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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-07-10 |
HRD-Driven Reprogramming of Macrophage Function and Spatial Architecture in High-Grade Serous Ovarian Cancer
2026, Genetics research
IF:1.4Q4
DOI:10.1155/genr/7364793
PMID:42106020
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了高浆液性卵巢癌中HRD驱动的巨噬细胞功能重编程及空间结构变化 | 首次系统描述了不同HRD亚型(FBI、HRD-Del、HRD-Dup)中巨噬细胞的转录组特征和空间分布差异,并关联了患者生存预后 | NA | 探究同源重组缺陷对高浆液性卵巢癌免疫微环境中巨噬细胞的影响 | 高浆液性卵巢癌患者的巨噬细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 166,895个巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 402 | 2026-07-10 |
Single-Cell and Multiomics Characterization of p21 in Cancer Progression and Therapeutic Sensitivity
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/5598948
PMID:42415742
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研究论文 | 通过单细胞和多组学分析揭示p21在癌症进展和治疗敏感性中的作用 | 在单细胞分辨率下系统描绘p21在肿瘤微环境中的功能,揭示其作为细胞周期抑制剂之外的免疫调节和治疗敏感性相关表型 | 功能发现需要进一步的临床验证 | 研究CDKN1A(编码p21)在肿瘤微环境中的功能,特别是其在单细胞分辨率下的表达模式和功能 | p21(CDKN1A)在多种癌症类型中的表达和功能 | 生物信息学 | 癌症 | NGS, RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 公共数据集中的多种癌症样本 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | 公共数据集中使用的单细胞RNA-seq平台 |
| 403 | 2026-07-10 |
Testicular macrophages: core immune regulators and emerging therapeutic targets in spermatogenic dysfunction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1868707
PMID:42416067
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综述 | 系统综述睾丸巨噬细胞在生精功能障碍中的核心免疫调节作用及新兴治疗靶点 | 首次全面整合睾丸巨噬细胞的发育起源、功能异质性及其在多种男性生精功能障碍中的机制作用,并系统总结了针对睾丸巨噬细胞的治疗策略 | 现有研究较为分散,缺乏系统性综述与全面整合 | 综述睾丸巨噬细胞在生精功能障碍中的机制作用及治疗进展 | 睾丸巨噬细胞及其在生精功能障碍中的功能与机制 | 机器学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 404 | 2026-07-10 |
Immune activation induced by FOLR2+ decidual macrophage deficiency impairs decidualization and angiogenesis in spontaneous abortion
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1852410
PMID:42416064
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和临床验证,发现FOLR2+蜕膜巨噬细胞在复发性流产中减少,导致蜕膜化障碍和血管生成受损,揭示其维持母胎界面免疫耐受和妊娠的关键作用 | 首次鉴定出FOLR2+蜕膜巨噬细胞具有免疫调节、组织驻留和促血管生成特性,并揭示其与蜕膜基质细胞的互作形成正反馈环路维持妊娠,为复发性流产免疫机制提供新见解 | 主要基于体外功能实验,缺乏体内动物模型验证 | 阐明复发性流产中巨噬细胞亚型的异质性和功能机制 | 人类子宫内膜和蜕膜组织中的FOLR2+巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类子宫内膜和蜕膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 405 | 2026-07-10 |
B cell-mediated immune reconstitution after lung transplantation: mechanisms, interventions, and prognostic evaluation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1798139
PMID:42421940
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综述 | 综述了肺移植后B细胞介导的免疫重建机制、干预措施及预后评估 | 系统总结了B细胞在肺移植不同阶段的特异性扰动,并探讨了单细胞RNA测序和BCR谱分析等新技术用于分层免疫监测和风险预测的潜力 | 未明确指出局限性,但作为综述,可能受限于现有研究数据的完整性和异质性 | 总结肺移植中B细胞生物学、阶段特异性扰动,并探索多组学技术如何支持个性化免疫调节和预后评估 | 肺移植患者中的B细胞动态变化 | 机器学习 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 406 | 2026-07-10 |
Integrative single-cell transcriptomics and mendelian randomization identifies BTN3A2 as a shared protective factor in Behçet's disease and inflammatory bowel disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1845143
PMID:42421947
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学与孟德尔随机化分析,发现BTN3A2是白塞病和炎症性肠病的共同保护因子,并提供了这两种疾病链接的实验证据 | 首次通过单细胞转录组学与孟德尔随机化相结合的方法,识别出BTN3A2作为BD和IBD的共享保护因子,并首次在EAU小鼠模型中观察到类似IBD的结肠病理改变,建立了BD相关眼部炎症与肠道病理之间的直接联系 | 未明确提及局限性 | 探索白塞病与炎症性肠病之间的分子联系和共享治疗靶点 | 白塞病和炎症性肠病患者的外周血单细胞,以及实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型 | 单细胞转录组学、孟德尔随机化 | 白塞病、炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、孟德尔随机化、共定位分析 | NA | 单细胞转录组数据、eQTL数据、GWAS数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 407 | 2026-07-10 |
Functional shifts in immune composition follow lactation stage in human milk
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1850094
PMID:42421962
|
研究论文 | 对人类母乳中免疫成分随哺乳阶段的变化进行多模态分析 | 首次通过单细胞RNA测序、高维流式细胞术和可溶性蛋白检测等多模态方法,系统揭示母乳免疫微环境在初乳、过渡乳和成熟乳三个阶段的动态重塑特征 | 需要进一步研究这些阶段相关免疫特征的功能意义及其对新生儿健康的影响 | 探讨母乳免疫微环境是否随哺乳阶段发生变化 | 人类母乳中的免疫细胞、上皮细胞和可溶性免疫介质 | 数字病理学 | 不适用 | 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术, 可溶性蛋白检测 | 不适用 | 基因表达数据, 流式细胞术数据, 蛋白质数据 | 纵向队列中配对母体外周血和母乳样本 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 408 | 2026-07-10 |
Liquid-liquid phase separation-associated gene networks link EMT and ferroptosis to define a PDGFRB-centered prognostic signature in bladder cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1846096
PMID:42421957
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研究论文 | 本研究整合了转录组、单细胞和空间数据,构建了基于5基因的膀胱癌预后特征,揭示了液-液相分离、上皮间充质转化和铁死亡之间的调控网络 | 首次构建以PDGFRB为中心、连接液-液相分离基因网络与EMT和铁死亡易感性的膀胱癌预后特征,并通过实验验证PDGFRB的相分离能力及其在细胞增殖、迁移和铁死亡中的作用 | 未提及具体局限性 | 探究液-液相分离、上皮间充质转化和铁死亡在膀胱癌中的整合作用并开发预后标志物 | 膀胱癌患者样本、T24膀胱癌细胞系、临床标本和小鼠原位模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 蛋白相分离重构 | NA | 转录组数据, 单细胞数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 临床标本及小鼠原位模型(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 409 | 2026-07-10 |
Single-cell dissection and multi-cohort validation identify a hypoxia-related prognostic signature with experimental verification in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1845179
PMID:42422066
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研究论文 | 整合单细胞RNA测序与多队列转录组数据,构建并验证肺腺癌低氧相关预后模型,并通过体外实验确认关键基因VWA1的功能 | 首次在单细胞水平系统解析肺腺癌中低氧信号的细胞异质性,并基于此构建经多队列验证的低氧相关预后模型 | 未提及明确局限性 | 探索肺腺癌中低氧信号的细胞分布及其预后分层价值 | 肺腺癌患者组织样本及细胞系 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 预后模型(采用多种算法比较) | 基因表达数据(单细胞及批量转录组) | TCGA训练队列及两个独立外部验证队列 | Illumina | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | 来自GEO数据库的单细胞RNA-seq数据及TCGA等批量转录组数据 |
| 410 | 2026-07-10 |
Integrated machine learning and multi-omics analysis identifies CYP1B1 as a candidate target of orientin in intervertebral disc degeneration-associated low back pain
2026, Frontiers in pain research (Lausanne, Switzerland)
DOI:10.3389/fpain.2026.1870398
PMID:42422480
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研究论文 | 通过整合机器学习和多组学分析,发现CYP1B1是荭草苷治疗椎间盘退变相关腰痛的候选靶点 | 首次结合网络药理学、机器学习、分子动力学模拟和单细胞RNA测序,系统鉴定荭草苷作用于椎间盘退变相关腰痛的核心靶基因CYP1B1 | 研究仅基于公共数据集GSE70362进行预测,缺乏大规模临床样本验证,且分子机制尚未深入探讨 | 探索荭草苷治疗椎间盘退变相关腰痛的核心靶点基因 | 人椎间盘纤维环细胞(IL-1β刺激) | 机器学习 | 椎间盘退变 | 网络药理学, 机器学习, 分子对接, 分子动力学模拟, 单细胞RNA测序, 细胞实验 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | GSE70362数据集(具体样本数未提及)及人椎间盘纤维环细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 411 | 2026-07-10 |
NAD+ metabolic collapse and arrest of epithelial development in Hirschsprung disease
2026, World journal of pediatric surgery
IF:0.8Q4
DOI:10.1136/wjps-2026-001222
PMID:42422596
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序探究先天性巨结肠症中NAD+代谢崩溃与上皮发育停滞的机制 | 首次在HSCR上皮中发现NAD+生物合成不足与过度消耗共同导致的代谢脆弱性,颠覆了以肠道神经系统为中心的传统疾病模型 | NA | 明确HSCR患者神经节段结肠的上皮状态及其代谢异常 | HSCR患者及非HSCR对照(HSCR相关疾病)的远端结肠组织 | 数字病理学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、图像 | HSCR患者与非HSCR对照的远端结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 412 | 2026-07-10 |
Intestinal subepithelial myofibroblasts in inflammatory bowel disease: fibroblast heterogeneity, fibrosis, and therapeutic targeting
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1808431
PMID:42422813
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综述 | 综述肠上皮下肌成纤维细胞在炎症性肠病中的作用,包括成纤维细胞异质性、纤维化机制及治疗靶点 | 整合单细胞和空间转录组学最新进展,揭示成纤维细胞异质性与致病性成纤维细胞亚群,并系统总结靶向基质途径的治疗策略 | 作为综述,未提供原始实验数据,且部分新兴治疗策略尚未在临床试验中充分验证 | 全面总结肠上皮下肌成纤维细胞在炎症性肠病中的生理和病理作用,探讨纤维化机制及治疗靶点 | 肠上皮下肌成纤维细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞转录组学,空间转录组学 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒,10x Visium空间基因表达 |
| 413 | 2026-07-10 |
RBMS3 promotes ferroptosis in colorectal cancer and is suppressed by M2 tumor-associated macrophages via STAT3 activation
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1872659
PMID:42422878
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研究论文 | 本文研究了RBMS3在结直肠癌中促进铁死亡的作用,并发现M2型肿瘤相关巨噬细胞通过STAT3激活抑制RBMS3表达 | 首次揭示RBMS3通过铁死亡通路影响结直肠癌预后,并阐明M2巨噬细胞-STAT3-RBMS3轴的免疫调控机制 | 主要基于细胞系和公共数据库分析,缺乏体内动物模型验证和更大规模的临床队列数据 | 探索RBMS3在结直肠癌中的预后价值及其与铁死亡和免疫微环境的关系 | 结直肠癌患者样本、TCGA泛癌及COAD数据集、HCT116细胞系、THP-1来源的M2巨噬细胞 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Cox比例风险模型, Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA-COAD队列(约500例)及GEO多个验证数据集(具体样本数未明确) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 414 | 2026-07-10 |
Piezo1 promotes colitis progression by modulating the Nrf2/NF-κB/NLRP3 signaling pathway
2025-Dec, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117293
PMID:40886854
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研究论文 | 该研究探讨了机械敏感离子通道Piezo1通过调节Nrf2/NF-κB/NLRP3信号通路促进结肠炎进展的机制 | 首次揭示Piezo1通过机械感知特性调控Nrf2/NF-κB/NLRP3信号通路在结肠炎发展中的作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类IBD患者中验证,Piezo1介导机械信号的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究Piezo1在肠道炎症病理生理中的作用及其对Nrf2/NF-κB/NLRP3信号通路的调节机制 | 野生型和Piezo1Lyz2溃疡性结肠炎小鼠模型的结肠组织及巨噬细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 图像 | 小鼠结肠组织样本及巨噬细胞样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 415 | 2026-07-10 |
Multi-omic profiling reveals age-related immune dynamics in healthy adults
2025-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09686-5
PMID:41162704
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研究论文 | 通过对300多名健康成年人进行单细胞RNA测序、蛋白质组学和流式细胞术等多组学分析,揭示了年龄相关的免疫动态变化 | 发现了年龄相关的T细胞亚群非线性转录重编程,且该过程不由系统性炎症或慢性巨细胞病毒感染驱动,并揭示了记忆T细胞中T2细胞偏向性功能与流感疫苗中高度增强抗原的B细胞反应失调相关 | 未明确提及局限性 | 研究年龄如何影响外周免疫的组成和状态,以及免疫衰老的机制 | 300多名健康成年人(25至90岁),其中96人接受为期2年的纵向季节性流感疫苗接种随访 | 单细胞组学 | 免疫衰老 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞术数据 | 300多名健康成年人(16百万以上外周血单核细胞,71个免疫细胞亚群),96人纵向随访 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 416 | 2026-07-10 |
Structural and functional characteristics of local immune memory formation in SARS-CoV-2-infected cynomolgus macaques
2025-Dec, Clinical immunology (Orlando, Fla.)
DOI:10.1016/j.clim.2025.110589
PMID:40882689
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研究论文 | 使用单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫检测技术,研究SARS-CoV-2奥密克戎感染的非人灵长类动物模型中局部免疫记忆的形成机制 | 首次在非人灵长类动物模型中揭示iBALT形成功能性三级淋巴结构及其在SARS-CoV-2感染后局部免疫记忆中的作用 | 样本量有限,且仅针对奥密克戎变种,未涵盖其他SARS-CoV-2变种 | 探究SARS-CoV-2感染后肺部局部免疫记忆的结构和功能特征 | SARS-CoV-2奥密克戎感染的食蟹猴 | 机器学习 | COVID-19 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,免疫检测 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,免疫检测数据 | 非人灵长类动物(食蟹猴)样本,具体数量未提供 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium,10x Visium | 10x Chromium 单细胞RNA测序,10x Visium 空间转录组学 |
| 417 | 2026-07-10 |
Exploring the toxicological impact of 6PPDQ exposure on psoriasis through network toxicology, machine learning, and multidimensional bioinformatics analysis
2025-Dec-01, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
DOI:10.1016/j.envpol.2025.127291
PMID:41120051
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研究论文 | 通过网络毒理学、机器学习和多维生物信息学分析,探究轮胎抗氧化剂衍生物6PPDQ暴露对银屑病的毒性影响 | 首次结合网络毒理学框架、机器学习(LASSO和SVM-RFE)及单细胞RNA测序数据,系统揭示6PPDQ通过核心基因(如NR3C1)调控免疫炎症通路(如IL-23/Th17轴)加重银屑病的机制,并建立了不良结局通路模型 | 研究基于计算预测和公开数据集,缺乏体内外实验验证;分子对接和动力学模拟未考虑代谢物或实际环境暴露浓度的影响 | 探索环境污染物6PPDQ暴露与银屑病发病之间的潜在关联及分子机制 | 6PPDQ与银屑病重叠的290个靶点基因,以及通过机器学习筛选的四个核心基因(CD3D、IRF7、NR3C1、HDAC1) | 机器学习和生物信息学 | 银屑病 | 网络毒理学、机器学习(LASSO和SVM-RFE)、基因本体论和KEGG通路分析、免疫浸润分析、单细胞RNA-seq、分子对接、分子动力学模拟 | LASSO回归和SVM-RFE模型 | 基因表达数据和单细胞RNA-seq数据 | 使用公开数据集GSE13355(银屑病转录组样本),具体样本量未在标题和摘要中明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 418 | 2026-07-10 |
Mapping the tumor immune landscape: single-cell RNA sequencing in cancer immunotherapy
2025-Nov-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.218012
PMID:40889736
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综述 | 系统总结了单细胞RNA测序在肿瘤免疫微环境研究中的分析流程、最佳实践及新兴应用与挑战 | 全面梳理了scRNA-seq在肿瘤免疫治疗中的核心分析工作流及数据处理最佳实践 | 未提及具体局限性 | 探讨scRNA-seq在肿瘤免疫微环境研究和转化肿瘤学中的应用 | 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞状态和细胞间相互作用 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 419 | 2026-07-10 |
Insights into the lactylation-immune regulatory axis as a mechanistic bridge in migraine pathophysiology
2025-Nov-18, The journal of headache and pain
IF:7.3Q1
DOI:10.1186/s10194-025-02208-8
PMID:41254496
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评论 | 对一篇关于乳酰化-免疫调节轴在偏头痛病理生理学中作用的多组学孟德尔随机化研究提出四个方面的澄清请求 | 通过多组学孟德尔随机化框架首次将乳酰化-免疫介导通路与偏头痛风险联系起来,并提名EP300、SIRT1和SLC16A1为潜在因果驱动因子 | 未能明确EP300和SIRT1在多组学修饰中的特异性、外周与中枢免疫的权重比较、单细胞RNA测序中SIRT1和SLC16A1的差异表达在样本量或技术层面可能存在的局限性,以及该通路在不同偏头痛亚型中的临床异质性有待探索 | 澄清乳酰化-免疫调节轴在偏头痛中的机制,并为生物标志物选择和转化研究提供指导 | 偏头痛相关的乳酰化修饰、免疫细胞表型(B细胞和NKT细胞)及基因(EP300、SIRT1、SLC16A1) | 机器学习和生物信息学 | 偏头痛 | 多组学孟德尔随机化、单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据、免疫细胞表型数据 | 未明确提及,但包括外周血单细胞RNA测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 420 | 2026-07-10 |
Paired single-cell and spatial transcriptional profiling reveals a central osteopontin macrophage response mediating tuberculous granuloma formation
2025-09-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01559-25
PMID:40772762
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研究论文 | 通过配对单细胞和空间转录组测序揭示了骨桥蛋白巨噬细胞在结核肉芽肿形成中的核心作用 | 首次结合单细胞与空间转录组分析,绘制了人类结核肉芽肿的细胞转录层结构,并鉴定出SPP1/骨桥蛋白表达的巨噬细胞为关键调节细胞群 | 样本数量有限,且主要依赖于活检组织,可能无法完全代表肉芽肿的动态发展过程 | 解析结核肉芽肿的细胞组成、空间组织及分子调控机制 | 结核病患者活检组织中的肉芽肿 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序,空间转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 多名结核病患者活检标本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组测序 | NA | NA |