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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4141 | 2026-02-02 |
Multimodal analysis of TAAD pathogenesis: SHAP-enhanced interpretable models and single-cell sequencing analysis reveal immune microenvironment alterations
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1630404
PMID:41613150
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞转录组数据,结合机器学习算法和SHAP分析,揭示了SIX4、SCNN1B和PCDH11X作为TAAD的关键调控因子,并阐明了SIX4在血管平滑肌细胞可塑性和免疫微环境重塑中的作用 | 采用SHAP增强的可解释模型量化基因贡献,并整合批量与单细胞转录组数据揭示TAAD的分子机制和免疫微环境改变 | 研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 阐明TAAD的分子机制,识别可靠的生物标志物以改善诊断和指导靶向干预 | 斯坦福A型主动脉夹层(TAAD)患者样本及血管平滑肌细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 转录组测序,单细胞转录组测序,CCK-8实验,伤口愈合实验 | LASSO,随机森林,SVM-RFE | 转录组数据,单细胞转录组数据 | 整合了四个转录组数据集和两个单细胞转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4142 | 2026-02-02 |
The expression of mercaptopyruvate sulfurtransferase serves as a potential biomarker for prognostic stratification and immunotherapy in certain cancers
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1686443
PMID:41613530
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和临床样本验证,探讨了MPST基因在多种癌症中的表达、预后分层和免疫治疗潜力 | 首次对MPST基因进行全面的泛癌分析,结合单细胞测序数据揭示其在肿瘤免疫微环境中的功能状态 | 研究主要基于公共数据库和初步临床验证,需要更多实验和前瞻性研究来确认MPST作为生物标志物的临床适用性 | 评估MPST基因在癌症诊断、预后和免疫反应中的潜在影响 | 多种癌症类型,包括肺腺癌等 | 生物信息学 | 多种癌症 | 生物信息学分析,免疫组化染色,单细胞测序 | NA | 基因表达数据,DNA甲基化数据,蛋白质相互作用网络,临床样本图像 | 基于TCGA和HPA数据库的多种癌症样本,以及收集的临床组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4143 | 2026-02-02 |
Spatial transcriptome and single-cell sequencing reveal the role of nucleotide metabolism in breast cancer progression and tumor microenvironment
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1703778
PMID:41613532
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和空间转录组学技术,揭示了核苷酸代谢在乳腺癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 整合五种单细胞富集评分方法对乳腺癌细胞群进行综合分析,并利用空间转录组学数据映射单细胞簇,以区分肿瘤细胞亚型 | NA | 探索核苷酸代谢在乳腺癌细胞中的复杂性及其与肿瘤微环境的相互作用 | 乳腺癌细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4144 | 2026-02-02 |
DPCDI: an artificial intelligent-derived indicator interpreting the diagnostic, stratification, and therapeutic implications of druggability programmed cell death in heart failure
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1753636
PMID:41613752
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研究论文 | 本文开发了一种名为DPCDI的人工智能衍生指标,用于解释心力衰竭中可药物化程序性细胞死亡的诊断、分层和治疗意义 | 通过整合机器学习框架(Lasso和随机森林算法)识别了15个关键基因构建DPCDI,并结合非负矩阵因子分析、单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析和实验验证,为心力衰竭提供了全面的诊断、风险分层和靶向治疗开发框架 | NA | 开发一个指标以解释心力衰竭中可药物化程序性细胞死亡的诊断、分层和治疗意义 | 心力衰竭患者和HF小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 分子对接 | Lasso, 随机森林, 非负矩阵因子分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4145 | 2026-02-02 |
High glucose-induced PLCG1 histone acetylation to promote ferroptosis by LAMP2A/HSPA8 in a diabetic nephropathy model
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1640721
PMID:41614070
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研究论文 | 本研究探讨了高血糖诱导的PLCG1组蛋白乙酰化通过LAMP2A/HSPA8信号通路促进铁死亡,从而在糖尿病肾病模型中加速疾病进展 | 首次揭示了PLCG1通过组蛋白乙酰化调控LAMP2A/HSPA8信号通路,促进线粒体氧化应激和铁死亡,在糖尿病肾病中的新作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,缺乏大规模临床样本验证;单细胞RNA测序数据的分析深度可能有限 | 探究PLCG1在糖尿病肾病中的分子机制及其与铁死亡的关系 | 糖尿病肾病小鼠模型(C57BL/6小鼠)和高糖诱导的NRK-52E细胞 | 分子生物学与病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、组蛋白乙酰化检测、蛋白质印迹 | NA | RNA测序数据、蛋白质表达数据、临床生化指标 | 糖尿病肾病患者与正常对照组、小鼠模型、NRK-52E细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4146 | 2026-02-02 |
Insights Into Systemic Sclerosis from Gene Expression Profiling
2021-Sep, Current treatment options in rheumatology
IF:1.7Q3
DOI:10.1007/s40674-021-00183-0
PMID:41614080
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综述 | 本文综述了基因表达谱分析在系统性硬化症研究中的应用,特别是通过转录组学揭示疾病异质性、病因及治疗靶点 | 利用转录组学(包括bulk和单细胞技术)量化系统性硬化症的分子异质性,为个性化治疗提供数据驱动见解 | 疾病轨迹预测仍具挑战性,需进一步研究靶组织中的细胞和分子动态 | 通过基因表达谱分析提升对系统性硬化症分子异质性和治疗策略的理解 | 系统性硬化症患者 | 自然语言处理 | 系统性硬化症 | 转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4147 | 2026-01-30 |
Lycium barbarum polysaccharides enhance testicular spermatogenesis in d-galactose-induced aging rats via calcium signaling
2026-Feb, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70119
PMID:40939042
|
研究论文 | 本研究探讨了枸杞多糖如何通过调节钙信号通路改善d-半乳糖诱导的衰老大鼠睾丸精子发生功能 | 首次结合单细胞测序和多组学方法,系统揭示了枸杞多糖通过钙信号通路改善睾丸衰老的具体细胞机制 | 研究主要基于动物和细胞模型,尚未在人体中进行验证 | 探究枸杞多糖对d-半乳糖诱导的睾丸功能障碍的保护作用及其分子机制 | d-半乳糖诱导的衰老雄性大鼠和TM3细胞模型 | 生殖医学 | 老年性疾病 | 单细胞测序、多组学分析、组织学分析、SA-β-gal染色 | 动物模型、细胞模型 | 测序数据、组织图像、生化指标 | 未明确说明具体样本数量,但包括大鼠和细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4148 | 2026-01-30 |
Systemic activation and tissue infiltration of CD8 + CX3CR1 + T cells in non-small cell lung cancer treated with neoadjuvant immune checkpoint blockade
2026-Feb, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03160-9
PMID:41275012
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了CD8+CX3CR1+T细胞在非小细胞肺癌新辅助免疫检查点阻断治疗中的系统性激活和组织浸润特征 | 首次系统性地鉴定并表征了与NA-ICB治疗反应相关的CD8+CX3CR1+T细胞亚群,揭示了其在血液中的增殖动态、组织迁移路径以及向耗竭和细胞毒性NK样CD8+T细胞分化的轨迹 | 样本量相对有限(共40例患者),且为观察性研究,需要更大规模的前瞻性队列验证其作为生物标志物的预测价值 | 探究新辅助免疫检查点阻断治疗非小细胞肺癌时,哪些T细胞亚群发生扩增和功能重激活,及其组织起源、迁移模式和表型转换 | 26例接受NA-ICB治疗和14例未经治疗的NSCLC患者的肿瘤组织、配对正常肺组织及外周血样本 | 单细胞组学与免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, TCR repertoire分析, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞数据 | 40例NSCLC患者(26例治疗组,14例未治疗组)的肿瘤、正常肺组织和外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4149 | 2026-01-30 |
Single-cell transcriptional mapping of Mustn1 exhibits consistent mural cell localization across musculoskeletal tissues
2026-Feb, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf193
PMID:41522665
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学方法,系统性地绘制了Mustn1基因在肌肉骨骼组织中的表达图谱,并揭示了其在平滑肌肌动蛋白表达细胞中的一致定位 | 首次利用开源单细胞RNA测序数据集,采用自上而下的转录组学方法,在多种肌肉骨骼组织中系统性地绘制了Mustn1基因的表达图谱,并发现其与Acta2在血管周细胞中的共定位 | 研究依赖于已有的开源数据集,可能受限于数据质量和覆盖范围;未进行实验验证Mustn1蛋白的功能 | 探究Mustn1基因在肌肉骨骼组织中的表达模式和细胞定位 | 肌肉骨骼组织(骨、滑膜、肌肉、肌腱)中的细胞,特别是血管周细胞和Sox9谱系细胞 | 单细胞转录组学 | 肌肉骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4150 | 2026-01-30 |
Integrative Single-Cell Analysis Reveals Targetable Vacuole Membrane Protein 1-Mediated Mechanism of Tumor Angiogenesis in Glioblastoma
2026-Feb, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70619
PMID:41589276
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞分析揭示了VMP1在胶质母细胞瘤中促进肿瘤血管生成的非自噬功能机制 | 首次发现VMP1在胶质母细胞瘤中具有独立于自噬功能的促肿瘤生长作用,并揭示了其通过VEGFA-VEGFR2信号通路促进血管生成的新机制 | 研究主要基于胶质母细胞瘤模型,VMP1在其他癌症类型中的功能仍需进一步验证 | 探究VMP1在胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的非经典功能及其在血管生成中的作用机制 | 胶质母细胞瘤细胞、内皮细胞、小鼠模型 | 单细胞分析 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4151 | 2026-01-30 |
omnideconv: a unifying framework for using and benchmarking single-cell-informed deconvolution of bulk RNA-seq data
2026-Jan-26, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03955-w
PMID:41582216
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研究论文 | 本文提出了omnideconv框架,用于统一和基准测试基于单细胞RNA测序数据的批量RNA-seq数据去卷积方法 | 开发了一个统一的框架omnideconv,用于简化去卷积方法的应用、基准测试和优化,并全面评估了第二代工具的准确性、可扩展性和鲁棒性 | NA | 评估和优化基于单细胞RNA测序数据的批量RNA-seq数据去卷积方法的性能 | 批量RNA-seq数据的细胞类型去卷积 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4152 | 2026-01-30 |
CIPHER: An end-to-end framework for designing optimized aggregated spatial transcriptomics experiments
2026-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.08.698503
PMID:41542523
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CIPHER的端到端框架,用于设计优化的聚合空间转录组学实验,通过联合优化实验编码矩阵和下游细胞嵌入,提高细胞类型可分离性和解码准确性 | CIPHER首次将实验编码矩阵和下游细胞嵌入联合优化,并将成像检测的物理限制直接整合到损失函数中,从而在提高区分能力的同时保持对测量噪声和信号约束的鲁棒性 | NA | 开发一个计算框架,用于设计基于聚合测量的空间转录组学实验,以实现与单细胞RNA-seq数据的高效准确整合 | 小鼠大脑单细胞RNA-seq参考数据 | 空间转录组学 | NA | 聚合转录特征测量,单细胞RNA-seq | 神经网络 | 转录组数据,模拟数据,实验数据 | 大规模小鼠大脑scRNA-seq参考数据 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4153 | 2026-01-30 |
A dual-action core-shell microneedle system restores mitochondrial function and accelerates healing in diabetic wounds
2026-Jan-17, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04048-3
PMID:41547872
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研究论文 | 本文开发了一种用于治疗糖尿病伤口的新型核壳微针系统,通过顺序递送策略恢复线粒体功能并加速愈合 | 利用单细胞RNA测序识别了糖尿病伤口中上调的关键内皮靶点VDAC1,并设计了一种具有ROS响应外壳和光交联核心的双功能核壳微针系统,实现了抗氧化、抗菌与持续抑制VDAC1寡聚化的顺序治疗 | 研究主要基于动物模型(小鼠和猪),尚未进行人体临床试验;长期安全性和大规模生产可行性有待进一步评估 | 开发一种新型治疗平台,以解决糖尿病伤口愈合中由线粒体功能障碍和持续炎症导致的临床挑战 | 糖尿病伤口(小鼠和猪模型) | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 糖尿病小鼠和猪模型(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4154 | 2026-01-30 |
Prognostic significance and immune landscape of anoikis-related genes in hepatocellular carcinoma: a multi-omics analysis of subtypes and cellular communication
2026-Jan-16, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-026-02043-4
PMID:41543595
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索了失巢凋亡相关基因在肝细胞癌中的预后意义和免疫景观,构建了预后模型并识别了两种可靠的HCC亚型 | 首次结合失巢凋亡相关基因、多组学分析和单细胞RNA测序数据,系统研究其在HCC中的预后价值和细胞间通讯机制 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于HCC细胞系,缺乏临床样本的直接验证 | 开发肝细胞癌的预后生物标志物并探索其免疫微环境特征 | 肝细胞癌患者数据、HCC细胞系(HepG2和LO2) | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析、qRT-PCR、Western blot、单细胞RNA测序 | 预后模型 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4155 | 2026-01-30 |
FOXM1 regulates platelet-induced anoikis resistance in pancreatic cancer cells
2026-Jan-14, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02644-8
PMID:41535944
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研究论文 | 本研究探讨了血小板通过调控FOXM1基因表达增强胰腺癌细胞失巢凋亡抵抗的机制 | 首次在胰腺癌细胞中揭示血小板通过激活AKT信号通路上调FOXM1表达来促进失巢凋亡抵抗的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证;样本量有限且仅针对特定胰腺癌细胞系 | 探究血小板如何调控胰腺癌细胞的失巢凋亡抵抗及其分子机制 | 胰腺癌细胞系 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | RNA测序、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确样本数量,使用胰腺癌细胞系进行实验 | NA | 单细胞RNA测序、转录组分析 | NA | NA |
| 4156 | 2026-01-30 |
Single-cell and multi-omic characterization of ex vivo expanded ASTRLs from stable kidney transplant recipients reveals a regulatory T cell phenotype
2026-Jan-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-33656-6
PMID:41535376
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、流式细胞术和质谱流式细胞术,详细表征了从稳定肾移植受者外周血单个核细胞中扩增的异质性抗原特异性T细胞富集调节细胞系(ASTRL),揭示了其获得调节性T细胞表型 | 首次结合单细胞和多组学技术对肾移植受者中扩增的ASTRL进行深入表征,发现其在供体抗原刺激下获得调节性T细胞转录组特征,为器官移植中的调节性细胞疗法开发提供了新见解 | 研究基于体外扩增模型,可能无法完全反映体内环境;样本来源仅限于稳定肾移植受者,缺乏疾病状态或健康对照的比较 | 探究ex vivo扩增的抗原特异性T细胞富集调节细胞系(ASTRL)在肾移植受者中的表型和功能特征,以评估其作为调节性细胞疗法的潜力 | 从稳定肾移植受者外周血单个核细胞(PBMC)中扩增的ASTRL细胞系 | 单细胞组学 | 肾移植 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术, 质谱流式细胞术(mass cytometry) | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 从稳定肾移植受者PBMC中扩增的ASTRL细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4157 | 2026-01-30 |
Long-Read Spatial Transcriptomics of Patient-Derived Clear Cell Renal Cell Carcinoma Organoids Identifies Heterogeneity and Transcriptional Remodelling Following NUC-7738 Treatment
2026-Jan-14, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18020254
PMID:41595180
|
研究论文 | 本研究结合长读长空间转录组学与患者来源的透明细胞肾细胞癌类器官模型,揭示了肿瘤异质性及NUC-7738治疗后的转录重塑 | 首次将长读长空间转录组学应用于患者来源的ccRCC类器官,实现了空间分辨的转录本和异构体水平分析,并评估了新型治疗药物NUC-7738的效果 | 未提及样本量具体大小或长期治疗效果的验证,可能局限于类器官模型的体外环境 | 解析ccRCC的基因和异构体水平异质性,并阐明新型治疗药物的空间转录反应 | 患者来源的透明细胞肾细胞癌类器官 | 空间转录组学 | 肾细胞癌 | 长读长空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4158 | 2026-01-30 |
Tumor microenvironment differences between diagnostic and relapsed classic Hodgkin lymphoma revealed by scRNA-seq
2026-Jan-13, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025017107
PMID:40924921
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了经典霍奇金淋巴瘤诊断时与复发时肿瘤微环境的差异,并发现早期复发样本中富含具有免疫抑制潜能的galectin-9阳性幼稚B细胞 | 首次在早期复发经典霍奇金淋巴瘤中发现并表征了一群具有免疫调节潜能的galectin-9阳性幼稚B细胞,揭示了其在塑造免疫抑制微环境中的作用 | 样本量相对有限,且研究主要基于观察性分析,功能验证有待进一步深入 | 探究经典霍奇金淋巴瘤诊断与复发时肿瘤微环境的差异,特别是非恶性B细胞在复发中的作用 | 配对诊断和复发经典霍奇金淋巴瘤样本中的肿瘤微环境细胞 | 单细胞组学 | 经典霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,成像质谱流式细胞术,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,空间蛋白质组数据 | 配对诊断和复发CHL样本,并在独立验证队列中确认 | NA | 单细胞RNA-seq,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 4159 | 2026-01-30 |
PCID2 is essential for spermatogonial differentiation by regulating alternative splicing
2026-Jan-13, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05840-4
PMID:41526677
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研究论文 | 本研究揭示了PCID2通过调控选择性剪接在精子发生中的关键作用 | 首次证明PCID2通过调控选择性剪接影响精原细胞分化,并鉴定出四个关键剪接靶基因 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的生理功能尚需进一步验证 | 探究PCID2在精子发生中的生理功能及其分子机制 | 小鼠精原细胞及精子发生过程 | 生殖生物学 | 男性不育症 | 单细胞转录组测序、RNA测序、免疫沉淀质谱、共免疫沉淀、PCR | 条件性基因敲除小鼠模型 | 转录组数据、蛋白质相互作用数据 | Pcid2条件性敲除小鼠及其对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4160 | 2026-01-30 |
Single-Cell Transcriptomic Atlas of Chicken Ovarian Aging and Cancer Drives Prognostic Model Development
2026-Jan-13, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers18020243
PMID:41595163
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了母鸡卵巢衰老和癌症的转录组图谱,并基于共同失调基因构建了人类卵巢癌的预后模型 | 首次对母鸡卵巢癌进行单细胞RNA测序研究,并利用卵巢衰老和癌变过程中免疫细胞显著变化的216个基因构建了20基因预后模型 | 研究基于母鸡模型,其与人类卵巢癌的完全等效性需进一步验证,样本量相对有限 | 探索卵巢衰老与癌变之间的免疫相关联系,并开发人类卵巢癌的预后预测工具 | 母鸡的卵巢组织,包括正常年轻卵巢、正常老年卵巢和老年卵巢癌组织 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归模型 | 单细胞转录组数据 | 三个母鸡组:35周龄正常卵巢、110周龄正常卵巢、110周龄卵巢癌组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |