单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38047 篇文献,本页显示第 4201 - 4220 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
4201 2026-01-30
Ectopic Expression of MUC5B in the Respiratory Bronchiole Initiates Endoplasmic Reticulum Stress in the IPF Lung
2025-Oct-15, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术,探讨了MUC5B在特发性肺纤维化(IPF)发病机制中的作用,特别是其异位表达如何引发内质网应激 首次通过空间转录组学揭示了MUC5B在呼吸性细支气管中的异位表达与内质网应激的直接关联,并验证了其在IPF肺组织中的共表达模式 样本量相对有限(15例IPF和13例对照),且依赖于特定平台(CosMx),可能影响结果的普遍性 深入理解MUC5B驱动的肺纤维化发病机制,特别是其在IPF中的作用 特发性肺纤维化(IPF)患者和未受影响对照者的肺组织样本 空间转录组学 特发性肺纤维化 空间转录组学 半监督聚类 空间转录组数据 15例IPF患者和13例对照者的肺组织,共捕获43个视野 NA 空间转录组学 CosMx平台 NA
4202 2026-01-30
Single-cell analysis of Barrett's esophagus and carcinoma reveals cell types conferring risk via genetic predisposition
2025-Oct-08, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析Barrett食管和食管腺癌,结合全基因组关联数据,揭示细胞类型特异性遗传风险及参与疾病发展的细胞过程 首次整合单细胞转录组数据与全基因组关联分析,识别Barrett食管和食管腺癌发展中的关键细胞类型及细胞过程,特别是肠化生细胞和柱状细胞分化过程 未明确提及样本量限制或技术验证细节,可能需进一步实验验证细胞类型特异性机制 确定Barrett食管和食管腺癌发展中涉及的细胞类型及其遗传风险,探索疾病预测的生物标志物 Barrett食管、食管腺癌及配对正常组织样本 数字病理学 食管腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4203 2026-01-30
Sensitive dissection of a genomic regulatory landscape using bulk and targeted single-cell activation
2025-Oct-08, Cell genomics IF:11.1Q1
研究论文 本研究开发了TESLA-seq技术,结合CRISPRa筛选与靶向单细胞RNA测序,用于高灵敏度解析PHOX2B基因座附近的增强子及其靶基因调控网络 开发了TESLA-seq新技术,首次将CRISPRa筛选与靶向单细胞RNA测序结合,实现了对数百个增强子与所有基因位点关系的并行检测 研究主要聚焦于PHOX2B基因座,可能未涵盖更广泛的基因组区域;实验系统可能无法完全模拟体内环境 识别和功能扰动内源性增强子,解析基因调控网络 PHOX2B基因座附近的增强子(CaREs)及其靶基因 基因组学 神经母细胞瘤 CRISPR激活筛选,靶向单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4204 2026-01-30
Integrated Spatial and Single-Cell Transcriptomics Reveals Poor Prognostic Ligand-Receptor Pairs in Glioblastoma
2025-Oct-01, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过整合空间转录组学和单细胞转录组学,揭示了胶质母细胞瘤中与不良预后相关的配体-受体对及其在肿瘤组织内的空间定位 首次结合单细胞和空间转录组学数据,全面评估胶质母细胞瘤中的细胞间相互作用,并识别出与细胞外基质相关、影响预后的特定配体-受体对 这些配体-受体对的临床重要性仍需进一步研究 识别胶质母细胞瘤中的预后相关配体-受体对及其在肿瘤内的空间定位 胶质母细胞瘤细胞及其与微环境细胞的相互作用 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据 40,958个细胞来自单细胞RNA测序数据集,以及三个独立的胶质母细胞瘤队列用于空间转录组分析 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
4205 2026-01-30
Intestinal Bacteroides drives glioma progression by regulating CD8+ T cell tumor infiltration
2025-Jul-30, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究揭示了肠道微生物Bacteroides通过调节CD8+ T细胞肿瘤浸润驱动神经纤维瘤病1型相关低级别胶质瘤进展的机制 首次建立了肠道微生物Bacteroides与NF1-LGG病理生物学之间的机制性联系,并揭示了TGFβ介导的免疫调节通路 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 探究肠道微生物对神经纤维瘤病1型相关视路胶质瘤进展的影响机制 Nf1突变小鼠模型(Nf1OPG小鼠)的视路胶质瘤 肿瘤免疫学 神经胶质瘤 16S基因分型,单细胞RNA测序 NA 基因测序数据 使用Nf1OPG小鼠模型进行研究 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4206 2026-01-30
Pioneer factor ETV2 safeguards endothelial cell specification by recruiting the repressor REST to restrict alternative lineage commitment
2025-Jun, Nature cardiovascular research IF:9.4Q1
研究论文 本研究探讨了先锋因子ETV2通过招募抑制因子REST来限制替代谱系承诺,从而保护内皮细胞规格化的机制 揭示了ETV2作为先锋因子招募抑制因子REST来抑制非内皮谱系基因的创新机制,提供了单细胞分辨率下的内皮细胞规格化分子分析 未明确提及具体样本数量或实验重复次数,可能限制结果的普适性 研究ETV2过表达在人类诱导多能干细胞来源的中胚层祖细胞中高效指定内皮细胞的机制 人类诱导多能干细胞来源的中胚层祖细胞和内皮细胞分化过程 发育生物学与再生医学 NA CUT&RUN, scRNA-seq, scATAC-seq NA 单细胞RNA测序数据、单细胞ATAC测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
4207 2026-01-30
TGF-β-driven T-cell exclusion in ovarian cancer: single-cell and spatial transcriptomic views of immune low-response states
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
综述 本文综述了单细胞RNA和ATAC测序以及空间转录组学在揭示卵巢癌中TGF-β驱动的T细胞排斥和免疫低反应状态方面的进展,并评估了相关的转化机会 整合单细胞和空间转录组学数据,解析TGF-β信号相关的成纤维细胞、肿瘤和免疫程序,提出基于TGF-β信息的精准免疫治疗策略 存在部位特异性异质性、检测标准化有限以及预测指标稀缺等挑战,限制了临床实施 评估TGF-β驱动的免疫低反应状态在卵巢癌中的作用,并探索精准免疫治疗策略 上皮性卵巢癌(EOC)中的TGF-β信号、成纤维细胞、肿瘤细胞和免疫细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 表观遗传数据, 空间数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 NA NA
4208 2026-01-30
Multi-omics exploration of chaperone-mediated immune-proteostasis crosstalk in vascular dementia and identification of diagnostic biomarkers
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习算法,探索了分子伴侣系统在血管性痴呆中的调控网络和诊断潜力 首次将HSP90AA1-HSPA1B-DNAJB1网络识别为通过蛋白质稳态和免疫重编程双重机制驱动血管性痴呆发病的关键因素,其诊断性能显著优于传统生物标志物 需要更大规模的队列研究来验证其临床转化潜力 阐明血管性痴呆的分子机制并识别诊断性生物标志物 血管性痴呆患者的额叶、颞叶皮质和白质样本,以及双侧颈总动脉狭窄小鼠模型 机器学习 血管性痴呆 转录组学,单细胞转录组学,免疫微环境分析 LASSO, SVM-RFE, Random Forest 转录组数据,单细胞转录组数据 人类样本:额叶和颞叶皮质(n=15),白质(n=8);小鼠模型:双侧颈总动脉狭窄模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4209 2026-01-29
Distinct T and innate-like lymphocyte reprogramming following lyophilized fecal microbiota transplantation in recurrent C. difficile infection
2026-Dec-31, Gut microbes IF:12.2Q1
研究论文 本研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序,探索了冻干粪便微生物移植在复发性艰难梭菌感染中的免疫重编程机制 首次提供了冻干粪便微生物移植在复发性艰难梭菌感染中的单细胞免疫图谱,揭示了适应性及先天样淋巴细胞群体的独特转录特征 样本量较小,仅为探索性研究,结果需在更大队列中验证 阐明粪便微生物移植预防复发性艰难梭菌感染的免疫机制 接受冻干粪便微生物移植或冻干无菌粪便滤液治疗的复发性艰难梭菌感染患者 单细胞测序分析 复发性艰难梭菌感染 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 流式细胞术分析19名LFMT和18名LSFF接受者,单细胞RNA测序分析2名LFMT接受者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4210 2026-01-29
Single-cell transcriptome sequencing revealing the microenvironment of breast fibroepithelial tumor
2026-Mar, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了青少年与成人乳腺纤维上皮性肿瘤微环境的差异 首次在单细胞分辨率上比较了青少年与成人乳腺巨大纤维上皮性肿瘤的分子特征和细胞间通讯网络,并鉴定出青少年特异的抗原呈递成纤维细胞亚群 样本量较小(仅3例青少年病例和1例成人病例),且为观察性研究,需进一步功能验证 阐明青少年巨大乳腺纤维上皮性肿瘤的生物学基础,以指导靶向治疗 乳腺纤维上皮性肿瘤组织 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 4例患者(3例青少年,1例成人),共计26,737个细胞 BD Biosciences 单细胞RNA-seq BD Rhapsody BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System
4211 2026-01-29
Mapping the immune cells of the testis: Key insights into sexual maturation
2026-Feb, Andrology IF:3.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式细胞术,系统描绘了小鼠睾丸在性成熟前后的免疫细胞图谱和发育轨迹 首次在睾丸微环境中鉴定出罕见但功能重要的B淋巴细胞群体,并揭示了性成熟过程中髓系细胞的发育可塑性及间质细胞与免疫细胞间的信号轴变化 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且样本数量有限 系统描绘睾丸免疫细胞图谱,探究性成熟过程中免疫微环境的动态变化 小鼠睾丸中的白细胞(免疫细胞) 单细胞组学 生殖系统疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq),质谱流式细胞术(CyTOF),磁激活细胞分选(MACS) NA 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据 性成熟后(8周龄)和性成熟前(2周龄)小鼠睾丸样本 NA 单细胞RNA-seq,质谱流式细胞术 NA NA
4212 2026-01-29
High-throughput single-cell DNA methylation and chromatin accessibility co-profiling with SpliCOOL-seq
2026-Feb, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
研究论文 本文介绍了一种名为SpliCOOL-seq的高通量单细胞测序技术,用于同时分析全基因组DNA甲基化和染色质可及性 开发了基于分裂-合并连接策略的单细胞多组学测序技术,整合了原位GpC甲基化、通用Tn5转座和分裂-合并组合条形码,实现了更高的灵敏度和可扩展性 未明确说明技术成本、数据分析复杂度或与其他平台的直接比较 开发高通量单细胞多组学测序技术,用于研究癌症表观遗传调控机制 肺癌细胞系和原发性肺腺癌样本 表观遗传学 肺癌 单细胞DNA甲基化测序、单细胞染色质可及性测序、分裂-合并组合条形码 NA 单细胞表观基因组数据 数千个细胞 NA 单细胞多组学 SpliCOOL-seq 整合原位GpC甲基化、通用Tn5转座和分裂-合并组合条形码的高通量单细胞测序平台
4213 2026-01-29
IgA-Producing B Cells Exert Regulatory Function Through Granzyme B in Kidney Allograft Tolerance
2026-Jan-27, Kidney360 IF:3.2Q1
研究论文 本研究探讨了IgA+ B细胞通过Granzyme B在肾移植耐受中的调节功能 首次揭示了IgA+ B细胞与GZMB+调节性B细胞在肾移植耐受中的强关联性,并证明IgA+ B细胞具有高调节功能 样本量较小(共76名参与者),且为病例对照研究,可能限制结果的普遍性 研究IgA+ B细胞与GZMB+调节性B细胞在肾移植耐受中的关联及功能 健康志愿者和肾移植受者(包括稳定功能、抗体介导排斥和耐受患者) 免疫学 肾移植相关疾病 单细胞RNA测序,多参数光谱流式细胞术,ELISA,Western blot NA 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,血清蛋白数据 76名参与者(45名健康志愿者,31名肾移植受者) NA 单细胞RNA-seq NA NA
4214 2026-01-29
HFFST: A Hierarchical Feature Fusion Algorithm for Spatial Gene Expression Prediction Using Histopathology Images
2026-Jan-27, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文提出了一种名为HFFST的层次特征融合算法,用于从H&E染色病理图像预测空间基因表达 提出了一种新的层次特征融合算法,充分利用病理图像的多层次信息,并采用从粗到细的回归框架来预测空间转录组图谱 未在摘要中明确说明 开发一种从H&E染色病理图像预测空间基因表达的方法,以克服空间转录组学技术成本高和复杂性大的限制 H&E染色病理图像和空间基因表达数据 数字病理学 NA 空间转录组学 层次特征融合算法 图像 五个公共数据集和高分辨率Visium数据 10X Genomics 空间转录组学 Visium 高分辨率Visium数据
4215 2026-01-29
Mechanisms, precision therapies, and technological frontiers in coronary atherosclerosis: a comprehensive review
2026-Jan-27, Acta pharmacologica Sinica IF:6.9Q1
综述 本文全面综述了冠状动脉粥样硬化的机制、精准疗法及技术前沿,整合了疾病机制、新兴治疗策略以及多组学技术、高分辨率成像和人工智能在心血管风险评估中的应用 强调了精准医学、多组学技术、高分辨率成像和人工智能在心血管风险评估中的突破性应用,并探讨了针对PCSK、炎症通路、血管再生的新型干预措施,以及CRISPR-Cas9基因编辑、纳米技术药物递送和肠道微生物群调节等前沿技术 尽管这些创新有望实现个性化动脉粥样硬化管理,但在可及性、健康公平性和临床实施方面仍面临挑战 旨在通过整合多模态数据分析和靶向治疗,减少冠状动脉疾病的全球负担,推动精准心脏病学新时代 冠状动脉粥样硬化及其相关分子、细胞机制、治疗策略和技术应用 数字病理学 心血管疾病 单细胞转录组学、多组学技术、高分辨率成像、人工智能 NA 多模态数据(包括分子、细胞、影像数据) NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4216 2026-01-29
Single-Cell Sequencing Reveals the Crosstalk Between MuSCs and FAPs in Ruminant Skeletal Muscle Development
2026-Jan-22, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序首次构建了山羊骨骼肌发育的单细胞图谱,揭示了肌卫星细胞与纤维脂肪祖细胞之间的相互作用 首次构建了反刍动物(山羊)骨骼肌从胚胎期到成年期14个发育阶段的单细胞转录组图谱,并发现了DLK1-NOTCH3配体-受体对在维持肌卫星细胞静息状态中的关键作用 研究仅针对山羊的长背肌,未涵盖其他肌肉类型;功能验证实验相对有限 阐明反刍动物骨骼肌发育过程中肌卫星细胞与纤维脂肪祖细胞的相互作用机制 山羊长背肌组织 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 120,944个细胞,覆盖胚胎第30天至出生后11年共14个发育阶段 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4217 2026-01-29
Emerging technologies for advancing molecular and cellular research in bats
2026-Jan-18, Zoological research IF:4.0Q1
综述 本文综述了蝙蝠生物学研究的最新进展,重点关注物种多样化、发育和免疫适应,并强调了新兴技术在分子和细胞层面的应用 整合了高分辨率多组学、单细胞转录组学和先进三维培养系统等新兴技术,以探索蝙蝠的生物学特性及其与人类健康的相关性 NA 推进蝙蝠分子和细胞研究,以理解其适应性进化、病毒抗性机制,并为生物医学和进化洞察提供关键平台 蝙蝠(哺乳动物) 分子生物学 病毒感染 高分辨率多组学、单细胞转录组学、三维培养系统 NA NA NA NA 单细胞转录组学 NA NA
4218 2026-01-29
Cellular and molecular profiling of collagenous gastritis implicates pathogenic CD4+ T cells
2026-Jan-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序等方法,研究了胶原性胃炎的免疫机制,并识别了潜在的CD4+ T细胞致病作用 首次在胶原性胃炎中应用单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术,揭示了激活/耗竭淋巴细胞群和整合素α4作为治疗靶点 样本量较小(仅7名患者),且疾病罕见,可能限制结果的普遍性 探究胶原性胃炎的免疫学病因和潜在治疗靶点 胶原性胃炎患者和匹配对照的胃和十二指肠活检样本 数字病理学 胶原性胃炎 单细胞RNA测序, T细胞受体测序, 流式细胞术, 组织病理学 NA 单细胞RNA测序数据, T细胞受体序列数据, 流式细胞数据, 组织病理图像 7名胶原性胃炎患者和若干匹配对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4219 2026-01-29
Integrative miRNA-mRNA Network and Molecular Dynamics-Based Identification of Therapeutic Candidates for Paroxysmal Nocturnal Hemoglobinuria
2026-Jan-14, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
研究论文 本研究通过构建PNH细胞模型、整合miRNA-mRNA调控网络和单细胞测序数据,结合分子对接与动力学模拟,识别了阵发性睡眠性血红蛋白尿症的潜在治疗药物和关键调控轴 首次整合CRISPR/RNP构建的PNH细胞模型、miRNA-mRNA调控网络、单细胞测序数据以及多数据库药物预测,并通过分子动力学模拟验证药物结合稳定性,系统性地识别了PNH的潜在治疗候选物 研究主要基于体外细胞模型和计算模拟,缺乏体内实验和临床样本的直接验证 识别阵发性睡眠性血红蛋白尿症的新治疗靶点和替代治疗策略 THP-1细胞系、公共单细胞测序数据集(PRJNA1061334和GSE157344) 计算生物学 阵发性睡眠性血红蛋白尿症 CRISPR/RNP基因编辑、单细胞RNA测序、差异表达分析、网络构建、分子对接、分子动力学模拟 miRNA-mRNA调控网络、hdWGCNA 单细胞RNA测序数据、miRNA表达数据、mRNA表达数据 未明确说明临床样本数量,使用了公共数据集和THP-1细胞模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4220 2026-01-29
Integrative Network Analysis of Single-Cell RNA Findings and a Priori Knowledge Highlights Gene Regulators in Multiple Myeloma Progression
2026-Jan-13, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据与先验知识,揭示了多发性骨髓瘤进展中的关键基因调控因子 首次将单细胞RNA测序数据与先验知识网络整合,构建疾病阶段特异性调控网络,并识别出多个先前未被纳入已知基因集的核心调控基因 NA 揭示多发性骨髓瘤从无症状前体阶段进展至活动性疾病的分子机制 CD138阳性浆细胞 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部