单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 30469 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-08-06 |
Uncovering Plaque-Glia Niches in Human Alzheimer's Disease Brains Using Spatial Transcriptomics
2024-Sep-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.05.611566
PMID:39314329
|
研究论文 | 利用空间转录组学揭示人类阿尔茨海默病脑中斑块-胶质细胞微环境的相互作用 | 首次结合空间转录组学(ST)和免疫组化(IHC)技术，系统分析了Aβ斑块与周围胶质细胞在人类大脑中的相互作用及其对神经元损失和炎症的影响 | 研究样本量相对有限(21例个体)，且均为死后脑组织，可能无法完全反映活体状态下的动态变化 | 探究阿尔茨海默病中Aβ斑块与周围胶质细胞的相互作用及其病理机制 | 21例个体的78个死后脑切片中的258,987个ST位点 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学(ST), 免疫组化(IHC) | NA | 转录组数据, 图像数据 | 21例个体的78个脑切片(258,987个ST位点) |
| 402 | 2025-08-06 |
PoweREST: Statistical Power Estimation for Spatial Transcriptomics Experiments to Detect Differentially Expressed Genes Between Two Conditions
2024-Sep-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.30.610564
PMID:39257799
|
研究论文 | 介绍了一个名为PoweREST的统计功效估计工具，用于支持10X Genomics Visium数据中差异表达基因检测的功效计算 | 填补了空间转录组学研究中差异表达基因检测功效计算工具的空白，提供了实验前和初步数据收集后的功效估计功能 | 仅适用于10X Genomics Visium数据，未涵盖其他空间转录组学技术 | 开发一个工具来估计空间转录组学实验中检测差异表达基因的统计功效 | 空间转录组学数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | NA |
| 403 | 2025-08-06 |
Vagal TRPV1 + sensory neurons regulate myeloid cell dynamics and protect against influenza virus infection
2024-Aug-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.21.609013
PMID:39229208
|
研究论文 | 研究揭示了迷走神经TRPV1+感觉神经元通过调控髓系细胞动态和免疫病理反应，保护宿主免受流感病毒感染的机制 | 首次明确了迷走神经TRPV1+伤害性感受神经元在肺部抗病毒防御中的具体作用机制，特别是其对髓系细胞反应和免疫病理的调控作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探究迷走神经TRPV1+感觉神经元在流感病毒感染中的保护机制 | 小鼠模型中的迷走神经TRPV1+感觉神经元和髓系细胞 | 免疫学 | 流感 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | 小鼠感染模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 未明确说明具体数量的小鼠样本 |
| 404 | 2025-08-06 |
Respiratory viral infection promotes the awakening and outgrowth of dormant metastatic breast cancer cells in lungs
2024-Apr-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4210090/v1
PMID:38645169
|
research paper | 该研究揭示了呼吸道病毒感染如何促进休眠的转移性乳腺癌细胞在肺部的苏醒和生长 | 首次展示了流感病毒和SARS-CoV-2感染通过IL-6依赖机制促进乳腺癌休眠细胞苏醒和转移的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅为观察性研究，需要进一步验证 | 探究呼吸道病毒感染对乳腺癌转移休眠细胞苏醒的影响机制 | 乳腺癌转移休眠细胞(DCC)和呼吸道病毒(流感病毒、SARS-CoV-2) | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 小鼠模型 | 基因表达数据和临床观察数据 | 小鼠实验模型和人类观察性数据 |
| 405 | 2025-08-06 |
The Extracellular Niche and Tumor Microenvironment Enhance KRAS Inhibitor Efficacy in Pancreatic Cancer
2024-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-2504
PMID:38294344
|
研究论文 | 本研究评估了KRAS抑制剂MRTX1133在胰腺导管腺癌(PDAC)中的疗效，并探讨了肿瘤微环境对治疗效果的影响 | 发现ITGB1可作为增强MRTX1133疗效的靶点，并证明3D细胞培养和体内环境中MRTX1133效果更佳，揭示了KRAS抑制通过调节肿瘤微环境促进免疫反应的机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型，需要进一步临床试验验证 | 开发PDAC新的治疗干预措施 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞系、患者来源的异种移植模型和同基因模型 | 肿瘤治疗 | 胰腺癌 | CRISPR-Cas9功能缺失筛选、数字空间分析、单细胞测序、多光谱成像 | NA | 基因表达数据、影像数据 | 多株PDAC细胞系、患者来源的异种移植模型和同基因模型 |
| 406 | 2025-08-06 |
Osteosarcoma Cells Secrete CXCL14 That Activates Integrin α11β1 on Fibroblasts to Form a Lung Metastatic Niche
2024-04-01, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-23-1307
PMID:38295227
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了骨肉瘤细胞通过分泌CXCL14激活成纤维细胞上的整合素α11β1，促进肺转移微环境形成的机制 | 首次发现CXCL14-整合素α11β1轴在骨肉瘤肺转移中的关键作用，并证明靶向该轴可抑制转移 | 研究主要基于体外和动物模型，临床转化效果需进一步验证 | 探究骨肉瘤肺转移微环境的形成机制及潜在治疗靶点 | 骨肉瘤细胞、肺转移微环境中的成纤维细胞 | 肿瘤微环境 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 未明确说明样本量（使用治疗初治骨肉瘤样本） |
| 407 | 2025-08-06 |
Single-cell Transcriptomics Reveals Activation of Macrophages in All-trans Retinoic Acid (atRA)-induced Cleft Palate
2024 Jan-Feb 01, The Journal of craniofacial surgery
IF:1.0Q3
DOI:10.1097/SCS.0000000000009782
PMID:38049149
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了全反式维甲酸(atRA)诱导的腭裂中巨噬细胞的激活情况 | 首次在单细胞水平上描绘了atRA诱导腭裂的细胞图谱，揭示了骨髓细胞特别是M1样巨噬细胞和单核细胞的异常激活 | 研究仅基于小鼠模型，人类样本的验证尚未进行 | 探究atRA暴露对腭组织发育的影响及其与腭裂发生的关联 | 妊娠16.5天的小鼠腭组织 | 数字病理学 | 腭裂 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | atRA暴露组和正常组小鼠腭组织样本 |
| 408 | 2025-08-05 |
Single-cell eQTL Mapping Reveals Cell Subtype-specific Genetic Control and Mechanism in Malignant Transformation of Colorectal Cancer
2025-Aug-04, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1561
PMID:40029140
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组、空间转录组和snMultiomes技术，揭示了结直肠癌恶性转化过程中的细胞和分子变化及动态细胞间相互作用 | 创建了结直肠癌单细胞表达数量性状位点(sc-eQTL)图谱，发现76%以上的sc-eQTL具有细胞类型特异性，且基于sc-eQTL的多基因风险评分显著提高了结直肠癌风险预测能力 | NA | 探究结直肠癌恶性转化过程中的细胞亚型特异性遗传调控机制 | 142个多阶段样本中的751,531个单细胞转录组 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组、snMultiomes | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、snMultiomes数据 | 142个多阶段样本，751,531个单细胞 |
| 409 | 2025-08-05 |
CRISPR-based genetic tools for the study of host-microbe interactions
2025-Aug-04, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/iai.00510-24
PMID:40757822
|
综述 | 本文综述了基于CRISPR的遗传工具在宿主-微生物相互作用研究中的应用及其最新进展 | 利用CRISPR技术高效、精准、高通量地探索微生物组，并结合单细胞RNA测序等新兴技术研究宿主与微生物的复杂相互作用 | 当前CRISPR工具仍存在局限性，未来需要开发更先进的遗传工具包 | 研究宿主-微生物相互作用的遗传基础及其在健康和疾病中的作用 | 宿主细胞和微生物 | 基因编辑 | NA | CRISPR筛选、靶向基因组编辑、记录系统、单细胞RNA测序 | NA | 遗传数据 | NA |
| 410 | 2025-08-05 |
Unraveling Liver Cirrhosis: Bridging Pathophysiology to Innovative Therapeutics
2025-Aug-03, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.70037
PMID:40754005
|
综述 | 本文综述了肝硬化的病理生理学、系统性影响及创新治疗方法的最新进展 | 整合了单细胞转录组学和空间生物学的最新发现，探讨了肠道微生物组在肝硬化中的作用，并介绍了抗纤维化药物、衰老细胞清除剂及干细胞治疗等新型治疗策略 | 未提及具体临床研究样本量或治疗效果数据 | 探讨肝硬化的病理机制与创新治疗方法的联系 | 肝硬化及其相关病理过程 | 医学研究 | 肝硬化 | 单细胞转录组学、空间生物学、弹性成像技术、液体活检 | NA | NA | NA |
| 411 | 2025-08-05 |
Revealing the core immunotoxicity of di-n-pentyl phthalate exposure in murine models using single-cell RNA sequencing
2025-Aug-02, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118754
PMID:40753775
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示邻苯二甲酸二正戊酯（DNPP）在小鼠模型中的核心免疫毒性 | 首次使用单细胞RNA测序技术全面评估DNPP对免疫系统的毒性作用，揭示了DNPP对多种免疫细胞功能的影响 | 研究仅基于小鼠模型，结果可能需要进一步在人体中验证 | 系统评估DNPP对免疫系统的影响 | 小鼠脾脏组织和外周血白细胞 | 免疫毒理学 | 免疫相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠模型 | RNA测序数据 | 不同剂量DNPP处理的小鼠脾脏组织 |
| 412 | 2025-08-05 |
Single cell RNA-sequencing reveals BHLHE40 and NDRG1 as key regulatory molecules modulating the trophoblastic senescence in preeclampsia
2025-Aug, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.06.009
PMID:40517485
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示BHLHE40和NDRG1作为调节子痫前期滋养细胞衰老的关键调控分子 | 首次通过整合生物信息学分析和实验验证，揭示了BHLHE40和NDRG1在子痫前期滋养细胞衰老中的关键调控作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，体内功能验证和临床转化仍需进一步研究 | 探索子痫前期滋养细胞衰老的分子机制和关键调控靶点 | 子痫前期患者的胎盘组织和LPS诱导的子痫前期大鼠模型 | 生物信息学 | 子痫前期 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), ChIP检测, 批量转录组测序 | WGCNA, nomogram模型 | RNA测序数据 | 来自GEO数据库的多个数据集(GSE173193, GSE24129, GSE75010)以及人类PE胎盘和LPS诱导的PE大鼠模型 |
| 413 | 2025-08-05 |
Single-Cell Omics Analysis Reveals Immunological Dysregulation in COVID-19 and HIV: Identifying a Shared Abnormality of B Cell Activation via the Unfolded Protein Response and Diagnostic Biomarkers Using Machine Learning Algorithms
2025-Aug, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70538
PMID:40757697
|
研究论文 | 通过单细胞组学分析揭示COVID-19和HIV的免疫失调，发现B细胞通过未折叠蛋白反应异常激活的共同机制，并利用机器学习算法开发诊断生物标志物 | 首次在单细胞水平上揭示了COVID-19和HIV感染之间的相互作用，并发现B细胞中未折叠蛋白反应通路的异常激活是两种疾病的共同发病机制 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平验证 | 探究COVID-19和HIV共同感染的分子机制 | COVID-19和HIV感染患者的外周血细胞亚群 | 生物信息学 | COVID-19, HIV | 单细胞转录组测序 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 大量批量转录组数据集验证 |
| 414 | 2025-08-05 |
Preliminary Study on GZMA- and GSDMB-Associated Pyroptosis and CD8+ T Cell-Mediated Immune Evasion in Skin Cutaneous Melanoma
2025-Jul-31, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
|
研究论文 | 本研究探讨了GZMA和GSDMB相关的细胞焦亡及CD8+ T细胞介导的免疫逃逸在皮肤黑色素瘤中的作用 | 首次基于单细胞和批量RNA-seq数据，结合细胞焦亡特征，揭示了GZMA和GSDMB在皮肤黑色素瘤中的表达模式及其与预后的关系 | 未发现显著的细胞焦亡相关差异表达基因，且细胞焦亡通路在肿瘤组未被激活 | 揭示皮肤黑色素瘤基于细胞焦亡特征的潜在发病机制 | 皮肤黑色素瘤(SKCM)患者 | 肿瘤免疫学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 批量RNA测序, qRT-PCR, CCK-8, 伤口愈合实验, Transwell实验 | NA | RNA-seq数据, 临床信息 | 来自TCGA和GEO数据库的SKCM患者数据 |
| 415 | 2025-08-05 |
Traditional medicine Kuanxiong Aerosol alleviates atherosclerotic plaque inflammation by mitigating CX3CR1+ macrophage apoptosis via the cGAS-STING pathway
2025-Jul-30, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157120
PMID:40753933
|
research paper | 研究探讨传统中药宽胸气雾剂通过cGAS-STING通路减轻动脉粥样硬化斑块炎症的机制 | 首次阐明宽胸气雾剂对巨噬细胞亚群的调控作用及其抗凋亡功能 | 研究主要基于ApoE-/-小鼠模型，人类样本验证不足 | 探索宽胸气雾剂治疗动脉粥样硬化的潜力及机制 | ApoE-/-小鼠及CX3CR1+巨噬细胞亚群 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | UHPLC-HRMS、单细胞RNA测序、生物信息学分析、分子对接 | ApoE-/-小鼠动脉粥样硬化模型 | 基因表达数据、组织学数据 | 未明确提及具体样本量，使用ApoE-/-小鼠模型 |
| 416 | 2025-08-05 |
Analyses of Nogo-Family Genes in Mouse and Human Microglia Omics Datasets Identify LINGO1 as a Candidate Drug Target in Alzheimer's Disease
2025-Jul-30, Current neuropharmacology
IF:4.8Q1
|
研究论文 | 本研究通过分析小鼠和人类小胶质细胞组学数据集，探讨了Nogo家族基因的表达模式，并发现LINGO1作为阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 首次在小鼠和人类小胶质细胞中全面分析Nogo家族基因的表达模式，并发现LINGO1在人类AD小胶质细胞中的高度富集 | 研究主要依赖公开数据集，可能受到数据质量和样本量的限制 | 探索Nogo信号系统在小胶质细胞中的功能及其在阿尔茨海默病中的作用 | 小鼠和人类小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | RNA-seq, RiboTag翻译分析, 单细胞测序 | NA | 组学数据 | 21个人类脑细胞单细胞测序数据集 |
| 417 | 2025-08-05 |
Single-Cell Transcriptomics: Technical Advances, Applications and Challenges in Cancer Drug Discovery
2025-Jul-30, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
|
综述 | 本文全面概述了单细胞RNA测序技术的基本流程、发展轨迹及其在癌症药物发现中的应用，并探讨了该技术面临的挑战和未来方向 | 单细胞RNA测序技术为癌症药物发现提供了高分辨率的基因表达分析，能够深入理解肿瘤异质性并识别潜在药物靶点 | 文章讨论了单细胞RNA测序技术面临的挑战，但未具体说明技术限制或样本量不足等问题 | 增强读者对单细胞测序的理解，启发肿瘤药物开发的新思路，支持临床研究的转化应用 | 单细胞RNA测序技术在癌症药物发现中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 418 | 2025-08-05 |
NNMT inhibition in cancer-associated fibroblasts restores antitumour immunity
2025-Jul-23, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09303-5
PMID:40702186
|
研究论文 | 本文探讨了NNMT在高级别浆液性卵巢癌中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 发现NNMT通过诱导H3K27me3低甲基化驱动CAFs分泌补体，吸引免疫抑制性MDSCs，并开发了特异性NNMT抑制剂以恢复抗肿瘤免疫 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 研究NNMT在肿瘤微环境中的免疫调节作用及其作为治疗靶点的潜力 | 高级别浆液性卵巢癌、乳腺癌和结肠癌的癌症相关成纤维细胞(CAFs)和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 卵巢癌、乳腺癌、结肠癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、高通量筛选 | 小鼠肿瘤模型 | RNA测序数据、免疫组化数据 | 多种小鼠癌症模型 |
| 419 | 2025-08-05 |
Renin Cells Drive Kidney Neurovascular Development and Arterial Remodeling when Renin Activity is Deficient
2025-Jul-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.08.663706
PMID:40672316
|
研究论文 | 该研究通过新型超亮肾素细胞特异性tdTomato报告小鼠、高分辨率3D成像和单细胞RNA测序技术，揭示了肾素细胞在肾脏神经血管发育和动脉重塑中的作用 | 使用新型超亮肾素细胞特异性tdTomato报告小鼠和高分辨率3D成像技术，首次详细描绘了肾素细胞与神经纤维及周围细胞的相互作用 | 研究依赖于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 探索肾素细胞在肾脏神经血管发育和动脉重塑中的功能 | 肾素细胞及其与周围神经纤维和细胞的相互作用 | 细胞生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA-Seq, 高分辨率3D成像 | tdTomato报告小鼠 | 图像, 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 420 | 2025-08-05 |
Comparative ScRNA-Seq Profiling of Antigen-Specific CD4+ T cells in Semi-Allogeneic Transplantation and Pregnancy Reveals Intersecting Signatures of Rejection and Tolerance
2025-Jul-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.06.663404
PMID:40672265
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序比较半同种异体移植和妊娠中抗原特异性CD4+ T细胞的转录状态，揭示排斥和耐受的交叉特征 | 首次在移植和妊娠模型中系统比较了抗原特异性CD4+ T细胞的转录状态，发现了排斥和成功妊娠中激活的滤泡和非滤泡效应表型的显著重叠 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证有限 | 探索移植和妊娠免疫中抗原特异性CD4+ T细胞的转录状态差异 | 抗原特异性CD4+ T细胞（包括常规T细胞和调节性T细胞） | 免疫学 | 移植排斥/妊娠免疫 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型（包括初次妊娠、父系皮肤致敏妊娠模型、同种异体心脏移植模型）及部分人类数据集 |