单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37421 篇文献，本页显示第 4221 - 4240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4221 | 2026-01-10 |
CausalGRN: deciphering causal gene regulatory networks from single-cell CRISPR screens
2025-Dec-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.30.692369
PMID:41509211
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为CausalGRN的可扩展计算框架，用于从单细胞CRISPR筛选数据中推断因果基因调控网络并预测细胞对未知扰动的响应 | 提出了一种新颖的自适应阈值校正方法，以减轻稀疏单细胞RNA-seq数据中普遍存在的虚假偏相关，从而能够稳健地推断无向图，并利用观察到的扰动结果进行定向，最终通过网络传播预测新扰动的下游效应 | NA | 从单细胞CRISPR筛选数据中解码因果基因调控网络 | 单细胞RNA-seq数据及CRISPR扰动结果 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, CRISPR筛选 | 网络推断与传播模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4222 | 2026-01-10 |
GLP-1R Agonism Directly Improves the Pumping Capacity of Murine Collecting Lymphatic Vessels
2025-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.26.696603
PMID:41509291
|
研究论文 | 本研究探讨了GLP-1R激动剂对小鼠集合淋巴管泵血能力的直接影响 | 首次发现GLP-1R在淋巴管内皮细胞中的特异性表达，并证明GLP-1R激动剂能直接改善淋巴管收缩功能 | 潜在的信号通路成分尚未完全阐明，需要进一步研究 | 研究GLP-1R激动剂是否对淋巴管功能有直接作用，而非仅通过体重减轻产生系统效益 | 野生型小鼠、饮食诱导肥胖小鼠和高胆固醇血症ApoE KO小鼠的淋巴管 | NA | 继发性淋巴水肿 | 单细胞RNA测序、荧光共聚焦显微镜、压力肌动描记术 | NA | 基因表达数据、图像数据、生理测量数据 | 多种小鼠模型（WT、DIO、ApoE KO）的淋巴管样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4223 | 2026-01-10 |
Spatial transcriptomic profiling of decalcified murine musculoskeletal samples via Xenium Prime 5K
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.693132
PMID:41509209
|
研究论文 | 本文详细介绍了针对小鼠肌肉骨骼组织样本的全面处理流程，旨在通过10x Genomics的Xenium Prime 5K平台实现高质量的空间转录组学数据生成 | 开发了一种综合样本处理流程，包括经心灌注、固定、脱钙、石蜡处理及样本共包埋策略，成功解决了在脱钙肌肉骨骼组织中保持RNA完整性的挑战 | NA | 旨在实现从小鼠肌肉骨骼组织中生成高质量的空间转录组学数据 | 小鼠的完整膝关节、胫骨和腰椎等肌肉骨骼组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | 涉及成年小鼠的多种组织类型，包括滑膜、半月板、髌腱、关节软骨、软骨下骨、皮质骨、骨髓、肌肉、骨折骨痂和背根神经节 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium Prime 5K | Xenium Prime 5K平台，用于基于成像的空间转录组学分析 |
| 4224 | 2026-01-10 |
Single-Cell Dissection of Fibroblast Heterogeneity in Diabetic Ulcers: Platelet-Rich Plasma (PRP) Therapy Activates Core Regenerative Programs via PLAGL1/RUNX2/ZKSCAN7 Networks
2025-Dec-18, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL47450
PMID:41504054
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多组学方法，揭示了糖尿病溃疡中成纤维细胞的异质性，并评估了富血小板血浆（PRP）疗法通过激活PLAGL1/RUNX2/ZKSCAN7网络促进愈合的机制 | 首次在糖尿病溃疡中系统表征成纤维细胞异质性，并鉴定出PRP疗法通过PLAGL1/RUNX2/ZKSCAN7转录因子网络激活核心再生程序的新机制 | 研究样本量相对较小（人类样本n=14，动物模型验证），且主要基于观察性数据，需要进一步功能实验验证机制 | 表征糖尿病溃疡中成纤维细胞的异质性，并评估PRP疗法的疗效及分子机制 | 糖尿病足溃疡患者（愈合n=9，未愈合n=5）的皮肤组织，以及链脲佐菌素诱导的糖尿病溃疡大鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病溃疡 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），细胞间通讯分析，转录因子分析，伪时间轨迹重建，动物模型验证 | NA | 单细胞RNA测序数据，转录组数据 | 人类样本：14例（愈合9例，未愈合5例）；动物模型：糖尿病溃疡大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4225 | 2026-01-10 |
Comprehensive Multi-Omics Analysis Identifies Lactylation-Related Gene RAN as a Novel Prognostic Biomarker and Therapeutic Target in Glioma
2025-Dec-18, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL46765
PMID:41504052
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与机器学习方法，鉴定出乳酸化修饰相关基因RAN是胶质瘤的新型预后生物标志物和治疗靶点 | 首次系统性地将乳酸化修饰与胶质瘤进展联系起来，并通过创新的多步骤分析流程（结合scRNA-seq、空间转录组学和101种机器学习组合策略）鉴定出RAN这一关键基因，揭示了其通过PI3K/AKT通路促进肿瘤恶性表型的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，功能验证仅在有限的胶质瘤细胞系（LN229, U87, U251）中进行，缺乏体内动物模型实验和临床样本的进一步验证 | 系统鉴定胶质瘤中关键的乳酸化修饰相关基因，阐明其功能和作用通路，并探索其作为新型治疗靶点的潜力 | 胶质瘤（中枢神经系统原发性恶性肿瘤） | 生物信息学， 计算生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习特征选择, shRNA敲低, 细胞功能实验（CCK-8, 克隆形成, EdU, 伤口愈合, Transwell）, 蛋白质印迹 | 多种机器学习算法（共10种）及其组合策略（共101种）， 包括弹性网络（ENet, α = 0.4） | 基因表达数据（RNA-seq, scRNA-seq）， 空间转录组数据， 临床预后数据 | 来自TCGA、GEO和CGGA数据库的多个数据集， 具体样本数量未在摘要中明确说明；功能验证使用了LN229、U87和U251三种胶质瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4226 | 2026-01-10 |
Cancer-Associated Fibroblast-Centric Risk Model Predicts Immunotherapy Resistance in Pancreatic Cancer and Reveals PLOD2 as a Key Stromal Therapeutic Target
2025-Dec-17, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL46316
PMID:41504058
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与实验验证，构建了以癌症相关成纤维细胞为中心的风险模型，用于预测胰腺癌免疫治疗耐药性，并揭示PLOD2作为关键基质治疗靶点 | 首次系统性结合加权基因共表达网络和蛋白质-蛋白质相互作用网络分析，识别出CAF相关核心基因，并通过单细胞RNA测序验证其在CAF中的表达，建立风险模型预测免疫治疗反应 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏大规模临床队列验证，且未深入探讨所有核心基因的具体作用机制 | 探究癌症相关成纤维细胞在胰腺腺癌中的作用机制，并开发靶向CAF的治疗策略 | 胰腺腺癌患者的多组学数据、肿瘤细胞行为及癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多组学数据分析、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 风险预测模型 | 多组学数据、基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但基于多数据库分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4227 | 2026-01-10 |
Hypoxia-Activated PERK Promotes Epithelial-Mesenchymal Transition in Gliomas: A Single-Cell and Spatial Transcriptomic Study With Therapeutic Implications
2025-Dec-17, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL46692
PMID:41504057
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，揭示了缺氧激活的PERK通路在胶质瘤中促进上皮-间质转化（EMT）的关键作用及其治疗意义 | 首次结合单细胞测序和空间转录组学技术，系统阐明了缺氧环境下PERK通路通过SPP1-CD44相互作用驱动胶质瘤EMT和侵袭的新机制 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证部分在细胞系和动物模型中进行，临床样本验证有限 | 探究内质网应激（ERS）特别是PERK通路在胶质瘤EMT和恶性进展中的作用 | 胶质瘤细胞系、裸鼠模型、公共单细胞和空间转录组数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、伪时间分析、细胞通讯分析 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、细胞实验数据 | 公共数据库中的胶质瘤样本、PERK沉默的胶质瘤细胞系、裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4228 | 2026-01-10 |
Cross-Study Meta-Analysis of Blood Transcriptomes in Type 2 Diabetes
2025-Dec-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412046
PMID:41465472
|
研究论文 | 本研究通过整合自身和公开的血液RNA-seq数据，进行跨研究荟萃分析，探索2型糖尿病的转录组变化和潜在生物标志物 | 首次通过跨研究荟萃分析整合多个血液转录组数据集，识别出2065个差异表达基因，其中包括713个在原始研究中未发现的新基因，并揭示了中性粒细胞活化和增殖在2型糖尿病中的潜在作用 | 不同研究间的基因表达变化一致性较低，仅少数差异表达基因在所有数据集中被一致识别，样本量相对较小，可能影响结果的普遍性 | 阐明2型糖尿病的致病机制并识别潜在的生物标志物 | 2型糖尿病患者和对照受试者的全血样本 | 自然语言处理 | 2型糖尿病 | bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | 9名T2D患者和9名对照受试者（自身研究），加上七个公开数据集 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4229 | 2026-01-10 |
Multi-dimensional omics integrated machine learning framework identifies macrophage-fibroblast-tumor co-infiltration patterns to predict prognosis in gastric cancer
2025-Dec-09, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-025-02179-9
PMID:41360923
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学、单细胞RNA测序和机器学习技术，识别并验证了胃癌中巨噬细胞-成纤维细胞-肿瘤细胞共浸润的空间模式，并开发了一个基于迁移学习的预测模型 | 首次在胃癌中系统性地识别了巨噬细胞-成纤维细胞-肿瘤细胞的空间共浸润模式，并利用迁移学习构建了能够识别该模式的机器学习框架 | 研究主要基于回顾性数据，需要在前瞻性队列中进一步验证模型的临床适用性 | 揭示胃癌肿瘤微环境的空间异质性，开发预后预测工具 | 胃癌组织样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光, 机器学习 | ResNet-50, 迁移学习 | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4230 | 2026-01-10 |
Immune landscape-driven subtyping reveals distinct microenvironment and prognostic profiles in thymic epithelial tumors
2025-Dec-06, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01197-w
PMID:41353296
|
研究论文 | 本研究通过整合公共数据集和内部验证队列的免疫相关基因表达数据，对胸腺上皮肿瘤进行免疫亚型分型，揭示了两种具有不同微环境特征和预后的亚型 | 首次基于免疫景观对胸腺上皮肿瘤进行亚型分型，并揭示了髓系/基质富集亚型通过MIF介导的机制抑制CD8+ T细胞功能 | 研究依赖于公共数据集和单中心验证队列，样本量有限，需要更大规模的多中心研究进行验证 | 建立胸腺上皮肿瘤的临床相关免疫分类系统，以整合分子、免疫学和临床特征 | 胸腺上皮肿瘤患者 | 数字病理学 | 胸腺上皮肿瘤 | RNA测序，单细胞转录组学，多重免疫荧光 | 共识聚类 | 基因表达数据，单细胞转录组数据，图像数据 | 公共数据集和内部验证队列共119例样本（LRS亚型86例，MSRS亚型33例），以及瑞金队列的FFPE-RNA测序验证 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 4231 | 2026-01-10 |
Promoting astrocyte-neuron triiodothyronine shuttling attenuates brain damage in neonatal hypoxic-ischemic encephalopathy
2025-Dec-02, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03641-x
PMID:41331484
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和蛋白质组学分析，揭示了新生儿缺氧缺血性脑病中星形胶质细胞与神经元之间的转录耦合，并鉴定了一个具有神经保护功能的Dio2⁺Slc1a2⁺星形胶质细胞亚群 | 首次在HIE中鉴定出具有代谢和神经保护特征的Dio2⁺Slc1a2⁺星形胶质细胞亚群，并揭示了T3介导的星形胶质细胞-神经元交互作用机制 | 研究基于大鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 探索星形胶质细胞-神经元交互在新生儿缺氧缺血性脑病中的作用，并寻找潜在治疗靶点 | 出生后第7天的大鼠幼崽（Rice-Vannucci模型诱导的缺氧缺血性脑损伤） | 神经科学 | 新生儿缺氧缺血性脑病 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学分析，多重免疫荧光，ELISA，Western blotting，激光散斑对比成像 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质组数据，图像数据，行为学数据 | 出生后第7天的大鼠幼崽，具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4232 | 2026-01-10 |
Single-cell transcriptomic profiling reveals aberrant CD4⁺ naive T cell differentiation driving immune activation in Behçet's uveitis
2025-Dec-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07520-0
PMID:41331613
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了白塞病葡萄膜炎中CD4⁺初始T细胞异常分化驱动免疫激活的机制 | 首次整合外周血和房水样本的单细胞转录组数据，系统描绘了BU中T细胞从循环到眼内炎症部位的动态分化轨迹，并识别出IL-32和CXCR4作为关键调控因子 | 样本量有限，功能验证主要在体外进行，缺乏体内干预实验证实靶向治疗潜力 | 阐明白塞病葡萄膜炎中T细胞功能障碍和局部免疫激活的精确机制 | 白塞病葡萄膜炎患者和健康对照者的外周血单个核细胞及公开的房水样本 | 单细胞组学 | 白塞病葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | BU患者和健康对照者的PBMCs样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4233 | 2026-01-10 |
Sex-dimorphic reprogramming of fetal mouse brain development by maternal estradiol excess
2025-Dec-02, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-025-00792-7
PMID:41331623
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，系统分析了母体高雌激素暴露对小鼠胎儿大脑发育的性别二态性影响 | 首次结合空间转录组学与细胞类型鉴定，揭示了母体高雌激素暴露导致胎儿大脑基因表达、信号通路和调控子活性的性别特异性变化，并发现了雄性大脑皮层神经祖细胞增殖-分化平衡的特定破坏 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；空间转录组学分辨率可能有限，未能捕捉所有细胞亚型的细微变化 | 探究母体高雌激素暴露如何导致胎儿大脑发育的性别二态性重编程，以理解神经发育障碍的机制 | 小鼠胎儿大脑组织 | 空间转录组学 | 神经发育障碍 | 空间转录组学，免疫荧光 | NA | 空间转录组数据，图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4234 | 2026-01-10 |
HCMV immediate-early protein IE2 induces neurotoxicity and hearing loss by disrupting TSC2-mTOR signaling and metabolic homeostasis
2025-Dec-02, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03646-6
PMID:41331812
|
研究论文 | 本研究揭示了人巨细胞病毒（HCMV）立即早期蛋白IE2通过破坏TSC2-mTOR信号通路和代谢稳态，导致神经毒性和听力损失的机制 | 首次发现HCMV IE2蛋白通过直接与TSC2相互作用，导致mTOR信号过度激活、代谢失调和线粒体功能障碍，从而引起听力损失，并证明mTOR抑制剂可缓解这些缺陷 | 研究主要基于转基因小鼠模型，其在人类HCMV感染中的直接相关性仍需进一步验证 | 探究HCMV立即早期蛋白IE1和IE2在感觉神经性听力损失（SNHL）中的作用及机制 | 表达HCMV IE1和IE2蛋白的转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 感觉神经性听力损失 | scRNA-seq, 透射电子显微镜 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据, 图像数据 | 转基因小鼠模型（具体数量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4235 | 2026-01-10 |
A mannitol-based buffer improves single-cell RNA sequencing of high-salt marine cells
2025-Dec-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12370-7
PMID:41326993
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于甘露醇的缓冲液（PBS-M），用于改善高盐度海洋生物细胞的单细胞RNA测序质量 | 开发了一种低盐度磷酸盐缓冲液（PBS-M），通过添加D-甘露醇来维持高盐度海洋细胞的活力，从而提高scRNA-seq的数据质量和细胞代表性 | 研究仅在海鞘类物种中进行了验证，尚未在其他海洋生物中广泛测试 | 优化单细胞RNA测序技术，以更好地应用于高盐度海洋生物的研究 | 海鞘Ciona robusta的血液细胞以及第二种海鞘物种 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量，但涉及海鞘的血液细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4236 | 2026-01-10 |
Leveraging two novel droplet-based single-cell RNA Sequencing platforms: a comparative study with 10x genomics
2025-Dec-01, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12355-6
PMID:41327014
|
研究论文 | 本文对两种新型液滴式单细胞RNA测序平台（SeekOne和MobiDrop）与广泛使用的10x Genomics平台进行了比较研究 | 首次独立比较了SeekOne和MobiDrop这两种新兴液滴式单细胞RNA测序平台与行业标准10x Genomics的性能差异 | 研究仅基于特定样本类型进行，可能未涵盖所有生物对象或实验条件，且比较范围有限 | 评估不同单细胞RNA测序平台的性能，以帮助研究者选择最适合其研究需求的平台 | 不同复杂度和质量的细胞悬浮液样本 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确指定具体样本数量，但涉及多种样本类型 | 10x Genomics, SeekOne, MobiDrop | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium, SeekOne平台, MobiDrop平台 | 液滴式高通量单细胞RNA测序平台，包括10x Chromium系统及两种新型替代平台 |
| 4237 | 2026-01-10 |
ASPEN: Robust detection of allelic dynamics in single cell RNA-seq
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013837
PMID:41417871
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为ASPEN的统计方法，用于在单细胞转录组数据中建模等位基因均值和方差，以提高等位基因动态检测的灵敏度 | ASPEN结合了敏感映射流程、调节贝塔二项式模型和自适应收缩技术，能有效区分单细胞中的等位基因失衡和等位基因方差变化，相比现有方法灵敏度提升约30% | 未在摘要中明确提及 | 开发一种统计方法以在单细胞RNA-seq数据中稳健检测等位基因动态，特别是等位基因失衡和方差变化 | F1杂交小鼠的脑类器官和T细胞 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq | 调节贝塔二项式模型 | 单细胞转录组数据 | 未在摘要中明确提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4238 | 2026-01-10 |
[Molecular targets of Shenyan Fangshuai Liquid in treating diabetic kidney disease based on transcriptomics]
2025-Dec, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
研究论文 | 本研究基于肾脏组织转录组学，探讨了肾炎防衰液治疗糖尿病肾病的分子靶点 | 结合转录组测序、WGCNA分析和单细胞测序数据，首次系统鉴定了肾炎防衰液干预糖尿病肾病的关键枢纽基因及其在细胞类型中的特异性表达模式 | 研究基于小鼠模型，结果需在人类临床样本中进一步验证；机制研究主要依赖生物信息学分析，缺乏深入的实验功能验证 | 阐明肾炎防衰液治疗糖尿病肾病的分子作用机制 | C57BL/6J小鼠的糖尿病肾病模型 | 转录组学 | 糖尿病肾病 | RNA-Seq测序、RT-qPCR、单细胞测序数据分析 | NA | 转录组测序数据、单细胞测序数据 | 72只C57BL/6J小鼠（分为6组，每组12只） | NA | RNA-seq, 单细胞测序 | NA | NA |
| 4239 | 2026-01-10 |
Multi-region spatial transcriptomics reveals region specific differences in response to amyloid beta (Aβ) plaque induced changes in Alzheimer's disease (AD)
2025-Nov-29, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00875-x
PMID:41318546
|
研究论文 | 本研究通过多区域空间转录组学分析，揭示了阿尔茨海默病中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异 | 首次在AD中结合多区域空间转录组学和Aβ免疫荧光染色，系统比较了不同皮质区域的细胞类型比例、基因表达和细胞间通讯差异 | 样本量较小（仅2名Braak III和Thal 4期AD患者），且未包括早期AD阶段或健康对照样本 | 探究AD中不同脑区对Aβ斑块诱导变化的区域特异性差异及其分子机制 | 阿尔茨海默病患者的内嗅皮质、枕颞皮质、背外侧前额叶皮质和纹状皮质 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学，免疫荧光染色 | NA | 空间转录组数据，免疫荧光图像 | 2名Braak III和Thal 4期AD患者的四个脑区样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4240 | 2026-01-10 |
[Mechanism of betulinic acid against colorectal cancer based on bioinformatics and experimental validation]
2025-Oct, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和体外实验验证，探讨了桦木酸治疗结直肠癌的潜力及其潜在机制 | 首次结合网络药理学、单细胞RNA测序分析和分子对接技术，系统性地揭示了桦木酸通过下调METTL3表达，进而调控PPAR信号通路来抑制结直肠癌细胞增殖、迁移和侵袭的新机制 | 研究主要在体外细胞系（HCT116）中进行，缺乏体内动物模型和临床样本的验证 | 探究桦木酸治疗结直肠癌的潜在靶点和作用机制 | 结直肠癌细胞（HCT116）及相关基因与信号通路 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序，分子对接，CCK-8，伤口愈合实验，Transwell实验，Western blot | NA | 基因表达数据，蛋白质相互作用数据，实验数据 | 使用来自TCGA的结直肠癌患者基因表达数据及HCT116细胞系进行实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |