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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4201 | 2026-01-18 |
Targeting the JAK2/STAT3 Axis and Remodeling the Tumour Microenvironment: The Dual Anti-Tumour Mechanism of Total Glucosides of Paeony in Gallbladder Cancer
2026-Jan, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157756
PMID:41512357
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研究论文 | 本研究评估了白芍总苷在胆囊癌中的抗肿瘤效果及其通过靶向JAK2/STAT3轴和重塑肿瘤微环境的双重作用机制 | 首次利用多维度平台(包括细胞系、PDX模型和类器官)全面评估白芍总苷在胆囊癌中的治疗潜力,并通过单细胞RNA测序揭示了其对肿瘤微环境重塑的深远影响 | NA | 评估白芍总苷在胆囊癌中的治疗潜力并阐明其药效学机制 | 胆囊癌细胞系、患者来源异种移植模型和患者来源类器官 | 数字病理学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序, 网络药理学, ELISA, Western blot, 免疫荧光 | NA | RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞因子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4202 | 2026-01-18 |
A human lung organoid platform for studying radiation-induced pulmonary fibrosis and antifibrotic drug screening
2025-Dec-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31582-1
PMID:41466095
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研究论文 | 本研究建立了一个源自人类胚胎干细胞的人类肺类器官模型,用于研究辐射诱导的肺纤维化及抗纤维化药物筛选 | 开发了一个包含主要上皮细胞类型的人类肺类器官模型,能够模拟辐射诱导肺纤维化的关键特征,为药物筛选提供了生理相关的人源体外平台 | 模型可能无法完全复制体内复杂的肺微环境,且研究基于体外类器官,需进一步验证其与临床病理的相关性 | 研究辐射诱导的肺纤维化机制并开发抗纤维化药物筛选平台 | 人类胚胎干细胞衍生的人类肺类器官 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4203 | 2026-01-18 |
S1PR3 Inhibition in alveolar epithelial cells alleviates pulmonary fibrosis by enhancing alveolar barrier function
2025-Dec-12, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03435-y
PMID:41387860
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研究论文 | 本文研究了S1PR3在肺泡上皮细胞中的表达及其在肺纤维化中对肺泡-毛细血管屏障功能的影响 | 首次揭示了S1PR3在肺纤维化中通过调节紧密连接蛋白表达影响肺泡屏障功能的具体机制,并提出了S1PR3作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人体中进行验证,且S1PR3抑制的长期安全性未知 | 探究S1PR3在肺纤维化发病机制中的作用,并评估其作为治疗靶点的可行性 | 肺泡上皮细胞、特发性肺纤维化患者样本、博来霉素诱导的肺纤维化小鼠模型 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序、siRNA敲低、选择性拮抗剂抑制 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织病理学图像 | 公共单细胞RNA测序数据集中的IPF患者样本、博来霉素诱导的肺纤维化小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4204 | 2026-01-18 |
NSUN7 is a catalytically inactive RNA m5C methyltransferase essential for sperm flagellum assembly
2025-Dec-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67233-2
PMID:41381527
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研究论文 | 本研究揭示了NSUN7是一种无催化活性的RNA m5C甲基转移酶,对精子鞭毛组装至关重要 | 首次明确了NSUN7缺乏催化活性,并揭示了其通过非催化调控功能在精子发生中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接相关性尚需进一步验证 | 阐明NSUN7的酶学功能和生理作用 | 小鼠睾丸组织、精子细胞 | 分子生物学 | 男性不育症 | 转录组m5C质谱分析、超快速亚硫酸氢盐测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、质谱数据 | Nsun7基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4205 | 2026-01-18 |
