单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
401	2025-07-05	Synergistic immunochemotherapy targeted SAMD4B-APOA2-PD-L1 axis potentiates antitumor immunity in hepatocellular carcinoma 2024-06-17, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06699-2 PMID:38886351	研究论文	提出一种针对肝细胞癌的协同免疫化疗策略，通过SAMD4B-APOA2-PD-L1轴增强抗肿瘤免疫	首次提出基于三种常见抗肿瘤药物的协同免疫化疗策略，并揭示其通过SAMD4B介导的2'-O-甲基化修饰调控免疫微环境的机制	研究主要基于PDX小鼠模型，临床样本量可能有限	开发针对晚期肝细胞癌的有效治疗方案	肝细胞癌患者和PDX小鼠模型	肿瘤免疫治疗	肝细胞癌	单细胞RNA测序、2'-O-甲基化修饰、多重免疫荧光染色	PDX小鼠模型	RNA测序数据、免疫荧光图像数据	未明确说明具体样本量，涉及PDX小鼠模型和临床患者数据
402	2025-07-05	MAL2 reprograms lipid metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma via EGFR/SREBP-1 pathway based on single-cell RNA sequencing 2024-06-12, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-024-06775-7 PMID:38866777	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序发现MAL2在肝内胆管癌中特异性富集，并通过调控EGFR/SREBP-1通路促进脂质代谢，影响癌细胞增殖和迁移	首次揭示MAL2通过稳定EGFR膜定位激活PI3K/AKT/SREBP-1轴促进脂质积累的机制，并筛选出小分子抑制剂sarizotan	研究主要基于体外实验和类器官模型，尚未进行大规模临床验证	探究MAL2在肝内胆管癌发生发展中的作用机制及治疗靶点	肝内胆管癌细胞及类器官模型	肿瘤生物学	肝内胆管癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)、转录组学、代谢组学、分子对接、Co-IP	类器官模型	RNA测序数据、代谢物数据	未明确说明具体样本数量
403	2025-07-05	Temporal Single-Cell Sequencing Analysis Reveals That GPNMB-Expressing Macrophages Potentiate Muscle Regeneration 2024-Mar-28, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-4108866/v1 PMID:38585871	研究论文	通过单细胞RNA测序分析揭示表达GPNMB的巨噬细胞在肌肉再生中的关键作用	发现了一个表达GPNMB的巨噬细胞亚群，该亚群在巨噬细胞介导的肌肉再生中发挥关键作用	研究未详细探讨GPNMB信号通路在肌肉再生中的具体分子机制	探究巨噬细胞在骨骼肌修复过程中的表型多样性和功能	骨骼肌损伤后的巨噬细胞	单细胞测序	肌肉损伤	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	不同时间点的骨骼肌单细胞样本
404	2025-07-04	Large-scale dependency and drug screens to characterize the therapeutic vulnerabilities of multiple myeloma with 1q 2025-Jul-03, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024025102 PMID:40073369	研究论文	通过大规模依赖性和药物筛选，系统性表征了1q+多发性骨髓瘤的治疗脆弱性，并发现其对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性增加	首次系统性揭示了1q+多发性骨髓瘤对MCL1和PI3K抑制剂的敏感性，并阐明了其作用机制	研究主要基于体外实验，尚未进行临床验证	开发针对1q+多发性骨髓瘤的靶向治疗策略	1q+多发性骨髓瘤患者	肿瘤学	多发性骨髓瘤	大规模依赖性筛选、药物筛选、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
405	2025-07-04	IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes 2025-Jul-03, Blood IF:21.0Q1 DOI:10.1182/blood.2024027689 PMID:40163892	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术探讨了特发性多中心Castleman病（iMCD）患者的免疫景观，揭示了IL-6和IFN-II信号通路在疾病进展中的关键作用	首次通过单细胞RNA测序揭示了iMCD患者中CCL单核细胞通过IFN-II信号与NK/NKT细胞相互作用，以及IFN-γ水平与疾病严重程度和治疗抵抗的正相关性	样本量较小（15例iMCD患者和4例健康对照），且部分发现需要在大规模独立队列中进一步验证	深入了解iMCD的免疫机制，建立早期预后分层并发现新的治疗靶点	特发性多中心Castleman病（iMCD）患者的外周血单个核细胞（PBMCs）、淋巴结和骨髓样本	免疫学	特发性多中心Castleman病（iMCD）	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	15例iMCD患者和4例健康对照的外周血单个核细胞（PBMCs），以及部分淋巴结和骨髓样本
406	2025-07-04	Choroid Plexus Fibroblast-ILC2 Niche Promotes Adult Hippocampal Neurogenesis after Traumatic Brain Injury 2025-Jul-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202415984 PMID:40605604	研究论文	本文研究了创伤性脑损伤（TBI）后脉络丛（ChP）中2型固有淋巴细胞（ILC2）的积累及其对神经发生的影响	首次揭示了ILC2通过优化免疫微环境和促进神经发生在TBI后的潜在治疗作用	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证	探讨TBI后脉络丛的结构变化和免疫细胞浸润特征及其对神经发生的影响	创伤性脑损伤（TBI）小鼠模型	神经科学	创伤性脑损伤	单细胞RNA测序、单核RNA测序、组织学分析	小鼠模型	RNA测序数据、组织学数据	未明确提及具体样本数量
407	2025-07-04	Cathepsin K Aggravates Pulmonary Fibrosis Through Promoting Fibroblast Glutamine Metabolism and Collagen Synthesis 2025-Jul-03, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202413017 PMID:40605618	研究论文	本文研究了组织蛋白酶K（CTSK）如何通过促进成纤维细胞的谷氨酰胺代谢和胶原合成加剧肺纤维化	首次发现CTSK通过SNX9介导的内吞作用促进TGF-β1诱导的SMAD3激活，进而上调GLS1和谷氨酰胺富集，最终增加胶原合成	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限	探究肺纤维化中成纤维细胞异常活化的触发因素及其分子机制	肺纤维化小鼠模型和患者血清样本	分子病理学	肺纤维化	蛋白质组学、单细胞测序	NA	蛋白质组数据、单细胞测序数据、血清生化指标	小鼠模型和患者血清样本（具体数量未明确说明）
408	2025-07-04	Single-cell transcriptomics reveals depletion and dysregulation of Mycobacterium tuberculosis-specific Th1 and Th17 cells early after acquisition of HIV 2025-Jul-03, The Journal of infectious diseases IF:5.0Q1 DOI:10.1093/infdis/jiaf354 PMID:40605619	研究论文	该研究通过单细胞转录组学揭示了HIV感染早期对结核分枝杆菌特异性Th1和Th17细胞的耗竭和功能失调	首次在HIV感染早期阶段，通过单细胞RNA测序技术揭示了结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞的耗竭和功能失调机制	研究样本量有限，且仅关注了HIV感染早期的变化	探究HIV感染如何影响对结核分枝杆菌的CD4 T细胞免疫应答	HIV感染者和非感染者的结核分枝杆菌特异性CD4 T细胞	免疫学	结核病/HIV感染	流式细胞术、单细胞RNA测序	NA	单细胞转录组数据	一组HIV感染者和非感染者的样本（具体数量未明确说明）
409	2025-07-04	Engineering a Lipid Nanoparticle with Atypical Calcium Crystal Structure for Enhanced IFNβ-Mediated Immunotherapy 2025-Jul-03, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202419870 PMID:40605669	研究论文	本研究开发了一种具有非典型晶体结构和pH响应特性的纳米材料NanoCa，用于增强IFNβ介导的免疫治疗	发现NanoCa通过Ca-calcineurin-NFATc2-PKCβ-IRF3信号通路触发干扰素，增强抗肿瘤免疫反应	未明确提及具体局限性	探索金属离子通过干扰素激活促进树突状细胞成熟的机制，并开发新型抗肿瘤免疫治疗策略	钙磷酸盐脂质体纳米材料(NanoCa)及其在肿瘤模型中的免疫调节作用	纳米医学	癌症	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	CT26肿瘤模型	基因表达数据	多种肿瘤模型(具体数量未明确)
410	2025-07-04	Lamin A/C Expression in Hematopoietic Cells Declines During Human Aging and Constrains Atherosclerosis in Mice 2025-Jul-03, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322893 PMID:40605747	research paper	研究探讨了人类衰老过程中造血细胞中Lamin A/C表达下降的现象及其对小鼠动脉粥样硬化的影响	首次在体内模型中研究了Lamin A功能增益对动脉粥样硬化的影响，并揭示了Lamin A/C作为年龄相关动脉粥样硬化的新型调节因子	研究主要基于小鼠模型，人类数据的直接应用可能存在限制	探究衰老过程中造血细胞Lamin A/C表达变化及其对动脉粥样硬化的影响	人类循环白细胞和小鼠模型	生物医学	心血管疾病	流式细胞术、单细胞RNA测序、活体显微镜检查	Lmna-null小鼠和Lmnatg小鼠模型	基因表达数据、图像数据	未明确说明样本数量，涉及人类白细胞和小鼠模型
411	2025-07-04	A Comparative Analysis Dissecting the Immune Landscape of Vitiligo and Melanoma from a single-cell Perspective: Two Sides of the Same Coin? 2025-Jul-03, Inflammation IF:4.5Q2 DOI:10.1007/s10753-025-02332-2 PMID:40608219	研究论文	通过单细胞RNA测序技术比较分析白癜风和黑色素瘤的免疫微环境差异	首次从单细胞角度全面比较白癜风和黑色素瘤的免疫微环境，揭示两者在免疫激活与逃逸机制上的根本差异	样本来源和数量未明确说明，可能影响结果的普适性	解析白癜风和黑色素瘤免疫微环境的异同点	健康对照者、白癜风患者和黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据	数字病理学	皮肤病（白癜风和黑色素瘤）	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	未明确说明具体样本数量
412	2025-07-04	Nonhuman Primates Model of Super-selective Intraarterial Ophthalmic Arterial Interventional Thrombolysis for Treatment of Ophthalmic Arterial Embolism Resulting From Hyaluronic Acid Filler Cosmetic Injection 2025-Jul-02, Aesthetic surgery journal IF:3.0Q1 DOI:10.1093/asj/sjaf132 PMID:40601619	研究论文	本研究提出了一种非人灵长类动物的视网膜缺血再灌注模型，用于研究透明质酸填充剂美容注射导致的眼动脉栓塞的治疗方法	首次建立了非人灵长类动物眼动脉缺血再灌注的临床相关模型，并生成了缺血损伤的视网膜细胞图谱	研究仅使用恒河猴作为模型，可能无法完全模拟人类临床情况	验证动脉内溶栓治疗对透明质酸注射导致的视力障碍的有效性	恒河猴眼动脉栓塞模型	眼科研究	眼动脉栓塞	数字减影血管造影(DSA)、眼底荧光素血管造影(FFA)、视网膜电图(ERG)、苏木精-伊红(HE)染色、透射电子显微镜(TEM)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)	恒河猴动物模型	影像数据、电生理数据、组织学数据、单细胞测序数据	未明确说明具体样本数量，使用恒河猴作为研究对象
413	2025-07-04	Synovial tissue atlas in juvenile idiopathic arthritis reveals pathogenic niches associated with disease severity 2025-Jul-02, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adt6050 PMID:40601776	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序、多重免疫荧光和空间转录组学技术，构建了幼年特发性关节炎（JIA）滑膜组织的细胞图谱，揭示了与疾病严重程度相关的致病生态位	首次在治疗初期的JIA患儿中，通过多组学技术构建了滑膜组织的细胞图谱，并识别了与关节炎严重程度和疾病风险相关的效应细胞群	研究样本仅限于治疗初期的JIA患儿，可能无法代表疾病晚期或治疗后的情况	提高对幼年特发性关节炎滑膜炎症细胞基础的理解，以指导精准靶向治疗	幼年特发性关节炎（JIA）患儿的滑膜组织、滑液和外周血	数字病理学	幼年特发性关节炎	单细胞RNA测序、多重免疫荧光、空间转录组学	NA	基因表达数据、图像数据	未明确提及具体样本数量，但包括治疗初期的JIA患儿滑膜活检样本及匹配的滑液和外周血样本
414	2025-07-04	Inhibition of methylthioadenosine phosphorylase protects from experimental acute kidney injury 2025-Jul-02, American journal of physiology. Renal physiology DOI:10.1152/ajprenal.00138.2025 PMID:40602784	研究论文	本文研究了甲基硫腺苷磷酸化酶（MTAP）在小鼠实验性急性肾损伤（AKI）中的保护作用	首次提出MTAP抑制可作为AKI的潜在治疗靶点，并通过转录组分析和人类单细胞RNA-seq数据验证了其机制	研究仅基于小鼠模型和人类单细胞RNA-seq数据，尚未进行临床验证	探索MTAP在急性肾损伤中的作用及其潜在治疗价值	小鼠模型和人类肾脏细胞	生物医学	急性肾损伤	RNA-seq	小鼠缺血再灌注和顺铂诱导的AKI模型	基因表达数据	小鼠模型和人类单细胞RNA-seq数据
415	2025-07-04	Pathogenic mechanism of extracranial arteriovenous malformations: insights from clinical, pathological, and genetic analyses 2025-Jul-02, Virchows Archiv : an international journal of pathology IF:3.4Q1 DOI:10.1007/s00428-025-04158-7 PMID:40603544	研究论文	本研究通过临床、病理和遗传分析探讨了颅外动静脉畸形（AVMs）的致病机制	揭示了MAP2K1、KRAS和BRAF突变与AVMs的基因型-表型相关性，并发现MAP4K4在异常小血管中的高表达	样本量较小（30例患者），且为回顾性研究	阐明颅外AVMs的发病机制及其与基因突变的关系	30例颅外AVMs患者	血管病理学	动静脉畸形	免疫组织化学、空间转录组学	NA	临床数据、病理数据、遗传数据	30例颅外AVMs患者
416	2025-07-04	Pan-cancer multi-omics profiling of MS4A2 unveils its functional landscape in lung adenocarcinoma 2025-Jul-02, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000002903 PMID:40607924	research paper	该研究通过整合多组学数据，揭示了MS4A2在肺腺癌中的功能景观及其预后价值	首次在四种生存指标（OS/DSS/PFI/DFI）上全面评估了MS4A2在肺腺癌中的预后分层，并揭示了其通过双趋化因子极化调控免疫抑制微环境的机制	研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证MS4A2的功能机制	阐明MS4A2在肺腺癌中的功能角色和临床意义	肺腺癌（LUAD）患者	digital pathology	lung cancer	bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 甲基化表观遗传分析	Cox回归模型, Kaplan-Meier模型	转录组数据, 表观遗传数据, 药物敏感性数据	TCGA/GTEx数据库中的33种癌症数据及NSCLC队列的单细胞数据
417	2025-07-04	Single-cell transcriptomic analysis reveals therapeutic mechanisms of adipose-derived stem cell exosomes in sepsis-induced lung injury 2025-Jul-02, International journal of surgery (London, England) DOI:10.1097/JS9.0000000000002894 PMID:40607951	研究论文	本研究探讨了脂肪源性干细胞外泌体对脓毒症诱导的肺损伤的治疗效果及其潜在机制	首次使用单细胞转录组分析揭示ADSC外泌体通过调节免疫细胞功能和细胞间通讯网络治疗脓毒症肺损伤的新机制	样本量较小（每组仅2个样本进行单细胞RNA测序），且仅使用雄性小鼠模型	探索脓毒症诱导的急性肺损伤的新型治疗方法	脓毒症诱导的急性肺损伤小鼠模型	单细胞转录组学	脓毒症	单细胞RNA测序	小鼠盲肠结扎穿孔(CLP)模型	转录组数据	每组12只小鼠用于生存率分析，5只用于肺组织病理学分析，2只用于单细胞RNA测序
418	2025-07-04	FLI1 and GATA1 govern TLN1 transcription: new insights into FLI1-related platelet disorders 2025-Jul-01, Haematologica IF:8.2Q1 DOI:10.3324/haematol.2024.286372 PMID:39744817	研究论文	本研究旨在阐明FLI1变异对人类巨核细胞和血小板的影响，揭示了FLI1与GATA1在TLN1转录调控中的新机制	发现FLI1变异通过影响与GATA1的协同转录活性导致talin-1缺乏，从而影响血小板功能，并提出talin-1可作为FLI1变异致病性的生物标志物	研究仅针对四种FLI1变异，可能无法涵盖所有相关变异的影响	阐明FLI1变异导致血小板功能障碍的分子机制	人类巨核细胞和血小板	分子生物学	血小板功能障碍	单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、荧光素酶报告基因检测	NA	基因表达数据、蛋白质水平数据	患者巨核细胞和血小板样本
419	2025-07-04	Enhancing genetic transformation efficiency in cucurbit crops through AtGRF5 overexpression: Mechanistic insights and applications 2025-Jul, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1 DOI:10.1111/jipb.13912 PMID:40213927	研究论文	本研究通过过表达AtGRF5基因，提高了葫芦科作物的遗传转化效率，并揭示了其机制	发现AtGRF5过表达通过促进愈伤组织增殖和增加再生过程中的密集细胞来显著提高遗传转化效率，并开发了ABA诱导的AtGRF5表达系统以减少多效性影响	AtGRF5过表达可能引起生长缺陷，需要进一步优化以减少副作用	提高葫芦科作物的遗传转化效率并揭示其分子机制	葫芦科作物	植物遗传学	NA	DNSO方法、高分辨率时间序列转录组学、单细胞RNA测序、DAP-seq	NA	转录组数据、单细胞RNA测序数据	未明确说明具体样本数量
420	2025-07-04	C-COUNT: a convolutional neural network-based tool for automated scoring of erythroid colonies 2025-Jul, Experimental hematology IF:2.5Q3 DOI:10.1016/j.exphem.2025.104786 PMID:40287006	research paper	介绍了一种基于卷积神经网络的工具C-COUNT，用于自动评分红细胞集落	开发了C-COUNT工具，通过CNN自动识别和评分红细胞集落，提高了传统手动评分的效率和准确性	未明确说明工具在极端或复杂条件下的性能表现	提高红细胞集落形成实验（CFA）的评分效率和准确性	红细胞集落形成单位（CFU-e）	digital pathology	hematologic diseases	automated microscopy, convolutional neural network	CNN	image	未明确说明具体样本数量，但涉及多个实验条件下的红细胞集落