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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4201 | 2025-10-06 |
Exploration of M2 macrophage-related biomarkers and a candidate drug for glioblastoma using high-dimensional weighted gene co-expression network analysis
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1587258
PMID:40661076
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研究论文 | 本研究通过高维加权基因共表达网络分析探索M2巨噬细胞相关生物标志物,并预测胶质母细胞瘤候选药物 | 首次结合单细胞RNA测序和hdWGCNA方法系统识别M2巨噬细胞相关基因标志物,并预测thalidomide作为候选治疗药物 | 研究基于公共数据库数据,需要实验验证;样本来源有限 | 识别M2巨噬细胞相关基因生物标志物并预测胶质母细胞瘤治疗药物 | 胶质母细胞瘤组织和细胞 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 高维加权基因共表达网络分析, 分子对接 | 诊断模型 | 基因表达数据 | GSE162631和GSE4290数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4202 | 2025-10-06 |
Silencing NEDD4L Effectively Inhibits the Malignant Behaviors of Hepatocellular Carcinoma
2025, Journal of hepatocellular carcinoma
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JHC.S511466
PMID:40661237
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研究论文 | 本研究探讨NEDD4L在肝细胞癌中的表达、预后价值及其通过调控细胞周期和免疫检查点促进肝癌恶性行为的机制 | 首次系统揭示NEDD4L在肝癌中的双重调控作用——既通过泛素化降解细胞周期抑制因子促进细胞异常增殖,又通过下调免疫检查点促进免疫逃逸 | 研究主要基于数据库分析和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探究NEDD4L在肝细胞癌发生发展中的作用机制及治疗潜力 | 肝细胞癌细胞系及患者单细胞测序数据 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞测序, Edu, CCK-8, Transwell, 伤口愈合实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 体外功能实验数据 | 多个数据库的肝癌患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
4203 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-sequencing highlights a curtailed NK cell function in convalescent COVID-19 pregnant women
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560391
PMID:40661959
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了康复期COVID-19孕妇中NK细胞功能受损的免疫特征 | 首次在康复期孕妇中发现SARS-CoV-2感染导致NK细胞和细胞毒性T细胞功能持续受损,揭示了感染后免疫系统长期改变 | 研究样本仅来自两个地理队列,需要更大规模研究验证 | 研究SARS-CoV-2感染对孕妇免疫系统的短期和长期影响 | 孕妇(包括COVID-19感染期和康复期) | 单细胞组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 两个独立地理队列的孕妇样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | Chromium Single Cell 3' Gel Bead Chip and Library Kit | 10x Chromium Single Cell 3'(Drop-seq方法) |
4204 | 2025-10-06 |
Development of a Starvation Response-Based Model and Its Application in Prognostic Assessment of Liver Hepatocellular Carcinoma
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/8828435
PMID:40662145
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研究论文 | 本研究基于饥饿反应相关基因构建了首个肝细胞癌预后风险模型 | 首次基于饥饿反应相关基因构建肝细胞癌预后风险模型,揭示了SRRGs在LIHC预后预测中的价值 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 开发基于饥饿反应相关基因的肝细胞癌预后评估模型 | 肝细胞癌患者、Huh7和THLE-2细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、WGCNA、功能富集分析、ssGSEA、伤口愈合实验、transwell实验 | RiskScore风险模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4205 | 2025-10-06 |
Antigen/HLA-agnostic strategies for Characterizing Tumor-responsive T cell receptors in PDAC patients via single-cell sequencing and autologous organoid application
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216741
PMID:38395378
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研究论文 | 本研究通过超深度单细胞TCR/RNA测序和自体类器官技术,在PDAC患者中鉴定和验证肿瘤反应性T细胞受体 | 开发了不依赖抗原/HLA的肿瘤反应性TCR表征策略,结合单细胞测序和自体类器官技术 | 仅为概念验证研究,样本量有限(仅2例PDAC患者) | 开发个性化TCR-T细胞疗法的肿瘤反应性TCR表征方法 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者 | 单细胞测序 | 胰腺癌 | 单细胞TCR/RNA测序,类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据,TCR序列数据 | 2例PDAC患者,超过82,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞TCR测序 | NA | NA |
4206 | 2025-10-06 |
Characterization of the distinct immune microenvironments between hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216799
PMID:38479553
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序系统比较了肝细胞癌和肝内胆管癌的肿瘤免疫微环境差异 | 首次通过整合41个单细胞RNA测序样本系统比较两种主要原发性肝癌的免疫微环境,并发现HCC中EGR1巨噬细胞的特异性富集 | 样本数量相对有限,仅包含41个样本 | 系统评估肝细胞癌和肝内胆管癌肿瘤免疫微环境的异同 | 肝细胞癌和肝内胆管癌的肿瘤组织样本 | 单细胞基因组学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 41个单细胞RNA测序样本,涵盖两种恶性肿瘤的四种不同组织类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4207 | 2025-10-06 |
Association of preoperative aspartate aminotransferase to platelet ratio index with outcomes and tumour microenvironment among colorectal cancer with liver metastases
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216778
PMID:38458593
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研究论文 | 探讨术前APRI指标对结直肠癌肝转移患者预后及肿瘤微环境的预测价值 | 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫组化揭示APRI与肿瘤微环境的关联机制 | 回顾性多中心研究,需前瞻性研究进一步验证 | 寻找改善结直肠癌肝转移患者预后预测的可靠生物标志物 | 1323例接受同步切除的结直肠癌肝转移患者 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化/免疫荧光 | Cox风险回归模型 | 血液检测数据, 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 1323例患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 多重免疫组化 | NA | NA |
4208 | 2025-10-06 |
CD63+ cancer-associated fibroblasts confer CDK4/6 inhibitor resistance to breast cancer cells by exosomal miR-20
2024-04-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216747
PMID:38403110
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研究论文 | 本研究揭示CD63+癌症相关成纤维细胞通过外泌体miR-20介导乳腺癌细胞对CDK4/6抑制剂产生耐药性 | 首次发现CD63+癌症相关成纤维细胞亚群在CDK4/6抑制剂耐药肿瘤组织中富集,并阐明其通过外泌体miR-20靶向RB1 mRNA的耐药机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序和肿瘤异种移植模型,临床验证尚需进一步研究 | 探究乳腺癌对CDK4/6抑制剂产生耐药性的机制及潜在治疗策略 | 雌激素受体阳性乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞、肿瘤异种移植模型 | 单细胞生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 外泌体分析, 纳米颗粒合成 | 肿瘤异种移植模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4209 | 2025-10-06 |
Comparable CD8+ T-cell responses to SARS-CoV-2 vaccination in single-cell transcriptomics of recently allogeneic transplanted patients and healthy individuals
2024-03, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.29539
PMID:38516755
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学比较了异基因造血干细胞移植患者与健康个体对SARS-CoV-2疫苗的CD8+ T细胞应答 | 首次在ASCT患者中结合单细胞RNA测序与TCR/BCR谱分析,揭示疫苗诱导的CD8 T细胞应答特征 | 样本量有限,仅40%患者产生保护性抗体滴度 | 评估ASCT患者对SARS-CoV-2疫苗的免疫应答特征 | 异基因造血干细胞移植患者和健康疫苗接种者 | 单细胞转录组学 | 免疫缺陷状态 | 单细胞RNA测序,TCR/BCR谱分析 | NA | 单细胞转录组数据,血清学数据 | ASCT患者队列与公开健康疫苗接种者数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4210 | 2025-10-06 |
CCDC66 mutations are associated with high myopia through affected cell mitosis
2024-02-21, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmg-2023-109434
PMID:37852749
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研究论文 | 本研究通过外显子测序发现CCDC66基因突变与高度近视相关,并探讨了其通过影响细胞有丝分裂导致高度近视的机制 | 首次发现CCDC66基因无义突变(c.C172T, p.Q58X)与高度近视表型共分离,并证明CCDC66缺陷会通过影响微管聚合和细胞有丝分裂过程导致视网膜发育异常 | 样本量相对有限(一个家系和200例散发病例),功能研究主要在HEK293和Hela细胞系中进行,未在视网膜原代细胞中验证 | 鉴定高度近视的致病基因并探索其致病机制 | 高度近视患者家系和散发病例,人类和小鼠胚胎视网膜,HEK293和Hela细胞系 | 遗传学 | 高度近视 | 外显子测序,Sanger测序,单细胞RNA测序,CRISPR/Cas9基因敲除,免疫荧光染色,免疫印迹 | NA | 基因组数据,转录组数据,细胞图像数据 | 1个高度近视家系和200例散发性高度近视患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4211 | 2025-10-06 |
Locus-specific expression of transposable elements in single cells with CELLO-seq
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01093-1
PMID:34782740
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研究论文 | 开发了结合长读长单细胞RNA测序与计算分析的CELLO-seq方法,用于在单细胞水平测量转座子元件在特定位点的表达 | 首次实现了在单细胞分辨率下对转座子元件进行位点特异性表达分析,解决了短读长测序技术无法准确定位高重复序列的难题 | 对于小鼠中极少数非常年轻的转座子元件仍无法高置信度地映射回参考基因组 | 开发能够准确测量转座子元件位点特异性表达的单细胞测序技术 | 二细胞期小鼠卵裂球和人类诱导多能干细胞 | 单细胞测序技术 | NA | 长读长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 二细胞期小鼠卵裂球和人类诱导多能干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | CELLO-seq(单细胞长读长RNA测序) |
4212 | 2025-10-06 |
CD163+ macrophages drive rapid pulmonary fibrosis via osteopontin secretion
2025-Aug-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114976
PMID:40466617
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研究论文 | 本研究揭示了CD163+巨噬细胞通过分泌骨桥蛋白(OPN)驱动快速肺纤维化的机制 | 首次发现CD163+巨噬细胞-骨桥蛋白轴在快速肺纤维化中的关键作用,并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于COVID-19相关快速肺纤维化患者,结果在其他病因引起的肺纤维化中的普适性需要进一步验证 | 阐明CD163+巨噬细胞在快速肺纤维化发病机制中的作用 | COVID-19相关快速肺纤维化患者、LPS三击诱导的小鼠快速肺纤维化模型、体外共培养系统 | 病理生物学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 基因敲除, 基因沉默 | 动物模型, 细胞共培养模型 | 基因表达数据, 病理学数据 | COVID-19相关快速肺纤维化患者样本、小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
4213 | 2025-10-06 |
Treatment with senolytic drugs ameliorates steroid-induced osteonecrosis of the femoral head by inhibiting osteoclastogenesis
2025-Aug-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114963
PMID:40480005
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研究论文 | 本研究探讨了细胞衰老在股骨头坏死中的作用,发现清除衰老细胞可抑制破骨细胞过度活化并改善疾病进展 | 首次揭示衰老巨噬细胞通过促进破骨细胞生成在股骨头坏死中的关键作用,并证明senolytic药物(D+Q)的治疗潜力 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未在人体临床试验中验证 | 探究清除衰老细胞是否能改善股骨头坏死 | 股骨头坏死患者样本、ONFH小鼠模型、骨髓来源巨噬细胞 | 骨科学 | 股骨头坏死 | 单细胞测序、TRAP染色、SA-β-gal染色、体外细胞培养 | 动物疾病模型、细胞模型 | 基因表达数据、组织染色图像、细胞功能数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4214 | 2025-10-06 |
Machine learning algorithms integrate bulk and single-cell RNA data to reveal the crosstalk and heterogeneity of NOTCH and autophagy activity following idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Aug-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115017
PMID:40494203
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA数据,揭示特发性肺纤维化中NOTCH信号与自噬活动的异质性和相互作用 | 首次在单细胞水平揭示NOTCH和自噬活动在IPF中的异质性和相关性,并识别出同时调控这两个通路的关键基因 | 研究主要基于转录组数据分析,虽然进行了蛋白质水平验证,但功能机制研究仍需深入 | 探究特发性肺纤维化中NOTCH信号通路与自噬活动的相互作用机制 | 特发性肺纤维化患者的不同细胞类型 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, Western blotting | XGBoost, Boruta, 随机森林, LASSO, GBM, SVM-RFE | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
4215 | 2025-10-06 |
High ELK3 expression is associated with the wild type IDH1 in glioma and enhances infiltration of M2 macrophages
2025-Aug-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115064
PMID:40513332
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研究论文 | 本研究探讨ELK3在胶质瘤中的预后价值及其通过调控M2巨噬细胞浸润的免疫调节机制 | 首次揭示ELK3表达与IDH1野生型胶质瘤的关联,并发现ELK3通过促进M2巨噬细胞浸润影响肿瘤免疫微环境 | 机制研究尚不充分,需要进一步实验验证ELK3调控免疫浸润的具体分子通路 | 探究ELK3对胶质瘤预后的影响及其在肿瘤免疫浸润中的作用 | 胶质瘤患者样本和公共数据库数据 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 生物信息学分析、免疫组化、RT-qPCR、Western blotting、免疫共培养 | Cox比例风险回归模型、预后列线图 | 基因表达数据、临床数据、免疫组化数据 | TCGA队列及外部验证队列 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
4216 | 2025-10-06 |
ISLR knockdown enhances radiotherapy-induced anti-tumor immunity by disrupting the Treg-mregDC-lymphoid niche in triple-negative breast cancer
2025-Aug-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114988
PMID:40517736
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研究论文 | 本研究探讨ISLR基因在三阴性乳腺癌中通过调节MIF/CD74信号通路影响放疗诱导的抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示ISLR通过调控Treg-mregDC-淋巴微环境在放疗诱导的免疫反应中的关键作用 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索ISLR在放疗调节三阴性乳腺癌免疫治疗反应中的作用机制 | 三阴性乳腺癌细胞系MDA-MB-231和荷瘤小鼠模型 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,基因敲低,基因过表达 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据,细胞功能数据,体内疗效数据 | 细胞系实验和动物模型,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4217 | 2025-10-06 |
Macrophages Atp6v0d2 regulates XBP1-mediated cholesterol metabolism to suppress metabolic dysfunction-associated steatohepatitis progression
2025-Aug-28, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115088
PMID:40526981
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞特异性基因Atp6v0d2通过调控XBP1介导的胆固醇代谢抑制代谢功能障碍相关脂肪性肝炎进展的机制 | 首次发现Atp6v0d2在MASH肝脏中显著上调,并阐明其通过调节XBP1内质网应激影响巨噬细胞表型转换和胆固醇流出的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类临床样本中充分验证 | 阐明Atp6v0d2在MASH发病机制中的功能意义并探索其作为治疗靶点的潜力 | 髓系来源巨噬细胞和饮食诱导肥胖的雄性小鼠模型 | 分子生物学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序,基因敲除技术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,病理学数据 | 多种基因修饰小鼠模型(Atp6v0d2Δmye,Atp6v0d2-/-, Trem2Δmye等) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4218 | 2025-10-06 |
Pediatric AML prognostication with an m6A-focused LASSO model
2025-Aug, Journal of investigative medicine : the official publication of the American Federation for Clinical Research
IF:2.5Q3
DOI:10.1177/10815589251334964
PMID:40183482
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,开发了一个基于m6A相关基因的LASSO风险回归模型,用于预测儿童急性髓系白血病的预后 | 首次在儿童AML中发现独特的m6A基因表达模式,并构建了专门针对儿童AML的LASSO预后预测模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步临床验证 | 探索m6A相关基因在儿童急性髓系白血病预后评估中的作用 | 儿童急性髓系白血病患者 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,LASSO回归分析 | LASSO风险回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4219 | 2025-10-06 |
Integrative Proteomics and Genomics Identify Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Vitiligo via Mendelian Randomization
2025-Aug, Dermatology and therapy
IF:3.5Q1
DOI:10.1007/s13555-025-01448-5
PMID:40536728
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研究论文 | 通过整合蛋白质组学和基因组学方法,利用孟德尔随机化识别白癜风的新型生物标志物和治疗靶点 | 首次将蛋白质组范围的孟德尔随机化与转录组测序分析相结合,系统识别与白癜风风险相关的蛋白质标志物 | 样本量相对有限(60例和95例白癜风病例),且主要基于欧洲人群数据 | 识别白癜风的候选蛋白质标志物和治疗靶点 | 白癜风患者和对照人群 | 生物信息学 | 白癜风 | 孟德尔随机化, 转录组测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 分子对接 | 孟德尔随机化模型, 生物信息学预测模型 | 基因组数据, 蛋白质组数据, 转录组数据 | EBI数据库:60例白癜风病例和402,672例对照;UK Biobank:95例白癜风病例和337,064例对照 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
4220 | 2025-10-06 |
Foxn3 is required to suppress aberrant ciliogenesis in nonphotoreceptor retinal neurons
2025-Jul-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500871122
PMID:40663603
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研究论文 | 本研究探讨转录因子Foxn3在抑制非光感受器视网膜神经元异常纤毛发生中的作用 | 首次发现Foxn3作为关键转录抑制因子,通过直接结合并抑制纤毛基因及其转录激活因子的启动子,防止非光感受器神经元形成类似光感受器的纤毛结构 | 研究主要基于小鼠模型,在人类视网膜中的功能需要进一步验证 | 探究Foxn3在建立和维持视网膜细胞纤毛结构分化中的作用机制 | 视网膜特异性条件性敲除Foxn3小鼠的非光感受器神经元(双极细胞和无长突细胞) | 发育生物学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序, 染色质分析, 转录分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 电生理数据, 染色质结合数据 | Foxn3条件性敲除小鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |