单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4181 - 4200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4181 | 2025-10-06 |
Human adipose-derived mesenchymal stem cell-derived exosomes induce epithelial remodeling and anti-scar healing revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Jul-14, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03548-y
PMID:40660260
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人脂肪来源间充质干细胞外泌体诱导上皮重塑和抗瘢痕愈合的机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示hADSC-Exos通过调控淋巴增强子结合因子1增殖角质形成细胞的上皮-间质可塑性促进无瘢痕愈合 | 研究仅关注术后第14天的时间点，缺乏动态过程分析 | 探究hADSC-Exos促进无瘢痕伤口愈合的分子机制 | 成年野生型小鼠和hADSC-Exos处理小鼠的伤口组织 | 单细胞组学 | 伤口愈合障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和hADSC-Exos处理小鼠在术后14天的伤口组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4182 | 2025-10-06 |
Targeted Inhibition of cGAS/STING signaling induced by aberrant R-Loops in the nucleus pulposus to alleviate cellular senescence and intervertebral disc degeneration
2025-Jul-14, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03579-5
PMID:40660286
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研究论文 | 本研究通过靶向抑制cGAS/STING信号通路来缓解细胞衰老和椎间盘退变 | 首次发现R-Loops异常积累通过cGAS/STING信号通路诱导髓核细胞衰老，并开发了靶向纳米递送平台 | 研究主要基于大鼠穿刺模型，临床转化需进一步验证 | 探索椎间盘退变的发病机制并开发治疗策略 | 髓核细胞和椎间盘组织 | 分子生物学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序，纳米递送技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4183 | 2025-10-06 |
DnaK of Parvimonas micra extracellular vesicles interacts with the host fibroblasts BAG3-IKK-γ axis to accelerate TNF-α secretion in oral lichen planus
2025-Jul-14, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02151-5
PMID:40660385
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研究论文 | 本研究揭示了小单胞菌细胞外囊泡通过DnaK-BAG3-IKK-γ轴抑制自噬并促进TNF-α分泌的口腔扁平苔藓发病机制 | 首次发现小单胞菌是口腔扁平苔藓的关键病原体，并阐明其细胞外囊泡通过DnaK-BAG3-IKK-γ分子轴调控成纤维细胞功能的机制 | NA | 探究口腔扁平苔藓的发病机制，特别关注口腔微生物与宿主细胞的相互作用 | 口腔扁平苔藓患者和健康个体的口腔黏膜组织、唾液样本及成纤维细胞 | 微生物组学 | 口腔扁平苔藓 | 微生物组分析, 单细胞RNA测序, 网络分析, 随机森林分析, NetShift分析, 共培养实验 | NA | 微生物组数据, 单细胞RNA测序数据, 蛋白质相互作用数据 | 口腔扁平苔藓患者和健康个体的多个口腔部位样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4184 | 2025-10-06 |
A scRNA-seq reference contrasting living and early post-mortem human retina across diverse donor states
2025-Jul-14, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00796-9
PMID:40660409
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序建立了活体与早期死后人类视网膜的对比参考图谱 | 首次系统比较活体与死后人类视网膜的单细胞转录组差异，发现ELF1-mlCone光感受器新亚群 | 样本数量相对有限，仅包含9个样本 | 建立人类视网膜单细胞参考图谱，比较活体与死后组织的转录组差异 | 人类视网膜组织 | 单细胞基因组学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | scVI, Leiden聚类, RNA velocity, CellChat | 单细胞转录组数据 | 106,829个单细胞，来自9个未冷冻人类视网膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics 3' RNA-seq |
| 4185 | 2025-10-06 |
Molecular pathology of acute spinal cord injury in middle-aged mice
2025-Jul-13, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03494-4
PMID:40653490
|
研究论文 | 本研究比较了年轻和中年小鼠在急性脊髓损伤后的行为、组织病理学和转录组学差异 | 首次对中年小鼠脊髓损伤病理生物学进行全面的转录组学研究，填补了该年龄段研究空白 | 仅研究了小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；研究时间限于损伤后一个月 | 探究年龄对脊髓损伤后恢复机制的影响 | 年轻（2-4个月）和中年（10-12个月）小鼠 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据,行为数据,组织病理数据 | 年轻和中年两组小鼠 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4186 | 2025-10-06 |
The immunological and prognostic landscape of TFAP4 in cancer: A single-cell RNA sequencing perspective
2025-Jul-11, Archives of biochemistry and biophysics
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.abb.2025.110551
PMID:40653182
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示TFAP4在肿瘤免疫微环境中的生物学功能和预后价值 | 首次从单细胞水平系统解析TFAP4在多种癌症类型中的免疫调控机制及其与治疗反应的关系 | 未明确说明具体涉及的癌症类型种类及样本数量 | 探究TFAP4在肿瘤免疫微环境中的生物学功能和临床意义 | 多种癌症类型的恶性上皮细胞和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4187 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals metabolic dysfunction prior to overt tauopathy in the PS19 mouse model
2025-Jul-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6941464/v1
PMID:40671812
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组分析揭示了PS19小鼠模型中在明显tau病变出现前的代谢功能障碍 | 首次在tau病变可检测病理出现前识别出CA3区域糖酵解通路基因的早期上调，揭示了区域特异性代谢失调的时间动态 | 研究仅限于PS19转基因小鼠模型，结果在人类疾病中的适用性需要进一步验证 | 探究区域脆弱性与前缠结tau驱动的转录组变化之间的关系 | tau P301S转基因小鼠模型（PS19品系） | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | PS19小鼠模型在不同疾病阶段的海马体和皮质区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4188 | 2025-10-06 |
From scRNA-seq to therapeutic targets: Unveiling the impact of activated mast cells on intestinal dysfunction in acute pancreatitis
2025-Jul-07, World journal of gastroenterology
IF:4.3Q1
DOI:10.3748/wjg.v31.i25.107865
PMID:40656612
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评论 | 对一项关于急性胰腺炎中肥大细胞通过分泌CCL5导致肠道功能障碍的单细胞转录组研究的评论 | 强调了研究中整合单细胞转录组与功能分析的方法创新 | NA | 探讨急性胰腺炎相关肠道损伤的细胞和分子机制 | 急性胰腺炎早期小肠组织 | 单细胞转录组学 | 急性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4189 | 2025-10-06 |
Developmental Origins and Oncogenesis in Medulloblastoma
2025-Jul, Annual review of neuroscience
IF:12.1Q1
|
综述 | 本文探讨了髓母细胞瘤的发育起源和致癌机制，重点关注分子亚群的细胞起源、可塑性和异质性 | 整合单细胞转录组学证据，提出各分子亚群特有的遗传-表观遗传改变导致神经发育程序停滞的新机制 | NA | 阐明髓母细胞瘤的细胞起源和肿瘤发生机制 | 髓母细胞瘤分子亚群及其发育起源细胞 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4190 | 2025-10-06 |
CD36 promotes iron accumulation and dysfunction in CD8+ T cells via the p38-CEBPB-TfR1 axis in earlystage hepatocellular carcinoma
2025-Jul, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2024.0948
PMID:40037690
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研究论文 | 本研究揭示了CD36通过p38-CEBPB-TfR1轴促进CD8+ T细胞铁积累和功能失调的新机制 | 首次发现CD36通过调控铁代谢导致CD8+ T细胞功能失调的机制，并证实NRF2激活可抑制脂质过氧化恢复T细胞功能 | 研究主要基于小鼠肝癌模型，人类样本验证尚不充分 | 探索早期肝细胞癌中CD8+ T细胞功能失调的机制 | 小鼠肝癌模型中的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4191 | 2025-10-06 |
USP14-IMP2-CXCL2 axis in tumor-associated macrophages facilitates resistance to anti-PD-1 therapy in gastric cancer by recruiting myeloid-derived suppressor cells
2025-07, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03425-w
PMID:40269263
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关巨噬细胞中USP14-IMP2-CXCL2轴通过招募髓源性抑制细胞导致胃癌抗PD-1治疗耐药的机制 | 首次发现USP14通过去泛素化稳定m6A阅读器IMP2，增强CXCL2表达和分泌，从而驱动抗PD-1治疗耐药的新机制 | 研究主要基于临床样本和动物实验，需要进一步验证在人类患者中的临床应用价值 | 探索胃癌抗PD-1治疗耐药的分子机制并寻找新的治疗策略 | 胃癌患者内镜活检样本、肿瘤相关巨噬细胞、髓源性抑制细胞 | 肿瘤免疫学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 无法手术胃癌患者的内镜活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4192 | 2025-10-06 |
Angiopoietin-TIE2 feedforward circuit promotes PIK3CA-driven venous malformations
2025-Jul, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00655-9
PMID:40410415
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研究论文 | 本研究揭示了PIK3CA驱动的静脉畸形中血管生成素-TIE2正反馈环路促进疾病进展的机制 | 首次发现静脉特异性信号环路，揭示PI3Kα活性通过自分泌和旁分泌机制放大上游TIE2受体信号 | mTOR阻断对晚期静脉畸形效果有限，研究主要基于小鼠模型 | 探究PIK3CA相关静脉畸形的发病机制和潜在治疗靶点 | 静脉畸形小鼠模型和人类静脉畸形样本 | 病理学 | 静脉畸形 | 单细胞转录组学，谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4193 | 2025-10-06 |
Mechanisms and therapeutic potential of epithelial-immune crosstalk in airway inflammation
2025-Jul, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2025.2514604
PMID:40452271
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综述 | 本文综述了气道上皮细胞与免疫细胞在气道炎症中的相互作用机制及其治疗潜力 | 整合了单细胞测序技术的新发现与单克隆抗体靶向治疗的最新进展 | 气道炎症的复杂病理生理机制尚未完全阐明 | 探讨上皮-免疫细胞相互作用在气道炎症中的机制及治疗潜力 | 慢性气道炎症疾病（包括慢性鼻窦炎、过敏性鼻炎、哮喘、囊性纤维化和慢性阻塞性肺疾病） | NA | 气道炎症疾病 | 单细胞测序 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4194 | 2025-10-06 |
Unveiling the Immune Landscape: Single-Cell Sequencing of Infectious Mononucleosis Patients
2025-Jul, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70491
PMID:40673701
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研究论文 | 通过单细胞测序技术分析儿童传染性单核细胞增多症的免疫动态特征 | 首次在单细胞水平揭示EBV感染B细胞亚群的趋向性差异，发现RPMS1致癌调节因子在维持病毒潜伏期的作用，以及NK细胞亚群对EBV的差异化应答机制 | 研究样本仅限于儿科IM患者，未包含其他年龄段或EBV相关疾病对照 | 解析EBV与宿主免疫系统的相互作用机制 | 传染性单核细胞增多症患者的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 传染性单核细胞增多症 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 儿科IM患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4195 | 2025-10-06 |
Decoding Cellular Communication Networks and Signaling Pathways in Bone, Skeletal Muscle, and Bone-Muscle Crosstalk Through Spatial Transcriptomics
2025-Jun-12, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6701121/v1
PMID:40585205
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研究论文 | 通过空间转录组学技术解析骨骼和骨骼肌中的细胞通讯网络及信号通路 | 首次构建了骨骼和骨骼肌之间空间分辨的细胞通讯图谱，揭示了13个关键信号通路和特异性配体-受体对 | 仅使用小鼠模型进行研究，人类组织中的验证尚需进一步探索 | 研究骨骼和骨骼肌之间的细胞通讯网络和信号通路 | 小鼠股骨及相邻骨骼肌组织 | 空间转录组学 | 骨质疏松症，肌肉减少症，代谢综合征 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 小鼠骨骼肌肉组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组分析平台 |
| 4196 | 2025-10-06 |
Interpretable Trajectory Inference with Single Cell Linear Adaptive Negative-binomial Expression (scLANE) Testing
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.19.572477
PMID:38187622
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研究论文 | 提出了一种用于单细胞RNA-seq数据的可解释轨迹推断方法scLANE测试 | 使用可解释的广义线性模型处理基因表达非线性变化，通过经验选择的基样条和扩展到估计方程与混合模型支持复杂实验设计 | NA | 开发可解释的轨迹差异表达分析方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义线性模型,基样条 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4197 | 2025-10-06 |
Variational inference of single cell time series
2025-May-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610389
PMID:39257806
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研究论文 | 提出一种名为SNOW的深度学习算法，用于解析单细胞时间序列数据中的时间依赖性和时间独立性贡献 | 开发了能够同时处理时间和细胞身份影响的概率框架，能够构建有生物学意义的潜在空间、去除批次效应并生成真实的单细胞水平时间序列 | NA | 解决单细胞时间序列数据分析中细胞类型注释和细胞类型依赖性动态建模的挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4198 | 2025-10-06 |
Inferring gene regulatory networks by hypergraph generative model
2025-Apr-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101026
PMID:40220759
|
研究论文 | 提出一种基于超图变分自编码器的贝叶斯深度生成模型，用于单细胞RNA测序数据分析和基因调控网络推断 | 首次将超图表示学习与变分自编码器结合，通过结构方程模型和超图自注意力机制协同优化基因调控网络推断 | NA | 开发高效的单细胞RNA测序数据分析方法，准确推断基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据，基因调控网络，基因模块 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器(VAE)，超图神经网络，自注意力机制 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4199 | 2025-10-06 |
A cost- and time-efficient method for high-throughput cryoprocessing and tissue analysis using multiplexed tissue molds
2025-Apr-21, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101023
PMID:40262526
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研究论文 | 介绍一种用于高通量冷冻处理和组织分析的多重组织模具方法 | 开发了首个可实现冷冻处理多重化的商业协议和产品，能同时处理不同大小和来源的组织 | 未提及该方法在临床应用中的验证数据 | 开发更高效、经济的组织冷冻处理方法 | 小鼠组织和神经类器官 | 组织病理学 | NA | 冷冻切片、组织分析、空间转录组学 | NA | 组织切片、表达标记数据 | 19种不同成年小鼠组织，约110个不同年龄和大小的神经类器官 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4200 | 2025-10-06 |
CellCover Defines Marker Gene Panels Capturing Developmental Progression in Neocortical Neural Stem Cell Identity
2025-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.04.06.535943
PMID:37383947
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研究论文 | 提出CellCover方法用于从单细胞RNA测序数据中识别细胞类型特异性标记基因组合 | 将标记基因选择问题建模为组合优化中的最小集合覆盖问题，克服传统差异表达方法的局限性 | 方法依赖于二值化表达数据，可能损失部分连续表达信息 | 开发更有效的细胞类型标记基因识别方法 | 血液和脑组织中的细胞类型，特别是新皮质神经干细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 组合优化算法 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公共数据集（包含大量细胞） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |