单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32645 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-11-13 |
MCUB Inhibits PRKN-Dependent Mitophagic Degradation of PD-L1 to Promote Immune Evasion in Bladder Cancer
2025-Nov-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514764
PMID:41221601
|
研究论文 | 本研究揭示了MCUB通过抑制PRKN依赖性线粒体自噬来稳定PD-L1蛋白，从而促进膀胱癌免疫逃逸的新机制 | 首次发现MCUB-PRKN-PD-L1轴在膀胱癌免疫逃逸中的关键作用，并提出靶向MCUB-PRKN相互作用可作为精准治疗策略 | NA | 探讨MCUB在肌层浸润性膀胱癌免疫逃逸中的作用机制 | 肌层浸润性膀胱癌组织和细胞 | 癌症免疫学 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学分析, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 402 | 2025-11-13 |
Single-Cell Transcriptome Atlas Reveals the Underlying Mechanism of Kynurenic Acid in the Regulation of Tumor Immune Microenvironment in Glioblastoma
2025-Nov-12, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202507705
PMID:41221633
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组图谱揭示了犬尿酸在胶质母细胞瘤中调节肿瘤免疫微环境的潜在机制 | 首次系统阐明犬尿酸通过重塑髓系免疫抑制细胞和逆转T细胞耗竭来增强抗肿瘤免疫反应的作用机制 | 研究主要依赖小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；T细胞缺陷模型虽证实适应性免疫的必要性，但具体机制细节仍需深入探索 | 探究犬尿酸在胶质母细胞瘤免疫微环境调节中的功能机制 | 胶质母细胞瘤组织样本和原位移植小鼠模型 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,飞行时间质谱流式细胞术,蛋白质组学,流式细胞术,靶向代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据,代谢组数据,流式细胞数据 | 临床队列组织样本和原位GBM小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术,蛋白质组学,代谢组学 | NA | NA |
| 403 | 2025-11-13 |
Bronchial Epithelial Transcriptome Reveals Dysregulated Interferon and InflammatoryResponses to Rhinovirus in Exacerbation-Prone Pediatric Asthma
2025-Nov-11, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197711
PMID:41217821
|
研究论文 | 本研究通过支气管上皮转录组分析揭示了易急性加重儿科哮喘患者对鼻病毒的干扰素和炎症反应失调机制 | 首次在器官型支气管上皮培养模型中结合bulk和单细胞转录组学，揭示了易急性加重哮喘儿童存在基线干扰素活性降低的致病机制 | 研究样本量有限，且为体外培养模型，需在更大队列和体内模型中验证 | 阐明鼻病毒诱发哮喘急性加重的宿主易感因素和分子机制 | 哮喘儿童和健康儿童的器官型支气管上皮细胞培养物 | 单细胞组学 | 哮喘 | bulk转录组测序, 单细胞转录组测序, 靶向蛋白分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据 | 特征明确的哮喘儿童和健康儿童的支气管上皮样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 404 | 2025-11-13 |
The cervicovaginal microbiome associates with spatially restricted host transcriptional signatures throughout the human ectocervical epithelium and submucosa
2025-Nov-11, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013677
PMID:41218071
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了宫颈阴道微生物组与人类宫颈上皮和黏膜下区域空间特异性宿主转录特征之间的关联 | 首次使用空间转录组学技术系统揭示微生物组在整个宫颈黏膜组织中的空间转录影响，突破了传统认为微生物定植仅限于腔面表层的认知 | 样本量相对较小（n=21），且研究对象仅限于肯尼亚女性性工作者群体 | 探究宫颈阴道微生物组对宫颈组织转录景观的影响及其与HIV易感性的潜在关联 | 肯尼亚女性性工作者的宫颈组织样本 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学 | 加权基因共表达分析 | 空间转录组数据 | 21例宫颈组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 405 | 2025-11-13 |
High-Resolution Multiplexed Sequencing of Single-Cell Full-length Transcriptome Via Combinational Barcoded Tn5 Transposon Insertion
2025-Nov-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202516013
PMID:41218139
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CBTi-seq的新型单细胞全长转录组测序技术，通过组合条形码Tn5转座子插入实现高分辨率多重测序 | 利用Tn5转座酶介导的组合条形码和UMI分子组装，实现单细胞全长转录组的高分辨率测序，正交组合条形码设计在减少DNA条形码多样性的同时增强多重检测灵活性 | NA | 开发一种能够在单细胞水平实现全长转录组高分辨率测序的新方法 | 基因编辑细胞和人类睾丸细胞 | 单细胞测序技术 | 生殖发育疾病 | 单细胞全长转录组测序，组合条形码Tn5转座子插入测序 | NA | 单细胞转录组数据，空间分辨组织微环境数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | CBTi-seq | 组合条形码Tn5转座子插入测序技术，兼容单细胞和空间分辨组织微环境分析 |
| 406 | 2025-11-13 |
FAM135B Deficiency Inhibits Cytotoxic T-Cell Activity in Triple-negative Breast Cancer by Blocking the IFI16-dependent STING Pathway
2025-Nov-11, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0310
PMID:41218197
|
研究论文 | 本研究揭示FAM135B通过调控IFI16依赖性STING通路激活细胞毒性T细胞，影响三阴性乳腺癌免疫治疗疗效 | 首次发现FAM135B作为抗肿瘤免疫调节因子，通过竞争性阻断TRIM21介导的IFI16泛素化降解来激活STING通路 | NA | 探究三阴性乳腺癌免疫检查点阻断治疗反应差异的分子机制 | 三阴性乳腺癌患者样本和免疫细胞 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞测序，功能实验 | NA | 单细胞测序数据，分子相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 407 | 2025-11-13 |
Multimodal learning enables chat-based exploration of single-cell data
2025-Nov-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02857-9
PMID:41219484
|
研究论文 | 开发了名为CellWhisperer的人工智能模型和软件工具，用于通过自然语言对话探索单细胞数据 | 建立了转录组与其文本注释的多模态嵌入，通过对比学习连接基因表达与文本描述，实现自然语言交互式探索单细胞数据 | NA | 解决单细胞测序数据解释的挑战，实现交互式单细胞数据探索 | 单细胞RNA测序数据和文本注释 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序，对比学习 | 多模态嵌入模型，大语言模型 | 基因表达数据，文本数据 | 100万个RNA测序图谱 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 408 | 2025-11-13 |
APOE4 to APOE2 allelic switching in mice improves Alzheimer's disease-related metabolic signatures, neuropathology and cognition
2025-Nov-11, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02094-y
PMID:41219507
|
研究论文 | 本研究开发了一种可诱导的APOE等位基因转换小鼠模型，证明从APOE4转换为APOE2可改善阿尔茨海默病相关代谢特征、神经病理学和认知功能 | 开发了首个可诱导的APOE等位基因转换小鼠模型(APOE4s2)，实现了从风险等位基因向保护性等位基因的短期转换 | 研究基于小鼠模型，人类临床应用效果需进一步验证 | 探究APOE等位基因转换对阿尔茨海默病病理和认知功能的影响 | APOE4s2基因转换小鼠模型，5xFAD阿尔茨海默病模型小鼠 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 基因敲入模型，单细胞转录组分析，蛋白质组学，脂质组学 | 基因编辑小鼠模型 | 基因表达数据，蛋白质组数据，脂质组数据，行为学数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 409 | 2025-11-13 |
Single-cell profiling reveals three endothelial-to-hematopoietic transitions with divergent isoform expression landscapes
2025-Nov-11, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00740-z
PMID:41219569
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了造血内皮细胞中三种不同的内皮-造血转化轨迹及其异构体表达差异 | 首次在卵黄囊和AGM区域识别出三种不同的造血内皮细胞亚群，并发现AGM区域造血内皮细胞具有更高的异构体复杂性 | 研究主要基于转录组数据，功能验证相对有限 | 探究造血内皮细胞向不同造血祖细胞分化的分子机制 | 小鼠胚胎卵黄囊和主动脉-性腺-中肾区域的造血内皮细胞 | 单细胞组学 | 造血发育 | 全长单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 卵黄囊和AGM区域的造血内皮细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 410 | 2025-11-13 |
Leveraging optimized oligonucleotide-tagged antigen assemblies and single-cell sequencing for multiplexed proteogenomic profiling of human B cell reactivities
2025-Nov-11, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf301
PMID:41220068
|
研究论文 | 开发基于寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的多重蛋白质基因组分析方法，用于分析人类B细胞反应性 | 建立结合寡核苷酸标记抗原组装和单细胞测序的新工作流程，实现并行分析不同抗原特异性B细胞 | 需要优化抗原与链霉亲和素比例，稀有细胞检测灵敏度仍需提高 | 开发多重蛋白质基因组分析方法以解析B细胞对抗原的反应性 | 人类B细胞，特别是外周血中的稀有抗原特异性B细胞 | 单细胞多组学 | 传染病（SARS-CoV-2、登革热） | 单细胞测序，流式细胞术，寡核苷酸标记 | NA | 单细胞多组学数据 | 人类外周血样本 | NA | 单细胞测序，流式细胞术 | NA | 寡核苷酸标记抗原组装与荧光标记抗原组装的双重标记方法 |
| 411 | 2025-11-13 |
Magrolimab (Hu5F9-G4) promotes macrophage M1 polarization and is associated with enhanced autophagy in colorectal cancer
2025-Nov-10, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102598
PMID:41218551
|
研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞免疫检查点抑制剂Hu5F9-G4通过促进M2d向M1极化、抑制结直肠癌进展及调节自噬途径的潜在治疗机制 | 首次揭示Hu5F9-G4通过促进巨噬细胞M1极化和增强自噬抑制结直肠癌进展，并鉴定CDKN1A和MAP1LC3B为自噬相关治疗靶点 | 样本量有限（73例CRC样本），需进一步临床验证 | 研究巨噬细胞免疫检查点抑制剂对结直肠癌免疫微环境的影响及治疗靶点 | 结直肠癌样本、体外培养细胞、荷瘤小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组分析、生物信息学分析、体外实验、体内实验 | NA | 转录组数据、临床数据、实验数据 | 73例CRC样本及动物模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 412 | 2025-11-13 |
Single-cell deconstruction of medulloblastoma microenvironment elucidates subtype-specific immune architectures and prognostic molecular signatures
2025-Nov-08, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218126
PMID:41213462
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术系统解析髓母细胞瘤微环境的亚型特异性免疫结构特征 | 首次构建髓母细胞瘤亚型特异性肿瘤微环境综合图谱，发现11个功能不同的肿瘤相关巨噬细胞亚群及其分化轨迹 | 样本量相对有限(38例)，需要更大规模验证 | 阐明髓母细胞瘤亚型特异性肿瘤微环境特征及其与预后的关系 | 38例髓母细胞瘤标本 | 单细胞测序分析 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, 伪时间轨迹分析, CellChat分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 批量转录组数据 | 38例髓母细胞瘤标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 413 | 2025-11-13 |
Identification of mitochondria-related hub genes and immune associations in acute myocardial infarction: A bioinformatic analysis
2025-Nov-07, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045611
PMID:41204556
|
研究论文 | 通过生物信息学分析识别急性心肌梗死中线粒体相关枢纽基因及其与免疫系统的关联 | 首次系统性地识别了5个与线粒体相关的AMI诊断枢纽基因，并揭示了这些基因与免疫细胞的关联机制 | 这是一项探索性研究，需要严格的外部验证才能考虑临床应用 | 探索急性心肌梗死中线粒体代谢与免疫反应的相互作用机制 | 急性心肌梗死患者的基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 差异表达分析、富集分析、加权基因共表达网络分析、机器学习、单细胞测序、实时定量PCR | 机器学习、列线图模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 414 | 2025-11-13 |
Multiplexed RNA imaging and in situ profiling in living cells
2025-Nov-06, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc06220a
PMID:41210282
|
综述 | 本文重点讨论活细胞多重RNA成像技术的最新进展及其与固定细胞空间转录组学方法的比较 | 开发了能够在活细胞中进行多重RNA成像的先进荧光探针技术，实现RNA定位、相互作用和浓度变化的实时监测 | 传统空间转录组学方法需要细胞固定和透化，只能提供静态快照 | 探索时空RNA分析技术，追踪RNA动态变化并揭示多种RNA物种间的时间关系 | 活细胞中的RNA分子 | 空间转录组学 | NA | 多重RNA成像，荧光原位杂交，空间转录组学 | NA | RNA图像，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA分析，多重成像 | NA | NA |
| 415 | 2025-11-13 |
Molecular, metabolic, and histological subtypes of pancreatic ductal adenocarcinoma and its tumor microenvironment: Insights into tumor heterogeneity and clinical implications
2025-Nov-01, Pharmacology & therapeutics
IF:12.0Q1
DOI:10.1016/j.pharmthera.2025.108946
PMID:41183744
|
综述 | 本文综述了胰腺导管腺癌的分子、代谢和组织学亚型分类方法及其临床意义 | 整合单细胞转录组学、空间转录组学、代谢组学和深度学习技术，揭示PDAC的肿瘤异质性和亚型可塑性 | NA | 提供PDAC亚型异质性的全面概述，指导亚型导向的治疗策略 | 胰腺导管腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 代谢组学, 深度学习 | 深度学习 | 转录组数据, 代谢组数据, 组织病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2025-11-13 |
Stress-NRF2 response axis polarizes tumor macrophages and undermines immunotherapy
2025-Oct-31, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013063
PMID:41176316
|
研究论文 | 本研究揭示了NRF2转录因子在肿瘤相关巨噬细胞极化为免疫抑制状态中的关键作用及其对免疫疗法的负面影响 | 首次发现NRF2激活梯度将肿瘤相关巨噬细胞分为促炎CXCL9+和抗炎SPP1+亚群，并证明其通过沉默IFN-STAT1通路导致免疫抑制 | 研究主要基于小鼠模型，人类癌症中的验证仍需进一步临床研究 | 探索NRF2在肿瘤相关巨噬细胞极化中的作用及其对免疫疗法疗效的影响 | 肿瘤相关巨噬细胞、MC38结肠肿瘤模型、MMTV-PyMT乳腺肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 结肠癌、乳腺癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、三维细胞培养、体内肿瘤模型 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 多种小鼠肿瘤模型及人类癌症样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 417 | 2025-11-13 |
Clonally expanded effector CD4+ cytotoxic T lymphocytes are associated with severe neurological adverse events after immune checkpoint inhibitor therapy
2025-Oct-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012350
PMID:41167637
|
研究论文 | 本研究通过单细胞基因组学分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗后神经系统不良事件与克隆扩增的CD4+细胞毒性T淋巴细胞之间的关联 | 首次在单细胞水平上揭示了n-irAEs患者体内存在特异性克隆扩增的CD4+CTLs，并发现其表达与神经炎症相关的效应基因谱 | 样本量较小（仅17例患者），且仅分析了外周血细胞而未直接研究中枢神经系统 | 探究免疫检查点抑制剂治疗诱发神经系统不良事件的免疫学机制和风险因素 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者，包括8例急性神经毒性患者 | 单细胞基因组学 | 癌症治疗相关神经系统并发症 | 单细胞RNA测序，T细胞受体谱分析 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据，TCR序列数据 | 17例癌症患者（8例n-irAEs患者），共186,435个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 418 | 2025-11-13 |
Exhausted KLRG1hi CD8+ T and pathogenic GZMA+ Th17 cells are associated with the mild Mycoplasma pneumoniae pneumonia in children
2025-Oct-30, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2025.106642
PMID:41173398
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和高维流式细胞术分析儿童轻度肺炎支原体肺炎中T细胞和B淋巴细胞的功能障碍 | 首次在MPP患儿中结合scRNA-seq和高维流式细胞术系统描绘T细胞和B淋巴细胞的功能障碍景观 | 研究仅针对轻度MPP患者，未涉及重症病例；样本量有限 | 探究适应性免疫在儿童轻度肺炎支原体肺炎免疫逃逸和免疫发病机制中的作用 | 儿童轻度肺炎支原体肺炎患者的外周T细胞和B淋巴细胞 | 单细胞组学 | 肺炎支原体肺炎 | 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 | 未明确样本数量，仅说明为住院的MP单一感染儿科患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 419 | 2025-11-13 |
Bi-specific T cell-engaging antibody triggers protective immune memory and glioma microenvironment remodeling in immune-competent preclinical models
2025-Oct-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011714
PMID:41151835
|
研究论文 | 本研究在免疫健全的临床前模型中评估双特异性T细胞衔接抗体对胶质母细胞瘤的治疗机制 | 首次在免疫健全的动物模型中系统研究BTEs的作用机制，揭示其诱导免疫记忆和重塑肿瘤微环境的能力 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探究双特异性T细胞衔接抗体在胶质母细胞瘤治疗中的作用机制 | 表达IL13RA2的胶质母细胞瘤细胞和鼠源T细胞 | 免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序、多重免疫荧光、多参数MRI | 原位移植模型和基因工程小鼠模型 | 基因表达数据、影像数据、细胞表型数据 | 多个临床前胶质母细胞瘤模型的小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 420 | 2025-11-13 |
Application of CTC-derived spheroid for drug screening toward personalized treatment in patients with breast cancer
2025-Oct-27, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102573
PMID:41151488
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于循环肿瘤细胞(CTC)的球体培养药物筛选平台，用于乳腺癌个性化治疗 | 首次将CTC计数、CTC来源球体药物筛选与激素受体表达和基因组突变谱整合，克服了组织依赖性类器官模型的局限性 | 样本量相对较小(34例初诊患者，13例进行药物筛选)，需要更大规模验证 | 建立临床可行的CTC来源球体药物筛选工作流程，实现乳腺癌个性化治疗 | 34例新诊断乳腺癌患者，其中13例接受系统治疗和复发的患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 微流控技术、空间转录组学、药物筛选 | CTC来源球体模型 | 细胞计数、基因表达、突变谱、药物敏感性 | 34例乳腺癌患者，13例进行CTC球体药物筛选 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium in situ | Xenium原位分析平台 |