Unveiling key genes for intervertebral disc degeneration prediction and potential drug discovery
2025-Dec-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-31675-x
PMID:41381667
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研究论文 | 本研究通过整合多个基因表达数据集和单细胞RNA测序数据,识别了与椎间盘退变(IDD)相关的关键基因,并构建了诊断模型及探索了潜在治疗药物 | 首次结合三个基因表达数据集和单细胞RNA测序数据识别IDD关键基因,并利用Connectivity Map数据库进行药物发现,同时通过临床样本验证基因表达 | 研究依赖于公开数据集,临床样本量可能有限,且药物发现部分需进一步实验验证 | 探索椎间盘退变的致病基因,构建诊断模型并识别潜在治疗药物 | 椎间盘退变(IDD)相关的基因表达数据和临床椎间盘组织样本 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组织化学(IHC)染色、分子对接 | 诊断模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据、临床组织样本 | 三个基因表达数据集、一个单细胞RNA测序数据集及临床椎间盘组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4206 | 2026-01-18 |
Single-cell and spatial detection of senescent cells using DeepScence
2025-Dec-10, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101035
PMID:41061702
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研究论文 | 本文开发了一种基于深度神经网络的工具DeepScence,用于在单细胞和空间转录组数据中准确识别衰老细胞 | 提出了一个整合多个已发表基因集的衰老相关基因集CoreScence,并基于此开发了首个能同时处理单细胞和空间转录组数据的深度学习方法DeepScence,其性能显著优于现有方法 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种能准确识别衰老细胞的计算方法,以研究其空间和分子特征 | 衰老细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 4207 | 2026-01-18 |
Tregs With High CD29 Expression Promote Cell Adhesion and Contribute to the Malignant Transformation of MASLD
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70421
PMID:41200753
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研究论文 | 本研究揭示了在代谢功能障碍相关脂肪肝病(MASLD)微环境中,高表达CD29的调节性T细胞(Tregs)通过促进细胞粘附驱动疾病向肝细胞癌(HCC)恶性转化 | 首次在MASLD背景下,通过单细胞RNA测序识别出高表达整合素β1(CD29)的Treg亚群,并阐明其通过增强细胞粘附驱动MASH向HCC转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,其在人类疾病中的普适性仍需进一步验证;CD29靶向治疗策略的临床转化潜力有待评估 | 探究Tregs在MASLD向HCC恶性转化过程中的作用机制,并评估CD29作为潜在治疗靶点的价值 | MASLD小鼠模型(通过高脂饮食和2-乙酰氨基芴诱导)及肝脏中的T淋巴细胞亚群 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),流式细胞术,体外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | MASLD小鼠模型(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4208 | 2026-01-18 |
scRNA-Seq Reveals Sustained Pro-Inflammation by Innate Immune Activation in In Utero HBV-Exposed Neonates of High HBsAg Mothers
2025-Dec, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70405
PMID:41204708
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学测序分析了高HBsAg母亲所生新生儿在乙肝疫苗接种前后的免疫状态,揭示了先天免疫激活导致的持续促炎症状态 | 首次使用单细胞多组学测序技术,结合转录组和表面标记物表达,系统评估了高HBsAg母亲所生新生儿在乙肝疫苗接种前后的免疫细胞功能变化,特别是CD8+T细胞的耗竭标记物表达和先天免疫细胞的促炎症特征 | 样本量相对较小,仅包括低和高HBsAg滴度两组母亲所生婴儿,且未涉及长期随访数据以评估免疫状态的持久性影响 | 探究高HBsAg母亲所生新生儿在乙肝疫苗接种前后的免疫状态,特别是先天免疫激活和适应性免疫受损的机制 | 来自低和高HBsAg滴度母亲的新生儿外周血单个核细胞(PBMCs) | 单细胞组学 | 乙型肝炎 | 单细胞多组学测序,免疫表型分析 | NA | 单细胞转录组和表面标记物表达数据 | 两组新生儿(低HBsAg滴度组和高HBsAg滴度组),具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞多组学测序 | NA | NA |
| 4209 | 2026-01-18 |
Reconstruction and analysis of the gene network regulating apoptosis in hepatocellular carcinoma based on scRNA-seq data and the ANDSystem knowledge base
2025-Dec, Vavilovskii zhurnal genetiki i selektsii
IF:0.9Q3
DOI:10.18699/vjgb-25-102
PMID:41541554
|
研究论文 | 本研究基于单细胞转录组测序数据和ANDSystem知识库,重建并分析了肝细胞癌中调控肝细胞凋亡的基因网络 | 结合scRNA-seq数据和人工智能驱动的知识库,重建了肝细胞癌凋亡调控网络,并识别了未在Gene Ontology中标注为凋亡参与者的关键蛋白(如CDKN1A、ERBB2、IL8、EGR1)在凋亡中的作用 | 研究依赖于计算分析和现有知识库注释,未进行实验验证;网络重建可能受数据质量和知识库完整性的限制 | 分析肝细胞癌中凋亡过程的分子机制,识别关键调控基因和蛋白,为寻找新的治疗靶点提供依据 | 肝细胞癌中的肝细胞(肿瘤肝细胞与正常肝组织肝细胞) | 计算系统生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | 基因网络重建与分析 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4210 | 2026-01-18 |
Human iPSC-derived spinal neural progenitors enhance sensorimotor recovery in spinal cord-injured NOD-SCID mice via differentiation and microenvironment regulation
2025-Aug-22, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07961-x
PMID:40846836
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研究论文 | 本研究开发了一种通过移植人iPSC来源的脊髓神经祖细胞治疗脊髓损伤的方法,并在小鼠模型中验证了其通过促进神经元分化和调节微环境来改善感觉运动功能恢复的双重机制 | 首次利用人iPSC来源的脊髓神经祖细胞在脊髓损伤模型中同时实现神经元分化和损伤微环境调节,并通过单细胞测序技术系统揭示了细胞移植后的分化轨迹和宿主微环境的变化 | 研究在免疫缺陷小鼠模型中进行,未能完全模拟人类脊髓损伤后的免疫反应;长期安全性和疗效仍需进一步验证 | 开发基于干细胞移植的脊髓损伤治疗新策略 | 脊髓损伤的NOD-SCID小鼠模型 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 单核转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核转录组学 | NA | NA |
| 4211 | 2026-01-18 |
Spatial Transcriptomics Advances the Use of Canine Patients in Cancer Research: Analysis of Osteosarcoma-Bearing Pet Dogs Enrolled in a Clinical Trial
2025-Jul-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-0687
PMID:40392977
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研究论文 | 本研究首次将GeoMx犬类癌症图谱应用于骨肉瘤临床试验中犬类患者的预后相关样本,通过空间转录组学分析揭示了与疾病无进展间隔相关的基因和通路 | 首次在犬类骨肉瘤临床试验样本中应用GeoMx犬类癌症图谱进行空间转录组学分析,验证了犬类模型在人类癌症研究中的价值 | 样本量较小(n=16),仅基于疾病无进展间隔进行分组,可能未涵盖所有临床变量 | 利用犬类骨肉瘤模型研究人类骨肉瘤的分子机制和预后标志物 | 犬类骨肉瘤患者的原发性肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 16个犬类骨肉瘤样本(高DFI组8个,低DFI组8个) | NA | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx犬类癌症图谱,用于福尔马林固定石蜡包埋组织的空间转录组分析 |
| 4212 | 2026-01-18 |
Myeloid Fatty Acid Metabolism Activates Neighboring Hematopoietic Stem Cells to Promote Heart Failure With Preserved Ejection Fraction
2025-May-20, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文通过比较患者样本和动物模型,揭示了骨髓脂肪酸代谢如何激活邻近造血干细胞,从而促进射血分数保留的心力衰竭(HFpEF)的机制 | 首次发现骨髓脂肪酸代谢通过重塑Vcam1启动子激活造血干细胞,促进HFpEF的系统性炎症和心脏舒张功能障碍 | 研究主要基于动物模型和体外实验,人类样本验证有限,且HFpEF的复杂病理机制可能涉及其他未被探索的因素 | 探究HFpEF中骨髓脂肪酸代谢对造血干细胞激活的因果机制 | HFpEF患者样本、小鼠模型、骨髓细胞和造血干细胞 | 心血管疾病 | 心力衰竭 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、质谱分析、碳标记 | NA | 基因表达数据、代谢数据、细胞表型数据 | 患者样本和小鼠模型,具体数量未在摘要中明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4213 | 2026-01-18 |
The Dyson equalizer: adaptive noise stabilization for low-rank signal detection and recovery
2025-Mar, Information and inference : a journal of the IMA
DOI:10.1093/imaiai/iaae036
PMID:39830802
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研究论文 | 本文提出了一种自适应噪声稳定化方法,用于低秩信号在异方差噪声下的检测与恢复 | 开发了一种基于随机矩阵理论和Dyson方程的自适应归一化程序,能均衡数据矩阵行列间的平均噪声方差,支持广泛的噪声分布和信号结构 | NA | 解决异方差噪声环境下低秩信号检测与恢复的挑战 | 数据矩阵中的低秩信号 | 机器学习 | NA | NA | NA | 矩阵数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4214 | 2025-12-02 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor microenvironment characteristics in ovarian malignant Brenner tumor
2026-Mar, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101635
PMID:41322338
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4215 | 2026-01-17 |
Integrative transcriptome profiling elucidates molecular and immunovascular characteristics of macrotrabecular HCC
2026-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001284
PMID:40009602
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研究论文 | 本研究通过整合大规模bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,深入解析了肝细胞癌(HCC)中侵袭性亚型(特别是巨梁状HCC)的分子和免疫血管特征 | 整合bulk和单细胞数据细化HCC分类,首次通过基因调控网络和细胞组成分析揭示p53和MYC在侵袭性HCC中的核心作用,并在小鼠模型中验证血管靶向与免疫检查点阻断联合治疗策略 | 研究样本量相对有限(6个单细胞数据集和691个肿瘤样本),且主要基于转录组数据,可能未涵盖其他分子层面的异质性 | 阐明肝细胞癌侵袭性亚型的分子机制和肿瘤微环境特征,探索潜在治疗策略 | 肝细胞癌(HCC)肿瘤细胞、免疫细胞及小鼠模型 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、bulk RNA测序、基因调控网络分析、基因集富集分析 | NA | RNA-seq数据(单细胞和bulk)、小鼠模型数据 | 228,564个活细胞(来自6个scRNA-seq数据集)和691个肿瘤样本(bulk RNA-seq) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4216 | 2026-01-17 |
Characterising the Periodontal Granulation Tissue Using scRNAseq
2026-Feb, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.70048
PMID:41055332
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了牙周肉芽组织的细胞组成和分子机制,旨在加深对牙周病发病机制的理解并识别再生治疗的潜在靶点 | 发现了一种新型内皮细胞亚群,该亚群特异性表达NOTCH3并参与骨化通路,为牙周病发病机制提供了新见解 | 样本量较小(n=3),可能限制结果的普遍性 | 研究牙周肉芽组织的细胞组成和分子机制,以理解牙周病发病机制并识别再生治疗的潜在靶点 | 牙周肉芽组织样本 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 3例牙周手术患者的肉芽组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4217 | 2026-01-17 |
A gene-expression module identifies circulating immune cells with enhanced recruitment to sites of inflammation
2026-Jan-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114227
PMID:41531734
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研究论文 | 本研究通过纵向单细胞转录组学分析,在肾移植受者外周血中发现了一个保守的基因模块ALARM,该模块协调免疫细胞向炎症部位的招募和效应功能 | 首次鉴定出ALARM基因模块,该模块整合了转录因子、归巢受体和早期激活标志物,揭示了其在免疫细胞招募和代谢重编程中的核心作用 | 研究主要基于肾移植受者和动物模型,在更广泛人群中的普适性有待进一步验证 | 探究循环免疫细胞基因表达程序如何影响其向炎症组织的招募过程 | 肾移植受者的外周血免疫细胞、移植排斥组织、猪模型以及公共数据集中的健康个体和感染患者 | 单细胞转录组学 | 肾脏移植排斥、COVID-19感染、肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 肾移植受者外周血样本、移植排斥组织、猪模型及公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4218 | 2026-01-17 |
CD19 CAR T-Cell Therapy for Autoimmune Hemolytic Anemia
2026-Jan-15, The New England journal of medicine
DOI:10.1056/NEJMoa2509820
PMID:41534043
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研究论文 | 本研究评估了CD19 CAR T细胞疗法在治疗多药难治性自身免疫性溶血性贫血患者中的安全性和有效性 | 首次将CD19 CAR T细胞疗法应用于多药难治性自身免疫性溶血性贫血患者,并进行了多组学分析以探索复发机制 | 样本量较小(仅11例患者),且随访时间中位数为12.2个月,长期疗效和安全性尚需进一步观察 | 评估CD19 CAR T细胞疗法在多药难治性自身免疫性溶血性贫血患者中的安全性和疗效 | 多药难治性自身免疫性溶血性贫血患者 | NA | 自身免疫性溶血性贫血 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、配对B细胞受体测序 | NA | 临床数据、多组学数据 | 11例患者(5例来自同情使用项目,6例来自1期研究) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4219 | 2026-01-17 |
Transient ER stress cell-autonomously promotes beta cell cycling in mice
2026-Jan-15, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06649-3
PMID:41537777
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型发现,短暂的内质网应激可自主促进β细胞增殖,为糖尿病治疗提供了新的潜在策略 | 首次揭示了转基因过表达、内质网应激、葡萄糖与β细胞周期激活之间的关联,并证明短暂内质网应激可独立于血管恢复促进β细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证;且内质网应激诱导的长期效应和安全性仍需进一步评估 | 探究内分泌胰腺实验性低血管化恢复是否能触发小鼠β细胞增殖 | 转基因小鼠模型中的胰腺β细胞 | 糖尿病研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,定量RT-PCR,免疫染色,BrdU/Edu标记 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据,图像数据 | 未明确指定样本数量,但使用了转基因小鼠模型和体外胰岛实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4220 | 2026-01-17 |
Single-cell atlas of axial skeletal immune-matrix interaction in spondylitis
2026-Jan-15, Immunologic research
IF:3.3Q3
DOI:10.1007/s12026-025-09743-1
PMID:41537924
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术,构建了强直性脊柱炎患者中轴骨骼的免疫-基质相互作用图谱,揭示了致病性细胞毒性T淋巴细胞与基质成纤维细胞之间的相互作用轴 | 首次在强直性脊柱炎患者的中轴骨骼组织中,通过整合单细胞RNA-seq和ATAC-seq技术,在空间和基质背景下解析了细胞毒性T淋巴细胞与骨基质微环境的原位相互作用 | 研究样本来源于手术患者,可能无法完全代表疾病早期阶段;研究为横断面设计,因果关系需进一步验证 | 解析强直性脊柱炎中轴骨骼受累的免疫-基质相互作用机制 | 强直性脊柱炎患者和年龄匹配对照者的中轴骨骼组织(椎体骨髓、附着点纤维软骨、邻近终板基质组织) | 单细胞多组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | 整合聚类分析、差异基因表达分析、染色质可及性分析、拟时序轨迹分析、配体-受体网络推断 | 单细胞转录组数据、单细胞表观基因组数据 | 24名活动性强直性脊柱炎患者和12名年龄匹配对照者,共108,752个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |