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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4281 - 4300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4281 | 2025-10-06 |
Network-Guided Sparse Subspace Clustering on Single-Cell Data
2025-Jul-15, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666251359688
PMID:40662619
|
研究论文 | 开发了一种网络引导的稀疏子空间聚类方法NetworkSSC，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | 在传统稀疏子空间聚类基础上整合了基因网络拉普拉斯矩阵的正则化项，能够捕捉基因间的功能关联 | 仅在九个单细胞RNA测序数据集上进行了比较分析，样本规模有限 | 解决单细胞数据高维特性导致的传统聚类方法效果不佳问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 稀疏子空间聚类 | 基因表达数据 | 九个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4282 | 2025-10-06 |
Integrative Single-Cell Analysis Decodes Gene Expression and Chromatin Accessibility in the Developing Human Fetal Brain
2025-Jul-15, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05184-x
PMID:40663269
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和染色质可及性测序，系统解析人类胎儿大脑发育过程中的基因表达和染色质调控机制 | 首次构建人类胎儿大脑发育的单细胞多组学整合图谱，揭示神经细胞分化轨迹和动态调控机制 | 研究样本仅涵盖8-17周孕期的流产胎儿组织，样本来源有限 | 解析人类胎儿大脑发育过程中的细胞异质性、谱系关系和转录调控网络 | 8-17周孕期的人类胎儿脑组织 | 单细胞组学 | 神经发育疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 流产胎儿脑组织（孕8-17周） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4283 | 2025-10-06 |
Testis Molecular Pathways in CAIS Unveil Testosterone/Estradiol on Germ Cell Tumor Risk in Non-Obstructive Azoospermia
2025-Jul-14, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgaf404
PMID:40658795
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示非梗阻性无精子症中睾丸分子通路与生殖细胞肿瘤风险的关联 | 首次在CAIS患者睾丸体细胞中发现与精原细胞瘤微环境相关的转录特征，并证实睾酮/雌二醇比值对非遗传性NOA患者TGCC的预后价值 | 样本量有限，特别是CAIS病例仅有一例，需要更大规模研究验证 | 建立非遗传性和遗传性NOA睾丸体细胞中共享或特异的分子通路 | 睾丸体细胞、NOA患者、CAIS患者、Klinefelter综合征患者和睾丸生殖细胞癌患者 | 单细胞测序分析 | 男性不育症、睾丸生殖细胞癌 | 单细胞RNA测序、数据整合分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床数据 | 752名年龄匹配男性（120名生育者，155名不育者，116名NOA患者，18名KS患者，343名TGCC患者） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4284 | 2025-10-06 |
SCassist: An AI Based Workflow Assistant for Single-Cell Analysis
2025-Jul-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf402
PMID:40650988
|
研究论文 | 开发了一个基于大型语言模型的R包SCassist，用于指导单细胞RNA测序数据分析 | 首次将大型语言模型集成到单细胞RNA测序分析工作流中，提供参数推荐和结果解释 | NA | 简化单细胞RNA测序数据分析流程，降低技术门槛 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | LLM（大型语言模型） | 基因表达数据 | NA | Google, OpenAI, Meta | 单细胞RNA-seq | Gemini, GPT, Llama3 | 基于大型语言模型的单细胞分析辅助工具 |
| 4285 | 2025-10-06 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals immunotherapy-driven bone marrow niche remodeling in AML
2025-Jul-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adw4871
PMID:40632867
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研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组学揭示了免疫治疗驱动的急性髓系白血病骨髓微环境重塑 | 整合单细胞RNA测序与单细胞空间转录组学数据，开发基于深度学习的图像分析方法，实现精确的转录本定位和细胞间距离量化 | 存在测序深度限制，需要整合多种技术来弥补数据不足 | 研究免疫治疗对AML骨髓微环境中细胞相互作用的影响 | 接受pembrolizumab和地西他滨治疗的急性髓系白血病患者骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学, 深度学习图像分析 | CNN | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 4286 | 2025-10-06 |
PIP4K2C inhibition reverses autophagic flux impairment induced by SARS-CoV-2
2025-Jul-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61759-1
PMID:40640184
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研究论文 | 研究发现小分子抑制剂RMC-113通过抑制PIP4K2C和PIKfyve脂质激酶，逆转SARS-CoV-2诱导的自噬流障碍，从而抑制病毒复制 | 首次揭示PIP4K2C在SARS-CoV-2进入、RNA复制和组装/释放中的作用，并发现其与病毒非结构蛋白6结合调控自噬流 | 研究主要基于人类肺类器官模型，尚未进行体内验证 | 开发广谱抗病毒药物，研究SARS-CoV-2复制机制 | SARS-CoV-2和其他RNA病毒，人类肺类器官 | 病毒学 | COVID-19 | 脂质组学分析，蛋白质组学，单细胞转录组学，功能测定 | NA | 分子相互作用数据，基因表达数据，代谢物数据 | 人类肺类器官模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 4287 | 2025-10-06 |
Mineralocorticoid receptor knockout alters hippocampal CA2 neurons to become like those in CA1
2025-Jul-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08378-0
PMID:40640339
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学方法发现盐皮质激素受体敲除会导致海马CA2神经元获得CA1样分子表型 | 首次揭示盐皮质激素受体在控制海马CA2神经元身份中的关键作用，证明其缺失会使CA2神经元转变为CA1样表型 | 研究主要关注发育阶段，对成年期的影响尚不明确 | 探究盐皮质激素受体敲除对海马CA2神经元命运的影响 | 小鼠海马CA2区域神经元 | 神经科学 | NA | 空间转录组学 | 条件性基因敲除模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4288 | 2025-10-06 |
Antiviral Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2025-Jul-09, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf367
PMID:40628395
|
研究论文 | 本研究通过分析HIV-1治疗中断前后血浆蛋白质组和单细胞转录组，发现病毒反弹前CD16++单核细胞增加并表达抗病毒基因 | 首次在可检测的病毒反弹前发现CD16++单核细胞增加及其抗病毒基因表达特征 | 样本量有限，仅观察外周血单核细胞，未涉及组织驻留细胞 | 识别治疗中断后病毒反弹前的早期免疫信号 | HIV-1感染者的外周血单核细胞和血浆样本 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞转录组测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 4289 | 2025-10-06 |
Early developmental origins of cortical disorders modeled in human neural stem cells
2025-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61316-w
PMID:40634286
|
研究论文 | 本研究通过人类神经干细胞模型探索皮层障碍的早期发育起源 | 首次在人类神经干细胞中系统分析皮层和神经精神疾病风险基因的表达动态，揭示疾病特异性关键阶段和跨疾病信号汇聚机制 | 研究主要基于体外模型，与体内真实发育环境存在差异 | 探索人类端脑早期发育阶段在皮层障碍病因学中的作用 | 人类神经干细胞和皮层发育过程 | 发育神经生物学 | 皮层障碍，自闭症 | 单细胞转录组测序，基因表达分析 | 人类神经干细胞体外分化模型 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4290 | 2025-10-06 |
Ptbp1 is not required for retinal neurogenesis and cell fate specification
2025-Jul-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.02.662808
PMID:40631124
|
研究论文 | 本研究通过条件性敲除Ptbp1基因评估其在视网膜神经发生和细胞命运决定中的作用 | 首次在视网膜发育过程中系统评估Ptbp1功能，发现其缺失不影响视网膜正常发育 | 研究主要关注视网膜发育过程，未全面评估其他神经系统的可能影响 | 评估Ptbp1在发育性神经发生中的作用 | 视网膜祖细胞和Müller胶质细胞 | 神经发育生物学 | NA | 条件性基因敲除, bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, 免疫染色 | NA | 基因表达数据, 剪接模式数据 | 胚胎期E16和成熟视网膜样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4291 | 2025-10-06 |
TCF7 functions as a prognostic biomarker in bladder cancer by strengthening EMT and stemness associated with TGF-β/SMAD3 signaling
2025-Jul, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05241-y
PMID:40025258
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研究论文 | 本研究探讨TCF7通过调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路，从而促进膀胱癌EMT和干细胞特性的机制 | 首次揭示TCF7通过转录调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路驱动膀胱癌EMT和干细胞特性的新机制 | TCF7在膀胱癌中的具体转录调控机制仍需进一步阐明 | 探究TCF7在膀胱癌进展中的作用及调控机制 | 膀胱癌 | 肿瘤生物学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4292 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing generates an atlas of normal tibia cartilage under mechanical loading conditions
2025-Jul, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05234-x
PMID:40072674
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析机械负荷对胫骨软骨细胞的影响 | 首次在单细胞水平构建正常胫骨软骨在机械负荷条件下的图谱，并鉴定负荷相关枢纽基因 | 样本量有限（6名供体），仅分析胫骨特定区域 | 探究机械负荷对软骨细胞生物学过程的影响机制 | 人胫骨软骨组织样本 | 单细胞组学 | 骨关节疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学染色 | NA | 单细胞转录组数据，图像数据 | 11个软骨组织样本（来自6名供体），132,685个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4293 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals that human milk feeding shapes neonatal immune cell interleukin signaling pathways in a nonrandomized clinical trial
2025-Jul, The American journal of clinical nutrition
DOI:10.1016/j.ajcnut.2025.04.024
PMID:40294751
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学分析比较母乳喂养和配方奶喂养婴儿的免疫细胞基因表达差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示母乳喂养对新生儿免疫细胞白介素信号通路的调节作用 | 非随机临床试验设计，样本量较小（n=9） | 表征母乳喂养与配方奶喂养婴儿循环免疫细胞亚群的基因表达差异 | 健康婴儿（3-3.5个月大）的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9名婴儿（6名母乳喂养，3名配方奶喂养） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4294 | 2025-10-06 |
Epitenon-derived progenitors drive fibrosis and regeneration after flexor tendon injury in a spatially-dependent manner
2025-Jul-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60704-6
PMID:40593535
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研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞RNA测序技术，揭示了腱外膜来源的祖细胞在肌腱损伤后纤维化和再生过程中的关键作用 | 首次明确鉴定腱外膜作为肌腱损伤后纤维化和再生的重要祖细胞来源，并证明其空间依赖性功能 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究肌腱损伤修复过程中的细胞来源和机制 | 小鼠肌腱损伤模型和人类肌腱周围瘢痕组织 | 单细胞生物学 | 肌腱损伤 | 遗传谱系追踪，单细胞RNA测序，免疫荧光染色 | NA | 单细胞RNA测序数据，免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4295 | 2025-10-06 |
Deciphering cholangiocarcinoma heterogeneity and specific progenitor cell niche of extrahepatic cholangiocarcinoma at single-cell resolution
2025-Jun-23, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-025-01716-z
PMID:40551145
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学方法揭示胆管癌的分子异质性及肝外胆管癌特异性祖细胞生态位 | 首次在单细胞分辨率下系统比较肝内和肝外胆管癌的肿瘤生态系统差异，发现肝外胆管癌特有的LY6D+基底样癌细胞亚群及其ISG15富集的微环境 | 样本量相对有限（28个样本），需要更大规模研究验证发现 | 解析胆管癌异质性并识别肝外胆管癌特异性祖细胞生态位 | 胆管癌患者组织样本（包括慢性胆道炎症和不同解剖部位胆管癌） | 数字病理学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序,空间RNA原位测序,多组学分析,组织微阵列,患者来源类器官,小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,多组学数据 | 109,071个单细胞来自28个样本（7个慢性胆道炎症,21个胆管癌） | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4296 | 2025-10-06 |
[Biological characteristics of liver zonation and its role in disease and aging]
2025-Jun-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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综述 | 本文总结了肝脏分区代谢特征在维持肝功能中的重要作用及其与疾病和衰老的关系 | 整合单细胞基因组学和空间转录组学新技术揭示肝脏分区在疾病与衰老中的作用机制 | NA | 探讨肝脏分区的生物学特性及其在疾病和衰老过程中的作用 | 肝脏细胞沿门静脉-中央静脉轴的异质性 | 空间转录组学 | 肝脏疾病 | 单细胞基因组学, 空间转录组学 | NA | 基因组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4297 | 2025-10-06 |
Two Specialized Intrinsic Cardiac Neuron Types Safeguard Heart Homeostasis and Stress Resilience
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.13.659555
PMID:40661461
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研究论文 | 通过单细胞转录组学等技术发现心脏内存在两种分子特征不同的神经元亚型，分别负责维持心脏稳态和应激韧性 | 首次在分子水平识别出两种功能特化的心脏内神经元亚型，并阐明其各自在维持冠状动脉灌注和心脏电稳定性中的独特作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类心脏中验证 | 探索心脏内在神经系统的分子和功能组织 | 小鼠心脏内在神经元 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、高分辨率成像、细胞特异性遗传工具 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4298 | 2025-10-06 |
Stc1-expressing myofibroblasts are a developmentally distinct lineage cleared through intrinsic apoptosis in the neonatal lung
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.12.659126
PMID:40661545
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研究论文 | 本研究通过建立遗传标记小鼠模型，揭示了表达Stc1的次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)是发育过程中独特的细胞谱系，并通过内在凋亡途径在新生儿肺中被清除 | 首次建立了能够特异性标记发育性短暂SCMF的遗传工具，并证明SCMF与肺泡管肌成纤维细胞(DMF)具有不同的祖细胞群和生态位 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明肺肌成纤维细胞不同谱系在发育和疾病中的独特贡献 | 小鼠肺组织中的次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)和肺泡管肌成纤维细胞(DMF) | 发育生物学 | 肺发育疾病 | 单细胞RNA测序, 胚胎谱系追踪, 遗传操作 | 遗传工程小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞谱系数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4299 | 2025-10-06 |
ASXL1 truncating mutations drive leukemic resistance to T cell attack
2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.29.656798
PMID:40661385
|
研究论文 | 本研究通过整合分子分析和免疫功能研究，揭示了ASXL1截断突变通过抑制HLA-I表达驱动白血病对T细胞攻击产生耐药性的新机制 | 首次发现ASXL1截断突变是DLI耐药性的遗传基础，并阐明其通过Polycomb非依赖性机制抑制HLA-I表达的免疫逃逸通路 | 研究主要基于白血病细胞系K562和有限的患者队列，需要在更广泛的样本中验证 | 鉴定驱动白血病对供体淋巴细胞输注(DLI)产生耐药性的分子机制 | 接受DLI治疗的白血病患者和K562白血病细胞系 | 癌症免疫学 | 白血病 | 全外显子组测序, 靶向突变panel测序, 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, CRISPR基因编辑 | NA | 基因组测序数据, 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | 138,152个骨髓单个髓系细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 4300 | 2025-10-06 |
Single-cell multi-omic analysis of mesenchymal cells reveals molecular signatures and putative regulators of lung allograft fibrosis
2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.27.625698
PMID:40661599
|
研究论文 | 通过单细胞多组学技术分析肺移植受体间充质细胞的分子特征，揭示肺移植物纤维化的调控机制 | 首次结合单细胞转录组和染色质可及性分析揭示CEBPD作为CLAD相关间充质细胞的关键调控因子 | 样本量有限，早期时间点差异不明显，需要更大队列验证 | 探索肺移植后慢性移植物功能障碍的分子机制 | 肺移植受体的支气管肺泡灌洗液中的间充质细胞 | 单细胞多组学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞多组学测序, siRNA敲低, 染色质可及性分析 | 逻辑回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 染色质可及性数据 | 肺移植受体支气管肺泡灌洗液样本（含CLAD和非CLAD对照组） | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |