单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 4181 - 4200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4181 | 2025-02-25 |
Evaluation of T Cell Receptor Construction Methods from scRNA-Seq Data
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae086
PMID:39666949
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研究论文 | 本文评估了从单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据构建T细胞受体（TCR）的不同方法，并引入了一种新的模拟器YASIM-scTCR | 引入了一种新的模拟器YASIM-scTCR，能够生成包含不同测序深度和读长的TCR衍生序列的scTCR-seq数据 | 测序深度对成功构建TCR具有关键限制 | 评估从scRNA-seq数据构建TCR的不同方法的性能 | T细胞受体（TCR） | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | scRNA-seq数据 | 实验性单细胞免疫分析数据集 |
| 4182 | 2025-02-25 |
Ectopic expression of NKG7 enhances CAR-T function and improves the therapeutic efficacy in liquid and solid tumors
2024-Dec, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2024.107506
PMID:39551173
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据探索了肿瘤浸润T细胞的特征，发现NKG7的异位表达能显著增强CAR-T细胞的功能，并提高其在液体和实体肿瘤中的治疗效果 | 利用临床肿瘤样本的单细胞测序数据寻找增强CAR-T细胞功能的策略，并首次发现NKG7的异位表达能显著提高CAR-T细胞的治疗效果 | 缺乏治疗后的活检数据，尤其是在实体肿瘤中，限制了CAR-T细胞体内特性的理解 | 探索增强CAR-T细胞功能的策略，并提高其在液体和实体肿瘤中的治疗效果 | 消化系统癌症的肿瘤浸润T细胞（TILs） | 生物医学 | 消化系统癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CAR-T细胞模型 | RNA测序数据 | 19个临床样本 |
| 4183 | 2025-02-25 |
Epsins oversee smooth muscle cell reprograming by influencing master regulators KLF4 and OCT4
2024-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.08.574714
PMID:39131381
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研究论文 | 本文研究了Epsins蛋白家族如何通过影响主调控因子KLF4和OCT4来调控平滑肌细胞的重编程，从而影响冠状动脉疾病的病理过程 | 揭示了Epsins在平滑肌细胞重编程中的新作用，并发现Epsins通过增强OCT4活性和抑制KLF4来促进平滑肌细胞向有益细胞类型转化 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步研究 | 探索Epsins在平滑肌细胞重编程中的作用及其在冠状动脉疾病中的潜在治疗价值 | 平滑肌细胞 | 分子生物学 | 冠状动脉疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 小鼠动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞 |
| 4184 | 2025-02-25 |
Gas6-Axl signal promotes indoor VOCs exposure-induced pulmonary fibrosis via pulmonary microvascular endothelial cells-fibroblasts cross-talk
2024-08-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2024.134786
PMID:38824778
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研究论文 | 本研究探讨了室内挥发性有机化合物（VOCs）暴露通过肺微血管内皮细胞与成纤维细胞的相互作用促进肺纤维化的机制 | 揭示了VOCs暴露通过Gas6-Axl信号通路激活成纤维细胞的新机制，并发现Atf3基因在调控PANoptosis表型中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人体内的机制仍需进一步验证 | 阐明VOCs暴露诱导肺纤维化的潜在分子机制 | 小鼠模型及肺微血管内皮细胞与成纤维细胞 | 生物医学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 4185 | 2025-02-25 |
Engrailed transcription factors direct excitatory cerebellar neuron diversity and survival
2023-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569445
PMID:38077070
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和空间表达分析，定义了小脑核内侧兴奋性神经元的分子亚域，并揭示了EN1/2在小脑兴奋性神经元谱系中的保守作用 | 首次定义了胚胎期小脑核内侧兴奋性神经元的分子多样性，并揭示了EN1/2在小脑兴奋性神经元分化与存活中的保守功能 | 研究主要聚焦于胚胎期，未涉及成年期的分子机制 | 研究小脑核内侧兴奋性神经元的分子多样性及其发育机制 | 小脑核内侧兴奋性神经元 | 神经科学 | NA | scRNA-seq, 空间表达分析 | NA | 基因表达数据 | 胚胎期小脑核内侧兴奋性神经元 |
| 4186 | 2025-02-24 |
Tumor infiltration of inactive CD8 + T cells was associated with poor prognosis in Gastric Cancer
2025-Mar, Gastric cancer : official journal of the International Gastric Cancer Association and the Japanese Gastric Cancer Association
IF:6.0Q1
DOI:10.1007/s10120-024-01577-4
PMID:39722065
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研究论文 | 本研究探讨了胃癌复杂肿瘤免疫微环境中各种免疫细胞的功能，特别是CD8 + T细胞的浸润与预后的关系 | 通过单细胞RNA测序和免疫组化分析，揭示了CD8 + T细胞在胃癌中的活性状态及其与预后的关联 | 样本量相对较小（34例患者进行单细胞RNA测序），且仅分析了Epstein-Barr病毒阴性病例的TCR库 | 探讨胃癌肿瘤免疫微环境中CD8 + T细胞的功能及其对预后的影响 | 胃癌患者及其肿瘤组织中的CD8 + T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫组化 | NA | RNA测序数据、免疫组化数据 | 34例胃癌患者的肿瘤和正常组织进行单细胞RNA测序，157例胃癌患者进行免疫组化分析 |
| 4187 | 2025-02-24 |
Spatiotemporal Transcriptomic Profiling Reveals the Dynamic Immunological Landscape of Alveolar Echinococcosis
2025-Feb-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202405914
PMID:39985260
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研究论文 | 本文通过整合bulk RNA-seq、scRNA-seq和空间转录组技术，揭示了宿主对多房棘球蚴的免疫反应机制，并构建了感染病灶的高分辨率空间图谱 | 首次结合多种转录组技术，从时空维度揭示多房棘球蚴感染过程中的宿主免疫反应机制，并发现中性粒细胞和巨噬细胞亚群在疾病进展中的关键作用 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 研究多房棘球蚴感染过程中的宿主免疫反应机制 | 感染多房棘球蚴的小鼠肝脏样本 | 数字病理学 | 棘球蚴病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组技术 | NA | RNA-seq数据 | 感染后多个时间点（最长15个月）的小鼠肝脏样本 |
| 4188 | 2025-02-24 |
Age-Dependent Clonal Expansion of Non-Sperm-Forming Spermatogonial Stem Cells in Mouse Testes
2025-Feb-22, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70019
PMID:39985763
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研究论文 | 本文研究了老年小鼠睾丸中非精子形成型精原干细胞（SSCs）的克隆扩展行为及其对精子生成的影响 | 揭示了老年小鼠睾丸中非精子形成型SSCs的克隆扩展现象，并发现这些克隆在老年小鼠中占据生态位空间，可能影响精子生成和遗传多样性 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类或其他哺乳动物的相关研究 | 探讨生理老化对睾丸开放生态位中精原干细胞克隆命运行为的影响 | 老年小鼠睾丸中的精原干细胞 | 生殖生物学 | NA | 单细胞RNA测序、谱系追踪、活体成像 | NA | 基因表达数据、影像数据 | 老年小鼠睾丸样本 |
| 4189 | 2025-02-24 |
Spatial transcriptomics in autoimmune rheumatic disease: potential clinical applications and perspectives
2025-Feb-20, Inflammation and regeneration
IF:5.0Q1
DOI:10.1186/s41232-025-00369-2
PMID:39980019
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术的发展及其在自身免疫性风湿病中的潜在临床应用 | 空间转录组学技术结合高plex RNA测序与空间数据，提供了单细胞水平的精确空间评估，增强了对疾病过程中细胞相互作用的理解 | NA | 探讨空间转录组学在自身免疫性风湿病中的临床应用潜力 | 自身免疫性风湿病，如类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮和干燥综合征 | 数字病理学 | 风湿病 | 空间转录组学，原位杂交，原位测序，原位空间条形码，显微切割方法 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4190 | 2025-02-20 |
Publisher Correction: Accurate RNA velocity estimation based on multibatch network reveals complex lineage in batch scRNA-seq data
2025-Feb-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02152-8
PMID:39966937
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4191 | 2025-02-24 |
Efficient Identification of Monoclonal Antibodies Against Rift Valley Fever Virus Using High-Throughput Single Lymphocyte Transcriptomics of Immunized Mice
2025-Feb-04, Antibodies (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antib14010012
PMID:39982227
|
研究论文 | 本文报告了使用10x Genomics技术进行高通量单细胞分析，以识别针对裂谷热病毒（RVFV）的稀有且强效的抗体 | 采用高通量单细胞转录组学技术，结合生物信息学分析，从免疫小鼠中筛选出针对RVFV表面糖蛋白Gc和Gn的单克隆抗体 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体试验 | 开发针对RVFV的高效治疗性抗体 | 裂谷热病毒（RVFV）及其表面糖蛋白Gc和Gn | 生物信息学 | 裂谷热 | 10x Genomics高通量单细胞转录组学技术 | NA | 单细胞转录组数据 | 从小鼠脾脏中分选的记忆B细胞群体 |
| 4192 | 2025-02-24 |
Generation of super-resolution images from barcode-based spatial transcriptomics by deep image prior
2025-Jan-27, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2024.100937
PMID:39729996
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研究论文 | 本文提出了一种名为SuperST的算法，通过深度图像先验从低分辨率空间转录组学库中重建高分辨率图像矩阵 | SuperST算法利用深度图像先验技术，解决了现有空间转录组学方法在从稀疏分布的条形码重建高分辨率图像时的局限性，生成的图像更接近免疫荧光图像 | 未明确提及具体局限性 | 提高空间转录组学图像的分辨率，解决零膨胀问题 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 深度图像先验 | NA | 图像 | NA |
| 4193 | 2025-02-24 |
TimeFlies: an snRNA-seq aging clock for the fruit fly head sheds light on sex-biased aging
2025-Jan-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.25.625273
PMID:39896546
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研究论文 | 本文介绍了TimeFlies，一种基于单细胞RNA测序的果蝇头部衰老时钟，揭示了性别差异在衰老过程中的作用 | TimeFlies是首个基于全基因组基因表达谱的泛细胞类型单细胞RNA测序衰老时钟，能够识别与年龄相关的关键标记基因，并揭示性别差异在衰老中的不同作用 | 研究主要局限于果蝇头部，未涉及其他组织或物种 | 开发一种基于单细胞RNA测序的衰老时钟，以研究果蝇头部衰老过程中的性别差异 | 果蝇头部细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 深度学习 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 4194 | 2025-02-24 |
Integrating Bulk and Single-Cell Transcriptomic Data to Identify Ferroptosis-Associated Inflammatory Gene in Alzheimer's Disease
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S497418
PMID:39959647
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了铁死亡相关炎症基因SLC11A1在阿尔茨海默病中的关键作用 | 首次从细胞类型特异性角度探讨了铁死亡、免疫炎症与阿尔茨海默病之间的分子机制，并发现了一个与铁死亡高度相关的小胶质细胞亚群 | 研究主要基于转录组数据，缺乏对蛋白质水平和功能验证的深入分析 | 探讨铁死亡、免疫炎症与阿尔茨海默病之间的分子联系 | 阿尔茨海默病患者脑组织和外周血的RNA测序数据 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, 免疫荧光 | NA | RNA测序数据 | 阿尔茨海默病患者脑组织和外周血的RNA测序数据，以及实验性自身免疫性脑脊髓炎小鼠脑组织的scRNA-seq数据 |
| 4195 | 2025-02-23 |
Revealing the therapeutic targets, mechanisms, and heterogeneity of Huatan Jieyu Granules for Parkinson's disease through single-cell sequencing
2025-May-15, Journal of pharmaceutical and biomedical analysis
IF:3.1Q2
DOI:10.1016/j.jpba.2025.116679
PMID:39864142
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探索了化痰解郁颗粒（HGs）对帕金森病（PD）的治疗靶点、机制和异质性 | 首次使用单细胞测序技术揭示了HGs治疗PD的分子机制和关键细胞类型 | 研究仅基于小鼠模型，未涉及人类样本 | 探索HGs对PD的治疗效果及其分子机制 | MPTP诱导的PD小鼠模型 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞测序 | 小鼠PD模型 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及样本数量，但涉及空白组、PD模型组和药物治疗组的小鼠 |
| 4196 | 2025-02-23 |
Differential expression of the MYC-Notch axis drives divergent responses to the front-line therapy in central and peripheral extensive-stage small-cell lung cancer
2025-Mar, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70112
PMID:39974662
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研究论文 | 本研究比较了中央型和周围型广泛期小细胞肺癌（ES-SCLC）对一线治疗的反应差异，并通过单细胞RNA测序探讨了潜在的生物学机制 | 首次揭示了中央型和周围型ES-SCLC对一线治疗的不同反应，并发现MYC-Notch-non-NE轴的差异激活状态可能是导致这些差异的原因 | 样本量较小（9个治疗初期的ES-SCLC样本），需要更大规模的研究来验证结果 | 探讨中央型和周围型ES-SCLC对一线治疗的反应差异及其生物学机制 | 广泛期小细胞肺癌（ES-SCLC）患者 | 癌症研究 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 265名患者（临床数据）和9个治疗初期的ES-SCLC样本（scRNA-seq数据） |
| 4197 | 2025-02-23 |
Impaired inflammatory resolution with severe SARS-CoV-2 infection in leptin knock out obese hamster
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111837
PMID:39981511
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研究论文 | 本研究通过基因编辑的瘦素敲除肥胖仓鼠模型，探讨了肥胖与严重COVID-19之间的机制 | 首次使用瘦素敲除肥胖仓鼠模型模拟肥胖患者的严重COVID-19，并通过单细胞转录组学揭示了单核细胞来源的肺泡巨噬细胞在肺部过度炎症中的关键作用 | 研究主要依赖于动物模型，可能无法完全反映人类肥胖患者的复杂情况 | 探讨肥胖与严重COVID-19之间的机制，并建立可靠的临床前动物模型 | 瘦素敲除肥胖仓鼠 | 生物医学 | COVID-19 | 单细胞转录组学 | 瘦素敲除肥胖仓鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 4198 | 2025-02-23 |
Microglial Regulation of Neural Networks in Neuropsychiatric Disorders
2025-Feb-11, The Neuroscientist : a review journal bringing neurobiology, neurology and psychiatry
DOI:10.1177/10738584251316558
PMID:39932233
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研究论文 | 本文探讨了小胶质细胞在中枢神经系统中的重要作用及其与神经网络的复杂相互作用，特别是在神经精神疾病和神经退行性疾病中的影响 | 利用单细胞测序技术揭示了小胶质细胞亚型的多样性，并深入探讨了其在神经精神疾病中的功能 | 未具体提及研究的局限性 | 研究小胶质细胞在神经精神疾病和神经退行性疾病中的作用，以探索新的治疗策略 | 小胶质细胞及其与神经网络的相互作用 | 神经科学 | 阿尔茨海默病、抑郁症、癫痫 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 4199 | 2025-02-23 |
The Society for Immunotherapy of Cancer Perspective on Tissue-Based Technologies for Immuno-Oncology Biomarker Discovery and Application
2025-Feb-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2469
PMID:39625818
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评论 | 本文总结了免疫肿瘤学中基于组织的技术用于生物标志物发现和应用的最新进展 | 本文强调了多参数、多组学和计算平台在生成前所未有的深度数据方面的潜力，以发现更强大的生物标志物，从而增强患者选择和个性化治疗方法 | 需要权衡各种技术的优缺点，包括最小化患者采样、最大化数据输出、评估结果的再现性和代表性，同时减少数据碎片化以实现协调 | 评估和推进免疫肿瘤学中生物标志物技术的应用，以改善患者护理 | 免疫肿瘤学中的生物标志物 | 数字病理学 | 癌症 | 多重免疫组化、免疫荧光、单细胞转录组学、质谱定量和空间分辨蛋白质组学成像技术 | NA | 多组学数据 | NA |
| 4200 | 2025-02-23 |
EPB41L4A-AS1 regulates cervical cancer by proliferative cells: mendelian randomization and single-cell transcriptomics analyses
2025-Jan-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-949
PMID:39974380
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，探讨了增殖细胞在宫颈癌中的作用及其机制 | 首次揭示了EPB41L4A-AS1通过调控增殖细胞在宫颈癌中的作用 | 研究主要基于单细胞转录组学和孟德尔随机化分析，未涉及临床试验验证 | 探讨增殖细胞在宫颈癌中的作用及其机制 | 宫颈癌组织中的增殖细胞 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 单细胞转录组学、孟德尔随机化、MTT、流式细胞术、GSEA、WGCNA | NA | 单细胞转录组数据 | 宫颈癌组织与健康组织的单细胞转录组数据 |