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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4161 | 2026-01-30 |
Multi-Omics Evidence Linking Depression to MASLD Risk via Inflammatory Immune Signaling
2026-Jan-13, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines14010174
PMID:41595706
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研究论文 | 本研究通过整合流行病学、遗传学、转录组学和单细胞RNA测序数据,提供了多组学证据,表明抑郁症通过炎症介导的免疫信号通路对代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)风险产生因果影响 | 首次采用多水平整合分析策略(流行病学、孟德尔随机化、转录组共表达网络、机器学习、单细胞测序)系统验证了抑郁症通过炎症免疫信号增加MASLD风险的因果通路,并识别出CCR1-CCL5轴作为潜在的性别特异性免疫机制 | 研究结果的稳定性受限于样本量,尤其是在单细胞数据分析部分 | 探索抑郁症是否增加MASLD风险,以及炎症是否介导这一效应 | 抑郁症与代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD) | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 单细胞RNA测序, GWAS, 转录组分析, 孟德尔随机化, 机器学习 | 机器学习, 加权基因共表达网络分析 | 流行病学数据, 遗传数据, 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 基于NHANES、GWAS、GEO和单细胞RNA测序数据集的多源数据,具体样本量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组学 | NA | NA |
| 4162 | 2026-01-30 |
Cancer-Associated Fibroblast Heterogeneity Shapes Prognosis and Immune Landscapes in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-Jan-09, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18020215
PMID:41595137
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了头颈部鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞的异质性,并评估了其与患者预后和免疫微环境的关系 | 首次在头颈部鳞状细胞癌中系统鉴定出6个CAF亚群,并发现炎症性CAF亚群相关的转录程序是患者生存的稳健标志物 | 进展无生存期预测显示出较大的队列依赖性,需要更多独立队列验证 | 表征CAF异质性并评估CAF亚群特异性转录程序的预后意义 | 头颈部鳞状细胞癌患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 预后风险模型 | 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 | TCGA HNSCC队列及独立验证数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4163 | 2026-01-30 |
Machine Learning Identifies Key Cells and Therapeutic Targets in Intervertebral Disc Degeneration: SASP-Driven Matrix Catabolism, Inflammation Amplification, and Metabolic Collapse
2026-Jan-07, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-025-02429-8
PMID:41501191
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,揭示了衰老相关分泌表型(SASP)在椎间盘退变(IVDD)进展中的作用,并识别出BMP2和MMP3作为核心调控靶点 | 整合单细胞RNA测序与批量RNA-seq数据,利用WGCNA和机器学习算法(LASSO、随机森林、Boruta)识别出BMP2和MMP3作为SASP信号的核心调控网络,并开发了基于这两个基因的SASP评分模型,同时通过药物筛选发现辛伐他汀作为BMP2/MMP3的双重抑制剂 | 研究主要基于转录组数据,可能未涵盖所有分子机制;动物模型的结果需在人类中进一步验证 | 探究椎间盘退变的细胞和分子机制,特别是SASP信号的作用,并寻找潜在治疗靶点 | 椎间盘退变(IVDD)中的髓核细胞(NPCs)亚型 | 机器学习 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序,批量RNA-seq | LASSO,随机森林,Boruta | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 4164 | 2026-01-30 |
Integrated Single-Cell and Bulk Transcriptomics Unveils Immune Profiles in Chick Erythroid Cells upon Avian Pathogenic Escherichia coli Infection
2026-Jan-07, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani16020179
PMID:41594369
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组学技术,揭示了鸡红细胞在禽致病性大肠杆菌感染下的免疫特征和亚群异质性 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘了鸡红细胞在感染状态下的免疫异质性,并识别了关键的免疫相关基因和转录因子调控网络 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平的功能验证;样本量相对有限;未深入探究不同亚群在免疫应答中的具体功能机制 | 探究鸡红细胞在禽致病性大肠杆菌感染下的免疫特征和细胞异质性 | 鸡红细胞 | 单细胞组学 | 禽致病性大肠杆菌感染 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类、伪时间分析、SCENIC分析 | 单细胞转录组数据、批量转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但包含感染组和对照组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4165 | 2026-01-30 |
Plant bZIPs in Root Environmental Adaptation: From Single-Cell Expression Atlas to Functional Insights
2026-Jan-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020568
PMID:41596219
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综述 | 本文综述了植物bZIP转录因子在根环境适应中的作用,结合单细胞表达图谱与功能遗传学,揭示了其调控机制及在培育气候适应性作物中的潜力 | 通过整合单细胞RNA测序技术,构建了根bZIPs的高分辨率表达图谱,并结合功能遗传学阐明了其在环境信号响应中的调控模块 | NA | 探讨植物bZIP转录因子在根环境适应中的调控功能及其在作物改良中的应用潜力 | 植物根中的bZIP转录因子及其在单细胞水平上的表达模式 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4166 | 2026-01-30 |
Chronic Kidney Disease in Metabolic Disease: Regulation of SGLT2 and Transcriptomic-Epigenetic Effects of Its Pharmacological Inhibition
2026-Jan-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27020589
PMID:41596241
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综述 | 本文综述了SGLT2在健康和代谢疾病中的表达与调控,以及SGLT2抑制剂在转录组和表观遗传层面的药理作用 | 整合了单细胞RNA测序数据,首次在人类中揭示了SGLT2抑制剂与肾小管代谢重编程及mTORC1抑制的关联 | 分子机制尚未完全阐明,且人类数据有限,主要依赖动物模型研究 | 探讨SGLT2在代谢疾病相关慢性肾病中的调控机制及其抑制剂的分子作用 | SGLT2的表达调控、SGLT2抑制剂的转录组与表观遗传效应 | NA | 慢性肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4167 | 2026-01-30 |
Linking Skin and Joint Inflammation in Psoriatic Arthritis through Shared CD8+ T Cell Clones
2026-Jan, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43286
PMID:40528683
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了银屑病关节炎中皮肤和关节炎症通过共享CD8+ T细胞克隆相连的机制 | 首次在银屑病关节炎中结合单细胞RNA测序和空间转录组学,系统比较皮肤和关节中CD8+ T细胞的表型、克隆性和细胞微环境,发现共享的T细胞克隆 | 样本量较小(n=6皮肤样本,n=5配对滑膜组织/滑液样本),空间转录组学数据仅来自一个配对样本和四个非配对样本,可能限制统计普适性 | 验证银屑病关节炎中皮肤和关节炎症在CD8+ T细胞表型和克隆性上是否相连 | 银屑病关节炎患者的皮肤、滑膜组织和滑液样本中的T细胞 | 单细胞组学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 6个皮肤样本,5个配对滑膜组织样本,5个配对滑液样本,1个配对皮肤和滑膜活检样本,4个非配对活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 4168 | 2026-01-30 |
Monocyte-Derived Macrophages-Synovial Fibroblasts Crosstalk Unravels Oncostatin Signaling Network as a Driver of Synovitis in Osteoarthritis
2026-Jan, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43299
PMID:40621694
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了骨关节炎中单核细胞来源巨噬细胞与滑膜成纤维细胞间的相互作用,并识别出Oncostatin M信号网络作为滑膜炎的关键驱动因素 | 识别了骨关节炎中三种具有不同基因特征和来源的巨噬细胞亚群,并首次将OSM/OSMR信号轴确定为招募巨噬细胞与成纤维细胞间交流的核心机制 | 研究样本量有限,仅包括小鼠模型和四名OA患者,且主要基于胶原酶诱导的OA模型,可能无法完全代表人类OA的复杂性 | 探究骨关节炎中巨噬细胞的异质性、起源、命运及其与基质微环境细胞的通讯网络 | 小鼠胶原酶诱导的OA模型中的滑膜细胞以及四名OA患者的CD14+巨噬细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,遗传命运图谱,成像质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 小鼠OA模型及四名OA患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4169 | 2026-01-30 |
A Single-Cell-Inspired Self-Enrichment Therapeutic Strategy Delays Intervertebral Disc Degeneration by Inhibiting Pyroptosis
2026-Jan, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202516405
PMID:41190793
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研究论文 | 本研究整合单细胞转录组学与临床验证,构建了椎间盘退变(IVDD)的全面细胞图谱,并开发了一种自富集纳米载体以靶向抑制细胞焦亡,从而延缓IVDD进展 | 结合单细胞测序发现纤维化屏障和STING介导的细胞焦亡关键机制,并创新性地设计了一种能催化过氧化氢产生不对称气泡推进、选择性穿透退变组织的自富集纳米载体 | NA | 阐明椎间盘退变的关键病理机制并开发靶向治疗策略 | 椎间盘退变组织、髓核细胞 | 数字病理学 | 椎间盘退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4170 | 2026-01-30 |
Endothelial Heterogeneity in Pulmonary Hypertension
2026-Jan, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.125.322482
PMID:41230600
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序揭示的肺内皮细胞异质性在肺动脉高压发病机制中的作用及靶向治疗策略 | 整合前沿技术探讨内皮异质性如何塑造肺动脉高压的疾病轨迹,为靶向内皮功能障碍的新型治疗策略开辟新途径 | NA | 阐明肺内皮细胞异质性在肺动脉高压血管重构中的作用机制并探索治疗新靶点 | 肺内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4171 | 2026-01-30 |
A low-level Cdkn1c/p57kip2 expression in spinal progenitors drives the transition from proliferative to neurogenic modes of division
2026-Jan, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00653-9
PMID:41361693
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-seq数据,揭示了细胞周期调节因子Cdkn1c在脊椎动物神经发生中调控从增殖性到神经源性分裂转变的关键作用 | 发现Cdkn1c在神经源性祖细胞中以低水平表达启动,并作为神经发生转变的双重驱动因子,其低表达控制祖细胞进入神经源性分裂模式,而高表达则介导子细胞周期退出 | 研究主要基于鸡胚胎神经管数据,可能需在其他脊椎动物模型中验证普遍性 | 探究脊椎动物神经发生过程中从对称增殖性到不对称神经源性分裂转变的调控机制 | 鸡胚胎神经管中的神经祖细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4172 | 2026-01-30 |
Single-Cell Transcriptome Meta-Analysis Reveals Epigenomic and Chromatin Dysregulation in Developing Neurons Derived From Human ESCs With 1q21.1 CNVs
2026-Jan, Autism research : official journal of the International Society for Autism Research
IF:5.3Q1
DOI:10.1002/aur.70156
PMID:41437869
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组元分析,揭示了人类胚胎干细胞中1q21.1拷贝数变异导致发育神经元表观基因组和染色质失调的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下,结合公共数据和内部疾病模型数据,通过元分析识别了与神经精神疾病相关的调控模块,并发现BPTF作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于体外模型(如脑类器官),可能无法完全模拟体内神经发育的复杂性 | 阐明复杂人类神经精神疾病的分子基础,特别是1q21.1拷贝数变异对神经元发育的影响 | 来自人类胚胎干细胞模型的发育神经元,重点关注1q21.1区域拷贝数变异 | 单细胞组学 | 自闭症谱系障碍、双相情感障碍、精神分裂症 | 单细胞转录组分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4173 | 2026-01-30 |
Exploring leaf variegation in Arabidopsis yellow variegated2 by single-cell RNA sequencing
2026-Jan, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70659
PMID:41557962
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研究论文 | 本研究首次利用单细胞RNA测序技术探索拟南芥yellow variegated2突变体的叶片杂色现象,揭示了FtsH8基因的斑块表达模式及其与叶绿体命运、活性氧调控和细胞周期的关联 | 首次在单细胞水平应用scRNA-seq研究叶片杂色,证实了FtsH8的斑块表达支持阈值模型,并揭示了白色区域形成通过抑制光合基因减少活性氧以促进细胞周期进展的新机制 | 研究仅针对拟南芥var2突变体,结果可能不直接适用于其他植物或杂色类型,且scRNA-seq技术本身存在捕获效率和基因检测灵敏度的限制 | 探究拟南芥叶片杂色现象的细胞分子机制,特别是遗传相同细胞表现型差异的原因 | 拟南芥yellow variegated2 (var2)突变体的叶片细胞 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4174 | 2026-01-30 |
Learning collective multicellular dynamics with an interacting mean field neural SDE model
2026-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013916
PMID:41564117
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研究论文 | 本文提出了一种名为scIMF的单细胞深度生成交互平均场模型,用于从时序单细胞RNA测序数据中学习集体多细胞动力学 | 利用McKean-Vlasov随机微分方程框架,结合细胞级注意力机制,首次在单细胞水平上建模非局部和非对称的细胞间相互作用 | 未明确说明模型在处理极大规模细胞群体时的计算效率,也未讨论对特定细胞类型相互作用的验证方法 | 开发能够整合细胞间相互作用的动态模型,以研究异质性多细胞系统的集体行为 | 时序单细胞RNA测序数据中的多细胞系统 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型、随机微分方程、注意力机制 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4175 | 2026-01-30 |
4R-tau seeding activity reveals molecular subtypes in progressive supranuclear palsy
2025-Dec-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67744-y
PMID:41476155
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研究论文 | 本研究通过分析进行性核上性麻痹(PSP)患者脑组织中不同分子形式的tau蛋白,揭示了tau种子活性与疾病分子异质性及临床异质性的关联 | 首次将tau种子活性(特别是高分子量tau组装体)与PSP的分子亚型联系起来,并发现高tau种子活性病例具有独特的免疫和代谢通路改变特征 | 未明确说明样本的具体数量或来源细节,且分子机制与临床症状的直接关联仍需进一步验证 | 探究PSP临床异质性的分子基础,并开发基于tau种子活性的患者分层方法 | 进行性核上性麻痹(PSP)患者脑组织,特别是初级运动皮层 | 神经退行性疾病研究 | 进行性核上性麻痹 | 生化检测、种子扩增试验、蛋白质组学分析、空间转录组学 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据、生化检测数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4176 | 2026-01-30 |
Unraveling the cellular characteristics of cardiomyopathy with rare variant-driven gene signatures using multi-omics analysis
2025-Dec-30, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-33901-y
PMID:41469780
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研究论文 | 本研究通过整合全基因组测序与单细胞转录组学数据,揭示了罕见变异驱动的基因特征在心肌病中的细胞特性与致病机制 | 首次将罕见变异(包括意义未明变异)与单细胞转录组学数据整合,系统解析了心肌病相关基因在心脏细胞异质性中的表达模式及细胞间互作网络 | 研究样本仅来自韩国人群,可能限制结论在其他人群中的普适性;单细胞数据来源于独立数据集,未与基因组数据直接配对 | 阐明罕见变异在心肌病发病机制中的作用,并揭示其在不同心脏细胞类型中的表达特征 | 245名韩国扩张型或肥厚型心肌病患者的心脏组织细胞 | 计算生物学 | 心肌病 | 全基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | 基因组序列数据, 单细胞转录组数据 | 245名患者(扩张型48.2%,肥厚型47.8%)及11,664个心脏组织细胞 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4177 | 2026-01-30 |
PET/CT-guided management of immune checkpoint blockade and multi-modal profiling following treatment in long-term responders with metastatic lung cancer in the National Network Genomic Medicine Lung Cancer Germany (nNGM)
2025-Dec-30, Annals of oncology : official journal of the European Society for Medical Oncology
IF:56.7Q1
DOI:10.1016/j.annonc.2025.12.011
PMID:41478526
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研究论文 | 本研究探讨了在转移性肺癌长期应答者中,基于PET/CT指导的免疫检查点阻断治疗管理策略的有效性,并通过多模态分析揭示了治疗后的耐药机制 | 首次在大型回顾性队列中评估PET/CT指导的ICB停药策略,结合基因组分析、组织学评估和空间转录组学探索晚期耐药机制,并发现第二原发性肺癌的高发生率 | 研究为回顾性设计,可能存在选择偏倚;样本量相对有限;需要前瞻性试验验证 | 确定免疫检查点阻断在肺癌长期应答者中的最佳治疗持续时间,并探索耐药机制 | 来自德国国家网络基因组医学肺癌网络的455名转移性肺癌患者,这些患者在接受一线ICB治疗后疾病控制时间≥2年 | 数字病理学 | 肺癌 | 综合基因组分析、组织肿瘤浸润淋巴细胞定量、空间转录组学 | NA | 临床数据、影像数据(PET/CT)、基因组数据、组织学数据 | 455名患者(队列A:126名,队列B:329名),匹配的治疗前后肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4178 | 2026-01-30 |
Revealing the Best Strategies for Rare Cell Type Detection in Multi-Sample Single-Cell Datasets
2025-Dec-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010031
PMID:41595450
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研究论文 | 本研究系统评估了多样本单细胞RNA测序数据中罕见细胞检测方法的性能,并比较了不同分析策略的效果 | 首次在多样本设置下对罕见细胞检测工具进行系统性基准测试,并识别出批校正合并样本检测为最优策略 | 仅评估了五种代表性工具,可能未涵盖所有现有方法;依赖于公开数据集,可能受数据质量和异质性限制 | 评估和比较多样本单细胞数据中罕见细胞检测方法的性能,以确定最有效的分析策略 | 单细胞RNA测序数据中的罕见细胞群体 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | Isolation Forest, 以及基于scGPT的方法 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公开可用的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4179 | 2026-01-30 |
Controllability of the gene regulatory network in zebrafish embryogenesis
2025-Dec-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-33869-9
PMID:41457100
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据重建斑马鱼胚胎发生过程中的基因调控网络,并分析其可控性 | 首次在斑马鱼胚胎发育全过程中重建基因调控网络,并发现网络可控性随发育进程增强,同时识别出关键转录因子 | 基于推断的基因调控网络可能不完全准确,且未考虑非转录因子调控机制 | 探究斑马鱼胚胎发生过程中基因调控网络的可控性 | 斑马鱼胚胎发育过程中的基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络可控性理论 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4180 | 2026-01-30 |
ATG7 dysfunction in senescent melanocytes and hypopigmented skin: Reversal by metformin
2025-Dec-26, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf529
PMID:41453137
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和时序转录组分析,揭示了自噬功能障碍是紫外线诱导黑素细胞衰老的早期关键事件,并发现二甲双胍可通过上调ATG7恢复自噬活性、延缓衰老 | 首次将ATG7下调确定为紫外线诱导黑素细胞衰老的最早期分子事件,并在特发性点状白斑皮肤中得到验证,同时提出二甲双胍作为通过恢复自噬延缓黑素细胞衰老的干预策略 | 研究主要基于体外UVB诱导的衰老模型和有限的患者皮肤样本,体内长期疗效和安全性尚未验证 | 识别黑素细胞衰老的早期分子事件,并评估预防黑素细胞老化的治疗策略 | UVB诱导的衰老黑素细胞、特发性点状白斑患者皮肤样本 | 单细胞组学 | 皮肤色素减退性疾病 | 单细胞RNA测序, 时序转录组分析, 免疫组化, 基因敲低/过表达 | NA | 单细胞转录组数据, 批量转录组数据, 蛋白质数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |