单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 32324 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2025-11-03 |
Endothelial cell-ILC3 crosstalk via the ET-1/EDNRA axis promotes NKp46+ILC3 glycolysis to alleviate intestinal inflammation
2025-Nov, Cellular & molecular immunology
IF:21.8Q1
DOI:10.1038/s41423-025-01345-z
PMID:40931105
|
研究论文 | 本研究首次揭示肠道内皮细胞通过ET-1/EDNRA轴与ILC3细胞互作，促进NKp46+ILC3糖酵解代谢以缓解肠道炎症 | 首次发现肠道内皮细胞与ILC3细胞通过ET-1/EDNRA信号轴进行交流，并阐明该通路通过调控HIF-1α促进糖酵解代谢的分子机制 | NA | 探究肠道内皮细胞与ILC3细胞间的相互作用机制及其在肠道炎症调控中的作用 | 肠道内皮细胞、第3组固有淋巴细胞(ILC3)、NKp46+ILC3亚群 | 免疫学 | 肠道炎症 | 单细胞转录组分析、蛋白表达检测 | NA | 转录组数据、蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 402 | 2025-11-03 |
Endothelial βII Spectrin Deletion Exacerbates Inflammation and Impairs Tissue Regeneration in Ischemic-Diabetic Skin Wound Healing
2025 Nov-Dec, Wound repair and regeneration : official publication of the Wound Healing Society [and] the European Tissue Repair Society
IF:3.8Q1
DOI:10.1111/wrr.70103
PMID:41157851
|
研究论文 | 本研究探讨了内皮细胞βII血影蛋白在糖尿病缺血性皮肤伤口愈合中的作用机制 | 首次发现βII血影蛋白通过调节炎症反应而非血管生成影响糖尿病伤口愈合 | 研究仅使用小鼠模型和HUVECs细胞，尚未在人体组织验证 | 阐明βII血影蛋白在糖尿病伤口愈合中的分子机制 | 糖尿病小鼠模型和人脐静脉内皮细胞(HUVECs) | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序，基因敲除，组织染色 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织学图像 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 403 | 2025-11-03 |
Single-Cell Transcriptome Atlas and Dynamic Regulatory Mechanisms of Anther Development in Alfalfa (Medicago sativa L.)
2025-Nov, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70276
PMID:40729546
|
研究论文 | 构建了紫花苜蓿花药首个单细胞转录组图谱，揭示了花药发育过程中的细胞类型特异性基因表达和动态调控机制 | 首次构建紫花苜蓿花药单细胞转录组图谱，发现绒毡层在四分体期的快速功能转换，鉴定出MsKIN14P、ERF3和ERF025等关键调控因子 | NA | 解析紫花苜蓿花药发育的单细胞转录景观和动态调控机制 | 紫花苜蓿花药中的各种特化细胞类型，特别是绒毡层和小孢子 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 404 | 2025-11-03 |
SMAD7-mediated ferroptosis in macrophages drives osteoporosis progression: A multi-omics study
2025-Nov, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.08.021
PMID:40897147
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现SMAD7介导的巨噬细胞铁死亡是骨质疏松进展的关键机制 | 首次揭示SMAD7通过调控巨噬细胞铁死亡驱动骨质疏松的分子机制，并验证SMAD7抑制剂mongersen的治疗潜力 | 研究主要基于细胞系和生物信息学分析，需要更多体内实验验证 | 探索巨噬细胞在骨质疏松发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 骨质疏松患者样本、RAW264.7巨噬细胞系 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | RNA-seq, scRNA-seq, 生物信息学分析, 免疫组化, micro-CT | 人工神经网络, 机器学习算法 | 基因表达数据, 影像数据, 蛋白质相互作用数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 405 | 2025-11-03 |
Pancreatic hypersecretion of amyloid-forming human amylin dysregulates the neuro-immune axis and B cell development in a model of type-2 diabetes
2025-Nov, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107153
PMID:41135632
|
研究论文 | 本研究探讨了2型糖尿病中胰腺分泌的淀粉样人胰岛淀粉样多肽如何通过CXCL12/CXCR4信号轴导致外周和神经免疫系统失调 | 首次揭示淀粉样人胰岛淀粉样多肽通过下调脑血管ICAM-1和上调前体B细胞CXCR4表达，导致免疫细胞脑部迁移障碍和B细胞发育缺陷的机制 | 动物模型研究结果需在人类中进一步验证，急性和慢性暴露效应的差异机制尚未完全阐明 | 探究2型糖尿病中胰腺人胰岛淀粉样多肽积累对免疫系统的调控机制 | 转基因大鼠和小鼠模型，以及2型糖尿病患者的单细胞测序数据 | 免疫学 | 2型糖尿病 | 单细胞测序 | 转基因动物模型 | 基因表达数据，免疫细胞计数数据 | 转基因大鼠和小鼠模型，2型糖尿病患者单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 406 | 2025-11-03 |
Single-cell transcriptional decoding of iron deficiency responses in maize root tips
2025-Nov-01, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03649-w
PMID:41175233
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了玉米根尖在铁充足和铁缺乏条件下的转录图谱，揭示了细胞类型特异性的铁缺乏响应机制 | 首次在单细胞分辨率下解析玉米根尖对铁缺乏的转录响应，发现皮层功能重编程和分布式调控网络协调铁缺乏响应 | 研究仅关注V3阶段初生根，未涵盖其他发育阶段或根型；功能验证实验有限 | 解析玉米根尖在铁缺乏条件下的细胞类型特异性转录响应机制 | 玉米根尖细胞 | 植物生物学，单细胞转录组学 | 营养缺乏症 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，系统发育分析，加权基因共表达网络分析，蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | WGCNA，PPI网络分析 | 单细胞转录组数据，批量转录组数据 | 15,306个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 407 | 2025-11-03 |
Single-cell omics for nutrition research: an emerging opportunity for human-centric investigations
2025-Nov-01, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2566387
PMID:41176166
|
综述 | 探讨单细胞组学技术在营养研究中的新兴应用及其推动人本营养研究的潜力 | 提出将单细胞组学技术与类器官和器官芯片等先进人类衍生系统相结合，实现生理相关背景下营养-细胞相互作用的机制研究 | 存在技术限制、模型选择困难和机构偏见等关键挑战 | 推进人本营养研究，揭示细胞特异性饮食反应和营养敏感通路 | 营养研究中的细胞类型特异性效应和个体间变异性 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞蛋白质组学、单细胞代谢组学 | NA | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 408 | 2025-11-03 |
Hspa8 modulation of immune responses mitigates ischemic brain injury
2025-Nov-01, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00359-x
PMID:41176589
|
研究论文 | 本研究探讨热休克蛋白A8在缺血性脑损伤后调节免疫细胞动态的作用机制 | 首次通过单细胞RNA测序等技术系统揭示Hspa8在调节中性粒细胞浸润和活性氧产生中的关键作用 | 研究主要基于实验模型，临床转化价值仍需进一步验证 | 阐明Hspa8在缺血性脑损伤免疫反应中的调控机制 | 缺血性脑损伤模型中的免疫细胞（T细胞、中性粒细胞、单核细胞） | 神经免疫学 | 缺血性脑损伤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质互作数据, 细胞表型数据 | 体外和体内缺血模型样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 409 | 2025-11-03 |
Systematic characterization of full-length RNA isoforms in human colorectal cancer at single-cell resolution
2025-Oct-31, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf049
PMID:40702779
|
研究论文 | 通过单细胞长读长RNA测序系统表征人类结直肠癌中的全长RNA亚型 | 首次在单细胞分辨率下使用高深度长读长scRNA-seq技术系统解析结直肠癌全长转录组，揭示不同分子亚型间的选择性剪接调控模式 | 样本量相对有限（12例患者），功能验证实验仍需进一步扩展 | 系统表征结直肠癌中全长RNA亚型的多样性及其在肿瘤发生中的作用 | 结直肠癌患者的结肠上皮细胞 | 单细胞转录组学 | 结直肠癌 | 长读长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12例结直肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 410 | 2025-11-03 |
Tumor-derived RAC1A159V mutation promotes an immunosuppressive microenvironment that represses response to immune checkpoint inhibitor
2025-Oct-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aea1212
PMID:41160695
|
研究论文 | 本研究揭示肿瘤来源的RAC1A159V突变通过激活mTORC1信号通路促进免疫抑制微环境，导致对免疫检查点抑制剂治疗产生抵抗 | 首次证明RAC1突变通过上调糖鞘脂生物合成激活mTORC1信号，进而改变肿瘤代谢和免疫细胞相互作用机制 | 研究主要基于基因编辑小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究RAC1突变如何影响肿瘤免疫微环境及免疫治疗反应 | 携带RAC1突变的肿瘤细胞和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 基因编辑、流式细胞术、单细胞RNA测序 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 411 | 2025-11-03 |
Circulating tumor cells as predictive biomarkers in the risk stratification of DCIS: Evidence of early dissemination
2025-Oct-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz0187
PMID:41160699
|
研究论文 | 本研究探讨循环肿瘤细胞作为DCIS风险分层预测生物标志物的潜力 | 首次在DCIS患者中系统研究CTC作为生物侵袭性指标，并通过单细胞RNA测序揭示早期播散证据 | 样本量较小(34例患者)，需要更大规模研究验证 | 改善DCIS患者风险分层，减少过度治疗 | 导管原位癌(DCIS)患者和健康对照 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 微流控技术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 34例DCIS患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 412 | 2025-11-03 |
Single-cell RNA-seq of small-intestinal neuroendocrine tumors reveals the cell of origin and gene expression of early tumor development
2025-Oct-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116500
PMID:41175375
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小肠神经内分泌肿瘤的细胞起源和早期肿瘤发育的基因表达轨迹 | 首次识别出位于隐窝+4位置及以下的CES1(+)、LCN15(-)肠嗜铬细胞亚群作为SI-NET的推定起源细胞，并发现PRODH2作为前体细胞的关键生物标志物 | 研究主要基于遗传性SI-NET患者样本，可能不适用于散发性病例 | 阐明小肠神经内分泌肿瘤的细胞起源和早期发育机制 | 遗传性小肠神经内分泌肿瘤患者的多发性同步肿瘤和前体病变 | 单细胞组学 | 小肠神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 遗传性SI-NET患者的多发性肿瘤和前体样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 413 | 2025-11-03 |
Niche Environment Remodeling Promotes Long-Term Endometrium Stromal Stem Cell Engraftment and Tissue Regeneration in Thin Endometrium
2025-Oct-31, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2025.10.053
PMID:41176621
|
研究论文 | 通过改造干细胞微环境促进子宫内膜基质干细胞长期定植和薄型子宫内膜组织再生 | 首次提出通过免疫抑制和血管重建双重策略改造干细胞微环境，显著提高干细胞移植存活率 | 研究主要基于大鼠模型，人类临床应用效果需进一步验证 | 开发治疗薄型子宫内膜的新型干细胞疗法 | 大鼠薄型子宫内膜模型和人类子宫内膜基质干细胞 | 再生医学 | 子宫内膜疾病 | 单细胞RNA测序，mRNA工程，异种移植模型 | 动物模型 | 基因表达数据，病理学数据 | 大鼠模型和人类干细胞异种移植实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 414 | 2025-11-03 |
Clonally expanded effector CD4+ cytotoxic T lymphocytes are associated with severe neurological adverse events after immune checkpoint inhibitor therapy
2025-Oct-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012350
PMID:41167637
|
研究论文 | 本研究通过单细胞基因组学分析揭示了免疫检查点抑制剂治疗后严重神经系统不良事件与克隆扩增的CD4+细胞毒性T淋巴细胞之间的关联 | 首次在单细胞水平上识别出与n-irAEs特异性相关的CD4+ CTL克隆扩增及其效应基因表达谱 | 样本量较小（仅17例患者），且仅分析了外周血细胞而未直接研究中枢神经系统 | 探究免疫检查点抑制剂诱导的神经系统不良事件的免疫学机制和风险因素 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者，包括8例急性神经毒性患者 | 单细胞基因组学 | 癌症治疗相关神经系统不良事件 | 单细胞RNA测序，T细胞受体谱分析 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据，TCR序列数据 | 17例癌症患者（8例n-irAEs患者），共186,435个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 415 | 2025-11-03 |
A spatial transcriptomics dataset of the endometrium from repeated implantation failure patients
2025-Oct-29, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05995-6
PMID:41162434
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术分析了正常个体和反复种植失败患者子宫内膜组织的空间基因表达特征 | 首次构建了正常和反复种植失败条件下子宫内膜组织的空间转录组图谱 | 样本量较小（仅8个组织样本），仅研究了黄体中期阶段 | 探究反复种植失败患者子宫内膜组织的空间转录组特征 | 4名正常个体和4名反复种植失败患者的子宫内膜组织 | 空间转录组学 | 生殖系统疾病 | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | 8个子宫内膜组织样本（4个正常对照，4个RIF患者） | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 416 | 2025-11-03 |
Implication of an exosome-based gene signature for estimating clinical outcomes of triple-negative breast cancer and assisting in individualized therapy
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-16751-6
PMID:41162433
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于外泌体基因特征的三阴性乳腺癌预后评估模型 | 首次构建基于外泌体相关基因的TNBC预后特征模型，并发现FAM129B作为潜在治疗靶点 | 研究样本量未明确说明，需要进一步临床验证 | 开发三阴性乳腺癌预后评估工具并指导个体化治疗 | 三阴性乳腺癌患者和TNBC细胞系(MDA-MB-231, MDA-MB-468) | 生物信息学 | 三阴性乳腺癌 | LASSO分析, 转录组学, 基因突变分析, siRNA转染, EdU检测, 伤口愈合实验 | LASSO回归模型 | 转录组数据, 基因突变数据, 实验数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 417 | 2025-11-03 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomics identify RELB, S100A9, and SOCS1 as key autophagy-endoplasmic reticulum stress genes linking T2DM with MAFLD
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21641-y
PMID:41162503
|
研究论文 | 通过整合批量转录组和单细胞转录组分析，鉴定出RELB、S100A9和SOCS1作为连接2型糖尿病与代谢相关脂肪性肝病的关键自噬-内质网应激基因 | 首次整合批量转录组、单细胞转录组分析和实验验证，系统揭示T2DM与MAFLD的共同分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型验证，需要在人类临床样本中进一步验证 | 揭示2型糖尿病与代谢相关脂肪性肝病之间的共同分子机制 | 基因表达数据、大鼠模型肝组织 | 生物信息学 | 2型糖尿病, 代谢相关脂肪性肝病 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 免疫组织化学 | 机器学习, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 四个GEO数据集, T2DM伴MAFLD大鼠模型 | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 418 | 2025-11-03 |
The role of miR-21 in early-stage lung adenocarcinoma: clinical and bioinformatics insights
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21742-8
PMID:41162544
|
研究论文 | 本研究探讨miR-21在早期肺腺癌中的临床意义及其分子机制 | 结合临床样本与生物信息学分析，系统揭示miR-21在肺腺癌中的调控网络和预后价值 | 样本量有限（50例患者），主要依赖公共数据库验证 | 识别肺腺癌发病机制中的关键miRNA和基因 | 早期肺腺癌患者和健康对照者 | 生物信息学 | 肺癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 生物信息学分析, 免疫组化 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | 50例早期肺腺癌患者和50例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 419 | 2025-11-03 |
Targeting LAG3 to alter the tumor immune reactivity of CD8+T cells is a potential therapy for skin cutaneous melanoma
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22377-5
PMID:41162565
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序分析，揭示了CD8+T细胞在皮肤黑色素瘤中的功能异质性，并证明LAG3抑制可抑制肿瘤增殖和转移 | 首次将CD8+T细胞分为CD8+LAG3+T细胞和CD8+LAG3-T细胞两个亚群，并证实LAG3抑制剂ZYF0033和单克隆抗体Miptenalimab能显著增强免疫细胞浸润并抑制肿瘤进展 | 研究主要在鼠类模型中进行，需要进一步临床验证；CD8+T细胞在SKCM中的具体作用机制仍需深入探索 | 探索CD8+T细胞在皮肤黑色素瘤免疫治疗中的作用和机制 | 皮肤黑色素瘤( SKCM )中的CD8+T细胞亚群 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 细胞间通讯分析, 差异基因表达分析, 免疫浸润分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 420 | 2025-11-03 |
A prognostic risk prediction model for gastric cancer based on the EFNA4 and ETS1 regulatory axis in tumor cells
2025-Oct-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21728-6
PMID:41162582
|
研究论文 | 基于EFNA4和ETS1调控轴构建胃癌预后风险预测模型 | 首次发现EFNA4和ETS1在胃癌中的表达模式，并构建基于肿瘤细胞特征的整合预后模型 | EFNA4高表达与良好预后的矛盾机制尚未完全阐明，需要进一步探索 | 开发胃癌预后风险预测模型 | 胃癌组织和相关基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | 风险特征模型 | 基因表达数据 | 373个TCGA-STAD数据集样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |