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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-06-08 |
Single-cell omics in tumor lymph node metastasis: mechanisms and therapeutic implications
2026-Feb-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-026-02585-x
PMID:41629958
|
综述 | 综述单细胞组学在肿瘤淋巴结转移机制及免疫治疗意义方面的研究成果 | 通过单细胞测序技术揭示肿瘤引流淋巴结在免疫治疗中的关键角色及其适应性改变 | 从技术及研究内容角度,提出了当前挑战及未来发展方向 | 总结肿瘤淋巴结转移的微环境及免疫抑制机制,综述相关新靶点及免疫治疗研究现状 | 肿瘤淋巴结转移过程中的肿瘤细胞、肿瘤引流淋巴结及其微环境 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 402 | 2026-06-08 |
BiCLUM: Bilateral contrastive learning for unpaired single-cell multi-omics integration
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013932
PMID:41632825
|
研究论文 | 提出BiCLUM双边对比学习方法,用于未配对单细胞多组学数据的整合 | 首次通过双边对比学习同时实现细胞级和特征级的跨模态对齐,并利用先验基因组知识将一种模态转换到另一种模态的数据空间 | 方法依赖先验基因组知识进行模态转换,可能限制其在缺失此类知识的场景下的适用性;未提及处理超过两种模态时的扩展性问题 | 开发一种鲁棒且可解释的未配对单细胞多组学数据整合方法 | 单细胞多组学数据,包括scRNA-seq、scATAC-seq和CITE-seq等 | 机器学习 | 不适用 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、CITE测序 | 对比学习 | 基因表达数据、染色质可及性数据、蛋白质丰度数据 | 不适用(未在标题和摘要中明确提及) | 不适用 | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 不适用 | 不适用 |
| 403 | 2026-06-08 |
A Comprehensive Analysis of Type I Interferon Risk Gene Signatures in Systemic Lupus Erythematosus
2026-Feb, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70211
PMID:41635152
|
研究论文 | 系统性红斑狼疮中I型干扰素风险基因标志的综合分析 | 通过孟德尔随机化分析首次确定HERC5、IFIT3、IFI44L和IFI6与SLE风险的因果关系,并发现IFI44L低甲基化是IFN-I通路激活的关键表观遗传驱动因素 | NA | 全面表征系统性红斑狼疮中I型干扰素风险基因标志及其因果关系 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞和单核细胞 | 机器学习 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据、临床参数、DNA甲基化数据 | 705例SLE患者和385509例对照(FinnGen队列),及外部验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 404 | 2026-06-08 |
Targeting the SIRT1-NAT10-GABABR1 Axis: A Novel Epitranscriptomic Approach to Mitigate Sevoflurane-Induced Cognitive Impairment in Aging
2026-Feb, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70762
PMID:41636018
|
研究论文 | 本研究探讨了SIRT1通过去乙酰化NAT10减少GABABR1 mRNA乙酰化,从而减轻七氟烷诱导老龄大鼠术后认知功能障碍的机制 | 首次揭示SIRT1-NAT10-GABABR1轴作为表观转录组调控新途径,通过去乙酰化NAT10降低GABABR1 mRNA ac4C修饰,恢复突触抑制与代谢-自噬平衡,为麻醉相关神经毒性提供全新治疗靶点 | 未明确说明 | 探索SIRT1通过调控NAT10介导的mRNA乙酰化及线粒体稳态,保护老龄大鼠免受七氟烷诱导的术后认知功能障碍 | 老龄大鼠七氟烷暴露模型及AAV介导Sirt1/Nat10操作的神经元亚群 | 数字病理学 | 老年性疾病 | NGS,单细胞RNA测序,RIP-qPCR,斑点印迹,膜片钳电生理记录 | NA | 基因表达数据,电生理数据,图像数据 | 老龄大鼠(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于鉴定神经元亚群 |
| 405 | 2026-06-08 |
Integrative single-cell analysis uncovers distinct tumour microenvironment ecotypes and immune evasion across skin cancers
2026-Feb, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70611
PMID:41636115
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组数据分析皮肤癌肿瘤微环境生态型及免疫逃逸机制 | 首次提出泛皮肤癌免疫重塑框架,鉴定出NARS2+NDUFC2+黑色素瘤细胞亚群及SPP1+巨噬细胞在免疫逃逸中的关键作用 | 单细胞数据样本量有限,功能验证主要基于体外实验,需进一步体内模型验证 | 揭示不同皮肤癌类型和进展阶段中肿瘤免疫生态系统的重塑模式及其对免疫逃逸和治疗抵抗的影响 | 皮肤癌患者样本(包括基底细胞癌、鳞状细胞癌、皮肤黑色素瘤和肢端黑色素瘤) | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序、CRISPR筛选、免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据、批量RNA测序数据 | 102个皮肤癌样本(包括癌旁正常皮肤、早期和晚期肿瘤) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 406 | 2026-06-08 |
Integrative Omics Analysis Reveals the Potential Value of CEACAM6 in Pan-Gastrointestinal Cancers
2026-Feb, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70327
PMID:41640009
|
研究论文 | 本研究利用多组学生物信息学方法探究CEACAM6在泛胃肠道癌症中的表达、预后价值及免疫功能 | 首次系统揭示CEACAM6在泛胃肠道癌症中的诊断准确性、肿瘤特异性过表达及空间转录组学定位特征,提出其作为精准免疫治疗靶点的潜力 | 未涉及实验验证,结论基于公共数据库的回顾性分析 | 评估CEACAM6在泛胃肠道癌症中的表达分布、预后价值和免疫功能 | 泛胃肠道癌症中的CEACAM6 | 计算机视觉 | 胃肠道癌症 | 多组学生物信息学、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、甲基化数据、突变数据、空间转录组数据 | TCGA、cBioPortal、GDSC2、TIMER2.0、TISCH数据库中的多人种样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 407 | 2026-06-08 |
Tissue-Derived Extracellular Vesicles Define Diagnostic Biomarkers for Renal Cell Carcinoma
2026-Feb, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70221
PMID:41656939
|
研究论文 | 通过分析组织来源的细胞外囊泡,确定了肾细胞癌不同亚型的诊断生物标志物 | 首次系统鉴定组织来源细胞外囊泡中用于区分不同肾细胞癌亚型的生物标志物,并结合单细胞测序揭示标志物来源细胞类型 | 外部验证队列规模有限,且未明确不同亚型标志物的分子机制 | 评估组织来源细胞外囊泡作为不同肾细胞癌亚型鉴别诊断标志物的价值 | 配对肿瘤与正常组织及其对应的组织来源细胞外囊泡 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞测序 | NA | RNA测序数据 | 配对肿瘤与正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 408 | 2026-06-08 |
Identification of Mitophagy-Related Genes With Diagnostic Value in Atherosclerosis Using Bioinformatics Analysis and Experiment Validation
2026-Feb, Chemical biology & drug design
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/cbdd.70260
PMID:41652980
|
研究论文 | 结合批量与单细胞RNA测序数据,分析了线粒体自噬相关基因在动脉粥样硬化中的诊断价值,并构建了诊断模型 | 首次整合批量与单细胞RNA测序数据系统分析动脉粥样硬化中线粒体自噬相关基因,并利用机器学习方法挖掘出四个关键基因构建诊断模型 | NA | 识别动脉粥样硬化中具有诊断价值的线粒体自噬相关基因,并揭示其分子机制 | 人类动脉粥样硬化斑块中的线粒体自噬相关基因及其表达失调 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA测序 | Random Forest, SVM-RFE | 基因表达数据 | 超过106,000个单细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 409 | 2026-06-08 |
Identification of potential drug targets for Alzheimer's disease from genetic insights: A Mendelian randomization study
2026-Jan-30, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000045715
PMID:41630303
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化研究从遗传学角度识别阿尔茨海默病的潜在药物靶点 | 首次联合孟德尔随机化分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络、分子对接和单细胞测序分析系统识别阿尔茨海默病的关键基因和潜在药物 | 研究依赖于公开的GWAS汇总统计数据,可能受限于原始数据的样本特征和混杂因素 | 探索血浆蛋白与阿尔茨海默病之间的因果关系并预测潜在药物靶点 | 阿尔茨海默病患者和对照组的血浆蛋白质组数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | NA | NA | 图像、文本 | 4907个血浆蛋白作为暴露因素,阿尔茨海默病作为结局 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2026-06-08 |
Calcified Artery Preparation and Processing with Preserved Morphology and RNA for Digital Spatial Profiling
2026-Jan-23, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69159
PMID:41662190
|
研究论文 | 提出一种针对钙化动脉的样本处理流程,保留形态和RNA完整性,用于数字空间分析 | 专门优化了钙化血管组织的处理流程,包括脱钙方法、组织微阵列构建和感兴趣区域选择策略,以克服血管组织用于空间转录组学的技术障碍 | 主要基于人类胫骨动脉样本,可能不适用于其他血管类型或钙化程度不同的样本 | 建立适用于钙化血管的空间转录组学样本制备协议,使科研人员能够获得层特异性基因表达数据 | 人类胫骨动脉(具有晚期病变) | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 图像 | 人类胫骨动脉样本(具体数量未提及) | NanoString Technologies | 空间转录组学 | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx DSP系统,结合组织微阵列和感兴趣区域选择策略 |
| 411 | 2026-06-08 |
BayesRare: Bayesian mixture model for population-level rare cell type detection in multi-subject single-cell RNA sequencing data
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag024
PMID:41632592
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研究论文 | 提出BayesRare层次贝叶斯框架,用于多受试者单细胞RNA测序数据中群体水平稀有细胞类型的检测 | 首次将贝叶斯混合模型与稀有簇指示器结合,实现跨受试者信息整合的稀有细胞类型联合聚类与识别,并量化不确定性 | 未明确说明具体局限性 | 开发一种能够利用跨受试者信息进行群体水平稀有细胞类型检测的统计方法 | 单细胞RNA测序数据中的稀有细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 412 | 2026-06-08 |
Cross-dataset transcriptomic analyses identify a conserved ENPP2+ macrophage-fibroblast activation axis in hypertrophic cardiomyopathy
2026-Jan-07, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag036
PMID:41642196
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研究论文 | 本研究通过跨数据集转录组分析,在肥厚型心肌病中鉴定出一个保守的ENPP2+巨噬细胞-成纤维细胞活化轴 | 首次通过跨数据集单核RNA测序和空间转录组学分析,揭示肥厚型心肌病中巨噬细胞向促炎表型转化并由ENPP2高表达驱动成纤维细胞活化的保守机制 | 机制验证主要基于初步的组织病理学和分子生物学实验,需要进一步功能研究确定ENPP2下游信号及其作为治疗靶点的可行性 | 阐明肥厚型心肌病中心肌纤维化的分子机制,特别是巨噬细胞转化为成纤维细胞活化的调控机制 | 肥厚型心肌病患者的心肌组织样本 | 数字病理学 | 肥厚型心肌病 | snRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 多个公开数据集(包括两种最常见突变类型的snRNA-seq数据、最大现有snRNA-seq和空间转录组学数据集) | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 413 | 2026-06-08 |
High-Resolution Laser Microdissection to Investigate Transcriptional States in Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Samples
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-5154-4_5
PMID:41629710
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研究论文 | 本文描述了如何利用高分辨率激光显微切割结合RNA测序分析福尔马林固定石蜡包埋样本中的转录状态 | 强调激光显微切割在空间转录组学中仍具有高空间分辨率和成本效益的优势,尤其适用于FFPE样本和回顾性研究 | 未明确提及,但可推断其通量低于新兴高通量空间转录组技术,且依赖精确的形态学注释 | 提供一种针对常规组织学样本(如FFPE)的稳健LMD-RNA-seq协议,用于揭示临床上相关的特定分子信息 | 福尔马林固定石蜡包埋的组织样本 | 数字病理学 | 未明确指定,但适用于多种疾病(如癌症) | 激光显微切割、RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 414 | 2026-06-08 |
Single-Cell Sequencing Reveals the Immunosuppressive Trajectory in the Tumor Microenvironment of Human Giant Cell Tumor of Bone
2026, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/9855803
PMID:41635288
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示人骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的免疫抑制轨迹 | 首次通过单细胞测序全面解析骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的细胞异质性和免疫抑制机制,识别出肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞和CD4+ T细胞的新亚型及其相互作用网络 | 样本量较小(7091个细胞),且未进行功能验证实验 | 阐明骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的免疫抑制机制及细胞间相互作用 | 骨巨细胞瘤肿瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 单细胞测序 | 骨巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 7091个细胞,来源于骨巨细胞瘤手术切除样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 415 | 2026-06-08 |
Spatial Analysis of Intraductal Papillary Mucinous Neoplasms Defines a Paradoxical Keratin 17-Positive, Low-Grade Epithelial Population Harboring Malignant Features
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101749
PMID:41638478
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研究论文 | 通过对导管内乳头状黏液性肿瘤进行空间转录组学分析,发现了一个表达恶性特征的角蛋白17阳性低级别上皮细胞亚群 | 首次在组织学低级别IPMN中发现一个表达恶性转录特征(包括KRT17、S100A10和CEACAM5)的上皮细胞亚群,并验证了该高风险基因特征 | NA | 研究IPMN进展过程中的转录变化,寻找更准确的风险分层标志物 | 包含从低级别不典型增生到癌变完整病程的IPMN患者组织样本,以及分支导管和主胰管IPMN活检样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序,免疫荧光染色 | NA | 图像数据,空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 包含完整病程的IPMN患者样本和外部空间转录组数据集中的多个IPMN样本 | Nanostring | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | Nanostring GeoMx | 使用Nanostring GeoMx进行空间转录组学分析,并对分支导管和主胰管IPMN活检样本进行单细胞RNA测序 |
| 416 | 2026-06-08 |
TIMELESS Promotes LUAD Growth via Suppressing Transferrin-Mediated Ferroptosis and Reprograms the Tumor Microenvironment against Anti-PD-1 Immunotherapy
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0009
PMID:41641368
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研究论文 | 本研究揭示TIMELESS通过抑制转铁蛋白介导的铁死亡促进肺腺癌生长并重编程肿瘤微环境对抗PD-1免疫治疗 | 首次阐明TIMELESS通过招募CNOT3加速TF mRNA降解抑制铁死亡、促进肺腺癌进展的分子机制,并发现TIMELESS/TF调控轴可作为潜在治疗靶点 | NA | 探讨高表达RBP TIMELESS在肺腺癌中的分子网络及其在肿瘤进展中的机制作用 | 肺腺癌细胞系及原位肺癌小鼠模型 | 机器学习和数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 光激活核糖核苷增强交联免疫沉淀测序, 免疫共沉淀-质谱, GST pull-down, RNA免疫沉淀, 流式细胞术, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 组织微阵列图像 | TCGA-LUAD, GEO, scRNA-seq数据集;组织微阵列样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 417 | 2026-06-08 |
Multi-omics analysis reveals STING activation mediates NLRP3-related pyroptosis and exacerbates myocardial ischemia-reperfusion injury
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0341839
PMID:41650015
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示STING激活介导NLRP3相关细胞焦亡并加重心肌缺血再灌注损伤 | 首次结合转录组学、蛋白质组学和单细胞转录组学,全面解析STING激活在心肌缺血再灌注损伤中通过NLRP3炎症小体介导细胞焦亡的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,需进一步在临床样本中验证STING-NLRP3轴的病理作用 | 阐明STING激活在心肌缺血再灌注损伤中促进NLRP3相关细胞焦亡的分子机制 | 小鼠心肌缺血再灌注模型和人心肌细胞缺氧/复氧模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 氧化应激检测 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠心肌组织样本和人类心肌细胞培养样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 418 | 2026-06-08 |
A multifaceted analysis of OTUD5 integrated MAVS in innate immunity of Primary Biliary Cholangitis
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0342306
PMID:41650163
|
研究论文 | 通过多层面分析揭示了OTUD5整合MAVS在原发性胆汁性胆管炎先天免疫中的作用 | 首次系统探讨OTUD5与MAVS在PBC免疫机制中的相互作用,结合单细胞转录组和蛋白组学分析,识别出单核巨噬细胞亚群11作为关键效应细胞 | RNA干扰实验仅在RAW264.7细胞系进行,未在人体原代细胞或动物模型中验证;样本量较小(16例患者vs 10例对照),可能限制结果的普适性 | 阐明OTUD5在PBC发病机制中的分子作用,为靶向治疗策略开发提供依据 | 原发性胆汁性胆管炎(PBC)患者的外周血和肝组织样本 | 生物信息学、免疫学 | 原发性胆汁性胆管炎 | 微阵列芯片、RT-qPCR、免疫荧光、蛋白组学分析(STRING/InBio Discover)、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质互作数据、单细胞转录组数据 | 16例PBC患者和10例健康对照的外周血和肝组织样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina测序平台 | 基于GEO数据集的微阵列芯片平台,单细胞RNA测序平台(未明确具体型号) |
| 419 | 2026-06-08 |
Investigating the Role of TNFSF12 in Thyroid Cancer Progression via Single-Cell RNA Sequencing and Integrated Multiomics Analyses
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/4753653
PMID:41930700
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和整合多组学分析,研究TNFSF12在甲状腺癌进展中的作用 | 首次通过整合单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化和功能验证,发现一个肿瘤特异性髓系亚群(C5)并鉴定出MERTK、MSR1和TNFSF12三个枢纽基因,其中TNFSF12被证实为背景依赖性癌基因 | 研究样本量可能有限,功能验证仅在甲状腺癌细胞系中进行,缺乏体内实验验证 | 鉴定并验证驱动甲状腺癌进展的关键髓系衍生基因 | 甲状腺癌组织样本及甲状腺癌细胞系 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、高维加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、qPCR、CCK-8、集落形成、Transwell实验 | NA | 图像、文本 | 甲状腺癌组织样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 420 | 2026-06-08 |
Aberrant IL-21/STAT3 signaling disrupts regulatory T cell function and CD4+ T cell homeostasis in children with type 1 diabetes
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1791993
PMID:42233023
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研究论文 | 本研究揭示了IL-21/STAT3信号通路异常激活导致1型糖尿病儿童调节性T细胞功能受损和CD4+ T细胞稳态失衡的机制 | 首次在单细胞水平解析IL-21/STAT3通路在儿童1型糖尿病T细胞亚群失衡中的免疫调节作用,并验证STAT3抑制剂的治疗潜力 | 体外实验主要基于原代细胞,体内实验仅使用NOD小鼠模型,尚需在人体中进一步验证临床转化价值 | 阐明IL-21/STAT3信号通路在儿童1型糖尿病T细胞免疫失衡中的分子机制 | 儿童1型糖尿病患者的外周血单核细胞及非肥胖糖尿病小鼠 | 数字病理学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、药理学抑制实验 | 无特定模型类型 | 单细胞转录组数据 | 儿童1型糖尿病患者样本(具体数量未提供),NOD小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |