单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 39702 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2024-08-07 |
Unraveling the dynamics of myometrial remodeling: insights from single-cell and spatial transcriptomics in term pregnancy
2024-08-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2026-05-23 |
Optimization of mouse kidney digestion protocols for single-cell applications
2024-07-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 通过比较三种小鼠肾脏单细胞消化方案，评估其对细胞异质性的影响，为单细胞研究提供方案选择指导 | 首次系统评估已发表的单细胞悬液制备方案，并比较其在小鼠肾脏细胞产量和异质性方面的差异 | 仅检测了三种方案，且未涉及其他可能影响消化效率的因素（如酶浓度、孵育时间），未进行体内验证 | 优化小鼠肾脏单细胞消化方案，为单细胞技术（如流式细胞术、单细胞RNA测序）提供高质量细胞悬液 | 小鼠肾脏细胞（包括白细胞、血管细胞、肾单位上皮细胞、足细胞、成纤维细胞） | 单细胞生物学 | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自雄性和雌性C57BL/6小鼠的肾脏样本 | Miltenyi Biotec | 单细胞RNA测序 | Miltenyi Biotec多组织消化试剂盒 | 三种方案：scRNAseq方案、Miltenyi Biotec多组织消化试剂盒、实验室自建方案 |
| 403 | 2026-05-23 |
Obesogenic diet disrupts tissue-specific mitochondrial gene signatures in the artery and capillary endothelium
2024-02-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 通过转录组测序研究高脂饮食对脂肪和肠系膜内皮细胞线粒体基因表达的影响及其在肥胖中表型趋同的机制 | 首次揭示肥胖通过下调PPAR-γ导致脂肪动脉和毛细血管内皮细胞氧化磷酸化基因表达减少，进而使肠系膜与脂肪内皮细胞发生表型趋同 | NA | 探究肥胖如何影响内皮细胞代谢表型，特别是线粒体基因表达 | 小鼠脂肪和肠系膜血管内皮细胞，以及人类内脏脂肪组织 | 数字病理学 | 肥胖 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | NA | 测序数据 | 小鼠（正常饮食组和高脂饮食组）及人类内脏脂肪组织样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 单细胞核RNA-seq | NA | NA |
| 404 | 2026-05-23 |
Collagen induction of immune cells in the mammary glands during pregnancy
2024-02-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过重新分析单细胞RNA测序数据，评估了妊娠-泌乳周期中乳腺脂肪垫的胶原动力学，发现免疫细胞异位表达胶原并参与细胞间相互作用 | 首次揭示妊娠阶段免疫细胞（包括淋巴系和髓系细胞）能异位产生I型和III型胶原，并显著增强细胞间胶原相互作用，为免疫细胞参与乳腺细胞外基质调控提供新证据 | 仅基于已有scRNA-Seq数据的二次分析，缺乏体内功能验证实验 | 探究妊娠-泌乳周期中乳腺胶原动态变化及免疫细胞在其中的作用 | 妊娠-泌乳周期中的乳腺脂肪垫组织及免疫细胞（淋巴系和髓系细胞） | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明样本数量，基于公开scRNA-Seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 405 | 2026-05-23 |
Exploring myometrial microenvironment changes at the single-cell level from nonpregnant to term pregnant states
2024-01-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学构建非孕期和足月孕期女性子宫肌层的单细胞转录组图谱，揭示细胞微环境变化 | 首次在单细胞水平上揭示非孕期与足月孕期子宫肌层的微环境变化，特别是平滑肌细胞亚群比例改变和M2巨噬细胞增加 | 未提及具体局限性信息 | 探索人类子宫肌层从非孕期到足月孕期在单细胞水平上的微环境变化 | 非孕期和足月孕期女性的子宫肌层组织 | 单细胞转录组学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | 12个人类子宫肌层组织样本，87,845个高质量单细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒，10x Visium空间转录组学平台 |
| 406 | 2026-05-23 |
The functional role of L-fucose on dendritic cell function and polarization
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1353570
PMID:38646527
|
研究论文 | 揭示L-岩藻糖对树突状细胞功能和极化的促进作用，及其在肿瘤免疫治疗中的潜在应用 | 首次发现膳食糖L-岩藻糖能增强树突状细胞的免疫刺激活性，促进其抗原摄取和加工，并调节T细胞活化 | 尚未明确L-岩藻糖增强DC功能的具体分子机制和信号通路 | 探索L-岩藻糖增强树突状细胞功能以提升抗肿瘤免疫应答的潜力 | 小鼠树突状细胞及黑色素瘤和乳腺癌模型中的瘤内树突状细胞 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 单细胞转录组数据 | 黑色素瘤和乳腺癌荷瘤小鼠模型的样本 | 未提及 | 单细胞RNA测序 | 未提及 | 未提及 |
| 407 | 2026-05-23 |
Single-cell transcriptomic analysis of pea shoot development and cell-type-specific responses to boron deficiency
2024-01, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.16487
PMID:37794835
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析硼缺乏条件下豌豆芽发育及细胞类型特异性响应 | 首次在单细胞水平揭示豌豆茎尖不同细胞类型对硼缺乏的差异化响应机制，并构建茎尖分生组织发育轨迹及其转录因子互作网络 | 本研究仅关注硼缺乏单一胁迫条件，未涉及其他营养胁迫或联合胁迫效应 | 探究营养胁迫（硼缺乏）如何影响植物生长发育的分子机制 | 豌豆（Pisum sativum）茎尖分生组织细胞 | 数字病理学 | 植物营养胁迫 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15个细胞簇，来源为硼缺乏条件下生长的豌豆茎尖 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 408 | 2026-05-23 |
Dimension-agnostic and granularity-based spatially variable gene identification using BSP
2023-11-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43256-5
PMID:37963892
|
研究论文 | 提出一种名为BSP的非参数模型，用于从二维或三维空间转录组数据中快速稳健地识别空间可变基因 | BSP方法能处理三维空间转录组数据，具有快速、稳健的优点，且是非参数模型，能比较两个空间粒度的基因表达模式 | 未提及主要局限性 | 开发一种维度无关且基于粒度的空间可变基因识别方法 | 空间可变基因 | 机器学习 | 癌症、类风湿性关节炎、肾脏疾病 | 空间转录组学 | 非参数模型（BSP） | 空间转录组数据 | 模拟数据及来自癌症、神经科学、类风湿性关节炎和肾脏研究的多种空间转录组技术数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 409 | 2026-05-23 |
Proteogenomic and V(D)J Analysis of Human Decidual T Cells Highlights Unique Transcriptional Programming and Clonal Distribution
2023-07-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200061
PMID:37195197
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术对人类蜕膜T细胞进行蛋白质组学和V(D)J分析，揭示其独特的转录编程和克隆分布 | 首次在单细胞水平同时获得人类蜕膜T细胞的转录组、有限蛋白质和受体库信息，揭示了蜕膜T细胞独特的转录编程机制和克隆分布的差异 | 未明确说明文章局限性 | 研究人类蜕膜T细胞的亚群分布、转录编程和克隆多样性，以理解母胎界面的免疫耐受机制 | 人类蜕膜和配对母体外周T细胞 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组、蛋白质、受体库 | 人类蜕膜和配对母体外周血T细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 410 | 2026-05-23 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals a dynamic control of metabolic zonation and liver regeneration by endothelial cell Wnt2 and Wnt9b
2022-10-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2022.100754
PMID:36220068
|
研究论文 | 利用单细胞空间转录组学揭示内皮细胞Wnt2和Wnt9b对肝脏代谢分区和再生的动态调控 | 首次明确证明内皮细胞来源的Wnt2和Wnt9b在肝脏分区与再生中的关键作用，并发现分区过程具有动态性，同时开发四价抗体激活剂为急性肝衰竭提供再生治疗新策略 | NA | 阐明调控肝脏分区和再生的Wnt信号具体来源及其机制 | 肝脏内皮细胞、肝细胞、小鼠模型及对乙酰氨基酚中毒急性肝衰竭模型 | 单细胞组学 | 急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 411 | 2026-05-23 |
Multiomic analysis reveals decidual-specific transcriptional programing of MAIT cells
2021-12, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13495
PMID:34411378
|
研究论文 | 采用多组学方法揭示蜕膜特异性MAIT细胞的转录编程 | 首次在单细胞分辨率下通过CITE-seq和scRNA-seq揭示了蜕膜MAIT细胞与外周血MAIT细胞的转录编程差异 | 未提供研究的具体样本量及功能验证的详细机制 | 研究妊娠期蜕膜MAIT细胞的转录编程及其功能 | 蜕膜（基底蜕膜和壁蜕膜）及外周血中的MAIT细胞 | 自然语言处理 | NA | CITE-seq, scRNA-seq, 流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 412 | 2026-05-23 |
Cell-level metadata are indispensable for documenting single-cell sequencing datasets
2021-05, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3001077
PMID:33945522
|
评论 | 文章指出单细胞RNA测序数据集中细胞层面元数据的缺失现象，并呼吁提高记录标准 | 首次系统评估单细胞测序数据集中细胞级元数据的缺失程度，并量化其普遍性 | 仅基于估计数据，未提供实际统计验证；未深入探讨元数据缺失对具体研究的影响案例 | 强调细胞级元数据对单细胞测序数据集可重复性和知识传递的重要性 | 已发表单细胞RNA测序研究的数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 元数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 413 | 2026-05-23 |
scGNN is a novel graph neural network framework for single-cell RNA-Seq analyses
2021-03-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-22197-x
PMID:33767197
|
研究论文 | 提出一种新颖的图神经网络框架scGNN用于单细胞RNA测序数据分析，在基因归集和细胞聚类方面表现优异 | 首次将图神经网络与左截断混合高斯模型结合，通过迭代多模态自编码器实现无假设的scRNA-Seq分析，有效处理测序稀疏性和基因表达异质性 | 未在更大规模或更多样化的数据集上验证，计算效率可能随细胞数量增加而下降 | 开发一种通用的图神经网络框架以改进单细胞RNA测序数据分析中的基因归集和细胞聚类 | 四个基准单细胞RNA测序数据集，以及来自阿尔茨海默症死后脑组织的13,214个单细胞核 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | 图神经网络（GNN）、自编码器、左截断混合高斯模型 | 基因表达数据 | 四个基准数据集，以及13,214个单细胞核（阿尔茨海默症研究） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 414 | 2026-05-23 |
Detection of chemotherapy-resistant patient-derived acute lymphoblastic leukemia clones in murine xenografts using cellular barcodes
2020-11, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2020.09.188
PMID:32946982
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研究论文 | 利用细胞条码追踪小鼠异种移植模型中化疗耐药的患者来源急性淋巴细胞白血病克隆 | 首次使用细胞条码技术追踪化疗介导的选择性压力下数百个患者来源白血病克隆的体内竞争动力学，并鉴定出甲氨蝶呤耐药克隆 | 仅在小鼠模型中验证，未在患者体内直接检测；未整合单细胞测序技术进行深度表征 | 开发和测试细胞条码分析方法，用于早期检测治疗耐药白血病克隆，以预防复发 | 患者来源的急性淋巴细胞白血病（ALL）细胞和SupB15细胞系 | 机器学习 | 急性淋巴细胞白血病 | 细胞条码分析 | NA | 序列数据 | NSG小鼠，具体数量未提及；分析数百个克隆 | NA | NA | NA | NA |
| 415 | 2026-05-23 |
Navigating the Depths and Avoiding the Shallows of Pancreatic Islet Cell Transcriptomes
2019-07, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/dbi18-0019
PMID:31221802
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评论 | 评估单细胞RNA测序在胰腺胰岛细胞转录组研究中的应用，探讨β细胞异质性的新见解及方法局限性 | 综合分析多个单个人类β细胞转录组数据集，评估单细胞分辨率下β细胞异质性的重叠与一致性，并指出工作于检测限以下的影响 | 单细胞分辨率下基因表达检测限的不可避免限制，以及其对单胰岛细胞转录组数据质量的影响 | 评估单细胞RNA测序如何增强对β细胞异质性的理解，并指导何时选择单细胞测序与批量测序方法 | 人胰岛α、β和δ细胞，以及小鼠和人类β细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 416 | 2026-05-22 |
Putative muscle stem cells promote Xenopus tail regeneration by modifying macrophage function via c1qtnf3
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504410122
PMID:41264239
|
研究论文 | 研究发现假定的肌肉干细胞通过c1qtnf3调节巨噬细胞功能，促进非洲爪蟾尾部再生 | 首次揭示了肌肉干细胞通过c1qtnf3基因调控巨噬细胞功能以促进尾部再生的机制 | 研究主要基于非洲爪蟾模型，其结论在哺乳动物中的适用性尚未验证 | 探究尾部再生过程中组织干细胞的动态行为及其调控机制 | 非洲爪蟾蝌蚪的侧群细胞和假定肌肉干细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9基因敲低 | NA | 基因表达数据 | 侧群细胞样本，具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 417 | 2026-05-22 |
Engineering a spatiotemporal macrophage circuit via STING phase separation to override immune suppression in pancreatic cancer
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2504718122
PMID:41264244
|
研究论文 | 通过STING相分离工程化时空巨噬细胞回路以克服胰腺癌免疫抑制 | 首次利用STING相分离机制构建巨噬细胞重编程平台PMMB，通过时空顺序控制实现TAM从免疫抑制向抗肿瘤表型转化 | 目前仅在临床前模型验证，缺乏人体临床试验数据，且STING相分离的长期安全性待评估 | 开发克服胰腺导管腺癌免疫抑制微环境的巨噬细胞靶向免疫治疗新策略 | 胰腺导管腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）亚群及CD8+T细胞 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个单细胞RNA测序数据集，具体数量未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 测序平台 |
| 418 | 2026-05-22 |
Precise combination therapy of radiotherapy and immunotherapy guided by joint PD-L1 imaging and T-cell imaging
2025-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012300
PMID:41260899
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研究论文 | 通过SPECT/CT成像技术联合监测肿瘤PD-L1表达和肿瘤浸润T细胞，指导放疗与PD-1/PD-L1阻断治疗的精准联合方案，提升疗效和安全性 | 首创利用SPECT/CT成像同时监测肿瘤PD-L1表达动态变化和T细胞浸润改变，实现联合治疗的时机指导与预后预测，提升个体化精准治疗水平 | 未明确提及研究局限，但可推断成像策略的临床转化仍需更大规模验证，且不同肿瘤模型间的疗效差异需进一步解析 | 探索利用PD-L1成像和T细胞成像联合指导放疗与免疫治疗精准组合的策略，以提高疗效和安全性，推动个体化精准癌症治疗 | 免疫热肿瘤和免疫冷肿瘤模型（小鼠） | 数字病理学 | 癌症 | SPECT/CT成像、单细胞RNA测序 | NA | 成像数据、单细胞转录组数据 | 免疫热和冷肿瘤小鼠模型，含多个时间点的成像和单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序用于分析肿瘤微环境变化 |
| 419 | 2026-05-22 |
Oligoclonal tumor-specific CD8 T-cell revival and IRE1α/XBP1-GDF15-mediated immunosuppressive niches determine neoadjuvant chemoimmunotherapy efficacy in cervical cancer
2025-Nov-19, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012630
PMID:41260902
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、VDJ测序和空间转录组学分析，揭示了新辅助化学免疫治疗在局部晚期宫颈癌中疗效的决定因素，即寡克隆肿瘤特异性CD8+T细胞复苏和IRE1α/XBP1-GDF15介导的免疫抑制微环境 | 首次阐明了IRE1α/XBP1-GDF15轴在药物耐受持久细胞（DTP）中介导的ER应激信号如何形成免疫抑制微环境，并影响新辅助化学免疫治疗疗效 | NA | 探究新辅助化学免疫治疗在局部晚期宫颈癌中疗效差异的微环境动态决定因素 | 局部晚期宫颈癌患者的肿瘤微环境，包括肿瘤细胞、CD8+T细胞、髓系细胞等 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞VDJ测序, 空间转录组学, 多重免疫组化, 小鼠模型 | NA | RNA-seq数据，单细胞转录组数据，空间转录组数据，免疫组化图像 | 10例患者（5对治疗前后配对样本），另外23例患者用于验证，6例手术切除标本用于多重免疫组化分析 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA-seq, 单细胞VDJ-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA-seq和VDJ-seq，空间转录组学平台用于空间分析 |
| 420 | 2026-05-22 |
USP2-mediated PPARγ stabilization promotes hepatocellular carcinoma progression and M2 macrophage polarization via oleic acid
2025-Nov-04, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012721
PMID:41193183
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研究论文 | 本文发现USP2通过去泛素化稳定PPARγ，促进肝细胞癌进展和油酸介导的M2巨噬细胞极化 | 首次揭示USP2通过K48位去泛素化稳定PPARγ，促进脂肪酸合成和油酸分泌，进而诱导M2巨噬细胞极化并形成IL-10/STAT3/USP2正反馈环路 | NA | 探究去泛素化酶USP2在肝细胞癌进展和肿瘤微环境免疫调节中的作用机制 | 肝细胞癌患者来源类器官、HCC细胞系、动物模型及共培养系统 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、免疫共沉淀、CUT&RUN、ELISA、质谱分析 | NA | 单细胞转录组数据、免疫组化数据、代谢数据 | 肝细胞癌患者类器官、细胞系及动物模型样品 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'端测序平台 |