本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']
”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!
除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
4221 | 2025-10-06 |
Treatment with senolytic drugs ameliorates steroid-induced osteonecrosis of the femoral head by inhibiting osteoclastogenesis
2025-Aug-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114963
PMID:40480005
|
研究论文 | 本研究探讨了细胞衰老在股骨头坏死中的作用,发现清除衰老细胞可抑制破骨细胞过度活化并改善疾病进展 | 首次揭示衰老巨噬细胞通过促进破骨细胞生成在股骨头坏死中的关键作用,并证明senolytic药物(D+Q)的治疗潜力 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证 | 探究清除衰老细胞是否能改善股骨头坏死 | 股骨头坏死患者样本、ONFH小鼠模型、骨髓来源巨噬细胞 | 骨科学 | 股骨头坏死 | 单细胞测序、TRAP染色、SA-β-gal染色、体外细胞培养 | 动物疾病模型、细胞模型 | 基因表达数据、组织染色图像、细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4222 | 2025-10-06 |
Machine learning algorithms integrate bulk and single-cell RNA data to reveal the crosstalk and heterogeneity of NOTCH and autophagy activity following idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Aug-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115017
PMID:40494203
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA数据,揭示特发性肺纤维化中NOTCH信号与自噬活动的异质性和相互作用 | 首次在单细胞水平揭示NOTCH和自噬活动在IPF中的异质性和相关性,并识别出同时调控这两个通路的关键基因 | 研究主要基于转录组数据分析,虽然进行了蛋白质水平验证,但功能机制研究仍需深入 | 探究特发性肺纤维化中NOTCH信号通路与自噬活动的相互作用机制 | 特发性肺纤维化患者的不同细胞类型 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, Western blotting | XGBoost, Boruta, 随机森林, LASSO, GBM, SVM-RFE | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4223 | 2025-10-06 |
High ELK3 expression is associated with the wild type IDH1 in glioma and enhances infiltration of M2 macrophages
2025-Aug-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115064
PMID:40513332
|
研究论文 | 本研究探讨ELK3在胶质瘤中的预后价值及其通过调控M2巨噬细胞浸润的免疫调节机制 | 首次揭示ELK3表达与IDH1野生型胶质瘤的关联,并发现ELK3通过促进M2巨噬细胞浸润影响肿瘤免疫微环境 | 机制研究尚不充分,需要进一步实验验证ELK3调控免疫浸润的具体分子通路 | 探究ELK3对胶质瘤预后的影响及其在肿瘤免疫浸润中的作用 | 胶质瘤患者样本和公共数据库数据 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 生物信息学分析、免疫组化、RT-qPCR、Western blotting、免疫共培养 | Cox比例风险回归模型、预后列线图 | 基因表达数据、临床数据、免疫组化数据 | TCGA队列及外部验证队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
4224 | 2025-10-06 |
ISLR knockdown enhances radiotherapy-induced anti-tumor immunity by disrupting the Treg-mregDC-lymphoid niche in triple-negative breast cancer
2025-Aug-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114988
PMID:40517736
|
研究论文 | 本研究探讨ISLR基因在三阴性乳腺癌中通过调节MIF/CD74信号通路影响放疗诱导的抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示ISLR通过调控Treg-mregDC-淋巴微环境在放疗诱导的免疫反应中的关键作用 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索ISLR在放疗调节三阴性乳腺癌免疫治疗反应中的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞系MDA-MB-231和荷瘤小鼠模型 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,基因敲低,基因过表达 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据,细胞功能数据,体内疗效数据 | 细胞系实验和动物模型,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4225 | 2025-10-06 |
Macrophages Atp6v0d2 regulates XBP1-mediated cholesterol metabolism to suppress metabolic dysfunction-associated steatohepatitis progression
2025-Aug-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115088
PMID:40526981
|
研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞特异性基因Atp6v0d2通过调控XBP1介导的胆固醇代谢抑制代谢功能障碍相关脂肪性肝炎进展的机制 | 首次发现Atp6v0d2在MASH肝脏中显著上调,并阐明其通过调节XBP1内质网应激影响巨噬细胞表型转换和胆固醇流出的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中充分验证 | 阐明Atp6v0d2在MASH发病机制中的功能意义并探索其作为治疗靶点的潜力 | 髓系来源巨噬细胞和饮食诱导肥胖的雄性小鼠模型 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序,基因敲除技术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,病理学数据 | 多种基因修饰小鼠模型(Atp6v0d2Δmye,Atp6v0d2-/-, Trem2Δmye等) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4226 | 2025-10-06 |
Pediatric AML prognostication with an m6A-focused LASSO model
2025-Aug, Journal of investigative medicine : the official publication of the American Federation for Clinical Research
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10815589251334964
PMID:40183482
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,开发了一个基于m6A相关基因的LASSO风险回归模型,用于预测儿童急性髓系白血病的预后 | 首次在儿童AML中发现独特的m6A基因表达模式,并构建了专门针对儿童AML的LASSO预后预测模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步临床验证 | 探索m6A相关基因在儿童急性髓系白血病预后评估中的作用 | 儿童急性髓系白血病患者 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,LASSO回归分析 | LASSO风险回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4227 | 2025-10-06 |
Integrative Proteomics and Genomics Identify Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Vitiligo via Mendelian Randomization
2025-Aug, Dermatology and therapy
IF:3.5Q1
DOI:10.1007/s13555-025-01448-5
PMID:40536728
|
研究论文 | 通过整合蛋白质组学和基因组学方法,利用孟德尔随机化识别白癜风的新型生物标志物和治疗靶点 | 首次将蛋白质组范围的孟德尔随机化与转录组测序分析相结合,系统识别与白癜风风险相关的蛋白质标志物 | 样本量相对有限(60例和95例白癜风病例),且主要基于欧洲人群数据 | 识别白癜风的候选蛋白质标志物和治疗靶点 | 白癜风患者和对照人群 | 生物信息学 | 白癜风 | 孟德尔随机化, 转录组测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 分子对接 | 孟德尔随机化模型, 生物信息学预测模型 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 转录组数据 | EBI数据库:60例白癜风病例和402,672例对照;UK Biobank:95例白癜风病例和337,064例对照 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
4228 | 2025-10-06 |
Foxn3 is required to suppress aberrant ciliogenesis in nonphotoreceptor retinal neurons
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500871122
PMID:40663603
|
研究论文 | 本研究探讨转录因子Foxn3在抑制非光感受器视网膜神经元异常纤毛发生中的作用 | 首次发现Foxn3作为关键转录抑制因子,通过直接结合并抑制纤毛基因及其转录激活因子的启动子,防止非光感受器神经元形成类似光感受器的纤毛结构 | 研究主要基于小鼠模型,在人类视网膜中的功能需要进一步验证 | 探究Foxn3在建立和维持视网膜细胞纤毛结构分化中的作用机制 | 视网膜特异性条件性敲除Foxn3小鼠的非光感受器神经元(双极细胞和无长突细胞) | 发育生物学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序, 染色质分析, 转录分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 电生理数据, 染色质结合数据 | Foxn3条件性敲除小鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4229 | 2025-10-06 |
Leptin Aggravates Thoracic Aortic Dissection Through Impairment of Energy Metabolism in Nrip2+ Smooth Muscle Cells
2025-Jul-16, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502027
PMID:40667784
|
研究论文 | 本研究探讨瘦素通过影响Nrip2+平滑肌细胞能量代谢加剧胸主动脉夹层的机制 | 发现新型Nrip2平滑肌细胞亚群及其在瘦素诱导的血管平滑肌细胞表型转换中的保护作用 | 研究主要基于动物模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明肥胖相关胸主动脉夹层的发病机制 | 瘦素、Nrip2+血管平滑肌细胞、胸主动脉夹层 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 瘦素敲除小鼠模型及TAD患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4230 | 2025-10-06 |
Chemotaxis overrides the killing response in alloreactive CTLs, providing vascular immune privilege during cellular rejection
2025-Jul-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI155191
PMID:40435228
|
研究论文 | 本研究揭示了在细胞排斥期间趋化作用如何通过引导细胞毒性T淋巴细胞远离内皮细胞来维持血管免疫特权 | 挑战了传统细胞内在免疫特权的观点,提出了细胞外在机制,证明趋化梯度能覆盖T细胞受体诱导的细胞毒性 | 研究主要基于肾脏移植模型,在其他器官或病理条件下的普适性需要进一步验证 | 探究移植排斥过程中血管免疫特权的机制 | 移植内皮细胞、细胞毒性T淋巴细胞、上皮细胞 | 免疫学 | 移植排斥 | 转录组学分析、单细胞RNA测序、活体显微镜、共培养实验 | NA | 基因表达数据、显微镜图像、临床活检数据 | 小鼠肾脏移植模型和人类肾移植活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4231 | 2025-10-06 |
Endocrine Resistance Score Based on Three Key Genes Predicts Prognosis and Reveals Potential Therapeutic Targets for ER+HER2- Breast Cancer
2025-Jul-15, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70100
PMID:40664624
|
研究论文 | 本研究基于CLEC3A、PCDH10和ST3GAL1三个关键基因构建内分泌抵抗评分,用于预测ER+HER2-乳腺癌预后并揭示潜在治疗靶点 | 首次发现CLEC3A、PCDH10和ST3GAL1三个基因与内分泌抵抗相关,并构建了具有预后预测价值的评分系统 | 研究样本量有限,需要更大规模临床验证 | 探索ER+HER2-乳腺癌内分泌抵抗的分子机制并开发预后预测工具 | ER+HER2-乳腺癌细胞系和患者组织样本 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 转录组分析,单细胞RNA测序,Cox回归分析 | nomogram模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,转录组测序 | NA | NA |
4232 | 2025-07-17 |
Mapping trait-associated cells with spatial transcriptomics
2025-Jul-15, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00877-4
PMID:40664743
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
4233 | 2025-10-06 |
scGPT: end-to-end protocol for fine-tuned retinal cell type annotation
2025-Jul-15, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01220-1
PMID:40665101
|
研究论文 | 提供scGPT在单细胞RNA测序数据中用于细胞类型分类的端到端微调协议 | 开发了基于scGPT基础模型的完整微调流程,实现了99.5% F1-score的高精度细胞类型注释 | 需要用户具备中等生物信息学知识,对Python和Linux有基本了解 | 解决单细胞研究中高分辨率细胞类型注释的挑战 | 视网膜单细胞数据集 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer, scGPT | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4234 | 2025-07-17 |
Unveiling new therapeutic targets for esophageal cancer treatment through single-cell transcriptomics: pH-responsive nanobubbles enhance the efficacy of 125I radiotherapy
2025-Jul-15, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03552-2
PMID:40665303
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
4235 | 2025-10-06 |
Light-Regulated Reprogramming in Moss: SHMT1 Mediates Blue Light Enhancement of Cell Regeneration
2025-Jul-15, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.70044
PMID:40665554
|
研究论文 | 本研究首次揭示蓝光通过上调SHMT1基因促进植物细胞重编程的分子机制 | 首次建立了光照条件与细胞重编程之间的分子联系,发现蓝光通过上调SHMT1基因加速细胞再生过程 | NA | 探究蓝光促进植物细胞重编程的分子机制 | 小立碗藓原生质体 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR | NA | 基因表达数据 | 新鲜分离原生质体(CK)、蓝光处理24小时(B24h)、白光处理24小时(W24h)三组样品 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4236 | 2025-10-06 |
Keratin 6A Overexpression in the Lymphovascular Invasion-Associated Tumor Subgroup Promotes Progression of Triple-Negative Breast Cancer
2025-Jul-14, Cancer research and treatment
IF:4.1Q2
DOI:10.4143/crt.2025.423
PMID:40665712
|
研究论文 | 本研究探讨角蛋白6A在淋巴血管侵袭相关的三阴性乳腺癌亚群中的过表达及其促进肿瘤进展的机制 | 首次通过单细胞测序识别LVI阳性TNBC中的主导上皮细胞亚群,并发现KRT6A通过Wnt/β-catenin信号通路促进EMT和转移的新机制 | 未明确说明样本量大小,机制研究可能仍需进一步验证 | 研究三阴性乳腺癌中淋巴血管侵袭相关的上皮调节因子及其功能作用 | 三阴性乳腺癌组织和细胞系 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞测序,转录组分析,免疫组化染色,CCK8,伤口愈合实验,Transwell实验,动物实验 | NA | 单细胞测序数据,转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4237 | 2025-10-06 |
Integrating bulk and single-cell RNA sequencing reveals intratumor heterogeneity phenotypes and immune infiltration in pancreatic cancer
2025-Jul-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03080-3
PMID:40652419
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,揭示了胰腺癌肿瘤内异质性表型及其与免疫浸润的关系 | 首次将bulk RNA测序与单细胞RNA测序相结合系统分析胰腺癌肿瘤内异质性,构建了11基因预后模型并发现Galectin信号通路的关键作用 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 | 探索胰腺癌肿瘤内异质性的预后价值和治疗指导意义 | 胰腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | Cox回归分析,多种机器学习技术 | 转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胰腺癌样本 | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | NA |
4238 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and multi-omics analysis of prognosis-related staging in papillary thyroid cancer
2025-Jul-12, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04101-4
PMID:40650680
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多组学分析建立甲状腺乳头状癌预后相关分子分型 | 首次基于肿瘤细胞分化状态构建甲状腺乳头状癌分子分型系统OSPTCC,并开发了7基因风险评分模型 | 样本量相对有限,单细胞数据仅来自11例患者,需要更大规模验证 | 改善甲状腺乳头状癌的风险分层和预后预测精度 | 甲状腺乳头状癌患者 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, 多组学分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 11例PTC患者(158,577个细胞)的单细胞数据,501例TCGA-THCA队列数据,48例独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4239 | 2025-10-06 |
Development and validation of a prognostic model for predicting survival and immunotherapy benefits in melanoma based on metabolism-relevant genes
2025-Jul-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03186-8
PMID:40652057
|
研究论文 | 基于代谢相关基因开发并验证了预测黑色素瘤患者生存和免疫治疗获益的预后模型 | 首次基于代谢相关基因对黑色素瘤患者进行分子分型,并构建了包含五个特征基因的预后模型,同时结合单细胞RNA测序分析和体外实验验证 | 研究样本量有限,模型验证需要更大规模的前瞻性研究 | 开发预测黑色素瘤患者预后和免疫治疗反应的预后模型 | 皮肤 cutaneous 黑色素瘤(SKCM)患者 | 数字病理 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, western blot, 定量PCR, 免疫组化, siRNA干扰 | LASSO回归, COX回归, ResNet50, 弹性回归 | 基因表达数据, 病理图像, 单细胞测序数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4240 | 2025-10-06 |
Decoding sexual dimorphism of the sex-shared nervous system at single-neuron resolution
2025-Jul-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv9106
PMID:40644535
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究性别共享神经系统中单个神经元水平的分子性别二态性 | 首次在单神经元分辨率揭示性别共享神经系统的广泛分子二态性,发现触觉感受器等先前未知的神经元类型存在性别差异表达 | 研究仅限于成年雄性和雌雄同体,未涵盖其他发育阶段或性别类型 | 解析遗传性别如何塑造神经系统在单个神经元水平的分子结构 | 成年雄性和雌雄同体的性别共享神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年雄性和雌雄同体的性别共享神经元 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |