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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-04-30 |
Inhibiting KDM6A Phosphorylation Suppresses Glycolysis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2026-Mar, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70142
PMID:41251278
|
研究论文 | 揭示KDM6A磷酸化在口腔鳞状细胞癌中调控糖酵解的机制 | 首次发现KDM6A Ser829位点磷酸化可作为E3泛素连接酶FBXW7的底物,并利用条件性敲入小鼠模型结合单细胞RNA测序阐明其对糖酵解的调控作用 | 未提及,但一般可能包括:机制验证仅在小鼠模型中进行,未在人类样本中确认;4NQO诱导的OSCC模型可能不能完全模拟人类疾病 | 探究KDM6A翻译后修饰在口腔鳞状细胞癌糖酵解调控中的作用 | KDM6A蛋白、FBXW7泛素连接酶、小鼠舌组织及口腔鳞状细胞癌细胞 | 分子生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | Co-IP(免疫共沉淀)、免疫印迹、条件性基因敲入、单细胞RNA测序、4NQO诱导OSCC模型、免疫荧光成像 | NA | 测序数据(scRNA-Seq)、免疫荧光图像 | Kdm6a S829A条件性敲入小鼠(多个)及野生型对照小鼠;具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 402 | 2026-03-31 |
Single-cell RNA sequencing-guided drug discovery to alleviate radiotherapy-induced esophageal toxicity
2026-Mar, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.12.038
PMID:41909731
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2026-04-30 |
Benchmarking cell-type-specific spatially variable gene detection methods
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag190
PMID:42041225
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研究论文 | 系统评估了六种最新的细胞类型特异性空间可变基因检测方法的性能,包括一致性、预测性能、旋转鲁棒性、可扩展性和生物学可解释性 | 首次全面比较多种ctSVG检测方法,涵盖46个真实数据集和大量模拟数据集,揭示了方法间的互补性和性能差异 | 旋转不变性问题仍需进一步研究,Celina方法易受非目标细胞类型影响产生假信号 | 评估和比较细胞类型特异性空间可变基因检测方法,为工具选择和算法开发提供指导 | 六种ctSVG检测方法(STANCE、Celina、C-SIDE、spVC、ctSVG、CTSV) | 数字病理学 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据 | 46个真实数据集及多种模拟数据集 | 不适用 | 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 404 | 2026-04-30 |
mosna Reveals Different Types of Cellular Interactions Predictive of Response to Immunotherapies and Survival in Cancer
2026-Feb-26, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2026.101536
PMID:41759628
|
研究论文 | 开发了mosna,一个用于分析空间组学数据并与临床或生物数据整合的Python包,能揭示与免疫疗法响应和癌症生存相关的不同类型的细胞相互作用 | mosna兼容所有空间组学技术,整合了临床数据并构建了多步骤分析流程,能够在不同条件下(如临床治疗反应或生存数据)训练机器学习模型并识别最具预测力的变量 | 尚未明确说明,但可能依赖手动注释的数据集来验证生态位发现方法 | 提供一种易于使用的空间组学数据分析工具,整合临床数据以识别与免疫疗法响应和癌症生存相关的细胞相互作用模式 | 细胞相互作用模式及组织结构,特别是与免疫疗法响应或生存相关的特征 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | 机器学习模型 | 空间组学数据(包括亚细胞分辨率转录组学、蛋白质组学和基于点的空间转录组学) | 两个空间蛋白质组学数据集和一个空间转录组学数据集,另有一个手动注释的空间转录组学数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | 10x Visium、MERFISH、seqFISH、Xenium、CODEX、MIBI-TOF、Slide-seq、Stereo-seq | 10x Visium、MERFISH、seqFISH、Xenium、CODEX、MIBI-TOF、低多重免疫荧光、Slide-seq、Stereo-seq |
| 405 | 2026-04-30 |
Longitudinal in vivo human wound healing model defines key role for smooth muscle cells in ECM remodeling
2026-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.24.707845
PMID:42051305
|
研究论文 | 通过纵向体内人体伤口愈合模型,定义平滑肌细胞在细胞外基质重塑中的关键作用 | 首次利用纵向体内人体数据,结合单细胞和空间转录组学,揭示血管平滑肌细胞在伤口愈合重塑阶段的主导作用,并鉴定TIMP1作为关键调控因子 | 未提及具体局限性 | 明确血管平滑肌细胞在人体伤口愈合中的调控机制,特别是与细胞外基质重塑相关的信号活动 | 健康志愿者的皮肤伤口组织以及糖尿病足溃疡患者的非愈合伤口组织 | 数字病理学, 机器学习 | 伤口愈合, 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据 | 健康志愿者(具体数量未提及),糖尿病足溃疡患者(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 406 | 2026-04-30 |
ADT-030, a novel PDE10 inhibitor, demonstrates potent antitumor activity in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Feb-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.11.705411
PMID:41726934
|
研究论文 | 研究了新型PDE10抑制剂ADT-030在胰腺导管腺癌中的抗肿瘤活性及其机制 | 首次发现PDE10抑制剂ADT-030能有效抑制KRAS突变PDAC细胞增殖并通过诱导G2/M期阻滞和凋亡发挥抗肿瘤作用,且对KRAS抑制剂耐药细胞也有活性 | 未提及具体局限性 | 评估新型PDE10抑制剂ADT-030在胰腺导管腺癌中的治疗潜力 | KRAS突变胰腺导管腺癌细胞系及动物模型 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含同源移植和患者来源异种移植模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序分析肿瘤微环境重编程 |
| 407 | 2026-04-30 |
The glia-immune network: Astrocytes and oligodendrocytes as microglial co-ordinators in health and disease
2026-02, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287015
PMID:40492604
|
综述 | 探讨星形胶质细胞和少突胶质细胞作为小胶质细胞协调者在健康和疾病中构成的胶质细胞免疫网络 | 提出大胶质细胞(星形胶质细胞、少突胶质细胞)应被视为中枢神经系统免疫系统的主动组分,形成胶质细胞特异性的免疫样网络,并协调多种中枢神经系统效应 | 基于现有文献综述,缺乏直接实验验证,且主要聚焦于阿尔茨海默病,对其他神经病理学适用性尚未充分探讨 | 综述大胶质细胞来源的免疫信号及其在健康和疾病中的相关性,特别是在阿尔茨海默病病理中的分子对话 | 大胶质细胞(星形胶质细胞和少突胶质细胞)以及小胶质细胞 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 用于分析健康和疾病状态下细胞谱系的单细胞转录组学技术 |
| 408 | 2026-02-26 |
Single-cell RNA sequencing reveals disease associated changes in brain endothelial cells in the 5XFAD mouse
2026-Jan-30, Fluids and barriers of the CNS
IF:5.9Q1
DOI:10.1186/s12987-026-00766-w
PMID:41618410
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2026-04-30 |
Differential Hes1 activation defines neural stem cell lineage commitment and niche maintenance in embryonic and adult mouse cortex
2026-Jan-27, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2511800123
PMID:41557790
|
research paper | 利用单细胞转录组学和条件敲除小鼠模型,研究Hes1差异激活在胚胎和成年小鼠皮层神经干细胞谱系特化及生态位维持中的作用 | 首次区分了Notch非依赖性表达Hes1的神经干细胞与Notch依赖性表达的放射状胶质细胞,并证明了NIHes1神经干细胞是产生其他神经前体细胞的祖先前体细胞 | 未明确提及具体限制 | 阐明Hes1差异激活在神经干细胞谱系特化和生态位维持中的功能和机制 | 小鼠胚胎和成年皮层神经干细胞/祖细胞 | machine learning | NA | 单细胞转录组学, 条件敲除小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 胚胎和成年小鼠皮层样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2026-04-30 |
EGFR-mutant transformed small cell lung cancer harbors intratumoral heterogeneity targetable with MEK inhibitor combination therapy
2026-Jan-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.197008
PMID:41574603
|
研究论文 | 通过对EGFR突变小细胞肺癌转化患者的恶性胸腔积液进行单细胞RNA测序,发现肿瘤内存在可被MEK抑制剂联合疗法靶向的异质性 | 首次揭示EGFR突变小细胞肺癌由不同细胞状态混合组成,并发现非NE细胞对MEK抑制剂具有选择性敏感性,为靶向肿瘤异质性提供了新治疗策略 | 仅基于少量患者的胸水样本,需要更大样本量和更多模型验证;EZH2调控EGFR表达的机制及临床转化潜力需进一步研究 | 探究EGFR突变小细胞肺癌转化中的肿瘤异质性及其治疗靶点 | EGFR突变小细胞肺癌转化患者的恶性胸腔积液及患者来源细胞系 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 多例EGFR突变小细胞肺癌转化患者的恶性胸腔积液样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 411 | 2026-04-30 |
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191990
PMID:41480746
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析甲状腺癌进展,识别出预后相关的成纤维细胞亚群 | 首次整合单细胞与空间转录组学,在儿童与成人混合样本中揭示甲状腺癌进展的空间图谱,并鉴定出与预后不良相关的POSTN+肌成纤维细胞癌相关成纤维细胞亚群 | 未明确提及,可能包括样本量限制或功能验证不足 | 解析甲状腺癌在儿童与成人中的演化机制,并识别具有预后价值的细胞亚群 | 甲状腺癌样本(包括分化型甲状腺癌、间变性甲状腺癌及儿童弥漫硬化型甲状腺癌)中的细胞群体 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量RNA测序数据 | 81个样本中的423,733个细胞的单细胞转录组,28个肿瘤的空间转录组,5个大型批量RNA测序队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium(推断), 10x Visium(推断) | NA |
| 412 | 2026-04-30 |
Identification of a distinctive gene signature associated with disease activity in granulomatous myositis
2026-01-08, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf543
PMID:41132132
|
研究论文 | 通过全转录组分析确定肉芽肿性肌炎疾病活动相关的特征基因标志 | 首次系统鉴定出肉芽肿性肌炎的特异性转录组特征(1293个上调基因和256个下调基因),并发现CHIT1基因表达与疾病严重程度强相关 | NA | 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制,通过定义其特异性转录组特征 | 肉芽肿性肌炎患者及其它肌病患者和健康对照者的肌肉活检样本 | 转录组学 | 肉芽肿性肌炎 | RNA-seq, 空间转录组学, 免疫组化 | 支持向量机 | 转录组数据 | 722例肌肉活检样本(包括38例GM患者) | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 413 | 2026-04-30 |
Indomethacin exerts both cyclooxygenase inhibition-dependent and independent mechanisms to enhance chemo-immunotherapy in mice
2026-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.07.698231
PMID:41542639
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研究论文 | 该论文研究了吲哚美辛通过COX抑制依赖和非依赖两种机制增强化疗联合免疫治疗在小鼠模型中的抗肿瘤效果 | 首次揭示吲哚美辛不仅通过抑制COX/PGE2通路增强化疗效果,还能通过抑制肿瘤内在的RAS信号通路发挥COX非依赖的联合增强作用 | 研究仅在小鼠肿瘤模型中进行,缺乏临床试验验证;且对不同肿瘤类型间的效果差异机制尚未完全阐明 | 探究吲哚美辛联合环磷酰胺化疗在多种小鼠肿瘤模型中的抗肿瘤效应及其免疫机制 | CT26、MC38、4T1、A20等多种小鼠肿瘤模型 | 免疫肿瘤学 | 多种癌症(结直肠癌、乳腺癌等) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多种小鼠肿瘤模型(CT26、MC38、4T1、A20) | 10x Genomics | 单细胞转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 414 | 2026-04-30 |
Single-cell RNA sequencing reveals transcriptional profiles of endometrial epithelial remodeling and identifies candidate genes regulating glandular cell development in Chinese Meishan pigs
2026-Jan-08, Journal of animal science
IF:2.7Q1
DOI:10.1093/jas/skag041
PMID:41808446
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序解析梅山猪子宫内膜上皮细胞在发情周期中的转录组图谱及腺体细胞发育调控基因 | 首次构建梅山猪子宫内膜上皮在卵泡期和黄体期的单细胞转录组图谱,鉴定出ALDH1A3+LGR5+干细胞和ALDH1A1+祖细胞亚群,并揭示从干细胞经祖细胞向腺上皮的连续分化轨迹及关键转录因子 | 仅基于梅山猪品种,且未涉及功能验证实验来确认候选转录因子对腺体发育的直接调控作用 | 揭示猪子宫内膜上皮细胞在发情周期中的异质性和分化轨迹,并鉴定调控腺体细胞发育的关键基因 | 梅山猪子宫内膜上皮细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3 |
| 415 | 2026-04-30 |
The single-cell landscape of the human vein after arteriovenous fistula creation and implications for maturation failure
2026-Jan, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.08.024
PMID:40992573
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术绘制动静脉瘘形成前后人静脉的单细胞图谱,揭示瘘管成熟失败的细胞和分子机制 | 首次在单细胞水平系统描绘人静脉在动静脉瘘形成后的细胞动态变化,发现巨噬细胞源性骨桥蛋白是驱动瘘管失败的关键旁分泌信号,并揭示Myddosome信号复合物、促炎性血管滋养管内皮细胞及过度活化的成纤维细胞在瘘管失败中的新作用 | 样本量相对有限(23例组织活检和20例单细胞样本),且未对不同种族或合并症患者进行分层分析 | 阐明动静脉瘘成熟过程的生物学机制,找出导致瘘管成熟失败的潜在治疗靶点 | 接受血液透析患者的动静脉瘘组织样本(包括术前静脉、早期切除标本、成熟及失败的瘘管) | 单细胞组学 | 肾病相关血管病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 23例组织活检标本和20例患者的70281个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 416 | 2026-04-30 |
Mechanisms of immune escape and extramedullary tropism in leukemia cutis
2026-Jan-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029121
PMID:41026928
|
研究论文 | 对10例皮肤和皮下组织孤立性髓外病变患者的23份白血病皮肤活检样本进行bulk和单细胞转录组分析,揭示急性髓系白血病髓外浸润的免疫逃逸机制和趋向性 | 首次对白血病皮肤进行bulk和单细胞转录组测序,揭示了髓外AML中T细胞耗竭、HLA II类分子下调及8个归巢受体分子的表达差异,为治疗靶点提供新线索 | 样本量较小(10例患者,23份活检),且缺乏功能验证实验 | 探究急性髓系白血病髓外浸润(特别是皮肤)的免疫微环境和白血病表型机制 | 10例伴发孤立性皮肤和皮下组织髓外病变的急性髓系白血病患者的白血病皮肤活检样本 | 转录组学 | 急性髓系白血病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 10例患者,23份白血病皮肤活检样本,7份骨髓复发样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 417 | 2026-04-30 |
Integrated single-cell transcriptomics and proteomics elucidate the molecular mechanisms and detoxification strategy of rifampicin-induced hepatotoxicity
2026, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.109757
PMID:41362738
|
研究论文 | 整合单细胞转录组学和蛋白质组学揭示了利福平诱导肝毒性的分子机制及解毒策略 | 首次结合单细胞RNA测序、批量RNA测序和基于质谱的蛋白质组学与代谢组学,系统揭示利福平诱导肝毒性的区域特异性肝细胞损伤机制,并发现维甲酸具有潜在治疗作用 | 基于小鼠模型,结论向人类转化的适用性需进一步验证 | 阐明利福平诱导肝毒性的细胞和分子机制,并寻找高效低毒的治疗干预措施 | 利福平诱导肝毒性的小鼠模型 | 机器学习 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 质谱蛋白质组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 | 小鼠肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 418 | 2026-04-30 |
ZIC2 drives colorectal cancer progression by regulating QPRT-mediated cell migration
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1722707
PMID:41694394
|
研究论文 | 本研究探讨了ZIC2通过调控QPRT介导的细胞迁移促进结直肠癌进展的机制 | 首次在泛癌及结直肠癌中系统分析ZIC2的临床意义,并发现ZIC2通过上调QPRT促进结直肠癌细胞迁移的新机制 | NA | 明确ZIC2在结直肠癌中的表达、临床意义及其通过QPRT促进肿瘤进展的分子机制 | 结直肠癌细胞系及公共数据集中的结直肠癌患者样本 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞转录组测序, 空间转录组测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA队列、GEO数据集(GSE39582和GSE139555)及CRC_10x空间转录组数据集中的多个样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 10x Visium | 10x空间转录组芯片 |
| 419 | 2026-04-30 |
Integrated Machine Learning and Multi-Omics Analysis Identifies Mitophagy-Related Core Genes and Mechanisms in Non-Alcoholic Fatty Liver Disease
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S575586
PMID:41907204
|
研究论文 | 通过整合机器学习和多组学分析,系统筛选非酒精性脂肪肝病(NAFLD)中线粒体自噬相关核心基因及其调控网络和免疫微环境机制 | 首次结合11种机器学习算法和SHAP模型可解释性分析,从多转录组和单细胞数据中筛选NAFLD线粒体自噬核心基因,并深入解析其与免疫微环境重塑的关联 | 缺乏大规模临床队列验证,体外实验仅使用细胞模型,未在动物体内验证核心基因功能及靶向治疗潜力 | 阐明NAFLD中线粒体自噬相关核心基因的分子调控网络及其在免疫微环境中的功能机制,为疾病诊断和治疗提供新靶点 | 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)患者的转录组数据和单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 机器学习, SHAP模型解释, 分子对接, Western Blot, qRT-PCR, JC-1染色 | WGCNA, 11种机器学习算法, SHAP | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个NAFLD转录组数据集(GEO数据库)及单细胞RNA测序数据,具体样本数量未明确 | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2026-04-30 |
ECM remodeling features in reparative chondrocytes during knee osteoarthritis
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1773139
PMID:42051458
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据整合分析,揭示膝关节骨关节炎中修复性软骨细胞的细胞外基质重塑特征 | 首次从伪时间轨迹框架揭示KOA中修复性软骨细胞(RepC)在ECM重塑中的动态变化,并验证FN1和TGF-β1信号对其诱导作用 | 依赖公开数据集,体外实验仅验证部分信号通路,未在体内模型中验证RepC的功能 | 阐明膝关节骨关节炎中修复性软骨细胞的ECM重塑特征及其动态转变机制 | 人类膝关节软骨细胞(对照和KOA样本) | 单细胞转录组学 | 膝关节骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |