单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4241 - 4260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4241 | 2025-10-06 |
Malevolent alliance of MYBL2hi cancer stem cell and SPP1+ macrophage confers resistance to neoadjuvant immunotherapy in bladder cancer
2025-Jul-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-011319
PMID:40639849
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组分析揭示了膀胱癌新辅助免疫治疗耐药的新机制 | 发现MYBL2hi癌症干细胞与SPP1+巨噬细胞之间的恶性同盟是膀胱癌免疫治疗耐药的关键机制 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探索膀胱癌新辅助免疫治疗耐药的分子机制 | 膀胱癌患者的外周血单核细胞、肿瘤组织、癌旁组织和转移淋巴结 | 数字病理 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间RNA测序, 多重免疫组化, 流式细胞术 | 小鼠原位膀胱癌模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 12例膀胱癌患者（2例未治疗，10例nICB治疗，含5例应答者和5例非应答者） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4242 | 2025-10-06 |
Systems analysis of clinical malaria reveals proteomic perturbation and innate-adaptive crosstalk linked to disease severity
2025-Jul-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2025.06.014
PMID:40664217
|
研究论文 | 通过整合血浆蛋白质组学和单细胞RNA测序数据，分析临床疟疾患者的系统生物学变化 | 首次将系统性蛋白质组变化与免疫细胞通讯和器官特异性反应联系起来，并识别出与疾病严重程度相关的11种蛋白质特征 | 研究对象为成人旅行者群体，样本代表性可能存在局限 | 理解疟疾的发病机制和宿主反应，改善临床管理和预防 | 成人旅行者中的急性恶性疟原虫疟疾患者 | 系统生物学 | 疟疾 | 蛋白质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 血浆蛋白质数据，单细胞RNA测序数据 | 包含单细胞RNA测序数据的供体亚群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4243 | 2025-10-06 |
Leucine-rich repeat-containing protein 19 suppresses colorectal cancer by targeting cyclin-dependent kinase 6/E2F1 and remodeling the immune microenvironment
2025-Jul-07, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v31.i25.107893
PMID:40656610
|
研究论文 | 本研究揭示了富含亮氨酸重复序列蛋白19通过靶向CDK6/E2F1轴和重塑免疫微环境抑制结直肠癌的机制 | 首次阐明LRRC19通过调控CDK6/E2F1轴诱导细胞周期阻滞，并发现其对肿瘤免疫微环境的重塑作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究LRRC19在结直肠癌中的肿瘤抑制功能及其分子机制 | 结直肠癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 定量PCR, 免疫组织化学, Western blotting, 流式细胞术, 双荧光素酶报告基因检测, 分子对接, 单细胞测序 | 异种移植模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 单细胞测序数据 | 来自GEO和TCGA数据库的结直肠癌样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4244 | 2025-10-06 |
Emerging Techniques of Translational Research in Immuno-Oncology: A Focus on Non-Small Cell Lung Cancer
2025-Jul-04, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17132244
PMID:40647543
|
综述 | 本文重点介绍免疫肿瘤学中用于改善非小细胞肺癌诊疗精度的新兴转化研究技术 | 聚焦人工智能、液体活检等创新诊断工具在解码肿瘤微环境相互作用机制中的应用 | NA | 优化非小细胞肺癌个性化治疗策略 | 非小细胞肺癌患者 | 自然语言处理 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 液体活检 | 机器学习, 深度学习 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4245 | 2025-10-06 |
Emerging Therapeutic Strategies Targeting GPX4-Mediated Ferroptosis in Head and Neck Cancer
2025-Jul-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136452
PMID:40650229
|
综述 | 本文综述了靶向GPX4介导的铁死亡在头颈癌治疗中的新兴策略 | 系统阐述了GPX4在铁死亡中的核心调控机制及其在治疗耐药头颈癌中的靶向价值 | 药物递送、毒性和耐药机制等挑战仍需解决，目前主要基于临床前数据 | 探索靶向GPX4介导的铁死亡作为克服头颈癌治疗耐药的新策略 | 头颈癌及其治疗耐药亚型 | 肿瘤治疗学 | 头颈癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4246 | 2025-10-06 |
Stratification of Hepatocellular Carcinoma Using N6-Methyladenosine
2025-Jul-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17132220
PMID:40647517
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一个基于m6A相关基因的八基因风险模型，用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗效果 | 首次利用m6A相关基因构建肝细胞癌风险分层模型，并系统评估其与免疫治疗疗效的关联 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要更多前瞻性研究验证模型的临床应用价值 | 开发基于m6A相关基因的肝细胞癌预后和免疫治疗疗效预测模型 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，LASSO Cox回归，多元Cox回归，体外实验 | 风险评分模型 | 转录组数据，临床数据，单细胞转录组数据 | 485例HCC患者（TCGA-LIHC和GSE76427），外加ICGC外部验证队列 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4247 | 2025-10-06 |
Current Landscape of Preclinical Models for Pediatric Gliomas: Clinical Implications and Future Directions
2025-Jul-02, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17132221
PMID:40647519
|
综述 | 本文综述了儿童胶质瘤临床前模型的现状，重点介绍了各类模型在模拟肿瘤生物学和肿瘤微环境方面的进展 | 整合了包括患者来源脑类器官、基因工程小鼠模型和区域特异性中线类器官在内的多种创新模型，并应用单细胞RNA测序和空间转录组学等多组学平台 | NA | 推进儿童高级别胶质瘤的有效治疗方法开发 | 儿童高级别胶质瘤（pHGGs），特别是弥漫性中线胶质瘤（DMGs） | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，CRISPR-Cas9，脂质体介导的转染，PiggyBac质粒系统 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 4248 | 2025-10-06 |
Scalable and unsupervised discovery from raw sequencing reads using SPLASH2
2025-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02381-2
PMID:39313645
|
研究论文 | 介绍SPLASH2，一种基于高效k-mer计数方法的快速可扩展实现，用于在多种测序技术和生物背景的大规模数据集中检测调控序列变异 | 基于高效k-mer计数方法实现快速可扩展的序列变异检测，支持多种测序技术和生物背景 | NA | 开发可扩展的无监督序列变异检测方法 | 原始测序读数 | 生物信息学 | 癌症 | k-mer计数，单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | NA |
| 4249 | 2025-10-06 |
Multiplexed, image-based pooled screens in primary cells and tissues with PerturbView
2025-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02391-0
PMID:39375449
|
研究论文 | 开发了一种名为PerturbView的光学池筛选技术，可在原代细胞和组织中进行多重图像表型筛选 | 利用体外转录在原位测序前扩增条形码，首次实现原代细胞和组织中的高多重表型筛选 | 未明确说明技术应用的样本规模限制或具体技术参数 | 开发适用于多种系统的光学池筛选技术 | 诱导多能干细胞衍生神经元、原代免疫细胞和动物模型肿瘤组织切片 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 原位测序、体外转录、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 光学池筛选、空间转录组学 | PerturbView | 基于体外转录条形码扩增的光学池筛选平台 |
| 4250 | 2025-10-06 |
Unveiling the impact of ferroptosis on diabetes-associated cognitive decline through comprehensive single-cell RNA sequencing and experimental studies
2025-Jul, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70101
PMID:40254912
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验研究探讨铁死亡在糖尿病相关认知衰退中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示铁死亡相关基因在糖尿病认知衰退中的表达变化，并验证Tfr1基因敲除和铁死亡抑制对认知功能的保护作用 | 研究仅使用小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 阐明铁死亡在糖尿病相关认知衰退发病机制中的作用 | 2型糖尿病小鼠的海马体组织，特别是少突胶质细胞和小胶质细胞 | 数字病理学 | 糖尿病相关认知衰退 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 行为学分析, 基因敲除 | NA | 基因表达数据, 行为学数据 | T2DM和对照小鼠的海马体样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 4251 | 2025-10-06 |
SpotSweeper: spatially aware quality control for spatial transcriptomics
2025-Jul, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02713-3
PMID:40481362
|
研究论文 | 开发了一种名为SpotSweeper的空间感知质量控制方法，用于空间转录组学数据 | 首次提出利用局部邻域信息校正空间混杂效应，能够同时识别局部异常值和区域伪影 | NA | 解决空间转录组学数据质量控制问题 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间基因表达平台 |
| 4252 | 2025-10-06 |
Cancer-Associated Fibroblasts: Heterogeneity, Cancer Pathogenesis, and Therapeutic Targets
2025-Jul, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70292
PMID:40656546
|
综述 | 系统阐述癌症相关成纤维细胞(CAFs)的异质性、在肿瘤发生发展中的作用机制及靶向治疗策略 | 整合单细胞多组学和空间转录组学最新发现，提出基于CAF亚型特异性的精准基质治疗路线图 | CAF功能双重性使治疗策略面临临床转化困难 | 探索CAFs在肿瘤微环境中的调控机制及靶向治疗潜力 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其亚型 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4253 | 2025-10-06 |
KIL transcription factors facilitate embryo growth in maize by promoting endosperm elimination via lytic cell death
2025-Jul-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf162
PMID:40579219
|
研究论文 | 本研究揭示了KIL转录因子通过促进胚乳溶解性细胞死亡来调控玉米胚胎生长的机制 | 首次发现KIL1和KIL2两个NAC转录因子特异性调控胚乳邻近胚盾片区域的细胞死亡过程，并揭示了父本基因对胚乳细胞死亡的调控作用 | 研究主要聚焦于KIL转录因子的功能，对其他可能参与调控的因子和分子机制探索不够深入 | 探究玉米籽粒发育过程中胚乳细胞死亡的调控机制及其对胚胎生长的影响 | 玉米(Zea mays)籽粒发育过程中的胚乳组织和胚胎 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析，功能丧失突变体分析 | NA | 转录组数据，表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4254 | 2025-10-06 |
Exploring the sublayer formation process in layer V of the neocortex through two newly identified molecular markers
2025-Jul-01, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhaf174
PMID:40668607
|
研究论文 | 通过两个新分子标记探索新皮层第五层亚层形成过程 | 首次发现Pcp4和FoxO1作为定义新皮层第五层Va和Vb亚层的新型分子标记 | 研究主要关注晚期分化阶段，早期发育机制尚未完全阐明 | 揭示新皮层第五层神经元亚型多样化的分子机制 | 小鼠新皮层第五层兴奋性锥体神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, Dicer条件性基因敲除 | NA | 基因表达数据 | Dicer条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4255 | 2025-10-06 |
GPX1 and RCN1 as New Endoplasmic Reticulum Stress-Related Biomarkers in Multiple Sclerosis Brain Tissue and Their Involvement in the APP-CD74 Pathway: An Integrated Study Combining Machine Learning and Multi-Omics
2025-Jun-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136286
PMID:40650067
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和单细胞测序技术，鉴定出13个与多发性硬化相关的内质网应激生物标志物，并揭示了它们在APP-CD74通路中的作用机制 | 首次结合机器学习算法和多组学方法系统鉴定多发性硬化中内质网应激相关生物标志物，并发现GPX1和RCN1的诊断价值 | 研究结果仍需在更大规模的人群中验证，动物模型与人类疾病的差异可能影响结果的普适性 | 探索内质网应激相关生物标志物在多发性硬化发病机制中的作用 | 多发性硬化患者脑组织和实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠模型 | 机器学习 | 多发性硬化 | 单细胞测序,加权基因共表达网络分析,机器学习算法,孟德尔随机化分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4256 | 2025-10-06 |
Identification of Potential Therapeutic Targets for Coronary Atherosclerosis from an Inflammatory Perspective Through Integrated Proteomics and Single-Cell Omics
2025-Jun-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26136201
PMID:40649979
|
研究论文 | 通过整合蛋白质组学和单细胞组学方法，从炎症角度识别冠状动脉粥样硬化的潜在治疗靶点 | 首次将蛋白质组范围的孟德尔随机化分析与单细胞RNA测序相结合，从炎症角度系统识别冠状动脉粥样硬化的治疗靶点 | 研究主要基于欧洲人群数据，需要在其他人群中验证 | 识别冠状动脉粥样硬化的炎症相关蛋白治疗靶点 | 冠状动脉粥样硬化患者及相关蛋白质靶点 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化分析, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质组数据, 基因组数据, 单细胞转录组数据 | UK-PPP队列54,219名参与者(2,923种蛋白质), 冰岛队列35,559名参与者(4,907种蛋白质) | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 4257 | 2025-10-06 |
Uncovering the Regional and Cell Specific Bioactivity of Injectable Extracellular Matrix Biomaterials in Myocardial Infarction through Spatial and Single Nucleus Transcriptomics
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.25.661525
PMID:40667036
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单核RNA测序揭示细胞外基质生物材料在心肌梗死中的区域和细胞特异性生物活性 | 首次使用单细胞和空间分辨转录组学探究生物材料支架在心脏中的治疗活性 | NA | 阐明细胞外基质水凝胶在心肌梗死治疗中的区域和细胞特异性生物活性 | 心肌梗死模型中的细胞外基质生物材料 | 空间转录组学 | 心肌梗死 | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 4258 | 2025-10-06 |
Personalized Gut-Liver Microphysiological System Maps Donor-Specific Tissue-Resident Immunity and Reveals a Conserved Metabolic Crosstalk
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.05.652244
PMID:40667172
|
研究论文 | 构建个性化肠道-肝脏微生理系统以重现组织驻留免疫特征并揭示保守的代谢互作 | 首次建立包含自体免疫细胞的个性化多器官微生理系统，揭示代谢对话与个体免疫特征的共存关系 | 仅使用两名供者的样本，样本规模有限 | 探索组织驻留免疫的个体差异及其与代谢互作的关系 | 原代结肠上皮细胞、肝细胞和自体CD45⁺组织驻留免疫细胞 | 生物医学工程 | 免疫代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | 微生理系统 | 单细胞转录组数据 | 2名供者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4259 | 2025-10-06 |
Stiffness sensing fuels matrix-driven metabolic reboot for kidney repair and regeneration
2025-Jun-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.22.660927
PMID:40667238
|
研究论文 | 本研究揭示了Mfap2通过调控细胞外基质硬度和机械信号传导，促进肾脏修复所需的代谢重编程机制 | 首次发现Mfap2作为核心基质蛋白通过Esr2-Lats1轴连接组织硬度感知与代谢重编程，为肾脏修复提供新机制 | 研究主要基于基因工程和药理学模型，临床转化潜力需进一步验证 | 探索细胞外基质驱动的肾脏修复机制 | 急性肾损伤后的肾脏修复过程 | 组织工程与再生医学 | 急性肾损伤 | 组织工程、多组学分析、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学 | 基因敲除模型、药理学模型 | 蛋白质组数据、转录组数据、空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,蛋白质组学 | NA | NA |
| 4260 | 2025-10-06 |
Tumor Cells Enriched for Interferon and Inflammatory Programs Pre-Exist in High Grade Serous Ovarian Cancer and are Proportionately Significantly Increased Post Chemotherapy
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.661404
PMID:40667229
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析化疗前后高级别浆液性卵巢癌肿瘤细胞的转录组变化 | 发现化疗后显著富集表达干扰素和炎症基因特征的肿瘤细胞群，并揭示LINE1去抑制与先天免疫激活的关联 | 样本量相对较小（7对匹配肿瘤），需要更大队列验证 | 定义可逆耐药细胞的脆弱性并探索化疗对肿瘤微环境的影响 | 高级别浆液性卵巢癌患者化疗前后的肿瘤样本 | 单细胞基因组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据，影像数据 | 7对匹配的化疗前后肿瘤样本，>130个初治肿瘤的跨队列分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |