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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-06-09 |
miRNA regulation in brain tissue space: the 3'UTR perspective
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080850.125
PMID:41672779
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综述 | 本文探讨了microRNA在脑组织空间中的调控作用，特别是从3'UTR的视角，总结了当前空间定量miRNA和3'UTR的实验与计算方法 | 首次从3'UTR视角系统探讨miRNA在脑组织空间中的调控，并指出当前没有方法能同时空间定量miRNA及其靶标3'UTR | 目前尚无方法可同时空间定量miRNA和3'UTR，且3'UTR亚型在空间中的变化尚未被充分探索 | 讨论miRNA在脑组织空间中的调控机制，重点关注神经发育和神经元功能 | 脑组织中的miRNA和3'UTR | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 402 | 2026-06-09 |
Downregulated lysyl oxidase in plasma extracellular vesicles: a biomarker linked to brain metastasis risk in lung adenocarcinoma
2026-Mar-12, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04785-0
PMID:41814259
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研究论文 | 通过多组学分析发现肺腺癌脑转移患者血浆细胞外囊泡中赖氨酰氧化酶（LOX）下调，可作为非侵入性生物标志物 | 首次系统证明血浆细胞外囊泡来源的LOX蛋白可作为肺腺癌脑转移的非侵入性生物标志物，并提出PI3K/AKT-LOX-细胞外基质调控轴假说 | 提出了一种基于多组学验证策略的标志物发现框架，但LOX下调机制及临床转化价值仍需进一步验证 | 鉴定与肺腺癌脑转移相关的血浆细胞外囊泡蛋白标志物 | 59例IV期肺腺癌患者（30例脑转移 vs 29例非脑转移）的血浆细胞外囊泡 | 机器学习 | 肺癌 | 蛋白质组学，单细胞转录组学，酶联免疫吸附测定 | LASSO/RF/SVM | 蛋白质组学数据，单细胞转录组数据 | 发现队列59例，独立验证队列158例 | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2026-06-09 |
FGFR4 and HER2 co-expression is associated with the proinflammatory tumor microenvironment in HR + breast cancer
2026-Mar, Breast cancer (Tokyo, Japan)
DOI:10.1007/s12282-026-01833-8
PMID:41670928
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研究论文 | FGFR4与HER2共表达与HR+乳腺癌中促炎肿瘤微环境相关 | 首次在HR+乳腺癌中揭示FGFR4和HER2共表达与促炎肿瘤微环境的关联，提出免疫治疗潜力 | 样本量较小（94例），且未进一步探索重塑肿瘤免疫微环境的治疗策略 | 研究FGFR4在不同乳腺癌亚型中的分子特征，为潜在治疗策略提供依据 | 激素受体阳性（HR+）和阴性（HR-）乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 靶向基因表达谱分析（AmoyDx Master Panel），单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | 94例乳腺癌患者（53例HR+，41例HR-） | AmoyDx | 靶向基因表达谱分析，单细胞RNA测序 | AmoyDx Master Panel | NA |
| 404 | 2026-06-09 |
Protective role of early Tnfsf15 upregulation in limiting glomerular injury and proteinuria in experimental Alport Syndrome
2026-Mar, Journal of pharmacological sciences
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jphs.2026.01.005
PMID:41672640
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析Col4a5 G5X Alport小鼠模型，发现早期Tnfsf15上调在限制肾小球损伤和蛋白尿中的保护作用 | 首次在Alport综合征早期阶段通过单细胞测序发现Tnfsf15的保护性上调，并利用基因敲除小鼠模型验证其限制蛋白尿和肾小球损伤的功能 | 未具体说明研究局限性，但可能包括小鼠模型与人类疾病的差异、早期时间点选择的局限性等 | 探究Alport综合征早期分子变化及其在疾病发生中的作用，特别是Tnfsf15的功能 | Col4a5 G5X Alport小鼠模型（5周和8周龄）的肾小球细胞 | 数字病理学 | Alport综合征 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | Col4a5 G5X Alport小鼠，涉及Tnfsf15基因敲除后比较分析，具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 405 | 2026-06-09 |
Unveiling hidden variables in stressed bacteria
2026-Feb-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.116966
PMID:41671084
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评论 | 综述了细菌应激反应中表型异质性背后的隐藏变量，提出看似随机的现象实际由可测定的确定性因素驱动 | 将细菌应激反应中的表型变异从随机噪声重新定义为可预测的隐藏变量，整合了确定性因素和前沿技术视角 | 主要基于已有案例和观点论述，缺乏原创实验数据验证 | 揭示细菌应激反应中表型异质性的隐藏变量，推动预测微生物学发展 | 细菌细胞及其应激反应行为 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，微流控 | 机器学习 | 图像，文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析系统 |
| 406 | 2026-06-09 |
Predictive modeling of molecular activity underlying physical cell-cell interactions
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101301
PMID:41672069
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研究论文 | 提出Gloss预测建模框架，系统关联基因与通路活性至直接细胞间相互作用强度 | 首次将组套索回归应用于单细胞RNA测序数据，实现可解释的细胞间相互作用强度预测 | 未明确说明，但基于方法学论文特点，可能存在对复杂相互作用网络的简化假设 | 开发能系统性关联分子活性与物理细胞间相互作用的计算框架 | 小鼠肿瘤中髓系-T细胞相互作用及病毒感染中T细胞亚群间相互作用 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 组套索回归 | 基因表达数据 | 多项数据集，包括抗Ctla4免疫治疗小鼠肿瘤样本及病毒感染样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 407 | 2026-06-09 |
Microbiota-host interaction in colorectal cancer: emerging computational technology, multi-omics integration, and mechanisms
2026-Feb-23, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
综述 | 本文综述了结直肠癌中微生物群与宿主相互作用的机制，包括基因组不稳定性、转录和表观遗传重塑以及代谢重编程，并探讨了新兴计算技术、多组学整合和精准微生物组医学的应用 | 系统整合了多组学策略和计算工具在解析微生物群-宿主相互作用中的最新进展，并展望了人工智能驱动计算整合和精准微生物组医学在结直肠癌预防、诊断和治疗中的转化潜力 | 数据组成性、稀疏性和高维度等分析挑战仍阻碍有意义的结果解读 | 总结结直肠癌中微生物群与宿主相互作用的机制，并评估新兴计算技术和多组学整合方法在相关研究中的作用 | 结直肠癌相关的微生物群与宿主相互作用 | machine learning | 结直肠癌 | 高通量测序, 长读长测序, 细菌单细胞空间转录组学 | NA | 多组学数据（基因组、转录组、表观基因组、代谢组） | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 细菌单细胞空间转录组学（具体平台未明确提及） |
| 408 | 2026-06-09 |
RMzyme: regulations of RNA-modifying enzymes in humans
2026-Feb-12, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02568-2
PMID:41672979
|
研究论文 | 通过378个多组学数据集对人类RNA修饰酶进行大规模表征，并开发了RMzyme平台 | 首次通过整合基因组学、转录组学、单细胞转录组学、表观转录组学、蛋白质组学和翻译后修饰等多组学数据，对RNA修饰蛋白进行了大规模系统性表征，并建立了RMzyme综合平台 | 信息不足，无法提取 | 系统表征人类RNA修饰蛋白的调控和功能，并构建综合性资源平台 | 人类63种组织中的RNA修饰蛋白及其多组学数据 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 多组学整合分析，包括基因组学、转录组学、单细胞转录组学、表观转录组学、蛋白质组学和翻译后修饰分析 | 非负矩阵分解 | 多组学数据（基因组、转录组、蛋白质组、翻译后修饰） | 378个数据集，涵盖63种人体组织 | NA | NA | NA | NA |
| 409 | 2026-06-09 |
A dual-action nanoparticle approach for spinal cord injury treatment: ferroptosis inhibition, inflammation control, and Myelin preservation
2026-Feb-12, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04114-w
PMID:41673859
|
研究论文 | 提出一种双作用纳米颗粒策略，通过抑制铁死亡、控制炎症和保护髓鞘来治疗脊髓损伤 | 首次使用从黄精中提取的新型果聚糖包被硒纳米颗粒，通过绿色抗坏血酸盐介导的还原合成PRP@SeNPs，实现与单细胞RNA测序识别的硒补充时间窗口对齐的前载且持续释放特性 | 未提及具体局限性 | 开发一种无药物、生物相容性的纳米治疗策略，通过补充硒来缓解脊髓损伤后的继发性损伤机制并促进神经保护和髓鞘再生 | 脊髓损伤小鼠模型及细胞 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2026-06-09 |
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2026-Feb-12, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03994-3
PMID:41673899
|
研究论文 | PreTSA是一种高效计算模型，用于分析大规模单细胞和空间转录组数据中的时间和空间基因表达模式 | PreTSA在保持与现有先进方法一致结果的同时，显著缩短计算时间，为处理包含数百万细胞的数据集提供独特解决方案 | 未明确提及具体局限性 | 开发计算效率高的方法以分析大规模单细胞和空间转录组数据中的时间和空间基因表达模式 | 大规模单细胞和空间转录组数据中的时间与空间基因表达模式 | 机器学习 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包含数百万细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 411 | 2026-06-09 |
WAS Protein Deficiency Disrupts Memory B Cell Formation During Acute LCMV Infection
2026-Feb-11, Journal of clinical immunology
IF:7.2Q1
DOI:10.1007/s10875-026-01984-5
PMID:41670926
|
研究论文 | 研究WAS蛋白缺乏对急性LCMV感染期间记忆B细胞形成的影响 | 首次利用单细胞RNA测序揭示WAS蛋白缺乏促进非典型记忆B细胞形成并降低经典记忆B细胞比例 | 未完全阐明WAS蛋白调控记忆B细胞分化的分子机制 | 探究WAS蛋白缺乏对急性病毒感染中记忆B细胞分化的影响及机制 | WAS蛋白敲除小鼠在急性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒（LCMV）感染后的记忆B细胞 | 机器学习和单细胞测序 | Wiskott-Aldrich综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | LCMV感染后第11天的WASp敲除小鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 412 | 2026-06-09 |
Single-cell atlas of AML reveals age-related gene regulatory networks in t(8;21) AML
2026-Feb-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104978
PMID:41671045
|
研究论文 | 通过大规模整合已发表的单细胞RNA测序数据集，创建了AML单细胞转录组图谱，并揭示了t(8;21) AML中与年龄相关的基因调控网络 | 构建了迄今最大的人类AML单细胞数据资源（含748,679个细胞），并首次利用该图谱揭示t(8;21) AML中年龄相关的基因调控网络特征，发现BCLAF1作为有前景的预后指标 | 主要基于已发表数据的整合分析，缺乏前瞻性实验验证；年龄相关发现在t(8;21)亚型中验证，对其他AML亚型的推广性有待确认 | 研究急性髓系白血病中t(8;21)亚型与年龄相关的基因调控网络及其临床意义 | 来自159名AML患者和51名健康供体的748,679个细胞，以及t(8;21) AML患者的额外多组学数据集（scRNA-seq和scATAC-seq） | 数字病理学, 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | 基因调控网络 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 批量转录组数据 | 159名AML患者和51名健康供体（共748,679个细胞），来自20项研究；额外包含多组学数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 413 | 2026-06-09 |
KLHDC4 serves as a novel prognostic biomarker and drives tumor progression via PI3K/AKT signaling in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-39061-x
PMID:41673210
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研究论文 | 整合多组学数据系统评估KLHDC4在肾透明细胞癌中的临床意义和功能作用，并通过实验验证其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 首次揭示KLHDC4在肾透明细胞癌中通过PI3K/AKT信号通路驱动肿瘤进展，并鉴定为其独立预后标志物和治疗预测因子 | 未在更大规模队列或不同种族人群中验证，且KLHDC4抑制剂ledipasvir的临床有效性仍需深入研究 | 阐明KLHDC4在肾透明细胞癌中的临床相关性、功能作用和分子机制，评估其作为预后标志物和治疗靶点的价值 | 肾透明细胞癌肿瘤组织、细胞系及小鼠模型 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 蛋白质组学, Western blot, 分子对接 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个癌症类型数据集，具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 414 | 2026-06-09 |
Single-cell RNA-Seq reveals transcriptional heterogeneity in sepsis and down-regulation of SNHG5/miR-324-5p/CDK16 axis in T cells
2026-Feb-11, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-026-10136-9
PMID:41673232
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示脓毒症中转录异质性及T细胞中SNHG5/miR-324-5p/CDK16轴的下调 | 首次利用单细胞RNA测序绘制脓毒症患者外周血单核细胞图谱，并揭示SNHG5/miR-324-5p/CDK16轴在T细胞凋亡及T淋巴细胞减少中的作用 | 样本量较小（仅3名患者和3名健康对照），需进一步验证机制并扩大样本 | 研究脓毒症诱导T淋巴细胞减少的分子机制，降低脓毒症感染发病率和死亡率 | 脓毒症患者和健康志愿者的外周血单核细胞 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个样本（3名脓毒症患者和3名健康捐赠者） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3端测序 |
| 415 | 2026-06-09 |
Single-cell transcriptomics reveal mechanisms of skeletal muscle differentiation across duck embryonic development
2026-Feb-11, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09665-0
PMID:41673320
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示鸭胚胎发育过程中骨骼肌分化的机制 | 首次发现慢肌纤维可通过LEF1+亚型转分化成快肌纤维，并证明该过程在不同脊椎动物中保守 | 未提及具体局限性 | 探究鸭胚胎发育中骨骼肌纤维类型多样性的发育起源和调控机制 | 鸭胚胎发育过程中的骨骼肌 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium 单细胞3'测序 |
| 416 | 2026-06-09 |
M5C-driven stabilization of SERPINB5 promotes cervical cancer progression and chemotherapy resistance
2026-Feb-11, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08453-2
PMID:41673397
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研究论文 | 该研究首次生成了宫颈癌中碱基分辨率的m⁵C转录组图谱，揭示了m⁵C修饰通过稳定SERPINB5 mRNA促进宫颈癌进展和化疗耐药的新机制 | 首次在宫颈癌中绘制碱基分辨率的m⁵C转录组图谱，并发现m⁵C-SERPINB5轴作为驱动宫颈癌恶性进展和化疗耐药的核心机制 | 未提及具体限制 | 探究m⁵C修饰在宫颈癌进展和化疗耐药中的功能机制及治疗意义 | 宫颈癌组织和细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | RNA甲基化测序, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium用于空间转录组，10x Chromium单细胞3'用于单细胞RNA测序 |
| 417 | 2026-06-09 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals immunological mechanisms by which recombinant Echinococcus granulosus P29 protein alleviates airway inflammation in mice with allergic asthma
2026-Feb-11, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07256-w
PMID:41673792
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示重组细粒棘球蚴P29蛋白缓解过敏性哮喘小鼠气道炎症的免疫机制 | 首次利用单细胞转录组测序技术系统研究了重组Eg.P29蛋白对过敏性哮喘小鼠肺组织免疫细胞的影响，特别是发现Treg细胞中Lag3+Tnfrsf9+亚群的潜在免疫抑制作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，临床转化仍需进一步验证；未涉及人类样本或长期治疗效果评估 | 研究重组Eg.P29蛋白如何缓解过敏性哮喘小鼠的气道炎症及其免疫机制 | 过敏性哮喘小鼠和重组Eg.P29蛋白处理的过敏性哮喘小鼠 | 单细胞转录组学 | 过敏性哮喘 | 单细胞转录组测序、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、细胞因子微球阵列、细胞通讯分析 | NA | 单细胞基因表达数据、血清抗体水平、炎症因子水平 | 过敏性哮喘小鼠（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 418 | 2026-06-09 |
TCF21-WNT5A axis drives metastasis of colorectal cancer via stromal-tumor cell communication
2026-Feb-11, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07835-6
PMID:41673874
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析，揭示TCF21-WNT5A轴通过基质-肿瘤细胞通讯驱动结直肠癌转移的机制 | 首次发现TCF21在结直肠癌转移中的高表达及其通过调控WNT5A促进转移的机制，并鉴定了12个与结直肠癌肝转移相关的关键基因 | 研究主要基于公共数据库数据，需进一步在更多临床样本和动物模型中验证 | 阐明结直肠癌肝转移的分子机制并发现潜在治疗靶点 | 结直肠癌组织样本、HCT116细胞系及GEO数据库中的单细胞和批量RNA测序数据 | 机器学学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 正常、原发肿瘤和转移组织三组样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 419 | 2026-06-09 |
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2026-Feb, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013956
PMID:41671295
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研究论文 | 对空间转录组学中识别差异表达基因的统计方法进行比较研究，并提出基于广义估计方程的方法 | 提出广义估计方程框架替代Wilcoxon秩和检验，有效纳入空间相关性以降低假阳性率，并在模拟和真实数据中验证了其优越性 | 研究未评估方法在不同空间转录组平台或更大规模数据集上的泛化能力 | 开发更稳健的统计方法用于空间转录组数据中的差异表达分析 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 机器学习 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 空间转录组学 | 广义估计方程 | 基因表达数据 | 模拟数据集及乳腺癌、前列腺癌空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 420 | 2026-06-09 |
Environmental flame retardant EHDPP stabilizes EGFR to accelerate lung cancer progression: Integrated network toxicology, bioinformatics, and in vitro evidence
2026-Feb, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.119854
PMID:41671956
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研究论文 | 通过整合网络毒理学、生物信息学和体外实验，揭示环境阻燃剂EHDPP通过稳定EGFR加速肺癌进展的分子机制 | 首次阐明EHDPP通过与EGFR结合抑制其泛素化降解，稳定EGFR蛋白并部分激活下游PI3K-AKT信号通路，从而促进肺癌细胞增殖和迁移的分子机制 | 研究主要基于体外细胞模型和生物信息学分析，缺乏体内动物实验和临床样本验证 | 探究环境阻燃剂EHDPP促进肺癌进展的分子机制 | EHDPP、肺癌细胞（如A549等）、EGFR蛋白、PI3K-AKT信号通路 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络毒理学、分子对接、肿瘤生物信息学分析、单细胞RNA测序分析、体外细胞实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、分子对接数据 | 体外细胞模型，具体样本量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 公开的单细胞RNA测序数据 |