单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4241 - 4260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4241 | 2025-10-06 |
Unveiling the impact of ferroptosis on diabetes-associated cognitive decline through comprehensive single-cell RNA sequencing and experimental studies
2025-Jul, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70101
PMID:40254912
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验研究探讨铁死亡在糖尿病相关认知衰退中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示铁死亡相关基因在糖尿病认知衰退中的表达变化，并验证Tfr1基因敲除和铁死亡抑制对认知功能的保护作用 | 研究仅使用小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 阐明铁死亡在糖尿病相关认知衰退发病机制中的作用 | 2型糖尿病小鼠的海马体组织，特别是少突胶质细胞和小胶质细胞 | 数字病理学 | 糖尿病相关认知衰退 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 行为学分析, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 行为学数据 | T2DM和对照小鼠的海马体样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 4242 | 2025-10-06 |
SpotSweeper: spatially aware quality control for spatial transcriptomics
2025-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02713-3
PMID:40481362
|
研究论文 | 开发了一种名为SpotSweeper的空间感知质量控制方法，用于空间转录组学数据 | 首次提出利用局部邻域信息校正空间混杂效应，能够同时识别局部异常值和区域伪影 | NA | 解决空间转录组学数据质量控制问题 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间基因表达平台 |
| 4243 | 2025-10-06 |
Cancer-Associated Fibroblasts: Heterogeneity, Cancer Pathogenesis, and Therapeutic Targets
2025-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70292
PMID:40656546
|
综述 | 系统阐述癌症相关成纤维细胞(CAFs)的异质性、在肿瘤发生发展中的作用机制及靶向治疗策略 | 整合单细胞多组学和空间转录组学最新发现，提出基于CAF亚型特异性的精准基质治疗路线图 | CAF功能双重性使治疗策略面临临床转化困难 | 探索CAFs在肿瘤微环境中的调控机制及靶向治疗潜力 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其亚型 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4244 | 2025-10-06 |
KIL transcription factors facilitate embryo growth in maize by promoting endosperm elimination via lytic cell death
2025-Jul-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf162
PMID:40579219
|
研究论文 | 本研究揭示了KIL转录因子通过促进胚乳溶解性细胞死亡来调控玉米胚胎生长的机制 | 首次发现KIL1和KIL2两个NAC转录因子特异性调控胚乳邻近胚盾片区域的细胞死亡过程，并揭示了父本基因对胚乳细胞死亡的调控作用 | 研究主要聚焦于KIL转录因子的功能，对其他可能参与调控的因子和分子机制探索不够深入 | 探究玉米籽粒发育过程中胚乳细胞死亡的调控机制及其对胚胎生长的影响 | 玉米(Zea mays)籽粒发育过程中的胚乳组织和胚胎 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析，功能丧失突变体分析 | NA | 转录组数据，表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4245 | 2025-10-06 |
Exploring the sublayer formation process in layer V of the neocortex through two newly identified molecular markers
2025-Jul-01, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhaf174
PMID:40668607
|
研究论文 | 通过两个新分子标记探索新皮层第五层亚层形成过程 | 首次发现Pcp4和FoxO1作为定义新皮层第五层Va和Vb亚层的新型分子标记 | 研究主要关注晚期分化阶段，早期发育机制尚未完全阐明 | 揭示新皮层第五层神经元亚型多样化的分子机制 | 小鼠新皮层第五层兴奋性锥体神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, Dicer条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | Dicer条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4246 | 2025-10-06 |
GPX1 and RCN1 as New Endoplasmic Reticulum Stress-Related Biomarkers in Multiple Sclerosis Brain Tissue and Their Involvement in the APP-CD74 Pathway: An Integrated Study Combining Machine Learning and Multi-Omics
2025-Jun-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136286
PMID:40650067
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和单细胞测序技术，鉴定出13个与多发性硬化相关的内质网应激生物标志物，并揭示了它们在APP-CD74通路中的作用机制 | 首次结合机器学习算法和多组学方法系统鉴定多发性硬化中内质网应激相关生物标志物，并发现GPX1和RCN1的诊断价值 | 研究结果仍需在更大规模的人群中验证，动物模型与人类疾病的差异可能影响结果的普适性 | 探索内质网应激相关生物标志物在多发性硬化发病机制中的作用 | 多发性硬化患者脑组织和实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 | 机器学习 | 多发性硬化 | 单细胞测序,加权基因共表达网络分析,机器学习算法,孟德尔随机化分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4247 | 2025-10-06 |
Identification of Potential Therapeutic Targets for Coronary Atherosclerosis from an Inflammatory Perspective Through Integrated Proteomics and Single-Cell Omics
2025-Jun-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136201
PMID:40649979
|
研究论文 | 通过整合蛋白质组学和单细胞组学方法，从炎症角度识别冠状动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 首次将蛋白质组范围的孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合，从炎症角度系统识别冠状动脉粥样硬化的治疗靶点 | 研究主要基于欧洲人群数据，需要在其他人群中验证 | 识别冠状动脉粥样硬化的炎症相关蛋白治疗靶点 | 冠状动脉粥样硬化患者及相关蛋白质靶点 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质组数据, 基因组数据, 单细胞转录组数据 | UK-PPP队列54,219名参与者(2,923种蛋白质), 冰岛队列35,559名参与者(4,907种蛋白质) | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 4248 | 2025-10-06 |
Uncovering the Regional and Cell Specific Bioactivity of Injectable Extracellular Matrix Biomaterials in Myocardial Infarction through Spatial and Single Nucleus Transcriptomics
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.25.661525
PMID:40667036
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单核RNA测序揭示细胞外基质生物材料在心肌梗死中的区域和细胞特异性生物活性 | 首次使用单细胞和空间分辨转录组学探究生物材料支架在心脏中的治疗活性 | NA | 阐明细胞外基质水凝胶在心肌梗死治疗中的区域和细胞特异性生物活性 | 心肌梗死模型中的细胞外基质生物材料 | 空间转录组学 | 心肌梗死 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 4249 | 2025-10-06 |
Personalized Gut-Liver Microphysiological System Maps Donor-Specific Tissue-Resident Immunity and Reveals a Conserved Metabolic Crosstalk
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.652244
PMID:40667172
|
研究论文 | 构建个性化肠道-肝脏微生理系统以重现组织驻留免疫特征并揭示保守的代谢互作 | 首次建立包含自体免疫细胞的个性化多器官微生理系统，揭示代谢对话与个体免疫特征的共存关系 | 仅使用两名供者的样本，样本规模有限 | 探索组织驻留免疫的个体差异及其与代谢互作的关系 | 原代结肠上皮细胞、肝细胞和自体CD45⁺组织驻留免疫细胞 | 生物医学工程 | 免疫代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | 微生理系统 | 单细胞转录组数据 | 2名供者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4250 | 2025-10-06 |
Stiffness sensing fuels matrix-driven metabolic reboot for kidney repair and regeneration
2025-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.22.660927
PMID:40667238
|
研究论文 | 本研究揭示了Mfap2通过调控细胞外基质硬度和机械信号传导，促进肾脏修复所需的代谢重编程机制 | 首次发现Mfap2作为核心基质蛋白通过Esr2-Lats1轴连接组织硬度感知与代谢重编程，为肾脏修复提供新机制 | 研究主要基于基因工程和药理学模型，临床转化潜力需进一步验证 | 探索细胞外基质驱动的肾脏修复机制 | 急性肾损伤后的肾脏修复过程 | 组织工程与再生医学 | 急性肾损伤 | 组织工程、多组学分析、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学 | 基因敲除模型、药理学模型 | 蛋白质组数据、转录组数据、空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,蛋白质组学 | NA | NA |
| 4251 | 2025-10-06 |
Tumor Cells Enriched for Interferon and Inflammatory Programs Pre-Exist in High Grade Serous Ovarian Cancer and are Proportionately Significantly Increased Post Chemotherapy
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.661404
PMID:40667229
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析化疗前后高级别浆液性卵巢癌肿瘤细胞的转录组变化 | 发现化疗后显著富集表达干扰素和炎症基因特征的肿瘤细胞群，并揭示LINE1去抑制与先天免疫激活的关联 | 样本量相对较小（7对匹配肿瘤），需要更大队列验证 | 定义可逆耐药细胞的脆弱性并探索化疗对肿瘤微环境的影响 | 高级别浆液性卵巢癌患者化疗前后的肿瘤样本 | 单细胞基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据，影像数据 | 7对匹配的化疗前后肿瘤样本，>130个初治肿瘤的跨队列分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4252 | 2025-10-06 |
A spatial atlas of chemoradiation therapy in pancreatic cancer identifies cellular and microenvironmental determinants of persister populations
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660757
PMID:40667350
|
研究论文 | 本研究构建了胰腺癌放化疗的空间图谱，揭示了耐受性细胞群体的细胞和微环境决定因素 | 开发了新型统计方法SpaCCI解析空间细胞互作，首次发现CXCL12/TGFβ驱动的耐受细胞生态位及其对铁死亡和铜死亡途径的抵抗机制 | 样本量相对有限（50例患者样本），空间转录组数据存在细胞类型混合的技术局限 | 阐明胰腺导管腺癌对放疗的适应性机制和细胞间相互作用 | 胰腺导管腺癌患者样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | SpaCCI统计模型 | 转录组数据, 空间数据 | 50例患者样本（16例纵向匹配单细胞RNA测序，34例空间转录组样本） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4253 | 2025-10-06 |
The transcriptome of playfulness is sex biased in the juvenile rat medial amygdala: A role for inhibitory neurons
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115782
PMID:40478737
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序探索了幼年大鼠内侧杏仁核中游戏行为的性别差异转录组特征 | 首次揭示了游戏行为相关转录组在内侧杏仁核中的性别特异性表达模式，并确定抑制性神经元是驱动这种性别差异的关键细胞类型 | 研究仅针对大鼠模型，结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探索游戏行为在内侧杏仁核中的分子机制和性别差异基础 | 幼年大鼠的内侧杏仁核组织 | 神经科学, 转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, 整合生物信息学分析 | NA | 转录组数据 | 新生和幼年大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4254 | 2025-10-06 |
Immunosuppressive Tumor Microenvironment of Osteosarcoma
2025-Jun-24, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17132117
PMID:40647416
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析骨肉瘤的免疫微环境特征 | 首次在骨肉瘤中系统鉴定免疫抑制细胞群体并揭示MDSCs通过NF-κB通路促进免疫抑制微环境的机制 | 样本量较小（12个单细胞RNA测序样本），需要更大队列验证 | 解析骨肉瘤免疫微环境的组成和功能 | 骨肉瘤肿瘤活检样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 细胞-细胞通讯模型 | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | 12个骨肉瘤活检样本（6个新测序+6个已发表） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4255 | 2025-10-06 |
Developmental Plasticity and Stromal Co-option Shape a Pituitary Neuroendocrine Tumor Transcriptional Continuum
2025-Jun-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.18.659743
PMID:40666832
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学解析垂体神经内分泌肿瘤的发育可塑性和微环境相互作用 | 发现垂体神经内分泌肿瘤存在跨越亚型的转录连续谱，挑战传统离散分类；揭示肿瘤细胞共用了正常成体神经内分泌细胞的细胞通讯网络 | 样本来源仅限于人类正常垂体和垂体神经内分泌肿瘤，未涉及其他物种或更广泛的肿瘤类型 | 解析垂体神经内分泌肿瘤的细胞起源、分子异质性和微环境相互作用 | 人类正常垂体和垂体神经内分泌肿瘤组织 | 数字病理学 | 垂体神经内分泌肿瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 419,874个细胞 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4256 | 2025-10-06 |
Cerebellum metastasis model of HER2-positive breast cancer unveils key role of IL34-induced Arg1+ macrophages
2025-Jun-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.17.660224
PMID:40666928
|
研究论文 | 本研究通过建立HER2阳性乳腺癌小脑转移模型，揭示了IL34诱导的Arg1+巨噬细胞在脑转移中的关键作用 | 首次开发了免疫活性小鼠的HER2阳性乳腺癌小脑转移模型，并发现癌细胞产生的IL34通过诱导Arg1+巨噬细胞促进脑转移生长 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究HER2阳性乳腺癌小脑转移的分子机制及治疗策略 | HER2阳性乳腺癌小鼠模型和小脑转移灶 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，MRI，光学成像 | 小鼠移植瘤模型 | 基因表达数据，影像数据 | 未明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4257 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomics Analysis Uncovers ER stress in MANF-deficient Purkinje Cells Underlying Alcohol-induced Cerebellar Vulnerability in Mice
2025-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.19.660571
PMID:40667236
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了MANF缺陷浦肯野细胞中内质网应激在酒精诱导的小脑易损性中的作用机制 | 首次发现MANF在保护浦肯野细胞免受酒精诱导的内质网应激中起关键作用，并揭示了性别特异性差异 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；机制研究仍需进一步深入 | 探究MANF在酒精诱导的浦肯野细胞内质网应激和神经退行性变中的保护作用 | 小鼠浦肯野细胞 | 空间转录组学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学，高通量原位分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据，行为学数据，组织学数据 | PC特异性MANF敲除小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4258 | 2025-10-06 |
Combining Machine Learning and Multiplexed, In Situ Profiling to Engineer Cell Type and Behavioral Specificity
2025-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660790
PMID:40667316
|
研究论文 | 开发了一个结合机器学习和多重原位分析的端到端平台，用于加速脊髓背角增强子发现 | 开发了ESCargoT平台，整合机器学习指导的增强子优先排序、模块化AAV组装和多重原位筛选，实现空间分辨的多重增强子分析 | 基于猕猴基因组的增强子在小鼠中表现出功能特异性，可能存在物种差异限制 | 开发精确控制神经回路的方法，加速细胞靶向工具和基因治疗发展 | 脊髓背角少突胶质细胞和15种背角神经元亚型 | 机器学习 | 疼痛和瘙痒相关疾病 | 染色质可及性数据分析，机器学习模型，空间平行报告基因检测 | 机器学习模型 | 染色质可及性数据，空间表达数据 | 27个增强子-AAV文库在小鼠中进行测试 | NA | 多重原位分析，空间转录组学 | ESCargoT平台 | 整合机器学习指导的增强子优先排序、模块化AAV组装和多重原位筛选的端到端平台 |
| 4259 | 2025-10-06 |
The Human LRRK2-R1441G Mutation Drives Age-Dependent Oxidative Stress and Mitochondrial Dysfunction in Dopaminergic Neurons
2025-Jun-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.16.660029
PMID:40667152
|
研究论文 | 本研究探讨LRRK2-R1441G突变如何通过年龄依赖性方式导致多巴胺神经元线粒体功能障碍和氧化应激 | 首次结合BAC转基因小鼠模型和线粒体靶向氧化还原成像技术，揭示LRRK2突变引起年龄依赖性线粒体功能衰退的机制 | 研究基于转基因小鼠模型，与人类帕金森病存在物种差异 | 探究LRRK2-R1441G突变对中脑多巴胺神经元线粒体功能的影响 | BAC转基因小鼠模型中的中脑多巴胺神经元 | 神经科学 | 帕金森病 | 双光子成像、空间转录组学、线粒体靶向氧化还原成像 | BAC转基因小鼠模型 | 图像、基因表达数据 | 3、6、10月龄小鼠脑切片 | NA | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx数字空间分析仪 |
| 4260 | 2025-10-06 |
Single-Cell Profiling of Lichen Planus Reveals Type I IFN Response Triggering the Interface Dermatitis Reaction
2025-Jun-09, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.043
PMID:40499747
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示扁平苔藓中I型干扰素反应触发界面皮炎反应的免疫发病机制 | 首次在扁平苔藓中发现I型干扰素富集环境，并证明IFN-β能使角质形成细胞对CD8 T细胞介导的细胞死亡敏感 | NA | 研究扁平苔癣的免疫发病机制及驱动界面皮炎反应的潜在机制 | 扁平苔藓患者皮损组织与健康对照皮肤 | 单细胞组学 | 皮肤炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |