单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4261 - 4280 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4261 | 2025-10-06 |
OrgaCCC: Orthogonal graph autoencoders for constructing cell-cell communication networks on spatial transcriptomics data
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013212
PMID:40577399
|
研究论文 | 提出一种基于正交图自编码器的空间转录组数据细胞间通讯网络构建方法 | 使用两个正交耦合的变分图自编码器分别捕获细胞/点和基因维度特征，并通过最大化重建特征相似性进行整合 | NA | 从空间转录组数据推断细胞间通讯网络 | 细胞间通讯机制 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 变分图自编码器 | 基因表达谱，空间位置数据 | 五个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4262 | 2025-10-06 |
Mechanisms of Sepsis from a Metabolic Immunology Perspective: A Bidirectional Mendelian Randomization and Single-Cell Sequencing Study of CD39+ Cells
2025-May-27, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002633
PMID:40663487
|
研究论文 | 通过双向孟德尔随机化和单细胞测序研究CD39+细胞在脓毒症中的代谢免疫机制 | 首次整合双向孟德尔随机化与单细胞转录组学揭示CD39+CD8+T细胞通过代谢中间产物影响脓毒症风险的免疫代谢交叉对话机制 | 研究样本量有限，需要进一步实验验证代谢物与免疫表型间的因果关系 | 探究免疫表型与代谢物在脓毒症发病机制中的相互作用 | 脓毒症患者与对照组的免疫细胞和代谢物 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 孟德尔随机化 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 代谢组数据 | 11,643例脓毒症病例和GSE167363数据集样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4263 | 2025-10-06 |
Molecular pathology of acute spinal cord injury in middle-aged mice
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.08.652873
PMID:40463189
|
研究论文 | 本研究通过比较年轻和中年小鼠在脊髓损伤后的行为、组织病理学和转录组学变化，揭示了年龄对脊髓损伤修复机制的影响 | 首次对中年小鼠脊髓损伤病理生物学进行全面的转录组学研究，填补了该年龄段研究空白 | 研究仅关注急性期变化，未评估长期修复过程；样本量相对有限 | 探究年龄对脊髓损伤病理生物学的影响 | 年轻（2-4个月）和中年（10-12个月）小鼠 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据,行为数据,组织病理学数据 | 年轻和中年小鼠群体 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4264 | 2025-10-06 |
Inhibition of Aspartate β-Hydroxylase Enhances Anti-Tumor Immunity
2025, ImmunoTargets and therapy
IF:6.2Q1
DOI:10.2147/ITT.S530987
PMID:40655119
|
研究论文 | 本研究探讨了抑制天冬氨酸β-羟化酶(ASPH)如何增强DNA疫苗诱导的抗肿瘤免疫反应 | 首次发现ASPH抑制可增强DNA疫苗激发的CD8+T细胞免疫反应，并对MHC-I下调的肿瘤产生有效免疫 | 研究仅使用小鼠TC-1/A9肿瘤模型，尚未在人类临床试验中验证 | 研究ASPH抑制对诱导抗肿瘤免疫的影响及参与的免疫细胞 | 小鼠TC-1/A9肿瘤模型及相关的免疫细胞 | 免疫肿瘤学 | 肿瘤 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, ELISPOT检测 | NA | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4265 | 2025-10-06 |
The role of ATF3 in precision medicine of brain arteriovenous malformation: based on endothelial cell proliferation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1567970
PMID:40655140
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多组学分析揭示了ATF3在脑动静脉畸形内皮细胞增殖中的关键作用 | 首次发现ATF3在脑动静脉畸形发病机制中的关键作用，并验证其通过影响内皮细胞增殖促进疾病进展 | NA | 探索脑动静脉畸形的发病机制并开发新的治疗策略 | 脑动静脉畸形患者的内皮细胞 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 细胞转染, CCK-8, RT-qPCR, Transwell, EdU, 管形成实验 | monocle2, CytoTRACE, slingshot, CellChat, pySCENIC | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 4266 | 2025-10-06 |
Using pseudotime derivative on single-cell RNA sequencing data to identify genes undergoing cell cycle regulation
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf123
PMID:40655197
|
研究论文 | 开发了一种利用单细胞RNA测序数据和伪时间导数识别细胞周期调控基因的新方法 | 通过伪时间方法和基因表达速度计算，无需细胞周期同步化或选择实验即可研究细胞周期 | 方法主要适用于细胞系实验，可能受技术变异影响 | 开发无需化学修饰或特定阶段细胞选择的研究细胞周期的方法 | 细胞周期调控基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4267 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals the spatiotemporal effects of long-term electromagnetic field exposure on the liver
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1579121
PMID:40655943
|
研究论文 | 通过单细胞分析研究长期电磁场暴露对肝脏的时空影响 | 首次在单细胞分辨率下系统评估长期电磁场暴露对肝脏的时空影响，揭示了不同肝细胞区域对电磁辐射的敏感性差异 | 研究仅使用小鼠模型，结果向人类外推需谨慎 | 系统评估长期电磁场暴露对肝脏的影响 | 小鼠肝脏细胞 | 单细胞分析 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序，脂质组学分析，组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据，血清生化数据，组织学图像 | 长期电磁场暴露的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4268 | 2025-10-06 |
Multi-Omics Analysis Reveals the transforming growth factor-β Signaling-Driven Multicellular Interactions with Prognostic Relevance in Cervical Cancer Progression
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.114505
PMID:40657372
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了宫颈癌进展中TGF-β信号驱动的多细胞相互作用及其预后相关性 | 首次在单细胞分辨率上系统描绘宫颈癌不同进展阶段的肿瘤微环境动态变化，发现TGF-β驱动的Epi0-中性粒细胞-CAFs生态位形成及其预后价值 | 样本量相对有限（scRNA-seq仅11例），需要更大队列验证 | 解析宫颈癌进展过程中肿瘤微环境异质性演变及其预后意义 | 宫颈癌患者肿瘤组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重免疫组化 | 计算模型,基因集变异分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据 | scRNA-seq: 11例（局部3例、区域4例、转移4例）,TCGA-CESC队列: 304例 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 4269 | 2025-10-06 |
Integration of Multi-Scale Profiling and Machine Learning Reveals the Prognostic Role of Extracellular Matrix-Related Cancer-Associated Fibroblasts in Lung Adenocarcinoma
2025, International journal of medical sciences
IF:3.2Q1
DOI:10.7150/ijms.113580
PMID:40657391
|
研究论文 | 本研究通过整合多尺度分析和机器学习方法，揭示了细胞外基质相关癌症相关成纤维细胞在肺腺癌进展和预后中的关键作用 | 首次系统鉴定eCAFs作为CAF分化的进化终点，发现其通过COL1A1-CD44和COL1A2-CD44配体-受体对与SPP1+巨噬细胞相互作用的新机制 | 需要进一步的实验验证 | 研究肺腺癌中细胞外基质相关癌症相关成纤维细胞的预后作用和治疗靶点价值 | 肺腺癌肿瘤样本和多个队列的转录组数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | 101种机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | 15个LUAD肿瘤样本，整合TCGA、GSE31210、GSE72094多队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组分析 | NA | NA |
| 4270 | 2025-10-06 |
CRISPR-Cas9 Genome Editing Allows Generation of the Mouse Lung in a Rat
2024-07-15, American journal of respiratory and critical care medicine
IF:19.3Q1
DOI:10.1164/rccm.202306-0964OC
PMID:38507610
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR-Cas9基因编辑和囊胚互补技术，首次在大鼠体内成功生成了小鼠肺组织 | 首次实现跨物种（小鼠-大鼠）肺组织生成，胚胎干细胞对肺组织贡献率达到近99% | 研究仅限于小鼠和大鼠模型，尚未在大型动物或人类中验证 | 探索利用大型动物作为生物反应器生成人类肺器官的可能性 | 小鼠胚胎干细胞和大鼠胚胎 | 发育生物学 | 肺发育不全 | CRISPR-Cas9基因编辑，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，免疫染色图像，流式细胞术数据 | 基因编辑大鼠胚胎和鼠-大鼠嵌合体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4271 | 2025-10-06 |
Immune Response following FLASH and Conventional Radiation in Diffuse Midline Glioma
2024-Jul-15, International journal of radiation oncology, biology, physics
DOI:10.1016/j.ijrobp.2024.01.219
PMID:38364947
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术比较了FLASH和常规放疗对弥漫中线胶质瘤肿瘤免疫微环境的影响 | 首次以单细胞分辨率绘制了常规和FLASH放疗对DMG肿瘤免疫微环境的免疫改变图谱 | 研究样本量有限，仅使用小鼠模型，时间点观察有限（仅第4天和第10天） | 探索FLASH和常规放疗对弥漫中线胶质瘤肿瘤免疫微环境的影响差异 | 原位同系小鼠脑干弥漫中线胶质瘤模型中的免疫细胞 | 数字病理学 | 弥漫中线胶质瘤 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 小鼠脑干DMG模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4272 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the landscape of epithelial-mesenchymal transition molecular heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2024-04-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216723
PMID:38342234
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示食管鳞状细胞癌上皮间质转化的分子异质性景观 | 首次在单细胞水平系统描绘ESCC中EMT的分子异质性，发现SERPINH1作为新的EMT标志物，并验证靶向EMT的潜在药物 | 样本量相对有限，需要更大规模验证 | 探究食管鳞状细胞癌中上皮间质转化的分子异质性及其临床意义 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，RNA-seq数据，TCGA数据 | 44名患者的39个肿瘤样本和16个癌旁样本，共209,231个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4273 | 2025-10-06 |
Up-regulation of RAN by MYBL2 maintains osteosarcoma cancer stem-like cells population during heterogeneous tumor generation
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216708
PMID:38336287
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示骨肉瘤癌症干细胞通过MYBL2-RAN通路维持异质性肿瘤的分子机制 | 首次发现MYBL2转录上调RAN并通过增强MYC蛋白核积累促进癌症干细胞自我更新的正反馈机制 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探索骨肉瘤癌症干细胞维持肿瘤异质性的调控机制 | 骨肉瘤癌症干细胞及其分化的异质性细胞群体 | 单细胞转录组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床骨肉瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4274 | 2025-10-06 |
Inhibition of ATM promotes PD-L1 expression by activating JNK/c-Jun/TNF-α signaling axis in triple-negative breast cancer
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216642
PMID:38278470
|
研究论文 | 本研究揭示ATM通过抑制JNK/c-Jun/TNF-α信号轴负向调控PD-L1表达的新机制 | 首次发现ATM通过JNK/c-Jun/TNF-α信号通路负向调控PD-L1表达的分子机制 | 样本量有限（4例scRNA-seq，86例免疫组化），需更大规模研究验证 | 探索ATM调控PD-L1表达的分子机制及其在TNBC免疫治疗中的意义 | 三阴性乳腺癌细胞系、动物模型和临床标本 | 癌症生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化染色，细胞因子阵列分析，Western blot，荧光素酶报告基因检测 | 基因敲低稳定细胞系，动物模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据，临床病理数据 | 4例scRNA-seq临床标本，86例免疫组化TNBC标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4275 | 2025-10-06 |
Single-cell characterization of infiltrating T cells identifies novel targets for gallbladder cancer immunotherapy
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216675
PMID:38280478
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建胆囊癌浸润T细胞图谱并建立分子分型标准 | 首次基于T细胞特征建立胆囊癌分子分型标准，识别了12种T细胞亚型及其与肿瘤微环境的关系 | 未提及样本量大小和研究队列的局限性 | 探索胆囊癌中T细胞的异质性并开发免疫治疗新靶点 | 胆囊癌患者的浸润T细胞 | 单细胞生物学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4276 | 2025-10-06 |
Neoadjuvant chemotherapy-induced remodeling of human hormonal receptor-positive breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2024-03-31, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216656
PMID:38266804
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示新辅助化疗对人类激素受体阳性乳腺癌的免疫微环境重塑作用 | 首次在单细胞水平系统揭示HR乳腺癌化疗前后免疫细胞组成变化，发现新的免疫细胞亚群与化疗敏感性相关 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探索激素受体阳性乳腺癌化疗耐药机制及化疗对肿瘤微环境的重塑作用 | 激素受体阳性乳腺癌患者配对的化疗前后肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 | 配对的化疗前后HR乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4277 | 2025-10-06 |
scRNA-seq of colorectal cancer shows regional immune atlas with the function of CD20+ B cells
2024-03-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216664
PMID:38253219
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结直肠癌不同区域的免疫图谱，揭示CD20+ B细胞的功能 | 首次系统描绘结直肠癌不同解剖区域的免疫特征，发现CD20+ B细胞在右半和左半结直肠癌中具有不同的发育轨迹并与预后相关 | 样本量相对有限（19个样本），需要在更大队列中验证 | 表征结直肠癌不同区域的免疫景观并寻找潜在治疗靶点 | 结直肠癌患者肿瘤组织和配对正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19个样本（来自4个区域），共39,484个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4278 | 2025-10-06 |
Updates in Skin Cancer in Transplant Recipients and Immunosuppressed Patients: Review of the 2022-2023 Scientific Symposium of the International Immunosuppression and Transplant Skin Cancer Collaborative
2024, Transplant international : official journal of the European Society for Organ Transplantation
IF:2.7Q2
DOI:10.3389/ti.2024.12387
PMID:38562207
|
综述 | 总结2022年国际免疫抑制与移植皮肤癌协作组科学研讨会关于移植受者和免疫抑制患者皮肤癌的最新研究进展 | 汇集了皮肤癌在免疫抑制人群中的最新研究成果，包括化学预防、免疫抑制方案、免疫治疗和空间转录组学等前沿领域 | NA | 回顾和总结移植受者和长期免疫抑制患者皮肤癌研究领域的最新科学进展 | 实体器官移植受者和其他形式长期免疫抑制患者 | NA | 皮肤癌 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4279 | 2025-10-06 |
Idiopathic subglottic stenosis arises at the epithelial interface of host and pathogen
2023-May-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2945067/v1
PMID:37292825
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究特发性声门下狭窄的发病机制，揭示上皮细胞异常与微生物群位移在纤维化过程中的作用 | 首次利用国际患者队列和单细胞RNA测序无偏倚地表征声门下狭窄的细胞亚群，发现上皮祖细胞耗竭和微生物群位移至固有层的新机制 | 疾病罕见性和患者地理分布广泛可能限制样本代表性，动物模型与人类疾病的完全一致性尚需验证 | 探究特发性声门下狭窄的发病机制和病理过程 | 特发性声门下狭窄患者的病变黏膜组织和动物模型 | 单细胞基因组学 | 特发性声门下狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、微生物组数据 | 国际iSGS患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4280 | 2025-10-06 |
Unique Cell Type-Specific Signaling Patterns Define Cholesteatoma
2025-Aug-01, Otology & neurotology : official publication of the American Otological Society, American Neurotology Society [and] European Academy of Otology and Neurotology
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/MAO.0000000000004455
PMID:40062383
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析胆脂瘤的细胞组成和细胞类型特异性信号通路 | 首次在单细胞水平上识别胆脂瘤的细胞类型特异性信号模式，揭示了传统批量分析无法发现的细胞异质性 | 样本量有限，仅为计算机模拟细胞研究 | 识别驱动胆脂瘤的细胞类型和信号通路 | 人类胆脂瘤标本和正常人类鼓膜组织 | 数字病理学 | 胆脂瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | CellChat算法 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |