转录组学技术的数据，以克服单个技术的局限性，实现未测量基因的表达估算和低空间分辨率技术的混合表达解卷积 | 人类乳腺癌和结肠癌组织的10x Xenium-Visium配对数据 | 数字病理学 | 乳腺癌, 结肠癌 | 空间转录组学技术 | 联合非负因子分解模型 | 基因表达数据 | NA |
| 4298 | 2025-03-11 |
Identification and Pharmacological Targeting of Treatment-Resistant, Stem-like Breast Cancer Cells for Combination Therapy
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.08.562798
PMID:38798673
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，识别并药理学靶向治疗耐药、干细胞样乳腺癌细胞，用于联合治疗 | 利用单细胞RNA测序和CROP-seq实验验证，识别出能够逆转化疗耐药性癌症干细胞样细胞转录状态的药物，并发现阿苯达唑与紫杉醇的联合使用具有显著协同效应 | 研究样本量较小，仅涉及七名转移性乳腺癌患者 | 开发基于机制的联合疗法，靶向互补的肿瘤亚群 | 乳腺癌患者中的癌症干细胞样细胞 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, CROP-seq | NA | RNA测序数据 | 七名转移性乳腺癌患者 |
| 4299 | 2025-03-11 |
Single-Cell Omics for Transcriptome CHaracterization (SCOTCH): isoform-level characterization of gene expression through long-read single-cell RNA sequencing
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.590597
PMID:38746128
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SCOTCH的计算方法套件，用于通过长读长单细胞RNA测序在异构体水平上表征基因表达 | SCOTCH方法利用长读长的独特优势，通过动态阈值和读长映射分数的子外显子识别策略，精确对齐读长到已知异构体并发现新异构体，解决了长读长单细胞数据中常见的模糊映射挑战 | NA | 开发一种新的计算方法来更准确地分析单细胞转录组复杂性 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 长读长单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 4300 | 2025-03-11 |
ScRNA-seq reveals trained immunity-engaged Th17 cell activation against Edwardsiella piscicida-induced intestinal inflammation in teleost
2024-Dec, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2024.127912
PMID:39326350
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了β-葡聚糖训练如何通过调节肠道Th17细胞功能来减轻细菌感染引起的肠道炎症 | 提出了训练免疫激活调节肠道Th17细胞功能的新概念，为维持肠道稳态提供了新的策略 | 研究仅限于大菱鲆这一种鱼类，未在其他物种中验证 | 探究鱼类肠道免疫细胞在细菌感染中维持肠道稳态的细胞机制 | 大菱鲆（Scophthalmus maximus）的肠道免疫细胞 | 免疫学 | 肠道炎症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA |