单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28877 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-06-13 |
Machine learning-driven construction and validation of an intra-tumoral heterogeneity-associated prognostic model for bladder urothelial carcinoma
2025-Jun-11, Computer methods in biomechanics and biomedical engineering
IF:1.7Q3
DOI:10.1080/10255842.2025.2516767
PMID:40500142
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研究论文 | 本研究基于肿瘤内异质性相关基因构建了膀胱尿路上皮癌的预后模型 | 结合LASSO和随机生存森林算法开发了14基因预后特征，并在多个独立验证队列中表现出强预测性能 | 研究主要依赖公共队列数据，缺乏前瞻性临床验证 | 构建膀胱尿路上皮癌的预后预测模型 | 膀胱尿路上皮癌患者 | 机器学习 | 膀胱癌 | 转录组测序、单细胞RNA测序 | LASSO、随机生存森林 | 转录组数据、临床数据 | 多个公共队列数据集 |
| 402 | 2025-06-13 |
CD73 inhibitor AB680 suppresses glioblastoma in mice by inhibiting purine metabolism and promoting P2RY12+ microglia transformation
2025-Jun-11, Acta pharmacologica Sinica
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41401-025-01585-9
PMID:40500344
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研究论文 | 本研究探讨了CD73抑制剂AB680在胶质母细胞瘤(GBM)中的抗肿瘤效果及其机制 | 发现AB680通过抑制嘌呤代谢和促进P2RY12+小胶质细胞转化来抑制GBM | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探索AB680在GBM治疗中的潜在应用 | 胶质母细胞瘤(GBM)小鼠模型和人类GBM样本 | 肿瘤免疫治疗 | 胶质母细胞瘤 | 代谢组学分析、scRNA-seq、snRNA-seq | 小鼠GBM模型 | 代谢组数据、单细胞RNA测序数据 | G422-GBM小鼠模型和人类GBM样本 |
| 403 | 2025-06-13 |
Stem cell fate decisions: Substates and attractors
2025-Jun-10, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102532
PMID:40499510
|
review | 本文综述了人类多能干细胞在基因表达异质性方面的研究，强调了它们占据不同亚稳态的能力及其对分化结果的影响 | 提出了一种新的方法来模拟荧光标记分布随时间变化的序列，认为亚稳态之间的转变可能由确定性混沌和基因表达的随机波动共同调控 | NA | 探讨干细胞命运决定的机制，特别是基因表达异质性和亚稳态的作用 | 人类多能干细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞转录组学、荧光标记动态分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 404 | 2025-06-13 |
Differentiation of lung tissue-resident c-Kit+ cells into microvascular endothelial cells alleviates pulmonary vascular remodeling
2025-Jun-09, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.01.010
PMID:39909047
|
研究论文 | 本研究探讨了肺部组织驻留的c-Kit+细胞分化为微血管内皮细胞对缓解肺血管重塑的作用 | 揭示了肺部c-Kit+细胞通过分化为成熟内皮细胞在肺血管重塑中的保护作用，并发现通过AAV增强Nr2f2表达可促进这一分化过程 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证 | 探究肺部c-Kit+细胞分化在肺血管重塑中的作用及其潜在治疗策略 | 肺部组织驻留的c-Kit+细胞及其分化的内皮细胞 | 细胞生物学 | 肺高血压 | 遗传谱系追踪、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | SU5416/低氧（SuHx）诱导的肺血管重塑小鼠模型 | 基因表达数据 | SuHx诱导的小鼠模型及肺高血压患者样本 |
| 405 | 2025-06-13 |
Spatial transcriptomics reveals tryptophan metabolism restricting maturation of intratumoral tertiary lymphoid structures
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.011
PMID:40185093
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research paper | 该研究利用空间转录组学技术揭示了色氨酸代谢在肝细胞癌中限制肿瘤内三级淋巴结构成熟的机制 | 首次发现恶性细胞塑造的色氨酸富集代谢微环境会导致三级淋巴结构成熟偏离，并证明抑制色氨酸代谢可促进肿瘤内三级淋巴结构成熟 | 研究仅针对肝细胞癌，其他癌症类型中的情况尚不明确 | 探究三级淋巴结构成熟的影响因素及其与免疫治疗的关系 | 肝细胞癌(HCC)中的三级淋巴结构(TLSs) | digital pathology | liver cancer | spatial transcriptomics | NA | spatial transcriptomic data | NA |
| 406 | 2025-06-13 |
Radiotherapy promotes cuproptosis and synergizes with cuproptosis inducers to overcome tumor radioresistance
2025-Jun-09, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.031
PMID:40215978
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research paper | 该研究揭示了放疗通过上调铜转运蛋白1（CTR1）和消耗线粒体谷胱甘肽来诱导线粒体铜水平升高，从而触发铜死亡（cuproptosis），并提出通过靶向铜死亡来克服肿瘤放射抗性的治疗策略 | 首次揭示了放疗与铜死亡之间的联系，并发现通过铜离子载体治疗可以增强铜死亡，从而克服肿瘤的放射抗性 | 研究主要基于食管癌模型，其他类型癌症的适用性尚待验证 | 探索放疗如何诱导铜死亡以及如何利用这一机制克服肿瘤放射抗性 | 食管癌细胞和患者来源的异种移植模型 | 肿瘤学 | 食管癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 患者肿瘤样本和细胞系模型 |
| 407 | 2025-06-13 |
eIF5A maintains intestinal epithelial homeostasis by sustaining intestinal stem cells
2025-Jun-09, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00243-z
PMID:40488929
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研究论文 | 本文探讨了真核翻译起始因子5A（eIF5A）在维持肠道上皮稳态中的作用，特别是在肠道干细胞（ISCs）的维持方面 | 揭示了eIF5A通过调控线粒体翻译维持肠道干细胞的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和肠道类器官，人类相关性的验证尚不充分 | 阐明eIF5A在肠道上皮稳态维持中的分子机制 | 小鼠肠道上皮细胞和肠道类器官 | 细胞生物学 | 肠道疾病 | 条件性基因敲除、质谱分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 小鼠肠道上皮细胞和肠道类器官 |
| 408 | 2025-06-13 |
Prognostic and immune modulatory effects of ammonia-induced cell death in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Jun-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02508-0
PMID:40490575
|
research paper | 本研究探讨了氨诱导的细胞死亡（ACD）在头颈部鳞状细胞癌（HNSC）中的预后意义及免疫调节作用 | 首次将氨死亡特征（ADS）确立为HNSC的新型预后生物标志物，并揭示了其与肿瘤进展和免疫抑制的关联 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探究ACD在HNSC中的预后价值和免疫调节机制 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSC） | digital pathology | head and neck squamous cell carcinoma | 随机生存森林（RSF）、单样本基因集富集分析（ssGSEA）、肿瘤免疫表型追踪（TIP）分析、单细胞RNA测序 | RSF | 转录组数据 | NA |
| 409 | 2025-06-13 |
Single-cell chromatin accessibility profiling reveals regulatory mechanisms and evolution in pig brains
2025-Jun-09, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02263-2
PMID:40490756
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研究论文 | 通过单细胞染色质可及性分析，揭示了猪脑的调控机制及其进化特征 | 首次在猪脑中进行大规模单细胞染色质可及性分析，并比较了家猪与野猪的细胞类型特异性调控景观 | 研究仅聚焦于大脑皮层和小脑，未涵盖其他脑区 | 探索猪脑的调控机制及其在进化过程中的变化 | 家猪和野猪的大脑皮层及小脑细胞 | 生物医学 | 神经退行性疾病（如阿尔茨海默病） | 单细胞染色质可及性分析、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | 71,798个细胞（来自家猪和野猪的大脑皮层及小脑） |
| 410 | 2025-06-13 |
Comprehensive analysis of immunoglobulin expression in the mouse brain from embryonic to adult stages
2025-Jun-09, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03457-9
PMID:40490799
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据和Ig库分析，揭示了从小鼠胚胎到成年阶段大脑中免疫球蛋白（Ig）的表达谱 | 首次全面描述了Ig在大脑中从胚胎到成年阶段的表达谱，并发现小胶质细胞和第六层皮质丘脑神经元中Ig的表达模式及其对脂多糖的反应与B细胞不同 | 研究仅基于小鼠模型，尚未验证在人类大脑中的表达情况 | 阐明Ig在小鼠大脑中从胚胎到成年阶段的表达情况及其可能的非经典免疫功能 | 小鼠大脑中的免疫球蛋白（Ig）表达 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序、Ig库分析 | NA | RNA测序数据 | 从小鼠胚胎到成年阶段的多个发育时期的大脑样本 |
| 411 | 2025-06-13 |
Exploring the role of LFNG in hepatoblastoma using multiomics and raise a query in proof link
2025-Jun-09, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149604
PMID:40499700
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索LFNG在肝母细胞瘤中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 首次发现LFNG在肝母细胞瘤中作为细胞间通讯的靶点，促进肿瘤发展，并验证了LFNG过表达对肿瘤细胞迁移和侵袭的影响 | 研究主要基于公共数据集和体外实验，缺乏体内实验验证 | 识别肝母细胞瘤中异常表达的基因，探索影响肿瘤免疫微环境的细胞间通讯靶点 | 肝母细胞瘤组织和HUH6细胞系 | 肿瘤生物学 | 肝母细胞瘤 | 多组学分析、单细胞转录组测序、划痕愈合实验、Transwell实验 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 两个公共数据集（GSE133039和GSE180664）的肝母细胞瘤样本 |
| 412 | 2025-06-13 |
Single-cell profiling of lichen planus reveals type I interferon response triggering the interface dermatitis reaction
2025-Jun-09, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.043
PMID:40499747
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序揭示了扁平苔藓（LP）中I型干扰素反应触发界面皮炎反应的机制 | 首次在扁平苔藓病变皮肤中发现I型干扰素富集环境，并揭示了I型干扰素对炎症性角质形成细胞和成纤维细胞的独特影响 | 研究主要基于体外模型，可能需要更多体内实验验证 | 研究扁平苔藓的免疫发病机制及其驱动界面皮炎反应的潜在机制 | 扁平苔藓患者的病变皮肤与健康对照皮肤 | 免疫学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序 | 体外共培养模型 | RNA测序数据 | 未明确说明样本数量（LP患者和健康对照的皮肤样本） |
| 413 | 2025-06-13 |
Folliculin deletion in the mouse kidney results in cystogenesis of the loops of Henle via aberrant TFEB activation
2025-Jun-09, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.05.010
PMID:40499782
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research paper | 该研究探讨了在小鼠肾脏中删除Folliculin（FLCN）基因如何通过异常的TFEB激活导致Henle环的囊肿形成 | 揭示了FLCN-TFEB信号通路在肾单位发育中的关键作用，特别是在Henle环中，为Birt-Hogg-Dubé（BHD）综合征的发病机制提供了新的见解 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类肾脏组织的验证 | 探究FLCN基因在肾单位发育中的作用及其与BHD综合征的关系 | 小鼠肾脏中的肾单位，特别是Henle环 | 分子生物学 | Birt-Hogg-Dubé综合征 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确提及样本数量 |
| 414 | 2025-06-13 |
Primitive Hepatoblasts Driving Early Liver Development
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.08.658502
PMID:40501632
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research paper | 该研究识别并描述了一种在早期肝芽发育过程中源自Cdx2阳性内胚层祖细胞的原始肝母细胞群 | 发现了一种新的原始肝母细胞群，揭示了其在早期肝发育中的贡献以及WNT抑制和RA许可对原始肝母细胞出现的调控机制 | 原始肝母细胞在晚期胎儿和出生后发育中的贡献减弱，具体机制尚不明确 | 研究早期肝脏发育过程中的细胞谱系异质性 | 小鼠和人类的原始肝母细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、谱系追踪、表观遗传和功能扰动研究 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类样本 |
| 415 | 2025-06-13 |
Evidence for Transcriptomic Conservation Between the Main Cells of the Drosophila Prostate-Like Accessory Gland and Basal Cells of the Mammalian Prostate
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.05.658085
PMID:40501690
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序数据比较了果蝇前列腺样附属腺体与哺乳动物前列腺基底细胞的转录组相似性 | 提供了果蝇前列腺样附属腺体与哺乳动物前列腺基底细胞之间转录组相似性的新证据 | 不确定这些相似性是否反映共同的进化同源性，还是由于共享组织功能而独立衍生的特征 | 探索果蝇前列腺样附属腺体与哺乳动物前列腺基底细胞之间的转录组相似性 | 果蝇前列腺样附属腺体和哺乳动物前列腺基底细胞 | 生物信息学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 来自Fly Cell Atlas和哺乳动物成人前列腺单细胞数据集的数据 |
| 416 | 2025-06-13 |
Single-cell transcriptomics showed that maternal PCB exposure dysregulated ER stress-mediated cell type-specific responses in the liver of female offspring
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657944
PMID:40501930
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，探究母体暴露于多氯联苯（PCBs）对雌性后代肝脏发育的细胞类型特异性影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示了母体PCB暴露通过内质网应激途径对雌性后代肝脏细胞类型特异性反应的调控机制 | 研究仅针对雌性后代小鼠，未涉及雄性后代或更长期的影响 | 探究母体PCB暴露对后代肝脏发育的细胞特异性影响 | 出生后28天的雌性小鼠肝脏组织 | 单细胞转录组学 | 代谢紊乱 | scRNA-seq, RT-qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 出生后28天的雌性小鼠肝脏组织样本 |
| 417 | 2025-06-13 |
Robust self-supervised machine learning for single cell embeddings and annotations
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.05.658097
PMID:40502088
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研究论文 | 本文提出了一种名为DR-GEM的自监督元算法，用于改进单细胞和空间基因组学研究中的降维和聚类方法 | DR-GEM结合了分布鲁棒优化和平衡共识机器学习的原理，通过自监督机制提高对稀有细胞类型和状态的检测能力，并减少技术噪声的影响 | NA | 改进单细胞基因组学中的降维和聚类方法，以更好地支持数据驱动的发现 | 单细胞和空间基因组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞分辨率空间转录组学、Perturb-seq | 自监督元算法（DR-GEM） | 单细胞组学数据 | 合成和真实世界的单细胞组学数据集 |
| 418 | 2025-06-13 |
A multi-step immune-competent genetic mouse model reveals phenotypic plasticity in uveal melanoma
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.04.657841
PMID:40502063
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研究论文 | 开发了一种多步骤免疫能力遗传小鼠模型，用于研究葡萄膜黑色素瘤的表型可塑性 | 通过逐步引入人类UM进展相关的遗传改变，创建了一个能够模拟人类疾病进展的免疫能力小鼠模型 | 模型可能无法完全捕捉人类UM的所有复杂性 | 研究葡萄膜黑色素瘤的生物学特性并开发免疫治疗策略 | 葡萄膜黑色素瘤 | 癌症研究 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 遗传工程小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 419 | 2025-06-13 |
An updated and spatially validated somatic single-cell atlas of Hydractinia symbiolongicarpus
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.03.657738
PMID:40502179
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研究论文 | 本文通过整合新的固定细胞数据集与先前发表的活细胞数据，更新并验证了Hydractinia symbiolongicarpus的体细胞单细胞图谱 | 发现了新的假定免疫细胞群、先前未描述的神经亚型、两个空间上不同的腺细胞群、一个茎干特异性细胞类型，并探索了完整的刺细胞发育轨迹 | 先前图谱在细胞数量和转录组深度上仍有限制，且细胞类型分配主要基于推测 | 推进对Hydractinia symbiolongicarpus细胞多样性和动态的理解 | Hydractinia symbiolongicarpus的体细胞 | 单细胞转录组学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过47,000个细胞，来自摄食息肉和茎干组织 |
| 420 | 2025-06-13 |
Exploring the causal links between inflammation-related genes and atherosclerosis through Mendelian randomization analysis
2025-Jun-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000042584
PMID:40489880
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析探讨炎症相关基因与动脉粥样硬化之间的因果关系 | 利用多个数据集综合分析动脉粥样硬化斑块中的基因表达谱和分子机制，并通过单细胞RNA测序数据揭示不同细胞类型中的基因表达特征 | 研究依赖于公开数据集，可能受限于数据的质量和样本量 | 探讨炎症相关基因在动脉粥样硬化中的作用及其潜在治疗靶点 | 动脉粥样硬化斑块中的基因表达和分子机制 | 生物信息学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | DESeq2, clusterProfiler, Cytoscape, TwoSampleMR | 基因表达数据 | 多个公开数据集（GSE198600, GSE120521, GSE253903, GSE224273） |