单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4281	2025-02-11	The CD8+ T cell tolerance checkpoint triggers a distinct differentiation state defined by protein translation defects 2024-06-11, Immunity IF:25.5Q1 DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.026 PMID:38776918	研究论文	本文研究了外周CD8+ T细胞耐受性检查点，揭示了其与自身免疫疾病和抗癌免疫的关系	通过流式细胞术、单细胞RNA测序和染色质可及性分析，发现耐受性触发了一种与耗竭、记忆和功能性效应细胞不同的分化状态	研究主要关注于小鼠模型，可能需要在人类样本中进一步验证	探讨外周CD8+ T细胞耐受性检查点的分子机制及其在自身免疫疾病和抗癌免疫中的作用	外周CD8+ T细胞	免疫学	自身免疫疾病, 癌症	流式细胞术, 单细胞RNA测序 (scRNA-seq), 染色质可及性分析	NA	RNA测序数据, 染色质可及性数据	NA
4282	2025-02-11	β-cell Jagged1 is sufficient but not necessary for islet Notch activity and insulin secretory defects in obese mice 2024-Mar, Molecular metabolism IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.molmet.2024.101894 PMID:38311286	研究论文	本文研究了肥胖小鼠和2型糖尿病患者胰岛中Jagged1的表达及其对Notch信号通路和胰岛素分泌缺陷的影响	研究发现Jagged1是肥胖小鼠和2型糖尿病患者胰岛中Notch活性增加的唯一配体，并通过中和抗体实验证明抑制Jagged1-Notch信号可能具有治疗益处	遗传功能丧失实验表明β细胞可能不是Jagged1信号的来源，这限制了Jagged1作为治疗靶点的潜力	研究Jagged1在肥胖小鼠和2型糖尿病患者胰岛中的表达及其对Notch信号通路和胰岛素分泌缺陷的影响	肥胖小鼠和2型糖尿病患者的胰岛	生物医学	2型糖尿病	单细胞RNA测序（scRNA-Seq），葡萄糖耐量测试，单克隆中和抗体	NA	基因表达数据，生理数据	高脂饮食喂养的小鼠和瘦素受体缺陷小鼠，以及有和无2型糖尿病患者的胰岛
4283	2025-02-11	Single-cell RNA-seq and single-cell bisulfite-sequencing reveal insights into yak preimplantation embryogenesis 2024-01, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.jbc.2023.105562 PMID:38097189	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和单细胞亚硫酸盐测序揭示了牦牛胚胎植入前发育过程中的基因表达和DNA甲基化变化	结合单细胞DNA甲基化和转录组分析，鉴定了43个可能与胚胎发育相关的候选甲基化驱动基因，并确定了与组蛋白去乙酰化酶HDAC1/2相关的表观遗传修饰对胚胎发育的重要性	研究主要聚焦于牦牛胚胎，可能限制了其在其他物种中的普适性	研究牦牛胚胎植入前发育过程中的表观遗传重编程及其对转录调控网络的影响	牦牛的卵母细胞和不同发育阶段的胚胎	表观遗传学	NA	单细胞RNA测序, 单细胞亚硫酸盐测序	NA	单细胞基因表达数据, 单细胞DNA甲基化数据	牦牛的卵母细胞和一系列不同发育阶段的胚胎
4284	2025-02-11	Human placental cells are resistant to SARS-CoV-2 infection and replication 2024, Wellcome open research DOI:10.12688/wellcomeopenres.20514.2 PMID:39640372	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序和共聚焦显微镜技术，探讨了人类胎盘细胞对SARS-CoV-2感染的易感性及其支持病毒释放的能力	首次量化了胎盘细胞对SARS-CoV-2感染的易感性，并确定了其支持病毒释放的能力	研究主要依赖于体外实验，可能无法完全反映体内情况	探讨SARS-CoV-2在胎盘细胞中的感染和复制能力	人类胎盘细胞	生物医学	COVID-19	单细胞RNA测序（scRNAseq），共聚焦显微镜	NA	RNA测序数据，显微镜图像	包括早期妊娠和足月胎盘细胞，以及JEG-3、JAR和HUVEC细胞系
4285	2025-02-11	Here and there a trophoblast, a transcriptional evaluation of trophoblast cell models 2022-Nov-08, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-022-04589-4 PMID:36346530	综述	本文综述了人类滋养层细胞和干细胞（hTSCs）模型的转录组数据，评估了这些模型的实用性和适用性	整合了单细胞RNA测序数据集，以识别这些模型如何重现早期滋养层发育	NA	评估人类滋养层细胞和干细胞模型的转录组数据，以确定其在实际应用中的价值	人类滋养层细胞和干细胞模型	生物信息学	NA	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
4286	2025-02-11	CD34+ cell atlas of main organs implicates its impact on fibrosis 2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-022-04606-6 PMID:36315271	研究论文	本文通过单细胞RNA测序分析和遗传谱系追踪小鼠模型，研究了CD34+细胞在生理和病理条件下的异质性及其在血管生成和器官纤维化中的作用	揭示了CD34+细胞在血管生成和器官纤维化中的双重作用，特别是表达Pi16的CD34+细胞可能转化为肌成纤维细胞并参与器官纤维化	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨CD34+细胞在生理和病理条件下的身份和作用，特别是其在血管生成和器官纤维化中的角色	CD34+细胞	单细胞RNA测序	心血管疾病	单细胞RNA测序，遗传谱系追踪	遗传谱系追踪小鼠模型	单细胞RNA测序数据	NA
4287	2025-02-11	Integrative insights and clinical applications of single-cell sequencing in cancer immunotherapy 2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-022-04608-4 PMID:36316529	综述	本文综述了单细胞测序在癌症免疫治疗中的进展和应用	单细胞测序提供了单细胞水平的多维度细胞特征，揭示了肿瘤微环境的复杂性、肿瘤异质性的普遍性、细胞组成和细胞间相互作用、细胞谱系追踪以及肿瘤耐药机制	单细胞技术的临床转化尚未深入，特别是在免疫治疗中的应用	提高免疫治疗疗效，推动精准医学发展	癌症患者	数字病理	癌症	单细胞测序	NA	基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组和多组学数据	NA
4288	2025-02-10	Hypoxia regulates small extracellular vesicle biogenesis and cargo sorting through HIF-1α/HRS signaling pathway in head and neck squamous cell carcinoma 2025-Mar, Cellular signalling IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111546 PMID:39631619	研究论文	本研究探讨了缺氧条件下头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞中小细胞外囊泡（sEVs）的生物生成和货物分选的机制	揭示了缺氧通过HIF-1α/HRS信号通路调控sEVs生物生成和货物分选的新机制	研究主要集中于HNSCC细胞，未涉及其他类型癌症细胞	研究缺氧对头颈部鳞状细胞癌中小细胞外囊泡生物生成和货物分选的影响	头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞	细胞生物学	头颈部鳞状细胞癌	空间转录组学和免疫组织化学	NA	细胞实验数据	NA
4289	2025-02-10	Decoding the blueprints of embryo development with single-cell and spatial omics 2025-Mar, Seminars in cell & developmental biology IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.semcdb.2025.01.002 PMID:39889540	综述	本文深入探讨了单细胞和空间组学技术在胚胎发育研究中的最新技术进展及其应用	提供了单细胞和空间多组学方法的最新进展，并系统整理了这些技术在胚胎发育领域的应用	未具体提及技术的局限性	探讨单细胞和空间组学技术在胚胎发育研究中的应用及其潜力	胚胎发育过程中的细胞分化和基因表达变化	生物信息学	NA	单细胞测序、空间转录组学	NA	转录组数据、多组学数据	NA
4290	2025-02-10	Large-Scale Production of Expandable Hepatoblast Organoids and Polarised Hepatocyte Organoids From hESCs Under 3D Static and Dynamic Suspension Conditions 2025-Feb-08, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.70001 PMID:39921573	研究论文	本研究开发了一种新的培养系统，能够在3D悬浮条件下从人类胚胎干细胞（hESCs）大规模生成可扩展的肝母细胞类器官（HB-orgs）和成熟的极化肝细胞类器官（P-hep-orgs）	利用低浓度Matrigel支持的3D悬浮条件，首次实现了在培养皿和生物反应器中大规模生成可扩展的肝母细胞类器官和成熟的极化肝细胞类器官	研究中未提及长期培养的稳定性和功能维持情况	开发一种成本效益高且稳健的平台，用于大规模生产功能性hESC衍生的肝细胞，以用于细胞治疗、疾病建模、药理学和毒理学研究	人类胚胎干细胞（hESCs）	细胞生物学	NA	scRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	NA
4291	2025-02-10	ICOSL, OX40L, and CD30L Control Persistence of Asthmatic CD4 Trm cells 2025-Feb-05, The Journal of allergy and clinical immunology IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1097 PMID:39921040	研究论文	本文研究了控制哮喘CD4 Trm细胞持久性的共刺激分子，并探讨了它们的靶向治疗对哮喘相关记忆T细胞群体寿命的影响	通过单细胞RNA测序技术，识别了ICOSL、OX40L和CD30L在哮喘患者和小鼠模型中的表达，并展示了联合抑制这些分子对减少肺部炎症和记忆T细胞积累的有效性	研究主要基于小鼠模型，人类样本的研究结果需要进一步验证	探索控制过敏原诱导的记忆CD4 T细胞再激活的共刺激分子，并评估其靶向治疗对哮喘相关记忆T细胞群体寿命的影响	人类和小鼠的哮喘肺CD4 T细胞	免疫学	哮喘	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	人类和小鼠的哮喘肺CD4 T细胞样本
4292	2025-02-10	Identification of potential immunologic resilience in the healing process of diabetic foot ulcers 2024-Mar, International wound journal IF:2.6Q1 DOI:10.1111/iwj.14465 PMID:37926487	研究论文	本研究通过生物信息学工具和单细胞RNA测序技术，分析了糖尿病足溃疡（DFU）患者的基因表达数据，揭示了CD8 T细胞在DFU愈合过程中的重要作用	首次通过单细胞RNA测序技术识别了DFU中不同细胞群体的分布，并验证了CD8 T细胞及其相关关键基因在DFU愈合过程中的作用	研究主要依赖于公共数据库的基因表达数据，样本来源和数量可能有限	探讨糖尿病足溃疡的发病机制及治疗新视角	糖尿病足溃疡患者	生物信息学	糖尿病	单细胞RNA测序, RT-qPCR, 流式细胞术	NA	基因表达数据	NA
4293	2025-02-09	Immune mechanisms in multiple sclerosis: CD3 levels on CD28+ CD4+ T cells link antibody responses to human herpesvirus 6 2025-Mar, Cytokine IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.cyto.2025.156866 PMID:39884183	研究论文	本研究通过孟德尔随机化分析探讨了抗体介导的免疫反应与多发性硬化症（MS）之间的联系，并揭示了CD28+ CD4+ T细胞上CD3水平通过改变人类疱疹病毒6（HHV-6）的比例对MS进展的影响	揭示了CD28+ CD4+ T细胞上CD3水平通过改变HHV-6比例对MS进展的影响，为HHV-6介导的MS生物学机制提供了新的见解	抗体介导的免疫反应与MS之间的确切因果关系仍不明确	探讨抗体介导的免疫反应与多发性硬化症（MS）之间的关联，并识别可能参与MS发病和进展的特定感染病原体	多发性硬化症（MS）患者和对照组	免疫学	多发性硬化症	单细胞测序，孟德尔随机化分析	NA	基因表达数据	MS患者和对照组
4294	2025-02-09	Characterization of T-bet expressing B cells in lupus patients indicates a putative prognostic and therapeutic value of these cells for the disease 2025-Feb-07, Clinical and experimental immunology IF:3.4Q3 DOI:10.1093/cei/uxaf008 PMID:39918986	研究论文	本文研究了T-bet+ B细胞在系统性红斑狼疮（SLE）患者中的预后和治疗价值	首次提出T-bet+ B细胞可作为SLE严重程度的预后生物标志物，并可能成为新的治疗靶点	样本量较小，仅包括10名健康捐赠者和22名活动性SLE患者	探讨T-bet+ B细胞在系统性红斑狼疮中的预后和治疗潜力	系统性红斑狼疮（SLE）患者和健康捐赠者的外周血样本	免疫学	系统性红斑狼疮	流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	流式细胞数据、RNA测序数据	10名健康捐赠者和22名活动性SLE患者
4295	2025-02-09	Massively parallel flow-cytometry-based screening of hematopoietic lineage cell populations from up to 25 donors simultaneously 2025-Feb, Methods (San Diego, Calif.) DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.014 PMID:39608688	研究论文	本研究旨在开发一种方法，允许对造血来源细胞表面标记进行高维度和技术统一的筛选	该方法能够在技术上统一的方式下筛选数百万细胞上的数百个标记，从而识别和表征稀有细胞群体的变化	虽然该方法能够处理大量细胞，但对于极低丰度的细胞群体，仍可能遗漏某些调控异常	开发一种高维度且技术统一的细胞表面标记筛选方法，以识别和表征稀有细胞群体的变化	造血来源的细胞群体	生物信息学	NA	流式细胞术、单细胞RNA测序（RNAseq）	机器学习算法	细胞表面标记数据	25个供体的细胞样本
4296	2025-02-09	An analysis of single-cell data reveals therapeutic effects of AMG487 in experimental autoimmune uveitis 2025-Feb, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2024.116671 PMID:39615601	研究论文	本文通过单细胞测序技术分析了AMG487在实验性自身免疫性葡萄膜炎中的治疗效果及其机制	首次使用单细胞测序技术全面分析了AMG487对免疫细胞的转录组影响，揭示了其在调节免疫细胞比例和功能中的作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探讨AMG487在自身免疫性葡萄膜炎中的治疗效果及其作用机制	实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠及Vogt-Koyanagi-Harada患者的免疫细胞	数字病理学	自身免疫性葡萄膜炎	单细胞ATAC测序、RNA测序、流式细胞术	NA	单细胞转录组数据	实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠及Vogt-Koyanagi-Harada患者的免疫细胞样本
4297	2025-02-09	CMAP prediction and experimental validation of Forskolin as a podocyte protective and anti-proteinuric drug for nephrotoxic serum-treated mice 2025-Feb, Biochemical pharmacology IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.bcp.2024.116727 PMID:39716644	研究论文	本文通过结合肾脏单细胞RNA-seq数据库和Connectivity Map数据库（CMAP），预测并验证了Forskolin作为一种足细胞保护和抗蛋白尿药物在肾毒性血清（NTS）处理小鼠中的效果	首次结合单细胞RNA-seq和CMAP数据库预测特定足细胞损伤的药物，并验证了Forskolin的保护作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中进行验证	探索针对特定足细胞损伤的药物预测和验证方法	NTS处理的小鼠和培养的足细胞	数字病理学	肾脏疾病	单细胞RNA-seq, CMAP分析	NA	RNA-seq数据	NTS处理的小鼠和培养的足细胞
4298	2025-02-09	MetaLigand: A database for predicting non-peptide ligand mediated cell-cell communication 2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.01.14.633094 PMID:39868215	研究论文	本文介绍了MetaLigand，一个基于R语言和网络访问的工具，用于预测非肽配体介导的细胞间通讯	MetaLigand通过整合自动管道和手动整理的数据，提高了预测非肽配体丰度的准确性，并支持单细胞RNA测序和空间转录组数据	NA	研究非肽配体在细胞间通讯中的作用，并开发工具预测其生产和受体相互作用	非肽配体（NPLs）及其受体	生物信息学	年龄相关性黄斑变性	RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学	NA	转录组数据	233种非肽配体
4299	2025-02-09	Case study of a neuroendocrine tumor of uncertain origin: single-cell transcriptomics unravels potential primary location 2024-Dec-31, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-024-06071-z PMID:39738894	研究论文	本研究通过单细胞转录组学和全外显子测序技术，探索了一例来源不明的神经内分泌肿瘤的原发部位	利用单细胞RNA测序和全外显子测序技术，结合公开的转录组数据集，开发并验证了用于组织来源识别的分子基因特征	研究仅针对一例病例，样本量较小，结果可能不具有广泛代表性	确定非器官局限性神经内分泌肿瘤的原发部位，以进行准确的诊断和管理	一例位于十二指肠和胰头之间的腹膜后非功能性神经内分泌肿瘤	数字病理学	神经内分泌肿瘤	单细胞RNA测序（scRNA-seq），全外显子测序（WES）	NA	转录组数据	一例病例
4300	2025-02-09	Identification of psoriasis-associated immune marker G3BP2 through single-cell RNA sequencing and meta analysis 2024-12, Immunology IF:4.9Q2 DOI:10.1111/imm.13851 PMID:39267394	研究论文	本研究通过结合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和元分析，揭示了银屑病在细胞水平的潜在机制，并识别了在银屑病进展中起显著作用的免疫调节标记基因	创新性地结合了单细胞RNA测序和元分析，首次识别了与银屑病发病和进展相关的免疫调节标记基因G3BP2	样本量较小，仅包括12名银屑病患者的皮肤组织样本	探索银屑病的发病机制并识别有效的治疗靶点	银屑病患者的皮肤组织	数字病理学	银屑病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），元分析，加权基因共表达网络分析（WGCNA），LASSO回归，ROC曲线分析	NA	RNA测序数据	12名银屑病患者的皮肤组织样本